Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004955Chr1454028325405225+Transcription factor bHLH168

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004955.m12676PF00010.29HLHDomain40.62.00E-10
Download   Copy
>LITCHI004955.m1
ATGTTGATTTCTTCGGTGGCCGGCACAGCCAATTTGAAAAGAGTGAAATTTATGGAACCG
GGCACTAGCTCGTCTAGAATTGATAGAAACATGAAAGAGAGAGTTAGAAGAAAGCAGATG
AGAAATCTTCTCTCCCAGCTTGCTTATCTCATTCCACCTCCCCAAAGTTCTAAGGCTTCA
GTGCCTGAGTTGTTGGACCACGCAGCCAGTTACATAAAGCATTTGCAGGAAAGAGTTGAG
GAGCGAAAGGTAAGGCAGGCATTGTTGAAAGAGAAATGTCATCCAAATAAAAAGATCACA
AGCAGCTCGCCTGTGTTAAACATAAAAAGTTGGGATTCATGTTTGGAAATTAATTTGATA
TGTGGGTTGAACAAGAATTTCAGATTACATGAAATTATCAGTGTTCTTCAGCAAGAAGGA
GCTGAAGTTATAAGTGCTACACAGAATAATGCGGGTGACAGAGTCATCTATACAATTAGA
TCCCAGGCTATCTGTGCTAGAATCGGAATTGAAACTACAAGAGTTCGTGAGAGAATAAAA
GATCTAATTTTCTGA
Download   Copy
>LITCHI004955.m1
MLISSVAGTANLKRVKFMEPGTSSSRIDRNMKERVRRKQMRNLLSQLAYLIPPPQSSKAS
VPELLDHAASYIKHLQERVEERKVRQALLKEKCHPNKKITSSSPVLNIKSWDSCLEINLI
CGLNKNFRLHEIISVLQQEGAEVISATQNNAGDRVIYTIRSQAICARIGIETTRVRERIK
DLIF.
Download   Copy
>LITCHI004955.m1
CTTGAAATTGTTCTCAGTCAAAGTGATTTCATAATGATATAAGCTTGATTTATTTTTGAA
TTAGTTTACCTATGGATCAAATCATGAGTTACACTAATAAGAGATCATGTCCAAGTCCAT
GTGTAAAGAATTGTTCTGGGAATTTGCATTATCATGACAGTTATCTACCACATTATTTAA
CTTATTAACCCAGAAAACCAATAATATACTTAAATACTACTGTTTCTATATTGACTTCCA
GTTTTACAGATAGCCTTTTTCATCTTAGTCTAATTCGTTCATGTTACAATTTCGGTGCAC
TTAAGAACGTATCGTCTTTATATGTTGAAAATATAGCTACTGATTGTAGTCACCATCCCT
CTCTCTCCTAAATCCTATAAATACCAGAACATAATGTCCCCATTTACCCAACAATCTACT
TAGAATTTCTCTTCTTGTATCAATCATCTTTGTCATCTCTGTTTGAATGTTGATTTCTTC
GGTGGCCGGCACAGCCAATTTGAAAAGAGTGAAATTTATGGAACCGGGCACTAGCTCGTC
TAGAATTGATAGAAACATGAAAGAGAGAGTTAGAAGAAAGCAGATGAGAAATCTTCTCTC
CCAGCTTGCTTATCTCATTCCACCTCCCCAAAGTTCTAAGGCTTCAGTGCCTGAGTTGTT
GGACCACGCAGCCAGTTACATAAAGCATTTGCAGGAAAGAGTTGAGGAGCGAAAGGTAAG
GCAGGCATTGTTGAAAGAGAAATGTCATCCAAATAAAAAGATCACAAGCAGCTCGCCTGT
GTTAAACATAAAAAGTTGGGATTCATGTTTGGAAATTAATTTGATATGTGGGTTGAACAA
GAATTTCAGATTACATGAAATTATCAGTGTTCTTCAGCAAGAAGGAGCTGAAGTTATAAG
TGCTACACAGAATAATGCGGGTGACAGAGTCATCTATACAATTAGATCCCAGGCTATCTG
TGCTAGAATCGGAATTGAAACTACAAGAGTTCGTGAGAGAATAAAAGATCTAATTTTCTG
AATTGCTGAAATTTGCTTTCTACAACAGAAGTTAGGGCATTTACAGGACGCAAGATGAAC
TCTGAAGTAGACATAAATTAGTCGTGAAACTATTATGTGTATTTCGATGGATCTCACGTT
ATAATTTCCTTTCTGGAACGTGTAAATTACTGCTAGTCATAATTGTTAATGAGTGAAGTC
TTGAGTACTTGTGTTAGCACATGTTGTTTAATCAACTTGTTATCAACGTCTATGGTTAAT
CTATAAATTTTTCTGCTAAAAAGACATATATGGTTGTTATTTAGGGCAGACACTATAGAA
TTTGTACTGAACTAAGAACGTTTTACGTTCATTTTATTCATCATCATTCGAAC
Download   Copy
>LITCHI013639.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ATATTAATATACTAATAATAATTCTTAAAATAATAATAACAATAATTAGTCTCACATCAA
TTGTGTGGATTGCTCTCTCATTCTAGTGTGGATCTTCCCCTCTCCCCCTACCTTTGTGTG
GATGAATCTCTTCCAATTGAAAGTAGTCTCCGGAGCGTGCCACCAATGTTATATCTTGGT
TGGTCTCAGAAGCCCCCTGGATCTGTCCCAGATATAATTCTTATACTAAAAAAAAAAAAG
TTTAGTTATCTAAAATATATAACCACTCATATTTAAATATATGATATATGAAACTAGTTG
ATAAAGCATAGGAGGAGAACGGGGTTGATATAAATCTCTCTGTTGTTACTTCTTCTCCAT
ATTTTATTATTTGTGTTTCAATTACATAATAGACTTGTACATATAAACTAAAACTTTTAA
ATTGAGCATGATCATAAAGTTTCGGATTTGTATCCCACTCATTTTCTAATTCTTGCTCAT
TGTATATGTTACATGATGAGAGTGTCCTTAAGCAGAGTTAGGAGGTCTCAAATTTGCATT
TCTTTCTCCCATTTTTTCTGATTTTTTTATTCATTGTACACATTACACAACTAGAGGATT
TAATGTATTCTCACATTTGCTGACTCTCCACTTTGCTCTATCCCTATCAACTTAAGCGCA
TACATATATATATATATATATACATACATATATATATGTATGTATGTATGTATGCGCTTA
ATCCATGTCAACAACTTATGATTTAATAAATTTTTATTTGAACTCAAAGTTTTTGAACTT
CAATCTAATTCAAGGGAAAAAAAAAAAGTTAACCCAGAAAATATATGACGGAAAATTTTG
AGCAACTAGGCTATATAAATGATTGAAAATGTTGTACGAACACTAGATGTAATGTAATAA
ACACATGGTTTTGGCTGACAAAATTGTCGCCACAGAAACTGATGGACCACCTCTGGCATT
TGGCTTATGATAGAAGACATTTTCATCATATCTTGATCTTACAAAACACAAGAGAGGTTT
TAAAAACATTCAATGGTTGTTGTGTCCGGTGGGTTGATCATTAAGCTATCACTGTCTATT
GAGAGAGAGATAATCCCATCAATCTAACAACAAAACATCCTATCTTGATAAGGGAGATTC
ATTAAGCCAAGATCACTCTTGATTTTTGTTAATCACTTTCTCTGGAAATGCTTTTGTTGC
TTAATCATATCAGCCTCACAAAAACAGCTTTTTTAAGTGATAAAATAAAATAAAATCAAT
CTTATTATCTCTTTGACTATGACAACTTATAATTCCCTTGACTATGACCACTAATCAAAA
TGACCAAAAAGTGGAAGCAAGCAAGTTGATCAAACTGTTTAAAAGGGTAGAATAAAATGG
AGAATTTTTCACCATCTATATATATAGAAACACGTTCACTTATAATTCAAGTGGTTAAGT
TTACTATATATATTTATCAATATGCGTGGAAACTTTTTTTCTCTATATTACAAAAGTAAA
TTTCTCCCAATATTATCAATTTTTTTTTTTTTAAACTAATGAATATCTACCATTATTAAG
ATCTATCAAATCAAAGCTCAATAAATTTACTTGGTGGGAGTTAAACCATTAACACGTTAG
TAAATGGAATAGTACACAACCATTTATACTAACTTTTCAAATAGCACATATAGTGATTAA
TCTCCGTATATCTACTAGAATTTCATCTGAAAAATAAGAAAATCTAGAATATTATATGCT
TGTTAAGTGACAGCATAACCACATGATAAACAAAAAAGTCCACTTAGATAAATAAAACCA
GAAACCAATCTACACCACCATACAACTACTACTACTTCTACAACAAATATTTATTAATAA
AACTAAAAATAAAATAAAATAAAGAAGCTGGTGTCTTTGGATCCAGACCTTCTGCTTTTC
TTGTATAAACAAAACATGGGGTTCCTCCCTCTACAATCCCCAAAAACATATCAAACTCTT
CTCATCTCTAACCTCTTGCA
Download   Copy
>LITCHI013639.m1 GenomeSequence + 
AACCATTTATACTAACTTTTCAAATAGCACATATAGTGATTAATCTCCGTATATCTACTA
GAATTTCATCTGAAAAATAAGAAAATCTAGAATATTATATGCTTGTTAAGTGACAGCATA
ACCACATGATAAACAAAAAAGTCCACTTAGATAAATAAAACCAGAAACCAATCTACACCA
CCATACAACTACTACTACTTCTACAACAAATATTTATTAATAAAACTAAAAATAAAATAA
AATAAAGAAGCTGGTGTCTTTGGATCCAGACCTTCTGCTTTTCTTGTATAAACAAAACAT
GGGGTTCCTCCCTCTACAATCCCCAAAAACATATCAAACTCTTCTCATCTCTAACCTCTT
GCAATGCCTGCAACTCTAAGGCATCTCTTGCTTTCTTCTAATATATTTTTCTCCTCCTTC
ATTTTGTTCTTGTGTATAAACTCTCTTCTCTTCTATACTTGTCACTCCATTGATGAACAA
GGCCAGGCTCTTTTGGCATGGAAGAAGAGTCTCAACAGCTCCACAGATGTGTTGAAAACA
TGGAATCCTGCAGACCAAAGTGTGTGCAAGTGGGTTGGGATTCATTGCAACTCCAATGGA
GAAGTCATAGAGATAAGCTTGAAGGGAATGGAGTTACAAGGACCATTGCCTTCAAATTTC
CAGGCTTTCAGGTTTTTGAAGAGTCTTGTCATCTCATCATCCAATCTTACGGGAACAATC
CCAAAGGCGCTTGGAGAGTACCGCCAACTCGAGTTCATTGATCTAAGTGGAAATTCTCTC
TCAGGTGAAATCCCAATGGAGGTTTGCAACCTGAGGAAGCTTGACAGTTTGTATTTGAAC
ACAAACTTTCTTGAAGGTGAAATTCCTGCTTGCATTGGAAACCTGTCAGGACTTGCTTTT
TTGACACTCTATGATAACCAGCTCAGTGGGGAGATACCAAAAAGTATTGGAGAATTGAGA
AAGCTTCAGGTTTTTAGAGCTGGAGGGAATCAGAACTTGAAGGGAGAGCTGCCTTGGGAG
ATTGGAAACTGCACCGGCTTGGTCATGTTAGGCCTTGCAGAGACCGGCATTTCAGGAAGT
CTGCCTTCATCAATTCGGAAGCTGAAAAAGATTCAAACCATAGCCATTTACACATCTTTA
TTGTCAGGGCCAATTCCTGAAGAGATTGCAGACTGCAGTGAGTTGCAGAATCTGTATTTG
TATCAGAACTCCCTCTCAGGTCCTATCCCGAAGCGAATTGGGGAGCTGACCAAGCTTCAA
AATCTACTCCTGTGGCAGAACAGCTTGGTGGGTGCAATTCCCGAAGAGCTTGGAAGCTGC
AGAGAGGTGGTAGTCCTTGATTTGTCTGCGAATATCCTGACAGGAAGCATCCCGCGAAGT
TTTGGAAACCTTGTGAAGCTTGAAGAACTGCAGCTGAGTGTGAATCAATTGACAGGTACC
ATACCTATTGAAATAGCAAACTGCACAGCTTTGACACACCTTGAAATCGACAACAACAAG
ATTTCAGGAGAGATTCCCGAGGCTATTGGCAATTTGAAGAGCTTGACTCTCTTCTTTGCC
TGGCAGAATAAGATAACAGGCAACCTTCCAGGGAGGCTTTCAAAGTGTCAGGAGCTTCAG
GCTCTTGATCTGTCTTACAACAACCTCTTTGGTACGATACCGAAAGAGATTTTTGCGTTG
AGAAATCTCACCAAGCTGCTCCTGCTTTCCAATGATTTGTCAGGATTCATACCTCCTGAT
ATAGGAAACTGCACCACCTTGAGGAGGTTGAGATTGAATGGCAACAAGCTCTCAGGTACT
ATTCCATCAGAGATTGGAAACATGAAGAGCTTGAATTTTGTTGACATGAGTGAGAACCAT
CTTGTAGGAGGAATCCCTCCATCTTTGTTTGGATGTCAAAGCCTTGAGTTTCTTGATCTA
CACTCAAATGGGCTCACAGGTTCTGTGCCTGATACTCTGCCTACAAGCCTGCAGTTTGTG
GACCTTTCGGATAATAGGCTCGCAGGTCCTCTGACTCATAGCATTGGCTCACTTACAGAA
TTGACAAAGCTTCTTTTGGGAAGGAATCAGCTTTCTGGCAGGATTCCAGGGGAGATATTG
TCATGCAGGAAGCTAATATTGTTCGATATCGGGAGCAATGATTTCTCTGGGGAGATTCCA
AAGGAGTTGGGGCAAATTCCTGCCCTGGAAATCTCTCTCAACTTGAGTTGCAACCAGTTT
TCAGGAGTGATTCCGTCAGAGTTCTCTGGTCTTAACAAGCTGGGGATACTTGATTTGTCC
CACAACAAGTTATTTGGGGACTTGAATGTTCTTGCTAGCCTGCAAAACCTTGTCTCACTC
AATGTATCCTTCAATGACTTCTCTGGAGAATTGCCGAATACACCCTTCTTTCGAAAACTT
CCACTTAGTGACCTTGCTTCAAACCACGGTCTGTACATTTCTGGTGGGGTTGTGGGTCCA
AATGGCATGGGACCTGGCCACGCCAGACCGGCAATGAAGCTGGTGATGTCGATACTCATT
AGTGCTAGTGTGGTACTAGTACTATTAACACTGTACGTGTTGATTCGTACTAGAATAGCT
AGCCATAGGCTCATGGAAGACGAGAGTTGGGAGATGACTTTGTATCAGAAGCTCGACTTC
TCTATAGATGACGTTGTCAGGAATCTAACATCATCCAATGTGATAGGCACAGGAAGCTCA
GGAGTTGTGTATAGAGTGACGATTCCAAATGGGGAAACACTAGCAGTGAAGAAGATGTGG
TCATCGGAAGAGAATGGTGCATTCAATTCTGAGATCAAGACGCTAGGTTCAATCAGACAC
AAGAACATTGTGAGGCTTCTAGGTTGGGGTTCCAACAAGAACCTGAAGCTGCTCTTCTAT
GATTACCTCCCTAATGGAAGCCTGAGCTCACTCCTCCATGGTGCAGGGAAAGGAGGAGCA
GATTGGGACGCTAGATATGATGTTCTATTAGGTGTAGCACATGCCCTTGCATACTTGCAT
CATGATTGTGTGCCTCCTATTTTACATGGAGACGTCAAAGCAATGAATGTGTTGCTAGGT
CCTGGCTATCAGGCTTACCTTGCTGACTTTGGTCTAGCTAGAATTGTGAATAACCGTGGA
AGTGATGGTTTTTTGAAACAAAATCAAAGGCCTCATTTAGCTGGTTCTTATGGATACATG
GCTCCAGGTATATTATACTTTCTTACCTTTTCGATCTTCTTTTTAGTTGTTTTGTATGTT
TCGTGTTTTCTGAATTACTGATCGGTTTCCTCTTCTGAGGTGTTAATAGAGCATGCATCA
ATGCAGAAGATCACAGAGAAAAGTGATGTGTACAGTTTTGGTGTAGTGCTTTTAGAGGTA
TTAACAGGAAGGCATCCAATAGACCCAACATTGCCTGGTGGTGCACACTTGGTTCAGTGG
GTTAGGGACCACTTAGCCAGCAATAGAGACCCGGTTGACATTCTTGATCCGAAGCTTCGA
GGGAGAGCTGACCCTACCATGCACGAAATGCTACAAACACTTGCTGTATCTTTTCTCTGC
ATCAGCACTAAACCTGATGATCGTCCAATGATGAAAGATGTCGTGGCAATGCTCAAAGAG
ATACGCCACATTGAATCCACAAGACCAGAAGCTGATTTCTCGAAAGGACATCAAGTATCA
ACAGCACCACCCCCCTCACTGCCTCCTACTAGAATTGTAGTCTCTCAAGGATCCTCTAAC
GTCTCTTTTGCTTTCTCTGATGAGTCAGTATAAAAAGCCATCAAAATATGTTAAAAATTT
TCACTTTCTATGTTCTTAAATTGTAATTTTTACTGTCTAGTATTGTAGAGCTAAATAACT
AGTCTTGTTACCACAATGTCAAGCTAATGTAGTATTAATATCAAGAGTTGTAAGAAAATT
AAAAATAGTAGAGCTAATGAGAACTTCAAGGAATTAAAAGCTCAATTTACTAGAGAAAAA
GAAACTGGAACAATGATTGGTAGTTTTGTATTTTTATAACTAGAATTTATTGCAAAGTCA
TGAGATTCTCTCTCTCTCTCTCTTCACATGGTCCCTAGCTTCTCAGATCACATGTCCTTG
TACTGTCTGAGAGGGACTTTCCAGCAATGTAAAGAGGCTGTTAAAGTATACTAACCTTGG
TATAGAAGACGGTATGTCTTTGTCTGAAGGACATGTGCATCAAAGAGCCAATGTGCTTCA
TTTCATCAATAAAATAAGCATTCTTCATTGCTTCACATGCAAAGGAATCAGTTCACATCC
CCATTTTGATTATTACTGCAGACCTGCTGCAAGTTTTGAGAGAGGCTGTTAACTTGGTTT
GCAAAGAACCTGTGGGATTTTTATTTATATTTTCAATAATATTAATGTTTTCTCAAGGTT
TCTTATGGATCCAGTCGTCTTATAAGTTACATTTGTC