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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006080 | Chr14 | 19767164 | 19778289 | + | WD-40 repeat-containing protein MSI1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006080.m1 | 19 | 88 | PF12265.11 | CAF1C_H4-bd | Family | 94 | 5.30E-27 |
| LITCHI006080.m1 | 264 | 302 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 27.4 | 4.60E-06 |
| LITCHI006080.m1 | 365 | 401 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 18.4 | 0.0032 |
| LITCHI006080.m1 | 561 | 584 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16 | 0.011 |
| LITCHI006080.m1 | 589 | 606 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 17.2 | 0.0047 |
| LITCHI006080.m1 | 770 | 869 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 48.8 | 7.70E-13 |
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>LITCHI006080.m1 ATGGAAATTGAGGAGGAAGAAATGAGAGGCGAAATCGAAGAGAGGCTGATAAACGAAGAA TACAAGATCTGGAAGAAGAACACCCGTTTTTTGTACGATTTAGTCATCACTCACGCACTC GAATGGCCTTCTCTCACCGTCGAGTGGTTACCCGACAGAGAGGAGCCCGCTGGCAAAGAC TATTCTGTTCAAAAACTGATTCTTGGCACCCACACTTGCGAGAACGAGCCTAATTATCTA ATGCTAGCTCAGCTCCAGCTTCCTCTTCACGACTCCGACAATGATGCCCGCCACTATGAT GACGAACGCTCTGACTATGCTGCCTTTGGCTCTGCCACTGGCAAGGTTCAAATTATTCAG CAAATAAACCATGATGGAGAGGTCAACCGGGCTCGTTATATGCCCCAAAACCCTTTTATT ATTGCTACCAAGACTGTTGGTGCTGAAGTATATGTATTTGATTATAGCAAACACCCTTCT AAGCCTCCTTTGGATGGCGCTTGTTGTCCTGATTTGAGGCTCAGAGGTCATACCACCGAA GGGTATGGTTTGTCTTGGAGCAAGTTTAAGCAGGGTCATTTGCTTAGTGGTTCTGATGAT GCCCAGATATGTTTGTGGGACATTAATGCAACTGCTAAGAATAAGTCTCTTGAGGCTATG CAAATTTTTAAGGTGCATGAAGGTGTTGTAGAAGATGTAGCTTGGCATCTGAGGCATGAA TACTTGTTTGGTTCTGTTGGGGATGATCAGTACCTACTTATATGGGATCTACGTACGCCA TCAGTCAGCAAGCCTGTCCAGTCGGTTGTTGCTCATCAGAGTGAGGTAAACTGCTTAGCA TTCAATCCCTTTAATGAATGGATTTTGGCAACTGGGTCTACTGATAAGATGGTTAAGTTA TTTGATTTGCGCAAGATTAGCACGGCACTTCACACATTTAGTCACAAGGAGGAAGTTTTC CAAGTTGGATGGAACCCAAAGAGTGAGACTATTTTAGCATCTTGTTGTCTTGGTAGAAGG TTGAAGGTGTGGGATCTTAGGAGGATTGATGAGGAACAGACACTAGAGGATGCTGAAGAT GGTCCACCAGAGTTGCTTTTTACTCATGGCGGTCACACGAGTAAAATCTCAGATTTTTCG TGGAACCCATGTGAAGATTGGGTTATTGCTAGCGTAGCAGAAGATAACATTCTTCAAATA TGGCAGATGTCAGAGAACATTTACCATGATGAAGATGATTTACCTGGAGATGATGAATCT ACTAGAGGTTATTACTTTAGCAGCATGCTAACAACCCATAATAGATTGTTAATTAGTAGT AAGGGGTTATGTAGTCTTCCTTTAATATGGAAGCTTCACACACAGCTTAGAGTTGTCAAA TGGGCCTGCATCCAATCCCTAAAGTTGGGAGGGTTAGGCTTGACTCTCAAGACTCATGAG CCTGAAGAGCCGAGCGTGAAGGGGACTGGTCTCACAAAAACACTTTTAGGCCTGGTACAC ACTTGGCTCGATCTGTACCAGACCCTACCTGTTCTTGGCCTAACCCGCCCATTTGACACC TCTAACACAACTAGCAATGAAATGAAGAATATCCGAATGCGGCTTGTTGAGTTTGGGGGG CAAAGGCAAATGCATTGTCTTGCTTTGAAATGTGGCTTTGGTTGTGAATCATTTGTGGGC AGTAGTTTGGTGGATGTGTATTCAAAGTGCGGCGTGATGAGAGATGCTTGTAAGGTTTTT GAAGAGATGGATAGTACAGATGAAGTTTTGTGGACCGCAATGATTGATGGTTATGTGAAG AATGGTGATTTGAGGGAGCTTTGTTGGTTTATAAGGGGATGGGCCTGCAGAATCCATAAT GATAAAGATAGGGGGAAAATTGCTGTGGAAACGCTAATACAGCTTGAGCCGGAAATTGGT GGAGCTCGTATTGCTTTCAAATATATATGCAAAGGAACAACAATGGGAACATGTGAAGAA TCTGGGGAACATGATGAGAGATGCCAGTGTGAAAAAATTGCCAGGTTATGTGCTAGACTT GAAACTCGATTAATTCTGGATTTGCTATTCATGATGGCCCATATAGGTTTGAATCTTGAG ACAAGAGGTTTTGAACCTGGTAGATCATTAATTGGTTCCCAGTATATTAAGCGAAGAACT GAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGCGGTGCCTCATCCTATGAAGAAGACAACTTTCGA GTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAGAAGCAAGGGTTTCATAGAGCTACTGCAGCAACTT AGTGTTTGTGATGTGTCTGACAAACAATTTGAAGATAGATTTCAAGAGCTGAGCTCCTGC GGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAAGATCATCGGTCTGGGAAAATCATTGCAACT GGGAGCACATTCATCGAGAAAAAGTTTTTGAGGAATTGTGGTAAAGTTGGGCACATTGAA GATGTTGTAGTTGATGCCAATGCTCGAGGGATGCAATTAGGAAAAAAGGTTGTCGAGTTT CTTACTAATCATGCTCAGGCTATGGGATGTTACAAGGTAATACTTGATTGCAGTCTTGAC AACACAGGATTCTATGAAAAATGTGGGCTCAAGCAGAAAGGGATTGCAATGGCCCTGTAC TTTGATTGA
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>LITCHI011585.m1 - Up_Stream_Len 2000 CCTGCTACTACCTCAACTTATTTATAAAAGAACAAGAGCTACTAACAATTGAGATTTGAA GGTTTATATTTTAGAAAATTTGGATAACTCTAACTAGATTATTAATAAACTAGGCAAGTT TGGGGTATACAAAACTTGTCCTCACCTAATATATCCGTAGTAGGTTTAATTATCACACTT CATCTCTATCTAATAACTCCACTTGATCAATTTCATCTCGACTCCAAAAAGGTGAGTACC TATCAAGATTTATATTTACGAAATGTGGATAGTACCAATTGGATTATAGCGAATGGATTT GATGTAGAGAGTGAAAAACTCGTCCCCACCTCATACATATACTGAGTTTAATTATCATAC AATAGTTACATCTTGCCTCATCAAATCAATCTATATCTAATATTAATATAATATTATAAT ACTATAATTAATAATCATACTAATAATAATACTACTTGATACTTAGTTTTTCACCAATTG TGTGGGTTGTTCTCCCATCTCAGTGTGGGTCTCCCCCCTACCTCCATGTGGGTGGATCCC TACCAACTGGAAGTCGTCCCCCGGACCGTGCCACCAGTGTCATATCTCGGTTAAGGTCCC GGATGCCCCTGAATTTATTCCAGATGCAGTTTTGTACTAAAAAAAAATCAATTTATATCC CTATCGAGAGGTGGACCCTATTCATGATCAGGAGGAGGACGTGCCTATTCTAGATTTTTC TTTTCTTTTTTCCTTTTTCACTTTTATCTTACTTGTACCAGTTAATCCAAACTTATCTTA TATTAAACCTGATTTTAATTTCTTATAACCATTTTTTTCATTACATCTCACCGATACTAT ATCTTATAAATTAATTTCTTTCCCTTATTTTTATATATATGTTTTTCTTTTCAAATCTAA ATCATAAATTTGTTACATCAAATTTATTAACTATGAACTGTTATTTATTCTTTTGTCTTT AATTCTTTTCCTTTACTTTTTTAAGTTTACTAAATTTGAATTAATTAAAGTGATAGCTTG TTATTATTGAAATAATTATCGATTTTCACTCAATCCAACTATGAAATACAACCTTTGAAT TAAATAAAAATATAGTCATAAATTTAAGATAAAATTTTAAATTAATATAACTTAAACCTA TATATATTTTGATTAGGCCTGTTGTTTATTTTAGGATAGTGTTAAGGGCACATGTAAATA ACCACAACTAACTTATCAATCAAAACGTAAAATAACTGTAAAGATACAAAGAAATGAATA AATCAATTCATTGATTGTTTGTAGGTCCATTCACATCTTAATTTGTAAGTATTAATATTT TATAATTTGCATGTTAATTACGAATTACATGTTACCTAATTTAAACATGAATTTTGAGGG GGAAAATTATACAAACTAATATCACCATTAGTTTTATTTTTAGTATCTTCTTATTGTTAT TCTAAGTTGACACAAAAGAACATAAAAATCATTAAGTGCCCTTCTAATATGAGTTTCTGG GTCCATCATTATCCTTATCTTAACAGTTAACCCTAACGAGACGAGAACAACGAGGCATCA CGGCCGGTAATTTTACCATCCCAACGAAAAAGAATTTAAAAATTGAGTACTGTGCCAATA AAAGTACACTTTTATGTTGTTTTACCAAAGACAAAACTTTCTACTTCAAAAAACCCAGAA TATGGGGTTTATTTAGTTGGATTATATGGTGCCAATAATACCACTCTTGAGTTTTGGGCT CTAGCCCAATTTATAAATGTTCCATGAGCCCAAAAAATATAAACATAACCCGAACCCTGA TCCGACCCGAAAATATCATTCTTCTTCGTTTCGCTGCTCGTGTTTGACAGTACACACTAC TCGGCCAACGATAGCAACAGCAAAAGCTTCTCTCTCTGCGAAACCCAGGTGTGCCTCTTC ATATATACACTACCTATTTTTCATTTGTTTGTTTTGTATTGTATTTTGTTTTGTTTTGTC TTTTTTTTTTGTATCATAAA
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>LITCHI003207.m1 GenomeSequence - ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGGTACTGCAATTTTACT TCTAATACAATCTGTTTGCATTGTTATGCAAGTCGTCTAGCTCCATAGACAAAGGTACTA CTTTATCTTTAGTATTTTGAACTGTGTGTTTTCATGATTTGTGTTTTTGAAATTTATGGT GTCATTAATGTAGCATGAATTTGATGTTATATCGTTTCTGTATTATGCATGTACAATGTA TTTCTAACTTGATATTTTATATATTATTAATTATTTGAGTTACTAGAAAGAACAAACAAA TCAAACGAATTATTTTGATTGAATTAAAGACTAATATTTGAACAATTTGAGATGATTTAT TGTGGAATTAATTAGGAAGGTGGTTTTTGTTCTTCACTCTACTTTCTGAATTCAAGCGCA ATTAGGATCTGTTAATCCTGAAAAAATATTACCTCAGAACAACTTTCAAAGCAACAACTT AATCAATACAACCATTTATGAATCTAAAGAGAAACTTTCTTAATTATTTTTCTCTTGCTC TTCAGAATATTTAATCTTGTTTGTGTAATAGTTAATTGTTTTGTTAAGCTTTGTTTAATA GTCATGTGCACTTAAATTAAGTATTTGTGAGTGTTGTGATTGTGTTTTGGTCAAAAGGGA TTGTTTCTGATGAGCTAATGCTTGCTGGTTTTGTATCGGTTTTGATGGTTGTGTTTTGTT TTGACAATCATTTAGTTCATATATATTACATATGGCTCTTAATTGAAGGTTCATGGAATT GATCTGTAATCAAGGAAATTATTAGTATACCAAAATTTGCGGTATTTTAACATGTTGATG CCTTTGGTTGCAGAACCCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGC AATCTTTGATGGGAAAGATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCA TTATGTGTAGATCACTGACTTCTGTTCCTAATATGACTTTTAGGTGCATGAATTTGAATT ACTGTCTCGACATGTAAATGGGCGAGCTCTCTTTACTTTTCTCCCAAATATTTTAGGGTG TGATTTTTCTAATATGACATGAACCCTCAAAACAAAGGAAGTTTATTTGGTATTGTGCTT CCGCCAATACCAGCCTCACTTAACTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTTCCTTAGTACAGCC TAGCTCGTACATATGCCAGATAACATGATAAAACTGAATTAATGAAGACCTCTCATTCAA TCATACCCACCTCGAAATTTCTTTTATATTTTTGGGAAACCTTAGATGTTTGCAGAGATA AGAACAGCATGTAAACATCTTGTGCATTTCAATTACAAAGTTTATGATGATTGGATGGTG CCCTTTACGCGAATATATGTACAGTTTATATTACTTCCGATCTGGATAAAGTCGGAGTAG TCGCATTCCAATGTAGAGTCAGTAGTTCAGGTCATGAAAATTCCAATGTCACTAGATGAA ATTGGTTTTTCATAAAAACGTTGTTGTAATACATGTGAAGCTTTTCTCCCCATTTGCATG ACTCAATAGCAGAAGTTCTCCTGGTGTCCTAAAAGAGATGTTTGCTTCTTTAAGTTCTAG AAAACAAAATGAACATGAAAGACTAGATAATGTAAAACAAACCTAAAGGTAAATAGGTCA CCAAAAAAATGTCAACATTTCATAGATTAACCTATAAATAAATGGGCTATTTTCTAATTT TGTTCCAAGTATCTGAATGCTGACTAGTCGAGGAGATTGTGTATCCATTTTTCTACAACA GTTGGAGAACCATACCACGGTCTCAATGCATTGTCTGGGCTACTGGTGAGTGATAAACTC CATCTAAGCTTATGTTTAGTGCTCTTTCTAGATGCATAGATACTTCTGGTACAACTCCAT CACCTCATACATCTGCTTGTCCACAGACCTGATAATGCAAGAAAACAGAAATAACTTTAA AGAGAACACAGAACTCAACTTTTACGAAAAATGGCATGATTTTTGTTAAATGTGTGCAAG AAGCCTGGGGAAGTGACTTAACAACCTGCTTGTAACTTTGCCCAACTATGTGAGCACGAT AAGTTGAAACTGATGTTGGATTGGTCTTATTGTTTACAATAGCAACCTCAGAAGTTGGTT GGTCAGTGTCGATGGCCATGACAGGATCAACATCAATATTTGAGTTTCCAAAGAAGTGAG CACCCCCAATGTACCTGCAATTTAC