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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI005964 | Chr14 | 17888006 | 17891038 | + | PHD finger protein MALE STERILITY 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI005964.m1 | 619 | 665 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36 | 5.10E-09 |
| LITCHI005964.m2 | 492 | 538 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36.4 | 3.90E-09 |
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>LITCHI005964.m1 ATGTTCCTCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTTGATTTGTTTGCT ATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGGAGGAGAGGAGAG AGGGTATTTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAGTTTGTTGGGTCC TTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGGAATTTATGTGAT GGAATGCAAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCTATTCATATCTTA TTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGCAAGCTCTGCCAA TATGTTGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCA AAAAACATGGCGGCTGCGTTTATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAAC ATGGTGGAATTACAGGGGCATATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCAT TTGCTTTGTCTCAATGGAGTTGAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCAT TTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCA AGGAAAAGAGGCCTGGAATTGAGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTT GGTCGTTGGGGCTACAAGTTTGGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAA AAAGCCTTAGAAGCAATACAAGCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCT TCCAACCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTG GTTACCCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAG AATTGTATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCA AAGAGAGTTGACATGGCAACTCGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGG TGGGTTTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTG CTAGATTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGA AGCTTGAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTT CCTGACCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGA ATTCAATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAA GCTCTAAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGAC TCCAAATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAA TTGTGCTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAAC CCAAATGAAGAAGGGACAAAGAACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAAC AATGCTACATTCGATGAACTTAAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGG GGATTGAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTG GTTTTTGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGA GGAATTGCACTTCACCTGATGTATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCT TGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGG CAGCACACACGGTGTGTTGGGATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGC AGTCGATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG >LITCHI005964.m2 ATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCAAAAAACATGGCGGCTGCGTTT ATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAACATGGTGGAATTACAGGGGCAT ATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCATTTGCTTTGTCTCAATGGAGTT GAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACC GGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCAAGGAAAAGAGGCCTGGAATTG AGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTTGGTCGTTGGGGCTACAAGTTT GGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAAAAAGCCTTAGAAGCAATACAA GCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCTTCCAACCAAGACATTACACTC ATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTGGTTACCCTTGGTGACCTATTT CACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAGAATTGTATTGGAACCTACAAT CCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCAAAGAGAGTTGACATGGCAACT CGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGGTGGGTTTCCAGGCAAGAAGTT AGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTGCTAGATTTCGTGCTCAAATCG CTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGAAGCTTGAATCCGGTCACAAAG GTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTTCCTGACCAGGATTTGCTTCTC AACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGAATTCAATTGATGAAGGACATG AGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAAGCTCTAAGCTCAGGGAATGTT TTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGACTCCAAATACTTTGTTAAGGAA TATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAATTGTGCTTGGAAGGGAAATTG AAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAACCCAAATGAAGAAGGGACAAAG AACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAACAATGCTACATTCGATGAACTT AAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGGGGATTGAGGAGTTTCGTGATC GAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTGGTTTTTGGCCTCGTTGAAGTG GGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGAGGAATTGCACTTCACCTGATG TATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGAT GGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGGCAGCACACACGGTGTGTTGGG ATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGCAGTCGATGTGAGCAAGAGATC GTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG
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>LITCHI006310.m1 MRLPRFCFASPDEMGRLFFWVLLFLLIHGLSGFGSSGLDQGSLVLTRTASRSLLSLPPAV TRIGAGLDGTISLRDGNGTEIWKLATGSPIYSKYQAPVHQDNDDENAFEPSHGFSIECGD DWGLFVTDRHGRRMKLEWTIEDFIKRTPYISEEGAVTLGSKITTVFVIEAKTGKLIRTYQ SPDSLTAPHSYEEENALHKYDTVDKEHLKSGSRSAAEPPNKEVQLLFITRTDYIFKSFRP NSPKTSWSMRVAEIGYAFLCQEVENPFITATMNTSYELGPEIGSDFVMPFACQSKGVIQR FRKHDSSDSSARAHLPLPSSYVTLPSQPKVDKTVDNHSETTISPAPNPDPALPVQSESDK LPKLHQNGEVSETVDTYDGRMHYNSMSIISKWLTAFSPFLLITISVGIAIYYCALVAKGQ YLSNGELRTAASRRKKARKSGKNSGSADKNDKLISSESDDGHAHGDDSNKLFTDLNRLVD GGADGRRVGKLFVTNTEIAKGSNGTIVLEGIYEGRPVAVKRLVRAHHDVAFKEIQNLIAS DRHPNIVRWYGVENDQDFVYLSLERCTCSLDDFIQICLDSSHKSSSFDEGQTTKTMSEYK LRLDSVKSIIQDLNLWKANGHPSPLLLKLMRDIVSGLVHLHELGIIHRDLKPQNVLIIRE AEGSLCAKISDMGISKRLHADMSSLSHHATGGNFFLTTLLCTAYATDCCGSSGWQAPEQL LHGRQTRAVDLFSLGCVLYFCITGGKHPFGDRLERDINIAKNKVNLSLVKWIPEAEDLIS CLLNPDPQLRPSALEVLHHPLFWSSETRLSFLRDTSDRIELEDRETSSALLKALENTASV ALGTKWNEKMEPAFIANIGYYRRYRFDSVRDLLRVMRNKLNHYRELPREIQELVGPVPEG FDEYFASRFPRLLIEVYKVVCRYCREEECYQKYFKSDIL.
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>LITCHI006310.m1 ATGAGACTGCCGCGCTTTTGCTTTGCTTCACCAGATGAAATGGGCCGCCTTTTTTTCTGG GTATTGTTATTTCTGCTGATTCATGGACTCTCCGGGTTTGGAAGCTCCGGACTTGATCAG GGCTCTTTGGTTTTGACCCGAACCGCTTCAAGATCCCTGCTCTCTCTTCCGCCTGCTGTT ACGAGAATAGGTGCTGGTTTGGATGGAACAATCTCTTTGAGAGATGGTAATGGGACAGAA ATTTGGAAACTTGCCACAGGATCACCAATCTACTCTAAATATCAAGCTCCTGTACATCAA GACAATGATGACGAAAATGCCTTTGAACCAAGTCACGGGTTTTCTATAGAGTGTGGAGAC GACTGGGGGTTGTTTGTAACTGATCGTCATGGTAGAAGAATGAAACTTGAATGGACTATT GAAGACTTCATTAAAAGAACGCCATACATATCAGAAGAAGGAGCAGTTACACTTGGATCT AAGATAACTACTGTGTTTGTCATCGAGGCCAAGACTGGAAAACTGATTCGGACTTACCAG TCTCCTGATTCTTTAACTGCACCACACAGTTATGAAGAGGAGAATGCTTTACATAAGTAT GATACAGTTGATAAAGAGCACTTGAAGTCTGGTTCAAGAAGTGCTGCTGAGCCGCCAAAC AAGGAGGTTCAACTCCTTTTTATTACAAGGACAGATTACATCTTCAAGTCCTTCCGTCCA AACTCACCCAAAACTTCCTGGAGTATGAGAGTTGCTGAAATCGGATATGCTTTTCTTTGT CAAGAAGTTGAGAATCCATTTATTACAGCTACTATGAATACAAGCTATGAGCTTGGTCCA GAAATTGGCAGTGATTTTGTTATGCCATTTGCATGTCAATCGAAAGGTGTAATTCAGCGA TTTCGAAAGCATGATAGTTCAGATTCTTCTGCTAGGGCTCATCTCCCGTTGCCATCTTCA TATGTAACTCTTCCTTCCCAGCCCAAGGTTGACAAAACAGTAGACAATCATAGTGAAACT ACAATTTCTCCAGCACCTAATCCGGACCCTGCACTTCCTGTGCAATCTGAATCTGATAAA TTGCCGAAACTACATCAGAACGGTGAAGTATCTGAAACTGTTGATACATATGATGGGAGA ATGCATTATAACAGCATGTCAATCATTTCTAAGTGGTTAACTGCATTTTCTCCATTTTTG TTAATTACAATTAGTGTTGGCATTGCTATTTACTACTGTGCTCTAGTAGCGAAAGGACAA TATCTGTCAAATGGGGAGTTAAGAACTGCAGCTTCAAGACGAAAGAAAGCCCGTAAATCA GGAAAGAATAGTGGCAGTGCCGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAGCGATGAT GGACACGCTCACGGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACGGACCTTAATAGACTGGTGGAT GGTGGTGCTGATGGACGTAGAGTTGGTAAGTTATTTGTGACCAATACTGAAATAGCCAAG GGAAGCAATGGTACCATTGTCCTTGAGGGAATCTATGAAGGTCGGCCAGTTGCTGTCAAA CGACTTGTTCGAGCTCATCATGATGTGGCTTTTAAAGAAATCCAAAACCTTATTGCATCT GATAGACATCCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTGTGTAT CTTTCTCTGGAACGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTTATTCAAATTTGTTTAGATTCA TCTCATAAGTCATCATCCTTTGATGAGGGCCAAACTACGAAAACTATGAGTGAGTATAAG CTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTATCATACAGGATCTCAACTTGTGGAAAGCAAATGGC CATCCGTCACCTTTATTATTAAAATTGATGAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTGCATCTG CATGAGTTGGGAATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATTAGGGAA GCCGAAGGATCTTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAAACGCCTCCATGCA GATATGTCTTCTTTGAGTCATCATGCTACTGGCGGCAATTTCTTCCTAACTACATTGCTA TGCACTGCGTATGCTACTGATTGTTGTGGCAGCTCTGGTTGGCAAGCACCTGAACAACTT CTTCATGGACGCCAAACTCGTGCAGTAGATTTGTTCAGTTTGGGTTGTGTCCTGTATTTC TGTATCACCGGTGGTAAACATCCATTTGGCGATCGTCTTGAACGTGATATCAATATTGCT AAGAACAAAGTGAACCTTTCCTTAGTGAAGTGGATCCCTGAAGCTGAGGATCTTATTTCA TGTTTGTTAAACCCTGACCCTCAACTGAGGCCAAGTGCATTGGAAGTGTTGCATCACCCT CTATTTTGGAGTTCTGAGACGAGACTCTCATTTCTACGTGACACAAGTGACAGGATAGAG TTAGAAGATAGAGAGACCAGTTCTGCTCTCCTGAAAGCATTAGAAAATACTGCATCAGTG GCACTGGGCACAAAATGGAATGAAAAGATGGAACCAGCATTCATTGCTAATATTGGCTAT TACCGACGTTACAGATTTGACAGCGTTAGAGACCTATTGAGAGTCATGCGAAACAAGTTG AACCATTATAGAGAACTTCCCAGAGAAATTCAGGAACTTGTTGGACCAGTTCCAGAAGGA TTTGATGAGTATTTTGCGAGTCGATTTCCAAGACTATTGATAGAAGTATACAAAGTTGTA TGCAGATACTGTAGGGAAGAGGAATGCTATCAGAAATACTTCAAGAGTGACATCCTTTAA
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>LITCHI006310.m1 + Up_Stream_Len 2000 CAGCAGTCAACTTACGAATGCCAGTTCCTTTTTATTATCCCAACAACCCGACCAGATGGA CGATTTGGAACAGGATTTTGGTCACTGGTATTAACAACATTGGTATTTCTAGGAGCATCA TCAGCACTGCTTGGGGCCAGATGAACAACTTCTTCTTCCTCTTCTTCTGCAAGAAAACAA TAAATAAACAAGAATCGCCAATACAAACAGCACCCAAGCATTCAAATTATTTTAATCTAT GCTTTCAGATCTCCATCATATAAATTTACACAAAACCAAACATAATTTTTGTAAGCTTTG ATAATTTACTTTTAAGGAGGTGCTAGCAACATCTCTGCAATATGATAATCATGTTGATAA ATACCAGTTTTAGCTAACGAATACTCACAAGAAGTTTTTCCAATACAACCAACTTCCAGG AAGTCCAAAACATAAGGCCAAATGCACCATTTGTAACAAAATCCAGGATAAGCACCATTT TACAAGATAAAAAATTTGTTAAAGAACCATCTACATCGCTCAACACTCATCCACACACCC ACACAAATTCTGTAATAACAGACGAGTATGTCACTTCTTGGAAGATCAAAAGGCCAAAAC AGAAGCATACCTTCATCTGCTATAGATAACGATTTTTCTTCATGCCACTGTTCTTGAGGC AGAAGTTCCACAGCCACAATATCTCCATCAAAAGCTCTATTCATGTTTGTGCGTCCATAT ATAATTATTTCATCACCAATGCTCTCACTTCCAACATAAGCTTCAAATGGATTGTAACGG TTGACACGAAGCTTTCCTTGATGGTAAATCCCACAACGCAACCCACTAGTAATCTCAGAC ATTGGTTTGTGCTGAACAACAAACAAAGAACAAGAAAACTTACAAAACCACATCACATCA CAAAAACCTACATTGAACAAAAGAATATTCAACCGTCCTATACCTCAGCATAAACAACTT TCCTCTTTGAAGGCCTTAAATCTTCAGCATATTCCATATTTACATCTTCAGACGCAGGTT GTACAACCAAGTCAAGCAAATTCGGTTGTCCCAATGACTTCACATACGACTCAACTGAAA ACAGAAACATTTATAATCACCAACCTCCCCTCACAAAAATCACTAAACACACAAGAAAAA AAAAAAAAAACCACACATACTGGTCTCCGCAAAAATGCCTTGCTCAATAGCCTTCCTCTT ATTCTCTCTATCATTAGTAACAAGCAAAACCCGCGTATCATCACCAAGATGCTTCTGATA CCAGAGAGTGGCCACCCGAATTGCTGAATCATACAATACATCAAACAGTTTGAAATACAT AAAACTCTAAAAACAGAAAACAAAGTCCATAAAAAGAGAATAACATCCCTAACCTCTATC ATTGAGATCATTTGGAGTCTCTTTTTCCATCTTTTCAACATGTGTATCCCTAACCAACCA ACACAGGCACTACAATTTTATACTTCAATGAATTTAAATTGAACATTAATTTATAAGGAA AAAAAAAAAACCAACAACTCACTTGTGGAATGTATTAGCAAAAACATGGAATCTCCTGAG AGTGTTACTAGAAAGAGCTCGAATTCGATTATAGACAGTCAAGTTCTTGTTTTTAACTTC GTCCAACACCACAGACAGCACCACCACGTTATCAATCGCCGGATTCTCCAGCAAATCAAT CTACAAAAACCTCTACAATATAAGCAAACCACACAACAAATTACAAAGCTTAGTTTTTTT AGAAAAAAAAGAGACCTGGTTGAGGACGACGTTAGTGTCAACGACGAGCACAGTGGAGGA GGAGGAGAGGCGGGCAGAGGAGGAGGACTGGTGGCAGGCGGAGCAGAGGAGGTGCCACAG GAGATGTTGTCTCGAAGGTAGACTTCTCTGACTTCCTTCTTTATCTTGTTATTTCGCGTC TTCTTGCTGAACACGTTGCTCTTCAACATCTTTACACGATGGTTTCGATGAGTTTTCAAA AGCTGTCAGTCGAGTCACTG
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>LITCHI006310.m1 GenomeSequence + ATGAGACTGCCGCGCTTTTGCTTTGCTTCACCAGGTAGAAGACGAACCTTCCATTTATAG GAGAATTTTCTGGGCTGGCTATCTGTTTAATGGGCCGACGCCCCATGTTTTGTTGCCATC GGCCCACGTATAGGCCTACATCACTTTTTTTTTTTTTTTGCAATTTTTAATTATTTAATT ATTTTTTTCGATACAAACTAACATTAATTAATTGTTAAATAATACACAGCGATGTATACA TAGTTGAAAGACAAAATCTAACGACACACGTGACTTGGACCGGTTGCAAAACTAGACCAA CAAGCTCAAGTTGATGGTTGATCCTAAAATTGTAACCTTTGAGTAAGCATGGAATCTTCC TCGACCTCAAAAACCATTGAAAAAGGAAAACAATCTTAAATAAAAAAAAAAAAAAAAATC TTGACTTGACCCCTTAAACAGTCCAATCTCTCTAAGAGTCTCTTCTTCTTCATATATATA TATATATATATATATATATATATATATATGATATATTCTCATCAACTTCAACTTTGTTTT TGGAGTTCAGATGAAATGGGCCGCCTTTTTTTCTGGGTATTGTTATTTCTGCTGATTCAT GGACTCTCCGGGTTTGGAAGCTCCGGACTTGATCAGGGCTCTTTGGTTTTGACCCGAACC GCTTCAAGATCCCTGCTCTCTCTTCCGTGAGTAATCATGTTTTCTTCTTCTTTTATTGAA TTTTGTTAACAAGTTTGATTTTGGGTGTTCAAGTATGTGTTTGATTGGAGTTTATCAGGG TTGAGGCAAGAGTTGACTTTTTGAATCAGTGTTGAAGATAGAAGCTTATTAGTAATTTCA AAATGGCTGATTTTTCGCTCAATTTAGTACTATGCATGCATTGTCTATGTCACTGATGTA 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