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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004955 | Chr14 | 5402832 | 5405225 | + | Transcription factor bHLH168 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004955.m1 | 26 | 76 | PF00010.29 | HLH | Domain | 40.6 | 2.00E-10 |
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>LITCHI004955.m1 ATGTTGATTTCTTCGGTGGCCGGCACAGCCAATTTGAAAAGAGTGAAATTTATGGAACCG GGCACTAGCTCGTCTAGAATTGATAGAAACATGAAAGAGAGAGTTAGAAGAAAGCAGATG AGAAATCTTCTCTCCCAGCTTGCTTATCTCATTCCACCTCCCCAAAGTTCTAAGGCTTCA GTGCCTGAGTTGTTGGACCACGCAGCCAGTTACATAAAGCATTTGCAGGAAAGAGTTGAG GAGCGAAAGGTAAGGCAGGCATTGTTGAAAGAGAAATGTCATCCAAATAAAAAGATCACA AGCAGCTCGCCTGTGTTAAACATAAAAAGTTGGGATTCATGTTTGGAAATTAATTTGATA TGTGGGTTGAACAAGAATTTCAGATTACATGAAATTATCAGTGTTCTTCAGCAAGAAGGA GCTGAAGTTATAAGTGCTACACAGAATAATGCGGGTGACAGAGTCATCTATACAATTAGA TCCCAGGCTATCTGTGCTAGAATCGGAATTGAAACTACAAGAGTTCGTGAGAGAATAAAA GATCTAATTTTCTGA
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>LITCHI004955.m1 CTTGAAATTGTTCTCAGTCAAAGTGATTTCATAATGATATAAGCTTGATTTATTTTTGAA TTAGTTTACCTATGGATCAAATCATGAGTTACACTAATAAGAGATCATGTCCAAGTCCAT GTGTAAAGAATTGTTCTGGGAATTTGCATTATCATGACAGTTATCTACCACATTATTTAA CTTATTAACCCAGAAAACCAATAATATACTTAAATACTACTGTTTCTATATTGACTTCCA GTTTTACAGATAGCCTTTTTCATCTTAGTCTAATTCGTTCATGTTACAATTTCGGTGCAC TTAAGAACGTATCGTCTTTATATGTTGAAAATATAGCTACTGATTGTAGTCACCATCCCT CTCTCTCCTAAATCCTATAAATACCAGAACATAATGTCCCCATTTACCCAACAATCTACT TAGAATTTCTCTTCTTGTATCAATCATCTTTGTCATCTCTGTTTGAATGTTGATTTCTTC GGTGGCCGGCACAGCCAATTTGAAAAGAGTGAAATTTATGGAACCGGGCACTAGCTCGTC TAGAATTGATAGAAACATGAAAGAGAGAGTTAGAAGAAAGCAGATGAGAAATCTTCTCTC CCAGCTTGCTTATCTCATTCCACCTCCCCAAAGTTCTAAGGCTTCAGTGCCTGAGTTGTT GGACCACGCAGCCAGTTACATAAAGCATTTGCAGGAAAGAGTTGAGGAGCGAAAGGTAAG GCAGGCATTGTTGAAAGAGAAATGTCATCCAAATAAAAAGATCACAAGCAGCTCGCCTGT GTTAAACATAAAAAGTTGGGATTCATGTTTGGAAATTAATTTGATATGTGGGTTGAACAA GAATTTCAGATTACATGAAATTATCAGTGTTCTTCAGCAAGAAGGAGCTGAAGTTATAAG TGCTACACAGAATAATGCGGGTGACAGAGTCATCTATACAATTAGATCCCAGGCTATCTG TGCTAGAATCGGAATTGAAACTACAAGAGTTCGTGAGAGAATAAAAGATCTAATTTTCTG AATTGCTGAAATTTGCTTTCTACAACAGAAGTTAGGGCATTTACAGGACGCAAGATGAAC TCTGAAGTAGACATAAATTAGTCGTGAAACTATTATGTGTATTTCGATGGATCTCACGTT ATAATTTCCTTTCTGGAACGTGTAAATTACTGCTAGTCATAATTGTTAATGAGTGAAGTC TTGAGTACTTGTGTTAGCACATGTTGTTTAATCAACTTGTTATCAACGTCTATGGTTAAT CTATAAATTTTTCTGCTAAAAAGACATATATGGTTGTTATTTAGGGCAGACACTATAGAA TTTGTACTGAACTAAGAACGTTTTACGTTCATTTTATTCATCATCATTCGAAC
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>LITCHI004955.m1 + Up_Stream_Len 2000 CAGAATTCTAAAATTCAAATATTACATAATGGGCTAAAGTACTATTTTGCCCTTATTAAA ATATCATTTACTTACAAAAATTATTTCACTAGGAGATGTGCTCATAGTAACAGTGAAACA TTGTTTAAAAAAGAGAAAAATTTTTAAAAATAAATATTTTCAACTAAAAATATATAACTT GTTTAATAAATTACAAATATTTTACAAAATAAAATAAGATAAAATAACAATAGAGATTAG CTCCATCATCAGTTTAAATTATCTCTATTTAGAGTTTCCTTAACATTCAAGGAGATTGCT GATCTGTTTTGATTGATCTTCTCAATTGGGGAGTAGATCAACAACAATAACTATAATCTT TATTAGAGATTGACAACCAAAGACTACCTCCATCTTCAGTGGATGCAGCCATTTTTTAAA ATTAATTTTAACTATTTTTCTTTAATTTTTGTTGTTAGACTTGTATGTATGATTACTGTC TATAGATGTTAATTTCCTTATTCAAATTACATTTAACTAACAATTAATAAACGGGAGGAC CATTTGAATATATTTATGATATCGTGAGAAACAAAGAAGCTAATAAAGGAAAAACTAGTA AAAAAAACAAATTTGTAATAATTCTAGGAATTAAATGAAAATCCCTCCAACTCTTTTATC TCCGTCTCAAAAACTAAATAAATAAAACTAAAAAAATCTTTGTTTAAATTTACTGTACAA CGAAGATAAATAGGGAGTCCCTATTTATATAAACAGTATTTAATTCCTAGAATTATTACA AATTATTAGTATTTAATTCCTATTTATTTGAAGATCAAAAAATTAGGGACGGCACAATGT GTGTGCTGGGGTGGGCTAAAGCCTACCGTAGCCCGCTTTGAATATATAAATATATATAAT AGGATATAGTAAAATATAAATAGTATACAGGAAAGTTTGTTTATATCTTTTTATTTATTA ATTCTTTTTCATACCAAAATAATATATATATTTTTTAACCAATCATATATATATATGGTT TATATTTACTTTTCTCTTCAAATATTGTATATGTAAAAATTTTAATTTGATGCATTAAAT ATTAAATTTCATTTAATTTTTTCATTACACAGTATTACTTTCATAGGTTGCTTAAACTTA TTATTTTTTATTTTCGGCATCTTTCCTATTGTATATTTTAATCTAAAGTATAATAGTAAA TTATGATTATTAAAATGTATATTATCTATATTATTGATGCTATAATTGATAAATTTGATA ATTTGAATACTGTTAAATCTTGTTTGATTAATGTTTGATTGTATTTAGTTAATATATTTA TTTATAATATGAATTTTGAGAAATAAAACTTATTATGTGTCCTCTAACTATATAAACATA TATATATTTTTTTTTTAAAAAAACTAAGCATATATATTTTCCAATTTATAAATTTTGTTT TCAATTCAATTGAAGTTCATTTAATTTTTTTTTTTTATCGAATTAAAACGAAAGCAGAAA AAATAAGTATATTTTTCAAGTTTAGAGAAGTAATCTTGAAATTGTTCTCAGTCAAAGTGA TTTCATAATGATATAAGCTTGATTTATTTTTGAATTAGTTTACCTATGGATCAAATCATG AGTTACACTAATAAGAGATCATGTCCAAGTCCATGTGTAAAGAATTGTTCTGGGAATTTG CATTATCATGACAGTTATCTACCACATTATTTAACTTATTAACCCAGAAAACCAATAATA TACTTAAATACTACTGTTTCTATATTGACTTCCAGTTTTACAGATAGCCTTTTTCATCTT AGTCTAATTCGTTCATGTTACAATTTCGGTGCACTTAAGAACGTATCGTCTTTATATGTT GAAAATATAGCTACTGATTGTAGTCACCATCCCTCTCTCTCCTAAATCCTATAAATACCA GAACATAATGTCCCCATTTACCCAACAATCTACTTAGAATTTCTCTTCTTGTATCAATCA TCTTTGTCATCTCTGTTTGA
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>LITCHI004955.m1 GenomeSequence + CTTGAAATTGTTCTCAGTCAAAGTGATTTCATAATGATATAAGCTTGATTTATTTTTGAA TTAGTTTACCTATGGATCAAATCATGAGTTACACTAATAAGAGATCATGTCCAAGTCCAT GTGTAAAGAATTGTTCTGGGAATTTGCATTATCATGACAGTTATCTACCACATTATTTAA CTTATTAACCCAGAAAACCAATAATATACTTAAATACTACTGTTTCTATATTGACTTCCA GTTTTACAGATAGCCTTTTTCATCTTAGTCTAATTCGTTCATGTTACAATTTCGGTGCAC TTAAGAACGTATCGTCTTTATATGTTGAAAATATAGCTACTGATTGTAGTCACCATCCCT CTCTCTCCTAAATCCTATAAATACCAGAACATAATGTCCCCATTTACCCAACAATCTACT TAGAATTTCTCTTCTTGTATCAATCATCTTTGTCATCTCTGTTTGAATGTTGATTTCTTC GGTGGCCGGCACAGCCAATTTGAAAAGAGTGAAATTTATGGAACCGGGCACTAGCTCGTC TAGAATTGATAGAAACATGAAAGAGAGAGTTAGAAGAAAGCAGATGAGAAATCTTCTCTC CCAGCTTGCTTATCTCATTCCACCTCCCCAAAGTTCTAAGGTACATATGTAGTCTCCTCT CTCCTTCAATTACAATTTTAATGAAATAGACGTCTCATATCTTCTATCTATAGTAGTTTA ATGAAAATGTTCAAAATAAGATTTTTTAATTATGTCAATTAATTACTACTGTAACTAGTA CTACTTTTTTCAAAAATTATGTACACATAAGATTACATGGTGTGTACTTCCCTGACGTGA ACCTTATCTTTCTAAAGGCTTCAGTGCCTGAGTTGTTGGACCACGCAGCCAGTTACATAA AGCATTTGCAGGAAAGAGTTGAGGAGCGAAAGGTAAGGCAGGCATTGTTGAAAGAGAAAT GTCATCCAAATAAAAAGATCACAAGCAGCTCGCCTGTGTTAAACATAAAAAGTTGGGATT CATGTTTGGAAATTAATTTGATATGTGGGTTGAACAAGAATTTCAGATTACATGAAATTA TCAGTGTTCTTCAGCAAGAAGGAGCTGAAGTTATAAGTGCTACACAGAATAATGCGGGTG ACAGAGTCATCTATACAATTAGATCCCAGGTATGATATTTGTCTATTTGTTTCTGATTGT TAACTCAAATATATTTTTTGATATGGTAATTGCTAGGTGATATAGTTAGATAAAAAGCTT AATTATCGAGGTAAGTGTTTTACTTGTAATAGTTTTGAGAACTTCTACAATAATTTATGT CCAAGAAAAAAAATGAAAACACTTCTACAACAACGTTTTAATGAGTTGAAAAATTTTAGT TAAATGACGAACAACAGTTATCACTTCTATGAAACGTCCCTTACAATAAGGAAACTACCC CAAGCTCTCCATTTAAAAGCTTGAAAGCTGGTGATAACCACAAACGTCAGGTCAGGTCAC ATACACTCATAATTGACTAGACTTTTGGCTTGTCATACGCAATTAAAATTTATGTCCAAC ATTGATAATCACATTTAACTAAGAACATATATAGTACTGAAATGATAGAATAATCTTTTT ATTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAAACAGATAGATTAATCTTTTTATGTATATATATG TAAGTGAAAAATAGTGGTGTTCAATTTTTATACTTTATGTATTGTATTTTTTATGCTTAT AAGAAAGCGGTACATACATTACCAAATAGATTATTTAACTACTCTAATAAAATTAGTTTA TTATTCTAAAAAAATAATAATAAAATTAGTTTATAATTGTAGTGTATATATATACATGCA CTCTGCAATGCTACTTTCTGTTTTATTTTCAATATATCTTCTCAAGTTTCACGTATAAGT TCTCTAATGTACATCAAGTCTTGACCTAATTAATTTTTCTATAATGTTTGCAGGCTATCT GTGCTAGAATCGGAATTGAAACTACAAGAGTTCGTGAGAGAATAAAAGATCTAATTTTCT GAATTGCTGAAATTTGCTTTCTACAACAGAAGTTAGGGCATTTACAGGACGCAAGATGAA CTCTGAAGTAGACATAAATTAGTCGTGAAACTATTATGTGTATTTCGATGGATCTCACGT TATAATTTCCTTTCTGGAACGTGTAAATTACTGCTAGTCATAATTGTTAATGAGTGAAGT CTTGAGTACTTGTGTTAGCACATGTTGTTTAATCAACTTGTTATCAACGTCTATGGTTAA TCTATAAATTTTTCTGCTAAAAAGACATATATGGTTGTTATTTAGGGCAGACACTATAGA ATTTGTACTGAACTAAGAACGTTTTACGTTCATTTTATTCATCATCATTCGAAC