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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI005964 | Chr14 | 17888006 | 17891038 | + | PHD finger protein MALE STERILITY 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI005964.m1 | 619 | 665 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36 | 5.10E-09 |
| LITCHI005964.m2 | 492 | 538 | PF00628.32 | PHD | Domain | 36.4 | 3.90E-09 |
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>LITCHI005964.m1 ATGTTCCTCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTTGATTTGTTTGCT ATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGGAGGAGAGGAGAG AGGGTATTTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAGTTTGTTGGGTCC TTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGGAATTTATGTGAT GGAATGCAAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCTATTCATATCTTA TTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGCAAGCTCTGCCAA TATGTTGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCA AAAAACATGGCGGCTGCGTTTATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAAC ATGGTGGAATTACAGGGGCATATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCAT TTGCTTTGTCTCAATGGAGTTGAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCAT TTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCA AGGAAAAGAGGCCTGGAATTGAGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTT GGTCGTTGGGGCTACAAGTTTGGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAA AAAGCCTTAGAAGCAATACAAGCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCT TCCAACCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTG GTTACCCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAG AATTGTATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCA AAGAGAGTTGACATGGCAACTCGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGG TGGGTTTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTG CTAGATTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGA AGCTTGAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTT CCTGACCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGA ATTCAATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAA GCTCTAAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGAC TCCAAATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAA TTGTGCTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAAC CCAAATGAAGAAGGGACAAAGAACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAAC AATGCTACATTCGATGAACTTAAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGG GGATTGAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTG GTTTTTGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGA GGAATTGCACTTCACCTGATGTATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCT TGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGG CAGCACACACGGTGTGTTGGGATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGC AGTCGATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG >LITCHI005964.m2 ATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTCATTTTGCCCTCAAAAAACATGGCGGCTGCGTTT ATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCTGTTAAGTCCAACATGGTGGAATTACAGGGGCAT ATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAATGGTTTCGGGCATTTGCTTTGTCTCAATGGAGTT GAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAACATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACC GGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTGTATGATATTTCAAGGAAAAGAGGCCTGGAATTG AGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGCGAGACCTGGTTTGGTCGTTGGGGCTACAAGTTT GGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAGTCTATGTATCAAAAAGCCTTAGAAGCAATACAA GCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAATCATCTTGGAGCTTCCAACCAAGACATTACACTC ATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCGGACTACTCTTTGGTTACCCTTGGTGACCTATTT CACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGACTTCCCAAAGAGAATTGTATTGGAACCTACAAT CCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGTAGATGGTCTGCAAAGAGAGTTGACATGGCAACT CGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGGGCTGAATCCAGGTGGGTTTCCAGGCAAGAAGTT AGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGCGATACAGGGTTGCTAGATTTCGTGCTCAAATCG CTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTACTTGGTTCGTAGAAGCTTGAATCCGGTCACAAAG GTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATTTCCAACATATTTCCTGACCAGGATTTGCTTCTC AACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTATAAAATTACAGGAATTCAATTGATGAAGGACATG AGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAAGACCAAAAGCAAGCTCTAAGCTCAGGGAATGTT TTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGGATAATTCTAGACTCCAAATACTTTGTTAAGGAA TATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCATCTAAAGTTGAATTGTGCTTGGAAGGGAAATTG AAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAAAATACTGAAAACCCAAATGAAGAAGGGACAAAG AACACAATGCCACCATATGAATGCATCACGTTGAAAAACAATGCTACATTCGATGAACTT AAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGGGAACTCTATTGGGGATTGAGGAGTTTCGTGATC GAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAAGGAACCGATTTGGTTTTTGGCCTCGTTGAAGTG GGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGTAACAAAGAGAGAGGAATTGCACTTCACCTGATG TATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATTGTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGAT GGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATTTGTGAGGTTTGGCAGCACACACGGTGTGTTGGG ATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGTATATTTCTTTGCAGTCGATGTGAGCAAGAGATC GTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAG
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>LITCHI005964.m1 MFLQRDNYFFIGFWFFDLFAIYRNMSHLELNGCKKRRRGERVFRFNNFCENGHPVEFVGS FRHNVKALLEFGSFERNLCDGMQSWSFQLEVHRHPPIHILLFVVEEPIGISSNHQCKLCQ YVGWGHNMVCNKKYHFILPSKNMAAAFINCEGKEEAVKSNMVELQGHILHGVFHSNGFGH LLCLNGVETGSDLTGQHLMHFWGRLCTGLRARKVSLYDISRKRGLELRLLHAVAYGETWF GRWGYKFGRGSFGVTQSMYQKALEAIQAMPLCMLINHLGASNQDITLIFSRYQTLSDYSL VTLGDLFHFLFELKPRLPKENCIGTYNPGVLAETTSRWSAKRVDMATRAIVEALKRAESR WVSRQEVRDVARAYIGDTGLLDFVLKSLGNHIVGKYLVRRSLNPVTKVLEYSLEDISNIF PDQDLLLNNSKTKARYKITGIQLMKDMRNLFKYIFKDQKQALSSGNVFSGITIAARIILD SKYFVKEYCGDDHQLSSKVELCLEGKLKLFCTILLKNTENPNEEGTKNTMPPYECITLKN NATFDELKLEVERSFRELYWGLRSFVIESVVNLKAKGTDLVFGLVEVGRKIVFEGSNKER GIALHLMYENGVVNCIVDCPCGTQEDDGERMISCDICEVWQHTRCVGIPNNEEIPRIFLC SRCEQEIVQLPSLL. >LITCHI005964.m2 MVCNKKYHFILPSKNMAAAFINCEGKEEAVKSNMVELQGHILHGVFHSNGFGHLLCLNGV ETGSDLTGQHLMHFWGRLCTGLRARKVSLYDISRKRGLELRLLHAVAYGETWFGRWGYKF GRGSFGVTQSMYQKALEAIQAMPLCMLINHLGASNQDITLIFSRYQTLSDYSLVTLGDLF HFLFELKPRLPKENCIGTYNPGVLAETTSRWSAKRVDMATRAIVEALKRAESRWVSRQEV RDVARAYIGDTGLLDFVLKSLGNHIVGKYLVRRSLNPVTKVLEYSLEDISNIFPDQDLLL NNSKTKARYKITGIQLMKDMRNLFKYIFKDQKQALSSGNVFSGITIAARIILDSKYFVKE YCGDDHQLSSKVELCLEGKLKLFCTILLKNTENPNEEGTKNTMPPYECITLKNNATFDEL KLEVERSFRELYWGLRSFVIESVVNLKAKGTDLVFGLVEVGRKIVFEGSNKERGIALHLM YENGVVNCIVDCPCGTQEDDGERMISCDICEVWQHTRCVGIPNNEEIPRIFLCSRCEQEI VQLPSLL.
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>LITCHI005964.m2 CTTCCTTGACATATGTTCCTCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTT GATTTGTTTGCTATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGG AGGAGAGGAGAGAGGGTATTTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAG TTTGTTGGGTCCTTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGG AATTTATGTGATGGAATGCAAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCT ATTCATATCTTATTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGC AAGCTCTGCCAATATGTTGGTTAAGTATTGATCTTTTTATGCCTTTACTGCTCCTTGTTT TCCTTTTAATCCATATTCAATTAATTGGCACTTTTAGCGTTACAGGTAGAACTTCTTCGA TATGTTAATGGGATCATACAACATGCATTATGCTAATGTGTACTTATTTAAGATACATAC ATCGATAGAAATCTCACAATTGCTTGTGAGAATAGTTTATGTTTTATAACTTTATCCTTA CATATATAGAAAAAGGTCTCCTATGACTTGGTGAAATATGTATTTCTCACACTTTTAGTG ATTTGAATTCTCCATGATAGCTCAGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTAT CACTTCATTTTGCCCTCAAAAAACATGGCGGCTGCGTTTATAAATTGTGAAGGCAAAGAA GAAGCTGTTAAGTCCAACATGGTGGAATTACAGGGGCATATCTTGCATGGTGTTTTTCAC TCCAATGGTTTCGGGCATTTGCTTTGTCTCAATGGAGTTGAAACTGGTTCGGACTTGACT GGACAACATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGAAAGTG AGTTTGTATGATATTTCAAGGAAAAGAGGCCTGGAATTGAGGCTACTTCATGCAGTGGCA TACGGCGAGACCTGGTTTGGTCGTTGGGGCTACAAGTTTGGACGTGGGAGCTTTGGTGTT ACTCAGTCTATGTATCAAAAAGCCTTAGAAGCAATACAAGCCATGCCTCTGTGCATGCTC ATCAATCATCTTGGAGCTTCCAACCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACA TTATCGGACTACTCTTTGGTTACCCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAG CCCCGACTTCCCAAAGAGAATTGTATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACG ACAAGTAGATGGTCTGCAAAGAGAGTTGACATGGCAACTCGAGCGATTGTTGAAGCACTG AAAAGGGCTGAATCCAGGTGGGTTTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTAT ATTGGCGATACAGGGTTGCTAGATTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGG AAGTACTTGGTTCGTAGAAGCTTGAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAA GACATTTCCAACATATTTCCTGACCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCT CGGTATAAAATTACAGGAATTCAATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATC TTCAAAGACCAAAAGCAAGCTCTAAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCT GCAAGGATAATTCTAGACTCCAAATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAG CTTTCATCTAAAGTTGAATTGTGCTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTA CTAAAAAATACTGAAAACCCAAATGAAGAAGGGACAAAGAACACAATGCCACCATATGAA TGCATCACGTTGAAAAACAATGCTACATTCGATGAACTTAAGTTAGAAGTTGAAAGAAGT TTCAGGGAACTCTATTGGGGATTGAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAA GCCAAAGGAACCGATTTGGTTTTTGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAA GGAAGTAACAAAGAGAGAGGAATTGCACTTCACCTGATGTATGAAAATGGGGTGGTAAAT TGCATTGTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGC GATATTTGTGAGGTTTGGCAGCACACACGGTGTGTTGGGATTCCTAATAATGAAGAAATT CCTCGTATATTTCTTTGCAGTCGATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTT TAGTGATCTCGTACACATCAATTTCCTTTATTATTTTTTTTACGTTTAATATGTACACTG TAGTACTTCACATAAGAATATACAAATCAACGTAAGTGATTTGTATACGAATAATAATAT GTTAGTTATAATATTTTTTGGGGGGACAAATATTAATTATAATTTTATTCACGTGG >LITCHI005964.m1 CTTCCTTGACATATGTTCCTCCAAAGAGATAATTATTTCTTCATTGGTTTCTGGTTCTTT GATTTGTTTGCTATCTATCGAAATATGTCGCATTTGGAGTTAAATGGGTGCAAGAAAAGG AGGAGAGGAGAGAGGGTATTTAGGTTCAATAACTTTTGTGAAAATGGCCACCCAGTTGAG TTTGTTGGGTCCTTTAGGCACAATGTAAAAGCTCTTCTGGAATTTGGAAGTTTTGAGAGG AATTTATGTGATGGAATGCAAAGCTGGTCGTTTCAACTTGAAGTCCATCGCCATCCTCCT ATTCATATCTTATTGTTTGTTGTTGAAGAACCAATTGGAATATCAAGCAACCATCAATGC AAGCTCTGCCAATATGTTGGTTGGGGTCACAATATGGTTTGCAATAAGAAGTATCACTTC ATTTTGCCCTCAAAAAACATGGCGGCTGCGTTTATAAATTGTGAAGGCAAAGAAGAAGCT GTTAAGTCCAACATGGTGGAATTACAGGGGCATATCTTGCATGGTGTTTTTCACTCCAAT GGTTTCGGGCATTTGCTTTGTCTCAATGGAGTTGAAACTGGTTCGGACTTGACTGGACAA CATCTCATGCATTTCTGGGGTCGTTTATGCACCGGATTGCGAGCAAGGAAAGTGAGTTTG TATGATATTTCAAGGAAAAGAGGCCTGGAATTGAGGCTACTTCATGCAGTGGCATACGGC GAGACCTGGTTTGGTCGTTGGGGCTACAAGTTTGGACGTGGGAGCTTTGGTGTTACTCAG TCTATGTATCAAAAAGCCTTAGAAGCAATACAAGCCATGCCTCTGTGCATGCTCATCAAT CATCTTGGAGCTTCCAACCAAGACATTACACTCATTTTCTCAAGATACCAAACATTATCG GACTACTCTTTGGTTACCCTTGGTGACCTATTTCACTTTTTGTTCGAGCTCAAGCCCCGA CTTCCCAAAGAGAATTGTATTGGAACCTACAATCCGGGAGTCTTGGCTGAAACGACAAGT AGATGGTCTGCAAAGAGAGTTGACATGGCAACTCGAGCGATTGTTGAAGCACTGAAAAGG GCTGAATCCAGGTGGGTTTCCAGGCAAGAAGTTAGGGATGTTGCTCGTGCTTATATTGGC GATACAGGGTTGCTAGATTTCGTGCTCAAATCGCTTGGAAACCACATAGTAGGGAAGTAC TTGGTTCGTAGAAGCTTGAATCCGGTCACAAAGGTTCTCGAGTATAGCTTGGAAGACATT TCCAACATATTTCCTGACCAGGATTTGCTTCTCAACAATTCAAAAACGAAGGCTCGGTAT AAAATTACAGGAATTCAATTGATGAAGGACATGAGAAACTTGTTCAAGTACATCTTCAAA GACCAAAAGCAAGCTCTAAGCTCAGGGAATGTTTTTAGTGGAATAACAATTGCTGCAAGG ATAATTCTAGACTCCAAATACTTTGTTAAGGAATATTGTGGAGATGATCACCAGCTTTCA TCTAAAGTTGAATTGTGCTTGGAAGGGAAATTGAAGCTTTTTTGTACAATTTTACTAAAA AATACTGAAAACCCAAATGAAGAAGGGACAAAGAACACAATGCCACCATATGAATGCATC ACGTTGAAAAACAATGCTACATTCGATGAACTTAAGTTAGAAGTTGAAAGAAGTTTCAGG GAACTCTATTGGGGATTGAGGAGTTTCGTGATCGAATCGGTTGTGAATTTGAAAGCCAAA GGAACCGATTTGGTTTTTGGCCTCGTTGAAGTGGGAAGAAAGATTGTTTTCGAAGGAAGT AACAAAGAGAGAGGAATTGCACTTCACCTGATGTATGAAAATGGGGTGGTAAATTGCATT GTAGATTGTCCTTGTGGAACTCAAGAAGATGATGGTGAACGCATGATCTCGTGCGATATT TGTGAGGTTTGGCAGCACACACGGTGTGTTGGGATTCCTAATAATGAAGAAATTCCTCGT ATATTTCTTTGCAGTCGATGTGAGCAAGAGATCGTGCAATTGCCTTCTTTACTTTAGTGA TCTCGTACACATCAATTTCCTTTATTATTTTTTTTACGTTTAATATGTACACTGTAGTAC TTCACATAAGAATATACAAATCAACGTAAGTGATTTGTATACGAATAATAATATGTTAGT TATAATATTTTTTGGGGGGACAAATATTAATTATAATTTTATTCACGTGG
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>LITCHI025681.m2 + Up_Stream_Len 2000 ACATTTTATTTTTATCATTTTTAATTATTAGTTTTCATTATTTTTTAATTTTTAAATTTC AAAATGATGGATCTTTATACTAACATATTTGACTGGTAAAATAAAAGTTATTTTAATATT TTTATACTTTAACTAACGGTAAATGAACCATAATTAGCGGCGGGATGCACTACAACGTAA CCATCAAGTAATGTTTACACAATTATGTCAAAATTTTACATTTTTATATAGTTACACAAA CATCAGGGTCTTAATGTAATTTACCCTTCCGCAATCGCTTCCAACTTCCGCACTCAATGG TCCAGATTTAAAATAGCTGGACTGTCCGTATCCTGGCTGTTCATTGCGAGACCGTTATAA TTATAAAACCACACATTCGTTGGAAAAATCAGAAACTGCGTCGTTTTGACGCCAGACAAT AACAACATCGCTATTTCCCGCCTTGTCTATGTTGCCGGCAATCACAATCCAACATCTCAA TATCTATTTGGTTGGAGAGAAATAATTCGATTGGTTTCTTCTTCGTCGGTCCTTCACGAG CCAAACAGGTAAGAAAGAAACCCTAACCCTAATCTTCAATCATTTTTGGCGATGAATTCA ACGAGGCTTTTAATTATTTGATTATTTGTCGGAATCTTATCAGCATACAAGCAAAAACCT AGTTGTATCCGCAAACGATGACAACAACTTTGGATTATTCGACATCATTAACTGTCACTC CTTCAATGATGAGCTGTTATGTCTTCAAACAACACCGCGTCTGGTCTTTTCCATTCACTC TACTGCTTCGATTATTTTGGCTTCCGTGCTTTGGAAATGGAAGATTGTCCATCACCGCTT TCAACGGTAACGTTTCCATTACGATGCTTTCTTTGTAATGATGTAAAAAGATTGAAGTAA 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