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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005764Chr141437521514379437-Homeobox-leucine zipper protein HOX3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005764.m165119PF00046.32HomeodomainDomain61.65.20E-17
LITCHI005764.m1121155PF02183.21HALZCoiled-coil37.52.10E-09
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>LITCHI005764.m1
ATGGCGATTTTACCCGGAAGCTCTTCTAGCTTGGAGTTGACCATCTCGGTTCCTGGCTTC
TCCTCTTCCCCTTCTGTTGCATCATCTGGTGATCAAGGGGGTTGTGCAATGAAAGATTTG
GACATAAACCAAATACCATCAGGAGGTGAAGAGGAAGACTACGAGGAAGAGAGCAGCAAT
GGAGGCCCTCCTCGCAAGAAACTCCGTCTGTCGAAAGAACAATCTCGTCTTCTCGAAGAA
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AAGCTGAGACCAAGGCAAGTTGAGGTGTGGTTTCAGAACCGTAGGGCCAGGAGCAAGCTG
AAGCAGACAGAGATGGAGTGTGAGTATTTGAAAAGATGGTTTGGTTCATTGACTGAACAA
AACAGGAGGCTTCAACGTGAAGTGGAGGAACTCCGGGCCATGAAGGTGGGTCCACCCACC
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>LITCHI020970.m1
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>LITCHI020970.m2
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>LITCHI020970.m2
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TGGTTCAGCTGTTATTCCATTGCAGCAGCAACAACCCATCAATAGGTTCAGCCAGCAATA
CTACAATATTCCGGGTCAATTCAATTAAATCGATGGCAAGATGATGGAAAGCAGAATATG
GATAGAGAAAGCATGGTTCCTTAACTTTTTTGATTGAAGGCTCTCATCTTCATAGTTGTC
ATCCTCCTTCTCCTCTTGTATGGAAGGCATATATACAATAATTTATTTTGTTTTTGTCTG
AAGGGGAATTATAAAATTCATTGCTCTTTTTTTTTATTTCTTCGCATTTCTCACTTGAAT
CATAATTATTATTAATAATATGGTCCGCTTTTGCTTCACAAGTTAATTAGTTTGGAATCT
GTCTGAACGAGCTTTATTCCCA
>LITCHI020970.m1
TATAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTC
CCCAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAA
GATCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTT
CGTTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGATGGAAAGGAATATCAACAACAACAGTGC
GCATCCAGCATGCGCTGCATGCAAGCATCAAAGGAAAAAATGCAGTAATGAATGCATACT
TGCACAGTATTTTCCAGCCACCAGAACCCGAGAATTTCAGGCTGTTCACAAGGTATTCGG
CGTCAGTAACGTGACAAAGATAGTCCGCAATGCCAGGGTAGAAGATAGACACAAAGTCGC
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GGATAGTTATTGTTACTCTTCACAGTTTGTGCAAAGTCCAAGGAAATTGAAGCACGAAAT
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CCAGCAATACTACAATATTCCGGGTCAATTCAATTAAATCGATGGCAAGATGATGGAAAG
CAGAATATGGATAGAGAAAGCATGGTTCCTTAACTTTTTTGATTGAAGGCTCTCATCTTC
ATAGTTGTCATCCTCCTTCTCCTCTTGTATGGAAGGCATATATACAATAATTTATTTTGT
TTTTGTCTGAAGGGGAATTATAAAATTCATTGCTCTTTTTTTTTATTTCTTCGCATTTCT
CACTTGAATCATAATTATTATTAATAATATGGTCCGCTTTTGCTTCACAAGTTAATTAGT
TTGGAATCTGTCTGAACGAGCTTTATTCCCA
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>LITCHI020970.m2 -  Up_Stream_Len 2000
GTCATCAAGGAGTAAGGATTGTTTGCTAGATTATTGTTTTTACCAAACTTTTTGTAATAG
GAGTTTAAACTTAAGTTACGTATGAAAGAAAACAATATACAAGTTTTGATCATCTATTAT
TTTTTTTGTTGATGTGTCATTAGACTATCAAAAGTCTAGTCAAAAAAAATAAAAAATGAC
TCGCCATCACAAGGGTGGCTTTGTTACGTGTGAAGATTCAATTTTCATAGAAAGAAAGAT
CTCCTCCACATATGGAGGAGACCTATTCACCCTTTTGATTGGAGGTCCAACATTTTCCCT
CCAAAGTATAGGAGATTCAATAAGACTACTCCATAAGGAAGAGATCATCCACCTCTCCGC
TGTGTTCTTATTCATCTTCTTCCATTTCTTTTCAGATTTAAATCCAATTTTGGTTTCTGA
TTTTTTAATTAATTAACATAATTAGATTTTTTTTTTAATTATCGGGACTAATTCAGAGGA
CTATCAGGACGAAATGGAATGAGACACTTGTTGTACGATCCGAAGAGTAGCTCTCATAAG
AAAAAACTCCACTCACACGAAGATAAGAGGATGACCCACACAAGGTGGGATAAGACAGCC
ATATAGAGGTTGTACTGCTTAGTGTCAAACCCAAATTCACATGAAAGTTAGGGGTGCTGC
CAACCACTTTGGCAAAAACCAATGACTAATATAATTATATTTTAATATTGTAATTAAATT
GTAATTTGATTGATTTTTTTTAATTGAAATATCTCATTATTTGGGGCATTTTCAACTTTC
AAATTTTTCATCCAATCAATGGTTTAAAGTAGCCATGGTCAACATTTATCCGCATAGTTA
ATGCATAAGTTGCATATACATGCAATGGGGCCAAAATTTAGGAATATTCGTACAATTTGT
CCCTTTATTTAAATGTCCAAAGATAAAAGTTTGTAACTTCCCCGGTTTAATAAAAATAAG
ACCTAAGCTTCACAGGTTAATTGTGTACTCGCAATTACTTTTCCTCCGCCGACTTAGCAA
TCTGTAAAAGGTTGAATTAAACCTGGATTGAATTTTAAGTTACAATTTTAATTAATTGAT
TATCAATGTAAATATATATGTAGTTAAATACCATAGTCCACTATGACATATTAATAGAGA
ACACTCTCTGATAATATATGATATCTGAATCATTACACGTGATTTTTGAGATACTATCTT
CAATGTGGATTACTCAAATCTAGAATATTATCAAGTTTGATGATATTTCAATCACTAAAC
TATACGTGACGGTGATTGTTATATGTAGTTGATATTAAAAATACCATTTGTGGTACAATG
ATTGGAATATTATAGTATCTAACTGGAATATTATAGTGTGCAGTTTTTACCATCGATTCA
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TTCATAATGCAACTCAGCAATCCCTCCTGTCACACTTGATTTTTCAACATCCCAATCAAC
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ACCTATAAAACATAGATACATTTCTTTATTATACATATTTTTAATATACATTAACTTATA
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TCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTTCG
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AATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTA
TATATACAATTGGTCTTAGG
>LITCHI020970.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GTCATCAAGGAGTAAGGATTGTTTGCTAGATTATTGTTTTTACCAAACTTTTTGTAATAG
GAGTTTAAACTTAAGTTACGTATGAAAGAAAACAATATACAAGTTTTGATCATCTATTAT
TTTTTTTGTTGATGTGTCATTAGACTATCAAAAGTCTAGTCAAAAAAAATAAAAAATGAC
TCGCCATCACAAGGGTGGCTTTGTTACGTGTGAAGATTCAATTTTCATAGAAAGAAAGAT
CTCCTCCACATATGGAGGAGACCTATTCACCCTTTTGATTGGAGGTCCAACATTTTCCCT
CCAAAGTATAGGAGATTCAATAAGACTACTCCATAAGGAAGAGATCATCCACCTCTCCGC
TGTGTTCTTATTCATCTTCTTCCATTTCTTTTCAGATTTAAATCCAATTTTGGTTTCTGA
TTTTTTAATTAATTAACATAATTAGATTTTTTTTTTAATTATCGGGACTAATTCAGAGGA
CTATCAGGACGAAATGGAATGAGACACTTGTTGTACGATCCGAAGAGTAGCTCTCATAAG
AAAAAACTCCACTCACACGAAGATAAGAGGATGACCCACACAAGGTGGGATAAGACAGCC
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GTAATTTGATTGATTTTTTTTAATTGAAATATCTCATTATTTGGGGCATTTTCAACTTTC
AAATTTTTCATCCAATCAATGGTTTAAAGTAGCCATGGTCAACATTTATCCGCATAGTTA
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CCCTTTATTTAAATGTCCAAAGATAAAAGTTTGTAACTTCCCCGGTTTAATAAAAATAAG
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TCTGTAAAAGGTTGAATTAAACCTGGATTGAATTTTAAGTTACAATTTTAATTAATTGAT
TATCAATGTAAATATATATGTAGTTAAATACCATAGTCCACTATGACATATTAATAGAGA
ACACTCTCTGATAATATATGATATCTGAATCATTACACGTGATTTTTGAGATACTATCTT
CAATGTGGATTACTCAAATCTAGAATATTATCAAGTTTGATGATATTTCAATCACTAAAC
TATACGTGACGGTGATTGTTATATGTAGTTGATATTAAAAATACCATTTGTGGTACAATG
ATTGGAATATTATAGTATCTAACTGGAATATTATAGTGTGCAGTTTTTACCATCGATTCA
CATTGAATAGTGGTAAAATTGGGCTAAAATTGTATAATCTTGTTTTTATTGTCATACCAA
TTCATAATGCAACTCAGCAATCCCTCCTGTCACACTTGATTTTTCAACATCCCAATCAAC
CTTGATATCTAACAAGATTTGGTAATTACAATTTAATAAATAAGAAAATCTAGATTTGTT
ACCTATAAAACATAGATACATTTCTTTATTATACATATTTTTAATATACATTAACTTATA
TAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTCCC
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TCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTTCG
TTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCCCA
CTAATTTCTATTTTACTTGCGTCATAGTGATTTGTATATGGTGTGATAACTTTTGTTAAC
AATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTA
TATATACAATTGGTCTTAGG
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>LITCHI020970.m2 GenomeSequence - 
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CCCAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAA
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ATTGAGTTATAATAATAATCATGATCATGATGGGAATTCGATTGTTGATTCGGATAGTTA
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TGAATCATAATTATTATTAATAATATGGTCCGCTTTTGCTTCACAAGTTAATTAGTTTGG
AATCTGTCTGAACGAGCTTTATTCCCA
>LITCHI020970.m1 GenomeSequence - 
TATAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTC
CCCAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAA
GATCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTT
CGTTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCC
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ACAATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT
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ACAGCCTAATTTATTGGGATGGAACACTGACGATGGTTTTGTTAACAATATTAACAACGG
ATTGAGTTATAATAATAATCATGATCATGATGGGAATTCGATTGTTGATTCGGATAGTTA
TTGTTACTCTTCACAGTTTGTGCAAAGTCCAAGGAAATTGAAGCACGAAATTAGAGAAGT
TGGTTCAGCTGTTATTCCATTGCAGCAGCAACAACCCATCAATAGGTTCAGCCAGCAATA
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GATATGCCTTTAGAATTATTATTTTTATCATTATTATGATTTTGAAATATAATTTGTGAT
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ATCACAAAGGGGCCCTTTATTTTCTTTCTTTAATCATAAATCTAATGAAAAATTCTCTTA
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