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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005476 | Chr14 | 10329271 | 10335319 | + | SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005476.m1 | 59 | 197 | PF02365.18 | NAM | Family | 104.9 | 4.40E-30 |
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>LITCHI005476.m1 ATGGCTGGGCCATCATGGTTGGTGGACAGTAACAGGATTGCAACAAAAATCAGGAGTGCA TCTGGCACTTGTCATCCTGAAAGAGTTGTATGGAAAAGCAATCCAACTAAAGCTTGTCCA AATTGCCGACATGTTATTGACAATAGTGATGTTGCTCAAGAGTGGCCAGGTTTACCCAGA GGTGTAAAATTCGATCCATCTGATCAAGAGATTATATGGCATTTACTTGCAAAAGTAGGT GAGGAGGGCTTCAAACCTCATCCATTTGTTGAAGAGTTCATTCCGAATGTTGATCAAGAT GATGGAATCTGTTACACGCATCCTCAGAATTTGCCAGGTGTCAAGCAAGATGGAAGTTCA TCACACTTTTTTCATAGAGCAATCAAGGCTTACAGTACTGGAACTCGAAAGCGTCGAAAG ATTATTGGGGATGATTTCGGTGATGTCCGCTGGCACAAAACTGGCAAGACAAAACCAGTG ATGTTGGATGGAGTTCAGAAAGGGTGTAAAAAGATTATGGTTCTTTATATGAGCATGGCC AGAGGAGGCAAAGCTGAGAAAACTAATTGGGTGATGCATCAATATCATTTGGGAACTGGT GAGGATGAGAAGGAAGGGGAGTATGTTGTATCGAAAATATTTTATCAGCAGCAACAAGGC AAACTGGGTGATAAAATTGAGCAAGACTTTCCCGAAAGCACTGATGCTGTGATTGCAAAA GTAGATCCAGTCACACCCAAGTCAGTGACTCCTGACCCACCTCGTACTGAAAGACGATCT TCTGACTTGCATCAAGAGTTTAGTAGTACTTGCACAGATCAAGTTACTCAGCATGGTGAG GTGAGGTGTATAGAAGAAGAAGTTCAATTTGAATGTGGAAAGCCTAATTACAATGATCAA CCTGAAGCAGAAAACCATACTAATCAGAGGGTGGATGACAATGATAATCATGCTGAGGAA GATCCTAAATGGTGGGACAGTGAGTCACAGTATCTGTTGGATTCACAACAACTTGTGGAA GGGCTGTCTCTATGTGATGAACTCCTCCAAAGTCAGTCTCCAAATAGGGAGGGGAATATA AATGGAGCTTCTGAGCGAAAAGCCTGTCTTTCTGATTATGCTCAATTAGGACCTGAAGAT TTGAAAAAGGATTTGGAGGAGTGTCAAACTTTGATTCTTGATCCAGCTAACATAGAACTC GATACCCCTCCAGAATTCCGATTGAGCCAGCTTGAATTTGGTTCGCAGGATAGCTTCATT GCCTGGGGTGGAAGTATCAAGTAA
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>LITCHI005476.m1 MAGPSWLVDSNRIATKIRSASGTCHPERVVWKSNPTKACPNCRHVIDNSDVAQEWPGLPR GVKFDPSDQEIIWHLLAKVGEEGFKPHPFVEEFIPNVDQDDGICYTHPQNLPGVKQDGSS SHFFHRAIKAYSTGTRKRRKIIGDDFGDVRWHKTGKTKPVMLDGVQKGCKKIMVLYMSMA RGGKAEKTNWVMHQYHLGTGEDEKEGEYVVSKIFYQQQQGKLGDKIEQDFPESTDAVIAK VDPVTPKSVTPDPPRTERRSSDLHQEFSSTCTDQVTQHGEVRCIEEEVQFECGKPNYNDQ PEAENHTNQRVDDNDNHAEEDPKWWDSESQYLLDSQQLVEGLSLCDELLQSQSPNREGNI NGASERKACLSDYAQLGPEDLKKDLEECQTLILDPANIELDTPPEFRLSQLEFGSQDSFI AWGGSIK.
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>LITCHI005476.m1 AAAAAGACAATTCCGCTCTCTCTGTCATCGTACACGAACTGTGAAGCAATTTCAGCATTC GATTTCAAATTGGAAAAAGCAAAGCATTTAAATAATAGAAAATTTACTTTTTCATAATAT ATATATTAAAAAAGAAGGGGAATCGGTACTATTTAAAAACCTTGTTAGTTGTGTTTTTTA TTTTCTGTTTTTTGTTTTTTTGAAGTAAAACCTAGTTAGTTGTTATTTGCATAATCGAAT ACACGAACAGGAAGCGAAGCAGAGAGTTATTATCGATGGCTGGGCCATCATGGTTGGTGG ACAGTAACAGGATTGCAACAAAAATCAGGAGTGCATCTGGCACTTGTCATCCTGAAAGAG TTGTATGGAAAAGCAATCCAACTAAAGCTTGTCCAAATTGCCGACATGTTATTGACAATA GTGATGTTGCTCAAGAGTGGCCAGGTTTACCCAGAGGTGTAAAATTCGATCCATCTGATC AAGAGATTATATGGCATTTACTTGCAAAAGTAGGTGAGGAGGGCTTCAAACCTCATCCAT TTGTTGAAGAGTTCATTCCGAATGTTGATCAAGATGATGGAATCTGTTACACGCATCCTC AGAATTTGCCAGGTGTCAAGCAAGATGGAAGTTCATCACACTTTTTTCATAGAGCAATCA AGGCTTACAGTACTGGAACTCGAAAGCGTCGAAAGATTATTGGGGATGATTTCGGTGATG TCCGCTGGCACAAAACTGGCAAGACAAAACCAGTGATGTTGGATGGAGTTCAGAAAGGGT GTAAAAAGATTATGGTTCTTTATATGAGCATGGCCAGAGGAGGCAAAGCTGAGAAAACTA ATTGGGTGATGCATCAATATCATTTGGGAACTGGTGAGGATGAGAAGGAAGGGGAGTATG TTGTATCGAAAATATTTTATCAGCAGCAACAAGGCAAACTGGGTGATAAAATTGAGCAAG ACTTTCCCGAAAGCACTGATGCTGTGATTGCAAAAGTAGATCCAGTCACACCCAAGTCAG TGACTCCTGACCCACCTCGTACTGAAAGACGATCTTCTGACTTGCATCAAGAGTTTAGTA GTACTTGCACAGATCAAGTTACTCAGCATGGTGAGGTGAGGTGTATAGAAGAAGAAGTTC AATTTGAATGTGGAAAGCCTAATTACAATGATCAACCTGAAGCAGAAAACCATACTAATC AGAGGGTGGATGACAATGATAATCATGCTGAGGAAGATCCTAAATGGTGGGACAGTGAGT CACAGTATCTGTTGGATTCACAACAACTTGTGGAAGGGCTGTCTCTATGTGATGAACTCC TCCAAAGTCAGTCTCCAAATAGGGAGGGGAATATAAATGGAGCTTCTGAGCGAAAAGCCT GTCTTTCTGATTATGCTCAATTAGGACCTGAAGATTTGAAAAAGGATTTGGAGGAGTGTC AAACTTTGATTCTTGATCCAGCTAACATAGAACTCGATACCCCTCCAGAATTCCGATTGA GCCAGCTTGAATTTGGTTCGCAGGATAGCTTCATTGCCTGGGGTGGAAGTATCAAGTAAG GTGATCGTCTGAGTATGGGTTTTTATTCGCCATTACTGGATAACTTGGTGATATTTTTGT TGTCCCTTCTGTGAGTACTATGCCAGTTAAATTATCCTTGGGTGATCATGAACTGTAATT TTTTGCTAGACACCCAACTATAAGTAATGGCGATGAAGTTATTGTATCTAATATTTTGCT AGAGGAACTACTCTATGATCTCCGCTGTAATTTCTCTTCCACAAAATTAGGCGAGTGATG GTCTTTTGGAGTGATGTTGTATGCCTTATATGTCAAGGAATGTTGTAAATCTGCAAACAA GTCAACCTTTCTGTAAGCTTTGCATGTTTCTGACTGCAACATTTTCATTTCATATGACCT TGCAGTCTGATTTTGCCTGGGTCTGTCGTAAGACTGTCACTGAAATATGAAGTTGCCGCA TAATGTCTTTGGAACTGATCTTTTAGGCCTTGTTTGTTGGCTAGGATGAGACTGGGTTTG GACAAAAAATTTGTCCAAACCCATGTTTGGTCCAATCAAATACATTTCACTAAGTTATCT CAATAGTGATTTTAACCCAATGTCCCATTCTAATGGGTTAATTGAAATTGATTCAACAAG GTGGGTTAATTTTCTCCCACTTTCCTTGTCTGCTCTCTCTCCTCCAGCTACGTCGTCGCC ACTATTTGCTTCTACTGGTCATTCTCTTTCTTCTTCAATGAAATTGTTGTTCTTCCCGTT CTTCAGTCGTCACTTTTTTCTTCAGTCATCTCTTTTATCTCCGTTCTTCTCTTTTTTCTC TCTCTTCCATTGTCGATGATTTTTCAAGTAAGAACTCGTTGATGAGGTAGAGATTTTCGA TGGGTTCTCAGTTGAGTTTTGCGTTGCCTTCATCGTCATTTTAGGGCATCAATGCTTCCA TTATTTTCATCATTCGCCTCGTCTTTGGAAATGACGTGGGTTTTGGATAGGTTAGCGGTC GAGGGGATGATGAGAGAGAGAGAGGAGGGTGGTGGTGTGCAGTTAGAAATGGTGGAGGAA ATGAAGAAATATTTCAAATATCTGAAAGTTTGCATTTAAGTCCTTTGATAAATTTCATTT AAATCCTATCTTATTTTAGTGTCATCTAACTTGAGATAACAATTAAATTCTAATCCAATC TCATTCCATCCAATTCAATCCAATCTCATGCAAATAATCCAATCTTATCCTATGTAACAA ACAAGACCTTAAAGTATTTATCAATCTGGCATATATAGATCAAATAGCTACAACAAAGTA TCTGGATTAACATGTTTTGCCTCTTGAATGTGTGAAACCGGACATTGTGCTCCAGTTCTG GCTAGTCTGGCAACTGTCATTATCTTGGGTTGTTGAGCTTTATAGGTATTGTAGGGCAAG ACTAGCAAGAATGATTGAGGTCTTATAGAAAGAAGTCTGTAGCAGAATGAAACACTGTGT GGACCATCTAACTAGAGACGCAACTCATGCTCTGTTGAAGTCAAAGCAACATATATTGAT GAGTGGAATGCAGAAATGAGAGAATCAGGACATAAATGAATCATGAACCTATATAAGCAT ACAGATCAAACAAGTTGGCAAGAAAATGGCTTGGCAGGGGCTTTGTTGCTTTCTTCATTG ACAGCATGATCGCTTGTGGGGAAGCTAAAGCTATCCTAGACTTCCTAGTAGTCACATGTT GAAGGTTCAGTGCCTGCCCTTGGCTGGCTAAATGGTAGGGTGCTTCCTTTATTTTTTTGA AATGTAAATAGTAAGGTACTTGCTTCCATGTAGAGCACAAAAACTGTCCCAAGTGTTTTC CGGGCTAAAACATGAAAACTGGGCCAGTCTTTGCAAATACAGAGTGGCTCTCTCGCTCTT GACTTCGTGATGGAAGTAAGAGCAGACATACAGAACCAGAACACCCTGGTCAGTTTGGCT ATTTTAATAAAATGCGAGCCAATATTGTTCTGGGATACCATAGAAGCCTTCAAATAATAA ACCTTTTCTTCAACGAGACATTGAATTTGCACCCAAAAACAAAAACAATTATGTTGATGC GATGGTGTCCTATAGTGAATGTTTGGGTGGTGGCTGGTAAAAACCAGCAGACTCTTCAAA ATTTAATTGAATTCAGATTATGAGTCTCCAAACTCCAAATTTGTTGTCATTAGTCTCCCT GAAAGACATTTAGGCTGGCTATAACATTATAACTAAGGTTGGTGGTACACAAGATGGTCG GCTCAAAACAATGCCATATCTAAATCTGTGTCTTGGTATCCCAAATCTCTCACAACCTT
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>LITCHI005476.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGAGAATGGTAGAGAACGAAAGTTGAAAAAAAATTATTATTTTTTTTTTAAAGAAAAAAA GAAGTGCATTAGTGTTATTTCAGGTGCTAATAAAATTCAGTTCTTTAGTGCTAATTAAAC ATGACACCAGTTTTTTTGTACTATTTGACATCATTTACTCTTTATAACAAATTAATGGAA ACTTTGTTTTGATTGCTGCATTTTTTTTTTTTTGGGCCATGAAATATAACAAAAATAATG TAGATTTTTGGGTAATAAAATGAACAAATCTGCTGCATATTTTCTTGGAGGGTTAAAGCA GAATAACTTAAAAATCTTAACTAAAAAAAGTGACTTAAATGTTCTTTCATACATTTTTAC TCAATCTAAAAGTGAAAAAAAAAAAGAAAAGTAAATGTATGGATGGTGTGAAAATAAATG GATGGATATTGAAGTAATTTTTTTTAAAATTAAGAATTTAATTTAATTTAATTTTTTTTT TTGTAAATATTACAAATTTTAGCATTAAAAAATTACAGCAATATCCGTTGCACTTTATAA AACTTACAAAGAACAAACAGCATTTTTTTTTCCCAATCAAGAAGCAACATATCTTAATGC ACTCATGATAATTCATCAAAATTCACTGTTGATTCACAAAATTGAATTTTCATATTATAA TTTCAGTTTTGATTCAAAATATAATATTGGGTTCATAATGAAGTAGTTGAGTCATGAGTG TACTGTATGCATATAATATTGAATGTTGAAAAAAGGTGATTTTGTGATTGTGCAGGTTTG TCTTTTTAAGTAGTCGTGTACATCAATATTTTAGTAATAGGATTTTTATTATGATATGGG TGTGGTGAGAAATATTTTGGTGGCTTTATAATAAACTGAAGTGAAAATCAGTGAGCTGAC TTTTCCATTGTATTCTGAGATGCATTGTTTATAAGTGATTTTTTTGAAAGAAATTTTTGT ACTTTCAATAATTTTAATTAAGAAAGAAATTTAGAGAAACTTTAAGATTTGTTTTTATAG TTTGAATATATATATAAATTTTTATCAAAATACAAATAAATTATGTATTATTATATTAAA ATAAGAATAAGGGCACATGTTAATGTAACTTATTTATTTATATCGTCACAATTTTTGTTT CAATTTTAATTTTATTCTTAGGTGAATTTTAGTAAATAAGAATAAAATTTCAATAAATCC TAATAAACTATAACTATAGCTACCACTTTTTATTTCCAACTTATAATAAATTATAAACCT GGACTTTCTCTTACAACAAATCCTAACTTCTTCAAATATCTTTATTTTTTTCTTTCGTTC ATAGAAGAAAATTTGTTCCATATGCTTCCCAATAAAAGAGGTAAGTTCTCTTTCTTTTTT TAATTAAGATTAATGCCATTAAAACTAATTTATATAAACAAAAGTACTAATATTATCATA AAATTTGATATTCCTATATTGAAAAATGAAAATTGAAAGTTATTAAAGGAAGAGTTTATT TACAAATAATATGAATGCTGACATATTCGCATTCAATTGTATGTGGTCCAATTATAACTT TTGGTGGGTTGAATGTTGTTGGGCCATAAACTTGGGCTTCCAATGCCTAAAGTTTGACCA AAACAAAGCAAATCATCAGCCAAGACGGACCACGTCTAATCCAAGTCAACGACAAAGGAC GACTCAGTTTTTCTATTAACAAACATTTAAAAATAATAATAAACCAAAAAGACAATTCCG CTCTCTCTGTCATCGTACACGAACTGTGAAGCAATTTCAGCATTCGATTTCAAATTGGAA AAAGCAAAGCATTTAAATAATAGAAAATTTACTTTTTCATAATATATATATTAAAAAAGA AGGGGAATCGGTACTATTTAAAAACCTTGTTAGTTGTGTTTTTTATTTTCTGTTTTTTGT TTTTTTGAAGTAAAACCTAGTTAGTTGTTATTTGCATAATCGAATACACGAACAGGAAGC GAAGCAGAGAGTTATTATCG
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>LITCHI005476.m1 GenomeSequence + AAAAAGACAATTCCGCTCTCTCTGTCATCGTACACGAACTGTGAAGCAATTTCAGCATTC GATTTCAAATTGGAAAAAGCAAAGCATTTAAATAATAGAAAATTTACTTTTTCATAATAT ATATATTAAAAAAGAAGGGGAATCGGTACTATTTAAAAACCTTGTTAGTTGTGTTTTTTA TTTTCTGTTTTTTGTTTTTTTGAAGTAAAACCTAGTTAGTTGTTATTTGCATAATCGAAT ACACGAACAGGAAGCGAAGCAGAGAGTTATTATCGATGGCTGGGTAACCACTCTAATCAC ACTCTGTTGTCGGTTTTTTATGTTGTCCTTTTAAGATCTAACCAGCTTTTGTCTTGATTA TTAGTTCAGATTGTGTATCCGATTTGCGCACGTGCTTTCTTTTTTTATTCTCAGTATTTT TTCTGTGCTTGATTGAGCTCTATCATTTTTTCCACTGATAGTTGGGTTTGCTATGTTTTA ATGGAAGTTTGTATGAAGTGTTTGTTATACATTGATTTATGTGAATGTGTTGTTTTAATT GGATGAGGAGTGGATGATGTATTTGATGATTGGACCAAAGTGAAGAGGTTATGGTTTGTT TTCTGAAGTTTTAGACTTTTTCGTTTCCTTGCGGTTTTTAAGTGCGATGTGTGTTTTTTG AGAAGCTCCAAGTAAAAAGGAAAAGGAAAAGAAACAAGAATTTGTATGTGGAGTTGCATG AAAGTGTTGCTTATTTGATAATATTTAATATGTGTAATTTTGTTACATTTCGATTTCTGG GTTCGAATTGTTAGCTAAGTAACGTGAATTTTGTTTATGAAAGATAGAAATTTAAGGAAC TAGTTGCTATTTTATTGTTTTTAAGCTTTAAAGATATGTGGTATGTAGAGGATTGTTGCT 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