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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005540Chr141107817311083010-High mobility group B protein 7

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005540.m1109174PF09011.13HMG_box_2Domain64.51.10E-17
LITCHI005540.m1111177PF00505.22HMG_boxDomain82.22.80E-23
LITCHI005540.m2109156PF09011.13HMG_box_2Domain41.22.00E-10
LITCHI005540.m2111157PF00505.22HMG_boxDomain54.61.20E-14
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>LITCHI005540.m1
ATGGCGGGTGGTGGTTCATCCAAATCGAATGCTCCGAAGCCCAGGAAGAGAGTGGAGGCC
GACTCTGGCTCCTCCGCTCCTCCTTCAACTCTTGTCAGAGCCAAAGATGGCAGTGCTTTC
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>LITCHI005540.m2
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GACTCTGGCTCCTCCGCTCCTCCTTCAACTCTTGTCAGAGCCAAAGATGGCAGTGCTTTC
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CTTAAGAAGAAGGGAAGTGATTCGAACAAGCCCAAGCGACCTCCCACTGCTTTCTTTCTC
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TTTTTTTAA
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>LITCHI016781.m1
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>LITCHI015071.m1
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>LITCHI015071.m2
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CTCGACCTAAAAGAAAACCA
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TGGTCCGGGAGTCAAATGGTAGCACTGAGAGCTCTATTAAACCAATTGAGATACCTCCTC
CTCGACCTAAAAGAAAACCA
>LITCHI022986.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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CATGTAGGCACGAAAACTGCTGTCCAAATCCGAAGCCATGCTCAAAAGTTTTTCTCTAAG
GTTGAATTTTTGTGCTTATT
>LITCHI022986.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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ATACTGTTTTTCCCCTTCTCTTATTTGTTGTTTGCTTTTATTTTGTTTTAATTGCAAATA
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AGAATCTGCTCTGGGTTTCTGTCACTGTTTTACGCTTCTTCTTCGTAAGAGTCGATACTG
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CTACAAATATCTTCATTTACTTTTATTTTTCCTTTTTTATTTTTTTTTATTTATATATAT
TTTTTATTGCTATTATAGGAGAAACAGAGGAACTGTGAAATTTACTGTTTTTAAGGGGAA
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GAAGAAATGACTTCATTGATTGTTCTTCCATCTAAGTTATAGATTGTGGCTTGGTTCAAG
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TGTTAGCTAAATTGTTCAATTTTTTTTTTTGGGTACAGGATCCAATTTTGGGAGTGGAAA
AAAAAAAAAAAGAAAAAAGA
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>LITCHI024008.m1 GenomeSequence + 
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TACACAACATAATACCAAAAACATAAAATATAAGATAAAATCAAAAAACCAACAAAAACA
AACTATAAAAGCCAAAACCCATCCCTCAAACCCACCTCATTCTCTCTCTCTCTCCCACCA
TCTCACTGTTTCTTCCACAAACAAGAACTCACCTCTCTCTCTCTCTATAAATGGAGACGA
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AAGGCGCGATGGGAACCGTATTCTTGGTCCACGACCGGGAAGCTGACCCGTCTGCCCGCT
GCCCTTTCGCTTTGAAGGTGGTGGAGAAATCTTCCCTCCAAACGAAATACGAGGCTGAGC
GTCGAGCCCGGTGGGAAATCAGGGTGCTGGCCCGACTCCACCACCCGTTTCTGCCACGCC
TTATCGGATCCTTAGAGAACCCGGATTTCCTGGCTTGGGCTGTCCCGTATTGTCCGGGTG
GCGACCTAAACGTCCTCCGTTACCGCCAAAACGACCACGTTTTCTCCCCTGCCGTCATTC
GCTTTTATCTAGCGGAGATTGTCTGCGCGCTCGACCACCTCCATAGCATGGGGATTGTCT
ATCGTGATTTGAAACCGGAGAACATTTTGGTCCAACAGTCCGGTCACGTGACTCTCACGG
ACTTCGATCTCTCTCGCAACCTAACCAAAAAAACACAACCACAGAACCACAACGACAACG
TCGTTGTAAATGTTCAACAACTTCCACCAGACAGAATCTCGAAAAAACATAGACGAATCC
TGACCCGGTGGATCCAGGTCTTACCCGACGCCAAAAACGGGTTAAAAAAGGCCAAGTCAG
CACGAGTTAGCCCGGTAAGCCGACGGAAACCGAGTTTCGACAACGGAGAGCGGTCCAACT
CGTTCGTGGGGACCGAGGAGTACGTGTCACCCGAAGTGGTCCGTGGAGACGGACATGAAT
TCGCTGTCGACTGGTGGGCCCTGGGGATCCTCACGTACGAGATGTTGTACGGTACGACGC
CGTTTAAGGGGAAGAACAGGAAGGAAACGTTTCGAAACATTTTGATCAAACCGCCGGAGT
TCGTTGGCAAACGTACGGAACTGACGGACTTGATCCAACGGCTGTTGGAGAAGGATCCTA
CCAGGCGGTTGGGGTACATGAGAGGCGCGTGCGAGATCAAGGAGCACGTGTTCTTCCAAG
GGGTCAGGTGGGACCTACTAACGGAGGTCTTACGGCCGCCGTTTATTCCGTCAAGAGAGG
AGGCTGAGGTAACGGAGAAAGTAACGGCCACTGGGATTGACATAAGGGAGTTCTTTCAAA
ATCTAAGGGCACCAACGCCGTCGTCATTGCCACCGTCGCCGTTACTGTCACCGTCAGCAG
AGACGTATAGAAGAAACGGTTCGTTTACGGAGTACTAACTGACGGAGGCACGTGCGGGAG
AGGGATAATGGCACGTGTAAGAGTTAGATTAGTTATAAAATTCTTATTTTTGTGTATATA
TTAAAAAAAATTAAATAATGGGTAGAACGTGAAAGACGCGCGCGCGTTTTAGTGATTATA
TTAGTTGATTCTAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAACCTATAAATATATAGTTTTAGACT
TGTATTATACAGTTGTGTATACTGTTATTTAACATACGCGCCAAGGCGGCGCGTGAGATT
GACGCTCTGCCATTTAGGTTGCAAGAAGTGTGAGGGGATCTGGTTTTTTGGGGACAAGTT
TTGGGTTTTTGGGTTTTGCCTTTGACATGAAGCAATTCATAAATTCTTGCATTTCTTGCA
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ATTCTGTTTTGTTTATTTTTCTTTATTTAGGGAATTAAATTTTATCTTTTTATCAAATAA
TTTTTTATTAGGATACATTGGAATTCTAATTTATTAGTTTAATGAAAGGATTTTGTTATT
ATTATACGGTACTTGTGCATTACAGCAGAAAACAGAGGAATTTTTTTGTTAAGAC