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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005764 | Chr14 | 14375215 | 14379437 | - | Homeobox-leucine zipper protein HOX3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005764.m1 | 65 | 119 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 61.6 | 5.20E-17 |
LITCHI005764.m1 | 121 | 155 | PF02183.21 | HALZ | Coiled-coil | 37.5 | 2.10E-09 |
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>LITCHI005764.m1 ATGGCGATTTTACCCGGAAGCTCTTCTAGCTTGGAGTTGACCATCTCGGTTCCTGGCTTC TCCTCTTCCCCTTCTGTTGCATCATCTGGTGATCAAGGGGGTTGTGCAATGAAAGATTTG GACATAAACCAAATACCATCAGGAGGTGAAGAGGAAGACTACGAGGAAGAGAGCAGCAAT GGAGGCCCTCCTCGCAAGAAACTCCGTCTGTCGAAAGAACAATCTCGTCTTCTCGAAGAA AGTTTCCGACAAAACCACACCCTCAATCCTAAGCAAAAAGAAGCATTGGCTGCGCAATTG AAGCTGAGACCAAGGCAAGTTGAGGTGTGGTTTCAGAACCGTAGGGCCAGGAGCAAGCTG AAGCAGACAGAGATGGAGTGTGAGTATTTGAAAAGATGGTTTGGTTCATTGACTGAACAA AACAGGAGGCTTCAACGTGAAGTGGAGGAACTCCGGGCCATGAAGGTGGGTCCACCCACC GTCCTCTCTCCCCACTCCTGTGAGCCACTTCCCGCCTCTACTCTCACCATGTGTCCGCGT TGTGAGCGCGTCACCTCCACTGCCTCCGACAAGCCCGGTCCCACCAGGCTCACCACCACC TCCCCCGCCGCCGCAGCTGCCTCCACTGCCGCGTCCTTGTCCCCCAAAGTCGACTCTCCT GCCCTCCAATCACGACAGCCTTCTGCCGCTTGTTAG
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>LITCHI005764.m1 ATCTCACTTTTTTTATAACCTACCCTCCTCGTCTCTTCTCTTCCATTTTCTCATTTTCTT TTCCTTTTTTCTTGTTGTCTCCCTTTGTCTCCTTTTGTTTTTTTCTCTATTTACTTTACC TTTTTCGATCTTCTTCATTAAAGAAAATCTACCAGTCTTTTTATCTATCTCTATCTCTTG ATCATCATCTTCTTTTTCTTCTTCACCTGCAACTTTCATGGCGATTTTACCCGGAAGCTC TTCTAGCTTGGAGTTGACCATCTCGGTTCCTGGCTTCTCCTCTTCCCCTTCTGTTGCATC ATCTGGTGATCAAGGGGGTTGTGCAATGAAAGATTTGGACATAAACCAAATACCATCAGG AGGTGAAGAGGAAGACTACGAGGAAGAGAGCAGCAATGGAGGCCCTCCTCGCAAGAAACT CCGTCTGTCGAAAGAACAATCTCGTCTTCTCGAAGAAAGTTTCCGACAAAACCACACCCT CAATCCTAAGCAAAAAGAAGCATTGGCTGCGCAATTGAAGCTGAGACCAAGGCAAGTTGA GGTGTGGTTTCAGAACCGTAGGGCCAGGAGCAAGCTGAAGCAGACAGAGATGGAGTGTGA GTATTTGAAAAGATGGTTTGGTTCATTGACTGAACAAAACAGGAGGCTTCAACGTGAAGT GGAGGAACTCCGGGCCATGAAGGTGGGTCCACCCACCGTCCTCTCTCCCCACTCCTGTGA GCCACTTCCCGCCTCTACTCTCACCATGTGTCCGCGTTGTGAGCGCGTCACCTCCACTGC CTCCGACAAGCCCGGTCCCACCAGGCTCACCACCACCTCCCCCGCCGCCGCAGCTGCCTC CACTGCCGCGTCCTTGTCCCCCAAAGTCGACTCTCCTGCCCTCCAATCACGACAGCCTTC TGCCGCTTGTTAGATAGAGTCAACAACCAACAAAAACTTAGGGAGAATTTTTCATTTTTT ATTTTTAAGGGGAGAAAAAAAATATAGAAAGAAGTGGAGAAGGGGAAAAAAGTGTTCAGA GAGTGTTGATAGTTGTTACATAATGTGAATGGATGTACGGAAAATTGAAGATAGATAGAT ACTATAATATATGGTATCTAATCTCCAAATATATCTTTGTTATTTTGTTATTTGTTTTTT TTTTTTTTAAATTTATTTAATCATGTTTCTTTTCTTGATGGTTGACCATTTTCTTCTTTT TTTTTTTAATTATTATTATTTTTTTTTATATTCAAGTG
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>LITCHI005764.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGCAGTCCTGATCATCTCCCTTTGATTTTTATGTCTTAATCAAAGTCAAACCCCTCTTT TATTTTTCTTTCCCTTTTTAAATTACATTCTACTTATTCTTTCATATGTAAAATGTTATT GCAATAATATTGCTGAAAACAATTAAGAATATCATTTTTTTAAAAGAAAATATTCATATA ATTGCATTTATATCGTTAATTTTATAGTATAGTTGATATTGATTGAAATATTTAATTAAA TTTTTAAATTTAGAACATTTATTTGTTTGCACAATCGTTCAATGATAATTATATAAATAC ATATAAAAACAACTGTTTAATCAAATGATTTATTTTGACTTACATATTTCTCAATGCGAC GAGCAACGCTTGTCAACTGTTTCTTTTCCTTGCAATGACTTGTGTACGTTTTATGATATT ATTATAATAAAATAAAGAGAATTATTACCACTATTATTTTTTTTGTCTTGAAATGAAGGA GGTATTGAAAATCAAAATTGGCTGGATTTTGCGAACAAGTATCATGATCATATTTAGTTC CCCAAAAAAAAAAAAAAAGTATCATAAAAAAAAAAAAGTATTTCAGTTCCAAAAAAAAAA GAAAAAAAAGTATCATAATCGCATTTATAAGTATCTCAACCAACATTTGAAAAACAAGTT TTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGACCCATGAATTTATATCAATTTATATCAACTTTCAA CAATATTTATTACAATTAATTTTAGCTAGGTGTTGAATTATAACTAATAATCGATTGTGT CATTGACTAAATTTGAGATTGATACCGAATTAATATCTGCGCGGGTGTCTGTCTATGTCA AAATATGGTCCAATACCAAGGTTCTTGTGGGTACAGTTTCAAACAGAGAAGCAAAAATGG GTAACAGACTAACAATCACAAACACAAAACAAAACACTTTCTCCATTAATGAGACTTTGT CCAAACTCCATTTCCTCAAATTATGACTTCTACTTCTTTTGCAATTATGTCAACATACGT TACACCTCGTCTATTCCTATCGTACCCTCTTGCATTTAATTCTTCATTATTATATTACTG TAACTGGTGCTATCATAATTATAATTAATTAAACCCCACGATATATACTATAGCTAATCA TCCATCTCATTATCACAACCCAATAAAGTCAATGACCCAGATTATAAGTTTGCAAATATA GGTCCATGATGAATACTGAATTACACAGATAATCAAGACTTGACACTCAATAATTTTTTT AAAAAATTTGTTTATAACAGTCATTTAAAAAGTCAAACAAATCCAAATTTTTTTAAATTA AAATTATTATGTGTATATTGGCTTGCACAATAAATGTAAATAACTGACTATACAATTTGA ATATACCTAGAAAAATAAATAGGAATACTTGCACATAGAAGACATGAAATATAATTTTTT TTAAAAAAAGATTACATATGAAATAGTTGTAGAAATGATAAAATGTTGGGAGGGAAGGGA GGGGCTCAAAGCCCCAGTCTAGACTCCCAATCATTTCACGAGCTGACCTTTGAACCGACA ACCAGACTAAAACCATCTCACAAACAGAAAAAGACTGCCGGTGATCCTCCTACACCAATC AGATTGACACGTGTCGCGTATCAGATGGTCAGACCCTCTGACTTGACGACAACAGTCAAA AACCCTAGGCAGCTACCAATACAAATGATTTTCAATTCTTTTATTATAATTAAAATATAA TTTTCTCTTCTGTTTACTCTCTCTATTTATATTTGACCTTTATATCTCACTTTTTTTATA ACCTACCCTCCTCGTCTCTTCTCTTCCATTTTCTCATTTTCTTTTCCTTTTTTCTTGTTG TCTCCCTTTGTCTCCTTTTGTTTTTTTCTCTATTTACTTTACCTTTTTCGATCTTCTTCA TTAAAGAAAATCTACCAGTCTTTTTATCTATCTCTATCTCTTGATCATCATCTTCTTTTT CTTCTTCACCTGCAACTTTC
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>LITCHI017648.m4 GenomeSequence + TAGAACGTAAGAATAATTCGATCAACTTGTTAAAATGACACTTTAAAGAGGGCAATTTGG TCCTTACAGATTACAAAGTTGCAATTTGGCCTGTGTCCCGGTATAGAAACCAAGGCGCAC ATAATTACAGCGTAACGGTCGTGTTGCTCCGCTCCCAAAGAAGCTAATGGGAGCCGCAGA CTTGGCCTTCTTCGTCGCAGCTGCTCGTATCAACAGAGAAGATTGCAAGCGAACCAAACA CGACTCCCAGTTTTACAAATGGCAGGTTTTTTTCACTTACCCTCCTCTTCAGGACCTTAA ACGTACATATTTCATCGCTTTATTCTACTTCCTGTTCAATCTAAGCTAAAGTTAGCTTTC GGGGTTTCTATGTCACTCTTCAAAATCACATCTTTCAGTATACTTTCAAATTTTCAGATG CATTTGCTAAATATTGATGGGTTTGAAATTTGGGTGGCTAAAATTGACGAGGGCAAGTGT TGTTGTAAAAATAATGTGCACCCAGGTTCTTGTCGGGCCTTCAGATTGGGAAGATCACTC ACGCGGTAAGGAAGGAGTGGCTAGATATAGGGTTCACAACCTCCCTACTGTTATCTCTCC TGGACTTTATGAGCTTGGTATAGCTGTATCTTCCTCTCGCAAGATACTCTCAGATGATGT GGTTGTTGTTTACCTCGGACATTCTGACAATGTCCGAACACGAGTTCAGTGCTATGGTCG TAGTGGTGCTCATTTGAATAACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGGGGGCCTGGATTGTT TGAGGATATATTCAGTAGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTTCCTGTAAGTGTGTG TCTTTTTTAGCTTTTGAGTTTTGACTTGTTTCATTTTGCTTGGTTTTGTACTAATTTTAT 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