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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006239Chr142325864323264792;23264940+"Protein indeterminate-domain 5, chloroplastic "

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI006239.m17496PF12171.11zf-C2H2_jazFamily243.70E-05
LITCHI006239.m27496PF12171.11zf-C2H2_jazFamily243.70E-05
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LITCHI006239.m57496PF12171.11zf-C2H2_jazFamily243.70E-05
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LITCHI006239.m87496PF12171.11zf-C2H2_jazFamily243.70E-05
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>LITCHI006239.m1
ATGAATATGGCTACTTCTTCATCGTCGGCACCTTTCTTTGAAATTAGAGAAGAAGATCAA
AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
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GGACATGTGCAAGATCAAAACACATATGGTGGATTCAATGCAAACAGGAATAGCATAGAA
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CAACACCACCACCAACATGGACTTGATGTGAGTTCCTTGGATTCAGCAGAGAGAAATGTC
TCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAGTGA
>LITCHI006239.m10
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TGTGATGCACTGGCTCAAGAAAGTGCACGACACCCACCCACTTTGAGCGCCATTGGCAGC
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TCCCGCTCCACCCAATTCGACCATCTTCTTCCTCCATCAATCGGTTCATCAACGTTGTTT
CGACCACCACCACCACATACCATGGCTTCACCTGCCTTTTTTATGCAAGAATCAAACCAC
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AGAAATGTCTCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAG
TGA
>LITCHI006239.m11
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TGTGATGCACTGGCTCAAGAAAGTGCACGACACCCACCCACTTTGAGCGCCATTGGCAGC
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TCCCGCTCCACCCAATTCGACCATCTTCTTCCTCCATCAATCGGTTCATCAACGTTGTTT
CGACCACCACCACCACATACCATGGCTTCACCTGCCTTTTTTATGCAAGAATCAAACCAC
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GGCGTTGAAGGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCC
GGTGTGCCTTCGCTCTTCAGCTCATCAGTTCAAAACGACAACAACATAGTCTCGCACATG
TCTGCCACAGCACTGCTCCAAAAGGCTGCTCAAATGGGCTCACATTCCAGCAGCAACAAC
ACCGCTTCTTTGCTCAGGAGTTTTGGTAGCTCTTCTTCAAGTGCCTCCAAACCCAACTTT
ACTGGCATCTTTGGCGGCGAAAACGATAACAACCTGCAAGACCTAATGAACTCTTTTGCT
GCTGCTGGTAGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCGTCTGCAGGAGAAGTCAATGCA
TATAGTTCTGGACATGTGCAAGATCAAAACACATATGGTGGATTCAATGCAAACAGGAAT
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AGAGAAAAACAACACCACCACCAACATGGACTTGATGTGAGTTCCTTGGATTCAGCAGAG
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TGA
>LITCHI006239.m12
ATGGATTTGTTGACCAATAATTGGTGCAGGCGCGACAGTTTTATCACACACAGAGCCTTC
TGTGATGCACTGGCTCAAGAAAGTGCACGACACCCACCCACTTTGAGCGCCATTGGCAGC
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TCCCGCTCCACCCAATTCGACCATCTTCTTCCTCCATCAATCGGTTCATCAACGTTGTTT
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GGCGTTGAAGGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCC
GGTGTGCCTTCGCTCTTCAGCTCATCAGTTCAAAACGACAACAACATAGTCTCGCACATG
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ACTGGCATCTTTGGCGGCGAAAACGATAACAACCTGCAAGACCTAATGAACTCTTTTGCT
GCTGCTGGTAGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCGTCTGCAGGAGAAGTCAATGCA
TATAGTTCTGGACATGTGCAAGATCAAAACACATATGGTGGATTCAATGCAAACAGGAAT
AGCATAGAACCGAAATTGCACCAAAATCTTAATATAAGCAGTGGAGGATCTGATAGAACA
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AGAGAAAAACAACACCACCACCAACATGGACTTGATGTGAGTTCCTTGGATTCAGCAGAG
AGAAATGTCTCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAG
TGA
>LITCHI006239.m13
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TGTGATGCACTGGCTCAAGAAAGTGCACGACACCCACCCACTTTGAGCGCCATTGGCAGC
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TCCCGCTCCACCCAATTCGACCATCTTCTTCCTCCATCAATCGGTTCATCAACGTTGTTT
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AATCTCTTCAACCTCAACTTCCACTCAAACAGTAGCACCACCACAAGCAGCTTAAATAAC
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GGCGTTGAAGGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCC
GGTGTGCCTTCGCTCTTCAGCTCATCAGTTCAAAACGACAACAACATAGTCTCGCACATG
TCTGCCACAGCACTGCTCCAAAAGGCTGCTCAAATGGGCTCACATTCCAGCAGCAACAAC
ACCGCTTCTTTGCTCAGGAGTTTTGGTAGCTCTTCTTCAAGTGCCTCCAAACCCAACTTT
ACTGGCATCTTTGGCGGCGAAAACGATAACAACCTGCAAGACCTAATGAACTCTTTTGCT
GCTGCTGGTAGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCGTCTGCAGGAGAAGTCAATGCA
TATAGTTCTGGACATGTGCAAGATCAAAACACATATGGTGGATTCAATGCAAACAGGAAT
AGCATAGAACCGAAATTGCACCAAAATCTTAATATAAGCAGTGGAGGATCTGATAGAACA
ACTAGAGACTTCCTCGGAGTGGGACAAATAGTTAGAAGCATAAGTGGAGGGTTTTCTCAA
AGAGAAAAACAACACCACCACCAACATGGACTTGATGTGAGTTCCTTGGATTCAGCAGAG
AGAAATGTCTCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAG
TGA
>LITCHI006239.m2
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AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
CCACCACCCCCGAAGAAGAAGAGAAACCAACCTGGAACACCAAATCCAGATGCGGAGGTT
ATAGCACTATCTCCCAAGACACTAATGGCAACAAACAGGTTCATATGTGAGGTGTGCAAT
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AAGCTAAAGCAGAAGAGTACAAAAGAAGTGAAGAGGAAGGTGTATCTGTGCCCTGAGCCC
ACATGCGTCCACCATGACCCTTCTAGGGCTCTTGGCGACCTTACTGGCATCAAAAAACAC
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GTTCAATCTGATTGGAAAGCCCATTCTAAGACTTGTGGCACCCGAGAATATAGATGTGAC
TGTGGCACTCTCTTCTCAAGGCGCGACAGTTTTATCACACACAGAGCCTTCTGTGATGCA
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AAAGACCAAACCAGCCAATCTGGTGACATTTTACGCCTCGGCGGTGGTGGTTCCCGCTCC
ACCCAATTCGACCATCTTCTTCCTCCATCAATCGGTTCATCAACGTTGTTTCGACCACCA
CCACCACATACCATGGCTTCACCTGCCTTTTTTATGCAAGAATCAAACCACAACTATCAA
GAAGACCACAATTCTCAACAAGGGTTGCTCCCAAACAAGCCATTCCATGGACTAATGCAC
TTCTCCGACCTTCAAAACAACACAAACAATACACCACCCTCCGGAGCCAATAATCTCTTC
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GCCAACACCAATCTGCAGTCTTCAAGTTTACTCATGTCCAGCGCCGGCAGCGGCGTTGAA
GGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCCGGTGTGCCT
TCGCTCTTCAGCTCATCAGTTCAAAACGACAACAACATAGTCTCGCACATGTCTGCCACA
GCACTGCTCCAAAAGGCTGCTCAAATGGGCTCACATTCCAGCAGCAACAACACCGCTTCT
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TTTGGCGGCGAAAACGATAACAACCTGCAAGACCTAATGAACTCTTTTGCTGCTGCTGGT
AGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCGTCTGCAGGAGAAGTCAATGCATATAGTTCT
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CAACACCACCACCAACATGGACTTGATGTGAGTTCCTTGGATTCAGCAGAGAGAAATGTC
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>LITCHI006239.m3
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AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
CCACCACCCCCGAAGAAGAAGAGAAACCAACCTGGAACACCAAATCCAGATGCGGAGGTT
ATAGCACTATCTCCCAAGACACTAATGGCAACAAACAGGTTCATATGTGAGGTGTGCAAT
AAAGGATTCCAAAGGGAGCAAAACCTACAGCTACACAGAAGAGGACACAACCTGCCTTGG
AAGCTAAAGCAGAAGAGTACAAAAGAAGTGAAGAGGAAGGTGTATCTGTGCCCTGAGCCC
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TACTCTCGAAAACACGGTGAGAAGAAATGGAAGTGTGAGAAATGCTCCAAGAGGTATGCT
GTTCAATCTGATTGGAAAGCCCATTCTAAGACTTGTGGCACCCGAGAATATAGATGTGAC
TGTGGCACTCTCTTCTCAAGGCGCGACAGTTTTATCACACACAGAGCCTTCTGTGATGCA
CTGGCTCAAGAAAGTGCACGACACCCACCCACTTTGAGCGCCATTGGCAGCCATTTATAT
GCAAGCAGCAACAATATGGGTTTAGGCTTATCTCAAGTGGGTCCTCAACTTACATCAATA
AAAGACCAAACCAGCCAATCTGGTGACATTTTACGCCTCGGCGGTGGTGGTTCCCGCTCC
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CCACCACATACCATGGCTTCACCTGCCTTTTTTATGCAAGAATCAAACCACAACTATCAA
GAAGACCACAATTCTCAACAAGGGTTGCTCCCAAACAAGCCATTCCATGGACTAATGCAC
TTCTCCGACCTTCAAAACAACACAAACAATACACCACCCTCCGGAGCCAATAATCTCTTC
AACCTCAACTTCCACTCAAACAGTAGCACCACCACAAGCAGCTTAAATAACTCCAACAAT
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GGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCCGGTGTGCCT
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TCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAGTGA
>LITCHI006239.m4
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AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
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CCACCACATACCATGGCTTCACCTGCCTTTTTTATGCAAGAATCAAACCACAACTATCAA
GAAGACCACAATTCTCAACAAGGGTTGCTCCCAAACAAGCCATTCCATGGACTAATGCAC
TTCTCCGACCTTCAAAACAACACAAACAATACACCACCCTCCGGAGCCAATAATCTCTTC
AACCTCAACTTCCACTCAAACAGTAGCACCACCACAAGCAGCTTAAATAACTCCAACAAT
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GGGTCCAACAACCTCTTCTCAAACAGCATAATCAATGACCAAATCAGCTCCGGTGTGCCT
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GCACTGCTCCAAAAGGCTGCTCAAATGGGCTCACATTCCAGCAGCAACAACACCGCTTCT
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>LITCHI006239.m5
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AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
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ATAGCACTATCTCCCAAGACACTAATGGCAACAAACAGGTTCATATGTGAGGTGTGCAAT
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>LITCHI006239.m6
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AACCAGATGAAGCAGCAACATTCTTCAACACCAACTACATCATCAGCTCAAACACCAGCT
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AAGCTAAAGCAGAAGAGTACAAAAGAAGTGAAGAGGAAGGTGTATCTGTGCCCTGAGCCC
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>LITCHI006239.m7
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AAGCTAAAGCAGAAGAGTACAAAAGAAGTGAAGAGGAAGGTGTATCTGTGCCCTGAGCCC
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GTAGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCGTCTGCAGGAGAAGTCAATGCATATAGTT
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ACTTCCTCGGAGTGGGACAAATAGTTAGAAGCATAAGTGGAGGGTTTTCTCAAAGAGAAA
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TCTCTGCCCCGACAAGCCAATCTTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGGAGTTTTCAGTGAAGAA
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CCAAACAAGCCATTCCATGGACTAATGCACTTCTCCGACCTTCAAAACAACACAAACAAT
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GACCTAATGAACTCTTTTGCTGCTGCTGGTAGCTCCTCATCGATATTCGGTGCAGCTGCG
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TGGTACCACTTTGCCGGGAGAAAGAATATTTGAAGCCCCCACCGAGATGGGACACTTTTT
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CGTTACTTTCTGAAAGTTCGAAAAGGTAAACGCCTATTAGAAATTTAGTTATGTTCGAGG
TTACGCTTGACATATTTACTCACTGTTGTTATTTACTGTGAATCATATAAAAAAATAATA
TATAAATTTTCAAATTTGGACTGCCTTCGTCTTCTTCTCCTTATTTATTATTATTTTGTT
AATTGCGACCAATATTATTCAGCACAGACTAGACTATAAAAAAAAATTGTATAAATATAT
GTGTTAAATGTGTATATCTTTCTTCAGTGCTTATACAAGTTCAATTCAGACAATATGATT
GGAAAATGAGACGTGGTTATTTAAATGAAAACCTTTGTTTATTACTTCATCAATTTTGAC
CAGATCAAGTCAAGAGCCACAAAATGTGTCATAGAGTATAGGATTATTTTCCACCATAGA
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GCGACCTTACTGGCATCAAAAAACACTACTCTCGAAAACACGGTGAGAAGAAATGGAAGT
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TGAGCGCCATTGGCAGCCATTTATATGCAAGCAGCAACAATATGGGTTTAGGCTTATCTC
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>LITCHI006239.m2
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CGTAGCACGGAGGTGATTTA
>LITCHI006239.m16 +  Up_Stream_Len 2000
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CGTAGCACGGAGGTGATTTA
>LITCHI006239.m14 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI006239.m15 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI006239.m9 GenomeSequence + 
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>LITCHI006239.m3 GenomeSequence + 
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GTCTGCCACAGCACTGCTCCAAAAGGCTGCTCAAATGGGCTCACATTCCAGCAGCAACAA
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