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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006080 | Chr14 | 19767164 | 19778289 | + | WD-40 repeat-containing protein MSI1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006080.m1 | 19 | 88 | PF12265.11 | CAF1C_H4-bd | Family | 94 | 5.30E-27 |
| LITCHI006080.m1 | 264 | 302 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 27.4 | 4.60E-06 |
| LITCHI006080.m1 | 365 | 401 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 18.4 | 0.0032 |
| LITCHI006080.m1 | 561 | 584 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16 | 0.011 |
| LITCHI006080.m1 | 589 | 606 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 17.2 | 0.0047 |
| LITCHI006080.m1 | 770 | 869 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 48.8 | 7.70E-13 |
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>LITCHI006080.m1 ATGGAAATTGAGGAGGAAGAAATGAGAGGCGAAATCGAAGAGAGGCTGATAAACGAAGAA TACAAGATCTGGAAGAAGAACACCCGTTTTTTGTACGATTTAGTCATCACTCACGCACTC GAATGGCCTTCTCTCACCGTCGAGTGGTTACCCGACAGAGAGGAGCCCGCTGGCAAAGAC TATTCTGTTCAAAAACTGATTCTTGGCACCCACACTTGCGAGAACGAGCCTAATTATCTA ATGCTAGCTCAGCTCCAGCTTCCTCTTCACGACTCCGACAATGATGCCCGCCACTATGAT GACGAACGCTCTGACTATGCTGCCTTTGGCTCTGCCACTGGCAAGGTTCAAATTATTCAG CAAATAAACCATGATGGAGAGGTCAACCGGGCTCGTTATATGCCCCAAAACCCTTTTATT ATTGCTACCAAGACTGTTGGTGCTGAAGTATATGTATTTGATTATAGCAAACACCCTTCT AAGCCTCCTTTGGATGGCGCTTGTTGTCCTGATTTGAGGCTCAGAGGTCATACCACCGAA GGGTATGGTTTGTCTTGGAGCAAGTTTAAGCAGGGTCATTTGCTTAGTGGTTCTGATGAT GCCCAGATATGTTTGTGGGACATTAATGCAACTGCTAAGAATAAGTCTCTTGAGGCTATG CAAATTTTTAAGGTGCATGAAGGTGTTGTAGAAGATGTAGCTTGGCATCTGAGGCATGAA TACTTGTTTGGTTCTGTTGGGGATGATCAGTACCTACTTATATGGGATCTACGTACGCCA TCAGTCAGCAAGCCTGTCCAGTCGGTTGTTGCTCATCAGAGTGAGGTAAACTGCTTAGCA TTCAATCCCTTTAATGAATGGATTTTGGCAACTGGGTCTACTGATAAGATGGTTAAGTTA TTTGATTTGCGCAAGATTAGCACGGCACTTCACACATTTAGTCACAAGGAGGAAGTTTTC CAAGTTGGATGGAACCCAAAGAGTGAGACTATTTTAGCATCTTGTTGTCTTGGTAGAAGG TTGAAGGTGTGGGATCTTAGGAGGATTGATGAGGAACAGACACTAGAGGATGCTGAAGAT GGTCCACCAGAGTTGCTTTTTACTCATGGCGGTCACACGAGTAAAATCTCAGATTTTTCG TGGAACCCATGTGAAGATTGGGTTATTGCTAGCGTAGCAGAAGATAACATTCTTCAAATA TGGCAGATGTCAGAGAACATTTACCATGATGAAGATGATTTACCTGGAGATGATGAATCT ACTAGAGGTTATTACTTTAGCAGCATGCTAACAACCCATAATAGATTGTTAATTAGTAGT AAGGGGTTATGTAGTCTTCCTTTAATATGGAAGCTTCACACACAGCTTAGAGTTGTCAAA TGGGCCTGCATCCAATCCCTAAAGTTGGGAGGGTTAGGCTTGACTCTCAAGACTCATGAG CCTGAAGAGCCGAGCGTGAAGGGGACTGGTCTCACAAAAACACTTTTAGGCCTGGTACAC ACTTGGCTCGATCTGTACCAGACCCTACCTGTTCTTGGCCTAACCCGCCCATTTGACACC TCTAACACAACTAGCAATGAAATGAAGAATATCCGAATGCGGCTTGTTGAGTTTGGGGGG CAAAGGCAAATGCATTGTCTTGCTTTGAAATGTGGCTTTGGTTGTGAATCATTTGTGGGC AGTAGTTTGGTGGATGTGTATTCAAAGTGCGGCGTGATGAGAGATGCTTGTAAGGTTTTT GAAGAGATGGATAGTACAGATGAAGTTTTGTGGACCGCAATGATTGATGGTTATGTGAAG AATGGTGATTTGAGGGAGCTTTGTTGGTTTATAAGGGGATGGGCCTGCAGAATCCATAAT GATAAAGATAGGGGGAAAATTGCTGTGGAAACGCTAATACAGCTTGAGCCGGAAATTGGT GGAGCTCGTATTGCTTTCAAATATATATGCAAAGGAACAACAATGGGAACATGTGAAGAA TCTGGGGAACATGATGAGAGATGCCAGTGTGAAAAAATTGCCAGGTTATGTGCTAGACTT GAAACTCGATTAATTCTGGATTTGCTATTCATGATGGCCCATATAGGTTTGAATCTTGAG ACAAGAGGTTTTGAACCTGGTAGATCATTAATTGGTTCCCAGTATATTAAGCGAAGAACT GAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGCGGTGCCTCATCCTATGAAGAAGACAACTTTCGA GTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAGAAGCAAGGGTTTCATAGAGCTACTGCAGCAACTT AGTGTTTGTGATGTGTCTGACAAACAATTTGAAGATAGATTTCAAGAGCTGAGCTCCTGC GGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAAGATCATCGGTCTGGGAAAATCATTGCAACT GGGAGCACATTCATCGAGAAAAAGTTTTTGAGGAATTGTGGTAAAGTTGGGCACATTGAA GATGTTGTAGTTGATGCCAATGCTCGAGGGATGCAATTAGGAAAAAAGGTTGTCGAGTTT CTTACTAATCATGCTCAGGCTATGGGATGTTACAAGGTAATACTTGATTGCAGTCTTGAC AACACAGGATTCTATGAAAAATGTGGGCTCAAGCAGAAAGGGATTGCAATGGCCCTGTAC TTTGATTGA
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>LITCHI006080.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCAAACCTCTGCATCCTTACCATATGGCTTGGAATCAAATTGCTTCCCAACCTTAAGGTT GGGAGTCCCAACCTCCAGGTTGGGATCCAATCTTGTCCAACAACTAGTACAATAAAAACA TCAACTAAATGCAATGTGTTTTTATCGTGAAGGTTTGAAAGTCCTCCCACGTCTCTCACT GACGTTCAACTTGTTGCCTCTTCTTCCTTCGCCTTTTTGCCTCTTCTTCCCTCAACTTCT TCCTTCACCTTTTTGCCTCTTCTTCCCTCAACTTCTTCCTTCTTCTTCCATCCTCTGCTT CTTCTTCTGCTTTCGGTATGTTAGTTTCTTCGACAGAGAGAGTAAATGACCATTGGGTGA TGCGGTCTGAAATATGAGGGTTCGAAATGGAGTTTCTTTCACGGCTAAAGACCCAACAAT CGGTGGGTGCGTCGGTCGGAACGCGGGTTCGTGCGTCGCCTTTGCCTTGTCGCAATGGGT GTGTCGGTCGGAATGTGGGTTTAGCTCTGCAATGGGTGCTATACGACGGTAAGGAGACGC TTGCTTCTTTTTGAAAGGTTGCTTCGTTTTGAATAACACACAGAGTCAGCGTTTGGTTGA GCGCGCCACACCCGCACACAAACATTGGAGGGCAATTTCGTCCTCAAATTGTCAATGTCT TGAGCTTTAAAAAAAAGGGGTAGTTCCCAAATAGGTCATCCCAAAAAGGTTATTTTTCAA TAAAACCCTTAAAAAAAAGGCCTGGTTCAAACTTCGGGCCCACACAATCCAAAAGCTTGA TTCAAAAACAGAAGAAAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGAGATGGTGAAGAAAGAGGAAAAG ATGAGAGGGGACTCGGTTAAATAACTTGTCTCAGAGCATCAGATGGGTTTGGTGAGCATT ATAAGGGTTGTCTCAGAGCATTAAATGACTTGTCTCTCCATTTACGCTTGTACCGTGGCC GTTTTTTAACCCTTAAAGGAATATATGTAAATTTGATTGATTAAAAATTATATATATATT TATATATTTATTTATATTTACATTGATTGTACAGTCAATGCTTTCCAACCTCAAAAAAAT TAAGGATAAAAAACCAACCATTAAATCTGAAAAAAAGGGAAATAAATAATATAATTTTTT ATTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTTTTCATCAATTTAATAAACCGTTGAAATTTTTTTAT TTTAATTTTTTTAAAGTTTGGAGACATTGACTGTAGAATCATTATATATATCAGTGTTTT TAAAAGAAAAAACTCACTTACTTTAAAAGTAAGGACAAATTAATCAAATTCATTCATTGC ATTTTCTTTCATAAAATAAATTCTATTTCTTATTTAATTTAAATATAATAGATAAATTTG ATTGATTGATCATTATTTTTTAAAATAAGGGAGTTTTTATTTTAAAGATACTAATATATA TATATATATATAGTCTCAAAAATAGCTAAACATGGATCGATTTTTCGAACCCAAAACTGA ACACCCTTATTTTTGTTGCATGAACTAATCTGATCGCCAAAATTCGGTTCAGTTCGAGTT GTTCTAGTCGCTTCATGTTAAATTGCTCACCTTTAGGAGGTGGGGTTGCTTCTTAGATCG AAATTTAGCAATATTCATCCCTTGGCGATTTGGAGCTTATCCTATTTGTAATTAAAAAAT GAAAATCTAATTTTTTTGGTATTTTTTAATCCAAAATTTAAATAATTTAATATTTAATTC ATGTAAATGATAAAAAGACTTATTTATCCTTCAGACTTAACTACTAACGGTATAGTCAAT CAATCAAGGAAATCAGTGTAATTGAGGTAATAGTTTAGGGTTCATTGCAATTATAGATAA TGTCAGGGTTTCCTGTTGCAATTTAACCTTGAACATATAGCCAGACGACAATGCCGGGGA TAGGCCTATTTGTAATCTCAAATCGAAAGTGCAAAGCTTGCTCTGTAACACCCTAGCTGA AGGTCTCGGCTGAAAAAAGA
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>LITCHI013822.m1 GenomeSequence - ATGAATGAAAATGAATTGAGAAGCAGCGAGAGTCATCAGACTGGTTATTAAGCTAAAAAA TGGTAACTTGCACAGCCGATTGACAAGAGGGCCTTGATCAAAGCAATTGCTATAGTGAGA TCCTGATTCTTGATCTAGGCCTCTTGAATTCTCAGTGTTGCGGTGACCAGTAGAGCTTAA GTCTATTAATTTGAACAATTTTTAACAGTATATGACTTTAACTTTGAAATATGTTTTCGA ATTTTACTGATTTTTGTGTAAATCTTTACATATTAGGCTCATATTCAATAACTCAAGGAA GAAGTGAAAGTATTCAACAATCTGACACATCCAAACATTGTTGTGAGTGATAGTATATTC AGTTTTGTTGCGGATTTGATTGTATTTAAATGATGTCCGATTGTTTTTGTCTAAATTTTG TTATTTAGAGATATTTGAGAATTACAAGAGAGGATGAATAATGGAATATATTATTGGAAT GTGTTCTTGGTGGATATATATCATTGTTGTTAAGGAAATTTGAATCCTTTCCCGAGTCTA TAAATGATAATTGATTGTTGGTTTTTCAGTTTTAGAATGTGGCTGCTCTGGAATGCTACG GTGGGTTGTGTTTGATCAACAAGTTATTAGAATGTATACAAAGCAATTGTTATCGGGACT AGAATATCTTCACATGAATGGAATTATGCATAGGGACATTTAGGTAATTTTATTTAGTTC TTTTAAAGAGAAACTTTTATACATCTGTCTCGAGCTTGATTTAACAAGGGACATGTTTCA TTTAGGGAGCAAACATTCTTGTTGATAATAATGGCTGCATTAAGCTTGCAGACTTTTGTG CATCCAAAAAAGTTGTGAAGTTGGTATGATTTTTATTTTATTTTTTTTTTAAGTAACAAA AGAAAATTTTGTTTGCCCTTATAGATTTTGTATGAATTTCAGGTTTTAATGTTACCACAG GCTACAATAAATGGTGCCAAGACAATGAAAGGTACACCATATTGGATGGCTCCAGAGGTT ATTCTCCAGACTAAGCATAGCTTGTAAGGAAGATTTCCACATTCATGCTTATAGATATTG ACATTTATTTGATTGTCTTGACACTGTTAAATTAGAATGTCTATGCATTGCCATGATTGT GCTTTTTCTACAAGTTCATTTTGTTTGATTATATTTGCTAAAAATTTTGCTCTTAGTGAG ACTTAGTTACAAGGCATGCTAATTACTATGTCATTATGATATAATATTTTTAATAAAAAT GAGAGTGAGAAACAGATAAAACAAAGAGCTTGAATCATTATGTGTTTTTTATTTTTTTTT CAATTATTAACTTTTGATTTTATATGTTGTGAAGTATGATGTCAAGGTGATGTAATGAGA GTTTGAACATCTAATAATATGATGCCTTGTTCATTTGTTTTGGTTATTCATTTTTTTATT TTTTATTTTTTGGAGCTTTTCTATTGGGTGTAGATAATGTTGAGGAATGTTTTGTGTTGG AATTTTGTTGTTCCTCTTGTTTATGTTTTATTTAATGGTGATGTTGACGGGGTTTAGAAG CATGTCTAGTAAAATTTATGGTTTTAATGTTGGTTTGGAGTGCTTATGTTGAAAATGAAA ATGATGATTATTGATGTGTTTCAAATGTTGATTTTGTATGTTTCTTTGTTTTGCCTTTGG ATCTTTTATGTGTTTTAGGATTTTCAAGACTCTCCAGATTTGTATTTTTCAAAGAAACTT CCAGATGAAGTTAATTAATCCTTCATTAACTACATATTTGCAGCCTATAAGGAATGTCCC AAATAATCTAGGATGAGCTAGTGCGTCTTGATGACTAGATTGTCAATAATAGTGAGGGCA CAAGAGCTCTAACTTTGGACTTTGCTGTGAATTTGAAGATAAGCTTCTATAACCCATTAC ACATGGTGAGGTGAGTTATATTATTTTAGCCATGCAATTTTGTTAGTAATGATGTGAACT TTTTCTTCAAAATTTTATTTTAATTTTCTGCTTTTATTGTGGTCCATTTCTTGATTTACA TGCTAATCCAAGTCTATAACACTACACACAGTGACACAGACACATACATCTAAGAAGGAA GTATGTACGATCCCATCTGGAGCTGAAGCCTCATTTAATGTAGATTGAAGAGTTCAAATG TGTACTCTTGCAAACATGCTCTCAGACAAGAAGTTTACACTCTGATAAGACCTATTATAT GAATCTTCTTAATGTTCGTACTTAGGGAGTTGTAAACTCTTCCTTCCCTAGTAACTACAA AACTGGCATGGAGAGAAAGTGATTGTAGAAGAATTTATCTTTCAACCAAAATCTCTTTAT CCAGATGACAGGTTTGAAGTACTTAATCATTCCTTTTCTAATATATTACAAGGGGACAGC TGTTGTGAGAAAGTTCCTTGTGGTTTATATATTTTGAAATATCAGGCCTGATGCTATCTT TTATTTCAGGGTTCTGGCTACAAAAATGTCTCCAGTTTTGAGGGGCATAAGCTTTATAGA CTTGTACTACTAGTATTGGAGAGTTGATGCAAAAATAGGAAAAATGGTTCACCGAGTACT GCCAACTTACGTAAACCAAATGAATGAAAGTGCATTGAAAAGCAACAAGAGTCACAAGAT TGGTTATTAAGCTAAAAAATGGTAACTTGTGCAGCCGATTGACAAGAGGGCACCACTCTC TCTCCCACCTGCTCAAGGTATGGTGAGATATTTTTATATAAAAGGTAAAACAAAGTGTTT CAGAAGAGAAAACACAGGTGATATTTTTTTTTTGAAAGAAATTAATTTTCAGTCAAGTTC GATTGACAGTATATGACTTTAACTTTGAAGTATGTTTTTGAATTTTACTGAGTGAAGTAT GTTTTTGAATTTTACTGATTTGTATCTAAATCTTTACATATTAGGCTCATATTCGAGAAC TCAAGGAAGAAGTGAAACTATTAAAGAATTGTACACATCCAAACATTGTTGTAAGTAATT GTACATTCAGTTTTGTTGTGGACTTGATTGTATTTGGATGATATCTAATTGTTTTTGTCT AAATTTTGTTATTTTGAGATATTTGGGAACTGCAAGAGGGGATGAATCATTGAATATATT ATTGGAATTTGTTCCTGATGGATCTATATCATTGCTATTAGGGAAATTTGGATCCTTCCT TGAGTTTGTAAGTGATAATTAATTGTTGGTTTCTCAATTTTAGAATGTGGTTGCTCTAGA GTGTTAAAGTGGGTTGTGTTTGATTACTAGGTTATTAGAATGTATACAAAACAGTTGTTA TTGGGACTAGAATATCTTCACATGAATGGAATTATGCATAAGGACATTAAGGTAATTTTA TTTAGTTCTTCTAAAGAGAAAATTTTATACATCTATCTTTAGCTTGATTTAACAAGGGGC ATGTTTCATTCAAGGAGCAAACATTCTTGGTGATAATAAAGGTTACATTAAGCTTGCAGA CTTTGGTGCATCCAGGAAATTTGTAGACCTGGTATGATTTTTATTTTATTTGTTTTTTAA GTAACAGAAGAAAATTTTGTTTGTCCTTGTAGATTTTTGCATGAATTTCAAGTTTTTACA TTGTCAAAGGCTATAATAAATGGTGTCATATTGGATGGCTCTAGAGGTTGTTCTCTAGAT TGAACATATATAGCTTGTAAGGAAGATTTCCACATTCATACTTACAGATATTGATATTTA TTTGATTGTCTTGATACTTTTAAATTAGAGGGTCTATGCATTGCCATGATTATGCCTTTT TTGCAAGTTATCTTTTTGTTTGTTTATATTTGCTGAAAATTTGCTCTTAGTGAGACCCGG TTACAAGGCATGCTAATTACTATGTTATTATGATATAATATTTTTAATAATAATGAGAGT GAGAAAGAGATAAAACAAAGAGCTTGAATTATTATGTGTTTTTTATTATTAACTTTTGAT TTTATTTGTTGTGAAGTATGATGTCAAGGTCATGTAATGAGAGTTTGAACATCTAATAAT ATGATACCTTGTTCGTTTGTTCTGGTCCTTCATTTTTTTTCTCTTTTAAGAAAAAAAATA GTTTAGTTTTGAGGTTTTGATGTTGTTTTATTAAGATTTTTAAGGTATTTTTTTTTTTCC TAAATGTTTTGGTGTAGACAATGTTGAGGAATGTTTTGTGTTGGAATTTTTTTGTTCTTC TTGTTTACGTTTTGTTTAAACGTGATGCCAAGTGGGGTTTAGAAGTGTGTCTAGTAAAAT TTATGGTTTTATTGTCGGTTTGGAGTCCATATGTTGAAAAATGAAAATGAAGATTATCGA TGTGTTTCAAGTGTTGACTTTGTATGTTTCTTTGTTCTGCATTTGGATTTTTTTATGTGT TTTAGGATTTTGAAGATTTTCAGTGTTTGTATTTTTCAAATGTTTCTTTGTTTTGCATTC GAATTCATAATTGCATCTTTGTAGATTGTTGAGAGGTTGAATCCAACGCCTCACACAAAG GAGATCAAGCTTCAGTTAGTGCAAGATGTAGCTCGAGAATTCTCCATAGAATAG