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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005352Chr1489563418962826+Floral homeotic protein APETALA 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005352.m11057PF00319.21SRF-TFDomain89.47.90E-26
LITCHI005352.m187172PF01486.20K-boxFamily103.36.50E-30
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>LITCHI005352.m1
ATGGGGAGAGGTAGGGTTCAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAATCGCCAGGTGACG
TTTTCCAAAAGGAGGGCTGGTTTGTTGAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTGTTGTGTGAT
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TCCAGAAAGAACCAACTGATGTATGAGTCCATCTCTGAGCTTCAAAGAAAGGAAAAGGCA
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ACATGA
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>LITCHI005352.m1
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>LITCHI005352.m1
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GAGAGGCAGCTCGTTGCAACTGATCCTGAATCACAGGTGAACTGGACCATGGAGTATAAC
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TTAGACTCTATGAGTCTAAAAGAGATCCAAAATTTGGAACAGCAGCTTGACACTTCACTT
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TGGTGGAAGTGATATAATTTTCCGTACTAATAAACTTGTACATGGAGG
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>LITCHI005352.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TTTGCATAGGAAGCATTTAAAAAATAGGAGAAACTTAGAATATATATATACACACACACA
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CTTACTAGAGAAGTACTATATAGTATATATAAACTTTTGCTAATTTGAAATTGATGAAGC
ACATAATTAATTCCCACATATTGGACCAAACTTATAAAAGAATTTATTTGAGTCTAGCCA
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GTCTTCTTAGATTTGAATGTCTATCAATCTATATTTATGTCATGTAGGATGCACATTTCA
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GCTCTAATATATATGACAAAATTTCACCTCTTATTGTGGAAATAAATTTTTAGATTACAT
ATAATGTTTAATTTTAATAGGTTTCGGTAGACATCTAATAATTAGTGTAAAGATTTTTTA
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GTTCAAAATTACAATCAAATTATGTGACACATGAATTTTGACAACTATTTGTCAACTAAT
AAATAACATATCACGATTAAAAGTTAAAATATTAATATCATAATGAAAATAATAGTTATA
ATCCATAACATATAGAGTACTACGTATCATAATAAATACAATTTAATTTAAATGTACCAA
AAATGATAAAAGTCAAGTTCAAATAGACAGAAAATTGGAATGCAGGCGTACAGGGTTAAG
TTCATATAGAGTATTTATAAGATTTTCAGTTTCTTTATTCTAATATTTTTAGAATTTGAA
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GGGAAGGAAAAACGTCCGCCGTCGAAAGAAAGAGACTCGAATGGTCCGTGCAATAATCCT
GACAATGATAGCTTTTAGTGGCCGAAATGTAAAATCGTGGTTCCTACAACAGACAGTAAC
GACTGAACAGTAGACACAACCAATGAGAAGTCGACAGCACAATCTTAAAAACCAGCGTGG
TTTTCGTAATCCACCATACTTTCCCCTAAATCTACAATCTACGCATCTCAGCCTATATCT
TCTCTCCTTCATTTTCCATTTCTATATATGTGTGCATGCTTTCTTAGACAGGCTTCACAT
CTTGTAGCAGCAACAACAACAACTACCTCTACAAAATCCGTTTTGATTCTATAAAATAAA
ATAACCTTCTTCAGGTTTTCCATTTGTGGGTGTTGTAGGGTGTTTTTAGGGAAAAAGAAA
AAAGAGAGAGCGAGAGAGAG
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>LITCHI011306.m1 GenomeSequence + 
CTCCCGTGTGTATGGACAAATTATGTTTACTAAGGGTAGTTTTCTCCATAGAATTAGGGG
TCATTCTCTCAATTATTTGGAAGTAGATTATAATAACAGCGATGTGTTTGTTTCATATCA
TCAGTGTCTTATTGTCATAGTGTTTTTGATAGTTATAATTTGTTAAAAAAAAAAAGAGGG
GGGCGGGGCAGAAGGGGAGAATGTGAGGTTCAAGGAAAGGTATGTTACATTGTATGAATG
AAATTGAAATATACCAATTAACACTACACAAGCAAAGCAAGTCAAAGAGGAAAGTGAATT
ATCATCCACAAGCAGCAGCAGCAAGAGCCGCCTTGCCTTCTTCGCTTCCATGGATCCTCA
TCCTCATCCTCCTGCTTACGTTCATCACTCACGGTACGTCCCTATTTCTTCTCCTCCAAA
CCCTAATTTTTATGTCACCACCACCCCTGTTTACCACCACCACAATCAGCATCATCTTCC
ACCCCCACCTCCTCCGCTACCTCCACCCCCACCTCCACCCGCTCCCCCTCCGCCGCAATT
GCATCACCACCCTCTCCCTGCCCCTCCTTCTAAAACTCCCTTCACTCCCCACAATTCTCA
ATTTACCTTCAATCCCAATTTCAATCCTAGCCCTAACCCTAACCCTAAACCCAACAACAA
CAATCCCATTCCCAATCTCCGGATTCCTCTCGAAGCCGGCCCCAATCATTATCATCGCCA
CCGTCTGCTGTGGGACCCACCTCCACCACCACCCAGGATTGTTCCTGAACACCGCCCTCT
ATCCCCTTTTCGCTCGATTGAGGAGCTTAGGCATGATTTGGAGCCCAACTATAGGTTTAG
GGATAGAGAAAGGTACACAAATGATGGCTTTGCTTTTGAACGTCGTACTCAAAACCATCC
TGACATGGGGCCGCCCCGTCGTACTCCTTTGTTATCTGATTCTGGGATGTTGAATTCTGC
TAGTTATAGAGCACCATTTGATGCTGCTGAGTTGATGAGGCTCGATAGGCAGACGATAAG
AGAGAGAGAGCTGATTGAAAGTCAGAAATGTGGTGATGGGGTTAGGGTGTTTTCTGGAAA
GCGTGAGTTTCATCATTGGTATGGTAGCAATAGAGGAAGCAGAGAGAGAGAGAATAGTTA
TGAGTTTAATAGGACCCCACGAAAGCAAATACAAAAGAAGAGTGCACTTTTGAGAATTCA
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TGAGAGGAACTCGGATTCGTATAGGGACAAAGATCGGTTCTTGTATTCAGACCATCGGGT
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TAATTCGTTGGTGGCTAAGGCCATTGTTGCACCATCAAGTTCTTCTGTAGTTTCTGATAC
TAATTTAACACCTAAGAGTGGAAAGATTAGAAAATTTAAGCTGTTTAGTAAAGATTCTTC
AAGTTCACCTATGAATAAACTTAGTGAAAGTAATATGAAGTTGGATAGTTCTGAAGATGT
GAATATTGCCTCTTGTTCTAGTGATAAGGACTTGAAACAAAGTGAAGAGAAAATTTCCCC
TGGTGTTGTTCATGATATGCATGATGATAATTCACAGCCATCTTCCAGTGGGATTAACTA
TCCTATTTCAAATTTTACAGTGGAAAGGTCAAAGCGTAAGGTTTTGGATACAAGAAACAC
TGATATCAGTACTAGCAAAACATTGTTGCCAAGTGTTACAAAGAAGAAAAGAGTTGTAAA
CTTAAAACTCAAACACCCCGATACACATGTTTCCAGCTTGCTGCCGCATGAGAAAGTCAA
TAAGTCTGTGAAAAGAGATGGCTCTACCTTTAATACACCGGCAGCCACTGGGCCAAGAAA
GGGAAAAAAAATTTTGAAAGGAAAAATTACTTCTGCTGGTAGGGCTTCAGTTCGACCGTC
ATGCTCAAATGAAGTAACCATGTCGCTTGAGAATGAGAAATGCAGTGGGTCACCCCATAC
TGCCATGGTATCTGGTGAAGCTAGCACTGATGTTAATTTAGGTAGTTCATGTGTAACTAA
GATTAAGAGAAAGAGGAACAGCTTAATTTCTCCCATGGGTACATCACATCAGAGTGAAAC
AAAATTTGATGAGGGTCCTGAAAATGCTAATAATTGCATCCGTGATTTGCTAACCATATC
AGACGCTGACAAGGATTTGACTAAATCACTGAATGAAATTATTGTTTGTGATACTGGCAG
TGCTGAAGGTGTTAGCAAGCAGTTTTGCCACAATGGAGAATCTTTAATGGTTGAGAATTC
TGCCAAAAAAGAATCTCCTGAAATGTTGCTTTCAGTTGGCAGAGATATTAGTTCTGATTT
GTTAAACTCAGGGGAAAAGAAAAAACATGAGGATCATGTAGATATGTGTAGCTTTGCCCA
TCAAGTTCGTCCTGCTACAAATTTTGATGACGGTTTAGTTTGCTTACAAGGGAAAATTTC
AAACCAGGTCATTTCCTCAGTTGATACAAATATTGTGGAAGGAATTCCGTTGGCTATTCT
TCATGGAAGAACCAGTGAAATATCTGCTTCGCCAAGTTTAGAGGAAATTAGGAATCGCAA
TGTTTCTATACATTCAAACTGCTCCAACCATGACAGGGATTCTGACTATATTTGTAATAA
TTCAGAAGATAATAACCCTGCAACTGGTGATTATGTTGGTAAGCAGCTGTCTCTTGAACA
GATTACTTCATCAGTTGAGAATGATGCAACAGAAGGATTACCAAATACTTGGCATCGAGC
AGGAGGCTGTGAGCAGAATATGCCCAAAATTACAAATAACAGCAAAGTAACGACTCCTCT
ATTTCCGGATGGAACTTTAATGGATCCATACACCAGACCTGTGAATGCAGTTAGCTCAGC
TGAATGTGTTGATACAACTTGTGTGCATACAACTGCAGGTTTATCTGTGAAAGATTTTAA
TTCTGCAAAAGCTATGGTTACTTGTAGTTTGGATATCGGCTTACAACCTACTGCTGACAG
TGTTACTGTTTTTTATGAAAGCTTGACATGTGGACTTTCGGAGGCTAAGCCTTCTGTTAA
CAGCAGTTTCATTGACACTTCACCAGATAAAAGTAAGAGGAGGAAAGTCTCTACTTCCCA
CCCTGGATTCACTAATGCCATGCTATCTGAGATCAGCGAGGGACCTGTAGCAACAGATCT
CTCTGTTTCTGGTGTACAAATGGCCACCAAATTTAATGCGGGCCTAATGCGACCAGAACA
GCATACTGAAGTTTCTATGATGGATACTCTTTGTAATTCTGATTTGCCTCATTGTCTAGA
CAAAACTCAAGTATTGTGTGAAGATAGTTCAGAACAAGTATCTTCTCAGGTTGTGGTTTC
AGTCAATACAGATGCCTTTAGGGATAGGACTGATGGATTGAAAATTGACCAACAAAGGGC
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GCAAACAGCAAATGCTATTCTGGTTTTGGCTGGAACTAATGATAATACTGAAGACATGGA
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TTGCATTGCCTCGCAATTAAAATCTCCTTCACAACTTCCGTCTCTAGACTCAAATGAAAG
ATTGCCTGGTACGTATGTGGATTCCAATGAGTATCTTCTTGAAAAGGATGATTTGCCGTC
CGACTCAGCTTATATGGCTTTGGCTGCTCTTGGTGATGGAGTTTCTACTACTAACTCCAG
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TCTGCCGGTTATGCAGTCATTGACTTGCAAAGCATCATCAAACCAAATTTCTAATGAAGT
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TTCTAAGACTTATCCAAGTCATCAACCTTTTGTTTTTGCTTCTTCAAAGACTACAGGTTC
TTCAACCCATGTCACAAAGCCCCTAACATGGCACCGCTCAGACAAGTCTTCTGCTTCAAC
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GGCTGCTAAGTTTCAGAGTATGTCCTATGTTCGCAAAGGTAACAGCCTTGTTAGAAAACC
TGCTCCAGTTGCGGCTCTTCCCCAAGTGTCTCGTGCTCTACCTTCATCAGTTCATCGGTT
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TATTGAAACTCCAAATATCTTGAGAATGGGTGGTGTTGGTGCTCCTGTTGAGAGGCCCAG
AACACCCCCTTTACCCATTGTTACCAAAGTGAAAAATTGCACTACCAATTCATCAGATTG
TGATTCTTCACTGTTGGCAGAGCCTCTGCCTAAAAGTTGCTCTGTGACCACATCAGATCC
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TGATGGGACTTTGTCAACATCAAATTTGAAGAAGATAACGTATGTGAAGCGAAAATCAAA
TCAGCTGGTTGCAGCTTCAAGTCATTGTGAACTGCCTGTTCAAAATGCTGATAAGAAACA
GGGCTTTTCATCTGATGGCTACTACAAGAGGCGCAAAAATCAGCTAATAAGGTCTTCAGT
GGAAAGTGACATCAACCAGACAGTCGCCTTGCCTGACAATACTTTACTTTCAGAGGGCAA
AACAACTCCCACGGACAGCTTCAGGAGAAATTGTAGTAAGAGGCAATCTTATAAAGGTCA
GAATAAAGTAATTAATTCTTGTAGCATTTGTTGGAAGAGCTATTTAATGATCGGGCATAT
ATTTTTTCTTAGCAATTTATCACACATTTGAATTGAAGGAATTGATGATATTGAACATTT
TATGTTCAGTTGAAACCATCAAATGAGTAGAATGTATCTTGGTGTCAATCAATTTGTCTA
TACTCTTGCATGCAATACATATGTACAAGTATGCACAAATGCATGTGACACAAACACTCA
TGTATGCATTACTAGGAGAAGGTTCAATTTTCACTATTGAGTATTGATTGAAAGGACAAG
AATGTGCACTTAGATGCTCTGTGTTGTTACTTGACTGTAGCATTTGAAATGCTGGCATAT
ATTTTGCACATGGGGATCAGAGTTACTTCTATCAGTTGCATCTTCTGCCTAATTTTAATG
AGTTTGCATTGAAGCACATGTTATTTGCTATTCACTTAATTATTCTTCTCTTCTTTTTGT
AAGGTAAACATCCCTTTTTTTCCCCACAAGTACTTGCAAGCATTAATTAGGCTTAAGTCA
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ATGATAATTTTCTTGATGAAAAAATAGGTACCTGTCATATACATGATCGTGGATAATTTG
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AAATAAATCGTTAAGTAGAATAGGTTATCGAATCAGTTGTCTGGCATTTATTGTTGTACG
GTAAATATAACTTTTATGGCCTTGTGGTTATTATGTCATCTGCACGATTGTGGGAATCAT
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ATCTTCTGGAGTGTAATGCGGAAGCTGTTATGGTGACTAAATTTAATCATTAGCATCCCA
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TTTACTTACTATGCAAGCTAGAAACTACATTGCAGCACTCAGTATATTACATACGTAACT
TTTACTGCCTGTGGCTAGAAAGAGAAATGTCAGGACACCACTGCTACATTTGCATTATCA
GTGTCTAAACAAAAGCTTAAACCGTAATCATTTATTTGCAGTTATGTCAAAGATCAGCAG
ACCTTCAAGATTCTCTCTTGTTTGGACCCAAAGTAATATGCAGCCGAAAAAAATCAATGG
TCATTCATCTAATCGTCCGAAGGTCATGCCATACCTGATTCCTTGGAAAAGAGCTGGTTA
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CAGGTACATTAGTGTGATTTGTTTTCATTGATGCAGCTACTTTTGTTTTTTGGAGAGTTT
TATTCATTGTTTAAGCACATACTATATCATGGTTCTTCAGTCGGAAATTACTACTACTGA
GAAAGAGAGATGCAATTTACACAAGGTCAGGTCATGGGTTTTCACTCCGAAAATCTAAGG
TATTAAGTGTTGGAGGATCTAGTCTAAAATGGTCAAAATCTATTGAAAGGCGCTCAAAGA
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TTTGTGATTAAAATTTCCTTTGGAATTGTTGGTAGATATTATTAATTTTGGTTACTTTTT
TTAGGAAGCTACATTAGCTGTTGCTGCTGTGGGGAGGAAGCAAAGTGAACAAAATGGTAC
CAAATCTATTGCTTCTGAGACAAAGAACAGAAGTCATTCTTCCCGTAAGTCATTAAAATA
GCAGAAGTCTGCCTTGTGGATCAGTGACAAATCCTGTTGTGGCAGTTGCCTTGCAGTTTA
TCATATTATCATGTTTCTGAAGTGCCTGATGTGACTTTTGGTGTGATTTTGACAAGGATG
CTTGGATGATTGTACTCATGTAATGGTGATAACATGGTTTTTACATTGTTAATGTTCTTG
CAGGGGAACGAATATTCCGCATTGGTTCAGATCGCTACAAAATGGATTCTTCAAGACGGA
CCCTTCAGAGGATATCAGGTAGTACCTGAATGATTTCAATCTTGTTTTGCAATCTATTGT
TTCCATTTGAAGTTCATATTTTGTAGAGGTAGAATGCTACCATCAGGTAAGTGAACAACT
CATTGACTGTCCTGTTTTGTTACAGTTTAATTGTGCCAACTACATATTTCTTGCAATTTT
TTTTTTTAATGCATTTCTTCTTACCGAATAACTCGATTGTAAAGTTTGGATACAGAAATG
ATTGAAAGAAGGGTAGGTGTATTCTGTCGGACAACTTTTTTTTCAGTGTTTTTTTGTTTC
CTTTTTCCCCATCCCCAGATTCATGTTGTATGCATCTGGATCATTGGACTTGTTGGAAAT
GTTAGTTTGTTGAGACTAATTTAATAGGATTAAAGTTTTGTGATAGAAGGTCGAATGTCA
CGATAAATCAGTTTCTGCATAAACAATGCATTGGTTTAGACTTCAGTAATACTTTTGTTT
CCTTTAAAAGGGTATATATTGATGTAAAAGGGCCGCAGTTCTCTTATACTTTCTCATCAT
GCTGGCTTGCGTATTTGTAATTTCTTTATGTCGCAATGTCATAATTTTGAATTTGACTCC
ACTTACATGTCCTCGTAGATGATGAATTGTCTCATTCTGCTGCTCTCAACTTGGGGAAAA
ATGCCAAGAGATCTTATATTCCAAGGAGATTAGTTATTGGCAATGATGAGTATGTTTATA
TATCTTTATTAAATCCATTGCTTGTTGACTTCATCGCTATTTTTGAATAATAAGTTTGCA
TATGTATGAAATTCTTGTAGTGATGGATTTGATCATTATTCTGTTAGATTTTGATGTTCT
GCTTATCAATGCTATTCAAGAGATTGACTTGTGATCTGATATTGACAGATATGTGCGAAT
TGGCAATGGAAACCAGCTTGTTAGAGATCCAAAGAAACGGACTCGTGTTTTGGCTATTGA
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TGATCCTTCCAAAATTGCTGTCTGCACAAAATTTCTGAATGGTTTATGTTCCAATTCTGA
CTGCAAATTGACTCATAAGGTTTATTACTTTATCTGGTTGATAGAACTTCATGTGGTCTA
GTCGAGGTGATGACAGGCTTTAACATGTTTTGTCTACATTTTACTTTTGAGTTTATTTCT
CATGCAGGTTATTCCGGAAAGGATGCCAGATTGCTCTTATTTCTTGCAAGGTGTTTATTT
TTTTCTCTTTGATGTGGTCTTGTCCATCCTATTTATGAAAACATGGTATGCTGACACTTA
CTTTCAGGTTTATGCACCAACAAAGGTTGTCCATACAGGCATGTACATGTGAATCCAAAT
TCTTCAACTTGTGAAGGATTTCTCAAGGGCTATTGTGCTGATGGGAACGAGGTAAGATAT
CTCTGTAAGATTAGTACACTTAGGCTTTTACTTATATTTAGTACTCTTATATTTAATGTT
AAAAGAGTGGTTTTTTATATGGTTGATTTGTGCTACGAATTTGGCGTAGTCCTTTACTCC
TCTTCGTCTTTTTAGCAAGGGTTGAGTCCAAAGCATCGATGTATAGCAAAGTAAACCCTT
TTCACTGCATCTATTGCGTGGACTAGCTACTGAATGCCATCTTTTTAACGAAGGACAAAG
ATAGTGGCTCTGACTCTATGGATTAGACTTGAACCAAATTTGAAAAGGAAAGGAAAACAA
AAAGAACAAAAAAATGAAAAAATAATTAAAAAAAAAAAAAGGCCAGTGCCACACCTTGTT
CGAAGTTGTGGGTTGACATAACCTGCAGCAGCTCCTGTCCTTGGATTTTTAGCATTTCTA
TATTCCTGATGTTGAATACTGTTTAATAGTTGATATTTTTTCATCTAGTCTTGATACTTT
CCATGCTTGACCACTCTCTCGCACTCTCCTCTTTCTGAGTAAAACCAAAGGCTATCAGAT
GCCTATGGTGTTGTTTCTCTAAAATTCTCTACACTACACACAAGCCCACAGTGATTTTGA
ATAAGTAAAACAGAATTATATCTCTGCTCTCAGTGTCGGAAGAAGCACAGCTATGTCTGC
CCTATCTTTGAAGCAACAGGGTCATGTCCTCAAGGAACCAAATGCAAGCTTCACCATCCA
AAAGGCCAAAGGAAGGGAAAGAAACGCAAGCAATCAAGGGAACGGAAGAACAGTGGAGGG
CGTTATTTTGGTTCCCTGCATGTGGATGACTCTGACCAACGAACAATGGCATCTGAGAGG
CAATCTGAGCGAGATAATGGTGAAGTCATCTGCGAAGGAAAATATGCTGATTATATTACC
CTTGCTATTAGTGGTGATGAGGCTAGAGAAACTAATGATGCAATGAATGAGCAAACAATC
GTATATGACAGTGATAACTCGGATTTCCAATTGGATGATCTTGATGAGGTTATCAAACCA
ATTCGTATAATGAACTGA