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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004817 | Chr14 | 4224197 | 4227759 | + | Serine/threonine-protein kinase AFC2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004817.m1 | 124 | 451 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 168.6 | 1.80E-49 |
LITCHI004817.m1 | 126 | 362 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 67.6 | 1.10E-18 |
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>LITCHI004817.m1 ATGAAAATGGACTACGTTTCAGAGTTTCCTCACAATCACGTGGATCGTCGTCCGAGAAAG AGACCTCGATTAGCTTGGGAAACCCCTCAAATCCACACAAAGGCTCAGTCAGGGATATTT TGTGGGCAAGAGGTTGGCAATGTGACAAGCTATGGCCCTGCGAGGGGACACCTGAACCAT GCTGCTAGTGTGTTTAAGGGATTGGCTCAAAAAGGCTCCCCCCCACGGCGAGACGATGAC AAAGATGGACGCTATGTGTTTGCGCTTGGAGAGAATTTAACTTCTCGCTGTAATTACACT TTTTCATTATCATACTATAGATTACTTACGTTTCTTTTGAAAGAATGTGACTCTTTAGCT TCAAGTCATTATAAGATCCACGGAAAAATCGGCGAAGGAACTTTTGGTCAGGTTTTGGAT TGTTTGGATAGGGAAACAGGGGAGATGGTTGCCATAAAAGTTGTGCGGAGTATTAAGAAA TACCGTGAAGCAGCATTGACAGAAATTGATGTGCTTCAGTTACTGAGGAAGTGTGACAGA AGTGGCAGTTGTTGTGTCCAAATGCGGAACTGGTTTGAATATCGTAACCATATCTGTATC GTTTTTGAGATGCTTGGACCAACTGTATACGATTTTCTTCGGAAAAATAATTATCGCCCT TTTCCTGTTGATCTTGTCCGTGAGCTTGGCAGGCAACTGTTGGAATGTGTAGCATTCATG CATGATTTGCACCTCATCCATACTGACTTGAAGCCCGAGAACATACTTTTTGTTTCTTCA GATTATGTAAAAATACCTGACTGCAAGGTTACTTCTCGTTCTGCGACAGAGGGAACTCAT TACAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCTATCAAGGTTATAGATTTTGGCAGCACGGCTTAT GAGAATCAAGATCACAACTATATTGTCTCTACCAGGCACTACCGTGCACCTGAAGTTATT CTTGGACTTGGATGGAGCTGTCCTTGTGACATATGGAGTGCTGGTTGTATCTTGGTGGAA CTGTGCTCGGGAGAAGCATTGTTTCAGACACATGAGAACCTAGAGCATTTGGCCATGATG GAAAGGGTTTTAGGCCCATTACCTCAGCACATGTTGAAAAGAGTAGACAAACCTGCTGAG AAGTATGTTAGAAAAGGTAGGTTGGACTGGCCTGAGGGTGCAACATCTCGGGAAAGCATT AAAGCTGTTTTGAAGCTACCTCGTCTTCAGAATCTTGTCATGCAGCATGTAGATCACTCA GCTGGGGATCTCATAGATCTCTTGCAAGGTCTTCTCCAATATGACCCCTCCATCAGACTA ACCGCTCATGGAGCTCTTAGGCACCCTTTCTTTAACAGAGATTATTACAGGAAATTTTAG
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>LITCHI004817.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTAAAAAATAATGATATTTAAGCTTTTGTCCTCTTAAAGTTAAAATGGGTGTTCAAC TATTCTTACCAAAGGGTGTGAGATGTAATGTTTAACTAATTCTTTGATATAATAGTTTTT ATGAAAATGAAACCAAGTTTTATTGAATTATGATGTAAATAATTTACTAAATAAATGATT CAAGAACCCTTAATTAGATGTTAAATTTGATTTTGCGTAAGTAGGATATCATTTGTGTTC AAAATTTATTTACTTAGTTATGTTAGAAAGTAATAATAAAATAATATGTAAGTATGTAGC TCTTCAATTGGCCATCCTTTGTTTAAAATGAAAATGATAATCAACGGTCCACGAAAATTG CTTCAAAATATATAAGGACTTAAATTGTTGTAGAATATGGGAAAAAACAAGCCATTTTTG TCACTGTAAAATAAAGATAAATTAATATATCAATAATAATGCCTAATCTACTTGTAATTT GAGAACCGTAATTAGTTTACACATAACTCTACTTGAAATATTGTTCCATAACATGAAGAG AGGTACAATTTCATCTATAGTAGAATATGTGCTCGCAAATTTCAAACAAATACTAATTAC TTTCCATATGACATTCATAGATAAGATCAATTCTTAAAAATAATTTCATCGTGATAGACT CATCAATTCATCTCCTATAACTTAAACAAATAATTTACAGAGAGTTTAATGATTAAAACT AAAAAACATCAAACACAGTGCATAGGGTAATAATTTTGGACACACAGATAAAGTCCAACT TTCACTTGCAACTCAATAACTTTATTCACTATTTGATGATAGGTAGACTATGAAATCAGA TAAGAATATCATTAACGATTCTTGAAGAAGTTCAAAAATAATTTGTCGAAACTATGTTTG CTACAAAAGCAGGAACTACACCACACAAAATTAGCAGTCCACGAAATCAAAATCATCAAA ATATCAAAAAATATGGTCTTTCTAAACTTAATCAAACCAACATCTATTGGGTTATGTTGA TAAAATGCATTCATTTAGTTTCTTAAAATTCTAATTGGAAATAACTGCACCGCCTATTGT ATTAAAATAATTCTAATTAAATAAAATCATATGTCATTAACAAAATTCACTAAATTCAAT TACACATGCCTTAAACAAAGAGAATAAGGGTTCATTTTGGCGCCTATGATGCAAGCTCCT AAAGCCTCAGTGGAGAGGCAAATACCATCAAATTTGGTTTGTAATATATTATATATCTCG GAATTGTTTTAACAGACTTACTATTTGTGAATTACTTAATAACCGATGATGAATTTGAAT TTGTGTAAGTTTTTTAGTATTTATTTCAATTTGTACAAATGCTTTTAACTAGCATCACTT CTCATGAAAAGCAACTAAATAGTTTAAATAGCTTTCTTTTTAATTAATATCGCATTGATT TATTAAGTTTTTCAAAAAGTATTATAATTCCAATTGATGATTTTTCCTTTTTCAAATTTC ATCTATTTATTTCAACTAAAATGAAAGTCGGAAAAAGAATATATGCACAAGTATACAACA CAACAGAGCTTTCAAACTTGTACAAGACTTTTGTTATAATAGTTATGAAGAAAACAAAAC CAAATTTTATGATTGAACTATTGCTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTGAAAAAATATATATTA ATTATCAAATAAACAATTGTTTCGCTTTTGCATTAAATAAAAAAACAATAAAAAATTAAA AAGCCAACTCGACCATGGTTACAATCACCCCAATCAAACTAACCATAGTCAATCCAAAAA CGAACGGTGTAGATCAACCCAATCCAGCGGCTGTCACAGCTTCGATTACGATGGAGAACT GGGGTTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTGTCTCCCCACCCCACCAAAAAAAAAAAA AACTCGATGGATTTCTGCGTCAATCTCATCAATTAATTGATGAATCAATAAATCTATCCA GGGTTAGGGTTTTGTAGCAG
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>LITCHI004817.m1 GenomeSequence + TGGAGAACTGGGGTTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTGTCTCCCCACCCCACCAAA AAAAAAAAAAACTCGATGGATTTCTGCGTCAATCTCATCAATTAATTGATGAATCAATAA ATCTATCCAGGGTTAGGGTTTTGTAGCAGATGAAAATGGACTACGTTTCAGAGTTTCCTC ACAATCACGTGGATCGTCGTCCGAGAAAGAGACCTCGATTAGCTTGGGAAACCCCTCAAA TCCACACAAAGGTACAATTTTTTTTCTTTTTAATAGCTATACAGTGTAGGCTTTTCTTTG TATCTGTAGAAAAAAAATATTTTTTTTTATAAGTTTAATTTTGATTGGAACATTTTGTAT TTGAAAGTTTCGACTTTTGAGTTGTTTTTATGATTTTATGCTTTGACAGAAAATAAAAAT TGTATATTTGACTCTGTCTAGTATTTGTTAGTTACTTATTATGATTGAAAATGAGAAACT GTTTATTGTGCAATAGTTAGATGAAAATGCATCGTTTTTTCTATTTTTGTTTTGATGATG TGGTCTTTTGGATTTTTCAAGTTGGATGTGTTTTTTGTGTGATATTGTGTGGGCTAATGT GTTTAATTATGTTGATTGATTGATATGAGGGATGAGGTTAGATGTGAATAAATGTGGAGG GGGCAAAGTTTTTGATTACTTTGTGTTAAGTGGAGTATGAATGAGTGAATGTGTGTAGGC TCAGTCAGGGATATTTTGTGGGCAAGAGGTTGGCAATGTGACAAGCTATGGCCCTGCGAG GGGACACCTGAACCATGCTGCTAGTGTGTTTAAGGGATTGGCTCAAAAAGGCTCCCCCCC ACGGCGAGACGATGACAAAGATGGACGCTATGTGTTTGCGCTTGGAGAGAATTTAACTTC TCGCTGTAATTACACTTTTTCATTATCATACTATAGATTACTTACGTTTGTTAATCTGTA TTGCTAATGGTTCGTGATTTAATTTTATGAACAAATGGCCAGTTAAAATGTATGTAGTAA TGGTGTTTTTCAATTTTGCTGTTGCTTGCTATTTTCTTTCTTGATGTCATATCAATAGCA TTTCTGAAACTTTGTGAACTGTACCTCTAGCTTTTGAAAGAATGTGACTCTTTAGCTTCA AGTCATTGTAATTATTTTGAATGAGAGTACCATTGCAGATTTGGAAAAGATACTTTTTCT ATTTACATTATAAAAATATCTTCCAGTGGCAGTAGTTTTCTGTCTCATGCATCAGCAATG TAATGTCTATTCTCACTATCTACTTTCTCTTTTCCATAGTAAGTTAAATTAGGAGAGGAA TTTATTCTTTCTTCTTCTCCACCTCCCTCTCATCCTTTTTTTCTTCTCAAGTACGTGTGA AGTCTTTTTCTTTTGAGTTTAAATATTTCTTTTATTCATTATGTGATTGTTATTGGTTTG GGTTTGTCATTCATGTATTGGACTTATCAATTTTGCACTTTTCCTAATGCTCATTTGTGT GTGCATTGCAGATAAGATCCACGGAAAAATCGGCGAAGGTTAGTTTAAATTTTTAAGATT CTAAGTACAGTTGTCTTCATCTTTTGTTGATCTATTTCCTTATATTCTGCATTCCATTTG ATATTTCCTTCTTATTCTACAGGAACTTTTGGTCAGGTTTTGGATTGTTTGGATAGGGAA ACAGGGGAGATGGTTGCCATAAAAGTTGTGCGGAGTATTAAGAAATACCGTGAAGCAGCA TTGACAGAAATTGATGTGCTTCAGTTACTGAGGAAGTGTGACAGAAGTGGCAGTTGGTAA GCGTAACTCTTTTATAATTATTGTTATTTGCCGCTTTAGTATATTTATGTTGGTGTATAA GTGGGTTTGTTCTTTTGCAGTTGTGTCCAAATGCGGAACTGGTTTGAATATCGTAACCAT ATCTGTATCGTAAGTATATGATCCGTTTATAATGACATGATTTCCCCAACTTCATATTTA TTTTGGGTGTTTAAGACTTGTTGGTGAATTTAAATGGTCTTAACAGGTTTTTGAGATGCT TGGACCAACTGTATACGATTTTCTTCGGAAAAATAATTATCGCCCTTTTCCTGTTGATCT TGTCCGTGAGCTTGGCAGGCAACTGTTGGAATGTGTAGCATGTGTGTAGTTGGCTAACAC TCCTTTTTCTATAGTTTTCGGCAACATTTTGGGAGTTTTGTGAACCTTTTTAAAGAATTT AGTGGCTGTTTCTGTTATGTCTGTTTAATTAATAAGTTTCTTGTTCTTAATTTATTTTTT GCTTTCATGGGGGCCATTCATTTGTCTTAGAGCAAGATACTGCAACCCTTGACAATGGAT AACAGTAAGTCTATAAATGCTTATGTTTGCACTCATTGTCTGCAGTCATGCATGATTTGC ACCTCATCCATACTGACTTGAAGCCCGAGAACATACTTTTTGTTTCTTCAGATTATGTAA AAATACCTGACTGCAAGGTATGTCAGCTTATATTGTTGATGTTTGGAAATGTCTATGCTT TTTTGGTTTATCAAAGTGAGATGTTGAAATTTTAACTTCTCAATATGTTATTGCAGGTTA CTTCTCGTTCTGCGACAGAGGGAACTCATTACAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCTATCA AGGTTATAGATTTTGGCAGCACGGCTTATGAGAATCAAGATCACAACTATATTGTCTCTA CCAGGCACTACCGTGCACCTGAAGTTATTCTTGGTATGCTTGCTTTTTCCTGTCTAAATA TTTATCGTCATTGCATTTCTTGAAGTTTATGCATGTAAGCTTATTTGAATTAAGGACTTG GATGGAGCTGTCCTTGTGACATATGGAGTGCTGGTTGTATCTTGGTGGAACTGTGCTCGG TATGTTAATAACTCATACTGTTGGTATCTTCGTCAATATTGTAGAATGGGGCAGAATGTT ATGAAGGGTCTGTTTCTTATACTAGGAAAATTCATATAATTTGTATGCAGGGAGAAGCAT TGTTTCAGACACATGAGAACCTAGAGCATTTGGCCATGATGGAAAGGGTTTTAGGCCCAT TACCTCAGCACATGTTGAAAAGAGTAGAGTGAGTGTGATTAAAAAGTATTCTTGTTATCG TCCTCAAGTATAACATGTACTAGTTCATCTATTCTTATAACTTTTGTTTTATGTTGATTG TTGCTTCAGCAAACCTGCTGAGAAGTATGTTAGAAAAGGTAGGTTGGACTGGCCTGAGGG TGCAACATCTCGGGAAAGCATTAAAGCTGTTTTGAAGCTACCTCGTCTTCAGGTTTGTAC AATAACCATGTTCTCTTTAAGTCATATCATTCTTTTGATTTGATGGACACTTTTAGAAAT ATTATTTCTAAGTCTATGTACACCAATTTCTTATACTTATTTTATCTTTGCAGAATCTTG TCATGCAGCATGTAGATCACTCAGCTGGGGATCTCATAGATCTCTTGCAAGGTCTTCTCC AATATGACCCCTCCATCAGACTAACCGCTCATGGAGCTCTTAGGCACCCTTTCTTTAACA GAGATTATTACAGGAAATTTTAG