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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006447Chr1113322501343605+Zinc finger CCCH domain-containing protein 48

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006447.m169145PF16131.8TorusDomain31.52.40E-07
LITCHI006447.m1155190PF00400.35WD40Repeat21.20.00041
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LITCHI006447.m1318351PF00400.35WD40Repeat16.20.015
LITCHI006447.m269145PF16131.8TorusDomain31.52.40E-07
LITCHI006447.m2155190PF00400.35WD40Repeat21.20.00041
LITCHI006447.m2277312PF00400.35WD40Repeat22.90.00012
LITCHI006447.m2318351PF00400.35WD40Repeat16.20.015
LITCHI006447.m369145PF16131.8TorusDomain31.81.90E-07
LITCHI006447.m3155190PF00400.35WD40Repeat21.50.00034
LITCHI006447.m3277312PF00400.35WD40Repeat23.29.60E-05
LITCHI006447.m3318351PF00400.35WD40Repeat16.50.013
LITCHI006447.m469145PF16131.8TorusDomain31.81.90E-07
LITCHI006447.m4155190PF00400.35WD40Repeat21.50.00034
LITCHI006447.m4277312PF00400.35WD40Repeat23.29.60E-05
LITCHI006447.m4318351PF00400.35WD40Repeat16.50.013
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>LITCHI006447.m1
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AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT
GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT
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ATTCCGAAGAACGTATGTGTTTCAACGGACTCGGAAAATAAAACCAGGAAGACTACCAAA
TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG
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CAGTTTTTACATTCTTGGTTTCGCGGGGATGGGTTCACAATGCTGGCAAAGCTTGATGGC
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GATCTTGGTGCTGAAGTTGGGTCGTTGATTTGCGAGGGCCCATGGGTGTTCGTGGGCATG
CCGAATGTCATTAAGGCATGGAATATTGAATCATCAGCTGAATTTAGGATTGATGGACCT
GTTGGTCAAGTTTATTGCATGGTTGTTGCTGATGAAATGCTTTTCGCTGGAGCACAGGAT
GGGAACATTCTGGCTTGGAAAGGCAGTTCTGAAACTGAGAATCCTTTTCAACTGACTGCA
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TCTGGTTCTATGGACAACACAATAAGGGTTTGGGACCTGGAAACCTTACAGTCGGTTGTG
ACATTAGATGGACATACTGATGCAGTCATGTCGCTTCTTTGCTGGGATCAGTATTTATTA
TCTTGTTCATTGGACCGGACGATAAAAGTTTGGTTTGCTACTGAAGGAGGCAATTTGGAT
GTAGCTTATACGCAGAACGAAGAACATGGTGTGCTTCAACTTCATGGGCTGAATGATCCT
GATGGTAAACCAGTTCTGTTATGTGCTCGTAATGATGATTCGGTTCACCTGTATGAGTTG
CCATCGTTCATTGAGAGGGGCAAGATTTATTCGAAACGTGAAGTTAGAGCAATTGGAATA
GGTCCTGATAGCCTCTTTTTCACCGGTGATGGAACTGGGATGTTGAGTGTATGGAAGTTG
ACGGCAAAGCCCAGCGGAGAGGCATCATGA
>LITCHI006447.m2
ATGGACGTCAAGGCCTCCAGAAGATTTGCAGATAATAAATGGGAAAGATCAGTTTTAAAT
AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT
GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT
AACGCTAAATTTTCAAAACAATTACATGACAATCGGCCAAGGAAGAGTTCCAAGTATAAT
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TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG
AAGATGGAAAAGATTTGTGAGTACTGGGTATCCGGAGATTGTGTAAAAGGTGATAATTGC
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CACAAGAAGTGTGTCAGCGGGATAGCCCTTCCTTTAGGTTCTGACAAGCTTTACTCAGGC
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GTTGGTCAAGTTTATTGCATGGTTGTTGCTGATGAAATGCTTTTCGCTGGAGCACAGGAT
GGGAACATTCTGGCTTGGAAAGGCAGTTCTGAAACTGAGAATCCTTTTCAACTGACTGCA
TCTCTAAAAGGGCACATTCGTCCCGTGATTTGCTTAGCTGTTGGTGGCAAGAGGCTCTAC
TCTGGTTCTATGGACAACACAATAAGGGTTTGGGACCTGGAAACCTTACAGTCGGTTGTG
ACATTAGATGGACATACTGATGCAGTCATGTCGCTTCTTTGCTGGGATCAGTATTTATTA
TCTTGTTCATTGGACCGGACGATAAAAGTTTGGTTTGCTACTGAAGGAGGCAATTTGGAT
GTAGCTTATACGCAGAACGAAGAACATGGTGTGCTTCAACTTCATGGGCTGAATGATCCT
GATGGTAAACCAGTTCTGTTATGTGCTCGTAATGATGATTCGGTTCACCTGTATGAGTTG
CCATCGTTCATTGAGAGGGGCAAGATTTATTCGAAACGTGAAGTTAGAGCAATTGGAATA
GGTCCTGATAGCCTCTTTTTCACCGGTGATGGAACTGGGATGTTGAGTGTATGGAAGTTG
ACGGCAAAGCCCAGCGGAGAGGCATCATGA
>LITCHI006447.m3
ATGGACGTCAAGGCCTCCAGAAGATTTGCAGATAATAAATGGGAAAGATCAGTTTTAAAT
AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT
GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT
AACGCTAAATTTTCAAAACAATTACATGACAATCGGCCAAGGAAGAGTTCCAAGTATAAT
ATTCCGAAGAACGTATGTGTTTCAACGGACTCGGAAAATAAAACCAGGAAGACTACCAAA
TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG
AAGATGGAAAAGATTTGTGAGTACTGGGTATCCGGAGATTGTGTAAAAGGTGATAATTGC
CAGTTTTTACATTCTTGGTTTCGCGGGGATGGGTTCACAATGCTGGCAAAGCTTGATGGC
CACAAGAAGTGTGTCAGCGGGATAGCCCTTCCTTTAGGTTCTGACAAGCTTTACTCAGGC
AGTAGAGATGGAACAGCCAGACTTTGGGACTGTCATACCGGTCAGTGTATTAGTGTGATC
GATCTTGGTGCTGAAGTTGGGTCGTTGATTTGCGAGGGCCCATGGGTGTTCGTGGGCATG
CCGAATGTCATTAAGGCATGGAATATTGAATCATCAGCTGAATTTAGGATTGATGGACCT
GTTGGTCAAGTTTATTGCATGGTTGTTGCTGATGAAATGCTTTTCGCTGGAGCACAGGAT
GGGAACATTCTGGCTTGGAAAGGCAGTTCTGAAACTGAGAATCCTTTTCAACTGACTGCA
TCTCTAAAAGGGCACATTCGTCCCGTGATTTGCTTAGCTGTTGGTGGCAAGAGGCTCTAC
TCTGGTTCTATGGACAACACAATAAGGGTTTGGGACCTGGAAACCTTACAGTCGGTTGTG
ACATTAGATGGACATACTGATGCAGTCATGTCGCTTCTTTGCTGGGATCAGTATTTATTA
TCTTGTTCATTGGACCGGACGATAAAAGTTTGGTTTGCTACTGAAGGAGGCAATTTGGAT
GTAGCTTATACGCAGAACGAAGAACATGTATGTTGTTTTTCTTTTTCAATTGTTTCCTAT
TATATTACTATCTCAGGAGCTTAA
>LITCHI006447.m4
ATGGACGTCAAGGCCTCCAGAAGATTTGCAGATAATAAATGGGAAAGATCAGTTTTAAAT
AGACTTGGAGCAAGAGGAGGACAATCAGGCAATGGCAATATTTGTTATTTCTATACCATT
GGAAGGTGCAACCGGAAACCCTGTAGGTTTGTGCATGCAGACTCACCATCCACTTCTGTT
AACGCTAAATTTTCAAAACAATTACATGACAATCGGCCAAGGAAGAGTTCCAAGTATAAT
ATTCCGAAGAACGTATGTGTTTCAACGGACTCGGAAAATAAAACCAGGAAGACTACCAAA
TGTGATGGGCTGAAGAACTCATTGGCTTCTTCAGCAGGAGTTAAAAGTAGTACTCAGAAG
AAGATGGAAAAGATTTGTGAGTACTGGGTATCCGGAGATTGTGTAAAAGGTGATAATTGC
CAGTTTTTACATTCTTGGTTTCGCGGGGATGGGTTCACAATGCTGGCAAAGCTTGATGGC
CACAAGAAGTGTGTCAGCGGGATAGCCCTTCCTTTAGGTTCTGACAAGCTTTACTCAGGC
AGTAGAGATGGAACAGCCAGACTTTGGGACTGTCATACCGGTCAGTGTATTAGTGTGATC
GATCTTGGTGCTGAAGTTGGGTCGTTGATTTGCGAGGGCCCATGGGTGTTCGTGGGCATG
CCGAATGTCATTAAGGCATGGAATATTGAATCATCAGCTGAATTTAGGATTGATGGACCT
GTTGGTCAAGTTTATTGCATGGTTGTTGCTGATGAAATGCTTTTCGCTGGAGCACAGGAT
GGGAACATTCTGGCTTGGAAAGGCAGTTCTGAAACTGAGAATCCTTTTCAACTGACTGCA
TCTCTAAAAGGGCACATTCGTCCCGTGATTTGCTTAGCTGTTGGTGGCAAGAGGCTCTAC
TCTGGTTCTATGGACAACACAATAAGGGTTTGGGACCTGGAAACCTTACAGTCGGTTGTG
ACATTAGATGGACATACTGATGCAGTCATGTCGCTTCTTTGCTGGGATCAGTATTTATTA
TCTTGTTCATTGGACCGGACGATAAAAGTTTGGTTTGCTACTGAAGGAGGCAATTTGGAT
GTAGCTTATACGCAGAACGAAGAACATGTATGTTGTTTTTCTTTTTCAATTGTTTCCTAT
TATATTACTATCTCAGGAGCTTAA
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>LITCHI017631.m1
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SQGGSSASCDHDNQTVRNEVDSGLELTIWKKEERNENQSETCSAKWMSSKMRLMKKMMNS
EGAPPADTSNNNRTGKFEDEKQFSLTSLTGENSCNNSNLNTIRVCADCNTTKTPLWRSGP
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CLPFKKRCKMASPPPSKKKKQIGFEDLTIILSKHSAYQRVFPQDEKEAAILLMALSYGLV
HG.
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>LITCHI017631.m1
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CTCCTCTCCTCTCCTTTAAAATCCATTTTCCTCTCTCTACCTTAGAACCTTTTTGCCTTG
TCTCTCTCTTTTCAATTTCCTGTGTCCTGATCTCTTCCATCTTTACTGGACAACAGATAC
ACTACTATCAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTTCCAATGACTCCAAA
TTTTCATTCACACATGTCTCTTAACTTTCCTCTTAAAGAAGATCATCATGATCATCAACA
ACACCGCCACCACCACCCAGCTCTTCCTTTTTCAGTCTCAGTCTGCTTCTTCTTCTTCTT
CTCCTCGCTTCTTTGACCATGTTCAAGAACAAGGAGGGTATTATTATCACAGGGAAGAAT
CTCATCATTTGCTACACCACCACCAAGAAGAGGCAAAGGTGTATGTCTCACAAGGAGGAT
CATCAGCATCATGCGATCATGACAATCAAACGGTGAGGAATGAGGTTGACAGTGGGCTCG
AGTTGACTATCTGGAAGAAAGAAGAGAGAAATGAGAATCAGAGTGAGACTTGTTCAGCTA
AGTGGATGTCATCAAAGATGAGGTTGATGAAGAAGATGATGAATTCAGAAGGTGCTCCTC
CAGCTGATACATCAAATAATAATCGTACAGGAAAATTCGAAGATGAGAAGCAATTTTCGT
TAACCTCATTAACAGGAGAAAACAGCTGCAACAATAGCAACCTAAACACGATTAGGGTTT
GTGCTGATTGTAACACTACTAAGACCCCTCTTTGGAGGAGTGGACCTAGAGGTCCCAAGT
CACTTTGCAACGCCTGTGGAATCCGGCAAAGGAAGGCGAGGAGGGCCATGGCTGCGGCTG
CAGCGGCAGCCGCTAACGGCACCATGCTTGCAGCTGATGCACCGCCAGTACTGACTAAGA
AGAGTAAGGTGCAACACAAAGATAAGGCAACAGGTAATAATAACAGTTGTCTGCCATTCA
AGAAGAGGTGCAAAATGGCCTCTCCACCCCCATCAAAGAAGAAGAAGCAGATTGGTTTCG
AGGACTTGACGATAATCTTGAGTAAACATTCGGCTTATCAACGCGTTTTTCCTCAGGATG
AGAAGGAAGCTGCCATCCTATTAATGGCTCTATCTTATGGACTTGTTCACGGTTGAGTAT
CTTATAATATAATTAGTTTGTTATTTTCTTGTTAAGGAGGATAGTTGTGAGAGATCGAGA
GACAGTGTGTATCAGTGATCATCAAGGGAGAATTCAAAGTTGAAGGAAAAAGGAAAAATA
AAAGCTGTAGTATGGAGATTTTTAAGAGGGTTGTGGTGGATTTGAACAAGTTGATCATGC
CAAAGTCAAACTGGAGCCCTTGTTCATCTACATCTTATTTTGTTATCCAACTTATAATAA
GAGAATTATTATTTCAAGGTCTATTAATTAGATTATTTTCTGCCTTGTATTTTTTGTTCT
CATGATATCATTTAATTTGGAGATTATATATATGGTTTTTACTTTTACAAAATTTAATAT
GATATTGCCATGGTGATCATAAGGAATTTCACAAAACTTGACAATGCAAAGTTTGCAAAA
TGCATCACCAGAGATCTGATAGAGGCTGTGATCAATAATAAACGGTGCAGAAGAAAGCAA
CATTCTCTCTCTCTTATGACTGAAATTGGCCTATCAATCATGATGGTGATGATTCACATT
GCTAACAGCTTTTTAGATTTCTGAAAAATCACCTCAGTACTTTTGTCTCAGACCTTGTCT
TGCTTTTCTGACCTTCAATTTTTTGAGTAGTCTTGAAATATAGGCTAGTACAAAACTGGA
CTTTTACTCTTCAGGATCGATCAATTTGTCGGAGGCAAACACACACACACACACACATA
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AGTTCCCACTTACACATATACATATACATATATATATATATTATCTCTGCTCAAGTAATT
GGGTTGACCAACATAGGTCAACTCATAGCTTGAGGTAATTCTTTTAAGTTGTTTATATGA
TACTGGCTAAATAAATTATAAGATGATGCTGGATAATAATTTTGATGGTACAAAGTTGAT
GAAGGTGTGGGGATGGCTGCTTGAGTGCACAAACATTAAATGTGTTTTTGGCAATGTTAA
GGTGGGGGTTGATAGATGATCCTATGCAATTCTGAATTCCGATACTTGTCTTCTCATCAC
TATTGCATGCCCATGCTCCAATATCCCTCCCACATGGCATATATATATATATATATATAT
TTCTTCTTAGACATTGATTATATAAACATTTATAACTTGATGTTGATCATCAGTTCTGTC
ATCTTACAGAAGGCTTTCAATTGATGGTACTCTCTAGGGTTTATATAGGTTCATCTATAA
TATATAATATATTTGCAATGTTCAATATAATATTTTCCTTTTAAAGTGCTTAAAAAAAAT
TAAAATGAATTCAATAATTATTTTATAACGTTCAGTTGTAAATAAACAAAATACATTCTA
ATTAAAATACAGGTAAGGTTAACTTGCGTCCTTAGTGCATCCTTAGGGCACATGTTACAC
TAAGAAAAATTAAAATAAAAATCACAGTTAAACATTAAAGGATTTTTTTTTTTTTGTTTT
TTTTTTTCTCTCTCTTATTCCGTCATTGTTAATTATGATTTTAACTTTTACCCTTGGACA
CACGTTAACACTGCCTTTACAATGTATCTTTGATCTCAGGCAACCTCTTTAAATATGTTA
AGTAATTCATGTAATTTGTGGCCACAATATTAAGTGAAAATTGTAGGAGATGGACCATTT
GATTTATTATTGTAGGATTATCACATACTTAATAGTTTGAGTATCACATAAAAGCTATTT
CTTTCATATTTTATCCTTTTGTTTTCTTTCATAAATCTCAAGTTCTAAGTTTGATCGAAC
TCAGAACCAGAGCTCTGCTTTTTTTTTTTTTTTCCTTAAACTGTTATTATGTTGTTGTTG
ATGTTGAAGATGTTATTGTTGTGAGAGTTAATAATGTTGTGATTTTGTTGATGATGTTAA
AGATGGCGGGAGATGATGTTGATGAGTTGGGAGGTTTATCGAACCTAAAATATGGAGGAC
GTTGACGGTGTTCTTGATTATGTTGAATGTGATAGAGATCTAATTTGGTGAATCTCAATT
TTTTCTTTCAAATTTTTAAAAGAATTTTTATAAAAAATTAATTTTAAAAATCTAATAAAA
TATTTAAATTAATTTTATTCTAATCCAATCTCAAATAATATCAAACATAATATGTTTTAA
TTTTAATCTAATTATAATTTAATCAAATATGAAAAAGTAATATTTTAATTTAATTCATTT
CATTTCATTATAATATCGTATGTCAAATGCACGTAATCTTAGAGAAGCATTATCTTGAGA
TTAAATATATAACTTGGATCTGCATCATTTCGCAGAAATTAATTTATTACATAATATTAT
ACATTGACTTCGTTGACATATTTATTCTCAACTAGGGTGTGTGTGGGGACTCAGGGTAAA
ATAATTAGAGATAGGGTACATGTCGAATGTGGTGGTGCAGTAGCATTCCATAATAATTTT
GGTTTTGGTTTTTCTGTATAACTTGTGCGTTACAATCAAGTCACGTGAACCTCTTATTGC
TAGGTAGGTCTGCGCTGCTCCTGCCCTATCGCTCTCCTCTCCTCTCCTTTAAAATCCATT
TTCCTCTCTCTACCTTAGAACCTTTTTGCCTTGTCTCTCTCTTTTCAATTTCCTGTGTCC
TGATCTCTTCCATCTTTACTGGACAACAGATACACTACTATCAATTTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCATCTTCCAATGACTCCAAATTTTCATTCACACATGTCTCTTAACTT
TCCTCTTAAAGAAGATCATC
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>LITCHI017631.m1 GenomeSequence + 
AATCAAGTCACGTGAACCTCTTATTGCTAGGTAGGTCTGCGCTGCTCCTGCCCTATCGCT
CTCCTCTCCTCTCCTTTAAAATCCATTTTCCTCTCTCTACCTTAGAACCTTTTTGCCTTG
TCTCTCTCTTTTCAATTTCCTGTGTCCTGATCTCTTCCATCTTTACTGGACAACAGATAC
ACTACTATCAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTTCCAATGACTCCAAA
TTTTCATTCACACATGTCTCTTAACTTTCCTCTTAAAGAAGATCATCATGATCATCAACA
ACACCGCCACCACCACCCAGCTCTTCCTTTTTCAGTCTCAGTCTGCTTCTTCTTCTTCTT
CTCCTCGCTTCTTTGACCATGTTCAAGAACAAGGAGGGTATTATTATCACAGGGAAGAAT
CTCATCATTTGCTACACCACCACCAAGAAGAGGTATTTATTAGATATTTTCTTGCAACTA
TATATTCTTGATTTATGTCAACTTTTCATGCTTCATAATATGTATAGTGTGATCACTGAA
TACTTAAATATTATTCTCTCTTGATTTTAGGCAAAGGTGTATGTCTCACAAGGAGGATCA
TCAGCATCATGCGATCATGACAATCAAACGGTGAGGAATGAGGTTGACAGTGGGCTCGAG
TTGACTATCTGGAAGAAAGAAGAGAGAAATGAGAATCAGAGTGAGACTTGTTCAGCTAAG
TGGATGTCATCAAAGATGAGGTTGATGAAGAAGATGATGAATTCAGAAGGTGCTCCTCCA
GCTGATACATCAAATAATAATCGTACAGGAAAATTCGAAGATGAGAAGCAATTTTCGTTA
ACCTCATTAACAGGAGAAAACAGCTGCAACAATAGCAACCTAAACACGATTAGGGTTTGT
GCTGATTGTAACACTACTAAGACCCCTCTTTGGAGGAGTGGACCTAGAGGTCCCAAGGTA
ATTAATTATAATTAATCTATTGATCTAATACTAATACACTATTACCTACCCCTATATATA
TGCACACACTAATTGATGTATATCTTTTGTCGCAGTCACTTTGCAACGCCTGTGGAATCC
GGCAAAGGAAGGCGAGGAGGGCCATGGCTGCGGCTGCAGCGGCAGCCGCTAACGGCACCA
TGCTTGCAGCTGATGCACCGCCAGTACTGACTAAGAAGAGTAAGGTGCAACACAAAGATA
AGGCAACAGGTAATAATAACAGTTGTCTGCCATTCAAGAAGAGGTGCAAAATGGCCTCTC
CACCCCCATCAAAGAAGAAGAAGCAGATTGGTTTCGAGGACTTGACGATAATCTTGAGTA
AACATTCGGCTTATCAACGCGTTTTTCCTCAGGATGAGAAGGAAGCTGCCATCCTATTAA
TGGCTCTATCTTATGGACTTGTTCACGGTTGAGTATCTTATAATATAATTAGTTTGTTAT
TTTCTTGTTAAGGAGGATAGTTGTGAGAGATCGAGAGACAGTGTGTATCAGTGATCATCA
AGGGAGAATTCAAAGTTGAAGGAAAAAGGAAAAATAAAAGCTGTAGTATGGAGATTTTTA
AGAGGGTTGTGGTGGATTTGAACAAGTTGATCATGCCAAAGTCAAACTGGAGCCCTTGTT
CATCTACATCTTATTTTGTTATCCAACTTATAATAAGAGAATTATTATTTCAAGGTCTAT
TAATTAGATTATTTTCTGCCTTGTATTTTTTGTTCTCATGATATCATTTAATTTGGAGAT
TATATATATGGTTTTTACTTTTACAAAATTTAATATGATATTGCCATGGTGATCATAAGG
AATTTCACAAAACTTGACAATGCAAAGTTTGCAAAATGCATCACCAGAGATCTGATAGAG
GCTGTGATCAATAATAAACGGTGCAGAAGAAAGCAACATTCTCTCTCTCTTATGACTGAA
ATTGGCCTATCAATCATGATGGTGATGATTCACATTGCTAACAGCTTTTTAGATTTCTGA
AAAATCACCTCAGTACTTTTGTCTCAGACCTTGTCTTGCTTTTCTGACCTTCAATTTTTT
GAGTAGTCTTGAAATATAGGCTAGTACAAAACTGGACTTTTACTCTTCAGGATCGATCAA
TTTGTCGGAGGCAAACACACACACACACACACATA