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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005588 | Chr14 | 11820227 | 11820980 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005588.m1 | 26 | 78 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 34.3 | 3.20E-08 |
LITCHI005588.m1 | 155 | 200 | PF10551.12 | MULE | Domain | 36.8 | 4.30E-09 |
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>LITCHI005588.m1 ATGGTTGGCTTTAATGTGCGACATGCTGCGAAAGGATTCAAATGGGTTAATAATATGTTG ACGTTGGGTTTGCTCGAAGGAAGGAAAAAGTACTTGGAGCAACGAGATAGGCAGCATGAG TCCAAAGGCATAACTCGGGAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAA AAAAGTATGTGGGTTGTCAACGAGTTTATAACGGAACATTGTCATGCCTTAGTGACTCCA AACCAGACGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCATGTTCCGATTGCCAACATTGCACAAACT GAATCGTGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTGTCAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAA GCAGGCAGTCATGCAGCTTTTACTATAAGTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATATTTTGG GTTGACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTTGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCG ACGTACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTGGGCATAAATAACCAT AACAAAACTACAGTTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACG TAG
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>LITCHI005588.m1 ATGGTTGGCTTTAATGTGCGACATGCTGCGAAAGGATTCAAATGGGTTAATAATATGTTG ACGTTGGGTTTGCTCGAAGGAAGGAAAAAGTACTTGGAGCAACGAGATAGGCAGCATGAG TCCAAAGGCATAACTCGGGAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAA AAAAGTATGTGGGTTGTCAACGAGTTTATAACGGAACATTGTCATGCCTTAGTGACTCCA AACCAGACGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCATGTTCCGATTGCCAACATTGCACAAACT GAATCGTGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTGTCAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAA GCAGGCAGTCATGCAGCTTTTACTATAAGTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATATTTTGG GTTGACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTTGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCG ACGTACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTGGGCATAAATAACCAT AACAAAACTACAGTTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACG TAG
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>LITCHI005588.m1 + Up_Stream_Len 2000 GGGCGATTTATGGGTGTCTCCACCTAAGCCAATTGATGGCGTCACATATGATACATTGCA CGACCGCATTATGAATGGTAACAAACCAATTGCAGAGCGAAAAGCAAAGAAAATCTGTAA GGACAGTTGGCTGTCAACATGTACTAATGACGCAGAACCACTTGCTTGGTTTTCTGAGAC TTTTGGTGCACTTAATGCGTTACAGGAGCGTCAAGAATAGGCCATTGCAAACCTTAAGGC AGAGCAGGAGAAATTGTTCGCATCAATGTGCTCCCAACTTACGAGTCATGGACAATCCCT TGCTCATGTTACGCAGCTACTACATCAGGCAAAAACATCGACCACGAATGAGACAACTGT ACAGCAAGGCGATGTACTGGGTGAGGGATAACATGTATGGTGGATGTTGCATAGGTGTTA GTGGGATGCAGATTGTAAGGTACATATAAGGTAGCAAAATTGAAGTTAACACAATAGTTA TATTTAAACCAAACACTGTTGGCGCTTTTGGTTTAAGTGGACGGTCCACGGGGACAGCTT ATGCTTGCCGTTTTTGTTTTCGTTGTGACTTTACTGACTTGGTATTTGTCTTGTGCAAGT TTAAGCATGTGGTGATAGGCCTGGTGTAGTACTACCATGTATGAACTTATTCTTTTGTAA TGTTAATACAATTTTATTTGCTACTTGTTTTGCGGATGTACGGAATGCCATGCAGCTGCA TCTAATTACCATTTACCATCTCGACGTTGATAGTTGATATGAGTTGAAGTTGCAAACTAG TGTGGTTAAAATACCACATTATGGATAGTTACATATATAACTATATATATATATTTATGT ATATGTGTGTGTTAGTAATTTACTGTTTGCTCATTCAATGTAATCGACATTTTATCTTTT TTTAACAAGTATGATTTTTTGAAGGTTGATGTAATGTATATTATCACCATGTTGACATTT TAGTTTATGCCATTTTATGTTGACATAGATAAAACTTCAAAAATTTCAACAGATTCAATT ACAAATGTGAAAATAAAGTTCGTGGGATATACGGTTTCATTTAACATTCAAGATATATGT AGTTTGTGCTCGATTATTGGAAGTTACAATATGAAAATCCCTTAACAAATTGTTTAACCA CCCCCTCTTAATTTTGTGAACAAACCTTATAACCAACCACATCTTGCCTTGGCTACATCT TCAATTATGAATGCAAACAGGTGTGCTAACCAACCCCTCAGTTGGCTACATGGACAACTG TCTCATTAATGGATTTATATCAACCAACCACCAACCACCTACCCTAAAACAACCACATAT TAGGTGTTATACAAACTGTTTTGCCTATTTCCTGCAACATCCAACTTGGGTCAAACAACA CAAACACTGGTTGTTGTTGCTGCATACAAGCTTAAGAGGTCATCATCAATTGTCCCACAA ATGCATAGGTAATAATATATGTGCTAGTAGTGTAGTTGCTTTGCAAGTAAACAAAATGTG GGTGTACTCTGGTAGTGGTTATACTCATGAAACGTGACACACAACACAGAGGTCATCATA CACCTATATATATATATATATGCTTGTATATATACTTATATGCACACAGACACACATACA TATATATATATAAATCTATGACATCAACATATAATAATACATGGACCACCGTAGCTATGG TAGATCTGTACATTCCACAGTAAGTGAAATTTATTTTATAACATCGTGCAGGGATGAATG AAAAAAAGGTGGATTATTTTACTCACCAGTGGTTTCCGAATGTTAACAACGATAGCTTCC ATGCATCATCCTCTACAGACCAATGTACACGAACACCGTCGCTTTCCCAGACCACTGGTG ATGCTAATGCTGCTGTTGGAGGTTGCAAAAGTCCGTTGGATGATCCTAATAACTTCTCTT GTTTAAGTGCATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTTGTTTCTGTTGATGATGCAGAAACAT TTTACTAGAAATATTCATTT
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>LITCHI023042.m4 GenomeSequence + CGGGCCCAGCCACTTGTCAAAGCGAGCTTCAGTGAAGCCCACTTGTGGCTCAGTGTTTGG TGACGCACGTGGTCTCTCCACCGGCAAATCCCGGTGACACGACCGGACCAGCCGGTCACA ATCGAATCTTTGTAACAAATCGGACGGTCCACGTCTAACCATGTGATAAATAATGAAGTC GATTAAATTGACAAAAATCGCACACTTACAAAAAAATTCTTCAGTTCCTCTTTCTCTCTC TCTCAACAAGTAGAAGCGTTTTCTTCTTCGGTTCACAGAGAAGATTCTTCAGCTGAATTG TTGTATGATTTGAGATGGAGAGAGATTTTCTCGGCTTAGGTTCCAAAGCCTCTCCGATTA CTGTCAAAGAGGAGACCTCTGATTCCTCCAAAGACTCAGGTGTCTTTCCCTTCTTTTTTT TTTATATATATTTTTGGTTTTAATTTTAATTTTCATTATTTTCATTGCTTGTTTTACGGG TTTTTGAGTGCTCTGATTAATCTGATTCAAAATTTAATTCTTTTTATCTTCCTTTTGTGA ACTGTAAGAAGTTTTTGGAGCATGAAACGCTTAAAACATAAAATTTTCTTTCGTTTTCTC GGGAACCAAATAGAGTCTAGAGAAAGCTAACTCTGAACAAGAAAAGTACCCACGAAAACT ACACTTTTGTTATTCTTTTAATTATTTAACTATTTTTTCTGGTAATTAATTTAGGTTAAA CACGTAAAGTGGACTCGAAGTATTTTTTTTTTCACTATTGAAGTTAGCTTAAAAATCAAA TATTCACAAATTTTATTTTTCAATAAATTTTTATTATTTAATGGTGTATGCTAAGGTGCG CTGCGTGTGTACTGTTCACGTGTCGATCCCGTCACTTGGTCAAACCAGTTTGTATTCTAG 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