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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005964Chr141788800617891038+PHD finger protein MALE STERILITY 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005964.m1619665PF00628.32PHDDomain365.10E-09
LITCHI005964.m2492538PF00628.32PHDDomain36.43.90E-09
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>LITCHI005964.m1
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>LITCHI005964.m2
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>LITCHI005964.m1
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>LITCHI005964.m2
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TGCATTGTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGC
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TAGTACTTCACATAAGAATATACAAATCAACGTAAGTGATTTGTATACGAATAATAATAT
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>LITCHI005964.m1
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TTTGTTGGGTCCTTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGG
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GTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATT
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TTCACATAAGAATATACAAATCAACGTAAGTGATTTGTATACGAATAATAATATGTTAGT
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TCTGCTCCTAGTCTCTATTTCCTACAAGAGTTGTTTTCTGTTAATCAAAATTTTCTAGCA
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GTTTATGTCTGTAAAAAATCAACATATCCCAGGTGACCACAGAATTTGCAGGATTAGAAA
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AGCAATGCGTGCACCATTAATTAACATCATGTAATACGTAGCTGCGATAGATTTGCAAGG
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CTCCAATTTTATTTCCTGGCACTAATTGTGTGACCACGCACTATATCTAAGCTGTCCCAT
TTCGTGAACTTCCTTGACAT
>LITCHI005964.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TGAACTTACTAAAAGAGTGTATACCCAATTTTAGAGGGGTGTAAATATCAACCCTCCCTT
GTCGAAGTCATGAACCCAGACTATTAGATGTCATGTGACCTTGTAAAATTTGCGCTCAAG
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CTGATATGGTTTAAATTTTGTGTTTACTGATAGAACAACAACCCTGCACATTTGGAGCTG
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GTACTGAGTTTGCATGATTTTTTTTACCCTTTTCATGATCGCACAATTAATGGTATTTGG
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GCATACATAGTCTAAATATCTATTTTTATAAACTGAAGATAACTATATTCACAATAAAGG
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ATACTTATGGAGTAGTTGGCCAAGAAGTGTTGCGTTTATGTCTGTAAAAAATCAACATAT
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CATGTAATACGTAGCTGCGATAGATTTGCAAGGCACCCCTATTTTGAAACAAATCATGCG
AACAGTGACCTCTCCATATCTCAATTTCACTAGCTCCAATTTTATTTCCTGGCACTAATT
GTGTGACCACGCACTATATCTAAGCTGTCCCATTTCGTGAACTTCCTTGACATATGTTCC
TCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTTGATTTGTTTGCTATCTATC
GAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGGAGGAGAGGAGAGAGGGTAT
TTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAGTTTGTTGGGTCCTTTAGGC
ACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGGAATTTATGTGATGGAATGC
AAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCTATTCATATCTTATTGTTTG
TTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGCAAGCTCTGCCAATATGTTG
GTTAAGTATTGATCTTTTTATGCCTTTACTGCTCCTTGTTTTCCTTTTAATCCATATTCA
ATTAATTGGCACTTTTAGCGTTACAGGTAGAACTTCTTCGATATGTTAATGGGATCATAC
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CCTATGACTTGGTGAAATATGTATTTCTCACACTTTTAGTGATTTGAATTCTCCATGATA
GCTCAGGTTGGGGTCACAAT
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>LITCHI005964.m1 GenomeSequence + 
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GATTTGTTTGCTATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGG
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ATTCATATCTTATTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGC
AAGCTCTGCCAATATGTTGGTTAAGTATTGATCTTTTTATGCCTTTACTGCTCCTTGTTT
TCCTTTTAATCCATATTCAATTAATTGGCACTTTTAGCGTTACAGGTAGAACTTCTTCGA
TATGTTAATGGGATCATACAACATGCATTATGCTAATGTGTACTTATTTAAGATACATAC
ATCGATAGAAATCTCACAATTGCTTGTGAGAATAGTTTATGTTTTATAACTTTATCCTTA
CATATATAGAAAAAGGTCTCCTATGACTTGGTGAAATATGTATTTCTCACACTTTTAGTG
ATTTGAATTCTCCATGATAGCTCAGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTAT
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GGACAACATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGTTAGTC
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ATCCATATTTATAACTTCATTTACCAAACTAACCTCAAATTGCAAGGAACAGAAGAGTGG
TAACCTAGCTCAATTAACATTTTATTTACTTAAACTTTCTTTTATATATGTAAATATATA
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GAATTGGCTGTAAAGATAATTATTAAAATCAATCTAAGGACTATAATTTATGAGTAAGAT
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CCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTGGTTAC
CCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAGAATTG
TATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCAAAGAG
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TTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTGCTAGA
TTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGAAGCTT
GAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTTCCTGA
CCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGAATTCA
ATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAAGCTCT
AAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGACTCCAA
ATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAATTGTG
CTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAACCCAAA
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GAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTGGTTTT
TGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGAGGAAT
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ATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAGTGATCTCGTACACATCAATT
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