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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006080 | Chr14 | 19767164 | 19778289 | + | WD-40 repeat-containing protein MSI1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006080.m1 | 19 | 88 | PF12265.11 | CAF1C_H4-bd | Family | 94 | 5.30E-27 |
| LITCHI006080.m1 | 264 | 302 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 27.4 | 4.60E-06 |
| LITCHI006080.m1 | 365 | 401 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 18.4 | 0.0032 |
| LITCHI006080.m1 | 561 | 584 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16 | 0.011 |
| LITCHI006080.m1 | 589 | 606 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 17.2 | 0.0047 |
| LITCHI006080.m1 | 770 | 869 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 48.8 | 7.70E-13 |
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>LITCHI006080.m1 ATGGAAATTGAGGAGGAAGAAATGAGAGGCGAAATCGAAGAGAGGCTGATAAACGAAGAA TACAAGATCTGGAAGAAGAACACCCGTTTTTTGTACGATTTAGTCATCACTCACGCACTC GAATGGCCTTCTCTCACCGTCGAGTGGTTACCCGACAGAGAGGAGCCCGCTGGCAAAGAC TATTCTGTTCAAAAACTGATTCTTGGCACCCACACTTGCGAGAACGAGCCTAATTATCTA ATGCTAGCTCAGCTCCAGCTTCCTCTTCACGACTCCGACAATGATGCCCGCCACTATGAT GACGAACGCTCTGACTATGCTGCCTTTGGCTCTGCCACTGGCAAGGTTCAAATTATTCAG CAAATAAACCATGATGGAGAGGTCAACCGGGCTCGTTATATGCCCCAAAACCCTTTTATT ATTGCTACCAAGACTGTTGGTGCTGAAGTATATGTATTTGATTATAGCAAACACCCTTCT AAGCCTCCTTTGGATGGCGCTTGTTGTCCTGATTTGAGGCTCAGAGGTCATACCACCGAA GGGTATGGTTTGTCTTGGAGCAAGTTTAAGCAGGGTCATTTGCTTAGTGGTTCTGATGAT GCCCAGATATGTTTGTGGGACATTAATGCAACTGCTAAGAATAAGTCTCTTGAGGCTATG CAAATTTTTAAGGTGCATGAAGGTGTTGTAGAAGATGTAGCTTGGCATCTGAGGCATGAA TACTTGTTTGGTTCTGTTGGGGATGATCAGTACCTACTTATATGGGATCTACGTACGCCA TCAGTCAGCAAGCCTGTCCAGTCGGTTGTTGCTCATCAGAGTGAGGTAAACTGCTTAGCA TTCAATCCCTTTAATGAATGGATTTTGGCAACTGGGTCTACTGATAAGATGGTTAAGTTA TTTGATTTGCGCAAGATTAGCACGGCACTTCACACATTTAGTCACAAGGAGGAAGTTTTC CAAGTTGGATGGAACCCAAAGAGTGAGACTATTTTAGCATCTTGTTGTCTTGGTAGAAGG TTGAAGGTGTGGGATCTTAGGAGGATTGATGAGGAACAGACACTAGAGGATGCTGAAGAT GGTCCACCAGAGTTGCTTTTTACTCATGGCGGTCACACGAGTAAAATCTCAGATTTTTCG TGGAACCCATGTGAAGATTGGGTTATTGCTAGCGTAGCAGAAGATAACATTCTTCAAATA TGGCAGATGTCAGAGAACATTTACCATGATGAAGATGATTTACCTGGAGATGATGAATCT ACTAGAGGTTATTACTTTAGCAGCATGCTAACAACCCATAATAGATTGTTAATTAGTAGT AAGGGGTTATGTAGTCTTCCTTTAATATGGAAGCTTCACACACAGCTTAGAGTTGTCAAA TGGGCCTGCATCCAATCCCTAAAGTTGGGAGGGTTAGGCTTGACTCTCAAGACTCATGAG CCTGAAGAGCCGAGCGTGAAGGGGACTGGTCTCACAAAAACACTTTTAGGCCTGGTACAC ACTTGGCTCGATCTGTACCAGACCCTACCTGTTCTTGGCCTAACCCGCCCATTTGACACC TCTAACACAACTAGCAATGAAATGAAGAATATCCGAATGCGGCTTGTTGAGTTTGGGGGG CAAAGGCAAATGCATTGTCTTGCTTTGAAATGTGGCTTTGGTTGTGAATCATTTGTGGGC AGTAGTTTGGTGGATGTGTATTCAAAGTGCGGCGTGATGAGAGATGCTTGTAAGGTTTTT GAAGAGATGGATAGTACAGATGAAGTTTTGTGGACCGCAATGATTGATGGTTATGTGAAG AATGGTGATTTGAGGGAGCTTTGTTGGTTTATAAGGGGATGGGCCTGCAGAATCCATAAT GATAAAGATAGGGGGAAAATTGCTGTGGAAACGCTAATACAGCTTGAGCCGGAAATTGGT GGAGCTCGTATTGCTTTCAAATATATATGCAAAGGAACAACAATGGGAACATGTGAAGAA TCTGGGGAACATGATGAGAGATGCCAGTGTGAAAAAATTGCCAGGTTATGTGCTAGACTT GAAACTCGATTAATTCTGGATTTGCTATTCATGATGGCCCATATAGGTTTGAATCTTGAG ACAAGAGGTTTTGAACCTGGTAGATCATTAATTGGTTCCCAGTATATTAAGCGAAGAACT GAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGCGGTGCCTCATCCTATGAAGAAGACAACTTTCGA GTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAGAAGCAAGGGTTTCATAGAGCTACTGCAGCAACTT AGTGTTTGTGATGTGTCTGACAAACAATTTGAAGATAGATTTCAAGAGCTGAGCTCCTGC GGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAAGATCATCGGTCTGGGAAAATCATTGCAACT GGGAGCACATTCATCGAGAAAAAGTTTTTGAGGAATTGTGGTAAAGTTGGGCACATTGAA GATGTTGTAGTTGATGCCAATGCTCGAGGGATGCAATTAGGAAAAAAGGTTGTCGAGTTT CTTACTAATCATGCTCAGGCTATGGGATGTTACAAGGTAATACTTGATTGCAGTCTTGAC AACACAGGATTCTATGAAAAATGTGGGCTCAAGCAGAAAGGGATTGCAATGGCCCTGTAC TTTGATTGA
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>LITCHI006080.m1 GenomeSequence + TAATAGTTTAGGGTTCATTGCAATTATAGATAATGTCAGGGTTTCCTGTTGCAATTTAAC CTTGAACATATAGCCAGACGACAATGCCGGGGATAGGCCTATTTGTAATCTCAAATCGAA AGTGCAAAGCTTGCTCTGTAACACCCTAGCTGAAGGTCTCGGCTGAAAAAAGAATGGAAA TTGAGGAGGAAGAAATGAGAGGCGAAATCGAAGAGAGGCTGATAAACGAAGAATACAAGA TCTGGAAGAAGAACACCCGTTTTTTGTACGATTTAGTCATCACTCACGCACTCGAATGGC CTTCTCTCACCGTCGAGTGGTTACCCGACAGAGAGGAGCCCGCTGGCAAAGACTATTCTG TTCAAAAACTGATTCTTGGCACCCACACTTGCGAGAACGAGCCTAATTATCTAATGCTAG CTCAGCTCCAGCTTCCTCTTCACGACTCCGACAATGATGCCCGCCACTATGATGACGAAC GCTCTGACTATGCTGCCTTTGGCTCTGCCACTGGCAAGGTATGGTTTTGTTGTTTCTCTT CAAAAAAATCTTTGTTTTGCGAGATGGGTATTTGTAGTTTTTAATGTTTCCCTGTTTTGA TAGGTTCAAATTATTCAGCAAATAAACCATGATGGAGAGGTCAACCGGGCTCGTTATATG CCCCAAAACCCTTTTATTATTGCTACCAAGACTGTTGGTGCTGAAGTATATGTATTTGAT TATAGCAAACACCCTTCTAAGCCTCCTTTGGATGGCGCTTGTTGTCCTGATTTGAGGCTC AGAGGTCATACCACCGAAGGGTATGGTTTGTCTTGGAGCAAGTTTAAGCAGGGTCATTTG CTTAGTGGTTCTGATGATGCCCAGATATGTTTGTGGGACATTAATGCAACTGCTAAGAAT 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