Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004817Chr1442241974227759+Serine/threonine-protein kinase AFC2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004817.m1124451PF00069.28PkinaseDomain168.61.80E-49
LITCHI004817.m1126362PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain67.61.10E-18
Download   Copy
>LITCHI004817.m1
ATGAAAATGGACTACGTTTCAGAGTTTCCTCACAATCACGTGGATCGTCGTCCGAGAAAG
AGACCTCGATTAGCTTGGGAAACCCCTCAAATCCACACAAAGGCTCAGTCAGGGATATTT
TGTGGGCAAGAGGTTGGCAATGTGACAAGCTATGGCCCTGCGAGGGGACACCTGAACCAT
GCTGCTAGTGTGTTTAAGGGATTGGCTCAAAAAGGCTCCCCCCCACGGCGAGACGATGAC
AAAGATGGACGCTATGTGTTTGCGCTTGGAGAGAATTTAACTTCTCGCTGTAATTACACT
TTTTCATTATCATACTATAGATTACTTACGTTTCTTTTGAAAGAATGTGACTCTTTAGCT
TCAAGTCATTATAAGATCCACGGAAAAATCGGCGAAGGAACTTTTGGTCAGGTTTTGGAT
TGTTTGGATAGGGAAACAGGGGAGATGGTTGCCATAAAAGTTGTGCGGAGTATTAAGAAA
TACCGTGAAGCAGCATTGACAGAAATTGATGTGCTTCAGTTACTGAGGAAGTGTGACAGA
AGTGGCAGTTGTTGTGTCCAAATGCGGAACTGGTTTGAATATCGTAACCATATCTGTATC
GTTTTTGAGATGCTTGGACCAACTGTATACGATTTTCTTCGGAAAAATAATTATCGCCCT
TTTCCTGTTGATCTTGTCCGTGAGCTTGGCAGGCAACTGTTGGAATGTGTAGCATTCATG
CATGATTTGCACCTCATCCATACTGACTTGAAGCCCGAGAACATACTTTTTGTTTCTTCA
GATTATGTAAAAATACCTGACTGCAAGGTTACTTCTCGTTCTGCGACAGAGGGAACTCAT
TACAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCTATCAAGGTTATAGATTTTGGCAGCACGGCTTAT
GAGAATCAAGATCACAACTATATTGTCTCTACCAGGCACTACCGTGCACCTGAAGTTATT
CTTGGACTTGGATGGAGCTGTCCTTGTGACATATGGAGTGCTGGTTGTATCTTGGTGGAA
CTGTGCTCGGGAGAAGCATTGTTTCAGACACATGAGAACCTAGAGCATTTGGCCATGATG
GAAAGGGTTTTAGGCCCATTACCTCAGCACATGTTGAAAAGAGTAGACAAACCTGCTGAG
AAGTATGTTAGAAAAGGTAGGTTGGACTGGCCTGAGGGTGCAACATCTCGGGAAAGCATT
AAAGCTGTTTTGAAGCTACCTCGTCTTCAGAATCTTGTCATGCAGCATGTAGATCACTCA
GCTGGGGATCTCATAGATCTCTTGCAAGGTCTTCTCCAATATGACCCCTCCATCAGACTA
ACCGCTCATGGAGCTCTTAGGCACCCTTTCTTTAACAGAGATTATTACAGGAAATTTTAG
Download   Copy
>LITCHI030614.m1
MKIALGLARGLAYLHEDYFRFAKFSLGSNSHVSTRVMRIFGYLAPEYASSGKLTEKSDTF
SLGVVLLELITGRQPFPRNKCNLDDSMVDWICSCALVGTISYIIEHVLSKMTYITMNFRQ
SLCLHKLWKMASSIYAFVDPNLEEYDSSEMKQMVACAAICVRHLATHRPRMNQMVRVLEG
TISLEELNERVTSGHSKASSYGNSEFDSSQYKDDMKNFKKSARESGEHGSISIHY.
Download   Copy
>LITCHI030614.m1
ATGAAAATTGCTCTAGGCTTAGCGAGAGGATTGGCATATCTGCATGAGGATTATTTTAGA
TTTGCTAAGTTTTCTTTAGGTTCAAACTCTCATGTCTCCACTCGAGTCATGAGAATATTT
GGTTACTTGGCTCCAGAATATGCATCTTCTGGAAAGCTAACTGAGAAATCAGACACATTC
TCCCTTGGGGTTGTGCTTCTAGAGTTGATCACTGGACGTCAACCTTTTCCTAGAAATAAG
TGCAATCTTGATGATAGTATGGTTGACTGGATATGTTCTTGTGCACTTGTGGGTACTATC
TCTTATATAATTGAACATGTACTCAGCAAAATGACTTATATCACTATGAATTTTAGGCAA
AGCCTTTGCTTACACAAGCTTTGGAAGATGGCATCTTCTATATATGCTTTTGTTGATCCA
AATTTGGAAGAGTATGATTCTAGTGAAATGAAACAAATGGTTGCCTGTGCTGCTATCTGT
GTACGTCATTTGGCTACACATAGGCCACGGATGAACCAGATGGTTCGAGTTCTAGAAGGA
ACTATTTCTCTGGAAGAATTGAATGAAAGAGTCACATCAGGGCATAGCAAAGCATCTAGC
TATGGAAACTCAGAATTTGATTCTAGCCAATACAAGGATGACATGAAGAATTTCAAGAAA
TCGGCACGAGAAAGTGGAGAGCATGGTAGTATTTCAATTCACTACTGA
Download   Copy
>LITCHI030614.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTCTTAAAATACTAGGGATTAAAAGGAAGTTTCCTTTTAAATTTTGGATAATTATCATTT
GTTTGTTGTCTTGTTTTCTATCTGTAGCTTTGCATTGAATACAAGGGTTGACAAAATGAG
CAAAGATTCTTTATTATTATTATTATTTTTATTTTTATTTTACTAAACTTTTGATATTCT
AGTGAAACATTAACACAAAAATAGTGGATGACCAAGATTATTACATTTTTATTCTCTTAT
AAATCACATAAATTTAAGTTTTTATTATAAAAAACTTAAATAAAAAATTAATAGGGAATC
TTTACTCTACACAAACAAAAAATTAACATAAAATCATTGCTCTGACAGAATATTTGTTGT
CTTTTGTGATTTATGATTTCCTATTGTTTGAAAATATAGATGTTCTAATTAATGTATGAG
TTTAGTTCAATAATTAATGCAGATGTTCAAATATTCACTCAATTTTGTAGTCGATTAAGG
TGACCATATACCGTATGAACAGTGGCGGACCCAGACATTTATTTTAGGGGGGGCACCTTA
TAACAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGATAAAAATAATTATAATTTATATAA
GTTTTTTTAAGTATAGTTCATATGATTTTTTTTTACTTATAAATTTTATCATGTAAAATA
ATTTATGTAGAAGAAAAATAATTCATGATATATTTTTATCATCTTTTTTTATAGTTCAAA
CCTATATATGATGTATTTTTTAGAAAAAAAAAATATTATGTATTATGGTGGGGAATAAAA
CCGTACACAGCGCATATTTTTTTTTAAAAATAAAAAGAGAGAAAAAATTATGTGTTATTA
TAATTTTGAAAAAAAAATTATCTATTATGGTGGGGAATTGAACCATAATGATACATAAAA
AGGAAGATCAAACCTTATGGCACCAACACTTTTTTGTATTTGTCATCTAATTTACTTTAA
AAGTTATATATGAAATAACATAGTGTATTTTTGTAGAAAAAAAACTTGGGAAAAAATTTT
TGTTTTGCGGGGGGTATCGAACCTGTAACAAGTACTAAAAAGGCGAGCCTCATACCCATT
GCACCATCTTCTGACAGTGAGCATGTTTACTTTAAATTTTATATATCACATGACCATGGT
GCTTCTTTTGAAAATAAAATAAGAAAAATGTATATGTTGTGGTGGGGGAGCGAACCAGTA
CCAGGAGAGTAAGAAAGCACGCCTCAAGCCAGCGACGCTGGTTACGTAAAATAATCTCTT
TTTCCTTCAAATTATATATATAATATATTTAAAGATTTAACAATTAATATTATTAATTTA
ATTAATTTTCAAAAAATTTCAGGGGAGGCACGTGCCCCCCTGCCCCTAAGGTAGGTCCGC
CCCTGCGTATGAACAAAATTAATTGGAGTTCGATGTGACAATATCTGCTGACAATACTTT
CTGTTGGTCTATATTATTCTCTCCAGATGACCCACCACCATCCCCAAGCCCTCCAATTGG
AAATTTGCAAGGCTCATTTACTTATGAAGAACTAAAGATGGCAACGGATAATTTCTCTGA
AGCAAACCTTCTTGGTCAATGTGGTTTTGGTAATGTCCATAAAGGGATTCTTCCAAATGA
AAAGGTGGTAGCAATCAAACAGCTAAAAACCGGAAGCCGACAAGGGGAGCGTGAGTTTCA
GGTAGAGGTTGACATAATTACTCGTGTTTATCATAGACATCTTGTCTCTCTGGTTGGATA
TTGCATGTCCCAGGAGCACAGGTTGCTTGTATGTGAGTTTGTTTTTAACAAAACCTTGGA
ATTCCATTAACACGGTTAGTCCTTTCAGGAACTGGATTTCATTGACTCTATGACCTTGCC
AAAAAGAAAAAAAAAATTGAAAAGGGGTTGTTTGATAAGTGCATAACATTTTGCAAATCT
TAAATCAAGATACTGTGGTCTTACCAAATTGATACAATATCACAGGGAAAGGAAGAGCAG
TTATGAGTTCGCCAATTAGA
Download   Copy
>LITCHI030614.m1 GenomeSequence - 
ATGAAAATTGCTCTAGGCTTAGCGAGAGGATTGGCATATCTGCATGAGGATTGTGAGTAT
TCTGTGCGTTCTATTTTATCAACTGAAACTATATGTATCTCGGAGTTTCACTCTTTTTGG
GGCAAATGTATCTTCAGGTAACCCTAGGATCATACATCATGATATTAATGTAGCTAATAG
TCTTATTGATGAGAGCTTCAAAGCAAAGGCATGATTTTTATTCTTTTCGCATTACTTGTA
GTTTACATATGGAACTATTCTTTACGCATCTATATAGTTTATGTAGGAGTTTGTAAGTGA
GTTACAAAGTCTGATCAGTTTAGATTTTTGTAAATTTCATATTCTCTCCTTGCTTGCTAA
AAGGGAGGGTGTCTCTGTTAGTGAGTTTGGTGTTCTGTGTCTGGTTGTGGTAGGATGAAA
TTTTGTTCCTCTTATCTCTTCCAAGAATTTAAGAAAATCTCACATCGCAAGTCATAGTAC
TATAAACATCATCTTAATTTTCACCCTAATGCTCGTTCCAATAATAAATGAAATATCTTC
ACTAAATATCTTTGCTAAGTGTTGATTTGTTATTTATAAATATCAAAAGGATTCTTTTAC
AACACACACATCCAAAATCCAAAACTAATGTAAAATTTATATTTATTTTTTCAATATATC
AATTAAACTATTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTTTTTCTTTATGTTTTCAATCCTTATACA
CAGATTAACATAGTCCATTTAGAACCTTTTAATAGGTATTGCATGGCATTTGCAAATGCA
TCCATTAGTTGGAGTTGCCAAATTTAAACTTAGTTTATCTATGTGAATTAACAGAATTGT
GAGGAAGTATAATAAATTTATCTACGTGAATTAACAGAATTGTGAGGAAGTATAATAAAT
TATATCTTAAAACTATAAATGTTGTGTACACTAGTATGACATAGATTTGTTTGAAAATGT
TGTGAAAGATACCTTTCTTATTTGAGATTGAACCTCATTTCAATTTATTATTTGAGATTG
CAGATTTTAGATTTGCTAAGTTTTCTTTAGGTTCAAACTCTCATGTCTCCACTCGAGTCA
TGAGAATATTTGGGTAAATTACGTTTTCTTGATTATTATGTATAGTTGCCATACTTCAGT
AAATGCAATTAGTTATCACATGCATCTTGATCAACCAATCCTTTGTCACTTCTGATGCAA
CATTCACCAAATGTAGTTACTTGGCTCCAGAATATGCATCTTCTGGAAAGCTAACTGAGA
AATCAGACACATTCTCCCTTGGGGTTGTGCTTCTAGAGTTGATCACTGGACGTCAACCTT
TTCCTAGAAATAAGTGCAATCTTGATGATAGTATGGTTGACTGGATATGTTCTTGTGCAC
TTGTGGGTACTATCTCTTATATAATTGAACATGTACTCAGCAAAATGACTTATATCACTA
TGAATTTTAGGCAAAGCCTTTGCTTACACAAGCTTTGGAAGATGGCATCTTCTATATATG
CTTTTGTTGATCCAAATTTGGAAGAGTATGATTCTAGTGAAATGAAACAAATGGTTGCCT
GTGCTGCTATCTGTGTACGTCATTTGGCTACACATAGGCCACGGATGAACCAGGTACTTC
ACCAAATGTTATAAACGTAATTTTGGTTTTAAGTTCATAAACCAATATTTAATCATATAT
TGTTAGTAGTTTGACAAAATTGAATGATTTAAATGTGACTTATGCTAGAATGCTAATTAT
GAAATCTATACTTGTATAAATATAATCCTTTTATCATGTAACCATGTTAAGCAGATGGTT
CGAGTTCTAGAAGGAACTATTTCTCTGGAAGAATTGAATGAAAGAGTCACATCAGGGCAT
AGCAAAGCATCTAGCTATGGAAACTCAGAATTTGATTCTAGCCAATACAAGGATGACATG
AAGAATTTCAAGAAATCGGCACGAGAAAGTGGAGAGCATGGTAGTATTTCAATTCACTAC
TGA