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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004647 | Chr14 | 2937758 | 2940855 | + | Squamosa promoter-binding-like protein 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004647.m1 | 188 | 261 | PF03110.17 | SBP | Domain | 108.4 | 1.80E-31 |
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>LITCHI004647.m1 ATGAGTTCTGTCTCACTGATGGAGTGGAATGGGAAAATCCCCATACAGTGGGACTGGGAA AACCTTATTATGTTCAATGGAACTGCTGCTGAAAATTCTCGGAAGCTGCAACAAACTGAG TGGGAAATTGATGGGGATGGGGGCATTGACTCTGCATCTTTCTTTTCATCAGGGGGTATT GGCAGTAGTGGTGGTTCTGGCTCTGATTTGGTACTTGCTTCTTTGTCGAAGAGCTCAAAA TCAGTTTCCAATAATTCATCGTCAGTGGGGGAAACTAAAACATCTAAATTTAATCTGGAG GCTTTTGAGGAAATTCCAGAAGATGTTGGCAATAGGAAAGAATTTGCTAGGGTTGAGCCA GCTGGTGGTTCCCCGACACTTGAGGCTTCAGTTGGCTCGGGTGAGCCATTACTTGGTTTA AAGCTTGGTAAGCGAATGTACTTCGAAGATGTTTGTGCTGGGAGCAATACTAAGAATTTA TCTTCTTCTGCGGCTCCTGCATCCTCTGTAACTCCAGTAAAGAGATCCAAGTTGAATTAT CAGAGTCAACATGCTCCGCGTTGCCAAGTCGAAGGCTGTAGCCTTGACCTCTCATCAGCT AAAGATTATCACCGCAAACATAGAGTTTGTGAAAGTCATTCAAAGTCCCCAAAAGTTATG GTGGGTGGTCTTGAACGTCGGTTTTGCCAGCAGTGTAGCAGGTTCCATGGTCTATCAGAG TTTGATGAAAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGACGTCTATCTGATCACAATGCTAGGCGCCGC AAGCCACAGCCAGAAGCAGTCCGGTTAAATCCAACAAGGCTTTCTTCCTCGCTGTATGAT GGGAAGCAACAGATAAGCTTTGTTTGGAATAGGACCCCATTTGTTCAAAGAAAGCCCAAC GAAAGCTTTACGTGGGAAGGCTCTTGTGGCTCCGAGTCCATTCAAACAAAAGGGTGTGTG TCAAAGCACGCAAAAGCTGGAGGCACTAATGGGCTGCTGCATTTAGGTGGCAATCGAGTG TCAAACTCACTTACTGCAAATTATCAAAATTCCAATGGGTTCTTCCTGTCCAAGGCTAAG GGTGCTACTGAGGTTCTCAACCAAGGTTTGTTTTGCTTAGTATGTTTTGCATTCCTATCG GTGCATTCTTTTGCTAGGGCAAAACTGTTAAGACTTGTTCTAGTAAAAGCTCACCTCTTA CGCTGTCAGAAAGTTGACAGTCTAAAAAGAATTTGGACTGGCAGGGTAAATAAACTAGGT TCAAATAGATTTAAGGGGCAATTCAGGGTTCTGGAGGGGTGGGGTAGGGCTGCTGGTTCT AAGGAATTGGGTAGTGCTGCAGACCTGTGGGAAAATCTAGGTGAAGAAGAATCCATGATT TCGTTCAATTTGGGTGCGACACAAGATTGTCATCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACAAAT TCTTGGGGGGGTGTATGTGAGCCAAAATCGGTTCCACTTAGCAACCCCTTAAATACAAGT CATACCAACATGCCTCAGACTGTGATGCATGCAATGGCCCAAGGTTCTCCTCTTACTTCA TCAGAATACCGGCGGACTGGAAAAGAGTCTACTGCCCAAGTGCACACCATGGCTTCACAC AATGATGAAGGCAATTATACTCAAGAGTTCCGACTGCTCAAAGCACCATATGAGAGTGGT TTTTATTTTAATCATATGAACTGA
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>LITCHI004647.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAAAACCTCATTCTTCTCCAGCTCACACAGCCTCTCTCTGTATCTCTCCTTCCACTCAA CAAAAAATTTCAGGTAATTTTGATAATTTTTGCATTTATTTGAAACAAATCTTTTAATTT ATTTTTTTTATTGGGATTTACAAGATTTCATGATTGATATGGAAAATATAGCAAGTAATA ATGATAGGTGGCAAGAGAAAGCGTTGAAAAAATTACAAAAATTACCAAATTTGTAGAAAC ATCTGTTTATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTATTTTTTGCGGCTCAGAT TGAAACATCATTTTCTGTGGTGTTGTGTGTGTTTTGTCTCGACTTTTATAAAAGGAAATA AAAGAAGTTAAAGATGCTTTTACTTTCTTTTCCATTCTCATCATCCGTATTCTCTTTCAA TTCTTTTTTCCAGGAAAATGATTGGAACCTCTAACAAAACGCAGTCGTTTCTGTGATTTT TTATTTTATTTTATTTTTTGTGAAATAGGAAACCCTAGAAAATGGGACCCGGATTTTTCT TCGATGGTTTTGTCCTGGTTCTGTTTATTTATTTTTTTTGTAATGGGTATATTTTTTATG AAGAATATAAAAGAAAATGATCTGTCAACGGCTTCTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTT TAAATTTTTTCAGGAGGGTAGTTGTAGAAATTTGAGTGAGTTATATGATTGATGAGGGGG GCATTTGTGTTGATGTAGTGTGGTTTGTTGATTGGTATTTAATGTTTTTTATTAAATTAG GAGGTGATAGAAGGTTGTTGGCATCATCGATTATTTCGGTGAGTGGTACACAAGCAGAGA TTTTTGTTTGGGTATTTTTTAGTGTTTGAAGGTGTAGTTGAACTTTTGGTTTGGTAAGGT TTTTATTTTTATTTTTATTATTATTTTTTTAATTTTTGCGCTTAATTTTTAGTAATAGTT GTTGGTTTTGTTGATTTGTGGTTGTGGGGTCTTGAAAGTACACACACAGTTATCAGTATT TTGCCCAGATGTTGGAAATGGGAATTATTGGGGGTTATGGTAAAAAAGGTGATATATTTC TATTTAATGCAGTGACACCTTGTGGAAAATTAAATTATTGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA GAGAGCTGGGTTCACAGAATAAAAGGGTTGGTTTGTGGTTAATTTTAGATAAAGGTCAGT TCTTTGTGAGGATTTTGACTTGATATTTAGATTAGAAATAGCTGCAAACTGTTGTGGGAG CTTGGGGAACAAATACCATCCCTTATCAAACTGGTTGGTGGTGGTTATTTATAGAAGTTT GTAGCTAGTTGTGTTTAAATTCTTGTTACTGGTTTTATTATCTTGGGTATGATGATGGGA GGAAAGGTTTTCTGGTATTGATAGCTCGAGGTTTGGAGCTTGCTTGATCAGATCCATGTC TGCTTGAAGTCTTGATTAAAGTAATTGGTTTTGACCAGGATGGAAATTACGATCTGTGAG AGAGTTATTGGGATGGGAAGTGATTTTTCTTGAATTGAGTTATGTATTCTTTTTTTTTTT TTTTTTTACTTGTGTAGTTTTGACCTCTCTGGTGCTCCCTGTTCATACTCTTGAACTGTG TTAGTTTAAGCAAAGCATCAGTCTAATTGTTTGTTCAAATTTGGATAACCGGTTTTGTTC TGCAAAGGAGGTCACTGATTTTCATTTTGTTGGTATAAGAATCTTTACAAACAGATATGG TTTGCCATTTCTTGTTGTGAGATTTGAAGGTGAGGTGTGCTTTTGTTATCTGTTGCATCA TATACTGGTTTTGTTGGAACCTGTTTGTTGCTATGTGCATGTTTAGCGTTTTTGTGTTTT GCGTGTCGGTATCCCTAGTTTTGTTCAGCCTTATTTGAATATGTCACACATAACCTGATG TTTATAATGTGTGCAGGATCTGGCATCGCTGTTGCTAGTGCATTTTATGGAGAATAGTGT GTGAACTGTGAAGTACTTCT
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>LITCHI021516.m1 GenomeSequence - ATGGGTTACATATGTGATTTTTGTGGGGAACAAAGATCCATGGTGTATTGCCGATCTGAT GCAGCATGTTTATGTTTATCGTGTGACCGAAATGTACATTCAGCTAATGCCTTGTCAAAA CGCCATTCAAGGACCCTTTTATGTGAAAGATGTAATTCACAGCCGGCATTAGTTAGATGT GCCGAAGAGAGAGTATCTTTGTGTCAGAATTGTGATTGGATGGGTCATGGAACCTCTACA TCAGCTTCAACACATAAGAGGCAAACAATCAATTGTTATTCTGGCTGTCCGTCAGCTGCA GAGCTTTCTTCAATTTGGTCATTTGTTTTAGATGCTCCATCTGTGGGTGAATCTGCTTGT GAACAGGAATTGAGTTTGATGAGCATCGCTGATAACAGCATGAAGAATTCCTGGGGCCCT AATGAAGACACTGTCAGCCAAAATGCATCTGCTGGTGGCAGTGGTGGTGGTGTTGAGATC AGTAATATGCATGACATGGATAAGTCAGGTGTCTGGGTTGGGACTTCATCTACACCTGGA CTTGGCCCTGCTCCACAAAATCTTGAACGACCAACTGGATCAGCTAATAATGCGGCTTTG CCCAAGGTAGAATCTGCTTTTGAAATATCTATTATTTTGATGGCTAAATAATCTCCTTTG TAGAAATTTTGGTATTCAGCTGTTGGTTCCTTTTATCAATTAGTTGAAAATCTAGTTTCT GAGTCTAATATAGAGGATAAGGGGTAAAAGTTTGATGTGATGAGCAGTTTTTCCGGATTC TTCCATTTCATGATTCTATAGTGTGCTAAATTGAAAAGATATGGCAATTTCTCATCATTT CCGGTTCTTAGATTGAACTAAATTAACCGGTTCTGAAAGTTTCTGCTGTTTGGGATATCG TTTAGCTTAAAGTTACTATGATGGTCCTGCACCTTTTCCAGATGCCACATCTAGTCATTG CTACAAGAGTGGTCACCAAAGCAGCTTCTCATCATTAGGATTATGAAATTTAGGATTGAG AATCAGAGAGAGAATACGTCAAAGAGAGAAAAAAACGGATGAGAAGGGAAAGAAGAGATA ACCTTTGATCTAAGATTTAGAGAGGTAGAGAGAGGAGGAAGAATCAGGGGATTAAGGGAG TAATATTCTTACAAAATGGGGAGAAAGGATATTATTCTCAGTCTTGGGTTTAGTTTGTAG TGAGGGAGAGGGAAAGTAAATATCTCATCTATAATTTTTCCCGTCTGAAATTCTTTGCCC TCATACAATCCTGATTTGAGTCTTGATGCAGGCATGTTTCCCAATAGTTAATGCATATGA TGACCCTTACATGTAACCTAATTATGTTAGAGCCCAGAGCAACAGCATATTGTTCTTAAA TTCTCTTGAAAACATGGTCCAAATTCATGAACTAATTTTTACTTTATTAGTAAAAATAAG AAGCAAATAAGGTGTACTAAGTGCAGTACTTCTAGTTGTGAGTGACAGGGTTTTCAAATA TATGCATTACATAGACTACCATACTATTGGGAATATGACATGGTCTTGGCATGTGTTTTC ATACAACAAAACAGAGATTTCTTCATTGAATGAATTTTAAGGCCACCACTAGTTATTGTT GTGGTGTTCACCGCATACAGTCCTAGCTAAAGTGATGTATTGATATAATGGAACATGTGG CGCATGATGTGGCTAACACTCTTGGTTATATGATTGCTGTGGTATGATGGACCTATTTCA TAATATTTTTTGTTGCAGTTTCTTGTTATTACATGCAAAGTATTCAGTTTTAGTAGGTGA GCAGTAGTTTACATGCACAATTATATTGAATTCTGATTCGAACAAATGGACGGATCTATC TTATTCGTTCCTAAGATAAGTCTCAGCAGTCTCTAATGAATTTGAACAATTTAGCGTCTT TCTGATGTAAAATGGCTTCAATAAATCACAGTGCCTTTATCATAATGTACAGCATTCATT AAGCTAGTTCACCCAAATAATATGTCCAGTTAAACTTGCCAATGTGCTAATTTCTATTTC TTGATTTGTTGAGGACCTTTGCAAATTTTCATTTCATTAATATGCAGTTATACTGTCCTG CAACGAAAGGTCCTGCTTTCTGTGAAGATGATGACTTCTATGAGGACTTCAATATGGATG AAGTGGATTTGAATATTGAGAATTATGAAGAACTCTTTGGTGTGACTCTCAATCATTCAG AAGAGCTTTTTGAAAATGGTGGAATTGACAGCTTATTTGGGACAAAGGACATGTCTGCTG CTGATTCCAACTGTCAGGGTGCAGTTGCTGCTGAGGTTTTCTCATCTCATTTAATCTTGC TTTATGCTTTCCACAAAATTATTGTCAGCATTAGTGATGTATGCCTGATACGATAGGTTG TGTCTGTCATTTTTCAAGTGGTCTGAACTGGCAAGGTTTTTCCCATCTGTATATTCTAAA TATTGAATTTCTCATCTTTTTGGTCAAACCACAAAGTCTTATTTTAAAAAAATAATGTTC AATAATTCACTGCGTTAAAACATTTTGATTGAATTTTGTAGATGTTCTTGTTGCTAGGGT CTTTTAGTTAGAAGGTTCTGCTATATCTACTGAACGGTAAAACTGTCTATATGTTGGCCA AATTTATGAAAGTGATAACTTGCCAATTTTATGTGTTATTGCATTCAAATCTTCTTTGTA AAAATATCTGGTGATCCATATTGATAGAATATTTGCTGTAATCATAACAGGGTCCATAAC TTGAACATTCATGTCCATGGTTGGAAAACCCTTCAAATTTTCATTGTAAAACTTCCCCCT AGTTAGCAAATTTGTTTCTTACTAACCTTCCTCTTTTCAACCTACAAAGTTACGGTTTTA TCTGGTATATATCTCAATCCTGACTCACATTACACATACTGGAAGCAATTCAACATTGTG ATTAAGGACATCTGAGTTACTTATTAGATTCCTTATTTTCCGAGTTGTGTATTTTTGTTC AGGGCTCATCAGTTGGACTGGTCAATGCAATGCAGCCAGCATGCAGCAATGCAGCATCTG CAGATTCCATGATGAGTACTAAGACTGAACCAATCCTATGTTTCAACGCAAAGCAAGGAC ACTCAAGCCTCTCATTTTCTGGCCTTACTGGTGAGAGTAATGGTGGAGATTACCAAGATT GTGATGCTTCTTCAATGCTTCTCATGGGGGAGCCACCATGGTGCCCTCCATGTCCTGAGG CTTCCTTTACATCAGCAAGCCGCAGTAAAGCTGTCATGCGTTACAAGGAAAAGAAAAAGA CCCGCAAGTAAGTATATGATGATCCATGTTCAGCATTAATCATTATTTCTGAGTTAGCAA TTATGATTTCAGTTGCCTAATCTCTCCCTTTTATTTCAACCCTTTAAATATAAGACTATT CCAGCTTGTTTCTGAATTCCTACTTAGTAATGCTGGTATTGTATGTTGCTTTAATGGTTT GAAAGTTGTTTTAGTTCTTGAATGGACGTGTATGATTCACTGTGTAAATACATGAATACA TGGTCACATTTATGGTTATGTTTTTCTTCTTTCCTGTAAAAATGTAATTATGTATGGAAG TTTAGTTTAGTATTCAAATTCTGTTTGCATATTGGTCTTTTACTAGTAATAAATTTTATA TGCTCTAATGTCCTTTTACATTCATGATAGGTTTGACAAGACAGTGAGGTACGCCTCTCG TAAGGCAAGGGCTGATGTCAGAAGGCGTGTGAAGGGACGCTTTGTCAAAGCTGGTGATGC TTACGATTATGACCCTCTGAGCCAAACCAGAAGCTACTGAGAGTACAGTTTTTTTAACCA TGCTTTAAAAGGAAAGAAACAAACCATGTTTAGTTGGAAAGAGTCGGTTATTATTACCTA AACAATGGATGAAATTGATGGATTTCTTTCCTGTGAAATGACAAGTTGTATGATTGTATC TCAGGGGCCTAGGTTCTCAACGCGAGAAAAGGGTGGATGTTAGGAGGGAAAAAAAAAAAA AAAAAACAGGAAACCGGTTGCAAATGCTCTACAATAAATCTCAGGAGCAGATGGTTGACT ATCCATTACCATAAAGGAAGGATCTTGACAGCTTATGATCTCCTACCATTTGAACGCGCA ACTTCACCTGCTTAATTCTTTTATAAAGAAAAAGGAGAATGCTAATTGCTGTTTCAGTCA TATATACAATCCCTGATCACTATGTCAACTATTAATCTTTTCCTCTGCCTCATCATCATA ACTCTGGACACACTTCTTTAAAGGGGTTGCCATGGCATCATGGGCTGCCAAGGCTCATGA TCGCTAGGTCTCAGCCGGAAAAATCTGCCAGTTGTAGTTTTCACTTTTATTTTCCGTTTG ACATGTATAGCACACCATCTAATATATGCCACAGAACAATGGGTAAGGTCAGGCAGAAAA ACAAAACTTTGCAAATGCAATGTTGTCTTTTTGTTTCTATGGACATGTATAGCAACAGGA TAAATTGTATATGCTTGTTAAGAGAGAGTAGCTTCTAGTTAACTCCAGCTCTAAGTTTTC ACTGTTTTCCATTTCTGCTTGCTGTGACTATAACAGTTGTATTCATTTGTTACTTGGTAC TGTTTTTGTAATGAGGCTTTTTACTAGAGAGCCAGAGGCTTCTGTTACTTAAATCTTCTT CATGTGCAGCTAAGGCATGTATACAGGAAAGCAAGTTTTTATATGCTAAACATCCACTTC TACTTGGTAACTCCACCACAGACAATATCATTTGGCTGCCCCCTGAATATTTCTCTGTTT TTTTTTTTTAATA