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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI006080 | Chr14 | 19767164 | 19778289 | + | WD-40 repeat-containing protein MSI1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI006080.m1 | 19 | 88 | PF12265.11 | CAF1C_H4-bd | Family | 94 | 5.30E-27 |
| LITCHI006080.m1 | 264 | 302 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 27.4 | 4.60E-06 |
| LITCHI006080.m1 | 365 | 401 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 18.4 | 0.0032 |
| LITCHI006080.m1 | 561 | 584 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 16 | 0.011 |
| LITCHI006080.m1 | 589 | 606 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 17.2 | 0.0047 |
| LITCHI006080.m1 | 770 | 869 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 48.8 | 7.70E-13 |
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>LITCHI006080.m1 ATGGAAATTGAGGAGGAAGAAATGAGAGGCGAAATCGAAGAGAGGCTGATAAACGAAGAA TACAAGATCTGGAAGAAGAACACCCGTTTTTTGTACGATTTAGTCATCACTCACGCACTC GAATGGCCTTCTCTCACCGTCGAGTGGTTACCCGACAGAGAGGAGCCCGCTGGCAAAGAC TATTCTGTTCAAAAACTGATTCTTGGCACCCACACTTGCGAGAACGAGCCTAATTATCTA ATGCTAGCTCAGCTCCAGCTTCCTCTTCACGACTCCGACAATGATGCCCGCCACTATGAT GACGAACGCTCTGACTATGCTGCCTTTGGCTCTGCCACTGGCAAGGTTCAAATTATTCAG CAAATAAACCATGATGGAGAGGTCAACCGGGCTCGTTATATGCCCCAAAACCCTTTTATT ATTGCTACCAAGACTGTTGGTGCTGAAGTATATGTATTTGATTATAGCAAACACCCTTCT AAGCCTCCTTTGGATGGCGCTTGTTGTCCTGATTTGAGGCTCAGAGGTCATACCACCGAA GGGTATGGTTTGTCTTGGAGCAAGTTTAAGCAGGGTCATTTGCTTAGTGGTTCTGATGAT GCCCAGATATGTTTGTGGGACATTAATGCAACTGCTAAGAATAAGTCTCTTGAGGCTATG CAAATTTTTAAGGTGCATGAAGGTGTTGTAGAAGATGTAGCTTGGCATCTGAGGCATGAA TACTTGTTTGGTTCTGTTGGGGATGATCAGTACCTACTTATATGGGATCTACGTACGCCA TCAGTCAGCAAGCCTGTCCAGTCGGTTGTTGCTCATCAGAGTGAGGTAAACTGCTTAGCA TTCAATCCCTTTAATGAATGGATTTTGGCAACTGGGTCTACTGATAAGATGGTTAAGTTA TTTGATTTGCGCAAGATTAGCACGGCACTTCACACATTTAGTCACAAGGAGGAAGTTTTC CAAGTTGGATGGAACCCAAAGAGTGAGACTATTTTAGCATCTTGTTGTCTTGGTAGAAGG TTGAAGGTGTGGGATCTTAGGAGGATTGATGAGGAACAGACACTAGAGGATGCTGAAGAT GGTCCACCAGAGTTGCTTTTTACTCATGGCGGTCACACGAGTAAAATCTCAGATTTTTCG TGGAACCCATGTGAAGATTGGGTTATTGCTAGCGTAGCAGAAGATAACATTCTTCAAATA TGGCAGATGTCAGAGAACATTTACCATGATGAAGATGATTTACCTGGAGATGATGAATCT ACTAGAGGTTATTACTTTAGCAGCATGCTAACAACCCATAATAGATTGTTAATTAGTAGT AAGGGGTTATGTAGTCTTCCTTTAATATGGAAGCTTCACACACAGCTTAGAGTTGTCAAA TGGGCCTGCATCCAATCCCTAAAGTTGGGAGGGTTAGGCTTGACTCTCAAGACTCATGAG CCTGAAGAGCCGAGCGTGAAGGGGACTGGTCTCACAAAAACACTTTTAGGCCTGGTACAC ACTTGGCTCGATCTGTACCAGACCCTACCTGTTCTTGGCCTAACCCGCCCATTTGACACC TCTAACACAACTAGCAATGAAATGAAGAATATCCGAATGCGGCTTGTTGAGTTTGGGGGG CAAAGGCAAATGCATTGTCTTGCTTTGAAATGTGGCTTTGGTTGTGAATCATTTGTGGGC AGTAGTTTGGTGGATGTGTATTCAAAGTGCGGCGTGATGAGAGATGCTTGTAAGGTTTTT GAAGAGATGGATAGTACAGATGAAGTTTTGTGGACCGCAATGATTGATGGTTATGTGAAG AATGGTGATTTGAGGGAGCTTTGTTGGTTTATAAGGGGATGGGCCTGCAGAATCCATAAT GATAAAGATAGGGGGAAAATTGCTGTGGAAACGCTAATACAGCTTGAGCCGGAAATTGGT GGAGCTCGTATTGCTTTCAAATATATATGCAAAGGAACAACAATGGGAACATGTGAAGAA TCTGGGGAACATGATGAGAGATGCCAGTGTGAAAAAATTGCCAGGTTATGTGCTAGACTT GAAACTCGATTAATTCTGGATTTGCTATTCATGATGGCCCATATAGGTTTGAATCTTGAG ACAAGAGGTTTTGAACCTGGTAGATCATTAATTGGTTCCCAGTATATTAAGCGAAGAACT GAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGCGGTGCCTCATCCTATGAAGAAGACAACTTTCGA GTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAGAAGCAAGGGTTTCATAGAGCTACTGCAGCAACTT AGTGTTTGTGATGTGTCTGACAAACAATTTGAAGATAGATTTCAAGAGCTGAGCTCCTGC GGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAAGATCATCGGTCTGGGAAAATCATTGCAACT GGGAGCACATTCATCGAGAAAAAGTTTTTGAGGAATTGTGGTAAAGTTGGGCACATTGAA GATGTTGTAGTTGATGCCAATGCTCGAGGGATGCAATTAGGAAAAAAGGTTGTCGAGTTT CTTACTAATCATGCTCAGGCTATGGGATGTTACAAGGTAATACTTGATTGCAGTCTTGAC AACACAGGATTCTATGAAAAATGTGGGCTCAAGCAGAAAGGGATTGCAATGGCCCTGTAC TTTGATTGA
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>LITCHI018001.m1 CTACTACAGTGAGGTGGAGAATTTTGGACAGTTGCTGTAAACATTGCTTTTAAAAGCAAG TCGAATTACCGTAAAGTCAATAATAAATTAATCAATTTGCGACTTTCCGTGGGCTCAGTG TCATATATAACAAAACCATCCATATAAAGGCTCTGAAGTTTCAAGCTTTTTCTAGTTTCC AGCTCATACTTCTCTCCAACCTGCAACATTCGAAAAGGGTTGTTAGTTGGTCAAGATTTT GAATCAAAACAAGACTATAATCATTGTTCTGTAATTTATTATAAAGCTTGTAATTGGGAA TGCTGAAAGATGTGCTTCAAAGTCGAAAACCAGTTCGCTGAAGTTGATCAAGTTTTAGCT CCATCTGAGCTTCAACTGTTTGTTTATGATGTGGTTCAAGATTTAATTCACATCCCACTT CTGTTTGGTACTCAAACATCTGGTATGCCCAGAAACTTCAGTGAAAGTAAGTTAAGGCAT GATGTTTGTGACGATGGTTAGGCTTTTATGTTATTGAGACCGGCTCCTGTGTTATATTTA CCTAAATCACATTTATAGATATTGCAATTGCGAGTAGGATTAGCTTCTGTTGTGTATAAA GATTACTGAGACTGGGAATGGAAAACAAAGGGACTATATTGATGCAACGGTATGAGTTAG GGAAATTACTAGGCCAAGGAACCTTTGCGAAGGTCCACCATGCTAGGAATCTTAAAACCA GTATGAGTGTGGCCATTAAGATAATTGATAAAGCGAAGGTGTTTAAAGTTGGGATGATTA ATCAGATTAAGAGAGAAATTTCTGTCATGAACCTGGTTAGACATCCGAACGTGGTGGAGC TCTATGAGGTCATGGCGAGTAAAACCAAGATTTATTTTGTGATGGAATATGTTAAGGGTG GTGAGCTCTTTAATAAGGTAGCAAAAGGAAAGCTCAAGGAGGATGCTGCAAGAAAATATT 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>LITCHI006946.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACAAAATTCGTTGGAATGATATAATTATATCTTAATTTGATTTAAACAATCCGGTTATAT CTTTTCAATATACTCTTATAATAGTCATAAATAAAAATCTTAAAAAAGGTCAAGAAAACA TATACGAAGTTCCTTTCCTTGTAAGGAAGAAATAAAAAAGCAGGTGTCGGGTATCCACTT GGCCGTTAATGCTTGGTAGAAATTAATGCTAGAAAATCTGGTGATGCTGCTACCGGCCGT AAAAAGTATAGTCAAACTTTCCTAAAAATGAAAATTTAAATAAAAAAAAAAAAATACTCC CACGCCAACTAAACAACCAGTAGTTGGTAGTAGGTACGATGTACGAGTAACAGAAACAGA TACGAATTTGTCTATAATATCTCCTCCATTTAATACATCATTTTAAAATCATTCTCCAAA TCTCTCAAATTATTGTTAATTTCAATTAGGATTTAGTTAATAATAATTTGGATTAGGAAG GTGTAAGGCAAGGTCCCTTGTGTCTGGGAGCGTGTGCACTAAGGATATGGTTTACCGTTT CCGTACAGGTAAAAGGATGACAATGAAGCGAAGAAAAGGATGGGACGACAGACACGTGTC GGTGGAGAGAAGAAGCCGTTAAGGTGGTGGCAGGTTTACAGGCTGGATTTGGCAGTAAAG CAGTAATGATTCGTCCTCCGATTCGGCGACCGCTGTTGTTGTTTTGTGCCAGCTCAGCAG GTCCGTGCGTCCGTTCCTTTTTTTGTTTTATTTAAAGAAATGAAAAATGAAAAAAGGAAA AATCTAACACGAAAATGGTATACAGGCTGGCGTCCTGAGTCAAAGATAGACTGAAAACAA AAACCTTACCCAGACCCAACCGTTATCATGTTTATCCTCTCTGATATTATTTTTTTAACA AAATAAAATATGGTTGTCTCTGTTTGGATTGTCTCTTTAACTTCCACAACAGTAATTTTC TCAACTTATTTTATTAGAGGGTGGTTTCCCTAGCTGTACACTACGCTTTCACACCGCCGT GTCTAACACTCTCCTCAATTATGCCACGCCTTAATGTGACATAGTTTAAATATGTTTGAT AGGTACGTGGCCGTTTCTTGTCTCATCATATATTATATATTTATATCTAAATCTCTAAAG TTATTTTTTTACTGTTATAAAAGTAAAATTTTAAATTATACATATAATCTTAATAAAATT TATAAATTTTTAATTGTTACTGTCACTTTATAATCATATTGAAAAAAGTTAACTAATATC AATAGATTTACTTTATTAGCATTCATTAAATTATTGTTTATTTTGAAACAATAAGGTTGC AATATTATAGACGCTCCCCATTCGATTTAAAGTTAAATTTAAATCTAAATCATGGTAAAG GACGCCCCCGCTCTATGACATGAACATATTCATCACCTACTTTGAAGTAAAAGATATAGT TATAGAGAGAGAGAGAGTAGACGCTCCCAACTGAGAGAGTGCATATACAACACATAAAAA GAAAAGCAGGAGATATTAAGAGCTGAGACCATATTGATGAGACTATTTTGTAATTAATAT GATAAGATAAATTTATAAAATAATATTATTTTTTTAATATTTTTTATAAATTTTTTACTT TATTTTTTGATATTTTTATTCATCCATTTTATCAAATCAGTTCATCCCAAAAAAATGTAC TGTTTAAGAGAGTGACTCATGTAAATGAGTGCAACAAAAGAGCGACGCGTGTCACAAGCC AGCTGTATCCCAAACCCAAAATACCCCCCCAACCGCTTACCTCGAAGAAGCGGTGCCCAT AACGCTTCCTCACCCTCACTACCTGACCGGGTACCCCTCCCCCTCTCTTATATATTTCAT TTTCTCCTCATCCCCTCTTCGTTGAATTTGTGGACTCTCATTTCAAAAACTGAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTGCCTTTGCTTTGCACGATCATAAACTGAATTGCAGTTA GTTGTAATTGTATTACATCG
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>LITCHI006946.m1 GenomeSequence + ATGGCAGCTCTTAATAGAAAAGAAGTGGATCGGATCAAGGGCCCGTGGAGCCCGGAAGAG GACGAGGCACTCCAACAACTGGTCCACAAACACGGTCCCAGAAACTGGTCTCTCATCAGC AAATCCATACCAGGGAGATCGGGCAAGTCCTGTCGGCTGCGTTGGTGCAACCAGCTATCT CCCCAGGTGGAGCACCGGGCCTTCACGCCCGAGGAGGACGAGACCATCATACGCGCCCAC GCGCGCTTCGGCAACAAGTGGGCCACCATCGCGCGTCTTCTCAACGGTCGCACCGACAAC GCCATCAAGAACCACTGGAACTCTACTCTCAAACGCAAGTGCTGTTCCTCGCCCATGGCA GATGATTGTAATTTCGTTAGTTGTAAAGGGTACGATGGGGATTTCGGGGACGATAGTCAA CAGCAGCCGTTAAAGAGGTCGGTGAGTGCGGGATCCGGTGTGCCGCTGACTACCGGGCTT TATATGAGCCCCGGGAGCCCCTCGGGATCTGACGTCAGCGACTCTAGCATTCCGGTGTTG TCCTCCGGTCCGCATAATATCTACAGGCCGATGGCGAGAACCGGCGGTGTTAATGTTGAT GTAAATATGGTGCCCGAAACGACGTCGTCCTCCAACGATCCACCGACTTCACTGAGTTTG TCACTGCCAGGTGTCGAGTCGACGGAAGTAGTCAACGAGTCGACACAGCAGCAAGTAAAT ACCAAACCTTCGATGGCGGCGGCTACGGCGGCGGTGAATGGAGAAGAGAGGAGCAATGAA AGTGGGTTTGTGGGGTTCAGTGCGGATTTTATGGCAGTGATGCAGGAGATGATAAGGCAG GAGGTCAGGACGTACATGGCGGCGTTGGAGCAGCAGAGAACTGCTGGTGGTGGTGGTGGT GGTGGGGTGTTATCAGGGAGGATCCGCCGGCGGCGTGTTTAG