Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005486Chr141046466610467514+Transcription factor HHO3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005486.m1213264PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain28.31.70E-06
Download   Copy
>LITCHI005486.m1
ATGGACATGGGTTTTGCTCACAAAATGCAGAGATGTCATGAATATGTCGAAGCTTTAGAG
GAAGAAAAGCGGAAGATTCAGGTCTTTCAACGGGAACTTCCTTTGTGTTTAGAGCTTGTC
ACACAAGCTATAGAGACATGCAAGAAGGAGTTATCAGGGACAACGACGGAGTGCGTGCAA
GGACAATCAGAGTGCTCGGAGGAGCAAACATCAAGTGATGCTCCCGTTTTGGAGGAATTT
ATTCCTCTTAAAAGGACTTGTTCTTCTGAGGACAATGATGAGGAACATTCGCATAAGCCC
ACCGCCACCATCAACAGCAACAACTCCAGTGATAAGAAAAAATCTGACTGGCTTAGATCT
GTTCAGTTGTGGAATCAATCCCCAGATCCACCTTCCAAAGAGGATGTGCCTAGAAAAACA
ACAGTGGGGGAGGTGAAGAGAAACGGAGGTGCATTCCAGCCATTTCACAGAGTGAAAAGC
GTGGCCGAAACTGATAATCATCAATTCGTCGCCAAACCCAGTTCGGCTGCAGTGCCAGCG
GCCGCCACTAGTTCTACTACTGAGACCGTCTCTAAAGGCTGCGCTGGTAACAGCAAAAAA
GAAGACAAAGAAGGGCAGTCGGGTCAGAGAAAGCAAAGGCGGTGCTGGTCGCCTGAATTG
CATAGACGCTTTTTACATGCCCTTCAACAACTTGGTGGTTCACATGCTGCTACGCCTAAG
CAAATTAGAGAGCTAATGAAGGTTGATGGGCTCACTAATGATGAAGTCAAGAGCCATTTA
CAGAAATATCGGTTGCATACTAGAAGACCAAGTCCAACAATTCACAATAACACCAACCCA
CAAGCGCCCCAATTCGTGGTGGTCGGAGGGATATGGGTGCCACCGCCTGAATATGCAGCA
GTGAGTGCAAAGGCATCAGGCGAAGCAGCCTCTGTTGGTGGGGCCAACGGAATTTATGCT
CCGCTCGCAGCACCACCACCAACAGCCCCTCATTCACTACCTGCCCTGATGCAAAGATCG
CAATCCGAGCATATGCAATCAGAAGAAGGGGGCAGCCATAGCGAAGGAGGCCGGCATTCA
AGTTCCCCGGCCACATCTTCTTCTACACATACCACCACAACTTCGCCTGCCTTGTAG
Download   Copy
>LITCHI005486.m1
MDMGFAHKMQRCHEYVEALEEEKRKIQVFQRELPLCLELVTQAIETCKKELSGTTTECVQ
GQSECSEEQTSSDAPVLEEFIPLKRTCSSEDNDEEHSHKPTATINSNNSSDKKKSDWLRS
VQLWNQSPDPPSKEDVPRKTTVGEVKRNGGAFQPFHRVKSVAETDNHQFVAKPSSAAVPA
AATSSTTETVSKGCAGNSKKEDKEGQSGQRKQRRCWSPELHRRFLHALQQLGGSHAATPK
QIRELMKVDGLTNDEVKSHLQKYRLHTRRPSPTIHNNTNPQAPQFVVVGGIWVPPPEYAA
VSAKASGEAASVGGANGIYAPLAAPPPTAPHSLPALMQRSQSEHMQSEEGGSHSEGGRHS
SSPATSSSTHTTTTSPAL.
Download   Copy
>LITCHI005486.m1
AAAAAAGTTTTATGGATTGTGTAATGACACGAGATTTCATTTTATCTCGAAAGACAAAAA
TAGAAAACCAAAATCACATAAGCTTAAAATGAAAACATGCTCACACAAGTATAGTTCGCA
AAATAGAAAGAGAGAGAGAGAGTCAGTCATCGATCTTATCTGTAGAAAGGGGAAGAAGCT
GACGTCATTGCCAGCCCACATAGACGCGACGAAAAGGGAATCACACCCTGGAATATTCAA
CTCTATCTCTCTCTTCCCTTATATAAAGTTATAAAATCTCTCTATCTCTCTCTATCTCTC
AACACCGCCTTCTCATCAAAGATTCGTTTTGGTTACGCGACGCCCCGACCTCGATTCTAT
ATTTTTCCTACACCCTCCGATCTTTCCAATCAAACGAACCATTTCTGTGTTTTGTAATTT
CTTTTCTTGATTCCCAAGTTTATTCCGTTTCATGATTCTGGTTGGATCCCTTTATTTCTC
TGTTAAAAACGCTTCTCTTTCCTCTCTTTGTTTGGATCTATCGATGCTTTTTTGGTCCTA
AAACCACCCTTTTTGTTTATCGTCTCCCAAAAACCATTTCTTTATAATCTGGATAGGATA
TTACCAACCTTAACCTGGAGACGATAACATGGACATGGGTTTTGCTCACAAAATGCAGAG
ATGTCATGAATATGTCGAAGCTTTAGAGGAAGAAAAGCGGAAGATTCAGGTCTTTCAACG
GGAACTTCCTTTGTGTTTAGAGCTTGTCACACAAGCTATAGAGACATGCAAGAAGGAGTT
ATCAGGGACAACGACGGAGTGCGTGCAAGGACAATCAGAGTGCTCGGAGGAGCAAACATC
AAGTGATGCTCCCGTTTTGGAGGAATTTATTCCTCTTAAAAGGACTTGTTCTTCTGAGGA
CAATGATGAGGAACATTCGCATAAGCCCACCGCCACCATCAACAGCAACAACTCCAGTGA
TAAGAAAAAATCTGACTGGCTTAGATCTGTTCAGTTGTGGAATCAATCCCCAGATCCACC
TTCCAAAGAGGATGTGCCTAGAAAAACAACAGTGGGGGAGGTGAAGAGAAACGGAGGTGC
ATTCCAGCCATTTCACAGAGTGAAAAGCGTGGCCGAAACTGATAATCATCAATTCGTCGC
CAAACCCAGTTCGGCTGCAGTGCCAGCGGCCGCCACTAGTTCTACTACTGAGACCGTCTC
TAAAGGCTGCGCTGGTAACAGCAAAAAAGAAGACAAAGAAGGGCAGTCGGGTCAGAGAAA
GCAAAGGCGGTGCTGGTCGCCTGAATTGCATAGACGCTTTTTACATGCCCTTCAACAACT
TGGTGGTTCACATGCTGCTACGCCTAAGCAAATTAGAGAGCTAATGAAGGTTGATGGGCT
CACTAATGATGAAGTCAAGAGCCATTTACAGAAATATCGGTTGCATACTAGAAGACCAAG
TCCAACAATTCACAATAACACCAACCCACAAGCGCCCCAATTCGTGGTGGTCGGAGGGAT
ATGGGTGCCACCGCCTGAATATGCAGCAGTGAGTGCAAAGGCATCAGGCGAAGCAGCCTC
TGTTGGTGGGGCCAACGGAATTTATGCTCCGCTCGCAGCACCACCACCAACAGCCCCTCA
TTCACTACCTGCCCTGATGCAAAGATCGCAATCCGAGCATATGCAATCAGAAGAAGGGGG
CAGCCATAGCGAAGGAGGCCGGCATTCAAGTTCCCCGGCCACATCTTCTTCTACACATAC
CACCACAACTTCGCCTGCCTTGTAGTTTCTATAGAGTTGAAAATAATGTAAAATTTTGTA
ACCAAAGCCTTGGTAGAAAGTTTGACATGGTATAGATATATCTTTTCTTCTTGGTGTTCT
TTTTGGAGTGTACAATCTAAAGTTTTGCTGTTGGATACATTGGATAGGAACAGTCAGCCC
TTGTTCAATGAGTATCCTTTTACTACCAGAAACCTGAATACTGAAATAATAAAATGTAAT
TTTGTCAAGCATATGTAGACATCTTATTGTAGTTTGTATCAATTAATATTTTCCCCTAAT
CCTAATATGCTTTTTGAAATTTGATATCATC
Download   Copy
>LITCHI026596.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AGAGAATGAGGATGCACACATAAAATCAATGTTAAATGACATGCATTCAATCTTCTTTTT
TATTTTCGCTTTTTGATCTCTTAGACTGGATTTTAATTGATTTGATGGTAAAGGCGTTTG
ATCTCTATGATATGATATAATAAAATCACTTTTCTTTTGTATAATTCTTTGAAGATCATT
TGTGATTTTCTTATGTTTTCTTCTTTATCTTTTGGTTGAAATTTGATTTAATGATTTTTC
AAAGAATAATATTTAACTTCTCAATTTTTTTTTGTCTAAATTTATATCGAAATAACATAG
CATTTGAATTATCAACAATCTATTAATTATCACATAATCTTATGATTTATAAGATGTTGA
TAACTTACATATCATGTCATTTGAGTAAAAAATTTGGAAAGTCTGACATTATTCTTTTTA
ATTTAAAATAACATTTTCAACATTCAAAATTTTCATGCCTTAACGATTTTTTAAAATAAT
AAATTTAATACCTAAATTTCCCATGTCTTTAATGATTTTTTTAAATGATGCTTTCAATGC
TAGGATACACGTGTTAAAAATGAAATAAGAAATTTTTTATAATTTGATTTTGAGATCACA
TTTAGATTTGATAATAAAGATTTCTTTTGTCTTTAAAATAAAAATAAATAGCTACATATA
TAAACACACTACTTAAAAATATTTTTTTGGCATAATAAAATGTTAAAAATACATTGATGT
TAGATTTTTTTTTTTTTTTGCATTCATTGATGTTAGTTTAAATTTTTATATTATATGAAG
TTATATTTGGGTATCATTGCATAAACATCCTTACTCATTTATTGTTGTTATAGTTACATC
TAGTAGACAATTTTTGAATACGGCTAAATATGTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTATT
ATCATTACTATTTGTAATTCTAATTGATTTCATATGCATATTTGCGTATTTGAAAATTAT
TTCAAAGAAGAACAATGGATATTATCACTCTTTTCAGTAGATTAGAAACTAGCGCTTGAT
TATTTATGCCTACTTGACACGGTGTTTTTGTTTTATTTTTTCAAATCAACTTAATAAGTT
TTTGTGTGATTTTTTTTTTTACCAGTTGAGGACACTTCAAATTTCCTTCATTAGAAGACT
CGGCACCAAAGGTCAGAACAAAAGGAAAATAAATTCCAAAACATGTTAATCATAAAACAA
AAATAAAAAAGAAAAGATAGAATAAATCTAGAAATTATGATTTATTATTATTATTTTTTA
GCGAAAATAGCTTTCCACTCTCACTTGGTTATTTACTTGGTAGAACAATAACATGTAATA
ATCAGACAAGGCCTAGTTCTAGCCACCGGATGACATGAGATCATATATGAATGTTAATTT
AAAACAACTTTTACAATTTAACAAAGAATTCTCTATGTCTCAAGATTTATAGGGATTTGA
CTTCCTATATGGAAAACAAATTACCAAAAAAACTTTACAATTTAATACTCAAAAATCTTG
TTAAAGATTTACTAACAAAAATTTATATAGTATATTTGTAAAGAAATATTTTTAATTTAT
TACATCTTTACCATGAGATTTGCAAGAAGATATATTAACCTTTTGGTTCATGAGAATTCA
TAAAATGCAACCTGGAACAATGATAGCAGCTCGGCCTGCGATTGTCTTCATTGTGCTGGT
GAGTATACTTGTTCATGAAACTCGAATATTGTTTATTATACATATATTTTCTGATACTAT
TGTAACATGACGTAGCATACAAGAACTCTCTTGATGATATAATATACTTGCATGCACTTA
GTTTTTTTTTTTTTTAATTAATAATTTACTTAAACAATTATGTAATGACATTCTTCATCA
TAGAATATAATTTTTCTGCACTCACAACTATACTTGTGTTTGTACTCTTATTTTCTTCAA
AATATCTTCAATGACAGAGCCTCTTTATGTTGCTAATCCCATGCTTGTTAACACCATGGT
GGTATAAGACGGCAAAACGA
Download   Copy
>LITCHI026596.m1 GenomeSequence + 
ATGGAGCAGAAGGTAGACTTGAACTCCCATAGTTTGCGCTCTATGATGATATCTGAAATT
GATATCACAGCTAGGTTACTGCATCCACTGAGCTCGTCTGCAACGGTTTTAGCCAGACTT
ATGAATTCATCTTTAGACAGAAACAAACTTTCCTTCTTCGACATTGAAACTTGGGTTAGT
ACTTAAAAAGATTTAAGTTTGAGTTTATCTTACGTAGAAAGAAAGGTCTAAATTAATAGG
TGTAATGTTAGTTTTTTTTTTTGGTATGAAAAAGTGGTTATCACCCAACTATACTCGTGA
CCATTCCATCTAATGTATTTAATAAAAATTAATTAATTAATTAATTTTCTTTCTTGTAGG
TTGCAGCTTCACTGTTTCAAACACTCTCTACAATTCCTCTCATATCACAAATCTCATTTA
TTGGGTTGGATGGTTTGTTTTTCTCTTACTATATTAACAATAATCAAATCCTAGCAATGT
ACTGTAACTCTTCATTATCAAGTGTTGGTGGTAATAGAAGAAAGCAGACATGGTACACAC
AATCTGTGGATCGCGATACAGGAATTCTTTATGGAGAACCGATGATATCTACTCCTTTGA
ATATAAACTTAACTTTGCTTGAAGAAGTTTTACATAGCACAGATGCAATTGCTTCTAAAG
GGTCTGGCTGGATCCAGACTCGTGAGTCTCTATTTCTCAACACAGCTAATATTAATGGAA
GAGCAGCTGTCTCTATAGGGTGTCCAGTTGAATCAATAACTAACTTCTTCACTAGTATGA
ATTTGAGTCTCCATGGTGCGACTTTGTCCGTGGCTACAATTGATGGGGAAGTGTTGCTTG
AAGGACTTCCAAATGCTCATATGAAGTTCGCCAATAACTTAATTTCCTTCCAATCGAAGA
AGATAGTTGGTCGTAACATGCATACAAGTGACACTACATATATTACATGCGTGTCAGCTG
GTGCTGACTCATATTCTATTCTCAACATAGAGGACATAGAATATATTGTTTATTGTTCAC
CACTTGAACTTGTGGGCATGAAATCGGTAAGCTTAAAATCTATTGTTCTTATATTTACTT
AAAAATTTAAGTTTTTAGTTCTAACATTGACAACATAATCTTTACTAATTTTTCTAATTG
GGTTTTAGGTTTATGCATTGGCGTTGCCGCGCAAAGGAGTGACAAGCTTTGTGCATAGGA
CTAGCAAATTGGCACTCCAGCTCCTAATTCTATTAATGGTCATTGAAGGAATCACTGTGT
TCATCTCTGTACATTTGATGGTTAGATCGGCCAAAAGGGAGGCGCATTTGTGTGCTGCAC
TCATCAAACAAATGGAAACAACGCAACAAGCGGAGAGAAAAAGCATGAACAAGAGTACCG
CCTACGCTAGTGCTAGTCACGATGTTCGTGCCTTTGTAGCAGCCATTACTGGTCTCATTG
AGATTTCCTATCCTGACGCTCCTCCTGGTTCAGAATTGGAGACAAATTTGAGGCAAATGG
AAGGCATTGTAAAGGACCTTATCTGTAAGTTTTAAACTATAAATTTATATGCTATAGTAA
GTTCACTTACCCTTTTTTTTTACCCGTACACAATACTCATTAAATAATTGTGTAGTCCAG
CTTTATTGAATACTGTTCTTGATCAAAGCAAAATCGATGCGGGCAAGATGCAGCTAGAGG
AAGAACCATTTGATCTAGGCCAACTATTGGAGGACGTGGTTGATTCATTTCATGCTCGTG
CTGTGAGTAAAGGAGTAGAAGTGATGTTGGATCTTTTTGACGGCTCAGTTAACAAGTTTT
CACATGTTAAAGGAGATGAAGGAAAACTCAAACAAGTTTTGATCAACTTACTGAGCAATG
CCATTAAATTTACATCTAAAGGCCATGTAACTGTCAGAGCATGGGTTCAGAAGTCTAGTT
TACAAACTTCCATTATCGCTTCGAATCGAGATGGATTTTTACAGCATCTGTCCTGCTTGT
TTTACAAAAACAAGAAAGCAGAAACTGACCTTGCAGCCGTGAATTCCCTTAAAAACAATC
CTAACTGCATGGAATATGTTTTTGAAGTGGATGATACAGGTAAAGGAATCCCCAAGGAGA
AACAAGAATCGGTGTTTGAGAATTACGTGCAGGTCAAAGATGGGGAAGGAGGCACAGGCT
TAGGACTTGGCATTGTTCAATCTCTGGTATACTTATATATACATATATATATATATATAT
ATATTCTTTTAATTTAGCGAATTTACATTAAATAAATCAGTCTTGTGTAAAAGTAAATAA
CAGTTTTTAAATTAAAATGTTCCAACAGGTTCGACTCATGGGTGGTGACATCAAAATTGC
GGATAAACCAATAGGGGAGAAGGGAACATGCTTTAGGTTCAACATTTTCCTGACAGTAGA
AGAAGCCCGGTGTGTTGATAACACAAAAAACAGATAATGAAATGGGACCTGATTCTGCAT
TATACAACAGAGGATTAACTGTTGTGTCTCCCAGGCCTAACCTGACCATGATCAGGACCA
ATAGTCCCAGGCTCACCAGTCTTCTCAGTCCCAAGGTCGAAAGCTCCCTTGTAGTCCTGA
TAGGCAACCAAGAGCGCCGCCGTATTTCCCAGAAGTATCTGGAGCATCTGGGGATCGGGG
CGATGATCGTTGACGGTTCTCAAAGTCTTCAGGCCACACTCAGGAAGATAAAGAACAGGC
TTGGCCATTCTCCTCGTGGCTCCTTGGCGAAATTGGAAATGAGTTTTAGGAGTGACAGTG
CGAGGACGAAAGATGTCCCTTTAAGTGCCATGGAAGGTACCGACCAAAGGGTCCAATCAT
GTCGAAGGAGAGGAGGAGGAGGCCCAAACTTTGTGCTTCTTGTCATTGATGCAACTGCTG
GACCAATTTTAGAGCTTCTAAGGGTTGTCAATGAGTTTAGAAGAGACATTCACGGCCGCT
GCAAGGTGGTTTGGTTGGACAGTCCGACTTCAAGAAGAATCAACGTCAAGGACCCTGAAC
AGGAAGAGATGATTGATCCTAGTGACGAGATTGTAACCAAGCCATTACATGGATCTCGTT
TGACTCAAATTATAAGATATTTGCCTGAATATGGAGGCACTTACTCACCAAATGTTTCCA
CTAGACCAAGAAGAGAAAAAGGTCCCAGCTGCTCCCCTTGTGCTAAGCAATCTCAACGAA
GACAACTGAGTCAACAACAATCAGAGTCACAAGAAGAAGACATTTCTGGGAGTGGGAACT
ACTCTGGGAAGGATGTTTATTCAACTGCTCCAGTCCAGACCCATGGCAGGTCACCTAGCT
GTGGATACAAAACCAGACAGACAGAAATTGAAGAAGTGTTTGATGAACCAAAGGATGAAA
AGCCTTTGACTGGCAAGAGATTCCTGGTGGCCGAGGACAATCATGTGCTGCGCAAAGTGG
CCAGCATCACTCTAACCAACCTTGGTGCAACTGTCCAACTTTGTGAAAATGGAGAGGAAG
CTCTGCTACTGGTCCTCAATCGTCTCAAAGAATATATAAAACATGGTGGTCCTCCCATTA
TGCCCTATGATTACATATTAATGGACTGCGAGGTACGTAACGATTGTAATTTGTTTCCCA
TGTTATGGTTATTGGTTTTGTTCATTATTTTTAACTTGAATTGTGAAATTCATGTGCTTG
ACAGATGCCGATAATGAATGGGTTCGATGCAACGAAGCAGATCAGGGAGGAAGAGAAGTA
TTATGGAGTTCAGATTCCAATTATTGCATTGACTGCTTATGACTCAGGCGAACAAGTAGA
GAATGCCATTTTGGCTGGTATGGATATGCATCTCGCAAAACCCCTGAAGAAGGAGAATCT
ATTGGAGGCCATCAGATACATAGACCGTAAATACAGATATGTTTGAAATTTTTGTATCTC
TTAGATGTATGTAGCCTTTCAAGGTTTTGCATGTAATATAAATTATCCCTTTAGGATTTT
GGTATTAAATGAATGCAATTGTATGCAATATTTTAAAACTGCTTGGTGTTGAAG