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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005352Chr1489563418962826+Floral homeotic protein APETALA 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005352.m11057PF00319.21SRF-TFDomain89.47.90E-26
LITCHI005352.m187172PF01486.20K-boxFamily103.36.50E-30
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>LITCHI005352.m1
ATGGGGAGAGGTAGGGTTCAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAATCGCCAGGTGACG
TTTTCCAAAAGGAGGGCTGGTTTGTTGAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTGTTGTGTGAT
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GTTGCAACTGATCCTGAATCACAGGTGAACTGGACCATGGAGTATAACAGACTTAAGGCC
AAAATTGAGCTTCTACAAAGAAACCACAGGCACTACTTGGGAGAAGATTTAGACTCTATG
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TCCAGAAAGAACCAACTGATGTATGAGTCCATCTCTGAGCTTCAAAGAAAGGAAAAGGCA
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AGGAACGAGCTTGACCTCACTCTTGAACCCATATATTCGTGCAATCTTGGATGTTTCGCT
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>LITCHI005352.m1
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>LITCHI014657.m1
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TGTGGCTGATCATGTCAATGGAGAGGATGGAGGGTCGACGCTTGAACCATATAGAGGGTT
AGAGTTTGACTCGGCAAACGATGCGCGTGATTTTTATGCTCAGTATGCGATGCGTGTAGG
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AAGGTTTGTGTGTTCGAAGGAGGGATTTCAGCTCAATTCGAGGACTGGTTGTCCGGCTTT
TATAAGGGTGCAGAGACGTGATTCTGGAAAATGGGTTCTTGACCAAATTCAGAAGGAACA
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TGGAGATGGAGAGGAAGGTGTAGGTGAACCTTTTGCTGGACTAGAATTCAGTACAGCAAA
TGAGGCATACCTGTTTTATCAAACTTATGCTGAAAATAAAGGATTTAGGATTCGGATTGG
TCAGTTATTTCGCTCTAAAAATGATGGTTCAATTACGTCCCGGCGATTTGTGTGCTCCAA
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AGAATTTGGAGGTTGGGTAGTGGATCGTCTCATGAAAGATCACAATCATGATCTTGATGC
TCAAATTGGAATCAACAAGAAAGTCTCTATAGCTTCAAAGATATTCATTGATGATGACAC
TGATGGACTGGACTCTGTGGATCTAACTGAAGTAAGTACCGGCCATGTTGTTAAAAGAAC
TAAGGAAAACAACATTGGCAGCGAATGGTATCGTGTGCTTTTCCAGTATTTTCAAACCAA
ACAAGCAGAAGACACTGGTTTCTTTCAATCAGTTGATGTTGATAATGGCAAATGTATGAG
TGTCTTTTGGGCAGATGGCAGGTCTAGATTTCAATGCAGTCAATTTGGTGATTGTATTGT
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CAACCACCACAAAGAACCGGTGCTTTTGGGGTGTGCTTTATTAGCTAATGATTCTAAGGA
ATCTTTCACTTGGTTGTTTCAAACATGGCTTAGAGCAATGTCTGGACATCGTCCAAAGTC
AATAATTGCTGATCAAGACATGGCCATTCGACAGGCAATTGCTCATGCTTTTCCTAGGAC
TCATCATCGTTTTTCTATGTGGCAGATCAAGGCCAAGGAACAAGAGAATTTGAGGTCATT
GCCTAGTGAATTCAGATATGAATATGAGAAGTGTGTCTATCAGAGCCAAACAAATGTTGA
ATTTAATTCCATGTGGAGTGCACTTATCAACAAATATTCCTTGAAGGAGAATGTTTGGCT
GAAAGAAATGTATGAAAAGCGTGAAAGTTGGGTTCCATTGTACTTGCGTGGAACCTTTTT
TGCTGGCATTCCGATAGGCGAAAGCATTGAATCCTTCTTTGGCACAACTTTAACTGCCCA
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AATAGAAGAACAATGCAGAAGGCTTTATACGATTACGATATTCAAAATATTTCAGAATGA
GCTTACGCAGAGTTACAACTATGCTGGAATAAAGACTTATGAAGAAGAGACCATTGTCAG
ATACTTGGTGCGGAAGTGTGGGAATGAGAATGAGAAGCATGCTGTAACCTTCAGTGCTGT
AAGCGTAAGTTGCTCCTGTCAGATGTTCGAATTCGAAGGTGTGCTTTGCAGGCACATCTT
AAAAGTTTTCAACCTGTTGGACATAAAAGAAATTCCATCTCAGTATATCTTACATCGGTG
GACAAGAAATGCTGTGCGTGGTATTGTACGCGATTTAGAATCAGGGGTTAGTTCTCAAGA
ACTCAAGGCGATGATGACTTGGAGTTTGAGAGAAACAGCTTGTAAATACATAGAATCCGG
GACATCGTCATTAGAAAAATACAAACTCGCGTTTGAGATCATGAGAGAAGGTGGGAATAA
ACTTTCTTGGCAAAGCTTGGCTTACCCTATGGAATACACCTCTGAACCTACACATTCTAT
TAACAGCCTTGGAAGCAGGCGCACGATGTTTGGCCATTGGCACTTTTATCTTGAACTGTG
A
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>LITCHI026596.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AGAGAATGAGGATGCACACATAAAATCAATGTTAAATGACATGCATTCAATCTTCTTTTT
TATTTTCGCTTTTTGATCTCTTAGACTGGATTTTAATTGATTTGATGGTAAAGGCGTTTG
ATCTCTATGATATGATATAATAAAATCACTTTTCTTTTGTATAATTCTTTGAAGATCATT
TGTGATTTTCTTATGTTTTCTTCTTTATCTTTTGGTTGAAATTTGATTTAATGATTTTTC
AAAGAATAATATTTAACTTCTCAATTTTTTTTTGTCTAAATTTATATCGAAATAACATAG
CATTTGAATTATCAACAATCTATTAATTATCACATAATCTTATGATTTATAAGATGTTGA
TAACTTACATATCATGTCATTTGAGTAAAAAATTTGGAAAGTCTGACATTATTCTTTTTA
ATTTAAAATAACATTTTCAACATTCAAAATTTTCATGCCTTAACGATTTTTTAAAATAAT
AAATTTAATACCTAAATTTCCCATGTCTTTAATGATTTTTTTAAATGATGCTTTCAATGC
TAGGATACACGTGTTAAAAATGAAATAAGAAATTTTTTATAATTTGATTTTGAGATCACA
TTTAGATTTGATAATAAAGATTTCTTTTGTCTTTAAAATAAAAATAAATAGCTACATATA
TAAACACACTACTTAAAAATATTTTTTTGGCATAATAAAATGTTAAAAATACATTGATGT
TAGATTTTTTTTTTTTTTTGCATTCATTGATGTTAGTTTAAATTTTTATATTATATGAAG
TTATATTTGGGTATCATTGCATAAACATCCTTACTCATTTATTGTTGTTATAGTTACATC
TAGTAGACAATTTTTGAATACGGCTAAATATGTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTATT
ATCATTACTATTTGTAATTCTAATTGATTTCATATGCATATTTGCGTATTTGAAAATTAT
TTCAAAGAAGAACAATGGATATTATCACTCTTTTCAGTAGATTAGAAACTAGCGCTTGAT
TATTTATGCCTACTTGACACGGTGTTTTTGTTTTATTTTTTCAAATCAACTTAATAAGTT
TTTGTGTGATTTTTTTTTTTACCAGTTGAGGACACTTCAAATTTCCTTCATTAGAAGACT
CGGCACCAAAGGTCAGAACAAAAGGAAAATAAATTCCAAAACATGTTAATCATAAAACAA
AAATAAAAAAGAAAAGATAGAATAAATCTAGAAATTATGATTTATTATTATTATTTTTTA
GCGAAAATAGCTTTCCACTCTCACTTGGTTATTTACTTGGTAGAACAATAACATGTAATA
ATCAGACAAGGCCTAGTTCTAGCCACCGGATGACATGAGATCATATATGAATGTTAATTT
AAAACAACTTTTACAATTTAACAAAGAATTCTCTATGTCTCAAGATTTATAGGGATTTGA
CTTCCTATATGGAAAACAAATTACCAAAAAAACTTTACAATTTAATACTCAAAAATCTTG
TTAAAGATTTACTAACAAAAATTTATATAGTATATTTGTAAAGAAATATTTTTAATTTAT
TACATCTTTACCATGAGATTTGCAAGAAGATATATTAACCTTTTGGTTCATGAGAATTCA
TAAAATGCAACCTGGAACAATGATAGCAGCTCGGCCTGCGATTGTCTTCATTGTGCTGGT
GAGTATACTTGTTCATGAAACTCGAATATTGTTTATTATACATATATTTTCTGATACTAT
TGTAACATGACGTAGCATACAAGAACTCTCTTGATGATATAATATACTTGCATGCACTTA
GTTTTTTTTTTTTTTAATTAATAATTTACTTAAACAATTATGTAATGACATTCTTCATCA
TAGAATATAATTTTTCTGCACTCACAACTATACTTGTGTTTGTACTCTTATTTTCTTCAA
AATATCTTCAATGACAGAGCCTCTTTATGTTGCTAATCCCATGCTTGTTAACACCATGGT
GGTATAAGACGGCAAAACGA
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>LITCHI005243.m1 GenomeSequence - 
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CTGAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGCTGTACCTCGCTCTACCCTCGTAATGGATA
ATCACTGGTGCCGTCATTTGAAAAATACAAAAGTCGTCGAGGGCAGAAGAGTCATTTGGC
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ATAAAAAATATTGGGAGAGAAAGCTTTTTTGGTGAAGTGGGGGCGTGGACTTTTCACTGA
ATTTCAGATCCGCTGAACCCGAAAATTTTGAGAAGACAAACGACAAAACCCGTAAAGTGA
AAAAATCACAAGTTAAAAAGACCAGAGAGAGAGAGAGGTCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTG
GTTTGGTTTTGGTTTTGGATTTTGTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTTTTTTTTGATATATTT
TGCAATCTAATGGCCGAAAATGAAGAGCGACCGTCTGCGCCGTCAAAGCCGACAACGGCT
CAGCCGCCTCGGCCGACTATCACGCTCCCGCCACGGGCCGCCTTCGCAGAAGGTCTGTTC
AACAACGGGCCCGGTACGGGTTCGGGTACGGGCCTCGGGATGGGGTTCAGTCCGGGCCCC
ATGACTCTCGTCTCTAGTTTCTTCGCCGACTCCGACGACTGCAAATCCTTTTCTCAGCTT
CTCGCCGGCGCCATGGCTTCTCCGGCCGCCGCCACCGCCGGCCACTTGAGGCCCAACTTC
CTGGAGCAGCATATGGAGAGAAGCTCCGGCGATGACGCCGTCGTCGGCGAGGGGGATTTC
CGGTTCAAGCAGAGCAGACCGGCCGGGTTGGTGATCGCACAGCAACAGCCGATTTTCTCG
GTGCCGCCCGGATTGAGTCCCGCCACCTTGCTCGAGTCACCGAGTCTGGGGATGTTGTCT
CCTGCCCAGGTTGTTATAATTCAATTAGCTTTTGTTTGTTTTGAGTGTTATAGTAAAACT
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GTATGCAATGTTGTGGTGTACAAGTTTCTGTGTGCTCAATGTGATGGTGAATAGGTTGGT
CGTAGTAGAGAAATGATCGGTATACTTTATGGAGCATTTTGATTATGTTGTTTAATATCT
GAAGCAAGAAGTATTTGTTTTTAAATGCCAAGTAAAGCATAATATAGGATATTAATTTAA
TTTTTCGCTAATATTTAAGATTTCTTATGCTAATTTGAAATAGTGGAACGGATTGTATGT
AACTCGTATTCTTTCACTTATTGTAATTTTATAGTATAATGTATCAACGTAATGCAGTCT
AGAATTAATTTAAAAGCCATCGGTGTTACTGGTTTTTGTTATGGAGATCAAGTTGTCTTG
CTTTTTAACTGTTTTTAACACAATTAATTTGAATGGGAACATCTGCTTTGAGCCAAATAG
GTGAGAGTTTGGTTAATTTTCGGTGCAGCTTTTTTGGCTACTGATCAACTAGAGTGAAGA
CTGATGCTTGCAGTGGGTGTATGAATCTCGTATCTTGATGGATATATGTATTGTTTTGTG
TTTTTGTTTCTCATGGGTTTATGTTACTTTTTGGAATTCAGAGCCTATATGTGTGTCTAT
TACTAAATTTTGTTGATTTGTGGAATGCATCTAGGGCCCCTTTGGGATGACACATCAGCA
GGCCCTTGCGCAGGTTACTGCCCAGGCTGCACAAGCACAGTCCCATATACAAATCCAAGC
TGATCACGCGTCTTCGTTTTCATCAGCTCCTGGAACATCTATGGCACAAATGTCGTCCTT
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AAATTCAGACTTCTCTCATTCTAATCAGAGGTCGCAGCCTTCTTCATATGCTGTTGACAA
ACCTGCTGATGATTCCTATAACTGGCGAAAATATGGGCAAAAGCAGGTGAAGGGTAGTGA
ATTTCCTCGTAGTTATTACAAATGCACACATCCTAGTTGTCCTGTCAAGAAAAAGGTCGA
ACGATCTCTAGATGGCCAAGTAACTGAAATTATCTACAAGGGGCAGCATAACCATCAGCC
GCCTACTAATAGACGTGGAAAAGATACTGGGAGCTTAAATGGGAGTTTAAATAATCAGGG
GAGTTCTGAATTAGCTTCCCAATTTCAAAGTGGAAATTTGAACAAATCAAAAGAAGGGCA
TTCAATGTCTAAGAAGGATCAGGAATCTAGCCAGGTTACACCTGAAAATTTATCTGGGAC
TAGTGACAGTGAGGAAGTGGATGATGCCGAAACTGCTATGGATGCAAAAGATGAAGATGA
GCCTGACCCAAAGAGACAGTAAAGTTTTATACAAGAAAATATATCTGTCATACATCAGTG
CTTTTGATCTAATAGTCTGATTCATTTGTCTAATAAAACCTTTCTTAATTGCAGAAGTAC
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TGTGCAGACGACTAGCGAAGTTGATCTTTTGGATGATGGCTACAGGTGGCGCAAGTATGG
GCAGAAAGTTGTAAAAGGCAATCCTTATCCAAGGTTTTATATCGTTTCCATAGTTTATGA
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TAAAAAATCAATTCTCAACATGTCATTCTGGACCTTGTGAAGTGAATAATATATGGCATC
TGTGGCCTTGATTTTGTAATAGATTGTAGATAATGTATTTTTGCCCAATTGGAAAGTGAA
ATAATGCAGTGCCTGTGATCTGATATTGTATTAGATAGTACCAGAAATTCTGCAATTGTT
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TGCTATGCATTATATTGGAAAACCATTGATGTGTTTATCACTTTATGTTGTGCAGGAGCT
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TAACTTTTCAATGGGTTGGGAAAAAGCTGTAAGTCATCTTTCCGTAAATCTGTTTCTCAC
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AAGTCTAAAATGAAGAGAGAAAATCAACTGTTCAACTTAAAACAAAATTGCTTGTATTGA
TTAGAAGTTAATCTCTGTAGTAGTAGATTAGTTTAGTTCGTATATTTGTATTGAAATTCG
GCTCTGTGCATTCTTTTGTACATGGTTATACTTGTTTGTTATAATTGGTGATCAGTGTTG
CATTTGGGGCTTCGTGTTTGATAGCTTTAATGTTAAAG
>LITCHI005243.m2 GenomeSequence - 
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CTGAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGCTGTACCTCGCTCTACCCTCGTAATGGATA
ATCACTGGTGCCGTCATTTGAAAAATACAAAAGTCGTCGAGGGCAGAAGAGTCATTTGGC
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AAAGAAAAAGACAAAACCGAAAACGAAAACGAAAAAATAAAATAAAATAGAAATGAAAGA
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AAAAATCACAAGTTAAAAAGACCAGAGAGAGAGAGAGGTCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTG
GTTTGGTTTTGGTTTTGGATTTTGTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTTTTTTTTGATATATTT
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CAGCCGCCTCGGCCGACTATCACGCTCCCGCCACGGGCCGCCTTCGCAGAAGGTCTGTTC
AACAACGGGCCCGGTACGGGTTCGGGTACGGGCCTCGGGATGGGGTTCAGTCCGGGCCCC
ATGACTCTCGTCTCTAGTTTCTTCGCCGACTCCGACGACTGCAAATCCTTTTCTCAGCTT
CTCGCCGGCGCCATGGCTTCTCCGGCCGCCGCCACCGCCGGCCACTTGAGGCCCAACTTC
CTGGAGCAGCATATGGAGAGAAGCTCCGGCGATGACGCCGTCGTCGGCGAGGGGGATTTC
CGGTTCAAGCAGAGCAGACCGGCCGGGTTGGTGATCGCACAGCAACAGCCGATTTTCTCG
GTGCCGCCCGGATTGAGTCCCGCCACCTTGCTCGAGTCACCGAGTCTGGGGATGTTGTCT
CCTGCCCAGGTTGTTATAATTCAATTAGCTTTTGTTTGTTTTGAGTGTTATAGTAAAACT
GGATTATTTGGTGATTAATTCTAATTTTATATGCTTTGATTAATCTAAAAATTGGAAATT
GTATGCAATGTTGTGGTGTACAAGTTTCTGTGTGCTCAATGTGATGGTGAATAGGTTGGT
CGTAGTAGAGAAATGATCGGTATACTTTATGGAGCATTTTGATTATGTTGTTTAATATCT
GAAGCAAGAAGTATTTGTTTTTAAATGCCAAGTAAAGCATAATATAGGATATTAATTTAA
TTTTTCGCTAATATTTAAGATTTCTTATGCTAATTTGAAATAGTGGAACGGATTGTATGT
AACTCGTATTCTTTCACTTATTGTAATTTTATAGTATAATGTATCAACGTAATGCAGTCT
AGAATTAATTTAAAAGCCATCGGTGTTACTGGTTTTTGTTATGGAGATCAAGTTGTCTTG
CTTTTTAACTGTTTTTAACACAATTAATTTGAATGGGAACATCTGCTTTGAGCCAAATAG
GTGAGAGTTTGGTTAATTTTCGGTGCAGCTTTTTTGGCTACTGATCAACTAGAGTGAAGA
CTGATGCTTGCAGTGGGTGTATGAATCTCGTATCTTGATGGATATATGTATTGTTTTGTG
TTTTTGTTTCTCATGGGTTTATGTTACTTTTTGGAATTCAGAGCCTATATGTGTGTCTAT
TACTAAATTTTGTTGATTTGTGGAATGCATCTAGGGCCCCTTTGGGATGACACATCAGCA
GGCCCTTGCGCAGGTTACTGCCCAGGCTGCACAAGCACAGTCCCATATACAAATCCAAGC
TGATCACGCGTCTTCGTTTTCATCAGCTCCTGGAACATCTATGGCACAAATGTCGTCCTT
TACTACCACACAGCGACAGATGCCACCCTCGGTGTCAGACACCAGATTGGCGATGAAGGA
AAATTCAGACTTCTCTCATTCTAATCAGAGGTCGCAGCCTTCTTCATATGCTGTTGACAA
ACCTGCTGATGATTCCTATAACTGGCGAAAATATGGGCAAAAGCAGGTGAAGGGTAGTGA
ATTTCCTCGTAGTTATTACAAATGCACACATCCTAGTTGTCCTGTCAAGAAAAAGGTCGA
ACGATCTCTAGATGGCCAAGTAACTGAAATTATCTACAAGGGGCAGCATAACCATCAGCC
GCCTACTAATAGACGTGGAAAAGATACTGGGAGCTTAAATGGGAGTTTAAATAATCAGGG
GAGTTCTGAATTAGCTTCCCAATTTCAAAGTGGAAATTTGAACAAATCAAAAGAAGGGCA
TTCAATGTCTAAGAAGGATCAGGAATCTAGCCAGGTTACACCTGAAAATTTATCTGGGAC
TAGTGACAGTGAGGAAGTGGATGATGCCGAAACTGCTATGGATGCAAAAGATGAAGATGA
GCCTGACCCAAAGAGACAGTAAAGTTTTATACAAGAAAATATATCTGTCATACATCAGTG
CTTTTGATCTAATAGTCTGATTCATTTGTCTAATAAAACCTTTCTTAATTGCAGAAGTAC
AGAGGTCAGAGTTTCAGAGCCAGCTTCCTCACATAGGACTGTTACAGAACCTCGAATCAT
TGTGCAGACGACTAGCGAAGTTGATCTTTTGGATGATGGCTACAGGTGGCGCAAGTATGG
GCAGAAAGTTGTAAAAGGCAATCCTTATCCAAGGTTTTATATCGTTTCCATAGTTTATGA
TTAGTATTTCTAATATAGTTGTGCTAATAAGTAGTCTAGTAAAACTTCTTTTAAAACAAT
TAAAAAATCAATTCTCAACATGTCATTCTGGACCTTGTGAAGTGAATAATATATGGCATC
TGTGGCCTTGATTTTGTAATAGATTGTAGATAATGTATTTTTGCCCAATTGGAAAGTGAA
ATAATGCAGTGCCTGTGATCTGATATTGTATTAGATAGTACCAGAAATTCTGCAATTGTT
GATACATATACTGTTGTGAAAGCTTTTGAAGTTCTACCTGAAGAACGGGGTAAAATAAAA
AGAAGAGTAGCTTCCATTCTTATTGGCATGTTGTAACATGGTTTCAAAAATTTCATGACC
CAAAGTATGATTGGCATCATGCATTATTCTCATATTCTGCTATTTGGATCACATATTTGT
TATCCTTGTTGACTCCTAAAGAATATTTATTCAAATGAATATATGAGTGCTCTGTCAGTA
ATCACAACACTACTAAAAGTGAAAATAAGTAGTTATCAGTATCTACAACCCCTTCCTGTA
AAAGGAGCAAGGGCCTTTATGATGGATGACTCTTATTTTTAAGAGTCTCAGTAATTCTTG
AAGAAACTTAACGCTGCTTGTTTTGCAAGTCACCAAAGTCTTGGATTATACTTGTGTAAT
GTTGATGCAAAAGGTGTTTCTATAGATTTTCTGGTGCCTGAAACTTTTATGAAATTTAGG
TGCTATGCATTATATTGGAAAACCATTGATGTGTTTATCACTTTATGTTGTGCAGGAGCT
ACTATAAATGCACAACTCCAGGCTGCAATGTCCGGAAGCACGTTGAGAGGGCATCGTCAG
ACCCTAAGGCTGTCATAACAACATATGAAGGGAAACACAATCATGATGTACCAGCAGCTA
GAACGAGCAGCCACGGCACGGCCAACAGTAATGCATCTCAGATAAAACCACAAAATGCCA
AGACTGATTTTGGGAACAATAATCAACAGCCTATAGCACGTTTACGGTTAAAAGAAGAGC
ACTTGACATAGCTTGCCTGAGTTGCAATATGGATAAGAGGCCAGAGGATTAGTTGGACAT
TAACTTTTCAATGGGTTGGGAAAAAGCTGTAAGTCATCTTTCCGTAAATCTGTTTCTCAC
ACTTGTGGCCGTTGTTTTGTCCATGGCCATCTCCAACAGCTGATATACAAAAGAAAAAAG
AAGTCTAAAATGAAGAGAGAAAATCAACTGTTCAACTTAAAACAAAATTGCTTGTATTGA
TTAGAAGTTAATCTCTGTAGTAGTAGATTAGTTTAGTTCGTATATTTGTATTGAAATTCG
GCTCTGTGCATTCTTTTGTACATGGTTATACTTGTTTGTTATAATTGGTGATCAGTGTTG
CATTTGGGGCTTCGTGTTTGATAGCTTTAATGTTAAAG