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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006310 | Chr11 | 262640 | 267989 | + | Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1b |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006310.m1 | 494 | 802 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 128.8 | 2.60E-37 |
LITCHI006310.m1 | 495 | 797 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 71.4 | 7.40E-20 |
LITCHI006310.m1 | 626 | 696 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 25.1 | 7.20E-06 |
LITCHI006310.m1 | 808 | 934 | PF06479.15 | Ribonuc_2-5A | Family | 149 | 7.90E-44 |
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>LITCHI006310.m1 ATGAGACTGCCGCGCTTTTGCTTTGCTTCACCAGATGAAATGGGCCGCCTTTTTTTCTGG GTATTGTTATTTCTGCTGATTCATGGACTCTCCGGGTTTGGAAGCTCCGGACTTGATCAG GGCTCTTTGGTTTTGACCCGAACCGCTTCAAGATCCCTGCTCTCTCTTCCGCCTGCTGTT ACGAGAATAGGTGCTGGTTTGGATGGAACAATCTCTTTGAGAGATGGTAATGGGACAGAA ATTTGGAAACTTGCCACAGGATCACCAATCTACTCTAAATATCAAGCTCCTGTACATCAA GACAATGATGACGAAAATGCCTTTGAACCAAGTCACGGGTTTTCTATAGAGTGTGGAGAC GACTGGGGGTTGTTTGTAACTGATCGTCATGGTAGAAGAATGAAACTTGAATGGACTATT GAAGACTTCATTAAAAGAACGCCATACATATCAGAAGAAGGAGCAGTTACACTTGGATCT AAGATAACTACTGTGTTTGTCATCGAGGCCAAGACTGGAAAACTGATTCGGACTTACCAG TCTCCTGATTCTTTAACTGCACCACACAGTTATGAAGAGGAGAATGCTTTACATAAGTAT GATACAGTTGATAAAGAGCACTTGAAGTCTGGTTCAAGAAGTGCTGCTGAGCCGCCAAAC AAGGAGGTTCAACTCCTTTTTATTACAAGGACAGATTACATCTTCAAGTCCTTCCGTCCA AACTCACCCAAAACTTCCTGGAGTATGAGAGTTGCTGAAATCGGATATGCTTTTCTTTGT CAAGAAGTTGAGAATCCATTTATTACAGCTACTATGAATACAAGCTATGAGCTTGGTCCA GAAATTGGCAGTGATTTTGTTATGCCATTTGCATGTCAATCGAAAGGTGTAATTCAGCGA TTTCGAAAGCATGATAGTTCAGATTCTTCTGCTAGGGCTCATCTCCCGTTGCCATCTTCA TATGTAACTCTTCCTTCCCAGCCCAAGGTTGACAAAACAGTAGACAATCATAGTGAAACT ACAATTTCTCCAGCACCTAATCCGGACCCTGCACTTCCTGTGCAATCTGAATCTGATAAA TTGCCGAAACTACATCAGAACGGTGAAGTATCTGAAACTGTTGATACATATGATGGGAGA ATGCATTATAACAGCATGTCAATCATTTCTAAGTGGTTAACTGCATTTTCTCCATTTTTG TTAATTACAATTAGTGTTGGCATTGCTATTTACTACTGTGCTCTAGTAGCGAAAGGACAA TATCTGTCAAATGGGGAGTTAAGAACTGCAGCTTCAAGACGAAAGAAAGCCCGTAAATCA GGAAAGAATAGTGGCAGTGCCGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAGCGATGAT GGACACGCTCACGGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACGGACCTTAATAGACTGGTGGAT GGTGGTGCTGATGGACGTAGAGTTGGTAAGTTATTTGTGACCAATACTGAAATAGCCAAG GGAAGCAATGGTACCATTGTCCTTGAGGGAATCTATGAAGGTCGGCCAGTTGCTGTCAAA CGACTTGTTCGAGCTCATCATGATGTGGCTTTTAAAGAAATCCAAAACCTTATTGCATCT GATAGACATCCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTGTGTAT CTTTCTCTGGAACGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTTATTCAAATTTGTTTAGATTCA TCTCATAAGTCATCATCCTTTGATGAGGGCCAAACTACGAAAACTATGAGTGAGTATAAG CTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTATCATACAGGATCTCAACTTGTGGAAAGCAAATGGC CATCCGTCACCTTTATTATTAAAATTGATGAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTGCATCTG CATGAGTTGGGAATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATTAGGGAA GCCGAAGGATCTTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAAACGCCTCCATGCA GATATGTCTTCTTTGAGTCATCATGCTACTGGCGGCAATTTCTTCCTAACTACATTGCTA TGCACTGCGTATGCTACTGATTGTTGTGGCAGCTCTGGTTGGCAAGCACCTGAACAACTT CTTCATGGACGCCAAACTCGTGCAGTAGATTTGTTCAGTTTGGGTTGTGTCCTGTATTTC TGTATCACCGGTGGTAAACATCCATTTGGCGATCGTCTTGAACGTGATATCAATATTGCT AAGAACAAAGTGAACCTTTCCTTAGTGAAGTGGATCCCTGAAGCTGAGGATCTTATTTCA TGTTTGTTAAACCCTGACCCTCAACTGAGGCCAAGTGCATTGGAAGTGTTGCATCACCCT CTATTTTGGAGTTCTGAGACGAGACTCTCATTTCTACGTGACACAAGTGACAGGATAGAG TTAGAAGATAGAGAGACCAGTTCTGCTCTCCTGAAAGCATTAGAAAATACTGCATCAGTG GCACTGGGCACAAAATGGAATGAAAAGATGGAACCAGCATTCATTGCTAATATTGGCTAT TACCGACGTTACAGATTTGACAGCGTTAGAGACCTATTGAGAGTCATGCGAAACAAGTTG AACCATTATAGAGAACTTCCCAGAGAAATTCAGGAACTTGTTGGACCAGTTCCAGAAGGA TTTGATGAGTATTTTGCGAGTCGATTTCCAAGACTATTGATAGAAGTATACAAAGTTGTA TGCAGATACTGTAGGGAAGAGGAATGCTATCAGAAATACTTCAAGAGTGACATCCTTTAA
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>LITCHI016922.m1 TATTGTTGCCATGTGAATTGAATTGGGTCAGTTTGAAATTTCACTTAGATCACATATTTA TTCAACAATCATAACTTCCAAATAAGCCAACTGTAAACTAATATCAGAAAATAATTTTTT TTTATCAGGACCCAGAAACCTTATATGGGACCCATTTTTTGCTCTTCGTTGGGATCCAGA GAAGGCCATTGAAAAAGAGACCTCCAGTTCCCCATCCAGCTATCAACAAACTCAACTACA AAAGCCCATCTCTCCCTTTCTTCACTAGCACCACCATCCACCACAAACAACTCTCTCATT TTTTTTTCCCTCAGGCAGTTCCACAAACACTTTTCCAAGAAACGTTTCGGTGTTTTTTTT TTGTTTTTGTTAACAATGGCCAGACCGCAGCAGCGATATAGAGGCGTTCGACAAAGGCAT TGGGGCTCTTGGGTATCCGAAATCCGCCACCCGTTATTGAAGACTAGGATTTGGCTAGGC ACATTTGAAACGGCTGAGGATGCCGCGAGAGCCTATGATGAGGCTGCAAGGCTTATGTGT GGACCAAGAGCAAGAACCAATTTCCCATACAACCCAAATGCGTCACAGTCTTCTTCATCA AAGCTTCTCTCTGCAACTTTGACTGCTAAGCTACACAGGTGCTACATGGCCTCACTTCAG CTGACCAAATCATCCAATCACGAGCAGCCTCAAAAGACCCCATCTTCACAAGTCATGGTA GCCACCAACAGCATTGCAGGAAGAGGCAGCGAAATGGGTTGTGGTGGCGGTGGCGGTGGA GCAGCAAGGTTGCTAGAGACAAGACCACCAGTTGTGTCACTACAAGAGAGCACTATTAAT GAGCCAAATTGGCTGGTCAAGCAAGTAAAAGTCGAAACCTCCCAGCAGTTCAAACCACTT GAAGATGATCACATAGAGCAAATGATTGAAGAGTTGCTCGATTATGGTTCTATGGAGCTC TGCTCTGTTGTGCCACCTCAGGCTCCTGTAATGTAGTAGACTAAAAACATCTCAAAAAAG CCACCTTTTTTCTTTTCCTGTACCCTCTCTATGTGCCTCAAAAAATTCAGCTAATGCCAC TCATTTGCTAATTTAACCCCATTTTTATTAGCCTTGTTAGAGTCTTCTCTTTTTATTGAA GTGTAGTAGACTGTTTAGACCATCTAGACCATCTCCTGGTTCCTGGAATTATCTCCTGAG TGATCACATTTGAAGAAGAAGAAGCTTCATGTTAATGTATATACAGTGCAATTTATGTTA TTATATTATGCTATTATTATCAACTTTGTGTGTCTTCTTCTTTGAGGTGTCATTTTAGTT GAAATTGTAGTGCCATTAAATAGTATAGTGTTATAAAAAAAATAATAATAACCCTTTTTC AACACAAA
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>LITCHI023041.m1 - Up_Stream_Len 2000 CCAACTCCACACAACGACTTCTTTCAAGGATAATTATTTTGGTTCAAAAGGTTTGTTAGT TTACAACTTAATTTTTCTCCGGATTTGAGTATTTATCTATTAACCTTAACGATTTTATAA TTATGATTAGTTATTATTAAATAAAAAATAATTAAATCTAGCAATTTTTTTTTTGACATA AGCAATTATTGTTATGATTAATGTTAATAGAACTTTTCAATTTCAAGAGAAACTCGAATA AAGAAAAAAGGATTTTGAATATGTTGATATTTAACACCCTTACAAATCTTTAACTGTACA CTAGATTATTAATAATCGTAATTTTTTCCATTAAGACAATGGAGGTTGAATTTCAACCAA GCACATTTTGTATATTTGTATAAGTAGTTTTGTTCCCTTATTACAATTGTTCAATATTAT GAGAATAAATATCTTGAGTTGTGTATGTAATGATGGGATTAAGATATATTATCTATTTGG AGTCTAATAAAAAAATCACATAATTTTAAAAGGATTGTACAATTTATAGTAAAACTCTTA CTTATGGCAAATGTCATGATAGTTAATTTGCAATTTTATATAATTTTTATCAAAAAATTG TAATAATTACAAATATCTTGGTGATATCATTCTAATAAATAAAATTACGTCATGAATTTA GACTACATTTGATATACGGGATTATAATGAAATGTTTGAATTGGAAAATTACTATCCCAT GTTCAATAGAGCTTGAAATTATTTAATTATATCATATTATATTCGATATAGGTTGAGATT GAATTGAAATAAATTTATTTAAATATATAAAATACTTAAAATTAATTTAAAAAAAATTCT TTAGAAATTTGAAAAAAAAAAAGTAGAGTATACTTATTTCTAACTCATCAAATCCCATCA TTTTAGTTGGAAATAAACATTTCATGAGATGAAGATTTGAAAGAGTTTGAGATTAGGTTT GAAATCATACTCATCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAACACATGAACTGTATCTGGGACA AACCCAGGAGACATCCGGGACCAACCGAGATAAGACACTAGTAGCACGGCCCGGGAGACT ACTCCCAATTAGGAGATTACTACCCACACGAAAGTGGAGGGAAGACCCACACTAGGGTGG GAGCTACCCACATAATTGGTGGGACTAAATACTATTATATTATTATTATTATTATTATTA TTATATAGATTATTATATTATTTATTATTATTTAATATTATACAAATAGGGGTGTCGAAC CCTGCCCCCTTACAAAGGGAGGCAGGGCTGGCTGCTAGCGCTACCACTGCGCCAGCGGTC AGTTGACATGCTCATCGTTTTTTAAACATGAGATTTGAGAGTTCGATATATTTTGAATAT CAAACCCACCACAAAACTCATATTTCAAATGTTGCCTTAGTGTAATGACAATTTTACTAT GTATTGTAAAAGATTTATACCAACCATGGAGACTAATAATTTAGCTAGACTTACTATTTT AATTGATGACGAAGTAACTTGGATCGGAATATACGAATATCCATTGTGTTTTGTAATATT GGTAAATATTTGAAAATTCATCGAATACTTGCAACTTAGATCAACTTAACAAAACAATAA TTCGTGATTAGCGATTTGATAAAATATTTTGTTTCAAATTCAATTCAGTTAATAAATAAA TTAGTGAAAGAAAATTACAATAAGTTGAAAAAAAGTTAGCGTAAATGAAGGGAGAGTGGT ATATAAAAGACCACCACTCAACTCACATTCTCTCTTCCCTCTCTCGTTGTTCAACTCCGT TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTATTTCAAACTCTCTTCTTCATCCAGTTTTCTCT CTCTAGAAAATTTTGCAACTTGAAAGTAGTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCCCTTCTTCA ATGTCGGTTTTGGCAGCCCTGCAACCATGGTAGGGCTGCACGCCAGTTTAAGCAAACCCT AGTGTCGTTGAATCGAGAAG
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>LITCHI023041.m1 GenomeSequence - GATTTGATAAAATATTTTGTTTCAAATTCAATTCAGTTAATAAATAAATTAGTGAAAGAA AATTACAATAAGTTGAAAAAAAGTTAGCGTAAATGAAGGGAGAGTGGTATATAAAAGACC ACCACTCAACTCACATTCTCTCTTCCCTCTCTCGTTGTTCAACTCCGTTTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCACTTATTTCAAACTCTCTTCTTCATCCAGTTTTCTCTCTCTAGAAAATT TTGCAACTTGAAAGTAGTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCCCTTCTTCAATGTCGGTTTTG GCAGCCCTGCAACCATGGTAGGGCTGCACGCCAGTTTAAGCAAACCCTAGTGTCGTTGAA TCGAGAAGATGGTCTTCAAGAACAAGCTCTTCTTCTCCTCCTCGTCGAAGAAATCCGACT CTTCCAGCCCGGACGGGTCCTCCAACAGCCCCCGATCTTTCGGATCATCCAACTCCCCGA TCCGATCCGACAAGAAGAAGCCCAAATCTTCATCCAAAGACGAGACGCCTACCTCCAGTT TCACTTGCAGAAAAACGCAGGTCAAAGATGGGCTCAAAAAGAAAGATGCCAAAGCCAAAG AAACCGCCCACAAACCAACTGCTACCACTAGTATTAGTACAACAACAACCCCAACTAAAT CCGCCAAGGCTGGATTGGATTCCTCTAAAAAGGAAGTGCCGAATTCCGTTTCTCCGATAC TGGCCTCCTCTCTGGGGCTCAATCGGATAAAGACTCGCTCCGGGCCCTTGCCTCAGGAGA GCTTCTTTAGTTTCAATAGAACAGATAGTAATAAGGGTTCTTCTGTTGTGGCCGCCAGTA ACCTGTCGAGGGCTGCTGGCGGCGGCAAGAAGAAGGAGGTCGCCAGTAATAAAGTGGGGT 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