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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI006184 | Chr14 | 21371409 | 21375501 | + | Protein TRANSPARENT TESTA 16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI006184.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 83.2 | 7.10E-24 |
LITCHI006184.m1 | 81 | 167 | PF01486.20 | K-box | Family | 77.9 | 5.50E-22 |
LITCHI006184.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 83.2 | 7.10E-24 |
LITCHI006184.m2 | 81 | 167 | PF01486.20 | K-box | Family | 77.9 | 5.50E-22 |
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>LITCHI006184.m1 ATGGGACGCGGGAAGATACAAATCAAGAAAATTGAGAATTCGACCACAAGGCAAGTGACG TTTTCAAAGAGGAGATCTGGCCTTTTTAAGAAAACTCATGAGCTCTCAGTTCTTTGTGAT GCACAAATTGGTCTCATTGTCTTCTCAAGCACTGGAAAGCTCTCTCAGTACTGCACTGAG CCTTTCAGAATGGAGCAAATGATTGAAAGGTACCAGAAGGCTACTGGCACTCGCATTCCT GAGCACGATAATCGGGAACTATTATACAATGAGTTGGCAGTACTGAGAAAAGAAACTCGC CGTCTTGAATTAAGCATGCGATGCTACACTGGTGAGGACTTGAGCTCTATACCATATGAG GATCTTGATGGACTCGAACAACGTCTTGAGCGCTCTGTGAACAAGGTCCGAGACCAGAAG AATGAGCTCCTTCAACAGCAGCTTGATAATCTACGTAGAAAGGAGAGAATGTTGGAGGAA GAAAACAGCAACATGTTCCGATGGATTCAGGAGCACCAGGCAGCATTTGGGTATCAGCAA GCAGCAGTACAAGCAAAGCCAGTGGAGACTCAACAAATCCTGGAACAGTTTCCATTCTGT GGAGAGCAACCGAGTAGTTTCCTACAGCTTTCAACTACTCAAATGCACCACCCTTATCAT CATCTTCAGCTTGCTCAACCCAACCTTCAAGGTTCCAATATTTAG >LITCHI006184.m2 ATGGGACGCGGGAAGATACAAATCAAGAAAATTGAGAATTCGACCACAAGGCAAGTGACG TTTTCAAAGAGGAGATCTGGCCTTTTTAAGAAAACTCATGAGCTCTCAGTTCTTTGTGAT GCACAAATTGGTCTCATTGTCTTCTCAAGCACTGGAAAGCTCTCTCAGTACTGCACTGAG CCTTTCAGAATGGAGCAAATGATTGAAAGGTACCAGAAGGCTACTGGCACTCGCATTCCT GAGCACGATAATCGGGAACTATTATACAATGAGTTGGCAGTACTGAGAAAAGAAACTCGC CGTCTTGAATTAAGCATGCGATGCTACACTGGTGAGGACTTGAGCTCTATACCATATGAG GATCTTGATGGACTCGAACAACGTCTTGAGCGCTCTGTGAACAAGGTCCGAGACCAGAAG AATGAGCTCCTTCAACAGCAGCTTGATAATCTACGTAGAAAGGAGAGAATGTTGGAGGAA GAAAACAGCAACATGTTCCGATGGATTCAGGAGCACCAGGCAGCATTTGGGTATCAGCAA GCAGCAGTACAAGCAAAGCCAGTGGAGACTCAACAAATCCTGGAACAGTTTCCATTCTGT GGAGAGCAACCGAGTAGTTTCCTACAGCTTTCAACTACTCAAATGCACCACCCTTATCAT CATCTTCAGCTTGCTCAACCCAACCTTCAAGGTTCCAATATTTAG
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>LITCHI006184.m2 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTGACAAAAATGCCCTTTGGAAAAACTAAATTCACCTTCTCCAATTTCTTTTATTAT AGGAATCACTCTATTCTCCATCCGACATCTTCTCTAATGAACTTTCTCCCTTCTCCATCC AACATCTCTCTCTTATTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTCTCTTCCATTTCCACCGAAAAGT GATGTTCCTCTTCGGAAAAACACAAATCTACAACTAATAGTTTAAAATTAGTTGAGTCAT TGCCTTTCACTTTCGGTTTATTGGTTGCTAATAGTTTAAAATTAGTTTTGAAATTCATGA AGTTTTTTGAAAATTGAAATTTATGAAGTTAATTGCTAATTCGTATACTTTGATGTGAGT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGACTTACTCAATAAACCATTAGAATTACGGGAATA TAAGAAGTTGATTCTTGAATTTAACTGATGGATCTCTCAGGAGAAGACAACTATGAATCG GCCAGCTGTTATAGCACTCACATTTATTAGTGCGACAAATTTTTATTGATGGAGAAATTT CTAAGATATACAACTATGTGACACATGAAACAAAACTATTTCCACAATTTTCCTCTAATG ATCAGTGTCTGAAACCTTTAATTTGAATCTAATATTCGATGACTCCGAGTCTTGAAAAAC TAATCTCTTTTACATATCTAAAGAGCTAATTAAGGCCTTGTAAACCAACCATAAACTTCA AATTTGTTAGAAGTGAGAATCAAAAACTATGATGTGAACTCATATTTGTACATTTACAAA CTAAACAAGAGAAATATATAAATTGAACATATATATATCTACAGTCAAATAAGTTGGTGA AGATGGAATGTTGTAGAGTTATCTAAACTCTGACCAAGTAGAAAGACATTAATTATCCAC TTAATTGCTAAGATGGTAAGTGAGGCCTGGCTGAAAATATTATGATCTTAGCTGGGATTG TTACATGCAGTTTGTCGTTTCCCAATTCACATTAGCCAAATGCACATCTTGGCATTGTAA CCTTAGTTTCCTAACCATTGTTGAATGTTAAATCTTTCTCAATTTGGAAAAATTTAGGTC TCTTGTACAGATAAGAGCAGGGACTGGTTAAAAGGCACATCAACCCTTTTGTTCCGGCTG TCGTAAGATAAAAATAGAGGGCATATTTCTCTTGACAAATTACAGACACTGCCATCCATC AATGCATCTGTGTAGCCCTAGTCATGTTCCTAGATACATATGGTTTGGTGACTAGTCAAT GACCATGAAACAATTAATTCTTTATTGAAGTCATAATAAAAATATATCTCAGGTTTTATG TTGTGGGTTTATAAACAGTAAAATACGTCATCAAGTACTTTTAAGATATTATATAAGGTT GGGGCAACTTGAACTAAGGATATTATCAAATTATATGATTTTTTTTTAATCACCAAACTA TATTGGTGTATAATATATATTATCATTAATTTAACATATTAATAGAATTTATAAAATTAA TATGTCAAAAAGACAATACACTAAAATGGCACTCATTACATTCACTAACAATTTTCAATG TGTGTAACGATCAATGAGAACCAAACTACCAAAGGTTAAGCTAGGGTACGTGATGCTTGG GGGGCATTTTTGTAGTTTGCTTGAATTAAAAGGACTAAAAGTCAAAAGCAAATAAGGTGG TTTGCATGTATACATAAATAAATCAACTTCCACTGCGAACTCTCCCAAAATTACAAGCAA AAGAGAAGAAAAGATCAGGTCAGTCAGGCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTC TTATTTTCTACATTTTTATGAAATATACAGATAACAGCAATTGTTCTTATTTTAGGTTTT AGAAGTTTTATACCTACCATAGTCTTCATTTTAGTTTAAATTTTTATTGATTATAATGAT GAGGTTGCTATATATAATTTCCTGAAATTTTACATTTCCTTAAGGTCAAGTGATAGATCA CAAGATTTAAGGGTGATAAT >LITCHI006184.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTGACAAAAATGCCCTTTGGAAAAACTAAATTCACCTTCTCCAATTTCTTTTATTAT AGGAATCACTCTATTCTCCATCCGACATCTTCTCTAATGAACTTTCTCCCTTCTCCATCC AACATCTCTCTCTTATTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTCTCTTCCATTTCCACCGAAAAGT GATGTTCCTCTTCGGAAAAACACAAATCTACAACTAATAGTTTAAAATTAGTTGAGTCAT TGCCTTTCACTTTCGGTTTATTGGTTGCTAATAGTTTAAAATTAGTTTTGAAATTCATGA AGTTTTTTGAAAATTGAAATTTATGAAGTTAATTGCTAATTCGTATACTTTGATGTGAGT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGACTTACTCAATAAACCATTAGAATTACGGGAATA TAAGAAGTTGATTCTTGAATTTAACTGATGGATCTCTCAGGAGAAGACAACTATGAATCG GCCAGCTGTTATAGCACTCACATTTATTAGTGCGACAAATTTTTATTGATGGAGAAATTT CTAAGATATACAACTATGTGACACATGAAACAAAACTATTTCCACAATTTTCCTCTAATG ATCAGTGTCTGAAACCTTTAATTTGAATCTAATATTCGATGACTCCGAGTCTTGAAAAAC TAATCTCTTTTACATATCTAAAGAGCTAATTAAGGCCTTGTAAACCAACCATAAACTTCA AATTTGTTAGAAGTGAGAATCAAAAACTATGATGTGAACTCATATTTGTACATTTACAAA CTAAACAAGAGAAATATATAAATTGAACATATATATATCTACAGTCAAATAAGTTGGTGA AGATGGAATGTTGTAGAGTTATCTAAACTCTGACCAAGTAGAAAGACATTAATTATCCAC TTAATTGCTAAGATGGTAAGTGAGGCCTGGCTGAAAATATTATGATCTTAGCTGGGATTG TTACATGCAGTTTGTCGTTTCCCAATTCACATTAGCCAAATGCACATCTTGGCATTGTAA CCTTAGTTTCCTAACCATTGTTGAATGTTAAATCTTTCTCAATTTGGAAAAATTTAGGTC TCTTGTACAGATAAGAGCAGGGACTGGTTAAAAGGCACATCAACCCTTTTGTTCCGGCTG TCGTAAGATAAAAATAGAGGGCATATTTCTCTTGACAAATTACAGACACTGCCATCCATC AATGCATCTGTGTAGCCCTAGTCATGTTCCTAGATACATATGGTTTGGTGACTAGTCAAT GACCATGAAACAATTAATTCTTTATTGAAGTCATAATAAAAATATATCTCAGGTTTTATG TTGTGGGTTTATAAACAGTAAAATACGTCATCAAGTACTTTTAAGATATTATATAAGGTT GGGGCAACTTGAACTAAGGATATTATCAAATTATATGATTTTTTTTTAATCACCAAACTA TATTGGTGTATAATATATATTATCATTAATTTAACATATTAATAGAATTTATAAAATTAA TATGTCAAAAAGACAATACACTAAAATGGCACTCATTACATTCACTAACAATTTTCAATG TGTGTAACGATCAATGAGAACCAAACTACCAAAGGTTAAGCTAGGGTACGTGATGCTTGG GGGGCATTTTTGTAGTTTGCTTGAATTAAAAGGACTAAAAGTCAAAAGCAAATAAGGTGG TTTGCATGTATACATAAATAAATCAACTTCCACTGCGAACTCTCCCAAAATTACAAGCAA AAGAGAAGAAAAGATCAGGTCAGTCAGGCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTC TTATTTTCTACATTTTTATGAAATATACAGATAACAGCAATTGTTCTTATTTTAGGTTTT AGAAGTTTTATACCTACCATAGTCTTCATTTTAGTTTAAATTTTTATTGATTATAATGAT GAGGTTGCTATATATAATTTCCTGAAATTTTACATTTCCTTAAGGTCAAGTGATAGATCA CAAGATTTAAGGGTGATAAT
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