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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI006142Chr142060067820603403+Serine/threonine-protein kinase prpf4B

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
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>LITCHI006142.m1
ATGAGGGCATATGCAAAACAGCTTTTTATTGCCTTGAAGCATCTCAAGAACTGTGGTGTT
CTTCATTGTGATATAAAGCCAGATAACATACTGATTCTTCAATGCAAAGAATATTTTGGC
CAGTATGGGAAGTTTGATGACTTATATTGGATTGAATTTCTACCACCGATACTTAACATG
GGAGCAGCACATGCAGCAGGGAGCACTGTTCCAGATCCAACATCTAGATGCTTGCAAGAG
ATTGTATTGAGCACAAGTAACCTGAAGCGTTTGGTGGAGCAGTCTGCGAATGATCCTAAT
AACTTTAAAAGCCAGGTGTAA
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>LITCHI018977.m1
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APPPPHTQHFVGIPTTTQDDNISPLHGLLPRVHYNLYNPNYPTPPARDTPRAKQGLSLSL
SSQQQTGYGSQGGQGQAISGEDMRVSGGSASSGSGVTNGVSGMQSVLVSSKYLKAAQELL
DEVVNVNSSGINTKSEFSKKGSGNNITANNKEIGESSVTAGDGGEAAGKRAADLTTAERQ
EIQMKKAKLISMLDEVEQRYRQYHHQMQIVISSFEQAAGIGSAKTYTSLALKTISKQFRC
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>LITCHI018977.m2
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>LITCHI018977.m3
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>LITCHI018977.m4
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>LITCHI018977.m5
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>LITCHI008482.m1
CCATGTTTTGCCAATCCTTTTGATTTCAAAGGCAATGCAACAGTAAAAAGGGACACCTCC
AATGGGGACATGGGACGTATCGTACACCGCAGGATAGTGGAAGACACGCGGTACAAAAGC
GAGTGAGAGATAGAGTTAAAACGAGGGGATTATTTTAATGTGAAAAAAGTGGGTTTTGAG
TCGTAACTTCCTTGAATGTGGAAACCAGTGTCTTGGAGATAAAAACAACTGCGTACGCAG
ACACACATAACCCAGCAGCGGCTAATGTAAACAACACTCACCAAACTCTTCTCTCTCTTA
AATACCAACTCACTCCCTCACAAACAACAACATAAACACTAAAGCAAAAGCAAAATATTT
CTCTTGTCTTCCAAAGAAAAAGAAAAACAAAGATAAAAATGCGAATGAGCTGTAATGGAT
GCCGGGTTCTCCGCAAAGGTTGCAGCGAGAATTGTAGTATCAGACCTTGTCTACAATGGA
TCAAGAGCCCTGAGTCTCAAGCCAACGCCACTGTCTTCCTTGCTAAGTTCTACGGCCGCG
CTGGCCTCATGAACCTCATCAACTCTGGCCCTGAACATCTCCGTCCTGCGATTTTCAGGT
CGTTGTTGTATGAGGCTTGTGGGCGGATAGTGAACCCGATTTACGGGTCGGTGGGGCTGT
TGTGGTCGGGTAGTTGGCAGCTTTGTCAAGCGGCTGTTGAAGCGGTGTTGAAAGGGGCTT
CGATCACGCCGATTAATTCCGACGCGGCGGCGATCGGCCAGGGACCGCCGCTGAGGGCGT
ATGATATACGACATGTGTCCAAGGACGAGAACTCGGCCGCGGCTGCTGACCGGGTCAAGA
CTCGGTCTCGGGTAAAGCGGGTCGTGAAGCCGAAGGCGAGTAAGGTGGTTGGGCTCGGGT
CGGTTGATGATGGCGAGTCGGCCCGGCGGGTTCAGGAGAATTGTTGTGGTGGGGAGGAGG
TGAACAGGAATAATAGCAACGACAACAGGTCGACGAGTCACGAGTCGTCGCTGAGTCATC
AGTCCGAGTTGGTGGCGGTGGAGAATGACAGCAAGGAGACTGAGAGCATGGTCTCGGTGG
AGACGGCCGAACCCGCTTCTCTTTTGTTCCGACCCGAGCCCGAGTCCGGAACCAAATCGA
ATGAGCGGGTCAACTCGCATTGCGACATTGGGGTGGGGCTCGACCTGACACTGGGACTGG
GACTGGGACTGGAGCCGGTGGGGTCACGTGCGCATCACGTCGTGCCGGTGAAGAAGAGAA
AGTTGGAAGGCTGTGGGTCGTCCGAGGGCGACACGTGTCGGGTGAAGCTGGGGCTTGACT
ATCCGGCTGCCTGAGTGAAGCCAAAGAAAGAAAAGAAATCATGAAAGTTTTGGCGGCTCA
GTTCGGCTCCTGTTAATTTTCATAGATGAGTTGTGACTTTTTAAAAAAAAAAAAAAATTT
AGTTTCATGTATTTTTTTTTTTTGTTTTATTTTTCCCTTTATGAAGAACAAAAAGGTGTA
CAAATGGTTGGTTAAATGAAAATAGATATGGTAAATTAATAGAGGGAATCACATGAGACC
ACAAAATAAATTTTATTGTCATTTATTAAGATTTTAATAGTTTTTTCAACTCTCTTTTTT
ATTTTTAAGTTTTTTGGAAGTCACAGAATAATTAATTTATTCAATTTTGAATAAGTTTCA
ATTCAATGCATGTATGTCGACTCTCTCGTATCATATCGTTCCAAGCAATGTTATAATGTC
CAATATTATGGTTTCAATAATGATGCTGATTTATTTTTACCCATCATCTCATCATTGTAT
CATTTTATAATTAGTATTAATATGATTAATACTTTTTAGCCATAATATTGGACAAGTAGT
TAGTTATGAAAATTATTAAAGTATGTTTTCATATTTTTTTTTAAAAGATGCTAGTGATTA
GGTGTTCTCCTCTTAACTTTAG
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>LITCHI008482.m1 +  Up_Stream_Len 2000
GGTAACAAATTATTGTGGCCCAAATTTAATATTAAAAAATAAAAGATTAAAAAACCATGG
TCTTGTAAAAGCCAATGGATTTGTTGTTCTAATCTACAATTAAGGAAAGATTAAATCCAG
AAATCTAGAAGTCTAATCAAAAGTTGAGGTTGATGTCTTGGAAGATAAGCATTGGACACC
CATATAGACTATATATATAAATATATACATATATATCTATATATAATATATAGATATTTA
AAAAGAAGGGAAGACCTCCAAAACCGCTGGCTATCAAGTCTAGTGGTGCGCCCACAGTCC
CATTCCAAACCCGGAAACCGGTCACTGGTTTCCATTTTTCACTTTAGCGGTTTTTATGTC
ACGCAGACTTCCCGAATACCCGGAGCCTATTTTTAAAGATTAGAAATAAAATAAAAACTT
TAAACTCTCTCAAAACTTGGGCCCTTAGTTGCTGGGTGGGTCCCTTTTTCTCATTCCCCA
ATATGTGGCGATTCGACCGCACTCTGACACCTCTACGTGGTTGCCACGCGCTCCTCCTTT
CCCTGCTTTGTTTTTGTACCCACTTGCATGGCTTCCCGAGCCTTTTTCGCCACGTGTCCT
TGTTTTTCTTTGTTTCTCCTTTTGCCCTGCCATTTCTTGGGTTTTGAATCGGAAAAAGGT
CGTGATTAACGCTCCTTTCGAGGGTAATTGGATACCCAAATATGCCATCCGTATCTGCAT
CGGTATATAGATGGAGAAAATACTTGCCTGCACCGGTTGCACCTATTTTTCCTTCACATG
ATGGTAGATAAGGCTTATTTACTTCATGGATTGGGTACAATTATTCACCGATCATTATAT
TTAACTATTTTTTAATAATTATTTTATTATTAATGAATAACTTCACCTTAAATCTAAATA
ATGAATACTACATTATTGAAAATTAATGTTATTAGCTTGAATGAAAAACATTTAAATAAG
CATATAACCCAATTCATTTATTGAAAGATAGTTTTTAACTTTTTATATATAGTTATATCA
GAGATTGTTAGATTATATCCAATCTTTCGAGATATTAAAAATCATGAATATATTAAAAAA
TAAATACAAATTATTTAATTTTAAAATAATGTAAATTATTAATAAAAACAAATATTCTTA
ACGTATAATTTGAGAATACATGTTAATGTTACTCTAAATAATTTAAATTATATTATATTA
TTCGATTATTCTCATATATCATTTACAAGAAAATCTCTTATTGTACTTTGAGTTGACGTA
CTATATTAATATTGATATATTATTTTAATAATTATATTATACGTGATATTTCACCTTCAT
AAAAAATTAACATTGTATTTCTTCTCATTTATAAGAAAATTTTTATTTAAAAAATTATAT
CATATATCACATATCACGTTATCAATGAAAGGTTACACCAATATAATATTTTATAAAAAA
AAAATATCTCGTATGATATTTTTAGTAATAAATTATACTAACATTAACATAATACGTCAA
TTTAATCGTGTTCCATAAGAGATTTTTTTATGACCTACCGCTTTTGAGTGGCAAAGGATG
CTAAAACCGCTTTAACCCAATGTTTTTTCTCGCAAAGAGAGGCCATGTTTTGCCAATCCT
TTTGATTTCAAAGGCAATGCAACAGTAAAAAGGGACACCTCCAATGGGGACATGGGACGT
ATCGTACACCGCAGGATAGTGGAAGACACGCGGTACAAAAGCGAGTGAGAGATAGAGTTA
AAACGAGGGGATTATTTTAATGTGAAAAAAGTGGGTTTTGAGTCGTAACTTCCTTGAATG
TGGAAACCAGTGTCTTGGAGATAAAAACAACTGCGTACGCAGACACACATAACCCAGCAG
CGGCTAATGTAAACAACACTCACCAAACTCTTCTCTCTCTTAAATACCAACTCACTCCCT
CACAAACAACAACATAAACACTAAAGCAAAAGCAAAATATTTCTCTTGTCTTCCAAAGAA
AAAGAAAAACAAAGATAAAA
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>LITCHI019963.m2 GenomeSequence + 
AAATCTCCCTTAGATTGAAGAAAGGAAACACAACATAGAGAATATATACCCTTGAAAGTA
TGGCTTTTTCTTGCTTGCGATATTCTCCAGAATTAGTACTTGTTGGTCACGAAGATCAGG
ATCAAGAAGAGCTATACTTGCCATCAGGTTATCGGTTTGCGCCTCGAAATCATGAGTTGG
TTCTACATTATCTAGCTAAAAAGATCTTGGATCAGAAACTTCCTGCAAATATCATCACAA
CTGTTGATTTGTGTCAATATGATCCTGATCAACTCCCCATCCGTAATTTTTTTTTTCTTT
TCTTTTGATTATTATAAGACACTTGCACGCAAGTATTGAATAGTCTTAAAAACTCAAGTT
TAATCAAAATTATTTTTGATACAAAAATAGTCTTAAAAACTCAAGTGGAATCCAAAACAA
GCACATTTACTCACATGTGATAATGGTCCAACCACATGTATTTATTAGTATGTGTGGAAG
TAATCTCTAGATACTTCTCTATATTATAAGGGTAGATTTCTATGCTACACATACTATTTA
ATCCCATAGGTATGGACTAAAATTTAAACACCATAAGGATCAACTCTTTTTTAAAAAAAA
AATAAAAAATAAAATTTTTTATCAAGTTATTTGTATTACATTTGAAATTTTTCCTTAAGA
AACAATAACATATTTGTTCCTAATTTTTAGAAGCTAGAAAATTTATTTGAAATTTGTATC
AAACTCTACTGATTAAGATTTTTGCATGAAATTGACAGAATAAAAAAATTTCAATCTATT
TTTGAAGAATTTGAAGGAATTTTACAGAGCTGTTAAATAATGAGGTTGCTCTCAGTTAAT
ATTATTTTTGTTAAATATTATTTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGGGATTT
ATAGGTGATTTCAAGTATGGAAAACCTAACGAGGCATATTTTTTCAGCAAATTAGAATAC
AGACAATCAGAAGGATTGCCAAGAAGAACAACAAAGAGTGGTTATTGGAAGGCCACTGGT
AGACCTACCGAGATTTTCTATAAGAAAACAGTTGTTGGATTTAAGAAAATTTTGATTTTT
CATTGGGGAAAAGCCCCAACTGGGAAGAGCAGTCCTTGGATCATGCATGAGTTCAGAGTT
AATCCCAGCTTAATTCCAGCTACTGCATTGAATAACAAAATTAGAAGCAAGGTAATTGTA
AAACTATTATTGATTTTATTATGCGTTCACCTCAAGTTTTAAATACTATGATTTTAGGTT
TGGTGGCAACCAATATAGTATATCATCTCTCTCCTCTTTATCTCAAATTTTTGTTGCTAC
GTAACATGTATTTGATATTTGTCATCCGTCCACGCTATACGACGTGTTATGTATCAACCT
CAAACCTTAAACACTATAATTAGACCATTTTCTATTAGTTTAAACTTTTAGATTTGGTGT
ATCAATCTCAAGCTATAATTTTTTATTAACAGTAACTAACAGATTTCCAAAGCAATAGTG
AAAGCAATTTTAGTTAGAAATGATAAGTCATGCTTATATCAAACCATAAACAATTTTATA
ACCACCTAAATTAATTTTGTATTTATGTCATTTTTATGTCAAGGATTACTAAATTTACTA
TTTCACATTATTTTTAGAACTATTACTCTGCTTCGAGATCAAGGGAGGAAGATACTATTC
CAAACCATGACCACAATGGTGTAGGATACCAATGACCATCCTCCTGTAGTTCACTATCTA
ACATTGTTAAAATGTTTTTAAATGGTCAAAAACATGATTTGAACCTCTTCAATTGAAATA
AACAAATCATAAAAGTGTATCTTTTGTTTTCATTAACTGTGAAGGGCACTGGGTTTTGGG
AATTAATCAGAAAATACAGTTTATAATAAAGTACTTGACAAGTGTTTATTCTTTTGAAAA
GCACTTTTTATAATACATCTTTGAACTTGCTAAGTGTAAAGTATTTTAATTAACCCTTCT
TTTAGTTTGTTTCAGGTAGAGAGCTATGTGGTGTGCAAAATTAATTACAAAGAATTAGAG
GACAACAAGCCTTCAAAGGCTAAAAGCAAGAAAATCACCAAGATCTTTGGAGGAAACCAA
AATTTAGACAGTCAAGAAGCAAGTTTATTTGTTTCTAATTTACTTCAAGCAGATTTTCTT
ACCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTC
TTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC
>LITCHI019963.m1 GenomeSequence + 
AAATCTCCCTTAGATTGAAGAAAGGAAACACAACATAGAGAATATATACCCTTGAAAGTA
TGGCTTTTTCTTGCTTGCGATATTCTCCAGAATTAGTACTTGTTGGTCACGAAGATCAGG
ATCAAGAAGAGCTATACTTGCCATCAGGTTATCGGTTTGCGCCTCGAAATCATGAGTTGG
TTCTACATTATCTAGCTAAAAAGATCTTGGATCAGAAACTTCCTGCAAATATCATCACAA
CTGTTGATTTGTGTCAATATGATCCTGATCAACTCCCCATCCGTAATTTTTTTTTTCTTT
TCTTTTGATTATTATAAGACACTTGCACGCAAGTATTGAATAGTCTTAAAAACTCAAGTT
TAATCAAAATTATTTTTGATACAAAAATAGTCTTAAAAACTCAAGTGGAATCCAAAACAA
GCACATTTACTCACATGTGATAATGGTCCAACCACATGTATTTATTAGTATGTGTGGAAG
TAATCTCTAGATACTTCTCTATATTATAAGGGTAGATTTCTATGCTACACATACTATTTA
ATCCCATAGGTATGGACTAAAATTTAAACACCATAAGGATCAACTCTTTTTTAAAAAAAA
AATAAAAAATAAAATTTTTTATCAAGTTATTTGTATTACATTTGAAATTTTTCCTTAAGA
AACAATAACATATTTGTTCCTAATTTTTAGAAGCTAGAAAATTTATTTGAAATTTGTATC
AAACTCTACTGATTAAGATTTTTGCATGAAATTGACAGAATAAAAAAATTTCAATCTATT
TTTGAAGAATTTGAAGGAATTTTACAGAGCTGTTAAATAATGAGGTTGCTCTCAGTTAAT
ATTATTTTTGTTAAATATTATTTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGGGATTT
ATAGGTGATTTCAAGTATGGAAAACCTAACGAGGCATATTTTTTCAGCAAATTAGAATAC
AGACAATCAGAAGGATTGCCAAGAAGAACAACAAAGAGTGGTTATTGGAAGGCCACTGGT
AGACCTACCGAGATTTTCTATAAGAAAACAGTTGTTGGATTTAAGAAAATTTTGATTTTT
CATTGGGGAAAAGCCCCAACTGGGAAGAGCAGTCCTTGGATCATGCATGAGTTCAGAGTT
AATCCCAGCTTAATTCCAGCTACTGCATTGAATAACAAAATTAGAAGCAAGGTAATTGTA
AAACTATTATTGATTTTATTATGCGTTCACCTCAAGTTTTAAATACTATGATTTTAGGTT
TGGTGGCAACCAATATAGTATATCATCTCTCTCCTCTTTATCTCAAATTTTTGTTGCTAC
GTAACATGTATTTGATATTTGTCATCCGTCCACGCTATACGACGTGTTATGTATCAACCT
CAAACCTTAAACACTATAATTAGACCATTTTCTATTAGTTTAAACTTTTAGATTTGGTGT
ATCAATCTCAAGCTATAATTTTTTATTAACAGTAACTAACAGATTTCCAAAGCAATAGTG
AAAGCAATTTTAGTTAGAAATGATAAGTCATGCTTATATCAAACCATAAACAATTTTATA
ACCACCTAAATTAATTTTGTATTTATGTCATTTTTATGTCAAGGATTACTAAATTTACTA
TTTCACATTATTTTTAGAACTATTACTCTGCTTCGAGATCAAGGGAGGAAGATACTATTC
CAAACCATGACCACAATGGTGTAGGATACCAATGACCATCCTCCTGTAGTTCACTATCTA
ACATTGTTAAAATGTTTTTAAATGGTCAAAAACATGATTTGAACCTCTTCAATTGAAATA
AACAAATCATAAAAGTGTATCTTTTGTTTTCATTAACTGTGAAGGGCACTGGGTTTTGGG
AATTAATCAGAAAATACAGTTTATAATAAAGTACTTGACAAGTGTTTATTCTTTTGAAAA
GCACTTTTTATAATACATCTTTGAACTTGCTAAGTGTAAAGTATTTTAATTAACCCTTCT
TTTAGTTTGTTTCAGGTAGAGAGCTATGTGGTGTGCAAAATTAATTACAAAGAATTAGAG
GACAACAAGCCTTCAAAGGCTAAAAGCAAGAAAATCACCAAGATCTTTGGAGGAAACCAA
AATTTAGACAGTCAAGAAGCAAGTTTATTTGTTTCTAATTTACTTCAAGCAGATTTTCTT
ACCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTC
TTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC