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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005963Chr141785825117864104-Protein BASIC PENTACYSTEINE1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005963.m11285PF06217.15GAGA_bindDomain388.73.70E-116
LITCHI005963.m21285PF06217.15GAGA_bindDomain388.73.70E-116
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>LITCHI005963.m1
ATGGATGATGATGCGTTGAATATGCGTAACTGGGGTTACTATGAACCGTCCTTTAAAGGG
CATCTCGGTCTGCAGCTCATGTCAAGCATGGCGGACCGGGACACCAAACCTTTTCTGCCT
GGACGTGATCCTAGTATTATGGTTAGCACCAATGGCGCGTATCATCCCCGGGACTGTGTG
GTTTCGGAGACATCGATCCCTATGAATTATGTGAGGGATAGTTGGATGAACCAGCAGAGG
GAAAAGTTTTTGAACATGTTACCGGCGAATCCTAACTATGGGGTACTTCCGGAAACTTCA
GGAGCGCACTCCTTGCAAATGCTACAACCACCGCCCAACACTACTACTACGAGGGATGAT
AGAGTGGCACCTAGAGTTGAAGAGCCAGTAGTCAAAACTGAAGGAGGTGGTGGTGCTCAA
GTAAAGAAAAGGCAGGGCGGGGGTGTGCCAAAGACCCCGAAACCTAAGAAGGCTAGGAAG
CCGAAGGATAATGGAGCAGCTGTTCAGCGTGTAAAACCAGCTAAGAAGAGTATGGATGTG
GTGATCAATGGGATTGATATGGACATTTCAGGTATTCCTATTCCTGTCTGCTCATGCACT
GGAACTCCTCAGCAGTGTTATCGATGGGGTTGTGGCGGTTGGCAGTCTGCTTGTTGTACA
ACAAATGTGTCAATGTATCCTTTGCCGATGAGCACCAAAAGACGTGGTGCAAGGATAGCC
GGGCGGAAGATGAGTCAGGGGGCATTTAAGAAGGTATTGGAGAAACTCGCAGCCGAAGGT
TACAATTTTGCTAACCCAATTGATTTGAGGACTCATTGGGCTAGACATGGTACCAACAAG
TTTGTTACTATCAGGTAG
>LITCHI005963.m2
ATGGATGATGATGCGTTGAATATGCGTAACTGGGGTTACTATGAACCGTCCTTTAAAGGG
CATCTCGGTCTGCAGCTCATGTCAAGCATGGCGGACCGGGACACCAAACCTTTTCTGCCT
GGACGTGATCCTAGTATTATGGTTAGCACCAATGGCGCGTATCATCCCCGGGACTGTGTG
GTTTCGGAGACATCGATCCCTATGAATTATGTGAGGGATAGTTGGATGAACCAGCAGAGG
GAAAAGTTTTTGAACATGTTACCGGCGAATCCTAACTATGGGGTACTTCCGGAAACTTCA
GGAGCGCACTCCTTGCAAATGCTACAACCACCGCCCAACACTACTACTACGAGGGATGAT
AGAGTGGCACCTAGAGTTGAAGAGCCAGTAGTCAAAACTGAAGGAGGTGGTGGTGCTCAA
GTAAAGAAAAGGCAGGGCGGGGGTGTGCCAAAGACCCCGAAACCTAAGAAGGCTAGGAAG
CCGAAGGATAATGGAGCAGCTGTTCAGCGTGTAAAACCAGCTAAGAAGAGTATGGATGTG
GTGATCAATGGGATTGATATGGACATTTCAGGTATTCCTATTCCTGTCTGCTCATGCACT
GGAACTCCTCAGCAGTGTTATCGATGGGGTTGTGGCGGTTGGCAGTCTGCTTGTTGTACA
ACAAATGTGTCAATGTATCCTTTGCCGATGAGCACCAAAAGACGTGGTGCAAGGATAGCC
GGGCGGAAGATGAGTCAGGGGGCATTTAAGAAGGTATTGGAGAAACTCGCAGCCGAAGGT
TACAATTTTGCTAACCCAATTGATTTGAGGACTCATTGGGCTAGACATGGTACCAACAAG
TTTGTTACTATCAGGTAG
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>LITCHI017924.m1
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FTNTTVASICTLRGVLCWDAEENRIFSLELVGMKLSGQVPESLKYCHSLQLLNLSNNDLS
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RLKNFSVANNYLSWRIPSFFSRASMSRLAIDCRFSVEPPGSKPGGRLSNGKLAFISAAVA
FAATGAFLLSFALGWWCLFRWGRRKRVYEIVRDDYHRWLIANQHVEVSLFKKPLVKIQLA
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HPNLAPLLGFCILEKEKLLVYKHMSNGTLYALLHGGSSRIELDWLTRFQIGLGAARGLAW
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YSSTMVPSLKGDVYGLGVVLLELVSGQKPLDISTADGGFKGNLVDWVNQLSKSGRIKDAI
DKTLRGKGYDEDVLQFLEIASNCVVSRPKDRWSMYQVYQSLNSIAEKHGLSEQYNEFPLL
FMEFHKHYSDFNMQVTWCLCWNAIEYRIFSLELAAMKLSGQVPESLKYCHSLQLLNLSNN
VLFGPIPAQLCSWLPYLVTLDLSNNNISGSIPPELGNCIYLNTLILSNNHLSGHIPYQLS
NLTRLQNFSVAYNNLSGEIPSFFSGVSMPSFAKDSSFSDKPSGSKPAVANNDPSRRIPSF
FSQVSTSCLAICSIFLVEPLESKLGGWLSNRKLAVISAAVGFGATGALLLSFALGWWCSF
RWGRRKRVYDIGRDDYRCWLIANQHVEVSLFKTPLVKIQLADLMKATDNFGAENIIVSTR
KGTTYKAVLLDGSELAIKLLNTCKLGEKQFQSEMNRLGLLKHPNLAPVLGFCVSEKEKLL
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LVDEDFDARIMDFGLARLMTLSDESSYVDGDVGEFGYIAPEY.
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>LITCHI010905.m1
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TTAATTTGAAGTCAAATGAAGAAATGACTGTTCTAAAATTCCTTAAGTTTCTTAGTTATT
GTTGTTGTTGGTAGATGAAAAATGTAAGACTTGTTTTCCTCTCGTTTGGGGCACAGATAT
TATTTAAGCCCTGATAGAGTGGGAATTTTAATTATCAGATATCTGACGAATGGATATCTC
AATTTCCTTGTTTATTCTTTTTCTCTTGCCAACTCTTATATCTTCCTCTAAAACATTTGA
TAATGTTCTCACACAAGGCTCGTCTTTATCTGTGGAGAGATCAAGCGACCGTTTGACTTC
ATCAAACGGTGTTTACTCAGCAGGGTTCTTCTCCGTTGGCGATAATGCTTTCACCTTTGC
TGTATGGTTCGCCAAATCTTCACCACCCACTGCGGCTTGGATGGCTAACCGTGACGTGCC
TGTCAATGGAAAAGGCTCCAAGCTTTCACTTCTGAGAAATGGCGATCTTTCCTTGACTGA
TGCTGGTGGAATCTTGATATGGAATTCTAAAACCTTTTCAGGCGGTTCTCCAGTACAATT
AGTCCTTTCAGACACTGGCAATCTTGTTCTCTTTACTTTAGGGAGTTTAAATCGAACACT
CTGGCAAAGCTTCGATTCACCAACGGATACTCTTCTTCCAGAGCAACCATTCACCAACGC
CACACAACTTGTCTCGTCAAGAAGCCAAGGCAATTGTTCTTCAGGTTTCTTTAAGTTCTT
TTTCGACGACGACAACGTTCTGCGCCTTCTTTTCACTGGTCCTTTGATATCAAGTGTTTA
TTGGCCATTGCTTTGGAAGGGACTCTATCTCTGGGACTTGGGAAGAACAACCTACAACAA
CACCAGAGTGGCAGTATACGATAGTTCAGGCTACTTCATGTCATCTGACAATTATACGTT
CAGGCCATCGGACTACGGTATGGGGCCCCGTAGAAGATTGACGCTTGATTATGATGGCAA
CGTTCGAATGTATAGCCTAATAGAGGCTACGGGGAAGTGGGATGTGTCCTGGCAACTGGA
ATCCAGTCCATGCACGATTCATGGCGTCTGCGGAGAATATAGTCTATGCAGTTATGATCC
TTATAATGGTAGGAAATGCTCTTGCTTACCCGGATCCAAAATAAAAAATCACACTGATTG
GTCATATGGTTGCCAACTTGACTCAGAAATCCGTTGCAACAAAACAGAAGTTGGTTTCGT
CCAGCTCTCCCATGTTGATTTCTATGGCTTTGATATTCGCTACATACCAAATTCCACCAT
CAGTGAGTGTCGAAAGGAATGCCTGCAATTATGCAATTGTAAGGGATTCATGCTTCTATA
TGATCAAAAGAGAGGCGAGAACGACTGCTATCTGAAATTCCTTTTGATTAATGGACGCCT
TTCGCCGAATTTTCGTGGAATCACCTACTTCAAATTGCCTAAAGACAGAATTTCGTTCTC
GAAAAACAACAAGACCAGAGCTATGTCCACTTTGGATTGCTCAGGCCTAGCTCCAATAAT
ACTGGATAGAAGGTACGAGAAACCCAGAGAAAATGAATCATGGTGGATTTTGCTCTGGCT
CGCCTCTGGTTTTGGATGTTTTGAGGTGATGTGCATTTTTTTGGTATTGTGTTACCTGTA
TAGGACCAATCGAGAGGTGGACGCTTCTACTCAAGGCTACATTCTCGGGGCGACAGGATT
TAAAAGATTTAGTTACAGTGAGCTCAAAAAAGCCACTCTTGGTTTCACCCAAGAAATCGG
TAGAGGCGCAGGAGGTATTGTTTACAAAGGCACATTATCTGATGGTAGAGTTGCAGCAAT
CAAGCGACTCGATGAAGCAAACCAAGGAGAAGCTGAATTCCTAGCAGAAATAAGGTCAAT
TGGGAAGCTGAACCACATGAATTTGATAGAAATGTGGGGATATTGTGTTGAGGGAAAGCA
GAGGCTCCTAGTTTATGAGTATATGCAGCGTGGATCTTTAGCAGAAAATCTTTCCTCCAA
CCAACTTAAATGGGATAAAAGGTTTGGAATTGCGGTTGGAACTGCAAAAGGTTTGGCTTA
TTTGCATGACGAGTGCTTGGAGTGGATTTTGCACTGCGATATTAAGCCCAAAAACATACT
CTTGGACTTCAATTACCAACCAAAGGTGGCTGACTTTGGCTTGTCTAAACTTTTAAACAG
GGGTGGCCTCAACAATTCAAGCTTCTCAAAAGTAAGAGGAACCAGAGGTTATATGGCTCC
TGAATGGGTTTACAATCTTCCCATCACTTCAAAAGTGGACGTTTATAGCTATGGCATTGT
TGTGTTGGAGATGATAACGGGAAAAAGCCCTACCGGTATTTTAACCTTTGACTATGGAGA
GTTGACTGCAAATGGTAGATTGGTGACATGGGTGAAGGAGAAGGTGAACAAGGCTGCTGC
AACAGATTCTTGGGTTGAAGAAATTTTAGACCCCTCATTGGGATGTGAGTGCGACATTAA
TGAGATGAAGGTTTTGGTTAAAGTTGCCCTGCTATGTTTAGAAGAAGAAAAAGATTCAAG
ACCCACCATGAGGCAAGTGGTAGAGATGTTAGCTTCTCTGCAATGCAATGATTTCCAACA
TCTTGTTGACGCCTGAGATACGTTACACTTCATTTCAAGGCACCATGCATGGATTTTATG
TGAGCTCTTCTTAAAAGAGTTTGGTTGTCATATCATATTTGAATTTTGTCAGACCGTCGT
CGGTCGGTATTTATTGCATTTGTATGATGGTATTACTTTTGTCAAGCGGTCGTCGGTCGA
TATTTATTTTCTTTTAAATCACTTCAGTCGCTTGCTTTAGTTTGTCTTTAATTGTAATGT
GAATAATATCCAATGAATTTGAATTTGAAATGAAATACATATGGTC
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>LITCHI010905.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GTATACCTAATTTTAAAAAATAAAATCAATCAATCAAATTTATCGATTACATTTGAATTA
AATAAAAGAGAAAAATTGTTTTAAGAGAAAGAATGCAATAGATAAATTTAATTTATTAAT
CTTTACTTTTAAAATTAAGTATATCTTATTATAAAATATATATATAATAATTCTACTATT
ATTGTCTCCTGACTTTTTAAAGTTAGGATGAATCAATCAAATTCATCTATTGCATTTTAA
AGTTAGGCGGTACTAACAGTAAAAGCACTATATATATATTCTCTCTCTCCTATTTAATTC
AAATACAATTGATGAATTTAATTTATTTATCTTAACTTTTTAAAGTTAGGAACTACTGAT
AGTAAAATCACTATATATAAAATTATAGTCTAACACATTCAATTCATTGCTCCAATGTCA
AATATGACCTGTTTAATTCTTAAATTAATGGATATCGTAACAATGAGTAAAATGTTATGA
ATACAATATAATCATAAGAATAAATGTCCATCAATCCAAGAAAATAAATTCTGATTTTTT
ATATTTTTTTATTAATTTACTATCATGATTTATTTTATTGTAATTGTTAACTTATTATAA
TAAACTGTGATAGTGAGCCTATTACATGAGTTTTTATCATTGTATTTGTATGTTATTTGA
TGGAAATACTGGGAAATTATAAATTTTCTTCTTTTTGGGCTATCATTTCCTTTTCTCTCT
CTTTGTGTTATTATGTTTTAATTTCTTTATTTTCAATTGTTTCATAAAGTAGAACTATAT
ATTATTAAATTTCAAATTCATTATCAGTAATCAACATATATAGTTGATCGAGATCAAAAA
AATAATAATATTAAATAATCAATATCCTTGCAGTAAGTTAGTGTTATAATTGTTGCTTAC
GCCTGTAACTAACTGTATCCTCTTTGTTTGAGAACTTGCTAGATTCACACTATTTAATTT
GCTCTAAATTTATCCAGAAGTACATATAAAATCATCGTCATTGATAATTGTATATAATGG
ATTTTATTAACTTACTGATTGGATAAAAGTATCCCTCAATAACAATCTTTAGATTAGTTG
TAATAATAGTTATTAAATAATATTCAAGAGTTGTTATTGATAGGTAACCTGATCTAATAA
AAAAGATAGTCAAAGTCATATACAATGAGTTTTATTAACTTACTGATTAGATAAGGTTAT
CCATCAATAATAACTCTTGGATTGATTGTAAGGGTGATTATTAAAAAATATCGTTGTTAT
TGATAGGTAACCTTATGTATCTAAGCAATAAGGTAATCAAATCCATATACAATAAATTTT
ACTAATTTATCGATTGGATAAGGTTATTCATTAATAATAACATTTTAATTTATTAGAATA
TATTACGAGGCTCCTTGGCTTACGTTTTCCTTGCAAAGGTCGTCAGGCCTCAGTATCCCG
AGTTTCACAAACATAAGCTTTTCTCATGAAAATTATAAAGTATTCATGCGGTCTATCTTC
CTAGACAGGTAACCAGACCTACCCCGTCTCCTAATGGTAAACAAGCAAAAGCTGACTTAC
TAGAAACTTTTGGTTCTATTTTTCGTGTTATTGAGGTAAGTTCAAGCTACGTGCAACACT
CGTAAGCGATAAACAAAGCACAGCAATCTCATTAAGAGATAAGAATCTCCTGGACTTAGA
CCACCTGGCTCCTTCGTATTGGTGCATATGCTTTCTGGTTTCCAAAGTGTGGAAACAATA
CGCGTTGGAAAAACCAGGTCGCAAAAGGAAAAATAATCACATTTTCTACTAGCGTGCTTA
AAACGCGGCCTTGTATCGAGGGGTAACTACTTTAATTTGAAGTCAAATGAAGAAATGACT
GTTCTAAAATTCCTTAAGTTTCTTAGTTATTGTTGTTGTTGGTAGATGAAAAATGTAAGA
CTTGTTTTCCTCTCGTTTGGGGCACAGATATTATTTAAGCCCTGATAGAGTGGGAATTTT
AATTATCAGATATCTGACGA
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>LITCHI027382.m1 GenomeSequence - 
AGACACACCGAATTGACTCTATATATATATATTTCTCATATTTTACTTAGAACTTGAAAG
ATCACCATGAAAGAAGATGATCATGATTACAGTTGCGAGCAAAATTCCGGGACAACCCAC
TTTAACAAAAGCAATATTATCGGCTGTGAAGATTATATGGTGGAAAAGGTCTGCAAGTCA
GATAACAATATTGGAGAGAGCTCATCAATCAGCAACAGCTCAGTTGAAGATCATGATGAA
GATCCTGATCAAGAGAATCATGATGAAAAGAATATCAAGGCATGTGCAGCTTCTTCTTCT
TCAGCTGGATCTACAAGGCAGTACAATCGATCCAAGACGCCGAGGCTGCGTTGGACACCT
GAGCTCCATTTATGCTTTGTTCATGCTGTAGAAAGACTGGGAGGAAAAGAAAGTGAGTGC
TTCTTCTTTTTTCTCTTCTTCTTTTATGTGTTCTTGGTCATATATATTTTTTGGGCTTCA
AAAGAGGAGTTTGTTAGTGATATAAAAATAGCTTTATTTATTTAATCTGATGATGAGTAG
GAGCAACACCTAAGTTGGTTCTTCAATATATGAACATCAAAGGCCTAAACATATCTCATG
TGAAGAGTCATCTTCAGGTATATATATTCTAATCTCTAGAAACATATAGTATAATCTGCC
TAGTATGTCACAGATAATTAATGTAAAGTTTAATTGTTCAATCTATTATTAATATAATAA
TTGATTTGTTAATTTGTATAAACCCATTTTCAATTTGATTTTTTTAGATGTACAGAAGCA
AGAAAATCGATGACCCGGTTCAACCTACAGGTAAAGTTTTTGATCTGTTGATATCCATGG
AAAAAGTTAATTTAAAAAATTAGGGTTTCTTTTATATATATGATGTTATTATATTTACAT
ATAATATAGTGGAATAATTTTGATAGGTTTCAATCAACTCGCAATTCTCCGAAGTTTCAA
ACGAAGGCCTAGATCTTCAAGTTTAATTAGGTAAAAGAAGTACAATTTTCATGCTTTCTT
TTGAGTTCTAAACTGAGTTGATTGCTGCTATATATTCAGTTTCAGTTTTATATAATATAT
AGAATATAATAACATGGTGTTTTTGATTAACCATTAACGGTATGGTGGTGATGATCATGA
TCAAATTTAAAATGGCCCTGATAGAGCAAGACATGGAGTTTTTTATGCTTCAATGGCTGA
GAGAATATTAGCAAGCCACAACAAAAAAATGAAAACACAACATCAAAGCCAAAGCAGACC
ATACTCCTCATCATCTACATTGGAACACAACAGATCAACTCATGAGTCCATACAAGTAAG
TAAAGGAATAGATGATCATCAACATCAAACAAAATGTTTGAAAAACAGTAGCTCTTCATC
AATATCATCATCACCTGGTCATGATGATGGTACTAATAATAATGGATGGAAATTGATGGA
AGACCAAGTGGGAAACATCAGGCTAATGAAGAGGAAGATCATTTTGGACTCAGAATCTGA
AATGGATTTGAATCTATCTCTGAAAATAAAATCAAACATTGATCATGATCATAATCATGA
TGATTTTGAAAGGGGTTCGGATTGTGCTACTAGTGATGTTGAAGGAGATCATGGTAGCTT
ATTGTGTCTTTCTCTGTCTTCTTCATCATCTTCATCACCAAAGCCGATTAGCAGATTGAA
GTTAGAAAATAATAATCAGAAGCATGAAAGGACAATTGCAAGTACTCTAGATCTGACTTT
GTAA