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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005963 | Chr14 | 17858251 | 17864104 | - | Protein BASIC PENTACYSTEINE1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005963.m1 | 1 | 285 | PF06217.15 | GAGA_bind | Domain | 388.7 | 3.70E-116 |
LITCHI005963.m2 | 1 | 285 | PF06217.15 | GAGA_bind | Domain | 388.7 | 3.70E-116 |
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>LITCHI005963.m1 ATGGATGATGATGCGTTGAATATGCGTAACTGGGGTTACTATGAACCGTCCTTTAAAGGG CATCTCGGTCTGCAGCTCATGTCAAGCATGGCGGACCGGGACACCAAACCTTTTCTGCCT GGACGTGATCCTAGTATTATGGTTAGCACCAATGGCGCGTATCATCCCCGGGACTGTGTG GTTTCGGAGACATCGATCCCTATGAATTATGTGAGGGATAGTTGGATGAACCAGCAGAGG GAAAAGTTTTTGAACATGTTACCGGCGAATCCTAACTATGGGGTACTTCCGGAAACTTCA GGAGCGCACTCCTTGCAAATGCTACAACCACCGCCCAACACTACTACTACGAGGGATGAT AGAGTGGCACCTAGAGTTGAAGAGCCAGTAGTCAAAACTGAAGGAGGTGGTGGTGCTCAA GTAAAGAAAAGGCAGGGCGGGGGTGTGCCAAAGACCCCGAAACCTAAGAAGGCTAGGAAG CCGAAGGATAATGGAGCAGCTGTTCAGCGTGTAAAACCAGCTAAGAAGAGTATGGATGTG GTGATCAATGGGATTGATATGGACATTTCAGGTATTCCTATTCCTGTCTGCTCATGCACT GGAACTCCTCAGCAGTGTTATCGATGGGGTTGTGGCGGTTGGCAGTCTGCTTGTTGTACA ACAAATGTGTCAATGTATCCTTTGCCGATGAGCACCAAAAGACGTGGTGCAAGGATAGCC GGGCGGAAGATGAGTCAGGGGGCATTTAAGAAGGTATTGGAGAAACTCGCAGCCGAAGGT TACAATTTTGCTAACCCAATTGATTTGAGGACTCATTGGGCTAGACATGGTACCAACAAG TTTGTTACTATCAGGTAG >LITCHI005963.m2 ATGGATGATGATGCGTTGAATATGCGTAACTGGGGTTACTATGAACCGTCCTTTAAAGGG CATCTCGGTCTGCAGCTCATGTCAAGCATGGCGGACCGGGACACCAAACCTTTTCTGCCT GGACGTGATCCTAGTATTATGGTTAGCACCAATGGCGCGTATCATCCCCGGGACTGTGTG GTTTCGGAGACATCGATCCCTATGAATTATGTGAGGGATAGTTGGATGAACCAGCAGAGG GAAAAGTTTTTGAACATGTTACCGGCGAATCCTAACTATGGGGTACTTCCGGAAACTTCA GGAGCGCACTCCTTGCAAATGCTACAACCACCGCCCAACACTACTACTACGAGGGATGAT AGAGTGGCACCTAGAGTTGAAGAGCCAGTAGTCAAAACTGAAGGAGGTGGTGGTGCTCAA GTAAAGAAAAGGCAGGGCGGGGGTGTGCCAAAGACCCCGAAACCTAAGAAGGCTAGGAAG CCGAAGGATAATGGAGCAGCTGTTCAGCGTGTAAAACCAGCTAAGAAGAGTATGGATGTG GTGATCAATGGGATTGATATGGACATTTCAGGTATTCCTATTCCTGTCTGCTCATGCACT GGAACTCCTCAGCAGTGTTATCGATGGGGTTGTGGCGGTTGGCAGTCTGCTTGTTGTACA ACAAATGTGTCAATGTATCCTTTGCCGATGAGCACCAAAAGACGTGGTGCAAGGATAGCC GGGCGGAAGATGAGTCAGGGGGCATTTAAGAAGGTATTGGAGAAACTCGCAGCCGAAGGT TACAATTTTGCTAACCCAATTGATTTGAGGACTCATTGGGCTAGACATGGTACCAACAAG TTTGTTACTATCAGGTAG
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>LITCHI017924.m1 MNGPIHVKISYLKLFTIVLWLYGTNRSCVVVSAAAEDDVKCLKGVKSSLHDPEGRLRNWT FTNTTVASICTLRGVLCWDAEENRIFSLELVGMKLSGQVPESLKYCHSLQLLNLSNNDLS GPIPAQLCSWLPYLVTLDLSNNDISGSIPTELGNCTYLNTLILSNNHLSGHIPCQLSHLP RLKNFSVANNYLSWRIPSFFSRASMSRLAIDCRFSVEPPGSKPGGRLSNGKLAFISAAVA FAATGAFLLSFALGWWCLFRWGRRKRVYEIVRDDYHRWLIANQHVEVSLFKKPLVKIQLA DLMKATNNFDAENIIVSTRKGTTYKAVLLDGSELAIKVLNTCKLGEKQFRSEMNQLGLLK HPNLAPLLGFCILEKEKLLVYKHMSNGTLYALLHGGSSRIELDWLTRFQIGLGAARGLAW LHHGCQPPFLHQNICSNVILVDEDFDARIMDFGLARLMTSSDESSYVDGDLGEFGYIAPE YSSTMVPSLKGDVYGLGVVLLELVSGQKPLDISTADGGFKGNLVDWVNQLSKSGRIKDAI DKTLRGKGYDEDVLQFLEIASNCVVSRPKDRWSMYQVYQSLNSIAEKHGLSEQYNEFPLL FMEFHKHYSDFNMQVTWCLCWNAIEYRIFSLELAAMKLSGQVPESLKYCHSLQLLNLSNN VLFGPIPAQLCSWLPYLVTLDLSNNNISGSIPPELGNCIYLNTLILSNNHLSGHIPYQLS NLTRLQNFSVAYNNLSGEIPSFFSGVSMPSFAKDSSFSDKPSGSKPAVANNDPSRRIPSF FSQVSTSCLAICSIFLVEPLESKLGGWLSNRKLAVISAAVGFGATGALLLSFALGWWCSF RWGRRKRVYDIGRDDYRCWLIANQHVEVSLFKTPLVKIQLADLMKATDNFGAENIIVSTR KGTTYKAVLLDGSELAIKLLNTCKLGEKQFQSEMNRLGLLKHPNLAPVLGFCVSEKEKLL VYKHMSNGTLYSLLHGGSSRIELDWLTRFQIGLGAARGLAWLHHGCQPPLLHQNICSNVI LVDEDFDARIMDFGLARLMTLSDESSYVDGDVGEFGYIAPEY.
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>LITCHI010905.m1 AATAATCACATTTTCTACTAGCGTGCTTAAAACGCGGCCTTGTATCGAGGGGTAACTACT TTAATTTGAAGTCAAATGAAGAAATGACTGTTCTAAAATTCCTTAAGTTTCTTAGTTATT GTTGTTGTTGGTAGATGAAAAATGTAAGACTTGTTTTCCTCTCGTTTGGGGCACAGATAT TATTTAAGCCCTGATAGAGTGGGAATTTTAATTATCAGATATCTGACGAATGGATATCTC AATTTCCTTGTTTATTCTTTTTCTCTTGCCAACTCTTATATCTTCCTCTAAAACATTTGA TAATGTTCTCACACAAGGCTCGTCTTTATCTGTGGAGAGATCAAGCGACCGTTTGACTTC ATCAAACGGTGTTTACTCAGCAGGGTTCTTCTCCGTTGGCGATAATGCTTTCACCTTTGC TGTATGGTTCGCCAAATCTTCACCACCCACTGCGGCTTGGATGGCTAACCGTGACGTGCC TGTCAATGGAAAAGGCTCCAAGCTTTCACTTCTGAGAAATGGCGATCTTTCCTTGACTGA TGCTGGTGGAATCTTGATATGGAATTCTAAAACCTTTTCAGGCGGTTCTCCAGTACAATT AGTCCTTTCAGACACTGGCAATCTTGTTCTCTTTACTTTAGGGAGTTTAAATCGAACACT CTGGCAAAGCTTCGATTCACCAACGGATACTCTTCTTCCAGAGCAACCATTCACCAACGC CACACAACTTGTCTCGTCAAGAAGCCAAGGCAATTGTTCTTCAGGTTTCTTTAAGTTCTT TTTCGACGACGACAACGTTCTGCGCCTTCTTTTCACTGGTCCTTTGATATCAAGTGTTTA TTGGCCATTGCTTTGGAAGGGACTCTATCTCTGGGACTTGGGAAGAACAACCTACAACAA CACCAGAGTGGCAGTATACGATAGTTCAGGCTACTTCATGTCATCTGACAATTATACGTT CAGGCCATCGGACTACGGTATGGGGCCCCGTAGAAGATTGACGCTTGATTATGATGGCAA CGTTCGAATGTATAGCCTAATAGAGGCTACGGGGAAGTGGGATGTGTCCTGGCAACTGGA ATCCAGTCCATGCACGATTCATGGCGTCTGCGGAGAATATAGTCTATGCAGTTATGATCC TTATAATGGTAGGAAATGCTCTTGCTTACCCGGATCCAAAATAAAAAATCACACTGATTG GTCATATGGTTGCCAACTTGACTCAGAAATCCGTTGCAACAAAACAGAAGTTGGTTTCGT CCAGCTCTCCCATGTTGATTTCTATGGCTTTGATATTCGCTACATACCAAATTCCACCAT CAGTGAGTGTCGAAAGGAATGCCTGCAATTATGCAATTGTAAGGGATTCATGCTTCTATA TGATCAAAAGAGAGGCGAGAACGACTGCTATCTGAAATTCCTTTTGATTAATGGACGCCT TTCGCCGAATTTTCGTGGAATCACCTACTTCAAATTGCCTAAAGACAGAATTTCGTTCTC GAAAAACAACAAGACCAGAGCTATGTCCACTTTGGATTGCTCAGGCCTAGCTCCAATAAT ACTGGATAGAAGGTACGAGAAACCCAGAGAAAATGAATCATGGTGGATTTTGCTCTGGCT CGCCTCTGGTTTTGGATGTTTTGAGGTGATGTGCATTTTTTTGGTATTGTGTTACCTGTA TAGGACCAATCGAGAGGTGGACGCTTCTACTCAAGGCTACATTCTCGGGGCGACAGGATT TAAAAGATTTAGTTACAGTGAGCTCAAAAAAGCCACTCTTGGTTTCACCCAAGAAATCGG TAGAGGCGCAGGAGGTATTGTTTACAAAGGCACATTATCTGATGGTAGAGTTGCAGCAAT CAAGCGACTCGATGAAGCAAACCAAGGAGAAGCTGAATTCCTAGCAGAAATAAGGTCAAT TGGGAAGCTGAACCACATGAATTTGATAGAAATGTGGGGATATTGTGTTGAGGGAAAGCA GAGGCTCCTAGTTTATGAGTATATGCAGCGTGGATCTTTAGCAGAAAATCTTTCCTCCAA CCAACTTAAATGGGATAAAAGGTTTGGAATTGCGGTTGGAACTGCAAAAGGTTTGGCTTA TTTGCATGACGAGTGCTTGGAGTGGATTTTGCACTGCGATATTAAGCCCAAAAACATACT CTTGGACTTCAATTACCAACCAAAGGTGGCTGACTTTGGCTTGTCTAAACTTTTAAACAG GGGTGGCCTCAACAATTCAAGCTTCTCAAAAGTAAGAGGAACCAGAGGTTATATGGCTCC TGAATGGGTTTACAATCTTCCCATCACTTCAAAAGTGGACGTTTATAGCTATGGCATTGT TGTGTTGGAGATGATAACGGGAAAAAGCCCTACCGGTATTTTAACCTTTGACTATGGAGA GTTGACTGCAAATGGTAGATTGGTGACATGGGTGAAGGAGAAGGTGAACAAGGCTGCTGC AACAGATTCTTGGGTTGAAGAAATTTTAGACCCCTCATTGGGATGTGAGTGCGACATTAA TGAGATGAAGGTTTTGGTTAAAGTTGCCCTGCTATGTTTAGAAGAAGAAAAAGATTCAAG ACCCACCATGAGGCAAGTGGTAGAGATGTTAGCTTCTCTGCAATGCAATGATTTCCAACA TCTTGTTGACGCCTGAGATACGTTACACTTCATTTCAAGGCACCATGCATGGATTTTATG TGAGCTCTTCTTAAAAGAGTTTGGTTGTCATATCATATTTGAATTTTGTCAGACCGTCGT CGGTCGGTATTTATTGCATTTGTATGATGGTATTACTTTTGTCAAGCGGTCGTCGGTCGA TATTTATTTTCTTTTAAATCACTTCAGTCGCTTGCTTTAGTTTGTCTTTAATTGTAATGT GAATAATATCCAATGAATTTGAATTTGAAATGAAATACATATGGTC
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>LITCHI010905.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTATACCTAATTTTAAAAAATAAAATCAATCAATCAAATTTATCGATTACATTTGAATTA AATAAAAGAGAAAAATTGTTTTAAGAGAAAGAATGCAATAGATAAATTTAATTTATTAAT CTTTACTTTTAAAATTAAGTATATCTTATTATAAAATATATATATAATAATTCTACTATT ATTGTCTCCTGACTTTTTAAAGTTAGGATGAATCAATCAAATTCATCTATTGCATTTTAA AGTTAGGCGGTACTAACAGTAAAAGCACTATATATATATTCTCTCTCTCCTATTTAATTC AAATACAATTGATGAATTTAATTTATTTATCTTAACTTTTTAAAGTTAGGAACTACTGAT AGTAAAATCACTATATATAAAATTATAGTCTAACACATTCAATTCATTGCTCCAATGTCA AATATGACCTGTTTAATTCTTAAATTAATGGATATCGTAACAATGAGTAAAATGTTATGA ATACAATATAATCATAAGAATAAATGTCCATCAATCCAAGAAAATAAATTCTGATTTTTT ATATTTTTTTATTAATTTACTATCATGATTTATTTTATTGTAATTGTTAACTTATTATAA TAAACTGTGATAGTGAGCCTATTACATGAGTTTTTATCATTGTATTTGTATGTTATTTGA TGGAAATACTGGGAAATTATAAATTTTCTTCTTTTTGGGCTATCATTTCCTTTTCTCTCT CTTTGTGTTATTATGTTTTAATTTCTTTATTTTCAATTGTTTCATAAAGTAGAACTATAT ATTATTAAATTTCAAATTCATTATCAGTAATCAACATATATAGTTGATCGAGATCAAAAA AATAATAATATTAAATAATCAATATCCTTGCAGTAAGTTAGTGTTATAATTGTTGCTTAC GCCTGTAACTAACTGTATCCTCTTTGTTTGAGAACTTGCTAGATTCACACTATTTAATTT GCTCTAAATTTATCCAGAAGTACATATAAAATCATCGTCATTGATAATTGTATATAATGG ATTTTATTAACTTACTGATTGGATAAAAGTATCCCTCAATAACAATCTTTAGATTAGTTG TAATAATAGTTATTAAATAATATTCAAGAGTTGTTATTGATAGGTAACCTGATCTAATAA AAAAGATAGTCAAAGTCATATACAATGAGTTTTATTAACTTACTGATTAGATAAGGTTAT CCATCAATAATAACTCTTGGATTGATTGTAAGGGTGATTATTAAAAAATATCGTTGTTAT TGATAGGTAACCTTATGTATCTAAGCAATAAGGTAATCAAATCCATATACAATAAATTTT ACTAATTTATCGATTGGATAAGGTTATTCATTAATAATAACATTTTAATTTATTAGAATA TATTACGAGGCTCCTTGGCTTACGTTTTCCTTGCAAAGGTCGTCAGGCCTCAGTATCCCG AGTTTCACAAACATAAGCTTTTCTCATGAAAATTATAAAGTATTCATGCGGTCTATCTTC CTAGACAGGTAACCAGACCTACCCCGTCTCCTAATGGTAAACAAGCAAAAGCTGACTTAC TAGAAACTTTTGGTTCTATTTTTCGTGTTATTGAGGTAAGTTCAAGCTACGTGCAACACT CGTAAGCGATAAACAAAGCACAGCAATCTCATTAAGAGATAAGAATCTCCTGGACTTAGA CCACCTGGCTCCTTCGTATTGGTGCATATGCTTTCTGGTTTCCAAAGTGTGGAAACAATA CGCGTTGGAAAAACCAGGTCGCAAAAGGAAAAATAATCACATTTTCTACTAGCGTGCTTA AAACGCGGCCTTGTATCGAGGGGTAACTACTTTAATTTGAAGTCAAATGAAGAAATGACT GTTCTAAAATTCCTTAAGTTTCTTAGTTATTGTTGTTGTTGGTAGATGAAAAATGTAAGA CTTGTTTTCCTCTCGTTTGGGGCACAGATATTATTTAAGCCCTGATAGAGTGGGAATTTT AATTATCAGATATCTGACGA
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>LITCHI027382.m1 GenomeSequence - AGACACACCGAATTGACTCTATATATATATATTTCTCATATTTTACTTAGAACTTGAAAG ATCACCATGAAAGAAGATGATCATGATTACAGTTGCGAGCAAAATTCCGGGACAACCCAC TTTAACAAAAGCAATATTATCGGCTGTGAAGATTATATGGTGGAAAAGGTCTGCAAGTCA GATAACAATATTGGAGAGAGCTCATCAATCAGCAACAGCTCAGTTGAAGATCATGATGAA GATCCTGATCAAGAGAATCATGATGAAAAGAATATCAAGGCATGTGCAGCTTCTTCTTCT TCAGCTGGATCTACAAGGCAGTACAATCGATCCAAGACGCCGAGGCTGCGTTGGACACCT GAGCTCCATTTATGCTTTGTTCATGCTGTAGAAAGACTGGGAGGAAAAGAAAGTGAGTGC TTCTTCTTTTTTCTCTTCTTCTTTTATGTGTTCTTGGTCATATATATTTTTTGGGCTTCA AAAGAGGAGTTTGTTAGTGATATAAAAATAGCTTTATTTATTTAATCTGATGATGAGTAG GAGCAACACCTAAGTTGGTTCTTCAATATATGAACATCAAAGGCCTAAACATATCTCATG TGAAGAGTCATCTTCAGGTATATATATTCTAATCTCTAGAAACATATAGTATAATCTGCC TAGTATGTCACAGATAATTAATGTAAAGTTTAATTGTTCAATCTATTATTAATATAATAA TTGATTTGTTAATTTGTATAAACCCATTTTCAATTTGATTTTTTTAGATGTACAGAAGCA AGAAAATCGATGACCCGGTTCAACCTACAGGTAAAGTTTTTGATCTGTTGATATCCATGG AAAAAGTTAATTTAAAAAATTAGGGTTTCTTTTATATATATGATGTTATTATATTTACAT ATAATATAGTGGAATAATTTTGATAGGTTTCAATCAACTCGCAATTCTCCGAAGTTTCAA ACGAAGGCCTAGATCTTCAAGTTTAATTAGGTAAAAGAAGTACAATTTTCATGCTTTCTT TTGAGTTCTAAACTGAGTTGATTGCTGCTATATATTCAGTTTCAGTTTTATATAATATAT AGAATATAATAACATGGTGTTTTTGATTAACCATTAACGGTATGGTGGTGATGATCATGA TCAAATTTAAAATGGCCCTGATAGAGCAAGACATGGAGTTTTTTATGCTTCAATGGCTGA GAGAATATTAGCAAGCCACAACAAAAAAATGAAAACACAACATCAAAGCCAAAGCAGACC ATACTCCTCATCATCTACATTGGAACACAACAGATCAACTCATGAGTCCATACAAGTAAG TAAAGGAATAGATGATCATCAACATCAAACAAAATGTTTGAAAAACAGTAGCTCTTCATC AATATCATCATCACCTGGTCATGATGATGGTACTAATAATAATGGATGGAAATTGATGGA AGACCAAGTGGGAAACATCAGGCTAATGAAGAGGAAGATCATTTTGGACTCAGAATCTGA AATGGATTTGAATCTATCTCTGAAAATAAAATCAAACATTGATCATGATCATAATCATGA TGATTTTGAAAGGGGTTCGGATTGTGCTACTAGTGATGTTGAAGGAGATCATGGTAGCTT ATTGTGTCTTTCTCTGTCTTCTTCATCATCTTCATCACCAAAGCCGATTAGCAGATTGAA GTTAGAAAATAATAATCAGAAGCATGAAAGGACAATTGCAAGTACTCTAGATCTGACTTT GTAA