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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005230 | Chr14 | 7928365 | 7937573 | - | Integrin-linked protein kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005230.m1 | 33 | 93 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 31.7 | 1.90E-07 |
LITCHI005230.m1 | 62 | 90 | PF13606.9 | Ank_3 | Repeat | 23.6 | 4.50E-05 |
LITCHI005230.m1 | 62 | 93 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 22.5 | 0.00012 |
LITCHI005230.m1 | 63 | 100 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 27.1 | 4.90E-06 |
LITCHI005230.m1 | 156 | 410 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 196 | 7.90E-58 |
LITCHI005230.m1 | 158 | 412 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 215.9 | 6.30E-64 |
LITCHI005230.m2 | 45 | 300 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 197.3 | 3.20E-58 |
LITCHI005230.m2 | 48 | 302 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 217.2 | 2.50E-64 |
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>LITCHI005230.m1 ATGAGCTCGGGCAGTTCCTCCGCCGGTGAGTCCAAGGGGATCCCTTCCTCGGCGGACAAG CAGAAAGAGAAGGCGAGAGTGAGCAGGACTTCGATGATACTCTGGCACGCTCACCAAAAC GACGCCGCTGCCGTCCGCAAGCTTCTCGAAGAAGATCAGTCTCTCGTCCACGCCAGGGAC TACGACAATCGGACTCCGCTCCACGTGGCGTCTCTCCACGGCTGGATCGACGTCGCCAAA TGCTTGATTGAGTTCGGCGCTGATGTCAACTCCCAGGATCGCTGGAAAAACACGCCTCTA GCTGATGCAGAAGGAGCTAAGAAACACAGCATGATTGAGCTTTTAAAGTCACAGGGTGGC TTGTCTTTTGGTCAAAATGGAAGTCACTTTGAACCAAAGCCTGTTCTGCCCCCTCTGCCA AACAAGTGTGACTGGGAAATTGATCCTACTGAGCTGGACTTTTCGAACTCAACGATTATT GGGAAGGGGTCTTTTGGTGAGATTTTGAAAGCCTATTGGCGAGGAACACCAGTTGCTATC AAGCGTATTCTTCCATCACTTTCTGATGATAGATTGGTGATTCAGGACTTCAGGCATGAG GTTAATTTGCTAGTGAAACTACGCCATCCGAATATAGTCCAATTTCTGGGAGCTGTCACC GAGAAGAAGCCCCTTATGTTAATTACCGAATATTTGCGAGGGGGTGATCTCCATAAATAC CTCAAGGAAAAGGGTGCACTTAGTCCTTCAACAGCTGTTAACTTTGCATTGGACATTGCC AGAGGCATGGCTTATCTTCACAATGAACCAAATGTCATAATTCACAGGGACTTGAAGCCA AGGAATGTTCTTTTAGTCAACTCAAGCGCAGACCACCTGAAAGTTGGAGACTTTGGACTG AGCAAGCTCATCAAAGTTCAGAATTCTCATGATGTTTACAAAATGACTGGGGAGACTGGA AGTTATCGATATATGGCTCCTGAGGTTTTCAAGCACCGGAAATATGATAAGAAGGTTGAT GTTTTCTCATTTGGAATGATACTCTATGAGATGCTTGAAGGGGAACCACCGCTTGCAAAT CATGAGCCTTTGGAAGCGGCCAAATATGTGGCAGATGGACACAGGCCAACTTTTCGAGCG AAAGGATACATCCCAGAACTTAGAGGCTTAACGGAGAAGTGCTGGGCTGCTGACATGAAC CAAAGACCTCCATTCTTGGATATTCTCAAACGGCTGGAAAAGGTCAAGGAGGCTTTACCA TCAGATCATCACTGGAATATATTCAATCCATAG >LITCHI005230.m2 ATGATTGAGCTTTTAAAGTCACAGGGTGGCTTGTCTTTTGGTCAAAATGGAAGTCACTTT GAACCAAAGCCTGTTCTGCCCCCTCTGCCAAACAAGTGTGACTGGGAAATTGATCCTACT GAGCTGGACTTTTCGAACTCAACGATTATTGGGAAGGGGTCTTTTGGTGAGATTTTGAAA GCCTATTGGCGAGGAACACCAGTTGCTATCAAGCGTATTCTTCCATCACTTTCTGATGAT AGATTGGTGATTCAGGACTTCAGGCATGAGGTTAATTTGCTAGTGAAACTACGCCATCCG AATATAGTCCAATTTCTGGGAGCTGTCACCGAGAAGAAGCCCCTTATGTTAATTACCGAA TATTTGCGAGGGGGTGATCTCCATAAATACCTCAAGGAAAAGGGTGCACTTAGTCCTTCA ACAGCTGTTAACTTTGCATTGGACATTGCCAGAGGCATGGCTTATCTTCACAATGAACCA AATGTCATAATTCACAGGGACTTGAAGCCAAGGAATGTTCTTTTAGTCAACTCAAGCGCA GACCACCTGAAAGTTGGAGACTTTGGACTGAGCAAGCTCATCAAAGTTCAGAATTCTCAT GATGTTTACAAAATGACTGGGGAGACTGGAAGTTATCGATATATGGCTCCTGAGGTTTTC AAGCACCGGAAATATGATAAGAAGGTTGATGTTTTCTCATTTGGAATGATACTCTATGAG ATGCTTGAAGGGGAACCACCGCTTGCAAATCATGAGCCTTTGGAAGCGGCCAAATATGTG GCAGATGGACACAGGCCAACTTTTCGAGCGAAAGGATACATCCCAGAACTTAGAGGCTTA ACGGAGAAGTGCTGGGCTGCTGACATGAACCAAAGACCTCCATTCTTGGATATTCTCAAA CGGCTGGAAAAGGTCAAGGAGGCTTTACCATCAGATCATCACTGGAATATATTCAATCCA TAG
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