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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI005146 | Chr14 | 7070282 | 7071749 | - | Transcription factor PRE6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI005146.m1 | 21 | 61 | PF00010.29 | HLH | Domain | 24.9 | 1.70E-05 |
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>LITCHI005146.m1 ATGTCTGGCAGAAGATCGCGGTCGAGACAGAGTTCAGGTGTTTCGAGGATCAGTGATGAG CAGATCAGCGATCTAGTGTCCAAGTTACAACAGCTTATTCCGGAGCTTCGAGCTAGACGG TCCGACAAGGTGTCAGCTTCAAGGGTTTTACAGGAGACTTGTGATTATATTAGAAGCTTA CACCGAGAAGTGGATGGTCTAAGTGACCGGTTAGCTGAGCTTTTGGCGTCAACAGACGAC AGTAGTGCTGAGGCAGCAATAATTAGGAGTTTACTTATGTAA
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>LITCHI014253.m1 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVNMVEWLKMMVQIRRSEDVVDPNIETRPSTSALKR ALLTALRCVDPDADKRPKMSQVVRMLESEEYPIPREDRRRRRNQGPTESEFQRESSDTDK NDNPESRLNGRRNQQA. >LITCHI014253.m2 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVNMVEWLKMMVQIRRSEDVVDPNIETRPSTSALKR ALLTALRCVDPDADKRPKMSQVVRMLESEEYPIPREVWFCSFCLSPS. >LITCHI014253.m3 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVCNKHLFSKSVFSSVALSVLMLSSFWYMS. >LITCHI014253.m4 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVNMVEWLKMMVQIRRSEDVVDPNIETRPSTSALKR ALLTALRCVDPDADKRPKMSQVVRMLESEEYPIPREDRRRRRNQGPTESEFQRESSDTDK NDNPESRLNGRRNQQA. >LITCHI014253.m5 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVCNKHLFSKSVFSSVALSVLMLSSFWYMS. >LITCHI014253.m6 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVCNKHLFSKSVFSSVALSVLMLSSFWYMS. >LITCHI014253.m7 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVNMVEWLKMMVQIRRSEDVVDPNIETRPSTSALKR ALLTALRCVDPDADKRPKMSQVVRMLESEEYPIPREVWFCSFCLSPS. >LITCHI014253.m8 MASDLNKTLSKTYIGLQLWVLIVIGLGVVFVVILGVSLWLTFRKKSRRADMLPLSRFPVV SEEIKEIRVDQVSASNRSIATLSDKFTDRESEKVLIPHVENYDESIQSSSFNNIEKDVMG SQLGEEVGKPAGSAFRPSSHPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLQQATNRFSKDNI IGDGGYGVVYRGNLINGTPVAVKKLLNNPGQADKDFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCIE GTQRLLVYEYVNNGNLEQWLRGDMHDQGYLTWEARIKVLLGTAKALAYLHEAIEPKVVHR DIKSSNILIDDTFEAKISDFGLAKLLGAGKSHITTRVMGTFGYVAPEYANSGLLNEKSDV YSFGVVLLEAITGRYPVDYGRPQSEVCNKHLFSKSVFSSVALSVLMLSSFWYMS.
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>LITCHI028752.m1 ATTTTTTTTTGATGTAGTATTTTATAATAGAAAAACAACATCAAACGTTGATTACATCCG CCAAACTAAACTTATCAAAAGATAATAATTAAAAGTTAACTAATTAAGAAATTATACATT TATACATGAAAAAAATAGTTTAACAAATATTTTATCAAAACCAATAAAATTTTACTACTA CATGACAATTTGTGATGAGATGAAGTTTGGAGACTTGTGTTTAGGTTAGGGTTTGAACTT TGAAGGGTATATATATCTACCATTAAAATTACATGACTATCCCTCTAAAATAAAATTATT TTTTTATCCTTATTTAACGGGTCAATCCGTTATCCGTTAAATAGAATCCGAATCCGACCC GATAATTAAACGGGTTAAACAAGTTGATCCGTTTATTTATCCAACCCGTTAATACTCAAT CCTAATCCGTAATAATCGTGTCGGTTTCGTGTCGATCCGTCGTATTGGGTTTCAAATTGC CGGCACTACCAAAAAGTCAGTGAATAAGCAGAGTGGACAAAAGCAGAGGAGCTCCACTCA ATTTATTAACCCATAAAATCTACAAAATCCGAATATGAGCCAATCAATTCTGCTGCAACA TCCACATGACACTGCCACATATACACATAAAAAGCCAATCGGAATGAGCTTTTGGAAAAA GAATCCATCTCTTCTCAAACAAACACCATGCCGACAATAGCATTACACCCTACTTTCTGT ATCACTTCACAATCATCACCATCTTCTTCTTCCTCAAATACTCAACAACTCTTAGCAACA AAACCCAATAGTCTCCTCCAAAACCACCCTCTCTACCAACCGACTCATGCAAATCTCTCC CTTCAAATCCAAGAAAAAATCATCTGTCTTGAAATCATGGGTGTTGATTCCGGCAAGGTG CTCTCCCTCAACCCTTCTCTCCACTCAGCTCCACTCCATTCCATTCACTCCATAATCCAC TTCCTCCAATCCAAAGGCCTCCACCAGAAGGACTTGCCCAGGATCTTTGGGATGTGCCCA AAACTCCTCACTGCTGACATCAAAACTGACCTCACCCCAGTTTTTAACTTCCTCTCACAT GACCTAAAAGTCCCAGAATCCAACTTCAGGAGGGTCATCAACAAGTGTCCAAGACTGCTG GCTTCTAGTGTCAGAGACCAGCTCAAACCTGCTTTGTTTTATCTTCAAAGACTTGGCTTT AAGGACTTGGAAGCCTTGGCTTATCAAGACTCGGTTTTGTTGGTGTGTAGCGTGGAAAAC ACCTTGATACCAAAGCTCAAGTACATAGAGAGTATTGGGTTTTCCAGGCAGGAAGCTGTG GTTATGGTGTTGAGGTGTCCAGCTCTGTTCACTTACAGTGTTGAGAAGAATTTCAAACCC AAGTTTGAGTACTTCGTTGAGCAAATAGAGGGAGAGTTGGAGGATTTGAAGGAATTCCCA CAGTACTTTGCTTTTAGTTTGGAGAAGAGGATAAAGCCTAGGCACATGGAGGCCGTCCAA GCTGGCTTGAGACTTGCTCTCCCGTCATTGCTCAAGCCCAGTGATGATGAGTTCAACGAC CTCATCAAAGGAGGCCGAGGGCCTGCTTGAATAAATTTCTCTTATTTGTATACTTGTAGA ATTTTATGTTGTAAAGTGTTATTGTTTAATTTTAATCAACACCAATTGTTACGCGTTATA GTAATTTAGAAAGCCATTTTATGTCATTTTTGACATTCAATTGCAACACAGGTAGTTAGG AAGTTGGGATGTCAACGGATTAAATGAGTATTTGGATTGGAATATCCATCCTCATTCTCC ATCTCTTCCTCATTTCCAACCAAATCCTCAATTAAGAGTATTTGGTGATGAATTTCTCCA TACCCATACTTGTTTTAAATTTCCGTTGGACATTGTTTGACTTGAAAATTGTGATGGATT TCTCCATACCCATACTATTTTTAAATTTCCTCAATTGGACATTGTTG
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>LITCHI028752.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTATTTGTTTGGATATAACAGATGATAGGTTAAACACTTGAACCCACATAAATCTAATAA TTGTAAGAGTTCAATTATCGACATTTAGATCAGCATGACTGTTAGCTGCAGTGAGTCATT TGACATTTCCATAGCCAGAGTGGAAATAAATATGTGCTTGTATATCATGTACCTTAGTTT AATCTCGCTTCAGGCTTTCCTCTTCTAAAGTTAATGAACGTCTGAGTTGATCTAACTGGG AGCCTGATGGTTTGAGTGCAATTGCTAATTATTTTTGTATTATTATTATTATTATTATTT TTTGAATAAAATTATTTTTGTATTATTGGAATGAAATGGGGACTGGTTGACTCTCTAGAC GTGCTTTAATTTCTGATTTATACCAGCGGACAAACGCTAAAAATTCTTTGGTTCAACCTG ACTCGGTGGTAGTCACTTTTCCCCTTGAATAGTTTGACGGTGTCTCGTCTTTTCGAAGAG TAGAAGCAGAAATAACTTCTCCAAGACCAGAAGAAATAAAAAATACATAGTTCTGAAAAA TACGTTTATAGTTTCAAAAAAGAAAAAACGTTTATAATTAATTTTAATGCAAAACTTAGG AAGTATGAAGCCAGACAAACGGCTGAACTGAAATTTAAATTTTTCAATGAGGAACTGCTG AATCTGTTGTGATTAGTTATTGCTTAAGAGGTTTGGATAGGTGTATATTCAGCTGAACGA GGATGGATGTCCCTTACTGACATTTTCCAAATGTAGAGGGTGTCCAAAACTCGCAAGAAA CAAGTGCTTGATATTCCAAAAGCCATGGTATCTGTAAATAAATAGGGAGTGGGACCATTC GGAACCAAATGGCATGGTAGTGTGGGCGAGTGCCAAAGAGTAGGGGTGGCAATCCGGGTT GACGGGTTGAGTTGGACATGATCCGAACCCGATCCGATAATTTTTGACACAATCCGAACA CGACTTGATAAGGAAACGGGTTGAACCCCCTCAATCCGAACTCGATACGGTTATTAACGG GTCAACCCGTTAATGACCCGTTTAATCGATATATTAGTGACATGTTTAAGCGATATATAT AATAATTCGTTTAATCGATCCATTTATGACCCATTTAATGATAGTTAATACATTTAAATT TTAATATAGATATAATAAAAAAAAATTTAAAATAAAGATATATAAGATCTAAAAAATACT ATCATCCACAAATACAATTTAAACCATAAAAATACAAATGTTTACAAAGATGATTATAAA AATATCTTTGTAAATATAGTCCTTCATATTAAAAAAAAAAAAAAACAACATAAATTTTTT TTTGATGTAGTATTTTATAATAGAAAAACAACATCAAACGTTGATTACATCCGCCAAACT AAACTTATCAAAAGATAATAATTAAAAGTTAACTAATTAAGAAATTATACATTTATACAT GAAAAAAATAGTTTAACAAATATTTTATCAAAACCAATAAAATTTTACTACTACATGACA ATTTGTGATGAGATGAAGTTTGGAGACTTGTGTTTAGGTTAGGGTTTGAACTTTGAAGGG TATATATATCTACCATTAAAATTACATGACTATCCCTCTAAAATAAAATTATTTTTTTAT CCTTATTTAACGGGTCAATCCGTTATCCGTTAAATAGAATCCGAATCCGACCCGATAATT AAACGGGTTAAACAAGTTGATCCGTTTATTTATCCAACCCGTTAATACTCAATCCTAATC CGTAATAATCGTGTCGGTTTCGTGTCGATCCGTCGTATTGGGTTTCAAATTGCCGGCACT ACCAAAAAGTCAGTGAATAAGCAGAGTGGACAAAAGCAGAGGAGCTCCACTCAATTTATT AACCCATAAAATCTACAAAATCCGAATATGAGCCAATCAATTCTGCTGCAACATCCACAT GACACTGCCACATATACACATAAAAAGCCAATCGGAATGAGCTTTTGGAAAAAGAATCCA TCTCTTCTCAAACAAACACC
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>LITCHI025698.m3 GenomeSequence - TCTTCTTTCTTTTTGAATGATGATTGCAATTTAACATTTTTACTAAGAAATAAAGGGCTA CTTAAATCTATATCATTCAAAAAAACAGTAGTCAAAATTATAATTTTCTACGGATTATAC AGACAGAATCGTTCAGGTACTTCAACAATCACCATATATGTATGAGATTTAGATAAAACA AGTGCCAGTCCAAAACAACGTATAGTCTGTCTGTATCAACCGATCAGCCTCAACAAGAAC GCCTTCTTCTCCTTGATGTTTCTTTTGTCTTTTCTCATTGACCATATTTATTATAGTGAA TAGATAGACTAGCCAATGCAATGCTACCACCACCAAACTTTGACATTTTGTTTGACCACA TATTTTCCTCACTCATTTTACCCACTGGAACTACATTGCTCTCGTTTGGGATCAGCAACT ATCTTAACACGCGCCACCTGATTTGTCATCACGTGATTGCTTGACGCTCCTCAGACTCGC GTCTCTCTCTCAACATATCAACTCTCGTAAATTTTTTTTCAAAATCTGCATTAAGCAACT CGTTGTAGGAGCCACCACCACTGCAGAAAGAAAACTGAAGCCCACCAAAAACCCTAGTCT CAGTTTCAAACTGAGCAATCGATGTAAAGAGAAACAGTGATGATTTTCCTTTGTTTTCCC ATCAAACAAACAAAAATGGTTTTCTGGGGTCAAGTCATTTCACAGCCATTAATGTTCCAA ACACATTTTTTCTTATATTTTCTTTTGTGTCATCTCGCGAACCAAACAGAAGAAGAAGAG AGAAATAATAAATAACTACCGATGGCAAGTCATTTCATCATTGTGTCCGTACACTGCAAG TCACTGTCAGAGATATATAAAGCGAAACTCTCTCTCTCTTTCTTCATAAATTGGATCTCT CTTGTCCTCTCTTCTCTTTGAAGAATCCACCATCAATGCCTTTCACTGTCATGTTCACTA ACTGCACTGCATTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGACCTTGCTGTTCCACTGCAGCACC CCACCGTATTAACTCTCTTCAGTGTTTGTACGTACAAGTCTCTCTTACTCTCTCTCAATG ATAGTAGATTCAATATCTCTGTAATGCCTGTTATTGTCTATCATAAATACACTACTCCAC CGTTGTATATGTATACGGTATACACGTATATTTAATGCAAAGCCAGCTCGATTCACGCTG ACCCACTGTGCCTGGTACCCACGTCATTTATGAGTATAATAATAACATTATTCACTTTCG ATATCCCTAGATAATATCAAACTCGCATTTATAGCTCCCCCTTGTCTCTCTCATCTATCT TTGCACTTGCACCCTCTTTGTCACACTATATAACTATTTGTTTTCAGACTAGTTTGTTTT GTTTTTCCTTTCGAGATCGATCAAAGAGAGATATGGGGAGGACACCCTGTTGTGACAAGA AGGGATTGAAGAAAGGGCCATGGACTCCTGAAGAAGATGAGATTCTTGTTGAATATATCA AGAGCAATGGCCATGGTAGCTGGCGCTCTCTTCCCAAACTTGCTGGTATGATACATATAT ATATGTACACATCGATCTTTTCTCTTTTTCTTGTTTGAATGTAAAAAATCAGTAGAAAGC AAAGGTTTAATGTTGTTTATAAGTTGTAGGGTGGTGTTGTCTTGTCTTTGTTTAATTGTT AAGGTTTTTGTGTAGTGTGGATTGCTTGAGTTTTGAATCAGGAGAGAGGTGGTTTTAATG CAACTTTGCCTTTCAAAAGCCGAAAGAGACCTTTGATATATGTATTTGTTTAACTAGTCT AAGCTCTTTTATTTTTCTTTTATGATTTACTTGTTTGTGTTGAAATGTTGCCTTTTATAG 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AAGAACTTGTGGAATACTCACCTGAAGAAGCGAATGCTCTCCATGGGAATCGATCCCCAA ACTCACGAGCCCTTTACTTCCTGCGGACCAACCATGAAAGCACCTGCGTCTCCCACAACA CGTCACATGACACAATGGGAGAGTGCTAGGCTTGAAGCTGAAGCTAGACTCTCCAGGGAG TCACTACTCTTCAATCCACCACCACCACCGTCTGACAAAGCTGATTCTGATTACTTTCTT CGCATATGGAACTCTGAGGTTGGGGACTCTTTTAGGAAGTTGAATAAAGGAGACAAAACT GCATGCCAAAGCCCCAATTCTCAGGCCTCTTCATCAACGAAGTGTGGATCAGTTTCTGCC ATCACAATGGATCTTGGACACAACATTGGAGGGTCCTCAACACCTGGCAGTAACCAAATT GAAGACATGGAGTGCAAGAGCCCCAAGTCATACGACACATCAAGTTGTGATGATTTGCAG GATTCATCTGACTCTGCATTGCAGCTTCTGCTGGACTTCCCCATCAATAATGACATGAGC TTCTTAGAAGATAACTATGCCACATCATCTGCAATGTTCACTGAAAACTCATTGATCTGT CCTCTTTGAAGCATGTTTTGTAGCCTCTGTTTGGTTGAATTTTGAGCTTGGTTTTTGCTG CTTGAAAGCTGTCAAGGAGAGAAACAGCAAACGGAATTTTGTGGACAACTGGATTTGGTG TTAAGAGGCTGTGGTGCAGTGATGTTTCCATATTAATTAGGTTTTATTTACTAAACCCAG TTTATTTTACTATGTATGTATAGAAGATACATATTCCTTGTGGCCTCTTAAAACTTCCTA ATTTAGATTTGAAAATACTATTTTATATTATATTTTTGAATGGTTTTTGGTTGGACATTA TGATGCTATTAAGTTGACTCTGGTTTCATGTTTCCTTATTTGGCCATACAAGTTCACATG 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