Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005392Chr1493266449330606-Transcription factor bHLH49

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005392.m1370418PF00010.29HLHDomain25.41.10E-05
Download   Copy
>LITCHI005392.m1
ATGGATGTGAGTGACAAGGATAACTTTGAGTTGGGAAATAGGAATGATAATCCTATGAGC
TACCATTCACCTAATATGCCTGCAGACTGGCGATTTAGCAATGCACCGATGAATTTGGTT
CCGACTGATAGTGTGATGGCAGTTGGTTCTTCCTCATGTTCATCTGCTCCAATGGTGGAC
TCGTTTAGCCAAACCATTTGGGACCAAACTACCAATTCACCGAACTTGGGATTTTGTGAT
ATTGACGTGCAGAACAATGCAAGTAGTTCTAATTCATTAAAAATTAGAAAAGGCAGTCCT
GCCTCTTTGAGAAATAGTATTGATAGACCGGTAGATTTGGGATGGAATCCACCTAGTTCA
ATGCTAAAAGGGGGCATTTTCTTACCAAATGTCCCTGGAGCATTCCCACAGAGCTTATCT
CAGTTCCCAGCTGATTCCGGGTTCATTGAGCGAGCAGCGAGGTTTTCATCCTTCAGTGGT
GGGAATTTTAGTGATGTGGTGAACAATTTTGGCATTCCTGATGCAATGGGTCTCTATTCC
AGAGGTGCGGGTATGATGCAAGGGCCACAAGAGGTTTTTGCAGGCTGTGGTGTGAAATCA
ATATCTGGCAGTCAGTCTCAGAAAAATGAGATGAATGTGGGTGAAGCTTCCAAAGATGCT
TCCTTGTCTGTTGAACATCATGGGGCTACTAATGGCAGCCCACTAAAGAACGAGAGGAAA
AGTGAGAGCCTTGTGAGATCTCATGAAGCAAAACAAGGTGTTGGTGGGTCTGGTAATGAG
TCTGATGAAGCGGAGTTCAGTGGTGGTGGTGGTGGTCATGATGAGCCATCTGCATTGGAG
AATACGGGTGGGGAACCTTCTGCTAAGGGCCTCACCTCAAAGAAGAGAAAAAGGAATGTG
CAGGATACTGAGCTTGATCAAGCCAGGGTAGGTCAGTTACCTGGTGAAGCTGCTAAAGAT
GACACTGGAAAGCAACAAAAGGGAGACCAAAACCCAGCTTCAACCACTAATAAGACTTCT
GGGAAACAGGGAAAACAGGGGTCTCAAACTTCAGATCCACCGAAAGAAGACTATATTCAT
GTCAGAGCTCGAAGAGGCCAGGCAACAAATAGCCACAGTCTTGCTGAAAGAGTGAGAAGA
GAAAAGATCAGTGAGAGGATGAAATTCCTTCAAGACCTTGTACCTGGTTGCAGCAAGGTT
ACTGGCAAGGCTGTGATGTTGGATGAAATTATTAACTATGTACAATCGCTGCAACGACAA
GTTGAGTTCTTGTCAATGAAACTTGCAACAGTAAATCCACGGCTGGATTTTAACATAGAG
GGGCTCCTTGCAAAGGATATCCTTCAGTCTCGGGCTGGTCCTTCATCAAATCTGGGGTTT
CCTCCTGATATGCCAATGGCTTACCCTCCATTACATCCATCTCAACAGGGACTGATCCAA
GCTGCTCTTCCCGGCATGGGGAGCCCGTCTGACATACTTAGGAGATCTATCAATTCCCAA
GTGACACCCATGACCGGAGGATTCAAGGGGCCTGGTCAGGTGACCAATTGGGAGGATGAG
CTCCACAATGTTGTCCATATGAGCTATGCAACTAGTGCTCCTCTTGACAGCCAAGACATA
AATGGTATAACTATTTGA
Download   Copy
>LITCHI005392.m1
MDVSDKDNFELGNRNDNPMSYHSPNMPADWRFSNAPMNLVPTDSVMAVGSSSCSSAPMVD
SFSQTIWDQTTNSPNLGFCDIDVQNNASSSNSLKIRKGSPASLRNSIDRPVDLGWNPPSS
MLKGGIFLPNVPGAFPQSLSQFPADSGFIERAARFSSFSGGNFSDVVNNFGIPDAMGLYS
RGAGMMQGPQEVFAGCGVKSISGSQSQKNEMNVGEASKDASLSVEHHGATNGSPLKNERK
SESLVRSHEAKQGVGGSGNESDEAEFSGGGGGHDEPSALENTGGEPSAKGLTSKKRKRNV
QDTELDQARVGQLPGEAAKDDTGKQQKGDQNPASTTNKTSGKQGKQGSQTSDPPKEDYIH
VRARRGQATNSHSLAERVRREKISERMKFLQDLVPGCSKVTGKAVMLDEIINYVQSLQRQ
VEFLSMKLATVNPRLDFNIEGLLAKDILQSRAGPSSNLGFPPDMPMAYPPLHPSQQGLIQ
AALPGMGSPSDILRRSINSQVTPMTGGFKGPGQVTNWEDELHNVVHMSYATSAPLDSQDI
NGITI.
Download   Copy
>LITCHI005392.m1
ATGGATGTGAGTGACAAGGATAACTTTGAGTTGGGAAATAGGAATGATAATCCTATGAGC
TACCATTCACCTAATATGCCTGCAGACTGGCGATTTAGCAATGCACCGATGAATTTGGTT
CCGACTGATAGTGTGATGGCAGTTGGTTCTTCCTCATGTTCATCTGCTCCAATGGTGGAC
TCGTTTAGCCAAACCATTTGGGACCAAACTACCAATTCACCGAACTTGGGATTTTGTGAT
ATTGACGTGCAGAACAATGCAAGTAGTTCTAATTCATTAAAAATTAGAAAAGGCAGTCCT
GCCTCTTTGAGAAATAGTATTGATAGACCGGTAGATTTGGGATGGAATCCACCTAGTTCA
ATGCTAAAAGGGGGCATTTTCTTACCAAATGTCCCTGGAGCATTCCCACAGAGCTTATCT
CAGTTCCCAGCTGATTCCGGGTTCATTGAGCGAGCAGCGAGGTTTTCATCCTTCAGTGGT
GGGAATTTTAGTGATGTGGTGAACAATTTTGGCATTCCTGATGCAATGGGTCTCTATTCC
AGAGGTGCGGGTATGATGCAAGGGCCACAAGAGGTTTTTGCAGGCTGTGGTGTGAAATCA
ATATCTGGCAGTCAGTCTCAGAAAAATGAGATGAATGTGGGTGAAGCTTCCAAAGATGCT
TCCTTGTCTGTTGAACATCATGGGGCTACTAATGGCAGCCCACTAAAGAACGAGAGGAAA
AGTGAGAGCCTTGTGAGATCTCATGAAGCAAAACAAGGTGTTGGTGGGTCTGGTAATGAG
TCTGATGAAGCGGAGTTCAGTGGTGGTGGTGGTGGTCATGATGAGCCATCTGCATTGGAG
AATACGGGTGGGGAACCTTCTGCTAAGGGCCTCACCTCAAAGAAGAGAAAAAGGAATGTG
CAGGATACTGAGCTTGATCAAGCCAGGGTAGGTCAGTTACCTGGTGAAGCTGCTAAAGAT
GACACTGGAAAGCAACAAAAGGGAGACCAAAACCCAGCTTCAACCACTAATAAGACTTCT
GGGAAACAGGGAAAACAGGGGTCTCAAACTTCAGATCCACCGAAAGAAGACTATATTCAT
GTCAGAGCTCGAAGAGGCCAGGCAACAAATAGCCACAGTCTTGCTGAAAGAGTGAGAAGA
GAAAAGATCAGTGAGAGGATGAAATTCCTTCAAGACCTTGTACCTGGTTGCAGCAAGGTT
ACTGGCAAGGCTGTGATGTTGGATGAAATTATTAACTATGTACAATCGCTGCAACGACAA
GTTGAGTTCTTGTCAATGAAACTTGCAACAGTAAATCCACGGCTGGATTTTAACATAGAG
GGGCTCCTTGCAAAGGATATCCTTCAGTCTCGGGCTGGTCCTTCATCAAATCTGGGGTTT
CCTCCTGATATGCCAATGGCTTACCCTCCATTACATCCATCTCAACAGGGACTGATCCAA
GCTGCTCTTCCCGGCATGGGGAGCCCGTCTGACATACTTAGGAGATCTATCAATTCCCAA
GTGACACCCATGACCGGAGGATTCAAGGGGCCTGGTCAGGTGACCAATTGGGAGGATGAG
CTCCACAATGTTGTCCATATGAGCTATGCAACTAGTGCTCCTCTTGACAGCCAAGACATA
AATGGTATAACTATTTGATTTGTGTTTGAATCGTTGCTTTAAGTCTTCTTGAGCTTACTA
GAGAGCTCTGTATACTGCATATCCAGGGCCGGGTCATATGAAAGTTGAACACTGATCATT
CTCTATTGGTTTTTATGCCAACAGCACAATGAAGGTCTCATACATGCTCTACTATCTCGT
GGGGATGGCAAAGTCATTGAAATTATATTGCAAATATAGAAGATGATGTAACATACCCTA
TCACCGGGTTCCTATAACTTTCATCTGTCGATCGATGTGCTACAGACACGGTATCAGAGC
ATGGTGGATCAGTTTCTAATCAGGGACCTTTTACCTCTTGAGGGTCCCCAGGTATAGGAT
GGAGCAGTAACCTTCTTGTTTCTTTATCATTGCAATAGAATATGCCTCAAATGAGAAGAT
GTATGGATGACAGAATGTATAGATTAATATTCTAAGATCTCATGAGATAGGTAGGTAACA
GAAGCTATTCACAAGATAGCAACGGCAAGCCATGGAGTTCTTGTTCTGTTCAGAGTTGGA
ACCTCTATTTGTTAATGAAATATATTGTCAAATGTGGTGTTACTCCCCATTTTGTTCATG
CTATTTTCAAGAATTACATGGTGAACCTGCCTGCCTCCTTTGGAATGAAAAACATATATA
ATGTCTCATATTTGTTGGTCATGCAAGGGATTTTTCATTGGATTCATCCTTGCACCCGGC
AACCCCTCATATCAACCGTGAAATGAAGGGTTCTGTGCCCAAATCAAGTTCCTTCTTAGC
TGGCAAAGTTTATAGTTGCCTAGATGGCATTATTTTAGCTGAAAAATCCGTTGTCAACAT
ATTTTTGGCAGATCTTCCTGAGAACTGCATATTTGTCAGTATTTCTCGAAAGTAATGGTC
CCAATAAAATATAAGTACTGGTGTCTGACAGTTTTAGGACAAGGTCAAATTACCAGTCTG
GATCCTGAGTGAAGTCTGTACATTCCAAAACTATACAACGCACACATCTGCTTTTGTTTT
GTTTTAATTTGTTGTATTTTTTTTTCCCTTATAGCTGATATCTTATTAATCCCATATTAT
ACAAATAAACAATTCTACAATCCTCATAATTGTGATTAAATCTTTCCCTGAGATATTCAT
TTGTTGGAGGGATATTAATTCTTTTTTTTTTTGAAAAAATATGTTGCATCTGAATGAAAG
CTAATCCGATTGTTAACAATATCTAAGTTCATGGTGGATTGATAGTACTAATGATTGAAC
TGCAAGTGGACTAATAAAGCATTTATTTTATCTAAACTCAAAAGCAACCACTAAACTCAA
GTGGAATAATAGAACCCAACTAGATGAACTAGAC
Download   Copy
>LITCHI005287.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AGAAAAATACATGATGTATTTTCATTCTGTAATCAGATATGAACTCTTTGGAGAACTTTC
TGTGGTCTAAAAGCAAATGTTGTCAAGTAAGCTTTCAAGTTGTGATCATGAATGGATTGC
AACTAGTTATTTGAGAAAAAGCATCGATGATAAGCTGCTTTCTTATGAGTGGAAAACTTG
TTCATTTGACGACTCGCATTGTCACAAACAAAAGCATTATGCTTTTAATTTAAAGCATGT
ACGTTGCGTATCTAAAAGTGACAATAATACTTTCAAATGTGGATATAAGTGTTAAAAGTT
TTACTCACTACAAGTACGAGCAAGGTAATAACTATGACCAAAATGGGTTGTGAGTATGGA
TATGGAACATGGTCTCCAATTTATGTGTCGTATACTTCCGAAAAATGCACAGCTTGTGCT
CATTGTATGCATGAATAACTAGTAAAACATAAATTTGGTTGAAATCAAAGAGTAAACTCT
TATTTATGATCTAAAATTAGAGTAACGATTTTTTACTATCATTTTTTTTGCTAATATTTT
TATAATTTAATGATATATCAGTATTTAAAAAAATAGATGATCAAGATTGTTAAATTTTTT
TTTTTTATATATATCACTAAACTTAAATTTCTCTTATAAAAATATTAGCGTCATGTCAAC
ATTGATCTTTAGGTTTAAAATTAACGACTCTATTTAAAATTGATCCAACCTAATAGTTTT
ACTATTGTTGTCAACAAATGACATAGGTGAACAAAGATCTTTTTTTTTTTTAATTATTTC
ATCATTTTTATTAAAATAATAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAAAATTCCTGCTTCTCTAGG
CTTTATCTCCTATCTTTTCCGTCTTCTCCAACCTCCATCTCTAGCGAACTTCCTTGACTA
TACTTTTTCATCAACATTTTTTTTTCCTTTCCGTCTCCTTTCTTCCTCTTCATCTTTCTC
CTTTTCTTTTTCTTTCTTCTATTTTGTCTTCTTTTTTGTCTTCCTTCTTCATTTTTCACC
AAGATGTACCAAGGTAACTTATGTTAGAATTTGTAGATACCTTTTTTTGGCCAAGAAGAA
GGGAAGAGAGGAGGAGGAAGAATTAGAGTTGTCGGAGATGGAGCATCATATCACAATTGT
ACTTTCTTGATAATATAAGAGACCTCAAGGTAATGAGACAAGAAAAAATCATCAAGATGC
CAATAACTGTCATAGTGATAATTCGAGACAAAAGCTGATAGACGCCTTATAGCTATAATA
GGCACATTAAGAATATCAACCAACAGTTCCCAAGCTAATCGTCTAACCAGAAACGAACTT
ATAAGTGTTCCCTCCTAATCGAACAAGATGCAACTATATAAGAAACCAAAATACATATAA
TTTAAACCACCTAATTAGCTAACTTAAAAAAAAAAAGGTTGTAAAACGAAATGCATATAC
TTATTAATCAAAATACATATGCTAGCAATATAAGTTTTACTGTTTTTATATACATACGTA
CACACATATATATACATACATGAATATATATATCCCTGAATTAAATTTAAAAAATGAGGA
GTTTGATTAAAAAATGTGAATTAATCAAAGGTCTAACTTATCATCATGTTATTATTGTAA
ATAAGTGGTTACGAATAATCTCACCGAAGCAATAGAAATTAGACATAAGATAATTCTAAA
TAGAAAAACTTCAATCATTTCAATTTCATTGATTTGAAAGAGGAAAAAAAGGAGGTAATA
TCTAAGATGAACTATTAATATTAATCTGTATTACCCAGGAGTATTATTTTCAAATAATTA
ATAATTGAGAATTAATAGGTTAAGGAACTATACAATATATGGAATACCAAGGACTATTAT
TATTATTTTTTTGACTTATTCATTTAATTAATTTCAAATGAGTCTTGGGCAACAATCCTA
TCCATATTATTAAGAGGTCCTACACATTAATGATGCTTTCGAAATTAATGAGTTAATTAA
TTTATGTAATATATATAACT
Download   Copy
>LITCHI005287.m1 GenomeSequence - 
ATGGGTGCATGTAAAAATATACGTATTTGCCAAATGAGAGAACATTCTAAGTTGTATAAT
TCCATGACCCTTTCGGGCTTGGATCAGTTAGGATAGAACAAAATTAATACTATCAGAAGC
TTAATACCTTTGGGATTGGATTGAAAATAGTATTGATTGTTATTTGAGTTTTTTTTTTCC
ATCTTTTTTAATAATCTTTTTGTAATCTCTAATTGGAATCGAAGGATTGATTCGTGTTTG
TTTGAGACGTGTAGGTAACTTTGAAGGCTATTGCAAACCGAATATGGTGTATTTTTTCAC
TCCAAGTGAAGCGAGGACGGACCACGAAGAGCGGCCACTGGAAGGCATCTGGTGAGGAGG
TGGCGGTGATGCATGAGGACGAGCTCGTTGGATTTGAGAGGCCTTTTGTCTTCTACTCAG
GCGAGAAGAAAACTAACTGGATCCTGCACGAGTACAGAGTCCATCCTGGTTTGATTCCAG
CAAATGCACCAAATATCGTTAGTCACTGAATCATAACACGTGCTTTGAATTTCAAAGATC
ATTTCTACTGTAAATTTTACCTAAATCAAGTCGTGCTTGTTGCAGATAGACAGTTTTGTG
GTATGCAAGATTCAATATCAGGAGCCTGAGAATTCGACCAGCAAAGAAAGCACCTCCTCC
TCCGAAAGCATTTAG