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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006447 | Chr11 | 1332250 | 1343605 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 48 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006447.m1 | 69 | 145 | PF16131.8 | Torus | Domain | 31.5 | 2.40E-07 |
| LITCHI006447.m1 | 155 | 190 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 21.2 | 0.00041 |
| LITCHI006447.m1 | 277 | 312 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 22.9 | 0.00012 |
| LITCHI006447.m1 | 318 | 351 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 16.2 | 0.015 |
| LITCHI006447.m2 | 69 | 145 | PF16131.8 | Torus | Domain | 31.5 | 2.40E-07 |
| LITCHI006447.m2 | 155 | 190 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 21.2 | 0.00041 |
| LITCHI006447.m2 | 277 | 312 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 22.9 | 0.00012 |
| LITCHI006447.m2 | 318 | 351 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 16.2 | 0.015 |
| LITCHI006447.m3 | 69 | 145 | PF16131.8 | Torus | Domain | 31.8 | 1.90E-07 |
| LITCHI006447.m3 | 155 | 190 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 21.5 | 0.00034 |
| LITCHI006447.m3 | 277 | 312 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 23.2 | 9.60E-05 |
| LITCHI006447.m3 | 318 | 351 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 16.5 | 0.013 |
| LITCHI006447.m4 | 69 | 145 | PF16131.8 | Torus | Domain | 31.8 | 1.90E-07 |
| LITCHI006447.m4 | 155 | 190 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 21.5 | 0.00034 |
| LITCHI006447.m4 | 277 | 312 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 23.2 | 9.60E-05 |
| LITCHI006447.m4 | 318 | 351 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 16.5 | 0.013 |
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>LITCHI006447.m1 ATGGACGTCAAGGCCTCCAGAAGATTTGCAGATAATAAATGGGAAAGATCAGTTTTAAAT AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT AACGCTAAATTTTCAAAACAATTACATGACAATCGGCCAAGGAAGAGTTCCAAGTATAAT ATTCCGAAGAACGTATGTGTTTCAACGGACTCGGAAAATAAAACCAGGAAGACTACCAAA TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG AAGATGGAAAAGATTTGTGAGTACTGGGTATCCGGAGATTGTGTAAAAGGTGATAATTGC CAGTTTTTACATTCTTGGTTTCGCGGGGATGGGTTCACAATGCTGGCAAAGCTTGATGGC CACAAGAAGTGTGTCAGCGGGATAGCCCTTCCTTTAGGTTCTGACAAGCTTTACTCAGGC AGTAGAGATGGAACAGCCAGACTTTGGGACTGTCATACCGGTCAGTGTATTAGTGTGATC GATCTTGGTGCTGAAGTTGGGTCGTTGATTTGCGAGGGCCCATGGGTGTTCGTGGGCATG CCGAATGTCATTAAGGCATGGAATATTGAATCATCAGCTGAATTTAGGATTGATGGACCT GTTGGTCAAGTTTATTGCATGGTTGTTGCTGATGAAATGCTTTTCGCTGGAGCACAGGAT GGGAACATTCTGGCTTGGAAAGGCAGTTCTGAAACTGAGAATCCTTTTCAACTGACTGCA TCTCTAAAAGGGCACATTCGTCCCGTGATTTGCTTAGCTGTTGGTGGCAAGAGGCTCTAC TCTGGTTCTATGGACAACACAATAAGGGTTTGGGACCTGGAAACCTTACAGTCGGTTGTG ACATTAGATGGACATACTGATGCAGTCATGTCGCTTCTTTGCTGGGATCAGTATTTATTA TCTTGTTCATTGGACCGGACGATAAAAGTTTGGTTTGCTACTGAAGGAGGCAATTTGGAT GTAGCTTATACGCAGAACGAAGAACATGGTGTGCTTCAACTTCATGGGCTGAATGATCCT GATGGTAAACCAGTTCTGTTATGTGCTCGTAATGATGATTCGGTTCACCTGTATGAGTTG CCATCGTTCATTGAGAGGGGCAAGATTTATTCGAAACGTGAAGTTAGAGCAATTGGAATA GGTCCTGATAGCCTCTTTTTCACCGGTGATGGAACTGGGATGTTGAGTGTATGGAAGTTG ACGGCAAAGCCCAGCGGAGAGGCATCATGA >LITCHI006447.m2 ATGGACGTCAAGGCCTCCAGAAGATTTGCAGATAATAAATGGGAAAGATCAGTTTTAAAT AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT AACGCTAAATTTTCAAAACAATTACATGACAATCGGCCAAGGAAGAGTTCCAAGTATAAT ATTCCGAAGAACGTATGTGTTTCAACGGACTCGGAAAATAAAACCAGGAAGACTACCAAA TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG AAGATGGAAAAGATTTGTGAGTACTGGGTATCCGGAGATTGTGTAAAAGGTGATAATTGC CAGTTTTTACATTCTTGGTTTCGCGGGGATGGGTTCACAATGCTGGCAAAGCTTGATGGC CACAAGAAGTGTGTCAGCGGGATAGCCCTTCCTTTAGGTTCTGACAAGCTTTACTCAGGC 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>LITCHI006447.m3 CTGTATCAGGACAATTTATACACCACAATGATCCTGATTTGAATCGTCCTTATCTAGGTG ATATTATAAAAAAAGAAAAAGAACACAGTTTACACAAAAAAGGGACAGTGAAGGGCTTGG TCAGTTTCAACAAATTCTGTCAACAGTTTGCAACAATAATACAATTCCATCAAATTGAAA AATATACAACAATAGAGTGGAATAAGAATATCTCTGTTACCAACAGCTTCATATTCAATT TTTCACCTGCAGATTAGTTATATCTACAGCAACAACAAAGGAAGAAAAATTGGGGATAGG ACCACTCATTGTTTTGAATCATTCCCCATCAAGAATCACTTTAAATTTTTTTTGGCTTTC ATCTCAGCAGCTGCAGCCTTTGCTGCAGATTTCGCAAGGGAACTTGTCTTTAGCACACTT TTGGGGTTAAGTGCTTTTCTGATCTTGAATGCAGTCCATGCTGTTCCTATTGCATGCCCT GCTGCACCTAGTCCTTCATTTGTAGCCTCTGCTGCCTTTTCTCCATACCTGCAGGACACC AAAAAAAAAAAAAAGAACACTCCATAGTTTAACTTGTCTCACAGTACAACATATAATGCT ATGTTCATGAATTTTGTTTTTGCCCATCCCTTCATGTTCACAAATTTAGGCCACCAAATT ATTAATTATGTATCTAAATCAGTAACATGGCAAGTTCGAACAATTCTTCTTAAGACAAGA TTTAAGTATTTTCAAAAGTCAACGGGACGGTAGAGGGGGTGTTTTTGGATGATTTTGTAA AAGGGACTATCAGTTTCGTGTTAAGCCTTACCACAGTAGTATTTATAGCGTGCGCTTAAT ACCAATAATGAAAATAAAAGAGGTCGCATGTGAAGTATGTTGATAAATTGGACATAACCT ATCAGTTAGTGACATTAAAACACTCCAAATAAATTAAAACTTGAAATCATCACACAACAC 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TCTTTGCCCACCGAGCTGTGAATTGAGGATCATTGGACTCAACAAGGTAGTCAAGAAACC CATGTGACTTACAACACAACCTTGGTAAGAAACTTGTGGGGTATTATTTTTGGTATACGG CTCCTTGGGTTACAAACTTCACCGAACGAAAACATTGACAAATTACTAAAATGTTTAACT GAGGAAAGTTAATTCATTGACCAATTAAAACAACCTCGAAAACATCTCAATATTTATCTT AAGAGTTTGCAGTATTGTAAAACATGATTAGAGATTACAGGCCAACATTGCACCTTTTAG TTAGTAGGACTGTGTCCCGATTCTAATCCGTTGGATCTTATAGAACCCAATAACCAATCC AATCCAATAGCCGAAAGGTTCAAATCCAATTCAGTGAAACAAATCATATATATAAAAATC AAAATATGCATAAAATCAACTAAACGTAATAGTTGCAATATCAATCAACTTGTCTCACTA TTTTATTGAAACTAAAATGTGCATATGAGTAGGAATCAACAACCAAGAATTAAGCAGTGT CACTTGAGTAGAACTCAGAATGCATTTTATATATACTGAGATCAAGAAGGTTATTCCAGC CATTTGCTATTCTTTATAGTCGAACTGGATTTTCCATTGAATTTCACTCCATGGCAGTAA CGTGCTTGAAGACTTGAACCATCATGCAAATTGTCAGCTCTCAACATGCAATCTGCTTGA AATAGATGTCTATGTCCTAACTCTAGAAATCTTAACAAAGTAAGTCAATCACGGAAAAGA AACATCAATCCTAGATATTTAACGAAACTTAGGAAGCATTCACAAACCAATCTACGCCCC CAACAAATTATTTGCCCATAAACCACCTTTGGTACAGATTCAACACAATCAAAATGATAG CAGACACATGTAATATGATGTTCAACACTAGATACCAAAAACAAAAAGAAGTGTACTCAT CCAACATTTCATAGAAATATCAAACTCATCTCACAACCGAAAGCATATAAAAATTCCGTA ACATACTGAATCCGTCCAGTGATGCTAGGATGACTTCCCCCGGAAGTAGGCTGAAAAATT TCTTCCCTGCATTCGTGTTGGCAACCGAACTTGTAAAGAATCCGGACACCTTGACGACAC CAGTGAGTACCCCGTTGGCCACTCGCTGTGTCATCTTTGTCATGTTCTTGACCCTGCATG AATAAAATTAACCAAAACCATCGATGTTATAATCAATGACCATTCAAAATACGATAAATT CAACGTGTCTACAAATCAGGAATCTTGATTCCTGATTTGCAATTCCTATGTATTACTAAA ACTCAGGATATGAATACCCCACACGAATCAGTTTATTGCTAGAAAAGAAACTTAATTTCC TCATCCCACCCAAGGAAACCAAATTTCCTTTCCAGATTCTCTCCTCTATCGAACTTGATT TCCATCACTATGTCATCAAATTTACAATAAATCAAGACTAGAAAAGAAATTGAATTCTTT CATCTCACTACGGGAATTAAGTTCCCTATCCTGATTCTTTTCTGAATCCCTTCATCTTAC TCGAGAAATCAAGTTCTCTTTCTTGATTCTCTTTTCCATGGAAACTTAATTCCCGACACC ATGTGATCGAATTTACCTCTTGATCCTCTTCAATGTCTCAGGGCTAACCTCCCTATCCGC TCCACCAGGGGCCCACCTCTTCTTCATAACCTGATTCCCCCACTTCAACCTCTCCACCGT CACGTCTCCACACCACAAAATCCCTCGAATCAGCCTGCCTGAACCGGCCGCAATCAACTT CGCGGCGGTTCCGCTGTAGTCCTCCACATTAGGAGCCAATGTAGTCCAATACGCCGTACA ACTCTCCTCCACTGCTTCCTTCTTCTTCCCTTCCAACTCCACCGGCGCCGTATCCTTCAC 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