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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006313 | Chr11 | 273465 | 281343 | + | Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1a |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006313.m1 | 19 | 105 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 32.2 | 7.60E-08 |
LITCHI006313.m1 | 106 | 203 | PF06479.15 | Ribonuc_2-5A | Family | 115.9 | 1.40E-33 |
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>LITCHI006313.m1 ATGTCCAAAACAACATCAAACTCTGAGAATTCCTCAGAGATCACCTCAAGTCTCAACACT GCTCTTTCCGGCAGTTGTGGAAGCTCTGGTTGGCAAGCACCTGAACAACTTCTTCGTAAA TGCCAAACTCCTAGACTAGATTTGTTCAGTTTGGGTTGTGTCCTGTATTTCTGCATTGCC AGAGGTAAACATCCATTTGGCCATTGTCGTAGACGTGATATCAATATTGAGAAGAACAAA GTGAACCTTTCCTTCGTGGATAGGATCCTTGAAGCTAAGGATCTTATTTCACGTTTGTTA AACCCTAACCCTCAATTGAGTTCTGCTCTCCTGAAAGCATTAGAAAATACTGCATCGGTG GCTCTGGGTACAAAATGGAATGAAAAGATGGAACCACTATTCATTGCTAATATTGGCCAT TACCGCCGTTACAGATTTGACAGCGTTAGAGATCTATTGAGAGTCATGCGAAACAAGTTG AACCATTATAGAGAACTTCCCAGAGAAATTCAGGAACTTGTTGGACCAATTCCAGAAGGA TTTGATGAGTATTTTGCCAGTCGATTTCCAAGACTATTGATAGTAGTGTACATAGTTGTA TGCAGGTACTGTAGGTAA
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>LITCHI026165.m3 - Up_Stream_Len 2000 AAATCACATGACAATGTATCGTCCCAAAATATGCAGATGGGTCCTATTATCTCTTACACG TTTGAGGTATGTGGGATTGTTTTTTTGCATGGAAGTTACTTGGTGCCTCACCTCATAAAT CGCAAGTCAGTTAGGATATTCCATTTAAGAGCTGCCATGTTTAGGTCACGCATGCCCTCC AAAGAAAGGGAATCCCTTATTTTTGCAACCACAATTACGATTATGGTCTCCAGATATGTA TAAGTTCAGATATATGTTACTTAATTTGGATAAATGAAGGGGATAAAATGGTCAATTGGT GCTATCTCTTCATGGCTTTAGAATTGGGTTTGGAATAAATAAAGTTAAAAGATGAGGCAA AAAGAAGAGGCCTTCCAAATTCCCCCTCTGGTGGGGTTTGCTCCACCACTTTCACTATGC ACTACGACGTGAGAGAATAATTACAAATGAAAGAGAGACAGAAAGGACAAAAAAATCCTC CACAAAATTATGGAAAACAAGAATTACTTCAGAGTCCACAAAGCCTGAAATAATTCATAA AAAAATAGTATGTATGTGTTATCATAGTCTCTAAGATCAGAACCTACATTTTCACATTTA CTCTACAATTTTCAAAACTTTAACATATATAAACAAATATATTGACAAATAATTAACCTG AAATCCATCAAACATAATTAATTGTTTTCTAAAGTAAACCCTAAAAATGATACTTAAGTA AGTAGTACATGGGGTTTGAGAACGATAATTATTAAAGTTGATTGTAAAATAAAGATTAAT TACCAAACTTTTAATAATGTTATAGTTTAGACAAAGTGTATAAGTCGAGCTTCAATCAAG GTATCAATCATTTTAGTTGTGGGGCATTATTGAAGAGGTTTGGAAGCCATATCTCACAAG CTCTTATCTTTTCATGCTTCTCATTCTCTTAAGCACTATCTGGTTCTGGTAGGCAAAGCA ATTCTTCTCCTTTTAATAATATCATTATTCATTCCATTCAAATCAAGGCCCTTTTAGGGT TTGGGTGTTTTATAACAGGAACAAAGGAAAAGACAGAAAGTGCCAACGTCATACTCGCAA AAAATATATATAAAAATTAAAGGAAAAAAAAAATCAATTAAAATATTTTATTATGAGAAA ATTTTGCCTGAACAAGTTGGATGATCCTTCCTAGTCCTTGCTTGGCCTAGTTGCCCTCCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGAGCCTTTTTCTTTCACTAGTAATTGCTTTTTTT TTTTTTTTAAAGCTTTTTAATTTCTATATTTGCCACCCCTTCTCTTATAGTCTGCCACTG TAATCATCACCTCTTGTACGCTAATATCTGCTACCGAGCTACAGAAATTTTCTCTCTTTT TTTGGTTTTTTCATTTGCTGTTTGTCTATCTCTCACTTACTCTATCTAACTATATATATA TAAAAATCTTTTTGTACACATCAATGGATAGAAAGGAGAGGGTTATTGGGTAGTGGAGAG GTTTTAAAGAAAAAAAACGTCTGTTCTTTCCATGTTTTGATTGCATGAAGAAATCTTGAT GGGTTTGAAGAGAGGTTGGAAAGAGATACATCTGAATTGTGTTGCAGAGATGCTCAGACA AGCAATCCATGGCTAGATAGCGACTTCGAGAATAACCCATCATCATCATCTCTTCACGAG ATCTTTTTTATTTGTATTTCTTTGCTTTTTACCTAGCTAGCTACCTCCCAGCGAATGATG TCCTTGTGTGTCTATATGTCACTGCCACCTGTTAATGAACAGAACTGCGTTTTGGTTGTG TCCAAAGCTGGGATTCTCTGCTTCTAAGCTGGTCCTTCTCGGTCCTCTTCCCTTGTTGTT TCTTCAAAGGTGCAAGCACAACACTAGTTGATCAACAAGGGCTAAAGTGATAGACACATA TCAAACAAAACAAAAAGCTCACAGTGAAGTGGATTATTCTTCTTGTTTTTATATTTCTTG GATTTTTCTTCTTTACAGAC >LITCHI026165.m2 - 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>LITCHI026165.m3 GenomeSequence - TCAATCATTTTAGTTGTGGGGCATTATTGAAGAGGTTTGGAAGCCATATCTCACAAGCTC TTATCTTTTCATGCTTCTCATTCTCTTAAGCACTATCTGGTTCTGGTAGGCAAAGCAATT CTTCTCCTTTTAATAATATCATTATTCATTCCATTCAAATCAAGGCCCTTTTAGGGTTTG GGTGTTTTATAACAGGAACAAAGGAAAAGACAGAAAGTGCCAACGTCATACTCGCAAAAA ATATATATAAAAATTAAAGGAAAAAAAAAATCAATTAAAATATTTTATTATGAGAAAATT TTGCCTGAACAAGTTGGATGATCCTTCCTAGTCCTTGCTTGGCCTAGTTGCCCTCCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGAGCCTTTTTCTTTCACTAGTAATTGCTTTTTTTTTT TTTTTAAAGCTTTTTAATTTCTATATTTGCCACCCCTTCTCTTATAGTCTGCCACTGTAA TCATCACCTCTTGTACGCTAATATCTGCTACCGAGCTACAGAAATTTTCTCTCTTTTTTT GGTTTTTTCATTTGCTGTTTGTCTATCTCTCACTTACTCTATCTAACTATATATATATAA AAATCTTTTTGTACACATCAATGGATAGAAAGGAGAGGGTTATTGGGTAGTGGAGAGGTT TTAAAGAAAAAAAACGTCTGTTCTTTCCATGTTTTGATTGCATGAAGAAATCTTGATGGG TTTGAAGAGAGGTTGGAAAGAGATACATCTGAATTGTGTTGCAGAGATGCTCAGACAAGC AATCCATGGCTAGATAGCGACTTCGAGAATAACCCATCATCATCATCTCTTCACGAGATC TTTTTTATTTGTATTTCTTTGCTTTTTACCTAGCTAGCTACCTCCCAGCGAATGATGTCC 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