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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI005125Chr1468865186890687+"Single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic "

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI005125.m199233PF08536.14WhirlyDomain201.35.50E-60
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>LITCHI005125.m1
ATGTTGCAGCTACAGTTGTTGTCTTCACAAACCCTAAACCCTAGACTGTTATACCCATCT
CAATCCCTCTCCACAACAAAAGCCAACAGTTGCAGTTCCACTTCCATCTCTTTAACCCAA
AAGGTCGTCACCAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGCTCTCTGTCAAATGCCGCCAATCAGAG
TACTATGACCAACAGAGTCACGGTGTTGCTCCCAACAACTCTTCTTTTCCTCAACAATCT
CCTACAACAGTCTCGGTTGGAGCACTGCCACCGAGGGTTTATGTGGGGCATTCGATATAT
AAAGGGAAGGCTGCTCTTCAAGTGGAGCCTAGAGCACCGGAGTTTGTGTCTTTAGATTCC
GGGGCATTTAAGCTGTCCAAGGAAGGGTTTGTGATGCTACAGTTCGCGCCTGCGGTTGGT
GTTCGACAATATGATTGGAGTAGAAAGCAGGTATTTTCATTATCAGTGACAGAAATTGGA
ACTTTGGTTGGCCTAGGTGCTAGAGAATCTTGCGAATTTTTCCATGATCCTTTTAAGGGA
AAAAGTGAGGAAGGCAAGGTCAGGAAGGTGTTGAAAGTGGAGCCACTTCCAGATGGCTCC
GGCCACTTCTTTAACCTCAGTGTACAAAACAAGCTTATCAATTTGGATGAGAGCATTTAC
ATTCCCATTACCAGAGCAGAGTACACAGTCCTTGTCTCAGCGTTCAGTTTTATCTTGCCA
TACCTTTTGGGTTGGCATACCTTTGCAAACTCCATAAGAGCTGATGATACCAGCCGTTCA
AATAATGCCAATCCCAGATATGGAGGAGACTATGAATGGAACAAGTAG
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>LITCHI003462.m1
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>LITCHI003462.m2
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KVEVLRPQPRYCNATTLVVQPPPCLQEEMPKLQPSQEASSSSSAPLILPHPEFEQSQNAE
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>LITCHI003462.m3
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RKPNAEEDQKEEKQITTKVEVLRPQPRYCNATTLVVQPPPCLQEEMPKLQPSQEASSSSS
APLILPHPEFEQSQNAESNENPGSEDVNFGDLLADIDFDLEQVILTDYKTSSNWEWPDDD
LMVLDMDIWTQSF.
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>LITCHI003462.m2
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ACTTAGAAAGTGGCGTGGACCATTGATCACCATAAGGTTTAATGCTTTGTAGTAATTAGT
TGTTATGGACTTTTAACTTCAAGAAAAACATCTCAATATATACATGACAGAAGGATATAT
AAACATAACACACATAGGAGCTAGCTCAAAATTGAAATAGAAGAGTTATAATTATAGACT
TATAGTGTAAGAGATGGGAGGGATTGCTTGGAGTGAAGAAGAAGATCACTTGCTGAAGAA
ATGCATACAACAACATGGAGAAGGGAAGTGGCATCGCATTCCTCTACTTTCTGGTGGTCC
TTAATTGCAGCTAGATTACCAGGAAGAACAGGAAATGATATAAAGAATTATTGGAATTGC
CATTTGAGTAGAAAGCCGAATGCTGAAGAAGATCAAAAGGAAGAGAAGCAAATCACAACC
AAAGTAGAAGTTTTAAGGCCCCAGCCACGATATTGTAATGCAACAACCCTAGTAGTGCAA
CCACCACCGTGCCTGCAGGAGGAGATGCCAAAATTGCAACCATCACAAGAAGCAAGCAGC
TCATCAAGTGCCCCGTTAATATTACCACATCCAGAATTTGAACAATCTCAGAACGCGGAA
AGCAATGAAAATCCAGGCAGTGAAGATGTCAATTTTGGTGATTTGCTTGCAGATATTGAC
TTTGATCTTGAACAAGTTATATTGACTGATTATAAGACAAGCAGCAATTGGGAATGGCCG
GATGATGATTTGATGGTCTTGGACATGGATATATGGACTCAGTCATTTTAAATGTACATG
TTTTTTCATTCATGGGTTATGGATAATAAAAGTTACTATATTATTATCAAACTCTCTTGT
GTTTTATTATTGTTATTATCATCATCATATATTCTGTTGGAACACAGTGCAGATGTCGAT
GATATTAGAATTTAAGGAAAATGTTTGAATTTTGAATTTTGAATTTTTTATTTTTCAATC
CAAT
>LITCHI003462.m1
GATATATTCAACCATCGATGTTCAATTTGCCTGGCCTAAAACATGGAAACTGCCGTACAG
ACTTAGAAAGTGGCGTGGACCATTGATCACCATAAGGTTTAATGCTTTGTAGTAATTAGT
TGTTATGGACTTTTAACTTCAAGAAAAACATCTCAATATATACATGACAGAAGGATATAT
AAACATAACACACATAGGAGCTAGCTCAAAATTGAAATAGAAGAGTTATAATTATAGACT
TATAGTGTAAGAGATGGGAGGGATTGCTTGGAGTGAAGAAGAAGATCACTTGCTGAAGAA
ATGCATACAACAACATGGAGAAGGGAAGTGGCATCGCATTCCTCTACTTTCTGGTCTAAA
TAGATGTCCAAAGAGCTGTAGATTGGGATGGATGAACTATCTTCGTCCAAACATCAGGAG
AGGGAGTTTTGCTGAAGATGAAATTGATCTCATTGTCAGGCTTCACAAACTCCTGGGGAA
CAGGTGGTCCTTAATTGCAGCTAGATTACCAGGAAGAACAGGAAATGATATAAAGAATTA
TTGGAATTGCCATTTGAGTAGAAAGCCGAATGCTGAAGAAGATCAAAAGGAAGAGAAGCA
AATCACAACCAAAGTAGAAGTTTTAAGGCCCCAGCCACGATATTGTAATGCAACAACCCT
AGTAGTGCAACCACCACCGTGCCTGCAGGAGGAGATGCCAAAATTGCAACCATCACAAGA
AGCAAGCAGCTCATCAAGTGCCCCGTTAATATTACCACATCCAGAATTTGAACAATCTCA
GAACGCGGAAAGCAATGAAAATCCAGGCAGTGAAGATGTCAATTTTGGTGATTTGCTTGC
AGATATTGACTTTGATCTTGAACAAGTTATATTGACTGATTATAAGACAAGCAGCAATTG
GGAATGGCCGGATGATGATTTGATGGTCTTGGACATGGATATATGGACTCAGTCATTTTA
AATGTACATGTTTTTTCATTCATGGGTTATGGATAATAAAAGTTACTATATTATTATCAA
ACTCTCTTGTGTTTTATTATTGTTATTATCATCATCATATATTCTGTTGGAACACAGTGC
AGATGTCGATGATATTAGAATTTAAGGAAAATGTTTGAATTTTGAATTTTGAATTTTTTA
TTTTTCAATCCAAT
>LITCHI003462.m3
GATATATTCAACCATCGATGTTCAATTTGCCTGGCCTAAAACATGGAAACTGCCGTACAG
ACTTAGAAAGTGGCGTGGACCATTGATCACCATAAGGTTTAATGCTTTGTAGTAATTAGT
TGTTATGGACTTTTAACTTCAAGAAAAACATCTCAATATATACATGACAGAAGGATATAT
AAACATAACACACATAGGAGCTAGCTCAAAATTGAAATAGAAGAGTTATAATTATAGACT
TATAGTGTAAGAGATGGGAGGGATTGCTTGGAGTGAAGAAGAAGATCACTTGCTGAAGAA
ATGCATACAACAACATGGAGAAGGGAAGTGGCATCGCATTCCTCTACTTTCTGGTCTAAA
TAGATGTCCAAAGAGCTGTAGATTGGGATGGATGAACTATCTTCGTCCAAACATCAGGAG
AGGGAGTTTTGCTGAAGATGAAATTGATCTCATTGTCAGGCTTCACAAACTCCTGGGGAA
CAGGCAAAATTTTCTCGGTCTCTTTTACTATCTTGAGTCCACAACATGTGTGTTAGATTG
GGTTCTATTGAATTTTGGTGTAACTGGTTTTTGATAATCTAAGTATAGTAGATAATGTTT
GATAGAAGGGATTGATATGGTAACAATGTTAATGGAGAATTAATTCAAATAAGACTTTTT
TTATCAAATAGATTCTAATATCATGTCAATTAGTTGCTCCAGCTACAAACTTAATTGTAC
AAGTAATACCAAACAATTTGATAAAATAAGATGTTATTTTTAGTACTTTCGTGTTGAGGA
AAAACTGGTGAGATGGTTTAATATACATCTGTTTACTGATTTCCTATGTATCTGTCCATT
TAAAATATATCGCATAGTTTTTTAAAAAGTATATATGTCAAGTAATTGTACAAGTAATAC
CAAACAATTTGATAAATAAGATGTTATTTTTAGTACTTTCGTGTTGAGGAAAAACTGGTG
AGATAGTTTAATATACATCTGTTTACTGATTTCCTATGTATCTATTCATTTAAAATATAT
TGCATAGTTTTTTAAAAAGTATATATGTCAAGTGATGTGAGATCAATATATGTTTGGTTT
GACAACCGATATAATAAATTGAATTGATGGTGTACAGCTCAATTTTTTATTCTGTGTGAC
AAAAAAAAAAGACATTCATGGCATACCTAAAAAAGTGTGTTCTCAATTTTAACATTATTG
TTGGGCTCTTACTTAACAATTTATTCTTTGGATCGAAAGGTAACAATGTTTTGGTTTTCA
GGTGGTCCTTAATTGCAGCTAGATTACCAGGAAGAACAGGAAATGATATAAAGAATTATT
GGAATTGCCATTTGAGTAGAAAGCCGAATGCTGAAGAAGATCAAAAGGAAGAGAAGCAAA
TCACAACCAAAGTAGAAGTTTTAAGGCCCCAGCCACGATATTGTAATGCAACAACCCTAG
TAGTGCAACCACCACCGTGCCTGCAGGAGGAGATGCCAAAATTGCAACCATCACAAGAAG
CAAGCAGCTCATCAAGTGCCCCGTTAATATTACCACATCCAGAATTTGAACAATCTCAGA
ACGCGGAAAGCAATGAAAATCCAGGCAGTGAAGATGTCAATTTTGGTGATTTGCTTGCAG
ATATTGACTTTGATCTTGAACAAGTTATATTGACTGATTATAAGACAAGCAGCAATTGGG
AATGGCCGGATGATGATTTGATGGTCTTGGACATGGATATATGGACTCAGTCATTTTAAA
TGTACATGTTTTTTCATTCATGGGTTATGGATAATAAAAGTTACTATATTATTATCAAAC
TCTCTTGTGTTTTATTATTGTTATTATCATCATCATATATTCTGTTGGAACACAGTGCAG
ATGTCGATGATATTAGAATTTAAGGAAAATGTTTGAATTTTGAATTTTGAATTTTTTATT
TTTCAATCCAAT
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>LITCHI021474.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AATCAAACAGCTTTTGATATCTTGATTATAATATAAATAGATGGAAAAGAAAAAGGAAGA
GAGAAGAATAAAAATAGGACAGACACAAATCTTTTAACCACATCATAGAATGTAGAAGTA
GGTGACCTACTACTGAGTTTCTTTTCCCAAGTCAAAAAAAAATCCCAACACCAGATAGAA
CAAAACAAATTGAATGAAACCTGTTTGACTTATCAACTGCAGTTTCCAGTGATCATCACA
GCCGATTGAGAGCTTCAGACCCCTGTTCTATGGTGGGACAACCTTTCTGTGGGCAATGAT
GTACTCGATAATTTCCTCCACAACTTCAACTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTATATATA
TGCACGTTTATGTATAATTCAAAATAAATATAGGACAATTATTAGATTTGAAAAAATAAA
CAAAAACTTATATTTATTTTTTTGTTTGATTGATTCCGATTGAAAATAATTATTTAAAAT
ATGAAAATAATTATTTTAAAAAAAGTCCACACAAACTTTAAAATATGTTTAATGTAAACC
GAATCTCTAATAATTTAATGAAAGAAGATATGTTCAACTATTTATATTAAAAGATAATGT
GTATAAAAATTATAAATTATTATATTAAAAAAATAAATATGAATTATTTAATTAAACTTT
GGATAGTAACATATGGCTTAATCCGTGACAAAAGTGCACATTTTAAAACTTCTTTATATA
TATACATACATAAGTGCACATTTTAACACTTTATATATATATACATTTGCAAATTACATA
CCATGTGTTATCAAAGACCAGACCATATTTATCGTTTGGACAGTAGTATAATGGTAAGTT
ACTACCGTCTATAATTTTCTCATGGCATGAGTTTTACAACTGGTTTCCCCAAAATTTGTG
AGTTTTTTTCCCAACCCATTATGAGTTACTCATCCCCCATTTGATATGAATTGTTCTATT
TTATTACTTGAAAACTATTTTCGAGACCATACTATCAAAGTTTTATCTCGTTTGATTCCG
ACTATCCCTTGAACTAATATCGGTACAAAAAAAAAAAGATTATGCTAGATTTTTATTAAA
TGTTTTTTTTTTTCCTATAAGTATTGCATGTAAAGAAGTAAATAATTGTTTAATTTGTAA
AATTTCGATATTGTTTATATTTTAAAATGATGGACATAAAATTTTAATCAAAAAATATCT
TTAATATTGTAGTGGGCTCTTGGCCCAATTGGTAAATATCATAACCTCCTATGTCTTATG
ACAGAAGTTCTATACCTAATAAAAATATTCTTCCTCATCAATTCGTATAGGTTGACCCTC
CACCTTTACGTGAGTGGTTTTCCTACATTCATATGAACTGATCATTTTCATATAAAAATA
ATTATCTAAACTGTGCTATTGATGTCTCATCTCAGTTGATATTAATTGTTTATTGAATCA
GTTCGAGTAATAAAAAAATATATATCTTTAATATTTTATTTAATAAATATATTTAAAATT
TTCATATATTGATCAGAATCAATATTTACTTGCTTACTAATACGTAAGTATATATGCAAG
GTTTCGATGCATTGACTGTGGAAAGAAAAAGTTGGACCAAAGGCAGAAAACGTGTTGGAT
AGAACCTGAAAAAACACCATGTAGAAATGGAAAACTCAGCAGTTTTTCACATGTAACCTG
AAACTAACTTAGCCACCGCCGTCTTTGCAGGGCGGGAAAATAAAATTCCCAAAACCCAAA
AAACTAAAATCCAAATATAAAAAAAAAACCTTTTAAAATATACATGTTAAAAAAATAATA
AAAAACCAATAAACAAAAAATTATCATCAGACATTAATTAAAGTGATATTGTCATATTAT
ATATCCAAGAATCCCAAACACAACTTCTTTTGGGTCCCTCACGTTGGGTGTCTTTATCTA
CACCTTTTTGTCCTTGTTTCTTCCTTTCTAGTCCAATTTTTTTTTTCGTTCTTCCCTTTA
TATCATCTTGCAAAAAACCG
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>LITCHI017940.m1 GenomeSequence - 
ATTCGACTTATGGTCTTGTGGTCAAACTTCAAATTAATTACAATGATTGAAGGGAAAATG
CATGACTCCCTATACTCTCTCACATGATCATAACAAAACCCAATTGAAAAAATATAGACT
CATCCTCATCATATAAATCTTATAATATAATATTATCTCTACTCCCACAAACCAGAGCAA
CGGTATTGGCTACCTATATAGTTTTATATGTTTTTGTTTAAGTTAGTATAAATATATATA
TACATATATGTTTAGAAAATCTGAATGGCTTTTGTCTTCCTCGTGAATTGCGTCCCTCTC
TCTGTTTTGTCTGTAAGCTGTAACACATTCTTGGACACTGTAAAATGTAAATACACACAC
ACACACACTCACTCACAGTCACAGAGAGAGAGAGAGACTGAAACCCCAAATCAGCATTTC
AAATTTTGAATGCCGTTTTGAACCACCCTTCTTTAGCTTTTCCAAGTAGTACTTATTATT
ATTGTTACTAGTTACTTACTACAAGCCCGCGTCTCTCACTCACTTTGACCACCTCGGTCA
CACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTGACCACCCACCACCACCTACGTTTTTTTTAACAA
ACCCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGAAGAAAAATAAGTTTCATTGAGGCATTTTA
TCGAACACTTTGCATTGCATTATCATTTTGTCATGGAAAAGAAGAGTCTCTGTGGTGCAA
ATTGTGACAATGAGTCTGTTACTAGTAGTAGTCTACATAGTGTGAGTTTTTGTAGTAGTA
GCACTGTTTCTGTATCTGGGTCTGATAATAGTGTCAGTAGTAGTAATATTAGTAGTAGTG
GTAGTGGTGGTGGTGCAAAGAAGAAAACTGTGGATGGTGTTGTTGTTGTTGAATGTTGTG
AAGGAGAGAGTGGGAAGAGTAGCTTGAGTGGTGGGGATGCAAGTGAGTCTAGTTTTAGGA
GTAGTTGTCTCTCAAAGCCTCATAAAGGCAATGACATGAAGTGGGAGGCGGTGCAATGTG
TGAAGAGTAAAGATGGTGAGTTGGGGTTGGGGCATTTTAGGTTGTTGAAGAAGCTTGGTT
GTGGGGATATAGGGAGTGTGTACTTGGCTGAGTTGAGGGAGATGGGTTGTTTGTTTGCAA
TGAAAGTGATGGATAAGGGGATGTTGGCTGGGAGGAAGAAGTTGATGAGAGCACAGACTG
AGAGAGAGATTTTAGGCTTGTTGGATCACCCTTTTTTGCCTACTCTTTATTCACATTTTG
AGACTGACAAGTTTTCTTGCTTGTTGATGGAGTTTTGCAGTGGTGGAGACCTTCATACTC
TCCGCCAGCGCCAGCCCGGAAAGCATTTTTCAGAATATGCAACTAGGTTAGTAGCTCTTG
TTACCCAAGTTTGAACTTATCGTGTTTTATTTATGTTAATTTGATTTAGTTTATATGCTC
ATCTATTTGGTGTTAGAAAAAAGAAGAATCAATGCAGGTGATATGAGTGTTCATATAGGG
AAACGCATATTAATAAAACAACGTTGAATAAGTAATCCGATTTTAATTTTAGTACAAGAT
TAAGATATCTCTTTACAACCTTCAGTATGGTCTCCGAGTTCAAGATTGTTAAAATATCTG
AAACAGTCTACTTGGTCGAGTCCTTTATGTACAACTCCTTCAAATTTGTCCAAATTAACA
ATTGGGGTTTCTCGCTGGCAGTCATGTTGACTTCCGTGGTTGAAAATTTAATGTACTAGT
CCATTGTGGTGGGTGTGAAAAAGGTTGGTAATTATGGGGGAATAATGTTTTTCTTGTCTT
GTGGATGTTGACATGATTGTGTAGACAGTGTAGTGATGCTCATTGCCTGCTTAGTGTCGT
TTCTTGCTAGTACCAGTAGTGAACAATTCAATGGCCTGCAAACATTAGGATGCAATGCAA
GCGTCATAGTCATGAACTCATGATTAATTTTCTAATAGCTTCTTTATGTTCTTGCAGGTT
TTACGCTTCTGAAGTGCTTCTTGCACTTGAGTATCTACACATGATGGGCGTCATTTATAG
AGACTTAAAGCCTGAAAATGTGTTGGTGAGGGAAGATGGTCACATCATGCTCTCTGACTT
CGATTTGTCATTGAGATGTTTTGTGAGTCCTACTCTTGTTCAGTCCAGTGATGACCCAGC
TTGTAGAATATCTGCCTACTGTATTCAGCCATCATGCATCGATCCATCCTGCAAATTGCC
CGTTTGTGTGGAGCCTTCTTGCTTACAACCCTCTTGCTTTAAGCCTCGATTTCTCAACTC
CAAGACATCAAAGGTGAAAAGTGAAAAAACAAGTTTGGCCAACTCCGATTCACTTCCCGT
ACTTATTGCAGAACCAACTAGTGCCCGATCCATGTCATTTGTTGGGACCCATGAATATTT
AGCCCCTGAAATAATAAGAGGGGATGGCCATGGAAGTGCTGTTGATTGGTGGACATTTGG
TATTTTCTTGTATGAATTACTCCTTGGAAGAACACCATTTAAGGGGAATGGAAACCGGGA
GACATTATTCAATGTTGTAGGTCAGCCCCTAAAATTTCCAGAGGGATCCTCTCTCAGCTT
TGCTGCTAAGGATTTAATCCGGGGACTGCTTGTTAAGGACCCACAGAAGAGACTAGGGTT
CAAAAGAGGTGCTACGGAGATTAAACAGCACCCCTTCTTTGAAAGCATTAATTGGGCTCT
AATTCGCAGCACTCACCCTCCAGAAATTCCTAAACCAATCGATCTCATATTCTTAAATCA
CTCATCGAAGTCCTCCATGCCACAAAATAATAAGGCAACTTCAGACTCGGATAGGTCTTC
AGGTCCTTACTTAGATTTTGAATTTTTCTGATGATTGTTTTCGCCGGCAAAATTGTAGTA
GTTAGTTATTCTTGAGGTGTTTAGTTAGATTGTTGCTGTGTATTCATTCAAGTGCTCAAT
GAAATCTTATCTTTACAAGGTTCTAGTCCATTTCATGACTCAAAATGTGCTTGTCATTAT
TTGTTGTTCTTATGTTTGCTTTCTTGCAACAATTGGCATATGAATGAGAAGCGAGGACTT
AGAACCCCCACTTGATGCACCCTCTACTTCCAAAAAAGATGACCAAAAAATTGAAGCTGC
TTTTGTAGTTGATTTTGTCTTTCTCACCCCAAGTAGTGGTCCTCCATGTGGTGGGGCTTC
AAACCCTTGTTCATATGTTCCTTTTTGCTCAGTCACTCTTTGTCTAAAACCTGTATTGTC
CCAGTTATTCTCTTATCCAGAACTTTACCTGCAAATGAGGCTTTTGAAAAAGCAAAATTT
TGAAAACAAC