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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI005879 | Chr14 | 16189478 | 16193221 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 17 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI005879.m1 | 23 | 77 | PF15663.8 | zf-CCCH_3 | Family | 42.7 | 5.70E-11 |
| LITCHI005879.m1 | 27 | 48 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 9.5 | 1.6 |
| LITCHI005879.m1 | 58 | 77 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.8 | 0.071 |
| LITCHI005879.m1 | 117 | 139 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 20.7 | 0.00031 |
| LITCHI005879.m1 | 118 | 138 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.4 | 0.0013 |
| LITCHI005879.m2 | 60 | 82 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 20.8 | 0.00028 |
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>LITCHI005879.m1 ATGGTTGTGGCAGCGCAACAAGTCCAACAACAACCGCCCCAAACATCACCTGAGGAGGAA ATCTTGAAAAGAAACACTGATTGTGTTTACTTTCTTGCTTCTCCTTTAACCTGCAAAAAG GGGAGTGAATGTGAGTATCGCCACAGTGAATATGCTCGGGTTAATCCTAGGGACTGTTAT TTCTGGCTGAATGGTAATTGCTTGAATCCAAAGTGTGGGTTTCGGCACCCGCCCCTTGAT GGATTGTTAGGAACCCAAACGGCAACCTCTACTGCAGCTTCCTTTCCTTCATCTCACTCG GCCACAACGCCAACACCACATGCTCCTCACGGCTCGGGTAAACAAGCAGTCCCGTGCATT TTCTTTCAAAAGGGGCTTTGCCTAAAAGGTGACAGATGTGCTTTTCTGCATGGACCAACT TCCACCGTTAATAAAGCCCCACAGCTAGCAGCTGCTGCCCCTGCTAATGAACCTCCATCT CTAAAGAAGACTTCTGGTGTCCTTCAAAAGTGCACCCAAGAGCAGAAGGTTCCTCCAGCA AATGTCTCAAAGGCAGTTGTAGTACCACCTCAAGCTAATAAGCATGCTCCAAAAGCTGAA ACTGCTTTATTAAGAAATGGTCTGGGCATTCAAAGAGATGCACCACTACCGTCAGCTGCA GATGACGAGTTCCCCAGATACAAAGTGACAAATGTTACTTCAGTTGTTAATGGTAGCTCC GTGAGCCGTTCTAATCGTTTGCATCAGGCTCATGCATCAGATGATCAAGGGTTCCAAAGC GGGAAGGAAGCTGATGAGTTTTTGAGGGAGTCCTCTCCTGGTTTTGATGTTCTTGTTGAC GATGACCTAGGAGATTCTGATTATTACCATGGTGAAGATCAATATGGCAGAACTAGAGGT CATGAAGGGATGAACTTGAACTCTGTGAATGAATACAATGTGGGTGGCTCAGTTGATTAC AATTCAGTGGCTGACATTGACAGAGATGCACTGCATGATCATCGAGGCTATGACTCGTAT GACCGCATGCAGGGGCAGTATGCTTGGGAACAGCACAGGACATCATCAGATCGATTGCTA GTGGGTTCATCTCATCTGGAAAGGAAGAGTTACTCAAAGGCTGATGGCCCTGATCAAATT GATGAATCAGATCTGCGATATCGTTTGTCAAAGAATAGGAGGGGTAATGGGTTGAGATCA GTAGTCAGTCCTGATTATGCTTCTGACAAACAAGGTGAAGAGCGAAGTCACCGGGGTTCT TCTCGAAGAGACACGCACCATGGATCCTCACATGAGAGTTCTCTTAGTAGTCGTCTTCGA GGTAGGATAAAGCTTCCAAGGAGATCCCCAGTCAGCGGTATTGATATCCGTTCAGAAAGG GAAACAGACAGGGGAAGAAGTAGGGTACAGTTGTCACCTGGTAAGACTCAGACCTTCCAG CAGGGGATGCTCCGAGACAGAATAAAAGGTAGGGTGGATGAGGATTATGATAATGAGGGA AGAAACTTTAGGGGCCCGCAAATAAGAAGAGAAATTATGGATGATAGAAATATGAATTTT GCTGGTCCTAAAAGTCTTGCAGAACTGAAAGTTGGGAAGAATGTAGAGAGTAAGGAGCAG CAAATTCTTGGTAAGCGGAAAAGCTTAGAGTATAATCAACAATCTGAAGGTGACCATTCA TTTGAAGGGCCAATGCCACTTAGTGAGATTTTGAAGAGAAAAAGAGAAGCCCAAGAAGCT GCTTTCAGTAGTGGAATATCGTCGGTCAATAAGGAAGACAAAAATCAGAAAGAAAGCTCC AATAATACTGGTGTCGCAGCAATGCAGAATGCTGTTTCCAGTGTAGCCAAGGGGGAAGCC AACAATGAGGAAGAATGCAAGTCAGCAAAGGCAGAAGAAAAAATTGAAGTCGCACATGGC CTACCTTCTCAGCTACCTAATGGAAGTGAGCATGAGGCTGAAGATGGGATGATTGGTGAT GAAACCATGGAAGATCATGAGCTTGATGCTGATGATCAACGGGATGGAGACTATGAATAT GAGCAGGGTGATGAAGGGGAGTATAATTATGAAGAAGGGGAAAATGCTGATGCTGAAGAT GAATTGTTAGACGATGAAGATGGAGATGACTTTGCTAAGAAGATAGGTGTTATGTTCTCC TAA >LITCHI005879.m2 ATGAGTTCTAATAATCTGAAGTGCATTATTAATGTGGAGCTTTTATGTCTTCTTTGTCAG CCCCTTGATGGATTGTTAGGAACCCAAACGGCAACCTCTACTGCAGCTTCCTTTCCTTCA TCTCACTCGGCCACAACGCCAACACCACATGCTCCTCACGGCTCGGGTAAACAAGCAGTC CCGTGCATTTTCTTTCAAAAGGGGCTTTGCCTAAAAGGTGACAGATGTGCTTTTCTGCAT GGACCAACTTCCACCGTTAATAAAGCCCCACAGCTAGCAGCTGCTGCCCCTGCTAATGAA CCTCCATCTCTAAAGAAGACTTCTGGTGTCCTTCAAAAGTGCACCCAAGAGCAGAAGGTT CCTCCAGCAAATGTCTCAAAGGCAGTTGTAGTACCACCTCAAGCTAATAAGCATGCTCCA AAAGCTGAAACTGCTTTATTAAGAAATGGTCTGGGCATTCAAAGAGATGCACCACTACCG TCAGCTGCAGATGACGAGTTCCCCAGATACAAAGTGACAAATGTTACTTCAGTTGTTAAT GGTAGCTCCGTGAGCCGTTCTAATCGTTTGCATCAGGCTCATGCATCAGATGATCAAGGG TTCCAAAGCGGGAAGGAAGCTGATGAGTTTTTGAGGGAGTCCTCTCCTGGTTTTGATGTT CTTGTTGACGATGACCTAGGAGATTCTGATTATTACCATGGTGAAGATCAATATGGCAGA ACTAGAGGTCATGAAGGGATGAACTTGAACTCTGTGAATGAATACAATGTGGGTGGCTCA GTTGATTACAATTCAGTGGCTGACATTGACAGAGATGCACTGCATGATCATCGAGGCTAT GACTCGTATGACCGCATGCAGGGGCAGTATGCTTGGGAACAGCACAGGACATCATCAGAT CGATTGCTAGTGGGTTCATCTCATCTGGAAAGGAAGAGTTACTCAAAGGCTGATGGCCCT GATCAAATTGATGAATCAGATCTGCGATATCGTTTGTCAAAGAATAGGAGGGGTAATGGG TTGAGATCAGTAGTCAGTCCTGATTATGCTTCTGACAAACAAGGTGAAGAGCGAAGTCAC CGGGGTTCTTCTCGAAGAGACACGCACCATGGATCCTCACATGAGAGTTCTCTTAGTAGT CGTCTTCGAGGTAGGATAAAGCTTCCAAGGAGATCCCCAGTCAGCGGTATTGATATCCGT TCAGAAAGGGAAACAGACAGGGGAAGAAGTAGGGTACAGTTGTCACCTGGTAAGACTCAG ACCTTCCAGCAGGGGATGCTCCGAGACAGAATAAAAGGTAGGGTGGATGAGGATTATGAT AATGAGGGAAGAAACTTTAGGGGCCCGCAAATAAGAAGAGAAATTATGGATGATAGAAAT ATGAATTTTGCTGGTCCTAAAAGTCTTGCAGAACTGAAAGTTGGGAAGAATGTAGAGAGT AAGGAGCAGCAAATTCTTGGTAAGCGGAAAAGCTTAGAGTATAATCAACAATCTGAAGGT GACCATTCATTTGAAGGGCCAATGCCACTTAGTGAGATTTTGAAGAGAAAAAGAGAAGCC CAAGAAGCTGCTTTCAGTAGTGGAATATCGTCGGTCAATAAGGAAGACAAAAATCAGAAA GAAAGCTCCAATAATACTGGTGTCGCAGCAATGCAGAATGCTGTTTCCAGTGTAGCCAAG GGGGAAGCCAACAATGAGGAAGAATGCAAGTCAGCAAAGGCAGAAGAAAAAATTGAAGTC GCACATGGCCTACCTTCTCAGCTACCTAATGGAAGTGAGCATGAGGCTGAAGATGGGATG ATTGGTGATGAAACCATGGAAGATCATGAGCTTGATGCTGATGATCAACGGGATGGAGAC TATGAATATGAGCAGGGTGATGAAGGGGAGTATAATTATGAAGAAGGGGAAAATGCTGAT GCTGAAGATGAATTGTTAGACGATGAAGATGGAGATGACTTTGCTAAGAAGATAGGTGTT ATGTTCTCCTAA
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CAACACAAGCACACCTTATAAATAAAACCTTAAAAAATAAAAAAAAAATCAAGGAAGAGA GAAAAAGAAAAACTGGTTTAGGCCTTAGCTTTAAGGTCATACATTACACACACTCATCCC CTCGCTGTCTCTCTGTGGCGGCTCTTGTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTGTTCTTCATCTTG TTTCAGATTGTTGAAGAGGATCTTGTTTTGGGTAGTGGGTATCTCTCAGAAAACGGCCAT GGTTGTGGCAGCGCAACAAGTCCAACAACAACCGCCCCAAACATCACCTGAGGAGGAAAT CTTGAAAAGAAACACTGATTGTGTTTACTTTCTTGCTTCTCCTTTAACCTGCAAAAAGGG GAGTGAATGTGAGTATCGCCACAGTGAATATGCTCGGGTTAATCCTAGGGACTGTTATTT CTGGCTGAATGGTAATTGCTTGAATCCAAAGTGTGGGTTTCGGCACCCGGTAAGTATTTA CTTTTGATTAACAGCTGCTTGTGGTATTAAATTAATATCGAATAGGTTCTGTTCAATAAA CTTGGAAGTTTCTGTTATATCAATTATGAGTTCTAATAATCTGAAGTGCATTATTAATGT GGAGCTTTTATGTCTTCTTTGTCAGCCCCTTGATGGATTGTTAGGAACCCAAACGGCAAC CTCTACTGCAGCTTCCTTTCCTTCATCTCACTCGGCCACAACGCCAACACCACATGCTCC TCACGGCTCGGGTAAACAAGCAGTCCCGTGCATTTTCTTTCAAAAGGGGCTTTGCCTAAA AGGTGACAGATGTGCTTTTCTGCATGGACCAACTTCCACCGTTAATAAAGCCCCACAGCT AGCAGCTGCTGCCCCTGCTAATGAACCTCCATCTCTAAAGAAGACTTCTGGTGTCCTTCA AAAGTGCACCCAAGAGCAGAAGGTTCCTCCAGCAAATGTCTCAAAGGCAGTTGTAGTACC ACCTCAAGCTAATAAGCATGCTCCAAAAGCTGAAACTGCTTTATTAAGAAATGGTCTGGG CATTCAAAGAGATGCACCACTACCGTCAGCTGCAGATGACGAGTTCCCCAGATACAAAGT GACAAATGTTACTTCAGTTGTTAATGGTAGCTCCGTGAGCCGTTCTAATCGTTTGCATCA GGCTCATGCATCAGATGATCAAGGGTTCCAAAGCGGGAAGGAAGCTGATGAGTTTTTGAG GGAGTCCTCTCCTGGTTTTGATGTTCTTGTTGACGATGACCTAGGAGATTCTGATTATTA CCATGGTGAAGATCAATATGGCAGAACTAGAGGTCATGAAGGGATGAACTTGAACTCTGT GAATGAATACAATGTGGGTGGCTCAGTTGATTACAATTCAGTGGCTGACATTGACAGAGA TGCACTGCATGATCATCGAGGCTATGACTCGTATGACCGCATGCAGGGGCAGTATGCTTG GGAACAGCACAGGACATCATCAGATCGATTGCTAGTGGGTTCATCTCATCTGGAAAGGAA GAGTTACTCAAAGGCTGATGGCCCTGATCAAATTGATGAATCAGATCTGCGATATCGTTT GTCAAAGAATAGGAGGGGTAATGGGTTGAGATCAGTAGTCAGTCCTGATTATGCTTCTGA CAAACAAGGTGAAGAGCGAAGTCACCGGGGTTCTTCTCGAAGAGACACGCACCATGGATC CTCACATGAGAGTTCTCTTAGTAGTCGTCTTCGAGGTAGGATAAAGCTTCCAAGGAGATC CCCAGTCAGCGGTATTGATATCCGTTCAGAAAGGGAAACAGACAGGGGAAGAAGTAGGGT ACAGTTGTCACCTGGTAAGACTCAGACCTTCCAGCAGGGGATGCTCCGAGACAGAATAAA AGGTAGGGTGGATGAGGATTATGATAATGAGGGAAGAAACTTTAGGGGCCCGCAAATAAG 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>LITCHI020028.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGGAATTATATTGTACTATTTAATTATTTTCTATAAAGGTGTATTTGCATTTTTATTATA GTTAATTTGTAAATGTATACCAATAAGTCAGACAAAATAATCATTACAATCAAGTTTTAA AATATTAAAACGCTTACTAATCAGAAATGAAAAATAAAAAATAAAAAGAAAGAAATGAGT TCCAATAGAAAAGAAATTAAGATAAATCGGAATTAAATTATAATATTACATTCATCTGTT TACTAACTTTTGAGAATTAAAATTGGAATCAAATTAAAATTCCGTTTTTAAGTGTTTAGT AAAGTAAAAAGTAGGTGTTAAAAAAATAAATTGAATAATTTAAACTTCTCAAAAATTTGC TTAAGGAGTAACGTTAGACTTTCAAAATATTTGTTTGGATGTTGACAACTTATATGTCAT ATTATTTGGACAAACTATTTGAGAAGCCTAACATTACTCAACTTTATTTTATGAGTAATG CTAGGTTTTTTAAATATTTTGCCCAAATTTATGTCCAAATGAGTTATTAATATCTTATAA ATCATGAGATGATAAAATAATTAATAGAATGTTGACAATTCAAATGCTATATCATTCAAG TATGAATTTGAGCAAAGAATAATGTTAGATTTTCTAAATATTTTGCTTAAATCCATGCCC AAATGATGTAGTATGTAAATTGACAATATCATATTAATTATTACATCATGTTATGATTTA TAAGATATTGACAATTCACATGTCATATCGTTTGAATATGAATTTGAGCAAAATATTTGA GAAACCTAGCATTACTCATAATAGGCTTTCAAAATATTTTATCTAAATCTATACCTAAAT GATGTAGTATATGAGTTATTAATATATTATATATCATGAGATAACGTTGTAATAAATAGA ATGTTGATAACTCATATGCTATATCATTTGAATATGAATTTGGATAAAGTGTAATATTAA GGTTTTTAAATATTTTATCAAAATTCGTCCAAATAATATAGTATATAAATTATCAATATT CTATTAATAATCCCATGATGTAATGGTTTTCTCTCATGTACCATATACATCATCTACCGT ACACGTAAATGATGAAGCTATAAAGAAGATCATGATGCTGATCGAACGAAGGGCAAAATA GGAGTTTTGCAAACTGAATGCAAAATACAATCGAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAACGATT ACCGTACGGCGACCCAGAGAATCCGATCTGTAAACCTCCCCCTTTCTAAACAAACCCTAA TCGAAATCACTCTTCTCCAAGCTCTCCCAATTCTGCTCTTGTTTCATTCTCCATCAAATG TGTTGATAATTTTAGCCCATCTTTTCCCATATTACCCTCCGCGTCCCTTCCCAACTTCGA AGCCATCAACTTCCGATCAGATTTGGATTTCGTTTCAATTTCGGGGTTTTTCTTGATTCG GTAATTGGAATTCTGTTTCTGTCAATTTGTGTTTCTGTCAATTTATGTTTCTCGAATTCA TCAATTAATGATGTGGGTTTTGACTGTTTAATCGATTTGTGTATCTGAAATTCGATTGCA TGCCTGCTATATTTCAAAGGTGTCACCTTTTTAGGGTTTTCAGTTGAGGATTGTTTTTGG TTTTTGTTGTCTAACAGAACAAAGCTGAAATTTTTATACAGTTAGTTGTCTCTTCTGATT TTGTGTAAGACTAGGGTTCGTTCTATACATATCTACTTGTTGTTGATTCTATAAGTAATA GATTATATATCAGATAATGGAATTGGTGATTTTGTTTGTGTTCATTTATCTGTTTTTAGG CGATTATTGTAGAAATATGACAATGTAGTGTAGTGTTTCGATTGTGTTTAGTTTTAATTT CCTCAGCTGCCCATTACATTTAAGGGTGCAATTTAGATTGATTTGTGTAAGGATATGGAT AAGAAGTGTTTTGTATATGAAGCTGTATGTTTTATTGAAGGATGGTGTGAGGATTTATTG GGGACTGGTGATATTCAGTC
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