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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005549 | Chr14 | 11202718 | 11206253 | + | Zinc finger protein JAGGED |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
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>LITCHI005549.m1 ATGAGACCGGAGAAGAACCCTTTGGACCTCAACAACTTGCCTGAAGATTACTCTCGAGAT GGCAGCAAACAGGTCTTTGATCAAGACACCTCTTCTGCTGCTGGCTATAGGAGAAAGAAA AGCGGCGCTAAGGATGGGAAAGATGAGTGCGGTAAGGTCTACGAGTGTAGGTTTTGTTCC CTCAAGTTCTGCAAATCTCAAGCTCTCGGGGGACACATGAACCGCCACCGACAAGAGAGA GAGACAGAGACACTGAACCGGGCTCGTCAGCTGGTCTTCAATAACGATAACATTGCCGCT CAAGGGGCCCCCCATATAGGCTGCCATCCGATCACACCAGGAAGCTACATAGCAGATCCT TTCAGATCAGTGTATCCACCAAGACTCTTTTCCGGTTCTTCCTCCACTCTCATACCGCCA CCGCAGCCGCCACCTCCACAACCACCGCTATCTTATCCATATCCATCACCCTCACGTCTC ACTTCCTACCAGTCTCAATATACCCCACCACCACACCATCACATCAACGACTACTACGTC GGTCATGTTCTCGGTAGCAGCAGCACACACTCATCACAATACCCTCATCATCAAAATCTA AGCTACATGGGCGGTGGTGCACCAGAGTCCAACTACACATGCATAGGTGCACCAGTGGGA CACGGGTTCATGCCCGGCTCAAGCCGGGGCAGCTCGGACATAGCTGGATCATCATCAGGA GGAGGAGGAGGGGGTGGTGGTGGTAGAGATGTGTCAGTTCATCAACATTTGGATCCTTCA AATTCATCGATGATCAATCGGTTCCAAGATGGGTTCTAA >LITCHI005549.m2 ATGAACCGCCACCGACAAGAGAGAGAGACAGAGACACTGAACCGGGCTCGTCAGCTGGTC TTCAATAACGATAACATTGCCGCTCAAGGGGCCCCCCATATAGGCTGCCATCCGATCACA CCAGGAAGCTACATAGCAGATCCTTTCAGATCAGTGTATCCACCAAGACTCTTTTCCGGT TCTTCCTCCACTCTCATACCGCCACCGCAGCCGCCACCTCCACAACCACCGCTATCTTAT CCATATCCATCACCCTCACGTCTCACTTCCTACCAGTCTCAATATACCCCACCACCACAC CATCACATCAACGACTACTACGTCGGTCATGTTCTCGGTAGCAGCAGCACACACTCATCA CAATACCCTCATCATCAAAATCTAAGCTACATGGGCGGTGGTGCACCAGAGTCCAACTAC ACATGCATAGGTGCACCAGTGGGACACGGGTTCATGCCCGGCTCAAGCCGGGGCAGCTCG GACATAGCTGGATCATCATCAGGAGGAGGAGGAGGGGGTGGTGGTGGTAGAGATGTGTCA GTTCATCAACATTTGGATCCTTCAAATTCATCGATGATCAATCGGTTCCAAGATGGGTTC TAA
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>LITCHI005549.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATATGAAATTTCTTCCATGTCATGGATGTGTGGTAGTAACTAGTTTGGATTAATGGGAGC TGTGTAAGCTACAATTGAGATCACCGATAATAAAATTTTTAGGTTCTGATTTGAACATTT GAATGAACTCATATTGCTTTCTCTTTTCGTTTCTTTGGATTTTGTTGCATATTGTTTTAA TTGCACAGTGCCTTAGATCTTATACAGTTTAGGGAGTACTTATCAAGATCATCATCTTGA AACTTATTAAAGTACAGCTTGAGTCGTAGCTGAATGTACTTTTCAGCTTATTTAATATTT ATAATTAAATTCTACCATTTAACATTTAGCTATATATTTTTCTGATTTTAATATTTAAAA ATGGGTTAGAAAGGACATCGAGTTTGAATTCAATTATCTGGAAAACTACAATCACTTTAA AGTTGAATTTCATATTCATTGAAAAGGACTATGATCAACAACAAAAAGCTTCCAAAGAAT AAAACAACAATTTTAAGCGGGGATATGTCTAAATCCCAACTTAGATCACAAAACCCTAAC AATGAGATTTTGATAGTAACAGTTCCATGATCCATGGCAAGCCCTTGCCACAGAGTACAA TCATGACCCAGGAGACCTAATACAAAAACCTATATATGGGGACCATTTTTATTTGAACAT GCTAGGTGCTTCTCAAGACATACAATGAGCAGTACTAAAGCAGCTTATTTTTAGGGCTAG GCTTGTCCGTATGATTTCCCTCAAAACCATTTATTTCATCCTTGCATTGTTTCTAGGAAC CCCTGTTTGCTTAATTTAATGTTGGAATACCATGCGCAAAGTACATCATTGAATTGAAGT TTAACTGTGATATGTCACTTAATGATCTAAAACTTTGTACTTGGAAAATCTATTGGATTA GCAACAGTCACCGAAAATTTCATTTTGCTAGCCAGCAAGAATGAATTTCGGTCATCAATC TATAGGGATATTATCAAAGTACTTTTTGAAAATGAAACTAATGTGAAACCACTCATTTTT TGTTTTAAAAAATAAATTCAATGATATTATTTTTTTTTACTACTTTTTTATATTAAAATA TTGGGTTAATTGATATTATTTTTCATTTTAGAAGATTTTTCAGATTTTTTTCTAATTTAT ATATACCTCGTTAATTCTTTATAATTTAGATGTATTTTGAATGGCAAAATTTGAAAACAA AATTAGTAAGACTATAGCTAGGTACACACTTTAAAGAGTGCGCCACATAAATTAACATTG ATTGATTGCCTATATAAACTATTGCGTAATGATATCATATATCGATAAGACCATTTCTTT ATCAAATTAATATTGAAACCAGGTGCCCACTCACAAATTTTGAAATCTCTCTTACTAAAT AAAAAGTCCTCAAGTGTTAAAATAAATATGCCATCATATGGATTAATTATGTGTTCAAAA GGGACAAAATCTACACGAAACCAACTTTTTATACTGTATTAATCTATGACCATCTTGTGA ATCTCATTTTGTCATATTAAAGAAGATACTAGTAGTTCAAGTTGACCTCTAGGGCAATAG ACCTAAGCCCAGAGCCCTAATCCCTTCACTAAAAGGAAATAAAAAAAATAATAATAATAA AAAGAAAACATGAAGAGAAAAACAAAGGCAAAGTCCTTCTCATTCCCTTGCACTTCTAAC CAAATGATACTACTACCACCTGCCTAAGCCACTCCCCACACACTCAGCCTTGCTCTTTTT AAAGTCACGAGACCCTCTGTCCCATCCTGTGTTCTTTCAATTTACAAGAGAGAGAGAGGG ATGAGTCCACAGTGGGTGGCAGAGAAACTGATAGAGAACTTTCAAAACTCCTTTTTCTCC ACCTTCACTCAACTAGCCTCTATATAGCAGTCTCAAACTGAAGTCTTATAATTTTCTAAA GCTTTAGTTATCTTCCACCCATCTGAAAGATTGGCTTCACTTCTTATTTTTATTTTTTTC TGTCTTTCTCTGTCGGTACC >LITCHI005549.m2 + Up_Stream_Len 2000 TCCTTGCATTGTTTCTAGGAACCCCTGTTTGCTTAATTTAATGTTGGAATACCATGCGCA AAGTACATCATTGAATTGAAGTTTAACTGTGATATGTCACTTAATGATCTAAAACTTTGT ACTTGGAAAATCTATTGGATTAGCAACAGTCACCGAAAATTTCATTTTGCTAGCCAGCAA GAATGAATTTCGGTCATCAATCTATAGGGATATTATCAAAGTACTTTTTGAAAATGAAAC TAATGTGAAACCACTCATTTTTTGTTTTAAAAAATAAATTCAATGATATTATTTTTTTTT ACTACTTTTTTATATTAAAATATTGGGTTAATTGATATTATTTTTCATTTTAGAAGATTT TTCAGATTTTTTTCTAATTTATATATACCTCGTTAATTCTTTATAATTTAGATGTATTTT GAATGGCAAAATTTGAAAACAAAATTAGTAAGACTATAGCTAGGTACACACTTTAAAGAG TGCGCCACATAAATTAACATTGATTGATTGCCTATATAAACTATTGCGTAATGATATCAT ATATCGATAAGACCATTTCTTTATCAAATTAATATTGAAACCAGGTGCCCACTCACAAAT TTTGAAATCTCTCTTACTAAATAAAAAGTCCTCAAGTGTTAAAATAAATATGCCATCATA TGGATTAATTATGTGTTCAAAAGGGACAAAATCTACACGAAACCAACTTTTTATACTGTA TTAATCTATGACCATCTTGTGAATCTCATTTTGTCATATTAAAGAAGATACTAGTAGTTC AAGTTGACCTCTAGGGCAATAGACCTAAGCCCAGAGCCCTAATCCCTTCACTAAAAGGAA ATAAAAAAAATAATAATAATAAAAAGAAAACATGAAGAGAAAAACAAAGGCAAAGTCCTT CTCATTCCCTTGCACTTCTAACCAAATGATACTACTACCACCTGCCTAAGCCACTCCCCA CACACTCAGCCTTGCTCTTTTTAAAGTCACGAGACCCTCTGTCCCATCCTGTGTTCTTTC AATTTACAAGAGAGAGAGAGGGATGAGTCCACAGTGGGTGGCAGAGAAACTGATAGAGAA CTTTCAAAACTCCTTTTTCTCCACCTTCACTCAACTAGCCTCTATATAGCAGTCTCAAAC TGAAGTCTTATAATTTTCTAAAGCTTTAGTTATCTTCCACCCATCTGAAAGATTGGCTTC ACTTCTTATTTTTATTTTTTTCTGTCTTTCTCTGTCGGTACCATGTAGGTCTTCCCCACA TACATTTCTCCCCTCCAATTTTAAACACTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCCTCC TCCTCGTTCTCTTCTCTCCTCTCTTTCAAGTCCTTTTTCATTTTTGACTTTTGTCTCTCT TCTTTGTATATCACTTTTTATATATTCTTCTTTTTCGTTTTTGCAGGAGACCGGAGAAGA ACCCTTTGGACCTCAACAACTTGCCTGAAGATTACTCTCGAGATGGCAGCAAACAGGTCT TTGATCAAGACACCTCTTCTGCTGCTGGTAATCAACAATTTTTATTTATTTGTTTGTTTA TATAGACAAGCTAAAGAAAAAAAAAACACACTCACACACACAAACATAAAATGAAAATGA AACTGTGAGACAAAAAAAAAAAAAAAAACACTCACATGGGTTATTTTCTCGCTAAATTTA TAGTTAGAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAATAGGTGCATTTGATTGTTTAACAAGAAGAAG TCATCGTGTTAGAGAGTATTTAGAATAAAATAATGAATTTACATGGATTTCGGTGGGTGG GGTTCAATTAGGGTTGGGGTTTTGAGGCAAAGAATAGTCTCATCGAAGTTGCTTTAATTG CTGGGGTTGTTTTCATATTTCGAGCAGGCTATAGGAGAAAGAAAAGCGGCGCTAAGGATG GGAAAGATGAGTGCGGTAAGGTCTACGAGTGTAGGTTTTGTTCCCTCAAGTTCTGCAAAT CTCAAGCTCTCGGGGGACAC
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>LITCHI005549.m1 GenomeSequence + TTCTAACCAAATGATACTACTACCACCTGCCTAAGCCACTCCCCACACACTCAGCCTTGC TCTTTTTAAAGTCACGAGACCCTCTGTCCCATCCTGTGTTCTTTCAATTTACAAGAGAGA GAGAGGGATGAGTCCACAGTGGGTGGCAGAGAAACTGATAGAGAACTTTCAAAACTCCTT TTTCTCCACCTTCACTCAACTAGCCTCTATATAGCAGTCTCAAACTGAAGTCTTATAATT TTCTAAAGCTTTAGTTATCTTCCACCCATCTGAAAGATTGGCTTCACTTCTTATTTTTAT TTTTTTCTGTCTTTCTCTGTCGGTACCATGTAGGTCTTCCCCACATACATTTCTCCCCTC CAATTTTAAACACTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCCTCCTCCTCGTTCTCTTCT CTCCTCTCTTTCAAGTCCTTTTTCATTTTTGACTTTTGTCTCTCTTCTTTGTATATCACT TTTTATATATTCTTCTTTTTCGTTTTTGCAGGAGACCGGAGAAGAACCCTTTGGACCTCA ACAACTTGCCTGAAGATTACTCTCGAGATGGCAGCAAACAGGTCTTTGATCAAGACACCT CTTCTGCTGCTGGTAATCAACAATTTTTATTTATTTGTTTGTTTATATAGACAAGCTAAA GAAAAAAAAAACACACTCACACACACAAACATAAAATGAAAATGAAACTGTGAGACAAAA AAAAAAAAAAAAACACTCACATGGGTTATTTTCTCGCTAAATTTATAGTTAGAAAAAGAA AAAAGAAAAAGAAATAGGTGCATTTGATTGTTTAACAAGAAGAAGTCATCGTGTTAGAGA GTATTTAGAATAAAATAATGAATTTACATGGATTTCGGTGGGTGGGGTTCAATTAGGGTT 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