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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI005054 | Chr14 | 6258067 | 6261309 | + | Transcription factor KUA1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI005054.m1 | 96 | 141 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 43.4 | 3.20E-11 |
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>LITCHI005054.m1 ATGTCTCGCAGCTGCTCGCAGTGTGGAAACAACGGCCACAACTCGCGCACCTGCGCTGAG GCTGCTGGTGGTGGAAGCAGCGGCGCTGGCTCCTCTGCCGAGAACGGAATCATGCTGTTT GGTGTGCGAGTCACTGAGGCCTCCTCCTCCTTTAGAAAAAGTGTTAGCATGAACAATCTC TCCCAATTCGATCAGCCTCCTCAGGATTCAAACGCCGATGCTGGCTATGCCTCTGATGAC GTCGTCCACCCCTCCGGTAGAAGCCGTGAACGCAAGAGAGGAGTTCCATGGACAGAAGAA GAGCACAAGCTATTCTTGTTAGGGTTGCAAAAAGTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATT TCAAGAAACTTTGTGAAGACACGTACACCTACTCAGGTTGCTAGTCATGCCCAGAAGTAC TTTCTCCGTCGCTTCAACCAGAACCGGAGGCGCCGCAGATCTAGCCTTTTTGACATCACT ACTGATACTTTCATGGGGTCGTCAATGGAAGTAGACGAACAAGCTCATCAGGACAAGGTG ACTCTACCTCCACCACAGCCACAGCCACAGTCTCAACGGGCTTTAACTTGCAATCTAGGG TCATTTCCAGATGTGTCGACAGCTTATCCGGTGAAACTGAGTACGGTGGTGTTACCGGTG ACCGGGGAAAGTCCTAACTCTGTGGAGAATTTCACTTTAGGAACAACCAACCAACAGAGA ACATCATCAGCAAAGCTCATCCGTCCAATACCGATTCTTCCGGTTCCTCCTTCTTCAAAA ATGGCTGATCTTAACCTGAACCAAAAGCCCAACCACGTGGACCCACTGCCTTTATCACTC AAGCTGCCATCTACATCAACTCCCGAGGAGCAGTCATCAACACCGACACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACTACAAGTTCTCACTCGTCAGCTTTTCAGGCCATGTCCAGCGGCG ATAGCATCATCAGTGTTGCTTGAAGAAACATATATATGA
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>LITCHI005054.m1 MSRSCSQCGNNGHNSRTCAEAAGGGSSGAGSSAENGIMLFGVRVTEASSSFRKSVSMNNL SQFDQPPQDSNADAGYASDDVVHPSGRSRERKRGVPWTEEEHKLFLLGLQKVGKGDWRGI SRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRRFNQNRRRRRSSLFDITTDTFMGSSMEVDEQAHQDKV TLPPPQPQPQSQRALTCNLGSFPDVSTAYPVKLSTVVLPVTGESPNSVENFTLGTTNQQR TSSAKLIRPIPILPVPPSSKMADLNLNQKPNHVDPLPLSLKLPSTSTPEEQSSTPTQQQQ QQQQQLQVLTRQLFRPCPAAIASSVLLEETYI.
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>LITCHI005054.m1 CACAGCCACAAAGAAAGGTTGAGGTGAAGAGAAAGGGTAAGGTGGTGATGATGGTGATTG GTGGACTGAAGAGAGAGAAGATCATCATATTCATGTTGGTGATTAGTGGGGTCCATGTTC TCTTATCCTGCTCAACCACACCCACCACATTGAGACAATTAAATATGGGAAGTAGAGACA ACGAAATCTTTCTCAAACAGGTACCGAAGATGCCAAGTTGACGGTCGAGACACACTTTGT TTCTCCACCATCTCTTTTTTATTATTTTTCTCCTTTTAGTTTTATCATTACTATTTCATC AAATCTCTACGTTAGTTTCCACTAATATGCAGACATTTTGCACCAACTATATGCATTACT TTCAACAACAAATTAAATATATTTATTGATATGGAATAAGATAACTTATCTAACTTTATT TTTTTCTTGATTTTATATTATTTTAAATAGGATAGGATTTTATAGAGATTTCTACAGATT TTTTTTAATGAAAATCTTTTAATTTCTGTAGTTGAAAAATCATTTGACGACTTCTAAAAT CATTAAAACAACTTGTTTATATAATCCAAAAACTTAAACAGTTTCATTGCTTTTTAAAGA ACATATTTTAATTAACTCATTATTCTAACATAAACACATGTCGACTAGCCATTGGAGGGC TAAGCACTAGCTGCGGATAGGTTAAATCTGGGCCAGCCAATAACCAGAATCAGATTGGTG GAAACAAAGAATATACCAATATCTACAATTAAAAATGTTTAATTGCCAAATGCGTGAGAT CAAAGGGTGATCATTGGACGATGGCCAGGATTTTTTTTTCTTTTTTAAATTTTTAATTAT CAAACGTCTGCCCATGATGAGATGATATTACTAGAACATTTTGTTTCGGTCGTATCGTAG TGAGGTGAGACACATTGGACGGTCCTGATTCAGGTTGTGGTACAATATATAGCAGTCAAT GGTTCTGCGAAGCATTGTGACGTAACCTTTCCTATAGATTTCACTAACCACCATTCAGAA GCACAAAACAAAATCCTTAATATCTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAACA AAAAAAGAAAAACAAAATCCTAAATAAAACAGCCCTCGCTATCATTTTTTTTCTCTATAT AAATCAAGTAATTGCACTAGAAGTCATTTTTCCTATTCCTTTTTATTTTTCTCTTGTTGC ATGGACTGAGAGAGATTATATTAGACTTTCTCTCTCTTATAAATTTTCTTTCTGTCTCTT GGAACCAGCAAGCAAGCAAGTACAACAAGAAGAAAGAAGATGTCTCGCAGCTGCTCGCAG TGTGGAAACAACGGCCACAACTCGCGCACCTGCGCTGAGGCTGCTGGTGGTGGAAGCAGC GGCGCTGGCTCCTCTGCCGAGAACGGAATCATGCTGTTTGGTGTGCGAGTCACTGAGGCC TCCTCCTCCTTTAGAAAAAGTGTTAGCATGAACAATCTCTCCCAATTCGATCAGCCTCCT CAGGATTCAAACGCCGATGCTGGCTATGCCTCTGATGACGTCGTCCACCCCTCCGGTAGA AGCCGTGAACGCAAGAGAGGAGTTCCATGGACAGAAGAAGAGCACAAGCTATTCTTGTTA GGGTTGCAAAAAGTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATTTCAAGAAACTTTGTGAAGACA CGTACACCTACTCAGGTTGCTAGTCATGCCCAGAAGTACTTTCTCCGTCGCTTCAACCAG AACCGGAGGCGCCGCAGATCTAGCCTTTTTGACATCACTACTGATACTTTCATGGGGTCG TCAATGGAAGTAGACGAACAAGCTCATCAGGACAAGGTGACTCTACCTCCACCACAGCCA CAGCCACAGTCTCAACGGGCTTTAACTTGCAATCTAGGGTCATTTCCAGATGTGTCGACA GCTTATCCGGTGAAACTGAGTACGGTGGTGTTACCGGTGACCGGGGAAAGTCCTAACTCT GTGGAGAATTTCACTTTAGGAACAACCAACCAACAGAGAACATCATCAGCAAAGCTCATC CGTCCAATACCGATTCTTCCGGTTCCTCCTTCTTCAAAAATGGCTGATCTTAACCTGAAC CAAAAGCCCAACCACGTGGACCCACTGCCTTTATCACTCAAGCTGCCATCTACATCAACT CCCGAGGAGCAGTCATCAACACCGACACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTACAA GTTCTCACTCGTCAGCTTTTCAGGCCATGTCCAGCGGCGATAGCATCATCAGTGTTGCTT GAAGAAACATATATATGATGACGATATATAAATTTGTTGACCAAATTAGATATGTTGTAA ATTAAGGGTTGGGAGTGGGAAAGTTGGGAATATTTTGAATTAGATTAATGATAATGTTGG ATTAATCAAGTTAATTAAAAAGATTAGGTAATTAAATTATTATTAGGGCGATTAGGTGAT TCCTTGTTTGTACAGGTTAGAAGATGAGACAGAGATGGGCTGTCTTTTTCGTTTGTGGGG GATTCTTGTTTGTTTTGTCCAGTTTGTTTTGTTGTGAAATGACACAGAACCGGGTACGCT TTGCCTAGTTGTGTTCTTTGATTGGTCATACACTTGAAACGTCAACACAAGTAGGTAAAA TATCTTGAAACTGAATATTCTGTTTTGAGTGATTTTCTATTTTGATGCTATTATGATTTT GTGGAGAATAATCTAATAAGCTGTTATTCATTACTTTTTCTATAATAGAAACCTATAATG ATCTCTTTAATTACATAATATCCAAGGACCATACCCTCAGGCTGGGTGGGATCCCGTTAC ATAGCTGTGAGAAATCTAATAATTTGGTCGTTTTAATTTGTGTTATTGGTTCTTGGAAGA TCTTGTGATTTTTTTTTCTGAAGTACATGTGATTTTTCTTGTTATTCGTGGTTGTGTGTA AGCAAAAAAGATTAAAAA
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>LITCHI005054.m1 + Up_Stream_Len 2000 CACCTTACAACATCCTCATTCCTTCATTGCCTCATTGGATGCAAGATCTGTTACTATTAC TCGTGGGATCGAGCTGACCGATATATCGGCCATGCCCCTCTAGATTTTTTTTTTTCCATG GATATCTCTGTCCAGTTATATATGGAAAATTTTTTAACTTATTTAGGAGTAAACGTTGTA TGTATTAACCCAATGGTTTTAATATTTGATCTCTTACAGTAAGGTTATCTAGTGTGACAC AAAAAAGTGAGAGAAAGCCAGATTGAAATACTTTAATGTTGAAGCCTATTTCTAAACGTA GTCAAACTACGTAAAATTCTTATGTCTTTTATTTGCTGCTCGTGTTTGTGTTTGGATTTT TTCAACAAAATCTTGAGTTAAATTTGTTTAGAATGTATAAAATTACATATAAGTGTAATT CTTACATGTAAGATCTTAAATCTATTTGGAAAATTATAGTTTGATATTTTAATTGTTCGA GAAGATATATGACAGAATTAATGTTCCATGAATTTGTGATTTAGTTGATTTATGTGTAGT AGTGTAAAGATGGTGGACTTTGAAAAAACAATGTCAAACAGGGGGTGTTACTTCGGGGGC CCTGAAAACTCAAATAAGATTGAAAAAGGAAACCGTGTATGAAAATGAAATATACGATAA AAAGAAGGAAAGCAAAGCAAAGCTAAAAAGCATCCACCCACCACAGCCACAAAGAAAGGT TGAGGTGAAGAGAAAGGGTAAGGTGGTGATGATGGTGATTGGTGGACTGAAGAGAGAGAA GATCATCATATTCATGTTGGTGATTAGTGGGGTCCATGTTCTCTTATCCTGCTCAACCAC ACCCACCACATTGAGACAATTAAATATGGGAAGTAGAGACAACGAAATCTTTCTCAAACA GGTACCGAAGATGCCAAGTTGACGGTCGAGACACACTTTGTTTCTCCACCATCTCTTTTT TATTATTTTTCTCCTTTTAGTTTTATCATTACTATTTCATCAAATCTCTACGTTAGTTTC CACTAATATGCAGACATTTTGCACCAACTATATGCATTACTTTCAACAACAAATTAAATA TATTTATTGATATGGAATAAGATAACTTATCTAACTTTATTTTTTTCTTGATTTTATATT ATTTTAAATAGGATAGGATTTTATAGAGATTTCTACAGATTTTTTTTAATGAAAATCTTT TAATTTCTGTAGTTGAAAAATCATTTGACGACTTCTAAAATCATTAAAACAACTTGTTTA TATAATCCAAAAACTTAAACAGTTTCATTGCTTTTTAAAGAACATATTTTAATTAACTCA TTATTCTAACATAAACACATGTCGACTAGCCATTGGAGGGCTAAGCACTAGCTGCGGATA GGTTAAATCTGGGCCAGCCAATAACCAGAATCAGATTGGTGGAAACAAAGAATATACCAA TATCTACAATTAAAAATGTTTAATTGCCAAATGCGTGAGATCAAAGGGTGATCATTGGAC GATGGCCAGGATTTTTTTTTCTTTTTTAAATTTTTAATTATCAAACGTCTGCCCATGATG AGATGATATTACTAGAACATTTTGTTTCGGTCGTATCGTAGTGAGGTGAGACACATTGGA CGGTCCTGATTCAGGTTGTGGTACAATATATAGCAGTCAATGGTTCTGCGAAGCATTGTG ACGTAACCTTTCCTATAGATTTCACTAACCACCATTCAGAAGCACAAAACAAAATCCTTA ATATCTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAACAAAAAAAGAAAAACAAAATC CTAAATAAAACAGCCCTCGCTATCATTTTTTTTCTCTATATAAATCAAGTAATTGCACTA GAAGTCATTTTTCCTATTCCTTTTTATTTTTCTCTTGTTGCATGGACTGAGAGAGATTAT ATTAGACTTTCTCTCTCTTATAAATTTTCTTTCTGTCTCTTGGAACCAGCAAGCAAGCAA GTACAACAAGAAGAAAGAAG
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>LITCHI005054.m1 GenomeSequence + CACAGCCACAAAGAAAGGTTGAGGTGAAGAGAAAGGGTAAGGTGGTGATGATGGTGATTG GTGGACTGAAGAGAGAGAAGATCATCATATTCATGTTGGTGATTAGTGGGGTCCATGTTC TCTTATCCTGCTCAACCACACCCACCACATTGAGACAATTAAATATGGGAAGTAGAGACA ACGAAATCTTTCTCAAACAGGTACCGAAGATGCCAAGTTGACGGTCGAGACACACTTTGT TTCTCCACCATCTCTTTTTTATTATTTTTCTCCTTTTAGTTTTATCATTACTATTTCATC AAATCTCTACGTTAGTTTCCACTAATATGCAGACATTTTGCACCAACTATATGCATTACT TTCAACAACAAATTAAATATATTTATTGATATGGAATAAGATAACTTATCTAACTTTATT TTTTTCTTGATTTTATATTATTTTAAATAGGATAGGATTTTATAGAGATTTCTACAGATT TTTTTTAATGAAAATCTTTTAATTTCTGTAGTTGAAAAATCATTTGACGACTTCTAAAAT CATTAAAACAACTTGTTTATATAATCCAAAAACTTAAACAGTTTCATTGCTTTTTAAAGA ACATATTTTAATTAACTCATTATTCTAACATAAACACATGTCGACTAGCCATTGGAGGGC TAAGCACTAGCTGCGGATAGGTTAAATCTGGGCCAGCCAATAACCAGAATCAGATTGGTG GAAACAAAGAATATACCAATATCTACAATTAAAAATGTTTAATTGCCAAATGCGTGAGAT CAAAGGGTGATCATTGGACGATGGCCAGGATTTTTTTTTCTTTTTTAAATTTTTAATTAT CAAACGTCTGCCCATGATGAGATGATATTACTAGAACATTTTGTTTCGGTCGTATCGTAG TGAGGTGAGACACATTGGACGGTCCTGATTCAGGTTGTGGTACAATATATAGCAGTCAAT GGTTCTGCGAAGCATTGTGACGTAACCTTTCCTATAGATTTCACTAACCACCATTCAGAA GCACAAAACAAAATCCTTAATATCTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAACA AAAAAAGAAAAACAAAATCCTAAATAAAACAGCCCTCGCTATCATTTTTTTTCTCTATAT AAATCAAGTAATTGCACTAGAAGTCATTTTTCCTATTCCTTTTTATTTTTCTCTTGTTGC ATGGACTGAGAGAGATTATATTAGACTTTCTCTCTCTTATAAATTTTCTTTCTGTCTCTT GGAACCAGCAAGCAAGCAAGTACAACAAGAAGAAAGAAGATGTCTCGCAGCTGCTCGCAG TGTGGAAACAACGGCCACAACTCGCGCACCTGCGCTGAGGCTGCTGGTGGTGGAAGCAGC GGCGCTGGCTCCTCTGCCGAGAACGGAATCATGCTGTTTGGTGTGCGAGTCACTGAGGCC TCCTCCTCCTTTAGAAAAAGTGTTAGCATGAACAATCTCTCCCAATTCGATCAGCCTCCT CAGGATTCAAACGCCGATGCTGGCTATGCCTCTGATGACGTCGTCCACCCCTCCGGTAGA AGCCGTGAACGCAAGAGAGGTACTTTTTTTTGGGTTTATTTTTATTTTGTTGTGTTTAGA TGAATATATTTATATATAACTGAGAATATTTTATTTTAAGATCCGATCATGAAAATTTGT TAGATTCTTTTTCGCGTGTGCAGGAGTTCCATGGACAGAAGAAGAGCACAAGCTATTCTT GTTAGGGTTGCAAAAAGTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATTTCAAGAAACTTTGTGAA GACACGTACACCTACTCAGGTTGCTAGTCATGCCCAGAAGTACTTTCTCCGTCGCTTCAA CCAGAACCGGAGGCGCCGCAGATCTAGCCTTTTTGACATCACTACTGATACTGTATGTTT CCATTATTATATATGTACAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATTAATCTTTTTCACA TATTTGTCTTGTTTCACATGCGGGTTGTAGAACATTTATTTACTAAGTTTTTCGATATTA TACTAAGACGTTGTTGTTGTTATCGATTTGCAGTTCATGGGGTCGTCAATGGAAGTAGAC GAACAAGCTCATCAGGACAAGGTGACTCTACCTCCACCACAGCCACAGCCACAGTCTCAA CGGGCTTTAACTTGCAATCTAGGGTCATTTCCAGATGTGTCGACAGCTTATCCGGTGAAA CTGAGTACGGTGGTGTTACCGGTGACCGGGGAAAGTCCTAACTCTGTGGAGAATTTCACT TTAGGAACAACCAACCAACAGAGAACATCATCAGCAAAGCTCATCCGTCCAATACCGATT CTTCCGGTTCCTCCTTCTTCAAAAATGGCTGATCTTAACCTGAACCAAAAGCCCAACCAC GTGGACCCACTGCCTTTATCACTCAAGCTGCCATCTACATCAACTCCCGAGGAGCAGTCA TCAACACCGACACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTACAAGTTCTCACTCGTCAG CTTTTCAGGCCATGTCCAGCGGCGATAGCATCATCAGTGTTGCTTGAAGAAACATATATA TGATGACGATATATAAATTTGTTGACCAAATTAGATATGTTGTAAATTAAGGGTTGGGAG TGGGAAAGTTGGGAATATTTTGAATTAGATTAATGATAATGTTGGATTAATCAAGTTAAT TAAAAAGATTAGGTAATTAAATTATTATTAGGGCGATTAGGTGATTCCTTGTTTGTACAG GTTAGAAGATGAGACAGAGATGGGCTGTCTTTTTCGTTTGTGGGGGATTCTTGTTTGTTT TGTCCAGTTTGTTTTGTTGTGAAATGACACAGAACCGGGTACGCTTTGCCTAGTTGTGTT CTTTGATTGGTCATACACTTGAAACGTCAACACAAGTAGGTAAAATATCTTGAAACTGAA TATTCTGTTTTGAGTGATTTTCTATTTTGATGCTATTATGATTTTGTGGAGAATAATCTA ATAAGCTGTTATTCATTACTTTTTCTATAATAGAAACCTATAATGATCTCTTTAATTACA TAATATCCAAGGACCATACCCTCAGGCTGGGTGGGATCCCGTTACATAGCTGTGAGAAAT CTAATAATTTGGTCGTTTTAATTTGTGTTATTGGTTCTTGGAAGATCTTGTGATTTTTTT TTCTGAAGTACATGTGATTTTTCTTGTTATTCGTGGTTGTGTGTAAGCAAAAAAGATTAA AAA