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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005540Chr141107817311083010-High mobility group B protein 7

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005540.m1109174PF09011.13HMG_box_2Domain64.51.10E-17
LITCHI005540.m1111177PF00505.22HMG_boxDomain82.22.80E-23
LITCHI005540.m2109156PF09011.13HMG_box_2Domain41.22.00E-10
LITCHI005540.m2111157PF00505.22HMG_boxDomain54.61.20E-14
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>LITCHI005540.m1
ATGGCGGGTGGTGGTTCATCCAAATCGAATGCTCCGAAGCCCAGGAAGAGAGTGGAGGCC
GACTCTGGCTCCTCCGCTCCTCCTTCAACTCTTGTCAGAGCCAAAGATGGCAGTGCTTTC
GCCAGATGTGAAGAATGCAACAAAAATGTTCCAGTGGTGCTTATTAGCATGCATAATTGC
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AAGCTGATTTGAGTGGAGATCAATGGAAGAAATTCCATCTGGCAATTTTAGCTCTGAAAC
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>LITCHI005540.m2
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GAATGCTCCGAAGCCCAGGAAGAGAGTGGAGGCCGACTCTGGCTCCTCCGCTCCTCCTTC
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GCTGAAAATGAAGATGTAAGCTTTGAATTTCCATTTGGATGATGTGATTAGTTTCATTGC
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AGGAATCTGGTTTCATAAACTTCGGGAGGTTTCCTCTTATTTTACACCCAGCAAGACTGA
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AAGACAGGTCTATCGCTAGCAGAGAAGGAATGTCTTTGCCAAGAAAGTTTGGTAAAGGAT
CTGAGAAGCCATTTCTTGACAAATTAAGGTTCCAGAGGTTCTGCAATCTGGAAATGGACA
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TTATATTTATATTCAACAGCGCTTGTTCTGGGTAGAGACATTAATAATGTTCATGGTGAA
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CTCTCCTCACATTTGCACTTGCTTTTTATTTTCTCCACACAAGTCAAGTTCGAGTTCTTT
TTTTGCGGTAGTCGGTGGAA
>LITCHI005540.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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AATTTTCAATAAAATGAATATTTTTCCTTATACATTGAAATTTGATCTTTATGACTAAAT
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TATTCAACTTATGGCTGGTTTGGCATGTTATGTTGTATTGGATTAATCCCAATTTAATCG
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CATTTTCCCTCCCTAAGCCATTTTGATGCCCGTTTTCTCTCAATAAACTCCCTCGCGTAT
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TTTTGCGGTAGTCGGTGGAA
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GAATGCTCCGAAGCCCAGGAAGAGAGTGGAGGCCGACTCTGGCTCCTCCGCTCCTCCTTC
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TTTGTTTTTGTTTCTGGGTATTTTAGATTTTTGTGTCTCAGTCTTCGTAGTTGTGGTTCT
AATGTATCTATGCCTAGTTCATAGGTCCGATGCTTTGTTTGCATGTATTTTGAGTTTGTT
AGATTAGAATCTCAATTAATTGGACTTAATTTGATGTGAATTTGGACTTGTGTTAATACA
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TAAGTGGATCCTTTTTTTAATGTCCATATGATAATTATTCAATTATAAGTATGGTTTTTA
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CAAGGCAGAGTATGGGAAGGCCTTGGAGGGTAATGATGCTGAAAATGAAGATGTAAGCTT
TGAATTTCCATTTGGATGATGTGATTAGTTTCATTGCCTGTTGATTGTGTTATGTTTATT
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AATTTTGAAGCTCTAGTGAATGAAACTGGTTAGATGCTTTGAGAACTACTTAGTATAATA
TCTTACACTTTAAGCATCATTTGTGCGATCCTCTGTTTTATAATCATATGTTGCTGCATT
AATCTTTAAGCATCATCGCCATAATTCTCCTAAGTTGTTTAAAATTTGAAGGTTGCTGGC
AGCAATGATAACTGAGTTGATGATTGGTGATGGGGGCCAACTTTGACTGTGTCTCCATTC
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