Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005209Chr1477125397714690-Zinc-finger homeodomain protein 11

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005209.m147100PF04770.15ZF-HD_dimerFamily99.11.40E-28
Download   Copy
>LITCHI005209.m1
ATGGACTTAACGAACATCAACACCAGCAAAACCCCAGATAGAGAAATTGAGTCCCCACCA
CCACCCCCCACCAAGACCACGTCTTTATCCTTCACAAACGGCCCATTCCACCACCACCCA
CCACCGCCAGACATGGTGGTTTCTTACAAGGAATGTCTCAAAAACCATGCTGCCAGCCTT
GGTGGTCATGCCTTAGATGGGTGTGGAGAGTTCATGCCTAGTCCTACTGCCAATTCCAAG
GACCCCACCTCCTTAAAATGCGCCGCCTGTGGCTGCCACCGCAACTTCCACCGTAGGTAC
CCTTATGACCAACCCATTTCCATCCACTATTCCTTGCCTCCACCTCCACGCAGGAGTCCA
AGTCCAAGCACAGACCCTAGCACAGGTCGAAGTCTAGACCCCACCTCACCACAACCTGTG
ACATCACCAGCTCCTTGCTCTTACTTCTCATCTGCACCCCACATGCTGTTGGCTCTCAGC
TCGGGCTACTCTGGACCTGTCGATGATCATTTCCATCACCACACAGGTGGGTTCACAGTG
ACCAAGACGGAGAGCCCAATTGCAAGGAAGAGATCAAGAACAAAGTTCACTCAGGAACAG
AAAGACAAAATGTACTCTTTTGCAGAGAAGCTGGGTTGGAGGATGCTCAAAGGTGAAGAG
AAATCTATGCAAGAGTTTTGCAGTGAAGTTGGTGTGAGTAGACGTGTGTTCAAGGTTTGG
ATGCATAACCACAAGAATGCTTTTGGGAAGAAGAGCTTGGATATCAACAACAACAACAAC
CATAATGATGCCACTCTCAATCTTACCATGTCTCCTAAATCTCAAGACTGA
Download   Copy
>LITCHI005209.m1
MDLTNINTSKTPDREIESPPPPPTKTTSLSFTNGPFHHHPPPPDMVVSYKECLKNHAASL
GGHALDGCGEFMPSPTANSKDPTSLKCAACGCHRNFHRRYPYDQPISIHYSLPPPPRRSP
SPSTDPSTGRSLDPTSPQPVTSPAPCSYFSSAPHMLLALSSGYSGPVDDHFHHHTGGFTV
TKTESPIARKRSRTKFTQEQKDKMYSFAEKLGWRMLKGEEKSMQEFCSEVGVSRRVFKVW
MHNHKNAFGKKSLDINNNNNHNDATLNLTMSPKSQD.
Download   Copy
>LITCHI005209.m1
TTAAATACAGTTGAGTAGTCTTAAAGATCACACAGAAAGGACCCAAATACTGAAGAAATT
TGCATATTTCAGTTATAGAAGACGACAAAGATGAAGAAACAAGTGTTGGGCACAAATTCA
TGGGAAATATTCATTGCAGAGGATGAGATGGGAGTCTCTGAGTTGTCCTTTGGCCCTTTG
TTTGTTGTTGATGAGCCACGTTACCCCCCTCTACGAGGACAATTTTTGTAGGGAACCAAC
TGACCCAAGTAAAATCAGTGTTTCATTTCACCCAATCGAATATTACCCTTACCCTAAATA
AATAACATTACACAATTTACAGTCAAGAGGGCAACAACCCTAAGCTCGGTGAAAAAAAAT
CCAGGTCAAAGATAAAAGACAAGGCAGAAGAGGAAATTACATGATTAACCTAGCAATGAC
TGACCTAACCAACCCCCCCATGTCATAGCCTAGCTTAGCCCTTCACATTCATATTTTCAC
TAAGTTGATTGCAATTTGAGGTGGCGTGCATTAATATTACTATTTATATTCTCATTAAAA
ATAATAATAATAATAATAATTGTTTTGTTTTGTTTTCGAGTGTGAAAATGGGTTGTTTTT
ATCATCATAACCATCATGTTGTACAATTATCACATCATAATCAAATCAATCCCCATGGAG
AAAAACTGTGAACTTTCCCCAGTGACACACCCATATGGGGGGCTGGGGGTGGGATGGATT
AAAAAAGATTGAAAAAAAAGTCTTCAAGTTAAGAAAACCCTAACCCCAAGCTTGGATGTG
TGATTTATATAAATAAAGCCATGGACTTAACGAACATCAACACCAGCAAAACCCCAGATA
GAGAAATTGAGTCCCCACCACCACCCCCCACCAAGACCACGTCTTTATCCTTCACAAACG
GCCCATTCCACCACCACCCACCACCGCCAGACATGGTGGTTTCTTACAAGGAATGTCTCA
AAAACCATGCTGCCAGCCTTGGTGGTCATGCCTTAGATGGGTGTGGAGAGTTCATGCCTA
GTCCTACTGCCAATTCCAAGGACCCCACCTCCTTAAAATGCGCCGCCTGTGGCTGCCACC
GCAACTTCCACCGTAGGTACCCTTATGACCAACCCATTTCCATCCACTATTCCTTGCCTC
CACCTCCACGCAGGAGTCCAAGTCCAAGCACAGACCCTAGCACAGGTCGAAGTCTAGACC
CCACCTCACCACAACCTGTGACATCACCAGCTCCTTGCTCTTACTTCTCATCTGCACCCC
ACATGCTGTTGGCTCTCAGCTCGGGCTACTCTGGACCTGTCGATGATCATTTCCATCACC
ACACAGGTGGGTTCACAGTGACCAAGACGGAGAGCCCAATTGCAAGGAAGAGATCAAGAA
CAAAGTTCACTCAGGAACAGAAAGACAAAATGTACTCTTTTGCAGAGAAGCTGGGTTGGA
GGATGCTCAAAGGTGAAGAGAAATCTATGCAAGAGTTTTGCAGTGAAGTTGGTGTGAGTA
GACGTGTGTTCAAGGTTTGGATGCATAACCACAAGAATGCTTTTGGGAAGAAGAGCTTGG
ATATCAACAACAACAACAACCATAATGATGCCACTCTCAATCTTACCATGTCTCCTAAAT
CTCAAGACTGAAACTACTACAACAACAACTTGGTAGAGAGTAACACACAACTCAGAAGAT
CTTTCATGTTTTTTCTTTTTTCTGTTTTCAGTGCTAAATTTTGTTGTCATCATATTCATG
GTACTAATTGATGTTAGAAGTGGAGAAGACATGATCAGAATAGCAATTAAAGGAAATTAC
TTTTTTTGGTTACTGTTTAAATGTTAATTAACTTAGATGTTAATTTGTGGTCATTTAATT
TTAATTTCTTCTAGTAGCTAGCTAAGATCAAGAAAAACCTTCCATTAAATGGCATATATC
GTTGATCCTCTTCCTTCTTTTTATGAGTATTTGCTTAATAATGTTTCCACTCTCAAAAGA
AGATTCCCCATGCTTGCTTGTCCAAAAGACTGTAGCTGGCTTATCAATATATGGGGGGTG
TGATTTTGTTAGGATATGTCATGTGCAATTCTGACTATATTCATTTATAAAGCATTTCTG
CTTTTGCAGAGATATGCAACCTTGTCTTCTTGGGACAATGCTTCTGATCCTG
Download   Copy
>LITCHI010940.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ATTTATAAACCCTCTATGATGGATTTTCATGTAGTAGCGTAAAAGAGTATATTTAGGAGA
GATTCTAGATAGGAAAGACTTGGTTAGGGGTGGGCGTTTTCAGGTTCGGGTTGGGTTAGG
TTGAAAATTTCCCAACCCAATGTGGGTTGGGTTGAAAATTTTTCAACCCAACCCAACCCA
ATTTAATTTTCAACCCAACCTAACCCAACCCATCAATTTTTTTTTAAGATGTAACCCAAT
CCAACCTAATAAAAAATGATCGGGTTGGGTTGGGTTTATCGGGTTGAGTTGAAGATGCCC
ACCCCTAATTTACATTACAAAATGATTTTAGAACAAGTAAACACAATTAATTATTATCAT
TCTTCATTCGCATTCTCTAATCCATCAAGTAAACACACAATTATTTTGATTCCAATACAT
CATATCGATTTCATATTATTTCGATTATGTATAAGTAAACACACTATCAATCTCTTGTAT
TTTTGTGGAGTTGAAAATATATAAAAGAGATTATGAGATGATTAGAGTTTTAAGAAACTA
TGAATTTTACTGCCCAAATAATATGGAAGTTATTAATGATTTTGATATCGAGTCAATTAG
TAATTAGGCAAATTATCTCTTTATATGGCAAGAGACTTCAAATTCCTGGCAATCATGTGA
AATGATTTTATATATATGGAGTCATTGATTTCTTCTTTACATAATGAGATTTTCAAATAT
TTCTCATCATTTTACCAAAATCAATTATCTCTCTCTCTTTCTTTGTTGAAACTTTTTTTG
TTAATAAAAAAAAATAAAACAAGTATCTCCATTTTTATTTGGAAAAAAAGTCTTCAGTCA
GTATCTATTTGTATAATATTTTTCTTCGCGCAACCATTGAAAAACATAATAAACTTTTGT
TGAAGAGAATTTTCCAACATACAACAATTAAAATTAAAGAGAGAGAAAAAAAAAATCTTT
ACTATTAATTAATAATTACACATCCTCTCATCCACCACATCTATATAGGATAGCACAACT
ATAAATTTCAAAATTGCAAAATCAAACTTGTGGTAAAGGATTGCTTGATGGTTGGTGGAA
ATTTTAAAAGAGGCATTAGTGTTTAAAAAATCATACTACTTATTTAAAAGATTTATAAAA
TTATGAGTTTGATTGCGTAATATTTGTACTTTCCCTCTTAACCAAAGTAGTGTACATCTC
CCATATATATTCCAATTATGAAAATAGATATTCAATTCCAAATTACAAGTCTATCATTCT
CATTCACAATATATTAGTTAAACAAACATAGAATTTTAATACATTATCGTGTTTGTGTAT
AGTAGAAATTTATAGATATGGAACAACTTGACATTTCAATCCATTTCCAACAATTAGCAG
ATAATCCATTAGTGATGGACTGATGGGAAAAAAATGGGTAACTCTTGATTTGATATGATA
GTCCTTCCACTACTATAAATGATAGTCCTTCCACTAGTATAAATCATACCTTTCTCGGTA
TTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATATTTGGTTCCAAACATGCTCCAAGATATAGA
GGAATCACGTTATTCACAACAAAACAATCATGGAACATTCAAATATAATTGCACATGAGT
ATCTTAAAATTTCATAATTTATGGTCGTGAAAATTTGAACAATTCACTTTCTTTATTAAA
ATAAAAAACAAATTTTTGCTTTCCATAAATTAAAATCACAAACTGATCTTTTTCATTATA
AAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAGGCAAACCCATCCAACAAATGGGCCATTCTAAAGGCC
CAATAAGGAATCTTGCATTACTCCATCCAACAAACGCGCTACTCTGACGGCCCAATTTAG
GAATCGTGCTTTATTCCATCCGGATAATACCCAATCAGAATCGGATATTTACAAACTCAT
TATCCAAATATCTCTAGCTGAAACACAAGTACACAACCCAACCAAACACAAACACAAGCT
TAATACAAACAAAAGAAAAA
Download   Copy
>LITCHI031859.m1 GenomeSequence + 
TGGGATTCCAATTAATTAAATTAAATTAATTAAACAAACATCATCAAATGAATATCCTTT
TTGATTATCCTATCCAACTGTAAAGCTATCCAACATTGGATACTGAGAGCCAGTAACCAA
CACTCCTTTTGTTGATCCATTTGTCTAGTGAGTTGTGACTTGTGACCAAACCAGGGAGAA
GGAAGGAGGCAACAACCAACAAACAAACCCTAAACAGGCACAGGATGCCTTCCAGGGCCT
TTCCTCCTGCAAGTCCAGCAACAACCTCCTCAAAGCCTCCAAGCTTCATCCCCAAAACCA
AGCTTCTCTTGTTGATCCTCACAATCTCATCCTCCATAGTTATAATCTTCACATTGCTTT
ACTTCCTTTACCACCTTTGGTACTCCCTTGTTAACCGCTCTAGAACCCTTCCTTTTGACT
CCAATGCTCCTCTCAAGCTCCAAAGGTTCAGTTACAAAGAGTTGAAGAATGCTACTCATG
ATTTTGATGACACGAACATCATTGGCAAAGGCGGTTCTGCTACTGTCTTTCTTGGCATTG
CTAGAGATGGCAAGTTGTTTGCTATCAAGAGACTTGACACACTCTCTCTACAAACTGAGA
GGGAGTTTCAAAATGAGCTGCAGATTCTTGGTGGGTTAAGATCACCTTTCTTGGTCACTC
TCCTGGGCTACTGTGTGGAAAAGAACAAGCGATTGCTGGTTTATGAGTACATGCCAAACA
AGAGCTTGCAGGAAATGCTGTTTAGTGATGATGGCAATAATTTTGTTTTGAAATGGAATC
AGAGATTTGATATTATAATTGATGTTGCTAAGGCCTTAGAACTGTTGCATTTTGGCTGTG
ATCCACCTGTGATACATGGTGATATCAAGCCTAGTAATGTTCTGCTGGATATGGATTTTA
GAGCGAAAGTTTCGGATTTCGGTTTGTCGAGGATCAAGGTGGAGGGTGGTGAATATGGGG
TGGATTTGTTTAGCCAGGACTTGGGGAAGAGTCAAGAGCTTTCAGAGACTCCTGTGGATA
GTGCTCATGAGGTAGATTTTGCACTTGCTTTACAAGCATCTACTTCCTCTACCAATACTA
AAAAATGTTACAATGTTAGAGCTTTGAACTTGAATTCTTTCAATTATAATGCCAACATTG
CTAGTGAGACTGAATTTAAGAGTGGGGGGACTGTCAAGGGGAAGGAGGTCTCAAATGTAG
ATATCAGTGGGGTTGATTGGACTACTAGCAAGTTTGTGCCTTACGAGGATGAGCTAAGCA
GTGTTGATCATAGTAAGGAGTTGAATTTGAATGCTAATTCAGTTGGTGATGAAGCAGCAG
CAGCCACGAATATGAAACAATGGGGAAAGGATTGGTGGTGGAGGCAGGATGGAAGTGGCG
AATTGTGTAGTAAGGATTATGTTATGGAGTGGATAGGGAGCCAAATCTGCCCGTCAAGTA
ATCCTGATTGGGAAGAAGAGAAAAAGAGCATACATGAGAAAACTGAGTTGGATAATTCGA
CTGGATTGGATAATGTGGAAGACGTTAACGAAGAACCCCATTTGCAAGAACTTGGGTTCG
AGAAGAAAGAATTGAAAGTCAGGAAAAACTGGAAGAAGAAACACAGGAAGATGCAAGAAT
GGTGGAAAGAAGAACACTTGGCTGAGATCACCAATAAGGGGGGGAGTAGTAGTAAGCTGA
GAAATCTTGAAACCAAGTGGAAGAAGGGCATTAAGATACCACATTTTGATCTTGGTAAGC
GGTTTCGTTTCCATAGAAGGAAGAATTTTGGGGAACAGAACCAAGATGAATGTGATGATG
CAAATGGGGAGTTCAGTTTTAGAAGGGGATATAAGAAGAAGAGCAAGAATAATTCTATGG
GAAGTGACATGTGGAGTGGAGATCTTTTTAGTCGCGAGTTGAGCAGCACGACAAGCATGA
GGGGGACTCTGTGCTATGTTGCCCCAGAGTATGGTGGTTGTGGTTACTTGATGGAGAAGG
CTGATATTTACAGCTTAGGGGTCCTGATCCTTGTGATTGTGTCTGGTAGAAGGCCACTAC
ATGTTCTTGCTTCGCCAATGAAGCTCGAGAAAGCAAACTTAATAAGCTGGTGTAGGCAGT
TGGCTCAGTCCGGAAACATTTTAGACCTTGTGGATGAGAGATTGAAAGATGAGTACAATA
AAGAGCAGGCAAGTCTGTGTATCAATTTGGCTCTCACTTGCTTACAAAGAATGCCAGAGA
TGCGACCAGACATTGGGGAGACCGTAAAGATTTTGAAAGGGGAAATGGATCTCCCACCAC
TTCCGTTTGAGTTTTCTCCCTCTCCTCCATCGAAATTATACAACAAATCGAAGAGAAGAC
AGAAGGCGAACCCCGAATAGGCTTTTGGATTTTGTTTTCGTTATTGGTTTTTTTCTTTCA
TGTTATTGCATTGTGGGGGGTTTTGTGACAGAGTGTACACATTTGGGGACTGACTCTGTG
TATAAATTGCAATGTGAGAGTCATGCTGTTGTATGTACATTAGAGGAATCGTTTCTCATT
TCTTTGCATTTAAATTAGATGCAAATATTGATGGTAGCTAAAGTTACTTCTGCTTCTGTT
TTACAGTTGTGGTTGTACTAACCTCAGATTGAATAAAACCTTTATCCATAATTTTGATGC
TCTGGATTTCATATCCTGACAGAACATAAATGCAATGTGCTGC