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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005348Chr1488872708891729-Squamosa promoter-binding-like protein 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005348.m1180253PF03110.17SBPDomain109.58.30E-32
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>LITCHI005348.m1
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TTACATGTTGACTCTTTTGCAAGAAATACAAAGACATTGGTGGGCTGGGAAAGTAAACCC
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>LITCHI005348.m1
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AACAACGGGCCCGGTACGGGTTCGGGTACGGGCCTCGGGATGGGGTTCAGTCCGGGCCCC
ATGACTCTCGTCTCTAGTTTCTTCGCCGACTCCGACGACTGCAAATCCTTTTCTCAGCTT
CTCGCCGGCGCCATGGCTTCTCCGGCCGCCGCCACCGCCGGCCACTTGAGGCCCAACTTC
CTGGAGCAGCATATGGAGAGAAGCTCCGGCGATGACGCCGTCGTCGGCGAGGGGGATTTC
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ACTGGGAGCTTAAATGGGAGTTTAAATAATCAGGGGAGTTCTGAATTAGCTTCCCAATTT
CAAAGTGGAAATTTGAACAAATCAAAAGAAGGGCATTCAATGTCTAAGAAGGATCAGGAA
TCTAGCCAGGTTACACCTGAAAATTTATCTGGGACTAGTGACAGTGAGGAAGTGGATGAT
GCCGAAACTGCTATGGATGCAAAAGATGAAGATGAGCCTGACCCAAAGAGACAAAGTACA
GAGGTCAGAGTTTCAGAGCCAGCTTCCTCACATAGGACTGTTACAGAACCTCGAATCATT
GTGCAGACGACTAGCGAAGTTGATCTTTTGGATGATGGCTACAGGTGGCGCAAGTATGGG
CAGAAAGTTGTAAAAGGCAATCCTTATCCAAGGAGCTACTATAAATGCACAACTCCAGGC
TGCAATGTCCGGAAGCACGTTGAGAGGGCATCGTCAGACCCTAAGGCTGTCATAACAACA
TATGAAGGGAAACACAATCATGATGTACCAGCAGCTAGAACGAGCAGCCACGGCACGGCC
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GCAATATGGATAAGAGGCCAGAGGATTAGTTGGACATTAACTTTTCAATGGGTTGGGAAA
AAGCTGTAAGTCATCTTTCCGTAAATCTGTTTCTCACACTTGTGGCCGTTGTTTTGTCCA
TGGCCATCTCCAACAGCTGATATACAAAAGAAAAAAGAAGTCTAAAATGAAGAGAGAAAA
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TAGATTAGTTTAGTTCGTATATTTGTATTGAAATTCGGCTCTGTGCATTCTTTTGTACAT
GGTTATACTTGTTTGTTATAATTGGTGATCAGTGTTGCATTTGGGGCTTCGTGTTTGATA
GCTTTAATGTTAAAG
>LITCHI005243.m2
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CTGAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGCTGTACCTCGCTCTACCCTCGTAATGGATA
ATCACTGGTGCCGTCATTTGAAAAATACAAAAGTCGTCGAGGGCAGAAGAGTCATTTGGC
GTCTAAGACAGGGGCGGTTCAGCCAATCGGATGTGTTTCGTTGTACTTGCTCTAACGTTG
AAAGAAAAAGACAAAACCGAAAACGAAAACGAAAAAATAAAATAAAATAGAAATGAAAGA
ATAAAAAATATTGGGAGAGAAAGCTTTTTTGGTGAAGTGGGGGCGTGGACTTTTCACTGA
ATTTCAGATCCGCTGAACCCGAAAATTTTGAGAAGACAAACGACAAAACCCGTAAAGTGA
AAAAATCACAAGTTAAAAAGACCAGAGAGAGAGAGAGAGCGACCGTCTGCGCCGTCAAAG
CCGACAACGGCTCAGCCGCCTCGGCCGACTATCACGCTCCCGCCACGGGCCGCCTTCGCA
GAAGGTCTGTTCAACAACGGGCCCGGTACGGGTTCGGGTACGGGCCTCGGGATGGGGTTC
AGTCCGGGCCCCATGACTCTCGTCTCTAGTTTCTTCGCCGACTCCGACGACTGCAAATCC
TTTTCTCAGCTTCTCGCCGGCGCCATGGCTTCTCCGGCCGCCGCCACCGCCGGCCACTTG
AGGCCCAACTTCCTGGAGCAGCATATGGAGAGAAGCTCCGGCGATGACGCCGTCGTCGGC
GAGGGGGATTTCCGGTTCAAGCAGAGCAGACCGGCCGGGTTGGTGATCGCACAGCAACAG
CCGATTTTCTCGGTGCCGCCCGGATTGAGTCCCGCCACCTTGCTCGAGTCACCGAGTCTG
GGGATGTTGTCTCCTGCCCAGGGCCCCTTTGGGATGACACATCAGCAGGCCCTTGCGCAG
GTTACTGCCCAGGCTGCACAAGCACAGTCCCATATACAAATCCAAGCTGATCACGCGTCT
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CGACAGATGCCACCCTCGGTGTCAGACACCAGATTGGCGATGAAGGAAAATTCAGACTTC
TCTCATTCTAATCAGAGGTCGCAGCCTTCTTCATATGCTGTTGACAAACCTGCTGATGAT
TCCTATAACTGGCGAAAATATGGGCAAAAGCAGGTGAAGGGTAGTGAATTTCCTCGTAGT
TATTACAAATGCACACATCCTAGTTGTCCTGTCAAGAAAAAGGTCGAACGATCTCTAGAT
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CGTGGAAAAGATACTGGGAGCTTAAATGGGAGTTTAAATAATCAGGGGAGTTCTGAATTA
GCTTCCCAATTTCAAAGTGGAAATTTGAACAAATCAAAAGAAGGGCATTCAATGTCTAAG
AAGGATCAGGAATCTAGCCAGGTTACACCTGAAAATTTATCTGGGACTAGTGACAGTGAG
GAAGTGGATGATGCCGAAACTGCTATGGATGCAAAAGATGAAGATGAGCCTGACCCAAAG
AGACAAAGTACAGAGGTCAGAGTTTCAGAGCCAGCTTCCTCACATAGGACTGTTACAGAA
CCTCGAATCATTGTGCAGACGACTAGCGAAGTTGATCTTTTGGATGATGGCTACAGGTGG
CGCAAGTATGGGCAGAAAGTTGTAAAAGGCAATCCTTATCCAAGGAGCTACTATAAATGC
ACAACTCCAGGCTGCAATGTCCGGAAGCACGTTGAGAGGGCATCGTCAGACCCTAAGGCT
GTCATAACAACATATGAAGGGAAACACAATCATGATGTACCAGCAGCTAGAACGAGCAGC
CACGGCACGGCCAACAGTAATGCATCTCAGATAAAACCACAAAATGCCAAGACTGATTTT
GGGAACAATAATCAACAGCCTATAGCACGTTTACGGTTAAAAGAAGAGCACTTGACATAG
CTTGCCTGAGTTGCAATATGGATAAGAGGCCAGAGGATTAGTTGGACATTAACTTTTCAA
TGGGTTGGGAAAAAGCTGTAAGTCATCTTTCCGTAAATCTGTTTCTCACACTTGTGGCCG
TTGTTTTGTCCATGGCCATCTCCAACAGCTGATATACAAAAGAAAAAAGAAGTCTAAAAT
GAAGAGAGAAAATCAACTGTTCAACTTAAAACAAAATTGCTTGTATTGATTAGAAGTTAA
TCTCTGTAGTAGTAGATTAGTTTAGTTCGTATATTTGTATTGAAATTCGGCTCTGTGCAT
TCTTTTGTACATGGTTATACTTGTTTGTTATAATTGGTGATCAGTGTTGCATTTGGGGCT
TCGTGTTTGATAGCTTTAATGTTAAAG
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>LITCHI005243.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TTAAAGTTTGTATAATTTGATTTTTCATTTTATTATGAAAGTAAATATCTCTCATTTATA
AGAGCAAAATATCTAGATTATACACGTAATGTTTAATTTTGATTGAATTTGACATTTCTT
TTAGCTCTTTTAATGGCAACATTTTTCGAAGTGAAAATTGATTACGGGTGGGGAGGCGGC
TAGACATGCTATCCTTATATCAAACGAATTTGTGGTTTGACAAATGCTCCAAGTATTTAG
CTACATGTAACTTTACCGCTCCATCACTCAACCTTGATTATTTTCTAACCTAAATACCAA
GGTAGCTCTTCTTCTTCTTCTCTTTAATTCCCTTTTTGTTGGGTAACAATTAAATTCAAA
GTATAATTAAATTTGTAGACAAAAGATTAATTACAAAGATAAGAGTCTTGACTAATGATT
ATAACCCAACTGCAAGCACAAAGTGGGAGGACTTGGCGAGTAGCGAGCACCAGCACGAAG
AAAATGTGACATATATATATTGTATAGCAATATTTTATTAATATTCCCTTGCAAATGTGA
CCCTACGTGCTTTGCACTCTCATGGTCATGATACGTAGTTGGCATCAATTGACAACCACT
ATCAATAATGGCTCTGCCAACTTGCCTGTTGTGTCTCAGTTTCTCTACTGTACTGTACCC
CAGTAAATCAAATAACAAGCAGGGAACCTATGACTCAATTATATCTTTAGTTAATTAATT
TTACAGACAAATCTCAGTTACCGAATTTGACAGTACGTACTGGCTCCAAACAATGCACCT
AGGAAATTCCATATAAGTGTTTTTGCCAAAATATAAGAAAATTAACATAGAAAAGTGATA
TGTATTGCTCTATGAATCAGGGAGATGTTACATGTGTGCACGTCTTCAACTTGACCAATT
GTGTGGTTTATATTAAGTTTCAAGTTACATGTCAACAACCAACGCTTGCCGTTTTCTTTA
CACCAAAATGACATCACCATCTAAAATTTTAATGTCACTTGTTTTTATATATATATATAT
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ACCAAAAGGTTAGACATTTTGTACTTAAAAAAAAGGGGTTTGTAGAGATTCTCAGAGCAT
AGGGAAAAAATATTTGCAGGGATCCTTTTATGCAAGTCTGGCTGTACATTAGAAGATTGA
AAACCCATGTTCCTTTCCTCTTCACCGTTATTTTTACTGTTTTTGAAAACAAATAAAAAG
GCAACTCACAAAACACCATCATAAATGAGGATAAAACACAGATTAAAATGCTTGCCACTA
GTGGGTCAGTTTCATCAAATCATATGCTGCCACGTGAGTTGATGTGCCAGTAAATATAAA
TACAGAACCCAGTTTAACTAAACAAACATGTGAAGGATTTATTGCTGCGGAAATCAAACC
ATGGGTAAAAACTGAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGCTGTACCTCGCTCTACCCT
CGTAATGGATAATCACTGGTGCCGTCATTTGAAAAATACAAAAGTCGTCGAGGGCAGAAG
AGTCATTTGGCGTCTAAGACAGGGGCGGTTCAGCCAATCGGATGTGTTTCGTTGTACTTG
CTCTAACGTTGAAAGAAAAAGACAAAACCGAAAACGAAAACGAAAAAATAAAATAAAATA
GAAATGAAAGAATAAAAAATATTGGGAGAGAAAGCTTTTTTGGTGAAGTGGGGGCGTGGA
CTTTTCACTGAATTTCAGATCCGCTGAACCCGAAAATTTTGAGAAGACAAACGACAAAAC
CCGTAAAGTGAAAAAATCACAAGTTAAAAAGACCAGAGAGAGAGAGAGGTCTGGTTTTTT
TTTTTTTTTTGGTTTGGTTTTGGTTTTGGATTTTGTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTTTTTT
TTGATATATTTTGCAATCTA
>LITCHI005243.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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GTGAAAATTGATTACGGGTGGGGAGGCGGCTAGACATGCTATCCTTATATCAAACGAATT
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TATTTTATTAATATTCCCTTGCAAATGTGACCCTACGTGCTTTGCACTCTCATGGTCATG
ATACGTAGTTGGCATCAATTGACAACCACTATCAATAATGGCTCTGCCAACTTGCCTGTT
GTGTCTCAGTTTCTCTACTGTACTGTACCCCAGTAAATCAAATAACAAGCAGGGAACCTA
TGACTCAATTATATCTTTAGTTAATTAATTTTACAGACAAATCTCAGTTACCGAATTTGA
CAGTACGTACTGGCTCCAAACAATGCACCTAGGAAATTCCATATAAGTGTTTTTGCCAAA
ATATAAGAAAATTAACATAGAAAAGTGATATGTATTGCTCTATGAATCAGGGAGATGTTA
CATGTGTGCACGTCTTCAACTTGACCAATTGTGTGGTTTATATTAAGTTTCAAGTTACAT
GTCAACAACCAACGCTTGCCGTTTTCTTTACACCAAAATGACATCACCATCTAAAATTTT
AATGTCACTTGTTTTTATATATATATATATAATTTTTTAATAATATAAAATTGAAAAAGT
AAAATGTTTTCACATAACAATGCAAAAGTCACCAAAAGGTTAGACATTTTGTACTTAAAA
AAAAGGGGTTTGTAGAGATTCTCAGAGCATAGGGAAAAAATATTTGCAGGGATCCTTTTA
TGCAAGTCTGGCTGTACATTAGAAGATTGAAAACCCATGTTCCTTTCCTCTTCACCGTTA
TTTTTACTGTTTTTGAAAACAAATAAAAAGGCAACTCACAAAACACCATCATAAATGAGG
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GACCAGAGAGAGAGAGAGGTCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTGGTTTTGGTTTTGGA
TTTTGTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTTTTTTTTGATATATTTTGCAATCTAATGGCCGAAA
ATGAAGAGCGACCGTCTGCGCCGTCAAAGCCGACAACGGCTCAGCCGCCTCGGCCGACTA
TCACGCTCCCGCCACGGGCCGCCTTCGCAGAAGGTCTGTTCAACAACGGGCCCGGTACGG
GTTCGGGTACGGGCCTCGGG
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>LITCHI024709.m1 GenomeSequence - 
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CAAATCCCTCCAATGAACTCCACTGTGTTTTACTTCCCACAAGGCCACGCAGAGCACTGT
TTTGGCTCTGTGAATTTCCCTTCTTCAACAACACCAATCCCACCTCTCATTCTCTGCCGT
GTCACCTGTCTCAAGTTCCTTGCAGATTCCGAAACCGATGAAGTGTATGCAAAGATAAGG
CTGGTTCCATTACCAGCCACTAGTGATGTTGATTTTGAAGAGAGCACCAATAGCATGAGT
CTGAATTCTGATACTGATTCAGAGAAACCAGCCTCTTTTGCTAAGACTTTAACCCAATCT
GATGCCAATAATGGGGGTGGCTTCTCTGTGCCTAGATACTGTGCTGAGACTATATTTCCA
AGGTTGGATTACACTGCTGATCCTCCTGTGCAGACTGTGGTGGCTAAAGATGTTCATGGC
GAGATTTGGAAGTTTAGGCACATTTATAGAGGCACCCCTAGAAGGCACTTGTTGACTACT
GGGTGGAGTACTTTTGTTAATCAAAAGAAACTTGTTGCTGGGGATTCAATTGTGTTCTTG
AGAGCCCAAAACGGGGATCTTTGTGTTGGGATAAGGAGGGCTAAGAAGGGAATTGACTCT
CCTTCATCGGGTTGGAATTCGAATAGTGGAAGTGGTGTTGGTGTTAGTCCTTATGGAGGG
TTTTCGTGTTTCTTGAGAGAAGAAGAGAACAAGATGATGAGAAATGGAGCTATGAGTTTA
AATTCCAATGGAAGTTGCAATTCTAGTGGGAATTTGAGGGGGAGTGGAGGAGGAAGCAAA
GTGAAGCCTGATGCAGTCGTGGAGGCAGTGGCGCTTGCAGTTGGTGGGCAGCCATTTGAG
GTTGTTTATTATCCCCGTGCAAGCACACCGGAGTTCTGCGTCAAGGCATCTGCTGTGAGG
GCGGCAATGAGGGTTCATTGGTGTTCTGGACTGAGATTCAAGATGGCTTTCGAAACGGAG
GATTCTTCTAGGATAAGTTGGTTCATGGGGACTATATCATCTGTGCAGGTTGCTGATCCC
ATCCGCTGGCCTAATTCCCCTTGGCGGCTCCTCCAGGTATGGTTTCTTTTATCTGATAAA
TATTTCTTTGTATAACATGTTGGATTGTTAAATGTTTTGAAATTAGCATCCAATTTACTG
ATCCATATTAAGTTTGTGAATGTCTTTGTTGGGTTAATAATTGAAATTGATTAATTTAAC
TATATGATCCATGTCATTCACTTGTGTAAGCCCCTGATTTGGGATGTTTTAGATGAAGTA
ATCTGTCAAGTGAAGTGATACATATGATCCATAATATACCATTTCATTGATTTTTCCATT
TATGTATATGCATATACATAATTAGTTGCCATTTTTTTCTTCAGAGTTAAATTCCTGAAA
CTTACCTTGTATGCCAATTCCACTCCTTAAATGCTATGGCATTAAAGCAGGCTTATGACA
TGACTCTTGTGGAATTCAGTAGCGCTATCAATTTCACTGAGGTTCATGACAGTATTACAG
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CTAAGTGTTAGGTTATGTCTGGTGTACCTGTGTGTTCCAGCCAAAAGGCATATCATCCTC
ATCTCAACTGACAAGAACCACATGCATAGCATTCTACCTTGAGAGTTTTGTTAGGGCATC
TTTGTGGTCAATAAATGTGTTGATTTGGAGACTGAATATACATCAAATGCTCTTTACTGT
ACCTGACAGGAATTTTCAATTTATCCTGTTGTTTTTAAATGAATTTGGCAAAAAATTAGA
TGTTAGGCAGTTCATTTAATAAATGTTGTACAAATTATGCTGTCCATTTTGTACCGTGCT
ATATGTGTATAATGCATCATGAAGGAAACTCATTTAAAGCGTAACTTTGTTTGTATGTCA
ATGAGCTAAGATGCTTAAAACAAATTTTTGTGTATATGGATGAATTGTTATGCTTCTTTT
AGATAAGTTGGTGTCTTTAACATCTGAGTTTCCAGTGTCTAAATACTTAATGATTTTCTG
AATTCAGATTTCGTCCTGGTCCTATTATTTTCAGATTGTGTTTATTGAATTGTAAATGAT
CACTAGATATGACTTATGTAAGAGGCAATTTATTTTGCTACAGTTTACTTGTTTGCATGT
GGGTTCTTATGTGGGGTTCCATATTCCTTTTAACTGATGGTATTGCTGAATTCGAAATCA
CTTGCGTTTTAGAAATTTGAAAAATTCTGATCGTTCCCTAATTAATTTTGCAATATGTGC
TTGATTGTCAGTTTAAATTTTTTGAGACCATCATCCTGCTTGTTGCATTGCTTCTCACAC
TTATTTCAACCCCTTTACAGGTGACGTGGGATGAGCCAGATTTGCTACAAAATGTGAAAC
GTGTCAGCCCATGGTTGGTTGAACTGGTATCAAACATGCCCGTCCTTCATCTATCACCAT
TCTCACCACCAAGAAAGAAGTTGCGACTCCCGCAACAGTTAGACTTCCCTCTTGACGGCC
AATTTTCAATGCCGTCATTTTCAGGCAACCCCCTTGGGCCCAGCAGCCCCTTGTGTTGTC
TTTCTGACAACACTCCTGCAGGCATACAGGGAGCCAGGCATGCTCAATTCGGAACATCTT
TATCAGATTTTCATGTTTACAACAAACTGCAGTCAGGGCTGTTTATGTCCAGTTTCCAGC
GGTTCAATCCACAATCTAGAATTTCAGACAGCATCATGGCAAACCACACAAATAGTAACG
AGAATTTATCTTGCTTGCTGACAGTGGGGAATTCTAGTCAGAATTTGGAGAAATGTAATA
ACGTGAAAAAGCACCAGTTTATACTCTTTGGTCAACCAATACTAACCGAGCAGCAGATCT
CTCACAGTTGTTCTAGTGAGGCAGTCACACAAGTTCTTGGAAAAAGTTTGTCAGACGAGA
TTTCAGGCAAAGCGAAAGCATCTTCTGATGGTTCAGGAATCACTCGTGAACTGCAAATTT
CACCACAAAAGTCATCCAGTCCTGAATATTTTTGGAACCGTGGTTTACAAACAACTGATC
CTGGCCTAGATACTGGTCACTGCAAGGTATTCATGGAGTCAGAAGATGTGGGACGAACTC
TTGACCTCTCGGTTTTTGGCTCTTATGAAGAGCTGTACAGGAGGCTGGCCAACATGTTTG
GCATAGAAAGATCAGAGATGCTAAACCATGTACTCTATCAAGATGCAGCTGGTGCTGTTA
AAAGAATTGGAGATCAACCATTCAGGTATGATTTGTGTATCATATTATTTTGTGTTGCAT
CTTTGTAGTTTGGCTTCATGGAATCTCGGTGCTAATCTCATTTTGCAAGTGTAGATGCTC
ATGCAGTTAATTTCTTGGTGTTACATTGTTCATGCAGTGACTTCATAAGGAAGGCCAAAA
GATTGACAATTCTGATGGGTTCAGGCAGTGACAATGTCGGAAGGTAAGAGAAAATGATCT
TGTTACTTCTCATAACTACTACTTATTTATCAGCTTGATAGATGTCGTACATGATACATA
TTCCTCATCACTACTTTGCAACACAAAATAAGGCTTGGGGGCTCGGGGAAACATGCTTTG
GCTTCGCATACTTCTCAGTTGTTGCTTAAAATGGTTAAAATTGTTTTTGACTTAAATTAA
ATCCTGTCACATAAGAAGCTGTCTTGAACGAAGAGAGATATCTTTTGTTTGATTCAGAAG
TTTTTACTAGATATTTATTGACATTAATGTATTGTTGGTGTGACTGATTAAACGTAATAA
TCTGTTTTGCAGGACATGGATCACAGGGATGCGGAATGCTGACAATGGTCTAGACACCCC
CAATAAGACCGGTCCGCTGAGCATTTTCGCATAGTTCTTCTGGCATCCAACAGTAGATTT
TGAGACAACAATAATGGATGTTAAGTACTTGTTTTGTTCATTCTAATGTAGTTGCAAGAA
ACAGAACTTCGAACTGCTTTATATATTTCTCGGTTTATTTATCTGTTTAGATGTTTGACT
TGGTATTTCGATAATGCCTAATGACAATGATAATATGTAATGTCTTATATGTTGCCTATT
GCTATTTTGTTTTCATCTTTACAGTCTTCAAAGAAACAAATCTGTATATATTTCGTTGTG
TTTGATTGAAAATAAACAAAATCATTCTCTTTTCCGTTGTTAAAATGCTTGCAAATAATG
GTAGGAA