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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005348 | Chr14 | 8887270 | 8891729 | - | Squamosa promoter-binding-like protein 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005348.m1 | 180 | 253 | PF03110.17 | SBP | Domain | 109.5 | 8.30E-32 |
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>LITCHI005348.m1 ATGGAGTCTTGGAGCTATGACTCTGAAGGAAGAGGCCTTTTGTTTTCTGGTGAAGTGGAC TTACATGTTGACTCTTTTGCAAGAAATACAAAGACATTGGTGGGCTGGGAAAGTAAACCC TCTTCCAATTTTGATATCAATAGGCTTATTTCAGAAAGAGATACTGATGAGAATATAGAA CTTATGGATCATGGTTATACTGACTTGACAAGAAAACCTGTCCATAGTAAGCCAAGTGCA GCTACACTTAATGGGGAAGTTAGTTGGGATTTTAGTAGAAGGGTAACCAGTCCTAGTTGT TTGGTTACTTCAAATTCATTTTATGGGGACGTGGAATCAGGGTCAAAGATTTCAAGTTCC TGTATGGAGTCTAGTCAGGATTCAACACTCATTGATTTGAAGCTAGGGAGATTCATTGAT TGCAGAGATATACAGAATGGTGAATGTTTTAAGGAAAGATCAATTGTATCTTCTGTGCAT CCGTCACTGACGGCAAAGAGAGCTCGCCCGACAAGTTCATGCTCTCAAACTCCCCATTGC CAAGTTTATGGCTGTAACAAGGATCTTAGCTCCTCTAAGGACTACCACAAAAGGCATAAA GTTTGTGAGGTGCACACAAAGACTCCCAAAGTTATCGTTAACGGCAATGAACAAAGGTTT TGTCAGCAGTGTAGCAGGTTTCATTTACTGGCTGAATTTGATGAAAGTAAGCGCAGTTGT CGCAGGCGCTTGGCTGGACACAATGAGCGCAGAAGAAAACCTCAATTCAATATCCTATCT GGTAAACCACATAAGTTGCTGCAGTCATATCAAGTCAATAGAGATTATATTAATTGCTTA CTGTCTAATATTTATACAGGTTCAGCAGGCACCAAATTTTTGGGGACCTCCTTAGCAAAG GGAGCATCTTTAGTTTTTCCTGACATACTTCCGTCTGGTATTATTTTCCCAGAAATATAT GAACAAGCTTATCCATGTAATGGGAAACGCTCTAGTACTGAAATTCTTTCATCGGCAACT AAAGGCTGCAATTTTTCTGATGCTGTATCAACTGTTCAAGGATCATCTGGTATTTTAAGC TCTAGCTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAGGTCAATCACAGAACTTGTCAAGCCATTCAACA GGAATGCTCATGGCTAAGCCCTTGATCAATCAAGTTAGTTATACTCATCAGCGTCCAGAT CAAATTTTTGATAAAACTGCAGGTGTAATGTCTTTGGAAAAATACACAACAAATGGATTG TATTTATCTGGAATGAACTCCATGGATAATTCTCAGACAGGATCCATTTCTGTTCCTGAT GCTAGTCATGATGTTAACCTGAAAGTTGAAGCAGATGAAATTTGTCAAGAGTCGGATCTC TTGAATGCCAAGTATTCTCGCTCTCCTGAACGTGGATCTACTGTTGATTTGCTCCAATTG TCTTCTCATCTCAGAAGAGTGGAGCAGCAAAGGAATTCCCAGCAATTTAATCAGCAGAAT GAAGATTGCTGTTTCCTGACCTCATAA
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>LITCHI004771.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGAGATATATTATTATAATAATTATTATTATCAATTTATCAACATCATCACTATGGTTG CCCCATCAATAAAGTCAAAAGTTCAAGAATTTCACTCTATTCACTATTTAAATCCAAACA CCTTTTACCTATAATCTGCATTACTTTTTTTTTTGGAAAATTATAATCTACATTACTTAA ACATAAAAACATTTTGTTGTTAAACGAAGATAATTTTTTCTATATGTATACATACATACA TACATATATATATATTCTTTGCATCATTAACGAAGGCGCCATGGTCAAAAATCATCAATT ATAACATATGCTATTTCATTCAAATATTCTTTCACACCCACTTTAAATCTTTAATTAGGT TCATCTTCGATATTTCTAATGGGTAGGTCAGATTCTACTTTCATTTAATTACCGCAAAAC TGATTTTCTCACTTTGAAAAGAGAAAAAAAAAAATACAATACCGACATATTTTAAGATGA TCGCTTCAAAATATTCTTTATATTATAAACAAACTTCTCACTTTTTTTTTATTATATTTT AAGAAATATTACCACAATTTAAATCTCAATATCTTCACAGAAATTGGTATTTACTTTGAA TTTTAAAAAAATGATACCAAACGAAACAAAGATCTACTTAACCTTATTAAAATCAACCAC AACTTACATGACTTAAATATTTACTTCTATAATTAAAAGATAATCAACTCTGATAATAAA ATTAAAATACTCACTTACAAAATATGTATGATGAGTTGACATTTACTGTTATGTCTAAAA ATAGCATTTAGACCGCAAGTCCAATAACGTTCAAAAAAACCAACAAGCCTAAAGCCCAAA ACAAAGAGTGAAGTAGTATAAAACCTATAGACAGACCATCATATGTTACGTCTATGTGCT TTCGACAAGCAGTTTGTATAAGAGAACTCGAGATCGTATTGGTTTGACAGCTTAAGATAC ATCATCGGCCATTTTCTTTTTCTTATGATGCAGAGTCCCAAAAACAAGAAAGTTCCTATA ATGTATAAAAGATCTCTTTAAATAAGAAGTTGTCGGAATTATTTTTTATTTTGAATATGG ATGCACTAATTACAGCTTATATGGAAAAGCAAAGAGAACCTTCGTCAAATAAAAATTTCT TCAACTATGAAATCTCTGAAATTAAAGTTGGATTTAGTATCTAAACATTTAATGCAGTTG GATATAAAACATGAAAGAGAATCTTACTATTTTCTATATTTTAGTTACTAAATCATATAT AAATAAATAACTCTTATGCTATATAAAGCGTATTCTCCACATGTGTCAATCATCCCATCA CATCGCCTCTCAACCTGTAGTAAAAACTCTATTAAGACATATCTAAAAGTTCTCTCATCT CTTTGATTATTTTCTCTTACATTATTATTAATTATTTACTTCTAACATTATTACCACTAT ATTAATTTCATTCAACTCCTTAGATTTCACATGATTCACTGTTTTCACATTAATTCAAAT GTTGAATGTTTTTTGTCGTCAACACTTTCCTTAAAAACTTTTTAATTTTCCTTGCTCACT TCATTTTTTTTTTTAAAACTTCTTTATTTTCTTATTGAAAAACTTCAGAAAAAAACAAAA AAACAAAAATAAAAAGGGGAAGAGAGAGCCGAAAGAGGGTAAAAAGGAGAGAAAGGTGAC ACAGGGACCGTTAACAGCCGGCGCCAATATTCGTTGTTTGGTTCCACTTCTTCTCTTAAA ACCAATGCCAACCCAGTTTTTCCTTTTTTAAACCCTCCTAAAACACTTCTCTTACTCATT TTTTACTCTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TGTATACTTATATTAGTACTAGTAGTGGACCTAGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGCACTT CTTTTCTCTCTTTTGTCTATCTTGCATCTGTTTTACCTCCACCTTCAAGTGAACACTTCT CAACTTATTGTGGTCCTTCT >LITCHI004771.m4 - Up_Stream_Len 2000 TAGTTGCTGGTGGAAGATACCAATTTCTGAATTGATCAATTGTTTTCACCTAAGTGCTTT TTCTTAAGTATTAGCCAGTTGTTGTCGGGAGGCAACTTGTTTATAATCTTCTGTTAAAAT TTAGATGAAAAAAGGGTGATTCCTGCGTTGGGTAAAAACTGTTAACACCTAAATGAATTT CTTCTTGAGTGCCAAAGGCCTAATGTTTGAAGACGAATACTGTTGCACTAAAAAACGGTC GACAACGTGTTTACATATACAAGATAGTAAGAATAATATTGTTTCTTTATTTTCTAACTG AAACTTCTCAAACAGATACGAAGTGCAGTTGAATTGATGATTTATTCAGTATACTCTTAG GAATATACTCAGATAAAATAAATATAGGTATGTCTGTATTACGAGTTCACAGTAAGTATA ATTCTGATGTGAGGTTGCATAAGATGAAAAACTTGGTAATGAACTAGATTCACTGCACCA ATGAATAAGCTTGACCTTAGCCAGATTAACTGAGGTGGAAAATTGCTAACCACTGTATGA GATCCTATCAAAGTGTGACAGTAGCTTAAGCTTGACGTAAGTTCAAGCAAGCCAGAATTG AACCGACCAAATGTTTGCTTTGCATCTCTACAGCTGGCCTGGTGAATGCTCCTTAAAGTG TCTTTCTTCTGGAATCTTTAATTTTATTTTTGTCTGTTCTGATGGGACCGTCAAAGGCCT TCACTGCAGTTAATGAAACCTTAATGTTGACCTTCCATTTCATAATCTATTTATCTCTTA CATCTGGATCTTCTTCTTGAAATAGTTTTGGTATCTCTAATCAGACTGTTGGTGTCCTCA TCTCTTTGTATGTTTATTTGTGAATAACTTGTAATATTTCCTTGATATCTAAAATTGAGA TTACTAATATTTGGCAAAATGTCCATTTAAGTCTTACGGCACTTCAGTCAGTCATTGCTG AAGATATATTTGCATTCATCTCCTATAGTTTTCAGGGATTTAATCTTGTCATAATTCCTT CTTTTTCTGTGGCAAGAAATGAGTTTATTAAAGAATCATAATATCTCCCCTTGCTCAAGA AATGAGTTTAACTAAACATTTAAAGGAAAATTTTATTGGACCAACTGCCTTGCGTTTTGC AATATATGCTCAGCTGTCCTAGCATTGTGACATTTTCTTTCCTGCTTTTGTATGTTGTAG TGACCACATGTGGTTTAGCCAGAGATGCACTGCATTTGCTTCGCGAAAGAAAAGATGGCT ATGACATTGTAATCAGTGATGTCAATATGCCTGACATGGATGGGTTTAAGCTTCTTGAGC ATGTTGGACTTGAGATGGACCTTCCAGTCATCAGTAAGTTGTGTCATTACACATGGACAT TTGTCTTGAATGCCCAAAATTTCTTTAAATCATCTTCTTTTTTTGACATTCAATGAAACC TCTGCTCTTACAAACTATGTAACTCCACAGTGATGTCTGTGGACGGTGAAACTAGTAGAG TGATGAAGGGTGTCCAACACGGTGCATGCGATTATCTTCTTAAGCCTATAAGAATGAAAG AACTCCGGAACATATGGCAACATGTCTTCAGAAAGAGAATACATGAGGTAAAAGACATTG AAAGTCTTGAAGGGTTTGAAAGTCTTCAGATGCCAAGATATGGATCAGATCAGTCTGATG ATGGACACTTGTTTACTGGAGAGGACCTGACGGCACGAAAAAGAAAAGAATGTGACAGTA AACACGACGATAGAGACTGGGGGGATCCTTCTACAACAAAAAAAGCCAGAGTTGTTTGGT CAGTGGATCTCCACCAAAAGTTTGTTAAAGCAGTAAATCAGATTGGATTTGATAGTAAGT GATCCACAAACTTCCATTTTCTAATTATGGTCTTTGTAAATTGGAAAATTTTGGTTAACC TTTTAAAAATTAGTAATATTTTTCAGTTATTTGTTTTTCCAATGATATAGCTGCCATCTT TATCATGCTTCCACAGAGCC >LITCHI004771.m3 - 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Up_Stream_Len 2000 TTGAGATATATTATTATAATAATTATTATTATCAATTTATCAACATCATCACTATGGTTG CCCCATCAATAAAGTCAAAAGTTCAAGAATTTCACTCTATTCACTATTTAAATCCAAACA CCTTTTACCTATAATCTGCATTACTTTTTTTTTTGGAAAATTATAATCTACATTACTTAA ACATAAAAACATTTTGTTGTTAAACGAAGATAATTTTTTCTATATGTATACATACATACA TACATATATATATATTCTTTGCATCATTAACGAAGGCGCCATGGTCAAAAATCATCAATT ATAACATATGCTATTTCATTCAAATATTCTTTCACACCCACTTTAAATCTTTAATTAGGT TCATCTTCGATATTTCTAATGGGTAGGTCAGATTCTACTTTCATTTAATTACCGCAAAAC TGATTTTCTCACTTTGAAAAGAGAAAAAAAAAAATACAATACCGACATATTTTAAGATGA TCGCTTCAAAATATTCTTTATATTATAAACAAACTTCTCACTTTTTTTTTATTATATTTT AAGAAATATTACCACAATTTAAATCTCAATATCTTCACAGAAATTGGTATTTACTTTGAA TTTTAAAAAAATGATACCAAACGAAACAAAGATCTACTTAACCTTATTAAAATCAACCAC AACTTACATGACTTAAATATTTACTTCTATAATTAAAAGATAATCAACTCTGATAATAAA ATTAAAATACTCACTTACAAAATATGTATGATGAGTTGACATTTACTGTTATGTCTAAAA ATAGCATTTAGACCGCAAGTCCAATAACGTTCAAAAAAACCAACAAGCCTAAAGCCCAAA ACAAAGAGTGAAGTAGTATAAAACCTATAGACAGACCATCATATGTTACGTCTATGTGCT TTCGACAAGCAGTTTGTATAAGAGAACTCGAGATCGTATTGGTTTGACAGCTTAAGATAC ATCATCGGCCATTTTCTTTTTCTTATGATGCAGAGTCCCAAAAACAAGAAAGTTCCTATA ATGTATAAAAGATCTCTTTAAATAAGAAGTTGTCGGAATTATTTTTTATTTTGAATATGG ATGCACTAATTACAGCTTATATGGAAAAGCAAAGAGAACCTTCGTCAAATAAAAATTTCT TCAACTATGAAATCTCTGAAATTAAAGTTGGATTTAGTATCTAAACATTTAATGCAGTTG GATATAAAACATGAAAGAGAATCTTACTATTTTCTATATTTTAGTTACTAAATCATATAT AAATAAATAACTCTTATGCTATATAAAGCGTATTCTCCACATGTGTCAATCATCCCATCA CATCGCCTCTCAACCTGTAGTAAAAACTCTATTAAGACATATCTAAAAGTTCTCTCATCT CTTTGATTATTTTCTCTTACATTATTATTAATTATTTACTTCTAACATTATTACCACTAT ATTAATTTCATTCAACTCCTTAGATTTCACATGATTCACTGTTTTCACATTAATTCAAAT GTTGAATGTTTTTTGTCGTCAACACTTTCCTTAAAAACTTTTTAATTTTCCTTGCTCACT TCATTTTTTTTTTTAAAACTTCTTTATTTTCTTATTGAAAAACTTCAGAAAAAAACAAAA AAACAAAAATAAAAAGGGGAAGAGAGAGCCGAAAGAGGGTAAAAAGGAGAGAAAGGTGAC ACAGGGACCGTTAACAGCCGGCGCCAATATTCGTTGTTTGGTTCCACTTCTTCTCTTAAA ACCAATGCCAACCCAGTTTTTCCTTTTTTAAACCCTCCTAAAACACTTCTCTTACTCATT TTTTACTCTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TGTATACTTATATTAGTACTAGTAGTGGACCTAGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGCACTT CTTTTCTCTCTTTTGTCTATCTTGCATCTGTTTTACCTCCACCTTCAAGTGAACACTTCT CAACTTATTGTGGTCCTTCT
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>LITCHI004771.m1 GenomeSequence - GAGCCGAAAGAGGGTAAAAAGGAGAGAAAGGTGACACAGGGACCGTTAACAGCCGGCGCC AATATTCGTTGTTTGGTTCCACTTCTTCTCTTAAAACCAATGCCAACCCAGTTTTTCCTT TTTTAAACCCTCCTAAAACACTTCTCTTACTCATTTTTTACTCTCTTCACAACTCTCTCT CTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATACTTATATTAGTACTAGTAG TGGACCTAGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGCACTTCTTTTCTCTCTTTTGTCTATCTTGC ATCTGTTTTACCTCCACCTTCAAGTGAACACTTCTCAACTTATTGTGGTCCTTCTATGAT GGAGAATGGTTTCTCTTCTCCTAGAAACGACACCTTTCCTGCTGGTCTCCGGGTTCTTGT TGTTGATGATGACCCAACATGGCTCAAAATTCTTGAGAAGATGCTCAAGAAGTGCTCCTA TGAAGGTTAACTCTTCTTCAATCTTTTACTTTGTTACTATTGTTGATGTTTGTTGAAGAT TATGTGATTTACTTTGACCATAATTGATGTCGTGAGAAGGGTGTTTTGTGTTTTTGAAGT TTGATGGCATGTTAAGGCATATATGTTCATTTGGTGTTTTGTTGTTTGATTGTTTGTGTT CTTTAACATATGTTCATTCTTAGGTAATTGATTCTATGTTTATTTCAAAATTTTTGCTTT GCATGTATGTGACTAGGTAATCTTTCTCACATAAGATGAAAGTGACATGAGATGAGTTTG TGCCAAATTTTTTTTCTTTTAATTATTGATGGTGTTTGATGAGAATTTAATCTGATGGGT TCATTCGGAGGCAAAGGGTTCTGTAGATGCATGGATTGTGAGCTTGGTCATCATCTATTG 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