Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004652Chr1429616802964778+Squamosa promoter-binding-like protein 2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004652.m1188261PF03110.17SBPDomain108.41.80E-31
Download   Copy
>LITCHI004652.m1
ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA
AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG
TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT
GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA
TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG
GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA
GCTAGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA
AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA
TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT
CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT
AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG
GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTTCCATGGTCTATCAGAG
TTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGACGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGC
AAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAATCCAACAAGGCTGTCTTCCTCGCTGTATGAT
GGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAAAGAAAGCCCAAC
GAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACAAAAGGGTGTGTG
TCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGTGGCAATCGAGTG
TCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTGTCCAAGGCTAAG
GGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTTGCATTCCTATCG
GTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTTAAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTA
CGCTGTCAGAAAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGGTAAATAAACTAGGT
TCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTAGGGCTGCTGGTTCT
AAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTGAAGAAGAATCCATGATT
TCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACAAAT
TCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAACCCCTTAAATACAAGT
CATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGTTCTCCTCTTACTTCA
TCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCACACCATGGCTTCACAC
AATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCACCATATGAGAGTGGT
TTTTATTTTAATCATATGAACTGA
Download   Copy
>LITCHI004652.m1
MSSVSLMEWNGKIPIQWDWENLIMFNGTAAENSRKLQQTEWEIDGDGGIDSASFFSSGGI
GSSGGSGSDLVLASLSKSSKSVSNNSSSVGETKTSKFNLEAFEEIPEDVGNRKEFARVEP
ASGSPTLEASVGSGEPLLGLKLGKRMYFEDVCAGSNTKNLSSSAAPASSVTPVKRSKLNY
QSQHAPRCQVEGCSLDLSSAKDYHRKHRVCESHSKSPKVMVGGLERRFCQQCSRFHGLSE
FDEKKRSCRRRLSDHNARRRKPQPEAVRLNPTRLSSSLYDGKQQISFVWNRTPFVQRKPN
ESFTWEGSCGSESIQTKGCVSKHAKAGGTNGLLHLGGNRVSNSLTANYQNSNGFFLSKAK
GATEVLNQGLFCLVCFAFLSVHSFARAKLLRLVLVKAHLLRCQKVDSLKRIWTGRVNKLG
SNRFKGQFRVLEGWGRAAGSKELGSAADLWENLGEEESMISFNLGATQDCHRALSLLSTN
SWGGVCEPKSVPLSNPLNTSHTNMPQTVMHAMAQGSPLTSSEYRRTGKESTAQVHTMASH
NDEGNYTQEFRLLKAPYESGFYFNHMN.
Download   Copy
>LITCHI004652.m1
ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA
AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG
TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT
GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA
TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG
GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA
GCTAGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA
AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA
TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT
CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT
AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG
GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTTCCATGGTCTATCAGAG
TTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGACGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGC
AAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAATCCAACAAGGCTGTCTTCCTCGCTGTATGAT
GGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAAAGAAAGCCCAAC
GAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACAAAAGGGTGTGTG
TCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGTGGCAATCGAGTG
TCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTGTCCAAGGCTAAG
GGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTTGCATTCCTATCG
GTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTTAAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTA
CGCTGTCAGAAAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGGTAAATAAACTAGGT
TCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTAGGGCTGCTGGTTCT
AAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTGAAGAAGAATCCATGATT
TCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACAAAT
TCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAACCCCTTAAATACAAGT
CATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGTTCTCCTCTTACTTCA
TCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCACACCATGGCTTCACAC
AATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCACCATATGAGAGTGGT
TTTTATTTTAATCATATGAACTGA
Download   Copy
>LITCHI004652.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ACTTGATTCCTGAAAAAAACCTCATTCTTCTCCAGCTCACACAGCCTCTCTTTGCATCTC
TCCTTCCACTCAACAAAAAATTTCAGGTAATTTTGATAATTTTTGCATTTATTTGAAACA
AATCTTTTAATTTATTTTTTTTATTGGGATTTACAAGATTTCATGATTGATATGGAAAAT
ATAGCAAGTAATAATGATAGGTGGCAAGAGAAAGCGTTGAAAAAATTACAAAAATTACCA
AATTTGTAGAAACATCTGTTTATGTGTTTTTTTTTTTAATTTTAATTTTATTTTTTTGCG
GCTCAGATTGAAACATCATTTTCTGTGGTGTTGTGTGTGTTTTGTCTCGACTTTTATAAA
AGGAAATAAAAGAAGTTAAAGATGCTTTTACTTTCTTTTCCATTCTCATCATCCGTATTC
TCTTTCAATTCTTTTTTCCAGGAAAATGATTGGAACCTCTAACAAAACGCAGTCGTTTCT
GTGATTTTTTATTTTATTTTATTTTTTGTGAAATAGGAAACCCTAGAAAATGGGACCCGG
ATTTTTCTTCGATGGTTTTGTCCTGGTTCTGTTTATTTATTTTTTTGTAATGGGTATATT
TTATATGAAGAATATAAAAGAAAATGATCTGTCAACGGCTTCTTTCTTCTTTTTTTTTTT
TAAAAATTTTTTCAGGAGGGTAGTTGTAGAAATTTGAGTGAGTTATATGATTGATGAGGG
GGGCATTTGTGTTGATGTAGTGTGGTTTGTTGATTGGTATTTAATGTTTTTTATTAAATT
AGGAGGTGATAGAAGGTTGTTGGCATCGATTATTTCGGTGAGTGGTACACAAGCAGAGAT
TTTTGTTTGGGTATTTTTTAGTGTTTGAAGGTGTAGTTGAACTTTTGGTTTGGTAAGGTT
TTTATTTTTATTTTTTATTATTATTTTTTTAATTTTTGCGCTTAATTTTTAGTAATAGTT
GTTGGTTTTGTTGATTTGTGGTTGTGGGGTCTTGAAAGTACACACACAGTTATCAGTATT
TTGCCCAGATGTTGGAAATGGGAATTATTGGGGGTTATGGTAAAAAAGGTGATATATTTC
TATTTAATACGGTGACACCTTGTGGAAAATTAAATTATTGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA
GAGAGCTGGGTTCACAGAATAAAAGGGTTGGTTTGTGGTTAATTTTAGATAAAGGTCAGT
TCTTTGTGAGGATTTTGACTTGATATTTAGATTAGAAATAGCTGCAAACTGTTGTGGGAG
CTTGGGGAACAAATACCATCCCTTATCAAACTGGTTGGTGGTGGTTATTTATAGAAGTTT
GTAGCTAGTTGTGTTTAAATTCTTGTTACTGGTTTTATTATCTTGGATATGATGATGGGA
GGAAAGGTTTTCTGGTATTGATAGCTCGAGGTTTGGAGCTTGCTTGATCAGATCCATGTC
TGCTTGAAGTCTTGATTAAAGTAATTGGTTTTGGCCAGGATGGAAATTACGATCTGTGAG
AGAGTTATTGGGATGGGAAGTGATTTTTCTTGAATTGAGTTATGTATTCTTTTTTTTTTT
TTTTTTAACTTGTGTAGTTTTGACCTCTCTGGTGCTCCCTGTTCATACTCTTGAACTGTG
GTAGTTTAAGCAAAGCATCAGTCTAATTGTTTGTTCAAATTTGGATAACCGGTTTTGTTC
TGCAAAGGAGGTCACTGATTTTCATTTTGTTGGTATAAGAATCTTTACAAACAGATATGG
TTTGCCATTTCTTGTTGTGAGATTTGAAGGTGAGGTGTGCTTTTGTTATCTGTTGCATCA
TATACTGGTTTTGTTGGAACCTGTTTGTTGCTATGTGCATGTTTAGCGTTTTTGTGTTTT
GCGTGTCGGTATCTCTAGTTTCGTTCAGCCTTATTTGAATATGTCACACATAACCTGATG
TTTATAATGTGTGCAGGATCTGGCATCGCTGTTGCTAGTGCATTTTATGGAGAATAGTGT
GTGAACTGTGAAGTACTTCT
Download   Copy
>LITCHI004652.m1 GenomeSequence + 
ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA
AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG
TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT
GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA
TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG
GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA
GCTAGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA
AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA
TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT
CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT
AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG
GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTATAGCATCTTTTTGTTT
TTTTGACGGATTGTATGTTGGAATCTGAGGATGCTTTATTTAGGTGCCTGTTTTGTTGAA
TTTCACAATAGTGCTGCATGGAGCTATTTAGATAATGGCCTTGATTGTAAATATGTGGTA
AACTTGCTTGAAATATTATATTCATGAATTATGATGTTGATTTTTGATAACATGTTTACT
TGATGTCAAAGGTTCCATGGTCTATCAGAGTTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGA
CGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGCAAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAAT
CCAACAAGGCTGTCTTCCTCGCTGTATGGTAATAGCTTTAAACTCATACTCATAAAAAAG
TTGCTTGGTATATTGCTCACCAACCACAGATATAATCAATAATTCTTTATCCTGGAAAAT
CCTAATTTGATGTTGATTACTTTTGTTCATATTGAGGTTTTCTTTTGTATGATTGTTCAA
ATAGAAGGATTTGCATGTCTTAACTTATATAAATTGTTCAATTTGAGGAATCTCTCATTA
TCTTCCACGGACGGTCAATAGCAAAACTTCAATTCTGCATACAAGTATTGCTTTTTGTAA
CAATTGCTCCACCAGTTTGGCTCATCAGCACTCAGTTTCAACCAGTACAGTCTTTTGGTG
ATGTAGGTATAATTAGTACTACACTATACGTATGCATGAAATTTGATATGATCTTTGCCT
GTTTTTGCAGATGGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAA
AGAAAGCCCAACGAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACA
AAAGGGTGTGTGTCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGT
GGCAATCGAGTGTCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTG
TCCAAGGCTAAGGGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTT
GCATTCCTATCGGGTATGCTCAGGAGGCCAACAAAAGATTATAACATGCTATATTTTATT
AGAAAACCAAATTTTGTTGCTCACCACAGGCTTATTGGTCAAAACTTTCAAAGTAAACAT
TAATTTCACAAGTAAGATATTGTTAGCTAATCCAAATGTCTACAAATGGGGCCAGCCTAC
AAGAGATACTTAACATGCCGACGGTCATCTTTATTGGAGGTGCCCTTACTGTCTTACGGG
TACCTGCTGAATTTGGAAAGGTTAAATGAAATGAGAATTTTTTTTGTGGTGTATCCTAGG
AGCAGCAATGAACACCAATGTAGCCTTTTTCTTCCACTGTAAAATGTTCAAATGCATACT
CTTTTATCTTTATCCCTTTAGTGCATAACTACACCACCTGTACAGCCTTTGCATGCATAA
TAGATACCTAGCATTGGCTTTATTATTATATATTAAACTTGGTTATTTGTAACTGTAAAT
ACAATGTTGATTAACATTATGCTTATGGTCAGTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTT
AAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTACGCTGTCAGAAAGGTTAAGATCTATGAAG
TAGTTGGGCAGACATGAATTAACCCTATAGTACAGACCATTTTTTTTTTTTTTAATATAC
TGACACTCATGAAATTGGTTAATGGAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGG
TAAATAAACTAGGTTCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTA
GGGCTGCTGGTTCTAAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTAATA
ACCATTGCAAAGTTTTTCAAAATATATCAACCCAAGAAAAATGTGATTTCATAAGGAAGA
TGATGGAATGGTGATTGAATCAGAAAGTAAAATAAATTTAAGGCATTCTTATGGTGGACC
TTTGATGTCTGTCTAATGTTATGTCCTTTTAACTTGGATTGATGAAATTTTGCAGGTGAA
GAAGAATCCATGATTTCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCT
CTTCTGTCAACAAATTCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAAC
CCCTTAAATACAAGTCATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGT
TCTCCTCTTACTTCATCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCAC
ACCATGGCTTCACACAATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCA
CCATATGAGAGTGGTTTTTATTTTAATCATATGAACTGA