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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005103 | Chr14 | 6684621 | 6687271 | - | Homeobox-leucine zipper protein HAT5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005103.m1 | 78 | 132 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 58.7 | 4.00E-16 |
LITCHI005103.m1 | 134 | 174 | PF02183.21 | HALZ | Coiled-coil | 40.1 | 3.40E-10 |
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>LITCHI005103.m1 ATGGCAGATGGAGAAATCTGTGGCAGTTCAAGTGTTACCGCTTTGCTAAGAAACGAGAAG CTATCTTGTTCTTCTGATGTTCTTGAGTCACTTTGGATCCCCAAACCATCCTCTGTTGTT CATGAGAATGTTGGTGGAGGAGACACATCAGGGACACCGTATTTTCAATCACTTGATGAT AAAGAAGAGAATGGATATGAGGACATTGATGGGTGCTTGAATCCACCTGGAAAGAAGAGG CGGTTGACCGCCCCTCAAGTTCAGTTTCTGGAGAAGAATTTTGAGGTGGAGAACAAGCTT GAACCTGAGAGAAAGGTCCAACTTGCAAAGCATCTTGGGCTGCAGCCTCGACAGGTTGCA ATTTGGTTCCAAAACAGGCGTGCCCGGTTCAAGAACCAACGACTCGAAAAGGAACATGAT GCTTTGAAAGCTGTCTATGATAAGCTCAAAGTTGATTATGATAACCTCCTAAAAGAGAAG GAAGTTCTGAAGGATCAGGTTGTTTTACTTAAAGACAAGTTGCTTCTGAGAGAGAAAGAG CAGGGAAATTTGGAGATACTTGATGTCATCAAAACATTAGAGACAGAAGAGCCTCAAAAG CCAATCATGGATGGAGATATTAAAACTGTACTGTCCGCTCCACCAATGGTGGTTTGTAAG CAGGAGGATGCTAGTTCAGCCAAGAGCGATGTTTTCGACTCGGATAGTCCACATTACGCA GATGGGAACCATTCTTCTCTGACAGAACCTGCTGATTGCTCTCAAATTTTTGAACCAGAA CAATCTGATTTCTCACAAGATGAAGAGGACAACCCCAATTACAACATGAACCTTTTGCCC CCACCATCATGCCTGCTAAAACTTGAAGAAGATTGCTATTATGATGATGCCCCACCAACA AATTATTGTAATTTTGGATTCACTGTGGAGGATCAACCCTTTTGGTCCTGGTCTTATTAA
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>LITCHI005103.m1 MADGEICGSSSVTALLRNEKLSCSSDVLESLWIPKPSSVVHENVGGGDTSGTPYFQSLDD KEENGYEDIDGCLNPPGKKRRLTAPQVQFLEKNFEVENKLEPERKVQLAKHLGLQPRQVA IWFQNRRARFKNQRLEKEHDALKAVYDKLKVDYDNLLKEKEVLKDQVVLLKDKLLLREKE QGNLEILDVIKTLETEEPQKPIMDGDIKTVLSAPPMVVCKQEDASSAKSDVFDSDSPHYA DGNHSSLTEPADCSQIFEPEQSDFSQDEEDNPNYNMNLLPPPSCLLKLEEDCYYDDAPPT NYCNFGFTVEDQPFWSWSY.
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>LITCHI005103.m1 ATTATGAGTTTTCTCTTGCTTTAACGTGAGTCACTCTCCTTTTAGAATCGTATTATTGGT GTTCTATCTCATTTGATTTTATTTATTTTATGGGCTAATTTTAAAACTTAAAAAAAAAAA AATTGTTTTGTTATTTTGTGTTTTGTTTATTATTTAAAAGGTAAAAATAACAGAAAAATA GAAAATCAATGTACATGAAGGTAACTTGAACAAGACGTAGTGCACCAACCCAAACAAAAG CAACATCATCCCCTGTCCCTTCACCAGGCCTTGTTATAAACCCCATCAAGGCCTCCTTCC CAGAGAAGATTCTCCCTTTGCCACCCCACAAGTTTTCAACTTCCAATCAATCTCTCCTCC TGTCTTTCTCTCGCTCTCTCTTTTCTATCCGTTTTTCGAAAAAGAAAAAGAGCAAACTTT CAACTTCTCATCAGCTCCTCTCTCTGTCTATCCATCAATATAACAATCCAAAAGCAGAGG TTTTTTGGTTCCAAACTTTGAAGCTTAACAATTTCTTACTTTTTCCCCCCTTCTTCCTTT CAGTTTGATGGTTGTGAGGTGTTGTTGTGACTCTCTCAAACTTTCCACAAAACAGCGATA CACATCACCAGCCTTTTTAATCTCCACAACTCACAAACTATAGATCAAAATAACCAACAC CAACTACATGACCGTTGCTACTTCTCTTATTATGAACTTCTAACCTTTTTAACTCTCTCA CTCTCTAACAATTCAAAACAAACCAACAAACAAACAAACAAGCAAAAAAATATGGCAGAT GGAGAAATCTGTGGCAGTTCAAGTGTTACCGCTTTGCTAAGAAACGAGAAGCTATCTTGT TCTTCTGATGTTCTTGAGTCACTTTGGATCCCCAAACCATCCTCTGTTGTTCATGAGAAT GTTGGTGGAGGAGACACATCAGGGACACCGTATTTTCAATCACTTGATGATAAAGAAGAG AATGGATATGAGGACATTGATGGGTGCTTGAATCCACCTGGAAAGAAGAGGCGGTTGACC GCCCCTCAAGTTCAGTTTCTGGAGAAGAATTTTGAGGTGGAGAACAAGCTTGAACCTGAG AGAAAGGTCCAACTTGCAAAGCATCTTGGGCTGCAGCCTCGACAGGTTGCAATTTGGTTC CAAAACAGGCGTGCCCGGTTCAAGAACCAACGACTCGAAAAGGAACATGATGCTTTGAAA GCTGTCTATGATAAGCTCAAAGTTGATTATGATAACCTCCTAAAAGAGAAGGAAGTTCTG AAGGATCAGGTTGTTTTACTTAAAGACAAGTTGCTTCTGAGAGAGAAAGAGCAGGGAAAT TTGGAGATACTTGATGTCATCAAAACATTAGAGACAGAAGAGCCTCAAAAGCCAATCATG GATGGAGATATTAAAACTGTACTGTCCGCTCCACCAATGGTGGTTTGTAAGCAGGAGGAT GCTAGTTCAGCCAAGAGCGATGTTTTCGACTCGGATAGTCCACATTACGCAGATGGGAAC CATTCTTCTCTGACAGAACCTGCTGATTGCTCTCAAATTTTTGAACCAGAACAATCTGAT TTCTCACAAGATGAAGAGGACAACCCCAATTACAACATGAACCTTTTGCCCCCACCATCA TGCCTGCTAAAACTTGAAGAAGATTGCTATTATGATGATGCCCCACCAACAAATTATTGT AATTTTGGATTCACTGTGGAGGATCAACCCTTTTGGTCCTGGTCTTATTAATAAGTTATC TACCCCTTTTAAGTCTAAGCTTATAATGTGGGACACCTTGCTTGTTCAACATCTCAGTAA TGCAAAAATTTTTCACTTCTCACTTGTGTAATTAAAGTTGCGTGACTTTCTGTTTAACTG GCTAGGTGGGGGTTTTTGAATGCAGTTTCTCAAATGAATTTCTATCTCCAAGTCAAAAAA ACATTAAACAACATGTGAAAAATAATAAACCGCCGGCTGAATTAAGTAGGATGTCACAAT CTATGCGCTTCAAAAGCCTAAGTTCGCGAAATGAACGTGAATAATAAGATAAGTTGATCA ATGTAAAATCCAAAACCTGTGTATTCTTTTAAAACAGCGTAACCAATTGGTTTGAATTCG AGCAATGAAAAGTTTGAAAAAGGGAA
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>LITCHI005103.m1 - Up_Stream_Len 2000 GACAAATAGCTCTCTCGTGTATTCATTTAAATATGGAATGAATCAGACTCAGCTGGCTAA TAATTGGATCAGAAACTCAAAAAACGCAAGAGTAGACTTTACCATAGTGAATACATATTT CTAACAACTGTCATTTTTTTTTATAAAATAATTGTTACTGAGAGTACTGCAGATTTTGGA CAATAATCGGTATTCCTTGCAAGACTGCAATTTATCCGAATCATCATTAACTCATCTGCA TTTCATTTGCTCAATGAAAATTATGTGAACTCACATAAACAGGAAAAATAATAAAATATC GGTATTTTAGTTTTTTTATGTGCATAAACATTATAAAAATGCAATTCAAATGTGACCATT TTACTAATTTAATTACAATTACTGGATTGGTTATAAGATTTTTTAATAACTATCCTTATA ATTAATTCAATGATTGTTATTGAAGAAATTAGTTTACCAAAACTAATATTTTTTATTATT TTTTTAAATTTTTACTTATTAATAAGGATTTTACTTAAAAACCTCTTACATGATTTCAAT ACATAACTAAACTAAATGAAACTTTGGTACACATAATTGTGTGTGTATGTGTATATATAT AATATTTATTTTAAAAAAATGATACTAAATAAAGTGAAAAAAAATTATTGAAATTTAAAA ATACAAACACTATATACGCATTAGATGTCTACATGTCCAATCCAAATATTTATTTTTTTA TTGGAAGAGAATCCAAATATTTACTCTTTAACACACTTATTGATAAATACAATGAATGAA AATGAGGCTTGACCTATTAATTGCTAAACCAAGAGGGATTTGCATAGTATGTGGATTTAT CTTAATCCAATTGACATGAGATTTGTTTCCATCATTACTAACTTTCAACGTAAAATTCTA TTTACCTAACGTGCGTAAATTCGAATATAAGATAATTCTTATTAAAATTATAGTCATTAT CTATTTACAAACTATTTTATTATTATAGTTTGGGAAATGCCTCATGGGTTGAGGCACTAC CTCTGTGTCTTTAGTCCTATATCCGGTGGCGCCCTCACCCTCTCTCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCAAAAAAAAATCTATATATATATGAGTTTTCTTACTTTAACGTGAGTCACCTCC TTTTAGAATCGTATTATTGGTGTTCTATCTCATTTTATTTATTTCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCTCCCAAAAAAAAAATCTATATATATTATGAGTTTTCTCTTGCTTTAACGTGAGT CACTCTCCTTTTAGAATCGTATTATTGGTGTTCTATCTCATTTGATTTTATTTATTTTAT GGGCTAATTTTAAAACTTAAAAAAAAAAAAATTGTTTTGTTATTTTGTGTTTTGTTTATT ATTTAAAAGGTAAAAATAACAGAAAAATAGAAAATCAATGTACATGAAGGTAACTTGAAC AAGACGTAGTGCACCAACCCAAACAAAAGCAACATCATCCCCTGTCCCTTCACCAGGCCT TGTTATAAACCCCATCAAGGCCTCCTTCCCAGAGAAGATTCTCCCTTTGCCACCCCACAA GTTTTCAACTTCCAATCAATCTCTCCTCCTGTCTTTCTCTCGCTCTCTCTTTTCTATCCG TTTTTCGAAAAAGAAAAAGAGCAAACTTTCAACTTCTCATCAGCTCCTCTCTCTGTCTAT CCATCAATATAACAATCCAAAAGCAGAGGTTTTTTGGTTCCAAACTTTGAAGCTTAACAA TTTCTTACTTTTTCCCCCCTTCTTCCTTTCAGTTTGATGGTTGTGAGGTGTTGTTGTGAC TCTCTCAAACTTTCCACAAAACAGCGATACACATCACCAGCCTTTTTAATCTCCACAACT CACAAACTATAGATCAAAATAACCAACACCAACTACATGACCGTTGCTACTTCTCTTATT ATGAACTTCTAACCTTTTTAACTCTCTCACTCTCTAACAATTCAAAACAAACCAACAAAC AAACAAACAAGCAAAAAAAT
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>LITCHI013813.m1 GenomeSequence - ATGAATGGAATTATGCATAGGGACATTAAGGTTATTTTATTTAGTTCTTCCAAAGAGAAA CTTTTATACATTTGTCTCAAGCTTGATTTAACGAGGGGCATGTTTCATTTAGGGAGCAAA AATTCTTGTTGATAATAAAGGCTGCATTAAGCTTGCAGACTTTGGTGCATCCAAGAATGT TGCAGAGCTAGTATGATTTTTATTTTGTTTGTTTTTTAAGTAACAAAAGAAATTTGTTTT CCCTTGTACATTTTGCATGAATTTCAGGTTTTAACATTGCCATAGGCTGCAATAAATGGT GCTAAGTCAATGAAGGGTACACCATGTTGGATGGCTCCAGAGGTTATTCTTCAGATTGGG CATAGCTTGTAAGAAAGATTTTCACATTCATGCTTACAGATATTGACATTTATTTGATTG CCTTGACACTGTTAAATTAGAATGTCTATGCATTGCCATGAGTGTGCCTTTTCAATAAGT TCTTTTTGTTTGTTTATATTTGCTGAAAATTATGCTTTTAGTGAGACCCAATTACAAGGC ATGCTAATTACTATGTCATTATGATATAATTTTTTTTTTTAATAAAAATGAGAGCGAGAA AGAGATAAAACAAAGAGCCTGAATTGTCATGTGTTTTTTTTAATAACTTTTTATTTTATA GGTTGCAAAGTATGATGTCACGTTTATATAATGAGAGTTTGAATATCTAATAATATGATG TCTTGTTTGTTTGTTTTAGTTCTTCATTTAAAAAAAAAAAAGTTTAGTTTTAAGGTTTTA ATGTCTTTTTATTAAGAGTTGTAAGTGGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTT TTAAATTTAAATTTTTATTTTTATTTTAATGTTTTGGTGTAGATAAATGTTGAGGAATGT TTTGTGTTTCTGTTGTTCCTCTTGTTTATGTTTTGTTTAACGGTGACATTGAGTGGGGTT TAAAAACATGTTTGGTAAAATTTATGGTTTTAATATTGGTTTGAAGTCCTTATGTTGAAA ATGAAAATGATGATTATTGATGTGTTTCAAATGTTGATTTTGTATGTTTCTTTGTTCTGC ATTTGGATTTTTATGTGTTTTAGGATTTTGAAGACTCTCTGCATTTGTATTTTTGAAATG TTTCTTTACCATTTGGATTCATAATTGCATATTCAAATGTTTCCTTACTCTGCATTTGAA TTCATAATTTCATATTTGTAGATTGTTGAGAGATTGAATCCAACGCCTCACTCGAAGGAG ATTAAGCTTCAATTACTGCAAGACGTAGCTCAAGAATTCTCCATAGAATGGGATTCCAGG GCCTTGCAACATTTATTGTATACACCATTACCACTTGCCCTGGTGAGCCTTCCTCCCTGT GATTTACTACATTATTTAATCTTGATAGTGGAAAGGAAATTAAAGTTATATCTAGTATAA CAGCTTAAATGCTTGAATATAAGTTTCAGTTTTGATTGTGCTTTATCTCCAATCAATTAC TTGAATGTTAAAACTTCCCTTACATTCAACTTCTAATATGTTGAAATTGAATATGCATTT GATTTAATATATGCTAATAAACTTGCAAACATCCTTGGACTTTTTATAGCACAATTCGAA GTGTGGATCTTTCTATGACAAGGATGATGATGAATCAAAACAGTTGAAACAAAGGGATGA TGATTACAATTTACCAAGTAGCAGTGTTTCTTATGTGAAATTACATCAAGTATTTTTTTT TTTTTTTTGATAGAAGGTTGTTGTTCAGAGCCAATTTATTATTAAAAATAAATAAAAGGT TACAAAAAGGAACCAACTAGAACTTCTCAAAGCCGAAACTAACAAAATCAAGTATGACAC ACTATGAGGTTTCTGATTTTGTATTATAGTTGGTTGACTCATTATAATAACGACTGACTT CGCTTCAAACATATGTTACCTATGTATGAAACAAAGAAAAATACATTTGTTATCAAAGTG TAATTTGGGCACTTAATGTATTGAACCCTTCAAAAGGGCATGCAACATGCATCCTAAACA GTAAACACATAATTTGATCTTGTGCAAGTTTACTTGTAGACTTCCTCATTTGTAACTTGC AATATTTCACTCTATAACAACAATCAGTCTCTCTATAGTAGCTTTTATTGATTGTAACTA TGATATGCCATTTTTTTTTAGTTTAATGATTCAGCAAAAATAGTTATTAAGTTGATAATG AGAAGTGACAGATGTTGGTCCAAGGCCATGAAGATAGCTCTGCTGTTGGAGATGGTTAG