Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005494Chr141059456310600743+Transcription factor PERIANTHIA

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005494.m1189231PF07716.18bZIP_2Coiled-coil24.22.90E-05
LITCHI005494.m1190228PF00170.24bZIP_1Coiled-coil29.75.50E-07
LITCHI005494.m1275348PF14144.9DOG1Family1043.80E-30
Download   Copy
>LITCHI005494.m1
ATGCAGAGCTTCAAACCACTAGTTCCTGCTAACCCTGAATTATATTGTCACGCTTCGTTG
TTTCTCCGAGGAGTAGATGATGGTAGCCGAAACCAGACGCGTTTTGCGGATCTTGGAGAG
CTTGAACAACCTTTCCACAACGATGCTGTTGATTTAAGCCCAAGCTCCATGTTCAGTTTA
AAATCAAACAATGTCACCTTTGTTTCCAATAACCTGCACTACAACACCTTGAGCTCGAGT
GTTGGAATTGGATGTGCAACTACTGCAGAGATAATTGGTGCAACAGCAGGAGGAGGAGGT
GTGGGGTGTTTGGATACGGGGCAATTCATGTCCCAGAAAGGGACAACGATTGTTTCAACG
TTGGGAAACGGGCATATTGAGAACTGGGGTGAGTCAGGGATGGCTGACAACAGCCAACAG
ACTGACACTTCTACAGATATTGACACTGACGATAAAAACCAGGTCTCCTTGTCTCTTTCT
CGATTTCTTTCCGTTCATGGAAATCAGTGTGGCGCGCTTGTAGTTGTGGATTCTATGGAT
CAATCCACGGCAAAAGCTGGTGATCAGAAGGTACTTCGTAGGCTGGCTCAAAATCGAGAA
GCTGCAAGGAAGAGTCGGTTGAGGAAGAAAGCTTATGTCCAGCAGCTCGAGAATAGTCGT
CTCAGGCTTGCACAACTAGAGCAGGAGCTTCAAAGAGCACGACAGCAGGGTATTTTTATT
ACAACTGGATTATCAGGTGACAATGGCCATTCAGCAACTGGAAATGGGGCCTTGGCATTT
GACATGGACTATGCACGCTGGCTTGATGAACATCAAAGGCTGATCAGTGACCTAAGATCG
GCTGTAAACTCTCATATGGGTGATAATGATTTGCGCCTTCTGGTTGATGGTGTGATGGCA
CATTATGATGAACTCTTCCAGCTAAAGAGCATTGGGACAAAGGCTGATGTATTTCACATG
CTTTCTGGCATGTGGAAAACACCTGCTGAGAGGTGTTTCATGTGGTTGGGTGGTTTTAGA
TCATCTGAACTTCTCAAGATACTTGGAAACGATCTAGAACCCTTGACAGATCAACAGTTG
ATGGGCATTTGTAATCTACAGCAATCGTCCCAACAAGCTGAAGATGCCTTATCCCAAGGA
ATGGAAGCATTGCAGCAATCTCTTGTAGACACACTCTCATCTGCTTCTCTTGGCCCTTCT
GGCTCTGGAAACGTTGCTGACTACATGGGCCAAATGGCTATTGCTATGGGCAAGCTTGCC
ACACTAGAGAACTTCCTACACCAGGCTGACCTTCTGAGACAGCAAACACTTCAACAAATG
CATCGAATTTTAACCACTCGTCAAGCAGCACGTGCCCTTTTAGTCATAAATGATTATACT
TCACGCCTTCGGGCACTCAGTTCCTTATGGTTGGCTCGTCCTAGAGACTGA
Download   Copy
>LITCHI005494.m1
MQSFKPLVPANPELYCHASLFLRGVDDGSRNQTRFADLGELEQPFHNDAVDLSPSSMFSL
KSNNVTFVSNNLHYNTLSSSVGIGCATTAEIIGATAGGGGVGCLDTGQFMSQKGTTIVST
LGNGHIENWGESGMADNSQQTDTSTDIDTDDKNQVSLSLSRFLSVHGNQCGALVVVDSMD
QSTAKAGDQKVLRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLENSRLRLAQLEQELQRARQQGIFI
TTGLSGDNGHSATGNGALAFDMDYARWLDEHQRLISDLRSAVNSHMGDNDLRLLVDGVMA
HYDELFQLKSIGTKADVFHMLSGMWKTPAERCFMWLGGFRSSELLKILGNDLEPLTDQQL
MGICNLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSLVDTLSSASLGPSGSGNVADYMGQMAIAMGKLA
TLENFLHQADLLRQQTLQQMHRILTTRQAARALLVINDYTSRLRALSSLWLARPRD.
Download   Copy
>LITCHI025280.m1
TTCGTAATAACAATAATAAATGGAAGTGATGAGAGGCTGGTGAAAAGTAGTGGCCCGCTC
TGCTGCAGTGGCAGCGCTTTTTGAGGGAATGCATAGACTGCAGAGAAAGAGAAAGGGAGG
GAAAGGGCAAATGGAAAAAAGGGCAGAGTAATCTTTCGTATTATAATTATTTCGTAAAGT
GAGAAATTATTAAAGAGTGAGGAGCGAGATGGGTATGTAACCTGTGTTGTTGTGGTTGTG
GGTGCGTTTATAATGTGTGCGTGTGTGCGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGCTGAGTGTT
CACGTGGGTTATGCTCAGCTTGTCATGTGACACCCCCACCCCAACTCTTGCCTTCTGCAA
TCTAATTCAGCAGCTGAGTCAACTGAGTCTCTCTTCTGCTTCTGGTGTATGTGCGTAGTG
ATGGGCTGTTTCCAGTCCAAAACGGCACATCTACCGTCTCCTGACCAAGACCCCCCTCCA
CCGCAGCCAAAACCAGATCTAGCTGATGGCAATGAACAAGTCCCTCCCTTCAAAGAATTC
CCTCTTGCTGAGCTCCGAGCAGCCACAAACGGCTTCTCCAGCGATTTGATTGTTTCGGAG
AGCGGCGACAAAGCTCCCAATGTCGTCTACAAAGGGAAGCTCAAGAACAATCGTTTTGTT
GCTGTCAAGCGCTTCTCTAGACTCTCTTGGCCAGACCCCCACCAGTTTCTGACGGAAGCT
GCTGGTGTGGGCAAGGTGAGACATAAGAGACTGGTCAACTTGATTGGTTGTTGCGCCGAG
GGAGATGAGCGCTTATTGGTCGCCGAGTTCATGCCTAATGATACCCTCTCCAAGCACCTC
TTTCACTGGGAAAAGCAGCCATTGCCATGGGAAATGCGCGTCAGAGTTGCTTACCATATT
GCTCAAGCACTTGATCATTGCAACTCTGAAAACCGAAAAATCTATCATGATTTAAATGCT
TACAGGGTTCTTTTCGATGAGGATGGTGACCCTCGATTATCTAGTTTTGGTCTTATGAAA
AATAGCAGAGATGGAAAAAGCTACAGCACAAACTTGGCTTATACACCACCAGAGTTTTTA
CGGACTGGCAGAGTTATCCCAGAGAGTGTGATATACAGTTATGGAACTGTTCTGTTGGAC
CTTTTGAGTGGAAAACATATCCCTCCAAGTCATGCATTGGATTTAATAAGGGGAAAGAAT
CTGCTATTATTAATGGATTCATCCTTGGAAGGACAATATGCCAATGAAGATGCAACTCAA
TTGGTTGAACTGGCCTCGAAATGTCTTCAGTATGAAGCTAAAGATCGACCAGATATTAAG
TTTCTTCTTTCAGCAGTGGCACCTCTCCAGAAGCAGACAGAGGTTGCATCTCATGTTCTA
ATGGGTTTATCAAAAACTCCAGTGGTGCTGCCAACTATGTTATCCCCTCTTGGAAAGGCT
TGTGCAAGGATGGATCTTACTGCAGTGCATGATATATTACTTAAAACTGGTTATAAAGAT
GAAGAAGGTGCAGAAAATGAGCTATCATTCCAAGAATGGACACAACAAGTTCAGGATATG
TTGAATACAAAAAAGTTTGGGGATATTGCCTTTAGAGACAAGGATTTCAAAAATGCTGTT
GAGTATTACTCGAAGCTGGTATCGATGATGTCAGTCCCATCGGGTACAGTATTTGTGAGG
AGAGCGCTGGCATACCTGATGATAGAACAAGCAGAACTAGCACTGAGAGATGCAATGCAG
GCACAGGTGTGCTTGCCGGAGTGGCCGACAGCCTTCTACATGCAAGCTCTTGCACTAAAC
AAGCTGGGAATGGAGACTGACGCTCAGGACATGCTAAATGATGGAGCCTCCTTTGAAGCA
AAGAAGCAGAATAGCTGGCGCATTTAG
Download   Copy
>LITCHI025280.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TGTTATATGCATCTTATCAAAACTGTATGTACATCGATTTTGCTAATACAACCCATTAAA
GATTGTTTTTAAAAAATTATAGTCCACAGTTGTAATCATTTAATACAAAAGCTATTGTTT
CTTTAATTTATTGTATTACATATTTGTAAATAAATATCATCAAAACTTTTTTTTTTTTTA
AACATACGATAATAAGTTTAAAAAAATATTTTATAGGGTGTATTTACGGAATGGGTATAT
ACACAATTTTTAAGAGATGTATCCAAATTCCCAAATCCCTATCTTCATTCCTGTTACCAT
TTTGGAGGAAGCCTTTGAGAATGGAGGATGGTGATGAAATTCAGTTCCCAAATATAAATA
GGTTTTTGCTACTATATTGGATCTATGTAGTTACTTTGATAGTTGTGAAGGTGAGTTGGT
TTTATTTATTTTGTATTTTTACTTAAATTTTAAATTTTATTTTATTTTTTGATTTTGGAT
TAGAATCCAATCACCATTAACATTACCAATAATCATATAGAAGCATGATCAAATGTAAAT
AAGAAAGCACCCCATCCCCTTCTCCCCAATTAAATTATATATATAATTAAATATATTGTT
TTATGCATTATGTTTTATTTATATATTTTTGTATATTTAATTAAATTATTAATTAAAAAT
ATATATTCCTAATTTCGTGTCAAACTTAATCAAATAGAAATGGGCAACTAAAAAGAAAGA
AATGGTAGGAATGAGAAAATAGGGATGAACATTGGAGAGCCGCCTCCAAATCCTCCCTTC
TCGTTTTTTTGGAAAATGGATTTCATTTCGGTTGAATAGGCCCATTTAACCCAATTGATA
TATCCAGTAAAATTTTAGTCAATCCGTTTACGAGTTTATTTTCAGGCTTGACGATCTAAC
GCGCTGGGAATAGTTGAAAAAGTACACAAAGCATATGACCTGAGTATTCAAAGGAAGCAC
TCAATTGATGATTTTGGTTTTTTGCCCCGAGGGGAGGGGAGGGTGGAGGTGGTGGTGTGG
ATGAATAATAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAGACTTCATTTTGACCTT
TATATTTTAAAAAATTTATTGTTTTAAAAGTAAATTCGTTTATAATGTTCGTAAACCCTT
ACATTTTTAAATTCATCAACTTAGTCTCTTTGATGTGATTTTTAATGGCCAACATCAAAA
TAAAATTATAAAAAACTATTTTATCTTTAATTTTATATGTATTTTTAATTATGATTTTTG
TTTAATTTTTATTTTAAAAATTTTTCATCTTACACGTGTTCATATGTTATTAATTAGTGT
TAAAAGATAAAACTATTTTTAGGTAATATTTGACCGTTGATTAATAATGAGAATTAATTT
GATGAGATTTTATAATGGAATCATGAATATTATAAATAAATTTATATTAAAAAATGAGAA
GTTTCTTAAAAGGATTGGAATCAAAACAAAGTTTTCGTAATAACAATAATAAATGGAAGT
GATGAGAGGCTGGTGAAAAGTAGTGGCCCGCTCTGCTGCAGTGGCAGCGCTTTTTGAGGG
AATGCATAGACTGCAGAGAAAGAGAAAGGGAGGGAAAGGGCAAATGGAAAAAAGGGCAGA
GTAATCTTTCGTATTATAATTATTTCGTAAAGTGAGAAATTATTAAAGAGTGAGGAGCGA
GATGGGTATGTAACCTGTGTTGTTGTGGTTGTGGGTGCGTTTATAATGTGTGCGTGTGTG
CGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGCTGAGTGTTCACGTGGGTTATGCTCAGCTTGTCATG
TGACACCCCCACCCCAACTCTTGCCTTCTGCAATCTAATGTACGTATGTGATCACACACG
TTAGAGGAGTCATCTTAAGAGAGAAAAAGCCTACTTTTCTTTCCTTATTTGACTTTGAAG
ACTCATCTTCACACTTCTTCTACTTGCTTGTTGTTTAGTCAGCAGCTGAGTCAACTGAGT
CTCTCTTCTGCTTCTGGTGT
Download   Copy
>LITCHI025280.m1 GenomeSequence - 
TTCGTAATAACAATAATAAATGGAAGTGATGAGAGGCTGGTGAAAAGTAGTGGCCCGCTC
TGCTGCAGTGGCAGCGCTTTTTGAGGGAATGCATAGACTGCAGAGAAAGAGAAAGGGAGG
GAAAGGGCAAATGGAAAAAAGGGCAGAGTAATCTTTCGTATTATAATTATTTCGTAAAGT
GAGAAATTATTAAAGAGTGAGGAGCGAGATGGGTATGTAACCTGTGTTGTTGTGGTTGTG
GGTGCGTTTATAATGTGTGCGTGTGTGCGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGCTGAGTGTT
CACGTGGGTTATGCTCAGCTTGTCATGTGACACCCCCACCCCAACTCTTGCCTTCTGCAA
TCTAATGTACGTATGTGATCACACACGTTAGAGGAGTCATCTTAAGAGAGAAAAAGCCTA
CTTTTCTTTCCTTATTTGACTTTGAAGACTCATCTTCACACTTCTTCTACTTGCTTGTTG
TTTAGTCAGCAGCTGAGTCAACTGAGTCTCTCTTCTGCTTCTGGTGTATGTGCGTAGTGA
TGGGCTGTTTCCAGTCCAAAACGGCACATCTACCGTCTCCTGACCAAGACCCCCCTCCAC
CGCAGCCAAAACCAGATCTAGCTGATGGCAATGAACAAGTCCCTCCCTTCAAAGAATTCC
CTCTTGCTGAGCTCCGAGCAGCCACAAACGGCTTCTCCAGCGATTTGATTGTTTCGGAGA
GCGGCGACAAAGCTCCCAATGTCGTCTACAAAGGGAAGCTCAAGAACAATCGTTTTGTTG
CTGTCAAGCGCTTCTCTAGACTCTCTTGGCCAGACCCCCACCAGTTTCTGGTATGGTACG
CCTCTTTCTGTTTTTGTTATGCATGCATCGGCATCGCTTACTTGTTTATCTGTTTTATCT
GTTTGTTTGTTTCAGACGGAAGCTGCTGGTGTGGGCAAGGTGAGACATAAGAGACTGGTC
AACTTGATTGGTTGTTGCGCCGAGGGAGATGAGCGCTTATTGGTCGCCGAGTTCATGCCT
AATGATACCCTCTCCAAGCACCTCTTTCACTGTAATTTCTTCTTCTTTTATTTTCTCTTC
TTTCACTTGTTCTTTCTTTACGCTAGTCCTGTTCATTGCAGGGGAAAAGCAGCCATTGCC
ATGGGAAATGCGCGTCAGAGTTGCTTACCATATTGCTCAAGCACTTGATCATTGCAACTC
TGAAAACCGAAAAATCTATCATGATTTAAATGCTTACAGGGTTCTTTTCGATGAGGTACT
TGTCTTTACCATCACATTTATGAAATCATCACTGTGCTGGCTTCCAAATTCATTCTTTTC
AACCAACAAGGAATCACTCATCATCTTATTAAACTCTATTTATTTGTGCTCTTATAGTTT
CTTTAATTGCTTGAATTTGAATTTTGGGTTTAGTCCAACAAATTAATCTAGTTCGTTGAA
TAACAGTGAAAAAGAGTAACTTTTTTTTTTTTTTGGTTCACTCAAAAATTTACACATTTC
GCTCATTACATTTGACCAAAAAGAGAGACACCATGCAAGTGGGGATTCACTTGTTTGTGT
TAATTTATCCTGTTTGTTCAGTTTGAGAAATCTCGAAGTTGAAACATGTGTTTATACACA
AATTAGACAACATTTGGAATTCACTATGTATAGGTTCTTGGTCAATTGTACTACATTATT
TCAAACTTGTTACTTCTTTTGTTGTTGGGATTTAATTTGCTTACCTCATTTTTAATCCCC
TACTGCATTGACTAGATTAACCACTTCACCCAGTCAAAAGTCACAACTGCTCATCGTATC
AAGAGTCCTGCCTTGCTACTCTTTGAAAAGCCACACTATACTTCTTCCTGCTTCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCTCTCTCTCCATCTTGTTTCCAGTTTCCACACCTTTTTTATTTGAG
AGTCGTATCTAACCTGCTCAACCACTCCTTTGTGAGTAATGTTACTGCTCTTCGCGTAGG
GGCTCAACATTTTTCAGGAAAATACACAAGTTAGGCACAAACACTACATTAAATTTTATT
GCCTTTTGGCTTTGGGAGGAGCAGCAGTGGGAATGTTTTGTTTCTAGCATGTGGCCAAAC
TGCGTTTTGTTTCTAGCACGTTGACAAAGTATGGAGCAATGAAGAAGTTATATCCAGTTT
TGATATAGAAGTAAAAATGACATTCAAATATTGAAATGCAATCTTAATTCTGTATAAATT
GCAAATTGCTTCACACATCATGATTTTTCTTTCAAAACCATTTGAAAGAAGACCATTTCT
TTTTATTTCGTTAACATATAGATTTGCTGTTGTATTAATTTTATTTTATATTGCAGGATG
GTGACCCTCGATTATCTAGTTTTGGTCTTATGAAAAATAGCAGAGATGGAAAAAGCTACA
GCACAAACTTGGCTTATACACCACCAGAGTTTTTACGGACTGGTATGGCATTTGAATTTT
ACTTGCATTCTTACGTGTATTGAAGGTTGCTAATTGGCTGTTTATATGTTACAAAAATTT
CAACTGAAAGAGATATATAGATTTTCTGTTTCAATAAAGTTGAATTTATGAAAGCATACG
ATTGATAATATTAATTATGACATATTGATCGGTTTTAAGAAGAATCACTGCTTTAGGAAC
AGGGGCAATTAGGAAATTTTGTTGTAACTCTTGTAACAGGGGCAATTTAGAATATGCATT
TTTTGGCCACATGGACTTCAGTTACAGTTGGTTATATTGTCAATAGCCATTCAGAATATA
AAGAATTGTTTATGCAAACGAGTTTCTTCACCCTCTAATTTCAATGCTCTAATTTGCAGG
CAGAGTTATCCCAGAGAGTGTGATATACAGTTATGGAACTGTTCTGTTGGACCTTTTGAG
TGGAAAACATATCCCTCCAAGTCATGTATGATACACTGTCTCTTGGATCATCTACTTACT
CTCCTTTCTTTTGTCCTTTCTGCTATTTGTATATTTTAGTTCACATTCAATTGCCTGGTC
TTAGAACTAATATTTAACAGTCTGTTAGTTTACTATTTGTGAGATATTAACACCAATTGG
ATTTATTGTTTATTTTTTTCTTTTCAGATGTGTAATATCTTTTTTAACTAATTATGCTCG
TATTCTTTTGTTTGCTTCAAAGTGTCCTGAAAGAGGAATCTTGTAAGGGCCGAAGATATC
TATTCAGAATCATCTTATGCTGAATAATACAGTAGTATTATGTTGGTATGATTTGGAAAT
AGTTGATAGAACTAATAAGATTCAGTAGAAACAATATAACAAAGAGGAAGGTTTAGGATA
TCTACTCTTAAGATCCTGAATCGTAGCTTGTGAATTGGGTTTAAATATCTGGATTTCTTA
TTCATGTACTATACTGAAATGTTTTCCATAATATTGTTATAATGATAAAAAGGAATAAGG
CTTGCCAGAGTTGATATGCATGATAGTCTCTTTCTTTGTATTATAGTTAGGCCTTTGCTA
TAAGTTGTGGTGCTCATATGAAGTGCTTATATTAATATATATATTTTTGACTTTATCACA
TGGTTGTTGTGTCTCAGGCATTGGATTTAATAAGGGGAAAGAATCTGCTATTATTAATGG
ATTCATCCTTGGAAGGACAATATGCCAATGAAGATGCAACTCAATTGGTTGAACTGGCCT
CGAAATGTCTTCAGTATGAAGCTAAAGATCGACCAGATATTAAGTTTCTTCTTTCAGCAG
TGGCACCTCTCCAGAAGCAGACAGAGGTGAAATCTCATAGTCCCTTTGAACTTAAACAAA
AACTTGGTGTGCTCTTCATCTATGAGATATGGTGGTCCATACATGCTGATTAGCCCTATT
AATAAAGTGTTCTCTTTCACATAATTGATTTCCTTAGGTTGCATCTCATGTTCTAATGGG
TTTATCAAAAACTCCAGTGGTGCTGCCAACTATGTTATCCCCTCTTGGAAAGGCTTGTGC
AAGGATGGATCTTACTGCAGTGCATGATATATTACTTAAAACTGGTTATAAAGATGAAGA
AGGTGCAGAAAATGAGGTACGTCCCAGCCCCCATTTTCATTTCTGTTGGTTACTACACTA
TTACAGAAACAGAACAGAGAATTACATTTTCTTTTTTACTTTAAACCTAAAAGGAACTGA
CAGCAACCTTCCATTGGTTTCTAACTCATGCTACTGTCCGTCCACTGAATTTTATGGCAG
TTGTTGAAACATAACGGTCTTGTTGAGTGCATTAATATAATCTTTCCATGTGGGTGTTGT
AATTATACTTGTGCTTATGATGATCTAATTTACTGAAAATATGTAAAATTTGAAGCTATC
ATTCCAAGAATGGACACAACAAGTTCAGGATATGTTGAATACAAAAAAGTTTGGGGATAT
TGCCTTTAGAGACAAGGATTTCAAAAATGCTGTTGAGTATTACTCGAAGGTACATAGCTT
GATGGTTCTTCTTTTTCCCAGTTAGAATGAGTTTATATGTTGAGAAATTGATGGTTGGTT
GTAAAATTCAGCTGGTATCGATGATGTCAGTCCCATCGGGTACAGTATTTGTGAGGAGAG
CGCTGGCATACCTGATGATAGAACAAGCAGAACTAGCACTGAGAGATGCAATGCAGGCAC
AGGTGTGCTTGCCGGAGTGGCCGACAGCCTTCTACATGCAAGCTCTTGCACTAAACAAGC
TGGGAATGGAGACTGACGCTCAGGACATGCTAAATGATGGAGCCTCCTTTGAAGCAAAGA
AGCAGAATAGCTGGCGCATTTAG