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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005549Chr141120271811206253+Zinc finger protein JAGGED

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
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>LITCHI005549.m1
ATGAGACCGGAGAAGAACCCTTTGGACCTCAACAACTTGCCTGAAGATTACTCTCGAGAT
GGCAGCAAACAGGTCTTTGATCAAGACACCTCTTCTGCTGCTGGCTATAGGAGAAAGAAA
AGCGGCGCTAAGGATGGGAAAGATGAGTGCGGTAAGGTCTACGAGTGTAGGTTTTGTTCC
CTCAAGTTCTGCAAATCTCAAGCTCTCGGGGGACACATGAACCGCCACCGACAAGAGAGA
GAGACAGAGACACTGAACCGGGCTCGTCAGCTGGTCTTCAATAACGATAACATTGCCGCT
CAAGGGGCCCCCCATATAGGCTGCCATCCGATCACACCAGGAAGCTACATAGCAGATCCT
TTCAGATCAGTGTATCCACCAAGACTCTTTTCCGGTTCTTCCTCCACTCTCATACCGCCA
CCGCAGCCGCCACCTCCACAACCACCGCTATCTTATCCATATCCATCACCCTCACGTCTC
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CACGGGTTCATGCCCGGCTCAAGCCGGGGCAGCTCGGACATAGCTGGATCATCATCAGGA
GGAGGAGGAGGGGGTGGTGGTGGTAGAGATGTGTCAGTTCATCAACATTTGGATCCTTCA
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>LITCHI005549.m2
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CCAGGAAGCTACATAGCAGATCCTTTCAGATCAGTGTATCCACCAAGACTCTTTTCCGGT
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ACATGCATAGGTGCACCAGTGGGACACGGGTTCATGCCCGGCTCAAGCCGGGGCAGCTCG
GACATAGCTGGATCATCATCAGGAGGAGGAGGAGGGGGTGGTGGTGGTAGAGATGTGTCA
GTTCATCAACATTTGGATCCTTCAAATTCATCGATGATCAATCGGTTCCAAGATGGGTTC
TAA
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>LITCHI005549.m1
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GHVLGSSSTHSSQYPHHQNLSYMGGGAPESNYTCIGAPVGHGFMPGSSRGSSDIAGSSSG
GGGGGGGGRDVSVHQHLDPSNSSMINRFQDGF.
>LITCHI005549.m2
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>LITCHI019963.m2
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GGATCATGCATGAGTTCAGAGTTAATCCCAGCTTAATTCCAGCTACTGCATTGAATAACA
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ACAACAAGCCTTCAAAGGCTAAAAGCAAGAAAATCACCAAGATCTTTGGAGGAAACCAAA
ATTTAGACAGTCAAGAAGCAAGTTTATTTGTTTCTAATTTACTTCAAGCAGATTTTCTTA
CCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTCT
TTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC
>LITCHI019963.m1
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TGGCTTTTTCTTGCTTGCGATATTCTCCAGAATTAGTACTTGTTGGTCACGAAGATCAGG
ATCAAGAAGAGCTATACTTGCCATCAGGTTATCGGTTTGCGCCTCGAAATCATGAGTTGG
TTCTACATTATCTAGCTAAAAAGATCTTGGATCAGAAACTTCCTGCAAATATCATCACAA
CTGTTGATTTGTGTCAATATGATCCTGATCAACTCCCCATCCGTGATTTCAAGTATGGAA
AACCTAACGAGGCATATTTTTTCAGCAAATTAGAATACAGACAATCAGAAGGATTGCCAA
GAAGAACAACAAAGAGTGGTTATTGGAAGGCCACTGGTAGACCTACCGAGATTTTCTATA
AGAAAACAGTTGTTGGATTTAAGAAAATTTTGATTTTTCATTGGGGAAAAGCCCCAACTG
GGAAGAGCAGTCCTTGGATCATGCATGAGTTCAGAGTTAATCCCAGCTTAATTCCAGCTA
CTGCATTGAATAACAAAATTAGAAGCAAGGTAGAGAGCTATGTGGTGTGCAAAATTAATT
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TTGGAGGAAACCAAAATTTAGACAGTCAAGAAGCAAGTTTATTTGTTTCTAATTTACTTC
AAGCAGATTTTCTTACCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCTCCTTTCTTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC
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>LITCHI019963.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TTGATTTAAAAGCAGCATAAGGTAATAATAGTGAAAATAACTTTGTGGTGTTAGTTACCA
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ACACGCTATCTCACGTGTAACGTAAATAGATAAAAGACAGATGCTAAACGCCCTTACATT
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ATCAAGCTCTGATATCATGTTATTTATTACAAATTCAAAAGTTTAAATTGATAGAAAAAA
ATCTAACTATAATAAGATTTATGCTGACACGTGACATAAGGAATGAGTGTTGAGTCATAG
TGTAGTATCTAAAGCCCAACCCCAATGAGGCATTATTAAATGAAGTGTAGAGTATGGGTA
TTACAATAGAGTAACTAGTTCTCGATGTCATTGATAATAAAAAGTGTCTCCAATTTAAGA
TGATGAAAGCACAATATATTAAGAGTACGTAAAGACTAAAAAACAAATGGAAGCACAACC
ATAATCATCCAAGAAAGGATGCAAAAGGAAACAAGAATTTCGGAATTTCGAAAATCCAAC
AAAAATATATTCATGTTAATGATTGATCATTCCATAAGAGTGATTAAGGATTTTCTTCAA
GCATTATTACCTATATTCAAGAGTTGATATGGACCTTGAATTGAAAAAAAAAAAAAAAAT
CTTCTGGTGGAAGCTCGACAATAGGGTTTGAGAAATTTAATTATAAGAGTAATAAGAGTA
TTATTGGCATTAAATTGGGTGTTTAGAGTGATGATCTAATTTTTAAATTTTACATATGGG
TATACCAACAAAATGAGTGTGCAAATCATATTTATAGGTAACCTTAACGGCACCCATTTT
TAAATTTAATTTAATGAATGTATTAATAATTTAGGTGTGAAAATCATATATGTATGTGAC
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GAAGTTGTTATCAAATAATCAAGCATTATTCTATATTTTTTAGCATTTGCTATTATAAAA
GAACGGTAAAATATGCAACATAGCTAATACAGAATTAATAGTATTTTTTTCTATATCATT
TTATTTTTAATTTCTTATATATATACTACTTATATGGTGTAGTCAATAGAATATATTAAT
CTAGATCACTACTTATTAAAAAAAAAAAAAAATCTAGATCATTACTAGATTGAATGAAGA
CTCTCTACCAATTGCATGGTCTAAATAAATTATTTTTAGGACTTCAAATTTACTTGAACC
ATTATATTGATATTTAATTGATATCAATTACTCCATATAGCTATCCTATATAGTGTCATG
TAGCTTCGTGAACCAAACTTCTCAAATCCCACTATTGGTGAGATTGGAACTCAAGAGAAA
TTTGTACATAAAAACAATAACTATAAGAAACCTACTACTAGAAGACATGAGTAGACCAAA
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TGGTAATAATTCAAATAAAAATAGAAAAAACTAAAAATCTAGAAATCGATATTTGTTATT
ATGACCGAAACGTAATTGTAATTTTTCTTCTCCTAAAATTCCAAACAAATGAATCTCACA
CTAATTTGAATTTCCAAATCAGGAATCCGTGTTTCATTAGAATACATATTCTTAGAATCC
TCAACAAGAACAAAAACATAAAAGAATCTCCACCCTTATAAATATGTAACAAAGAGCCAC
TTTTTAAATAAACTTCAAACGAAATCTCCCTTAGATTGAAGAAAGGAAACACAACATAGA
GAATATATACCCTTGAAAGT
>LITCHI019963.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TTTGTACATAAAAACAATAACTATAAGAAACCTACTACTAGAAGACATGAGTAGACCAAA
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GAATATATACCCTTGAAAGT
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>LITCHI019963.m2 GenomeSequence + 
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TCTTTTGATTATTATAAGACACTTGCACGCAAGTATTGAATAGTCTTAAAAACTCAAGTT
TAATCAAAATTATTTTTGATACAAAAATAGTCTTAAAAACTCAAGTGGAATCCAAAACAA
GCACATTTACTCACATGTGATAATGGTCCAACCACATGTATTTATTAGTATGTGTGGAAG
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ATCCCATAGGTATGGACTAAAATTTAAACACCATAAGGATCAACTCTTTTTTAAAAAAAA
AATAAAAAATAAAATTTTTTATCAAGTTATTTGTATTACATTTGAAATTTTTCCTTAAGA
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ATAGGTGATTTCAAGTATGGAAAACCTAACGAGGCATATTTTTTCAGCAAATTAGAATAC
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GACAACAAGCCTTCAAAGGCTAAAAGCAAGAAAATCACCAAGATCTTTGGAGGAAACCAA
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ACCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTC
TTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC
>LITCHI019963.m1 GenomeSequence + 
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TGGCTTTTTCTTGCTTGCGATATTCTCCAGAATTAGTACTTGTTGGTCACGAAGATCAGG
ATCAAGAAGAGCTATACTTGCCATCAGGTTATCGGTTTGCGCCTCGAAATCATGAGTTGG
TTCTACATTATCTAGCTAAAAAGATCTTGGATCAGAAACTTCCTGCAAATATCATCACAA
CTGTTGATTTGTGTCAATATGATCCTGATCAACTCCCCATCCGTAATTTTTTTTTTCTTT
TCTTTTGATTATTATAAGACACTTGCACGCAAGTATTGAATAGTCTTAAAAACTCAAGTT
TAATCAAAATTATTTTTGATACAAAAATAGTCTTAAAAACTCAAGTGGAATCCAAAACAA
GCACATTTACTCACATGTGATAATGGTCCAACCACATGTATTTATTAGTATGTGTGGAAG
TAATCTCTAGATACTTCTCTATATTATAAGGGTAGATTTCTATGCTACACATACTATTTA
ATCCCATAGGTATGGACTAAAATTTAAACACCATAAGGATCAACTCTTTTTTAAAAAAAA
AATAAAAAATAAAATTTTTTATCAAGTTATTTGTATTACATTTGAAATTTTTCCTTAAGA
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ATAGGTGATTTCAAGTATGGAAAACCTAACGAGGCATATTTTTTCAGCAAATTAGAATAC
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CATTGGGGAAAAGCCCCAACTGGGAAGAGCAGTCCTTGGATCATGCATGAGTTCAGAGTT
AATCCCAGCTTAATTCCAGCTACTGCATTGAATAACAAAATTAGAAGCAAGGTAATTGTA
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TTTCACATTATTTTTAGAACTATTACTCTGCTTCGAGATCAAGGGAGGAAGATACTATTC
CAAACCATGACCACAATGGTGTAGGATACCAATGACCATCCTCCTGTAGTTCACTATCTA
ACATTGTTAAAATGTTTTTAAATGGTCAAAAACATGATTTGAACCTCTTCAATTGAAATA
AACAAATCATAAAAGTGTATCTTTTGTTTTCATTAACTGTGAAGGGCACTGGGTTTTGGG
AATTAATCAGAAAATACAGTTTATAATAAAGTACTTGACAAGTGTTTATTCTTTTGAAAA
GCACTTTTTATAATACATCTTTGAACTTGCTAAGTGTAAAGTATTTTAATTAACCCTTCT
TTTAGTTTGTTTCAGGTAGAGAGCTATGTGGTGTGCAAAATTAATTACAAAGAATTAGAG
GACAACAAGCCTTCAAAGGCTAAAAGCAAGAAAATCACCAAGATCTTTGGAGGAAACCAA
AATTTAGACAGTCAAGAAGCAAGTTTATTTGTTTCTAATTTACTTCAAGCAGATTTTCTT
ACCACACCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTC
TTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAGAGCTTATTTCTCTTATGTAATCAC