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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005414 | Chr14 | 9597230 | 9601116 | - | Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005414.m1 | 32 | 71 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 48.4 | 9.20E-13 |
LITCHI005414.m1 | 122 | 182 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.9 | 1.00E-08 |
LITCHI005414.m1 | 305 | 571 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.3 | 5.70E-43 |
LITCHI005414.m1 | 307 | 573 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 143.7 | 6.50E-42 |
LITCHI005414.m2 | 32 | 71 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 48.7 | 7.30E-13 |
LITCHI005414.m2 | 122 | 182 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.2 | 8.60E-09 |
LITCHI005414.m2 | 305 | 504 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 139.8 | 1.10E-40 |
LITCHI005414.m2 | 307 | 498 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 130 | 9.90E-38 |
LITCHI005414.m3 | 23 | 83 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35 | 9.50E-09 |
LITCHI005414.m3 | 24 | 45 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.9 | 0.14 |
LITCHI005414.m3 | 48 | 69 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.3 | 0.99 |
LITCHI005414.m3 | 206 | 472 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.9 | 3.80E-43 |
LITCHI005414.m3 | 208 | 474 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 144.3 | 4.30E-42 |
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>LITCHI005414.m1 ATGGAAATGATAAGGAAAGATACTCTTCTGTGTTGTTTGGCATTTTTGTGCTTGTGGACT TCTGCATGTGGATTGCTTTCAACCAGTGGTGTCAACTATGAAGTTCAAGCTTTGATGGGC ATTAAGGATTCCCTTGTTGATCCTCATGCTGTTCTAAACAACTGGGATGAAACTTCTGTT GATCCATGCAGTTGGGCTATGATTACTTGTTCTGCTGATGGTCTTGTCATTGGACTAGGT GCTCCAAGCCAGAATTTATCAGGCACTTTGTCACCAAGTATAGGGAACTTGACAAATCTC CAGCTTGTGCTCCTACAAAGTAACAACATATCAGGACATGTTCCTGCTGAGATTGGGAGG CTCCCTAAGCTCCGTACACTTGATCTTTCAAACAACAACTTCAATGGTCCAATTCCCACT ACACTATCTCACATGAAAAGCCTCCAATACCTGAGGCTGAACAATAACAGTCTTACTGGA GAAATCCCTCTATCCTTGACGAACATGTCCCAGCTTGCTTTCCTGGATCTGTCTTTTAAC AATATAAGTGGTCATGTACCCCGCATCCATGCTAAAACATTCAATATTGTAGGAAACCCT CTGATCTGTGCCTCCGGAACTGAGCAAGACTGCTTTGGAACAGCACCAATTCCATTTTCT ATGGCCTTGAATAATTCCCAAAATTCACAACCTTCTGGCAAATCTAAGAGCCATAAACTT GCTCTGGCCCTTGGTTCAAGCCTGGGCTGCATCTGCCTTTTAATTCTTGGCTTTGGATTC CTTCTCTGGTGGAGGCAAAAACATAACCAGCAAATATTCTTTGATGTTAACGAACAACAT CATGAACAAGTTTGCCTTGGAAACTTGAAGAGATTTCACTTCAAAGAGCTTCAGGCTGCT ACCAACAACTTCAGTTCCAAGAACTTGATTGGAAAGGGTGGGTTCGGAAATGTCTACAAA 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>LITCHI005414.m1 MEMIRKDTLLCCLAFLCLWTSACGLLSTSGVNYEVQALMGIKDSLVDPHAVLNNWDETSV DPCSWAMITCSADGLVIGLGAPSQNLSGTLSPSIGNLTNLQLVLLQSNNISGHVPAEIGR LPKLRTLDLSNNNFNGPIPTTLSHMKSLQYLRLNNNSLTGEIPLSLTNMSQLAFLDLSFN NISGHVPRIHAKTFNIVGNPLICASGTEQDCFGTAPIPFSMALNNSQNSQPSGKSKSHKL ALALGSSLGCICLLILGFGFLLWWRQKHNQQIFFDVNEQHHEQVCLGNLKRFHFKELQAA TNNFSSKNLIGKGGFGNVYKGFLRDGTVVAVKRLKDGNAIGGEIQFQTEVEMISLAVHRN LLRLNGFCMTATERLLVYPYMSNGSVASRLKAKPALDWATRKRIALGAARGLLYLHEQCD PKIIHRDVKAANILLDDYCEAVVGDFGLAKLLDHRDSHVTTAVRGTVGHIAPEYLSTGQS SEKTDVFGFGILLLELISGLRALEFGKSANQKGAMLDWVKKIHQEKKLEMLVDKDLKNNY DRIELEEMVQVALLCTQYLPSHRPKMSEVVRMLEGDGLAEKWAASQRAEATRSRANEFSS SERYSDLTDDSSLLVQAMELSGPR. >LITCHI005414.m2 MEMIRKDTLLCCLAFLCLWTSACGLLSTSGVNYEVQALMGIKDSLVDPHAVLNNWDETSV DPCSWAMITCSADGLVIGLGAPSQNLSGTLSPSIGNLTNLQLVLLQSNNISGHVPAEIGR LPKLRTLDLSNNNFNGPIPTTLSHMKSLQYLRLNNNSLTGEIPLSLTNMSQLAFLDLSFN NISGHVPRIHAKTFNIVGNPLICASGTEQDCFGTAPIPFSMALNNSQNSQPSGKSKSHKL ALALGSSLGCICLLILGFGFLLWWRQKHNQQIFFDVNEQHHEQVCLGNLKRFHFKELQAA TNNFSSKNLIGKGGFGNVYKGFLRDGTVVAVKRLKDGNAIGGEIQFQTEVEMISLAVHRN LLRLNGFCMTATERLLVYPYMSNGSVASRLKAKPALDWATRKRIALGAARGLLYLHEQCD PKIIHRDVKAANILLDDYCEAVVGDFGLAKLLDHRDSHVTTAVRGTVGHIAPEYLSTGQS SEKTDVFGFGILLLELISGLRALEFGKSANQKGAMLDWVS. >LITCHI005414.m3 MCFRLLQSNNISGHVPAEIGRLPKLRTLDLSNNNFNGPIPTTLSHMKSLQYLRLNNNSLT GEIPLSLTNMSQLAFLDLSFNNISGHVPRIHAKTFNIVGNPLICASGTEQDCFGTAPIPF SMALNNSQNSQPSGKSKSHKLALALGSSLGCICLLILGFGFLLWWRQKHNQQIFFDVNEQ HHEQVCLGNLKRFHFKELQAATNNFSSKNLIGKGGFGNVYKGFLRDGTVVAVKRLKDGNA IGGEIQFQTEVEMISLAVHRNLLRLNGFCMTATERLLVYPYMSNGSVASRLKAKPALDWA TRKRIALGAARGLLYLHEQCDPKIIHRDVKAANILLDDYCEAVVGDFGLAKLLDHRDSHV TTAVRGTVGHIAPEYLSTGQSSEKTDVFGFGILLLELISGLRALEFGKSANQKGAMLDWV KKIHQEKKLEMLVDKDLKNNYDRIELEEMVQVALLCTQYLPSHRPKMSEVVRMLEGDGLA EKWAASQRAEATRSRANEFSSSERYSDLTDDSSLLVQAMELSGPR.
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>LITCHI005414.m1 GCCAAATTATATATAATATTGCAGTGCATAACAGTTAATACTACACTTGCTTTTATAATA ATTTAAAATGTAACGATAGTATACTATAAAAGAGAGAATTCTCAAGCACCTTTTTTTTTT TTTTTTTTTAATAAACAAATGCATGATTGGAGGAATTTCTTTTCCAATCATCTTTTGATA TTATCTAGATTTGGTTGATGTGGGATTGCTTTTATATATTCTTCTTCCTTACTTTGTTGA ACCAGTGGCAGGCATGTTTAAGTTCTCTTTTAGCCTTTACTAACAAAAACCTCTGGTTTC TTTGGCTCTTGGGTCTGACACAAAGTTGTGTGTGAGAGAGAGTGAATTCCTGGTAAGAGA AGCATGAGGACTTGTACTGGTTGGCTTGTGATGTAAACATTACATACAACAAAACAAACA AAATCTTGTTAACACATTGGTGGTGTTGAATCTTTCATCATACCTCTCCTACCTGCTACT ACTTATTTGCTTTCCTACCTAAAAGGAAACTGATTTTGGTTTCTAGCTAGTTTCCTTGTT TTGAACCTCAACTCAATGGAAATGATAAGGAAAGATACTCTTCTGTGTTGTTTGGCATTT TTGTGCTTGTGGACTTCTGCATGTGGATTGCTTTCAACCAGTGGTGTCAACTATGAAGTT CAAGCTTTGATGGGCATTAAGGATTCCCTTGTTGATCCTCATGCTGTTCTAAACAACTGG GATGAAACTTCTGTTGATCCATGCAGTTGGGCTATGATTACTTGTTCTGCTGATGGTCTT GTCATTGGACTAGGTGCTCCAAGCCAGAATTTATCAGGCACTTTGTCACCAAGTATAGGG AACTTGACAAATCTCCAGCTTGTGCTCCTACAAAGTAACAACATATCAGGACATGTTCCT GCTGAGATTGGGAGGCTCCCTAAGCTCCGTACACTTGATCTTTCAAACAACAACTTCAAT 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