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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005125 | Chr14 | 6886518 | 6890687 | + | "Single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005125.m1 | 99 | 233 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 201.3 | 5.50E-60 |
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>LITCHI005125.m1 ATGTTGCAGCTACAGTTGTTGTCTTCACAAACCCTAAACCCTAGACTGTTATACCCATCT CAATCCCTCTCCACAACAAAAGCCAACAGTTGCAGTTCCACTTCCATCTCTTTAACCCAA AAGGTCGTCACCAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGCTCTCTGTCAAATGCCGCCAATCAGAG TACTATGACCAACAGAGTCACGGTGTTGCTCCCAACAACTCTTCTTTTCCTCAACAATCT CCTACAACAGTCTCGGTTGGAGCACTGCCACCGAGGGTTTATGTGGGGCATTCGATATAT AAAGGGAAGGCTGCTCTTCAAGTGGAGCCTAGAGCACCGGAGTTTGTGTCTTTAGATTCC GGGGCATTTAAGCTGTCCAAGGAAGGGTTTGTGATGCTACAGTTCGCGCCTGCGGTTGGT GTTCGACAATATGATTGGAGTAGAAAGCAGGTATTTTCATTATCAGTGACAGAAATTGGA ACTTTGGTTGGCCTAGGTGCTAGAGAATCTTGCGAATTTTTCCATGATCCTTTTAAGGGA AAAAGTGAGGAAGGCAAGGTCAGGAAGGTGTTGAAAGTGGAGCCACTTCCAGATGGCTCC GGCCACTTCTTTAACCTCAGTGTACAAAACAAGCTTATCAATTTGGATGAGAGCATTTAC ATTCCCATTACCAGAGCAGAGTACACAGTCCTTGTCTCAGCGTTCAGTTTTATCTTGCCA TACCTTTTGGGTTGGCATACCTTTGCAAACTCCATAAGAGCTGATGATACCAGCCGTTCA AATAATGCCAATCCCAGATATGGAGGAGACTATGAATGGAACAAGTAG
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>LITCHI005125.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTGATTTTAAAAGTATTTGGACCTGTTTATTCATTTCTTGCAATAGAAGGCATGAAATGC GAAACGAAAAGCAAAACAAATGGAATAACCACTGGGTGGACCTGCTTACAAATGCATACA AGGGACTCATGTACCTCTCAAAGTGTCTACATAAGTACATTTAAGTCACACGTGTTTAAG GATATGTAATCTATAAGGAATTCAAAATGAAAACAATAACTTAACGTTTCTTTCCATCAA TGACCATATGAGAAACAAGAAAAAATCAATATGGTAAAGATGCACAAGTCAGAAAATAGC AAAAAGAGGGAAAACAATATTTTGGATAATTGTGAATTTTGTACTATAAAAGCAGGTCAT CAGAAATCACATTGAGTGGGCTTTCTCCCATGGTCGTTCATCAATGGACTCTTCCCATAT GACACAATCGCCCAAGCACTGATGGCAGGTCATTATTCCCTGCTATTATTGAAGGAATAA TATCAATAATGATTAATGTTGAAGAAAAATAATGTGCTACCCAATATGATGAATGGTTTT GCGTCACATAATCAAACAAATAACTGACCAGAACTCATTTTTGAAGATCGTAACAATCAA GTTTAACCTTCAGTTAAGAGAATCTTTTTCATGCTTGCCCATTTAATTCTTTATTTGTTA ACAGTTTAATCTCAGAACATCATAGATATTTCTAGCAGGGTAATGTACTTGCTAATTTGA TAATCCATAAGTGACAATGCAGTGTTAACTCGCAGGCTACACTTTCATGTTTAATCAATA TGGAAATAACGACAAAGTTGCAAAAGCACGTACCTTTCCATTACATAAGGAACAGTCTAA TTGAGACCTTTCTATTCCACACTCCCTACAAGGAGTATAACCTCTCCCCCGACAACTAGG ACAGGGTAGCTCTCTAATATACTGACCATTCGGACCAAACCACGACCTTGGTTTTGAAGC GTCAGGAGTGGCATTCCTGAAATGAAATTTGACAAATAAATAACATGTCAACTTTTGTAG ATAGGATTAGGAATACCAAAGAAATACTATAGCTGATACATCATTAACAAACGTCTCACT TTTAGTAAGCAAAACGATATTAAACGCACCAAGTGTATTAGTACCCACTCTTACATTCAA AATCTTTAACCAAATTCGGTAAAAATAGCACAATCTAAACAACAATTTTCAACACAGCAG CTTGGCCTATAAAATTAAAATTTTGAACTTGACATATTCTTTAGCAGGGACTCTGCTACC TCAAGCCCCACTTAATCATGATAAATGAAACTACAACCCCAGATGTGGGACTAAATTTCA ACATTAAAAGCATAAGAGAAAGGAAAACTATCAAACCTAGGCTTTAGATCAACTCCGAGC CCGAACAACTCCTCTGAAGGATCATAACCCAACTGTCATCACAAAAAATCATAAGAATTA TTGTTACTACATGCTTGAATCAATGTGGCCTACAACAGAACATGCAAGTGAATAAAAAAC GTGCAGTGGGTGGTGCCTGGCGTTGTTTAGGCGATGAAACTGAATCATCATTTGCTGATG AACACACTGAACGAGGAACGAAACCGATTCTTCTCTTGGAATAGTGAAAATTCAAGAAAT GTAAGTTCTTGTACCCCCTTGGAGGTACAAAAACCCCAAAACAGCAACAAATCGATGACA TCATACATGCACAAGAAATTATTTGATTCTTCCAAGCGAAAAACTTGAAACATGTTTGTG CTGCGTTGTGTGGTTGAGAATGAGACAAGTAAGCGCACTTATTCACTTTCAACTTTGGTT TGTAATAACAAGAGACATAAGAGGTGTCCACGTGGCATGTCTTACATTCTTCTTTACGGT GGACCGTGGAGCAGGAAATCACATCTAATCGGTTCTGATATAATGTTGTGGCAAACTAGC CATCAGCAGCCACAGTTGCTTCTGCTGCTTTCAGGAGCTCAAAACGGCGACATCGCAAAA AACTTAAAAACGAAAAAGCA
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>LITCHI005125.m1 GenomeSequence + CGTGGAGCAGGAAATCACATCTAATCGGTTCTGATATAATGTTGTGGCAAACTAGCCATC AGCAGCCACAGTTGCTTCTGCTGCTTTCAGGAGCTCAAAACGGCGACATCGCAAAAAACT TAAAAACGAAAAAGCAATGTTGCAGCTACAGTTGTTGTCTTCACAAACCCTAAACCCTAG ACTGTTATACCCATCTCAATCCCTCTCCACAACAAAAGCCAACAGTTGCAGTTCCACTTC CATCTCTTTAACCCAAAAGGTCGTCACCAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGCTCTCTGTCAA ATGCCGCCAATCAGAGTACTATGACCAACAGAGTCACGGTGTTGCTCCCAACAACTCTTC TTTTCCTCAACAATCTCCTACAACAGTCTCGGGTGTGCTTTTCTTTCGCTAAACAGACAA AAGATTTCATTTTTTTCTTTGTTTTGTCTTGAAATAGACTGTGAAAGTTGTGAACTTTTT GAACATGAAGCGTTAGAGGAATTTGTGGGATTTTGTTTGTGTAGTTGGAGCACTGCCACC GAGGGTTTATGTGGGGCATTCGATATATAAAGGGAAGGCTGCTCTTCAAGTGGAGCCTAG AGCACCGGAGTTTGTGTCTTTAGATGTAATGTTTTGTTTCAAATTTGGTTCTTTTATAAT AGTCTGTGTTTCGTTTGTGGTGGATTTTAACTTGTTTTTGTGGTTTTGCATTGTGATTGG TGGGGTGCAGTCCGGGGCATTTAAGCTGTCCAAGGAAGGGTTTGTGATGCTACAGTTCGC GCCTGCGGTTGGTGTTCGACAATATGATTGGAGTAGAAAGCAGGTGATTTATGTTTATTT TGTTTGTGTAGGAGACGGAGGAGAGGAAGAATGAGACAATTGGTAGTTGTAGAAAGTAGA GATGGGGATTTTTATCTGATTTTGGATGTGTCGATGTAGTTTTTGAATTTACTACAGAAC CATTGAGGATGATCATGGTTGCTTTCATTTAGAGAATGTTGTAATGCTATTGTAGAATCC TTGGTTTTAACTCACCCCAGTGCTATGAAACCAAACTTGATCGATGATTGGGCGGTCGTT TCTGATTTGGGCTTTTAGAATCTAGATAAAACTGGACTAGTAATGCCATAATTGATTTTG AACTTATTCTTTTATGAATTTTCTCTACCAGTTGGCTTTAAATTTACTACTGTGACCTTT CCTTCTTGAAATTTGACAGGATTTGGGCTCCAATACTTGTTCGTTGTGTGCTCTAAAGTT TCTGTCACTTAGAGTGCTAGTCACAATTTTGCAATTGATTGGCATGGTCAAAACTACAGT TCATTTGTTAATTTGCTTGTTAAGAGGTTCTAATAATGGGGTTTCTGTGAAGTATAAGGA GTCTAATAATAATCAGTAGGCTAAAAAAAGCGTTAACCTTGCCGATTGACATGAGTAATT TGTATGTTAAATTACGATGTTTTTTTATTTGCTATGTGTTAATTTAAGCTGGTAAGTTAA GAAATAATCTTTTCCCCCTAGAAGCATGATCATATGTGGTTTGAGTTTGGTAAGCAAGAA TGCTTTGGTTTGTGTGAATTCACGGTTGTTTTGTCATGTCTCCAGGTATTTTCATTATCA GTGACAGAAATTGGAACTTTGGTTGGCCTAGGTGCTAGAGAATCTTGCGAATTTTTCCAT GATCCTTTTAAGGGAAAAAGGTACCAGCTATCTTTTAGCTACTAAAATTGACATGTGAAG TATAGATGAGTTTCAAAGTTGTTAGTAACTTCCCTTGGTTTATTTATTTATTTATTTTTT GTTCGCATATCAACATTTTCTAATAACTGTTGTCTATGTCATATACAGTCCCATTATGTC CTGATGATACTTGTAGAAATTGCATAGTTATTGTTGACAGATAGTAAAATGTGACTGCAT CTATGTAAATTATCTTCCAAACATATGAAGCCATTTATCTGACTTTGGGAGTATTTAGAC TAAGCAGCCATAAGAAGTTTGACCTTGCAAATCTAGCCATGCAATATTTATGCTTGATGT ACATGAGCTTGCTAAGTAGTTGCTGAGCCATCCAATAATAACAGTAGAAATTGTTAATTT ATAATTTACACACCCATGACTACTCAGTGCTGAGTCCTATCAATAAATACTCTAACAAGA TTTTTAAATTTTGTAGTGAGGAAGGCAAGGTCAGGAAGGTGTTGAAAGTGGAGCCACTTC CAGATGGCTCCGGCCACTTCTTTAACCTCAGTACTTATCTTTTCCCTTAATTACATGCTT TGTGATGCCATGATATATGAATGTAATGTGGCTTTCCTATATTACTGTTAACTTGAAATT GTACTATTTTGTTTATTACTAATAAATCCTTGCATATAAAACTTCTATGTATTTGTGGCC TAATAAAAGTGAAAATGTGTGAACAATGACACTTTGTCAAACAATGCATGTATAATATGA TGGCATGTTGCTAGAAGTTGTTTATGGTGGATCAGTTTGTCACACTGATTTTCACTATAT AATAGCTATTGTAAGTTTTTCACATTGAATTTCACTTTCATACATCTGTCTTTTTAAGTT TAATATATTTTATTATAGCCATATGACTAGCAATACCTTCATCCATTCAATTATGTTTTT TATTGATGGACTCAGATATGCTGATATTATATAACTTGGATGACAAATTAAGAGTAAATA TATGCTGGAATCTTATATATCTAACATTTTCTGTTTCTGGTGTATGTTATGGCGTCTATT GAAGGTGTACAAAACAAGCTTATCAATTTGGATGAGAGCATTTACATTCCCATTACCAGA GCAGAGTACACAGTCCTTGTCTCAGCGTTCAGTGTATGATATGCTTCTCTTTCTCACTCT TTCTTTCTATCTCTTGCATAGTCTGAGTATGTATACCTGCAAGTGTGCATTATGTATGCA TAATTGCAAGAAAAGATATGGTAGGACTTTTTGCCTATGATGCGAATGCACTACAAAATT GTAGAAAAAGCATTTTATTCATAGTATCAAGTGGCCTCTAGGATTCATCAATAGAGACAT GGCAGAGAATGGGAATATAAACAGAGTTAGTTGGCTGATCCTAGTAACAAATTGAAGGAA TTTGACTCATGTGATGCACATTTGATTTAGAAATCTGAGGACAAAGTTGAGATTGGTGCC CAGTGCTAAGCACCTCACACTCATACCTACGAAATTATAAGTTTGAGTTATATACCGATC TCCAACTCCCAAATCTGTACTAGTTCAAAAAATTGATTAAGATAGCTCAGGTCCAAATCA TGAGATTCTGCTAGTTGAACTGTATGCTCCTTTAACGTATAACAATTTTTGGAAAGATAA TATATTAACTCTGGGAGTGAGTGGTATTTCATTGCTTGTTTGCTTTCACTAGGGAGAGTG CTTATAACTTGCTTACACAACAGTTGTCATTAGCGGCTGTTGTTCTCTAACTTTGTCGGT TTCAAACGTGGTAGTTTTGCGGTCCCGTGTGAATTGCTGTTTATACATCCCAGTATTTAG GTCATTATTAATACAGTCTGACTCGTGTTCACTGCAGTTTATCTTGCCATACCTTTTGGG TTGGCATACCTTTGCAAACTCCATAAGAGCTGATGATACCAGCCGTTCAAATAATGCCAA TCCCAGATATGGAGGAGACTATGAATGGAACAAGTAGTAGGCAATGCAGGATTTCATAAT CTCAGTTTGTGAAAGGAACATCCTTTGACCTCAGCACCCATTCCTTGTCGTGTAACTAAT CCTCCCAAAAATTTTGGCAATGTCCTGCATTTTCATGTTCTAATATTGTGATGAGAGGAT GACAAAGATGGCTGAGCATTGTCGCTTGTAAGGATGTTAAATGTTTGCAAAATTTGACAA TCTAGCAAGTTACAGCCTCTTGTAATATTTGTTTAATTCTAAAACAGGGAATTGGATGGA TTTTTTTTTTCCTGAATTTAATTTTTGCTGAGTGACAAAAGAAAACTTGTGTTTTGTTGC CAGAAATTAATTAGGCTGATCACTTTAGATGGCTACAAAGCGTCTCAAGAAGTAATTTGG CAATCCATCCAAATAGGACCCTCTTTGTCATAAAAAATTAATAGAACATCTATATCTAAA ATGTCTTACTCTTATCAATGTTATTTTGAA