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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI005964 | Chr14 | 17888006 | 17891038 | + | PHD finger protein MALE STERILITY 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI005964.m1 | 619 | 665 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36 | 5.10E-09 |
| LITCHI005964.m2 | 492 | 538 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36.4 | 3.90E-09 |
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>LITCHI005964.m1 ATGTTCCTCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTTGATTTGTTTGCT ATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGGAGGAGAGGAGAG AGGGTATTTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAGTTTGTTGGGTCC TTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGGAATTTATGTGAT GGAATGCAAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCTATTCATATCTTA TTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGCAAGCTCTGCCAA TATGTTGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCA AAAAACATGGCGGCTGCGTTTATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAAC ATGGTGGAATTACAGGGGCATATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCAT TTGCTTTGTCTCAATGGAGTTGAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCAT TTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCA AGGAAAAGAGGCCTGGAATTGAGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTT GGTCGTTGGGGCTACAAGTTTGGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAA AAAGCCTTAGAAGCAATACAAGCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCT TCCAACCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTG GTTACCCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAG AATTGTATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCA AAGAGAGTTGACATGGCAACTCGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGG TGGGTTTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTG CTAGATTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGA AGCTTGAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTT CCTGACCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGA ATTCAATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAA GCTCTAAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGAC TCCAAATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAA TTGTGCTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAAC CCAAATGAAGAAGGGACAAAGAACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAAC AATGCTACATTCGATGAACTTAAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGG GGATTGAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTG GTTTTTGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGA GGAATTGCACTTCACCTGATGTATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCT TGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGG CAGCACACACGGTGTGTTGGGATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGC AGTCGATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG >LITCHI005964.m2 ATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCAAAAAACATGGCGGCTGCGTTT ATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAACATGGTGGAATTACAGGGGCAT ATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCATTTGCTTTGTCTCAATGGAGTT GAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACC GGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCAAGGAAAAGAGGCCTGGAATTG AGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTTGGTCGTTGGGGCTACAAGTTT GGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAAAAAGCCTTAGAAGCAATACAA GCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCTTCCAACCAAGACATTACACTC ATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTGGTTACCCTTGGTGACCTATTT CACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAGAATTGTATTGGAACCTACAAT CCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCAAAGAGAGTTGACATGGCAACT CGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGGTGGGTTTCCAGGCAAGAAGTT AGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTGCTAGATTTCGTGCTCAAATCG CTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGAAGCTTGAATCCGGTCACAAAG GTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTTCCTGACCAGGATTTGCTTCTC AACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGAATTCAATTGATGAAGGACATG AGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAAGCTCTAAGCTCAGGGAATGTT TTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGACTCCAAATACTTTGTTAAGGAA TATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAATTGTGCTTGGAAGGGAAATTG AAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAACCCAAATGAAGAAGGGACAAAG AACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAACAATGCTACATTCGATGAACTT AAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGGGGATTGAGGAGTTTCGTGATC GAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTGGTTTTTGGCCTCGTTGAAGTG GGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGAGGAATTGCACTTCACCTGATG TATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGAT GGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGGCAGCACACACGGTGTGTTGGG ATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGCAGTCGATGTGAGCAAGAGATC GTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG
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>LITCHI024606.m1 MGRAPCCDKANVKKGPWSPEEDSKLKEYIEKYGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLN YLRPNIKHGEFTDEEDRMICTLFASIGSRWSIIAAHLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLMAL APPQRKPPPFPSSHHQTTTLPFPSQSSLFSLNKDCTSSYYTPAKSFTCFDSFDQPISSNL STSHLLNNNNTQFQAQEHQLVSSMQFYSPMNENFLMFGSDQTSCSSSDGSCSQISYGKEI KQEDQVGGFQGGGYNYSSNGFEEDHNLFMLNYGCTNNSNSSTATTTITTGGENLNIWTEK TNGLFGETPPPISHYSTTTSTSTLEDVKQLISSSCVNGYNDDNNNTNNNFLTDANKYYFY YNY.
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>LITCHI024606.m1 CTTTGACTTATGTATCTTTTTGAATTAAAATATTTATATAGTTTTTTACTGTAGACACGC TCAAATCTCTTATATTAATTGGTACAATAGGACACCCCCACCAAAGTTCATCCAGAAAGT AAGACCTTTGGTTCCTTAAAGAGGTCAGCAGATATCCAAGAGATCATAAACTTCTTTCGG ACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTAGGGCTCCTTGCTGTGACAAGGCAAATGTGAA GAAGGGGCCATGGTCACCAGAAGAAGACTCAAAGCTGAAGGAGTACATAGAGAAGTATGG TACTGGCGGGAACTGGATTGCTCTTCCTCAAAAAGCTGGTCTAAAGAGATGTGGGAAAAG TTGCAGACTAAGATGGCTCAACTATTTGAGGCCAAACATTAAACATGGTGAATTTACTGA TGAGGAAGATAGGATGATCTGCACTCTCTTTGCTAGCATTGGAAGCAGATGGTCAATAAT TGCTGCTCACTTGCCAGGCAGGACTGACAATGATATCAAGAACTACTGGAATACTAAACT GAAGAAGAAGCTCATGGCCTTGGCTCCTCCTCAAAGAAAACCACCTCCATTTCCATCTTC TCATCATCAAACCACTACCTTACCATTCCCATCTCAATCCTCTTTGTTCTCACTAAACAA AGACTGCACATCATCATATTACACTCCCGCCAAATCTTTCACTTGTTTTGATTCATTTGA TCAACCCATCTCATCAAACCTGTCAACATCACATCTTTTGAACAACAACAACACACAGTT TCAAGCCCAAGAACACCAGCTAGTCAGTTCCATGCAGTTCTATAGTCCGATGAATGAAAA TTTCCTCATGTTTGGTAGTGACCAGACAAGTTGTAGTTCTTCTGATGGGAGTTGCAGCCA GATCAGCTATGGAAAGGAGATCAAGCAAGAAGATCAAGTGGGTGGTTTCCAGGGTGGTGG TTATAATTACTCATCAAATGGGTTTGAAGAGGACCACAATTTGTTCATGCTCAATTATGG CTGCACCAACAACAGTAACAGTAGTACTGCTACTACTACTATTACAACTGGAGGTGAAAA TCTGAACATTTGGACTGAGAAGACAAATGGGTTGTTTGGAGAAACCCCACCACCAATATC ACATTATAGTACAACTACTTCCACTTCTACTCTCGAAGATGTTAAGCAATTGATTAGCTC AAGTTGCGTTAATGGCTACAACGATGACAACAACAACACCAACAACAATTTCCTCACTGA TGCAAACAAGTACTACTTCTACTACAACTACTGATGATAAATGATGATAAAAGGCACTGA CTAAAAGTGAAAAATCAGACAGAGAGATTTGATGGGGTAAGGAAAGAGGTATGGTGATTG TGAGAGATGTTCAGAGATTTTAAAAAGAAGGTTGAGTTCCTGGGAGATCGTGTTTTGATG AAATGAAACATATTTCTTCCTTTGACGGTACATGGTAAAAGCTTCTTTTGATTTTGTGCA TAATATAATTGTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTCTTCTGATGATGATGATGATGTTAT GTGTTGTACGGCCTCACTGCAACACCCCAATCAATGTTAAACGTTTATGAAAACTAGACA AGTTATCATCATTTAACCCCTATAATCTCCTCTCTATCTAACTTAACCAAACATCCACTT TCTATATTTTTACTGCCCTCTCTCGTTTTCTGTTCTTATGTATATATGTGATATTGTCAG TATTGTTGGGGTATTGATGTGTTGTACATATACTTGCTGAAATGACAGTTCTAGCCCG
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>LITCHI024606.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCGTTCGACCCCATGACTTCAATTCCTATGTGTCACTTAGCTACGCATGCTAATGAACCC AGTAAGGAAATGCTAAAATGTAGCAGAACTATCTGTAAGAATTGTTTGCCCACTTTCACA TTACGAAAACTGTGACAATGTACAAGCTATGATGCGTCAACAACTCAATATATAGGTGGT GCCATTGATGAGTAGTCAGTCCCAAACACCTGATCAGATCATCAATTAAGGACAAAGAAT CTCATCCATACTTGGGCCCCTCTCTTTCGATCGATTGTTTGTTCGTTTCTCATTAATAAA TACTGATGACATTATATATGCACAATCGATGAGGTTACAGACTGTTGAAATATTTGATTT CGAATAACAATGGATTGGTTTAGAATAGGGTGAATTTCCAATTATAGACTGTCGTTGTAT TGGCATGCCCACTAGCTAGTTATTATATTACGCGTGAATTGTCCACTAGTTGTAATATTA AAATAGAATGTAATATAACTTAACAAATGAAATTTGATATCTAATATTAAAGATTTGATA TTTCATAGATTCATTATATTTTGATATTAAAATAGGATGTAATATAACTTGACAAATGAA ATTTGATATCTAATATTAAAGATTTGATATATCATAGACTCATTATATTTTGAACCTTTG ACATTATATCAAACAACTACTGGAACTTAGTTATTATAGAACTCTAACGTGCAGATTAGA TTATTGTTATCAAAATCGATAGACATTAATTCATATATAAAATATAAAATGAAAAAATTA TCACACTATTGAAAGTGTTAAAGTTCGAACTATGTCTTACGCTTATAAAAAGTGGGCAAA AAGGATTGTGACATTACACCAACCCATAGAGCTCTATATGTTCATTATATTGATACATAA TCTCGTATATTAAGAGGATTAATTTAACTCATTTATCTATTTTTGAAAAAATTATATTCT TTGCCTCTGCCCTAAAATTCATGTACATGTTAACACAAATTTAAAGAAAATAACAAATAA TCATCACTGGAATTAGTAATTGGGATCAGTGCCAGTACGCATTAGATTTCACTCACGAAA TATGTACTTTAAAGCTACCTATACAGGACAAAGCAAAAAAGAAGAAAATAAATTTTTTAA AAAAAAGTTAAACTGAAAAGTCTTAGTAGGCCTTAAATACTTCCTGGCTAGTTGTAGCCT CTACATGTATTCAATGTACTAGACTAGCTATTGTACGCATTTTGCCACTCGAATTTTCGA TATACACATTTGATTGTCACTGGTATAATCGGTTTAGGTGTATTGAAAATTTTTCATACA AATATCTTTTGAAGAAATTATAAAATAAATTTTGTATATACACAATACGTTATAGTGAAA TTGACTCATAAATTTAAAATTCGTCGAGAAGTATTATTATTACAGAACCATAAATACAGC CTTACAAGTACAACCACAAATTTATAAATAGCTTTGAGGTAATTATAAACATTTTTAACG TACCATTAAGTTGAAGACAGTTAGTTATATGTTTATCTACCTATCACTAAGTCTTTGGTT TGGAAAGTGTCACATTTCAAAGGTCCTCTATGTCTACCAGTACATATTGTCAATTGCTTT GTTCTATTTTCTACTTTGTCAAGACTTTGGATGCCTTTTAAAGAGGACTGAGAGCAAGGT TATATTTAGAGTACTTGCATTTCAGATAGAAAGTTCCACCAGCATATATATATAAATATA TGTGGGCGTTTGTGTGTGTAAGCTAATTAGCATAAGAACTGATTGGACTTGTCAATCACT TTGACTTATGTATCTTTTTGAATTAAAATATTTATATAGTTTTTTACTGTAGACACGCTC AAATCTCTTATATTAATTGGTACAATAGGACACCCCCACCAAAGTTCATCCAGAAAGTAA GACCTTTGGTTCCTTAAAGAGGTCAGCAGATATCCAAGAGATCATAAACTTCTTTCGGAC ACAGAGAGAGAGAGAGAGAG
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>LITCHI015934.m4 GenomeSequence + GTGAAAAAAATGAAAAAATGAAAAAAATGCCAGTGAGGGTGCAGTGTAAACCAAGAAGCT TCTTTTCTCTCTCGCTCTGTGAGTCTCTCTCTCTCATCAGATCTCTCTTTTATATAGACA CATGTATTTGTTTGTAAATAACAAGCTCTGCAAATGTACTGATTTTTTTTTGAAATTTTA AACTTATTCGATTATTCGCTTTTTGTTAAAAAAAAAGTAAGTGTGTGGATTCTTTGACTG CGTATTGTTGATTTTGTTTGATAATTGTGAGGAAGATCTAGTTTGGAATTGATGTTGTTG AGTGATTAGATCTTGTTTGACTGTGTTGAATTTGTTGGCTGATGATCTGTGGTGATTGCA GTTGAATTGACTTTTGTAGTGTATTTGTTGAAGGTAGCTTCTATTTTGTTAGTTTTGTTT GGTTAGGGTTTTTTATTGGAATGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGGTTTGATTTTGTG TGTTGAATTGTTGTTGGGATTAATTGTTGTGTGGTTGTTTATGTAGGGGTGAGGATTGCT GATTAGGATATTGGATATTGTAGGGATTTGGGAAGTTGATTGTTAATTTTGTTATTAGGG AGGCTTGGTTCGGAGGAAATTTGTGTTTAGATGGATAAGGATAAGTTGTCGAGCCATGTA GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTCCTGCCTCCATCTGGTCGTTTCTCAGGGTTTCCACCA CCTGCAGGGAACCCTAGTTTCAGTGTAAAAACGGAGCCATCTTCGTCTGTGTTTCCTCCG TTGGCTCCTGGTAGTTCTAGCTCGAATGGGGCGCATTTTGGTCATCAGTCGGATTCTAGC CGGTTTAGCAATGATATCAGCAGAATGCCTGATAACCCGCCGAAGAACGTAGGCCACCGT 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