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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004652 | Chr14 | 2961680 | 2964778 | + | Squamosa promoter-binding-like protein 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004652.m1 | 188 | 261 | PF03110.17 | SBP | Domain | 108.4 | 1.80E-31 |
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>LITCHI004652.m1 ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA GCTAGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTTCCATGGTCTATCAGAG TTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGACGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGC AAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAATCCAACAAGGCTGTCTTCCTCGCTGTATGAT GGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAAAGAAAGCCCAAC GAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACAAAAGGGTGTGTG TCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGTGGCAATCGAGTG TCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTGTCCAAGGCTAAG GGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTTGCATTCCTATCG GTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTTAAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTA CGCTGTCAGAAAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGGTAAATAAACTAGGT TCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTAGGGCTGCTGGTTCT AAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTGAAGAAGAATCCATGATT TCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACAAAT TCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAACCCCTTAAATACAAGT CATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGTTCTCCTCTTACTTCA TCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCACACCATGGCTTCACAC AATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCACCATATGAGAGTGGT TTTTATTTTAATCATATGAACTGA
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>LITCHI004652.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTTGATTCCTGAAAAAAACCTCATTCTTCTCCAGCTCACACAGCCTCTCTTTGCATCTC TCCTTCCACTCAACAAAAAATTTCAGGTAATTTTGATAATTTTTGCATTTATTTGAAACA AATCTTTTAATTTATTTTTTTTATTGGGATTTACAAGATTTCATGATTGATATGGAAAAT ATAGCAAGTAATAATGATAGGTGGCAAGAGAAAGCGTTGAAAAAATTACAAAAATTACCA AATTTGTAGAAACATCTGTTTATGTGTTTTTTTTTTTAATTTTAATTTTATTTTTTTGCG GCTCAGATTGAAACATCATTTTCTGTGGTGTTGTGTGTGTTTTGTCTCGACTTTTATAAA AGGAAATAAAAGAAGTTAAAGATGCTTTTACTTTCTTTTCCATTCTCATCATCCGTATTC TCTTTCAATTCTTTTTTCCAGGAAAATGATTGGAACCTCTAACAAAACGCAGTCGTTTCT GTGATTTTTTATTTTATTTTATTTTTTGTGAAATAGGAAACCCTAGAAAATGGGACCCGG ATTTTTCTTCGATGGTTTTGTCCTGGTTCTGTTTATTTATTTTTTTGTAATGGGTATATT TTATATGAAGAATATAAAAGAAAATGATCTGTCAACGGCTTCTTTCTTCTTTTTTTTTTT TAAAAATTTTTTCAGGAGGGTAGTTGTAGAAATTTGAGTGAGTTATATGATTGATGAGGG GGGCATTTGTGTTGATGTAGTGTGGTTTGTTGATTGGTATTTAATGTTTTTTATTAAATT AGGAGGTGATAGAAGGTTGTTGGCATCGATTATTTCGGTGAGTGGTACACAAGCAGAGAT TTTTGTTTGGGTATTTTTTAGTGTTTGAAGGTGTAGTTGAACTTTTGGTTTGGTAAGGTT TTTATTTTTATTTTTTATTATTATTTTTTTAATTTTTGCGCTTAATTTTTAGTAATAGTT GTTGGTTTTGTTGATTTGTGGTTGTGGGGTCTTGAAAGTACACACACAGTTATCAGTATT TTGCCCAGATGTTGGAAATGGGAATTATTGGGGGTTATGGTAAAAAAGGTGATATATTTC TATTTAATACGGTGACACCTTGTGGAAAATTAAATTATTGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA GAGAGCTGGGTTCACAGAATAAAAGGGTTGGTTTGTGGTTAATTTTAGATAAAGGTCAGT TCTTTGTGAGGATTTTGACTTGATATTTAGATTAGAAATAGCTGCAAACTGTTGTGGGAG CTTGGGGAACAAATACCATCCCTTATCAAACTGGTTGGTGGTGGTTATTTATAGAAGTTT GTAGCTAGTTGTGTTTAAATTCTTGTTACTGGTTTTATTATCTTGGATATGATGATGGGA GGAAAGGTTTTCTGGTATTGATAGCTCGAGGTTTGGAGCTTGCTTGATCAGATCCATGTC TGCTTGAAGTCTTGATTAAAGTAATTGGTTTTGGCCAGGATGGAAATTACGATCTGTGAG AGAGTTATTGGGATGGGAAGTGATTTTTCTTGAATTGAGTTATGTATTCTTTTTTTTTTT TTTTTTAACTTGTGTAGTTTTGACCTCTCTGGTGCTCCCTGTTCATACTCTTGAACTGTG GTAGTTTAAGCAAAGCATCAGTCTAATTGTTTGTTCAAATTTGGATAACCGGTTTTGTTC TGCAAAGGAGGTCACTGATTTTCATTTTGTTGGTATAAGAATCTTTACAAACAGATATGG TTTGCCATTTCTTGTTGTGAGATTTGAAGGTGAGGTGTGCTTTTGTTATCTGTTGCATCA TATACTGGTTTTGTTGGAACCTGTTTGTTGCTATGTGCATGTTTAGCGTTTTTGTGTTTT GCGTGTCGGTATCTCTAGTTTCGTTCAGCCTTATTTGAATATGTCACACATAACCTGATG TTTATAATGTGTGCAGGATCTGGCATCGCTGTTGCTAGTGCATTTTATGGAGAATAGTGT GTGAACTGTGAAGTACTTCT
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>LITCHI004652.m1 GenomeSequence + ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA GCTAGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTATAGCATCTTTTTGTTT TTTTGACGGATTGTATGTTGGAATCTGAGGATGCTTTATTTAGGTGCCTGTTTTGTTGAA TTTCACAATAGTGCTGCATGGAGCTATTTAGATAATGGCCTTGATTGTAAATATGTGGTA AACTTGCTTGAAATATTATATTCATGAATTATGATGTTGATTTTTGATAACATGTTTACT TGATGTCAAAGGTTCCATGGTCTATCAGAGTTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGA CGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGCAAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAAT CCAACAAGGCTGTCTTCCTCGCTGTATGGTAATAGCTTTAAACTCATACTCATAAAAAAG TTGCTTGGTATATTGCTCACCAACCACAGATATAATCAATAATTCTTTATCCTGGAAAAT CCTAATTTGATGTTGATTACTTTTGTTCATATTGAGGTTTTCTTTTGTATGATTGTTCAA ATAGAAGGATTTGCATGTCTTAACTTATATAAATTGTTCAATTTGAGGAATCTCTCATTA TCTTCCACGGACGGTCAATAGCAAAACTTCAATTCTGCATACAAGTATTGCTTTTTGTAA CAATTGCTCCACCAGTTTGGCTCATCAGCACTCAGTTTCAACCAGTACAGTCTTTTGGTG ATGTAGGTATAATTAGTACTACACTATACGTATGCATGAAATTTGATATGATCTTTGCCT GTTTTTGCAGATGGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAA AGAAAGCCCAACGAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACA AAAGGGTGTGTGTCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGT GGCAATCGAGTGTCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTG TCCAAGGCTAAGGGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTT GCATTCCTATCGGGTATGCTCAGGAGGCCAACAAAAGATTATAACATGCTATATTTTATT AGAAAACCAAATTTTGTTGCTCACCACAGGCTTATTGGTCAAAACTTTCAAAGTAAACAT TAATTTCACAAGTAAGATATTGTTAGCTAATCCAAATGTCTACAAATGGGGCCAGCCTAC AAGAGATACTTAACATGCCGACGGTCATCTTTATTGGAGGTGCCCTTACTGTCTTACGGG TACCTGCTGAATTTGGAAAGGTTAAATGAAATGAGAATTTTTTTTGTGGTGTATCCTAGG AGCAGCAATGAACACCAATGTAGCCTTTTTCTTCCACTGTAAAATGTTCAAATGCATACT CTTTTATCTTTATCCCTTTAGTGCATAACTACACCACCTGTACAGCCTTTGCATGCATAA TAGATACCTAGCATTGGCTTTATTATTATATATTAAACTTGGTTATTTGTAACTGTAAAT ACAATGTTGATTAACATTATGCTTATGGTCAGTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTT AAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTACGCTGTCAGAAAGGTTAAGATCTATGAAG TAGTTGGGCAGACATGAATTAACCCTATAGTACAGACCATTTTTTTTTTTTTTAATATAC TGACACTCATGAAATTGGTTAATGGAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGG TAAATAAACTAGGTTCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTA GGGCTGCTGGTTCTAAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTAATA ACCATTGCAAAGTTTTTCAAAATATATCAACCCAAGAAAAATGTGATTTCATAAGGAAGA TGATGGAATGGTGATTGAATCAGAAAGTAAAATAAATTTAAGGCATTCTTATGGTGGACC TTTGATGTCTGTCTAATGTTATGTCCTTTTAACTTGGATTGATGAAATTTTGCAGGTGAA GAAGAATCCATGATTTCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCT CTTCTGTCAACAAATTCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAAC CCCTTAAATACAAGTCATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGT TCTCCTCTTACTTCATCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCAC ACCATGGCTTCACACAATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCA CCATATGAGAGTGGTTTTTATTTTAATCATATGAACTGA