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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

Gene Information

GeneID	Chromosome	Start	End	strand	Descript
LITCHI006321	Chr11	313731	317998	+	Serine/threonine-protein kinase SRPK

Conserved Domain

Gene ID	Start	End	Accession	Domain	Type	Bit Score	E-value
LITCHI006321.m1	40	179	PF00069.28	Pkinase	Domain	79.5	2.80E-22
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LITCHI006321.m1	252	413	PF00069.28	Pkinase	Domain	76	3.10E-21
LITCHI006321.m2	40	179	PF00069.28	Pkinase	Domain	80.1	1.80E-22
LITCHI006321.m2	42	178	PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	40.2	2.50E-10
LITCHI006321.m2	252	341	PF00069.28	Pkinase	Domain	53.6	2.10E-14
LITCHI006321.m3	1	61	PF00069.28	Pkinase	Domain	41.6	1.00E-10
LITCHI006321.m3	134	295	PF00069.28	Pkinase	Domain	77.1	1.50E-21
LITCHI006321.m4	40	179	PF00069.28	Pkinase	Domain	80.4	1.50E-22
LITCHI006321.m4	42	178	PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	40.5	2.00E-10
LITCHI006321.m4	252	314	PF00069.28	Pkinase	Domain	49.3	4.60E-13

CDS sequence

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TAA
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Protein sequence

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mRNA sequence

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TTCTTCATATGATCTTCCATGTGTTGTCTGATTGTATGTGATGTTGTTGTTGATTGTGGT
GTCTGAAACAATTTTCGTTTTGTGTGTATCTATATGTGTGACCTGTTATGTTTTGATAGT
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ATCTGTATTGTCTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATACGATTTTCTACGGAAAAACAAT
TATCGCTCATTTCCCATTGATCTTGTCCGTGAGATTGGCAGACAACTGTTGGAATGTGTA
GCATTCATGCATGATTTGTGCTTGATTCATACTGATTTGAAGCCTGAGAATATCCTCTTA
GTTTCTCCAGAATATGTTAAAGTTCCTGATTACAAGAGTTCGTCACGCTCACCAAAGGAT
AGTTTGTATTTTAAACGAGTGCCAAAGTCAAGTGCTATTAAGGTGATTGATTTTGGTAGC
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GAAGTCATTCTTGGACTTGGGTGGAGTTATCCTTGTGATGTATGGAGTGTCGGTTGTATC
TTGGTGGAGTTATGCACGGGTGAGGCATTGTTTCAAACTCATGAGAATTTGGAACATCTT
GCAATGATGGAGAGGGTGCTTGGTCCCCTGCCACAGCATATGTTGAAGAGAACAGACCGC
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GACCATTCAGCTGGGGATCTGATACATTTGTTGCAAGGACTGCTTAGATATGACCCGGTT
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GCCTGAATCAGTTTATTATGATGGTGTGATTTTGCCTAAAGTAACATGCTGTTGCCGCTT
TGTCCCGATTGCATGTGTAAATATTGATTTTCAAAATGAAAATTTCTGGATGCCTTGTAC
ATGTGAAGAGCTCTACTGACAGATGTGACTGACCCAAATGTACAATAGAAAACTATAATC
CAGCTATAACAGAGCCTATTTTGTACTGAAGCACAATGTATAACGTTCTTCAGATATCGA
ACTCTGGTCCATTCGATTGTGAGCCATTCCTTTTCGTTGATCGTTCATTTGTGAATGCTT
TAGGTATTTTGTTATTACTTCTTTCGTTTCAGCTGCATCCTATTCTAGTTTTGTGTTAAT
ACTCAAAACATCTATCTCCACAGGTTATGTTATTTTATTTTGAAAATTTATCGGCAAATG
TATATTTTATAGTTTTGGTGACTTTATAGAAGTAAGCTTGTAGTTGTAATAAAGAGTAGT
TTCTCTGTTGAATATAATAATAATAATAATAATGTAGTTCCAATTACGGTGTCTTGTGTT
TTCCATCGTGCGAGGTATTATTAGGTATGGTAATGCATCAGATTAGACTTTTCTAAATCC
GTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m2
ACAAAAACCAAAAAGAGGCATCCTCATCCTTTCACGCTTGTTCATCAATCACCGAAAGTC
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CGGAGTTTCCTCTCACCCGCCTCGATCGGCGGCCAAGGAAGCGTGCGCGTTTGGGCTGGG
ACGTGCCTGAGGCGCCTAAGATAAAATCCACAGCAAAATGGGTGAAGGTACATTTGGCCA
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GATCAAGAAGTATCGTGAAGCTGCTATGATAGAAATTGAAGTTCTGCAGCAACTTGGCAA
ACATGATAAAGGTGGCAACCGTTGTGTGCAAATACGGAACTGGTTTGACTATCGTAACCA
TATCTGTATTGTCTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATACGATTTTCTACGGAAAAACAA
TTATCGCTCATTTCCCATTGATCTTGTCCGTGAGATTGGCAGACAACTGTTGGAATGTGT
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>LITCHI022509.m4
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CAGATAAAATCCACAGCAAA
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>LITCHI022509.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI022509.m5 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI022509.m1 GenomeSequence - 
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CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m4 GenomeSequence - 
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CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m3 GenomeSequence - 
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>LITCHI022509.m2 GenomeSequence - 
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CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m1 GenomeSequence - 
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CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m5 GenomeSequence - 
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CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG
>LITCHI022509.m4 GenomeSequence - 
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>LITCHI022509.m3 GenomeSequence - 
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AATGCAGCATGTAGACCATTCAGCTGGGGATCTGATACATTTGTTGCAAGGACTGCTTAG
ATATGACCCGGTTGACAGGCTAACTGCCGGTGAAGCCCTCAGGCATCCATTCTTTACTGG
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GTTTTGTGTTAATACTCAAAACATCTATCTCCACAGGTTATGTTATTTTATTTTGAAAAT
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GGTGTCTTGTGTTTTCCATCGTGCGAGGTATTATTAGGTATGGTAATGCATCAGATTAGA
CTTTTCTAAATCCGTTCAATCCTTTGG