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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004920 | Chr14 | 5081956 | 5083784;5086591 | + | Axial regulator YABBY 4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004920.m1 | 11 | 171 | PF04690.16 | YABBY | Family | 220.6 | 2.00E-65 |
LITCHI004920.m1 | 115 | 165 | PF06244.15 | Ccdc124 | Family | 24.5 | 2.70E-05 |
LITCHI004920.m1 | 122 | 170 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 25.3 | 1.90E-05 |
LITCHI004920.m1 | 127 | 168 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 27.3 | 3.90E-06 |
LITCHI004920.m2 | 11 | 168 | PF04690.16 | YABBY | Family | 219 | 6.00E-65 |
LITCHI004920.m2 | 112 | 162 | PF06244.15 | Ccdc124 | Family | 24.4 | 2.90E-05 |
LITCHI004920.m2 | 119 | 167 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 25 | 2.20E-05 |
LITCHI004920.m2 | 124 | 165 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 27.1 | 4.50E-06 |
LITCHI004920.m3 | 11 | 171 | PF04690.16 | YABBY | Family | 220.1 | 2.80E-65 |
LITCHI004920.m3 | 115 | 165 | PF06244.15 | Ccdc124 | Family | 24.4 | 3.00E-05 |
LITCHI004920.m3 | 122 | 170 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 25 | 2.30E-05 |
LITCHI004920.m3 | 127 | 168 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 27.1 | 4.60E-06 |
LITCHI004920.m4 | 21 | 107 | PF04690.16 | YABBY | Family | 120.2 | 1.40E-34 |
LITCHI004920.m4 | 51 | 101 | PF06244.15 | Ccdc124 | Family | 24.6 | 2.60E-05 |
LITCHI004920.m4 | 58 | 106 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 25.9 | 1.20E-05 |
LITCHI004920.m4 | 63 | 104 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 27.9 | 2.50E-06 |
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>LITCHI004920.m1 ATGTCTACACTCAACCATCTCTTTGATCTTCCTGAACAAATATGCTACGTTCAATGTGGT TTCTGCACCACCATTTTACTGGTAAGTGTCCCATGTAGCAGCTTGTCAAGGGTCGTGACT GTGAGATGTGGCCATTGCACAAGCCTCCTATCTGTCAACATGATCAAAGCTTCCTTTGTC CCTCTTCATCTTCTAGCTTCTCTACACCATGATCATGATGAGTATCTGCAGCCAAAAGAG GAAGGTTTCAAGGAAGAAGAGCAAGCACAGAAGGTCTTGAACAGGAGTAGTCCTTCAATG GTGACTTCTTCTGACAATGAAGAAGAAGATATGATAATTATGAATCACATCGTCAACAAA CCCCCAGAGAAGAGACAAAGAGCTCCATCAGCCTACAACCGCTTTATCAAGGAAGAAATC AGGAGGCTTAAGGCCGAAAATCCAAACATGGCTCACAAGGAAGCTTTCAGTACTGCTGCG AAAAATTGGGCAAATTTCCCTCCAATTCAGTACAAAGAAGATGGAGAAAGCTGTGGCCAG GAAGATGAAAAGGCAACACGGAACTCTGATGCTACTCCTGAGGTAAAGAGAGTGTGA >LITCHI004920.m2 ATGTCTACACTCAACCATCTCTTTGATCTTCCTGAACAAATATGCTACGTTCAATGTGGT TTCTGCACCACCATTTTACTGGTAAGTGTCCCATGTAGCAGCTTGTCAAGGGTCGTGACT GTGAGATGTGGCCATTGCACAAGCCTCCTATCTGTCAACATGATCAAAGCTTCCTTTGTC CCTCTTCATCTTCTAGCTTCTCTACACCATGATCATGATGAGCCAAAAGAGGAAGGTTTC AAGGAAGAAGAGCAAGCACAGAAGGTCTTGAACAGGAGTAGTCCTTCAATGGTGACTTCT TCTGACAATGAAGAAGAAGATATGATAATTATGAATCACATCGTCAACAAACCCCCAGAG AAGAGACAAAGAGCTCCATCAGCCTACAACCGCTTTATCAAGGAAGAAATCAGGAGGCTT AAGGCCGAAAATCCAAACATGGCTCACAAGGAAGCTTTCAGTACTGCTGCGAAAAATTGG GCAAATTTCCCTCCAATTCAGTACAAAGAAGATGGAGAAAGCTGTGGCCAGGAAGATGAA AAGGCAACACGGAACTCTGATGCTACTCCTGAGGTCCATATAGAAGGCAATTGTTTCCGT GAAAAAAAAGCCCCGAGGCATTCCATTTGGGCGAAGTCACCCTTCGAGTGA >LITCHI004920.m3 ATGTCTACACTCAACCATCTCTTTGATCTTCCTGAACAAATATGCTACGTTCAATGTGGT TTCTGCACCACCATTTTACTGGTAAGTGTCCCATGTAGCAGCTTGTCAAGGGTCGTGACT GTGAGATGTGGCCATTGCACAAGCCTCCTATCTGTCAACATGATCAAAGCTTCCTTTGTC CCTCTTCATCTTCTAGCTTCTCTACACCATGATCATGATGAGTATCTGCAGCCAAAAGAG GAAGGTTTCAAGGAAGAAGAGCAAGCACAGAAGGTCTTGAACAGGAGTAGTCCTTCAATG GTGACTTCTTCTGACAATGAAGAAGAAGATATGATAATTATGAATCACATCGTCAACAAA CCCCCAGAGAAGAGACAAAGAGCTCCATCAGCCTACAACCGCTTTATCAAGGAAGAAATC AGGAGGCTTAAGGCCGAAAATCCAAACATGGCTCACAAGGAAGCTTTCAGTACTGCTGCG AAAAATTGGGCAAATTTCCCTCCAATTCAGTACAAAGAAGATGGAGAAAGCTGTGGCCAG GAAGATGAAAAGGCAACACGGAACTCTGATGCTACTCCTGAGGTCCATATAGAAGGCAAT TGTTTCCGTGAAAAAAAAGCCCCGAGGCATTCCATTTGGGCGAAGTCACCCTTCGAGTGA >LITCHI004920.m4 ATGATCTCTCTCACTCTCTCTCCATCTCAGTATCTGCAGCCAAAAGAGGAAGGTTTCAAG GAAGAAGAGCAAGCACAGAAGGTCTTGAACAGGAGTAGTCCTTCAATGGTGACTTCTTCT GACAATGAAGAAGAAGATATGATAATTATGAATCACATCGTCAACAAACCCCCAGAGAAG AGACAAAGAGCTCCATCAGCCTACAACCGCTTTATCAAGGAAGAAATCAGGAGGCTTAAG GCCGAAAATCCAAACATGGCTCACAAGGAAGCTTTCAGTACTGCTGCGAAAAATTGGGCA AATTTCCCTCCAATTCAGTACAAAGAAGATGGAGAAAGCTGTGGCCAGGAAGATGAAAAG GCAACACGGAACTCTGATGCTACTCCTGAGGTCCATATAGAAGGCAATTGTTTCCGTGAA AAAAAAGCCCCGAGGCATTCCATTTGGGCGAAGTCACCCTTCGAGTGA
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