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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006311 | Chr11 | 270543 | 271647 | + | Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1a |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006311.m1 | 91 | 275 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 79.3 | 3.20E-22 |
LITCHI006311.m1 | 92 | 276 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 59.3 | 3.90E-16 |
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>LITCHI006311.m1 ATGCCGGATAACGGCGTTGGCTTTTCACGAGGATATGTGTTGAATGCGAAGTTTGGGGAT TCTAATTTAAGCACTGCAGCTTCAAAACGAAAGAAAGCCCGTAAATCAGGAAAGAATAGT GGCAGTGCTGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAATGATGATGGACACGCTCTC GGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACAGACGACCTTAATAGACTGGTGGATTGTGGTGCT GATGGACGTACAGTTGGTAAGTTATTTGTGACAAATACCGAGATAGCCAAGGGAAGCAAT GGTACCATTGTCTTTGAGGGAATCCATGAAGGTCGGCCAGTTGCAGTCAAACGCCTTGTC CGAGCTTATCACGATGTGGCTTTTAAAGAAATTCAAAATCTTATTGTATCTGATAGACAT CCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTGTGTATCTTGCTCTG GAGCGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTGATTCAAATTTGTTTAGATCCATCCTTTGAG TGTAACCTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTACCATGCAGGATCTCAACTTGTGGAAAGCA AATGGCCATCCCTCACCTCTATTATTAAAATTGATGAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTG CATCTGCATGAGTTGGGAATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATT AGCGAAGGCAGAGGATCTTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAGGCACCTC CTTGCAGATAAGTCTTCTTTGAGTAATCATGCTACTGGCAAGTACCCTTTCCAGCTTAAT CAACATAATGCAATTTACTGTTACTTCCTCGAGATATATTGA
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>LITCHI006311.m1 MPDNGVGFSRGYVLNAKFGDSNLSTAASKRKKARKSGKNSGSADKNDKLISSENDDGHAL GDDSNKLFTDDLNRLVDCGADGRTVGKLFVTNTEIAKGSNGTIVFEGIHEGRPVAVKRLV RAYHDVAFKEIQNLIVSDRHPNIVRWYGVENDQDFVYLALERCTCSLDDLIQICLDPSFE CNLRLDSVKSTMQDLNLWKANGHPSPLLLKLMRDIVSGLVHLHELGIIHRDLKPQNVLII SEGRGSLCAKISDMGISRHLLADKSSLSNHATGKYPFQLNQHNAIYCYFLEIY.
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>LITCHI006311.m1 ATGCCGGATAACGGCGTTGGCTTTTCACGAGGATATGTGTTGAATGCGAAGTTTGGGGAT TCTAATTTAAGCACTGCAGCTTCAAAACGAAAGAAAGCCCGTAAATCAGGAAAGAATAGT GGCAGTGCTGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAATGATGATGGACACGCTCTC GGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACAGACGACCTTAATAGACTGGTGGATTGTGGTGCT GATGGACGTACAGTTGGTAAGTTATTTGTGACAAATACCGAGATAGCCAAGGGAAGCAAT GGTACCATTGTCTTTGAGGGAATCCATGAAGGTCGGCCAGTTGCAGTCAAACGCCTTGTC CGAGCTTATCACGATGTGGCTTTTAAAGAAATTCAAAATCTTATTGTATCTGATAGACAT CCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTGTGTATCTTGCTCTG GAGCGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTGATTCAAATTTGTTTAGATCCATCCTTTGAG TGTAACCTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTACCATGCAGGATCTCAACTTGTGGAAAGCA AATGGCCATCCCTCACCTCTATTATTAAAATTGATGAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTG CATCTGCATGAGTTGGGAATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATT AGCGAAGGCAGAGGATCTTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAGGCACCTC CTTGCAGATAAGTCTTCTTTGAGTAATCATGCTACTGGCAAGTACCCTTTCCAGCTTAAT CAACATAATGCAATTTACTGTTACTTCCTCGAGATATATTGA
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>LITCHI006311.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGGGATCAGCTACCAAAGAAGAAGATGCAATCATTGATTGGCTTTGTGTAATACGGCATT TCCTGTTGAAGATCAATTTGCTGAACAAAATTACCCTGAAACGATCCATGTTGCCGCCTG CCTGAGTTGTTAAAAGTTTGATCTAATCAAAGGTATCATGCTGAAGCACTATGACCTGGT TTTCCAGAGACTTGACAGATGAGCCTTGAATTCGAGTTAAACCCGCCTCCTTGACCTCTA AATCTTCCTCTGAACTGCTGAAATTGTGCATTCTCGAGTATAGTTGCTGGAAGATCTCCT TTAACCAGTATATTGGCAGATGCATTGGGAAGTTCCAAGGTGACATTATAAGCCAGTTGT TCCATTCTTGACTTGTAACTCATTAATAAAACCTGTGCCTTTTGCAGTATGATCTCTTCT CTTTTGGCAGTGATAGTTACTACCACTGGGTCAAACTCTGAACCTAAAACCCCCTAATAT GTAAGACACTAAATCCTGCTCAGAAACAACCTGACCCGCAGCTTGTAAAGCATCTGCTAT ACTCTTCATTTTAATCACATATTCATTAACATTTAAAGCCCCTTTCTTCTGTGATTGTAA CTGGTTTCTCAAATGCATGACTCTTGCCATTGATTGCTGAGAAAACAACTATACTAATGT GGTCCATACCTCATAGGCAGTCACACAATTGGTTACTTGCCCTAAAACTGATTCACTAGG AGTAGAAAGCAACCAGCAAACCAATAATTGATCTATTTTCTTCCAGTTAAGATACTCTGA TCATTAAAGACCTGAGTTGACTCACCCGATTCCTCATCTTCAATCTCCACATACTTGACA GGGCCCAAGATGTAATCCCCTAGGTCAAATGCCCGAATAGCTGGCATGATCTGCGCCTTC CAGTACATAAAATTATTCAGATCAAGCTTGATTGGAAGATTGAAATTTGAGACCAACCGC TGTTTCTTGGTGAGAACTGGCCTCTTTAGGTTGCACTTCTTTGCCTCATTTTGCTGCTGA GAGGAAGGTGGTGGTGAAAAATCCATGCCTCTGATCAAGAGCTCTGATACCATGTAAAAT TGATCTATCTTGAATACAAAAGAAAGCAATAACAGAATGAATAAAGAGAGAAAGAAGTTG AGAGATTTCCTGATTTCATTGCTTGATCTGTTCCACAACTTCACTAGTATTTATATACAG TTATAAGTGTCCAGGCAGCTAACAATAATAGCTGCTAGGTGTCCTTGATATATTGACTTC ACTAACTAACTTGATAGTCAGCTTAACTGACTTCGAGCTGGGAAGCTAGATCAACTACAT GCTGCAAGAAGCCACCAAGCAATCACAGTGTGCCAACTCTCTTAACCAATAAGAATTGCC TAGCCTCTCTATATGAACCGATAGCTTTTCAACAAGAAAATATAAAAATGATGGAATTCA GTCATTCCAATAAAATAATGGTGGAAGTCACTTAATTTACAACATATATATAAACCGTAA TTTACGCACAGCAACAATCTCATTCCTTTTTGCAACCCTAATCCCACACTAGCCAAGCAG TCACCCACAGTCGGCTTGAGGAGAGGAGAAGAGAGGAGAGGGGAACGGCGGCCAGAAGGC TGGTTTCGATGGCCATAACGGCTGATGATGTATGTTCGCGATTCTTGGCACGCCTAGACA ATGCCTTTTTTGCGGGTTCAGTTGTGATTTTTCTTGACACGCCTAGATGGAAACGCCTTT TATTCTGGGTGTTGGTTTTTTTTGTTTTTTCTGAGAAAAGCTGGGTGTGGGTTCTCGTTT TTGTGATTGTGATTTTAATTGAAACAACTAGATCTGAACACCTATCAGCCGGTGCGTTGT TTTTAATGTCTGTTTTTGAGAGATTCTGGTGGCCGTTACTATCGCTGATTTGCTGCGGCT TTTATATATTTAAGCGGTCAACTAAACTTTCTGTACATAATGATGAAGTATCTGGAAGTG TTGATACACATGATGAGAGA
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>LITCHI006311.m1 GenomeSequence + ATGCCGGATAACGGCGTGTCAGTCATTTCTAAGTGGTTAATTGCATTTTCAGTATTTTTA TCAATTGCAATTATTTACTACTGTGCTCTAGTGGCTTTTCACGAGGATATGTGTTGAATG CGAAGTTTGGGGATTCTAATTTAAGCACTGCAGCTTCAAAACGAAAGAAAGCCCGTAAAT CAGGAAAGAATAGTGGCAGTGCTGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAATGATG ATGGACACGCTCTCGGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACAGACGACCTTAATAGACTGG TGGATTGTGGTGCTGATGGACGTACAGTTGGTAAGTTATTTGTGACAAATACCGAGATAG CCAAGGGAAGCAATGGTACCATTGTCTTTGAGGGAATCCATGAAGGTCGGCCAGTTGCAG TCAAACGCCTTGTCCGAGCTTATCACGATGTGGCTTTTAAAGAAATTCAAAATCTTATTG TATCTGATAGACATCCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTG TGTATCTTGCTCTGGAGCGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTGATTCAAATTTGTTTAG ATCCATCCTTTGAGTGTAACCTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTACCATGCAGGATCTCA ACTTGTGGAAAGCAAATGGCCATCCCTCACCTCTATTATTAAAATTGATGAGGTTAGTAT TATAAGTCTTCGTTGATGTGATACCTTTGTACAAACACGAAATTTGCACTAGTATTATTT TTCTCTTTTTTCTTTTCTCCTTTATTTGGTGGCTCAGGACTTGAGTTGCATATCTAGTCA TTTGATCTGTCTGTAATGCAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTGCATCTGCATGAGTTGGG AATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATTAGCGAAGGCAGAGGATC TTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAGGCACCTCCTTGCAGATAAGTCTTC TTTGAGTAATCATGCTACTGGCAAGTACCCTTTCCAGCTTAATCAACATAATGCAATTTA CTGTTACTTCCTCGAGATATATTGA