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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004635Chr1428177992843653;2843804+MADS-box protein FLOWERING LOCUS C

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004635.m11057PF00319.21SRF-TFDomain91.42.00E-26
LITCHI004635.m184155PF01486.20K-boxFamily49.83.20E-13
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LITCHI004635.m284167PF01486.20K-boxFamily61.57.20E-17
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LITCHI004635.m387156PF01486.20K-boxFamily52.35.30E-14
LITCHI004635.m41057PF00319.21SRF-TFDomain91.32.00E-26
LITCHI004635.m487170PF01486.20K-boxFamily61.47.40E-17
LITCHI004635.m51057PF00319.21SRF-TFDomain91.32.00E-26
LITCHI004635.m587158PF01486.20K-boxFamily49.73.40E-13
LITCHI004635.m61057PF00319.21SRF-TFDomain91.71.50E-26
LITCHI004635.m687156PF01486.20K-boxFamily52.35.30E-14
LITCHI004635.m71057PF00319.21SRF-TFDomain91.71.50E-26
LITCHI004635.m784153PF01486.20K-boxFamily52.45.10E-14
LITCHI004635.m81057PF00319.21SRF-TFDomain91.71.50E-26
LITCHI004635.m887156PF01486.20K-boxFamily52.35.30E-14
LITCHI004635.m91057PF00319.21SRF-TFDomain91.71.50E-26
LITCHI004635.m984153PF01486.20K-boxFamily52.45.10E-14
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GTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGAAAGACACAA
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TTGCTTCTAATGCAAAGGATGTACATTCTTGAAGATGAAGGATTGACAGGAAGATCTAGA
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GTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGAAAGACACAA
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ACCTGTCTTGTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGA
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GGGGGAGCAATGGCTACACTTTCCTTGCTAAAATAG
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CAGCTGTTGCAAATAGTTCAAAGGCAACTTGAAGGGCAAAACTTTGAGCAGATGACTGTG
ACCTGTCTTGTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGA
AAGACACAACTGATGATGGAATCAATAGTGACCCTCCATGAGAAGCTTAACCACTCCATT
TCAACCTCATTGCTTCTAATGCAAAGGATGTACATTCTTGAAGATGAAGGATTGACAGGA
AGATCTAGAACACCTTTAGAGTTAGATACGTTATAG
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CAGCTGTTGCAAATAGTTCAAAGGCAACTTGAAGGGCAAAACTTTGAGCAGATGACTGTG
ACCTGTCTTGTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGA
AAGACACAACTGATGATGGAATCAATAGTGACCCTCCATGAGAAGGTACCGAAACACCTG
CCAAACTTTATTCTATAG
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GTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGAAAGACACAA
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ACCTGTCTTGTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGA
AAGACACAACTGATGATGGAATCAATAGTGACCCTCCATGAGAAGGTACCGAAACACCTG
CCAAACTTTATTCTATAG
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GTCCAACTAGAGAAACAACTTGATGCTGCGCTGACACAAACCAGAGCTAGAAAGACACAA
CTGATGATGGAATCAATAGTGACCCTCCATGAGAAGGTACCGAAACACCTGCCAAACTTT
ATTCTATAG
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QDDCLPFFLDDDSSGPEGSPSFSKRRSSIKSTYGFSIDAKVDGREPTSNALNSMDLTSRH
GNTTRRKSESTSFRHDSHKLSDENLNEPPKLMDQRLATTRSRVGDSLDLIDQDYVLISVP
PMDMSSSSASISKPNPIPNKSESPLRTSVADNTTSSAPMPIIGASKSNFCCIGSLDSQNS
APGTSLGSMDAGDALEQPSTHCMTRLKSLQQCASAITELVHEKTEAGRHLEAFSIQLVIL
AIWKQALHICHTQAASAMDGSPSPETTRLRRISGNKHGTPDTEECSDFNAQRPEELASQI
EREFLREVEYAEELAKVIEPGSTEMPDAMETIFQAALALGRHGGVDELMGNMGSAASLYS
KAVRLLVFLLLEAPSLILNPPFSLTNSDRYRLRTYIDILNNRQGHSRSQRMALLKCQDQA
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>LITCHI018331.m2
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FNHPFLSQRQSDNMFRSRRHSAPTDGFPMFESNSGRDTEESSQDDCLPFFLDDDSSGPEG
SPSFSKRRSSIKSTYGFSIDAKVDGREPTSNALNSMDLTSRHGNTTRRKSESTSFRHDSH
KLSDENLNEPPKLMDQRLATTRSRVGDSLDLIDQDYVLISVPPMDMSSSSASISKPNPIP
NKSESPLRTSVADNTTSSAPMPIIGASKSNFCCIGSLDSQNSAPGTSLGSMDAGDALEQP
STHCMTRLKSLQQCASAITELVHEKTEAGRHLEAFSIQLVILAIWKQALHICHTQAASAM
DGSPSPETTRLRRISGNKHGTPDTEECSDFNAQRPEELASQIEREFLREVEYAEELAKVI
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NPPFSLTNSDRYRLRTYIDILNNRQGHSRSQRMALLKCQDQA.
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MDLTSRHGNTTRRKSESTSFRHDSHKLSDENLNEPPKLMDQRLATTRSRVGDSLDLIDQD
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EELASQIEREFLREVEYAEELAKVIEPGSTEMPDAMETIFQAALALGRHGGVDELMGNMG
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LKCQDQA.
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>LITCHI018331.m1
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GAAATTCGAGTACATGAAGACATGTTTAAAATGTGAGCTGATAAAATTGTTGTCAATGTA
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ATTGTATTGGAGTATTGTAGAGGAGGTGATCTTTCAATGTATATACAACGCCACGGATGT
GTCCAAGAAGAAACCGCTAAGCATTTCTTGCAGCAGCTGGGTATGTAGTGGGATTGTTTT
AGTTGTTTGTTTGGTTTTTTTATGTTGTTGTATTTTTTGGTGACTTAGTCATGTAGTGAT
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TAGATTTGTATGCATGATTGTGGTATTGTTGAGTAGAGTATTATTGTTTGACATGATTGT
AGAAAGCTAAGAAATTGCTGAGTAAGTAGGTAGTTTGGACTTTGGAGATGACATAGGATA
ATGTGTGATGTAAATTGATATTGTCTGTGTTGAGATTCCTTTTTTACATGAAACATTTAC
TTATAATGTGGTTCTTTTTATTGCAGAATCTTCTTCTTTCCACTGATGATAACAATGCTG
TTTTGAAGATTGCAGATTTTGGATTTGCGAGATCTCTGCAACCTAGAGGCCTTGCAGAAA
CCTTGTGTGGTTCACCTCTTTACATGGCTCCCGAGATAATGCAACTTCAGAAATATGATG
CAAAGGCAGATCTCTGGAGTGTTGGTGCAATTTTATTTCAGCTTGTGACTGGGAGAACCC
CGTTTACTGGAAACAATCAAATACAGTTGCTCCAGAACATTATGAAATCAACTGAATTGC
GTTTCCCTTTGGGTGCGAAAGTTTTAAGTGCTGACTGCAAAGACTTATGCCAGAAATTGT
TGCGACGTAATCCAGTGGAACGATTAACATTTGAAGAGTTCTTTAACCATCCATTCCTTT
CTCAGAGGCAATCAGATAACATGTTCAGGAGTAGGAGGCATTCAGCACCAACTGATGGTT
TTCCTATGTTTGAAAGTAACTCTGGGAGGGACACAGAGGAAAGTTCTCAGGACGATTGTC
TACCTTTCTTTCTGGATGATGATTCTAGTGGTCCTGAGGGGAGCCCTTCCTTTTCGAAAA
GGAGATCCTCAATAAAGTCTACTTATGGATTCTCTATTGATGCAAAAGTTGATGGAAGGG
AACCAACATCAAATGCTTTAAACAGCATGGATCTTACTTCAAGACATGGTAATACTACCA
GACGCAAATCAGAAAGTACTAGTTTTAGGCATGACAGCCACAAATTATCAGATGAAAATC
TAAATGAACCTCCGAAATTGATGGACCAAAGATTGGCAACCACCAGGTCAAGAGTTGGGG
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CGTCTTCTTCGGCAAGTATTTCCAAGCCAAATCCTATCCCAAACAAATCAGAAAGTCCAC
TGCGAACATCTGTTGCTGACAATACCACATCAAGTGCCCCCATGCCAATCATCGGTGCCT
CAAAAAGTAATTTCTGTTGCATTGGAAGCTTAGACAGTCAGAACTCTGCACCTGGTACTT
CTCTAGGATCAATGGATGCGGGAGATGCTTTGGAACAGCCTTCAACTCACTGCATGACAA
GGTTAAAGTCATTGCAGCAGTGTGCATCTGCCATCACAGAGTTAGTACACGAAAAGACTG
AGGCTGGTAGGCATCTAGAAGCATTCTCGATTCAGCTTGTGATTCTTGCAATCTGGAAGC
AAGCGTTGCATATTTGCCATACACAGGCTGCCTCAGCTATGGATGGAAGTCCAAGCCCAG
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GTTCTGATTTTAATGCTCAGAGGCCAGAGGAATTGGCCTCTCAAATTGAGAGGGAATTTC
TCCGGGAAGTTGAGTATGCTGAAGAACTTGCAAAGGTTATTGAGCCTGGAAGTACAGAGA
TGCCTGATGCGATGGAGACGATATTTCAAGCTGCTCTTGCTCTTGGCAGACATGGGGGAG
TTGATGAGCTTATGGGCAATATGGGGAGTGCAGCTTCCCTGTATTCAAAAGCAGTGCGAT
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ATTCGAGGTCTCAGAGGATGGCTCTTCTCAAGTGTCAAGATCAAGCATGACTTTTGAGAG
TTTTATGCCTTCTAATGATGAGTTACCTATTTTACAATGTAAAAATATTTCTTTGTACAG
CTCTATTCTTTTCAGTGGGGATTGGGATGTTATTGGTTTCAACCTGTATTAAACGTTGAT
AATGTAATATTCTTATTTCTGTGATTTCAGGAATTGATTATTTATAAATATTTGTTCTCC
CA
>LITCHI018331.m2
ATAAGTTTCGATTTTTATTTTTATTTTTCGGTCAAAAATTTTGATTTTTATTTATTTATT
TTTAAAAATGTTTGTGGTCTATGTGGATTTGTATTGACATCAATACACTTGTTCTGATTT
GAAATTCGAGTACATGAAGACATGTTTAAAATGTGAGCTGATAAAATTGTTGTCAATGTA
TATTTAGTTTGTTAAAAGGAGGTTTTGTTTGTTGTGTTTTAGGTACCTGGGAAGTTACAT
ATTGTATTGGAGTATTGTAGAGGAGGTGATCTTTCAATGTATATACAACGCCACGGATGT
GTCCAAGAAGAAACCGCTAAGCATTTCTTGCAGCAGCTGGGTATGTAGTGGGATTGTTTT
AGTTGTTTGTTTGGTTTTTTTATGTTGTTGTATTTTTTGGTGACTTAGTCATGTAGTGAT
GTTTGAGAAATGGTGTGTTTTCACAGCGGCTGGCTTGCAAGTTCTTCGTGATAATAATCT
TATACATCGAGACTTGAAACCTCAGGTTTGGTTGAAATTGTAATCTGTTCAATTCAGAAG
TAGATTTGTATGCATGATTGTGGTATTGTTGAGTAGAGTATTATTGTTTGACATGATTGT
AGAAAGCTAAGAAATTGCTGAGTAAGTAGGTAGTTTGGACTTTGGAGATGACATAGGATA
ATGTGTGATGTAAATTGATATTGTCTGTGTTGAGATTCCTTTTTTACATGAAACATTTAC
TTATAATGTGGTTCTTTTTATTGCAGAATCTTCTTCTTTCCACTGATGATAACAATGCTG
TTTTGAAGATTGCAGATTTTGGATTTGCGAGGTATATTATTAACTTCATCATTATTACGT
GTTCTCTGTGTCTCTCTCATGTCCAGACCCATATGACCAAGACATATTTGGAGCTACATT
TGTTTCTTTCTGAACATTAGTATAAATTAATCTTCAAATGTGTGGTAATATTATGCGGTG
ACAGGCAAGTAAGAAGTAACATTGGTGGTGCAGAAAGGCTTCTTGGCTTTAATTGCCTCT
CTAATTGCTTTTATTAATTTATTAGTGTGTACTTACTAGTTTTATGGGGCAAGAGAATAA
CTTTTATAGGTTTTGTAGAACACATACCAGTTCTAATGGTATGCGTTGTGGCCAGAAAGC
TTTGAAAGTCCAATATAACATTTGTATTTTTGATCTGTCAGATCTCTGCAACCTAGAGGC
CTTGCAGAAACCTTGTGTGGTTCACCTCTTTACATGGCTCCCGAGATAATGCAACTTCAG
AAATATGATGCAAAGGCAGATCTCTGGAGTGTTGGTGCAATTTTATTTCAGCTTGTGACT
GGGAGAACCCCGTTTACTGGAAACAATCAAATACAGGTTTGAATGACTTATCCCTCTTCT
ACACACACCTGAAGTTATCCCGTAGAGTTCTTTGGATTTGGTACTTTAAATTATGTGCTT
GTAGGATTACTAGTACTCCAGCCAAACAGGTGATGATTTCCATTCCCTTCTTTGTTCTTT
GTGATGCTGATGCACAGTTGCTCCAGAACATTATGAAATCAACTGAATTGCGTTTCCCTT
TGGGTGCGAAAGTTTTAAGTGCTGACTGCAAAGACTTATGCCAGAAATTGTTGCGACGTA
ATCCAGTGGAACGATTAACATTTGAAGAGTTCTTTAACCATCCATTCCTTTCTCAGAGGC
AATCAGATAACATGTTCAGGAGTAGGAGGCATTCAGCACCAACTGATGGTTTTCCTATGT
TTGAAAGTAACTCTGGGAGGGACACAGAGGAAAGTTCTCAGGACGATTGTCTACCTTTCT
TTCTGGATGATGATTCTAGTGGTCCTGAGGGGAGCCCTTCCTTTTCGAAAAGGAGATCCT
CAATAAAGTCTACTTATGGATTCTCTATTGATGCAAAAGTTGATGGAAGGGAACCAACAT
CAAATGCTTTAAACAGCATGGATCTTACTTCAAGACATGGTAATACTACCAGACGCAAAT
CAGAAAGTACTAGTTTTAGGCATGACAGCCACAAATTATCAGATGAAAATCTAAATGAAC
CTCCGAAATTGATGGACCAAAGATTGGCAACCACCAGGTCAAGAGTTGGGGATTCACTGG
ACTTAATTGATCAAGATTATGTTCTTATCTCTGTGCCACCTATGGATATGTCGTCTTCTT
CGGCAAGTATTTCCAAGCCAAATCCTATCCCAAACAAATCAGAAAGTCCACTGCGAACAT
CTGTTGCTGACAATACCACATCAAGTGCCCCCATGCCAATCATCGGTGCCTCAAAAAGTA
ATTTCTGTTGCATTGGAAGCTTAGACAGTCAGAACTCTGCACCTGGTACTTCTCTAGGAT
CAATGGATGCGGGAGATGCTTTGGAACAGCCTTCAACTCACTGCATGACAAGGTTAAAGT
CATTGCAGCAGTGTGCATCTGCCATCACAGAGTTAGTACACGAAAAGACTGAGGCTGGTA
GGCATCTAGAAGCATTCTCGATTCAGCTTGTGATTCTTGCAATCTGGAAGCAAGCGTTGC
ATATTTGCCATACACAGGCTGCCTCAGCTATGGATGGAAGTCCAAGCCCAGAGACTACCA
GATTGAGGAGAATCTCTGGCAATAAGCATGGTACTCCTGATACAGAAGAGTGTTCTGATT
TTAATGCTCAGAGGCCAGAGGAATTGGCCTCTCAAATTGAGAGGGAATTTCTCCGGGAAG
TTGAGTATGCTGAAGAACTTGCAAAGGTTATTGAGCCTGGAAGTACAGAGATGCCTGATG
CGATGGAGACGATATTTCAAGCTGCTCTTGCTCTTGGCAGACATGGGGGAGTTGATGAGC
TTATGGGCAATATGGGGAGTGCAGCTTCCCTGTATTCAAAAGCAGTGCGATTACTAGTCT
TCCTTCTATTGGAAGCACCATCTCTCATTCTGAACCCACCATTTTCGCTCACAAACTCAG
ACCGATATAGGCTCCGAACTTACATTGATATCCTTAATAACCGGCAAGGTCATTCGAGGT
CTCAGAGGATGGCTCTTCTCAAGTGTCAAGATCAAGCATGACTTTTGAGAGTTTTATGCC
TTCTAATGATGAGTTACCTATTTTACAATGTAAAAATATTTCTTTGTACAGCTCTATTCT
TTTCAGTGGGGATTGGGATGTTATTGGTTTCAACCTGTATTAAACGTTGATAATGTAATA
TTCTTATTTCTGTGATTTCAGGAATTGATTATTTATAAATATTTGTTCTCCCA
>LITCHI018331.m3
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AGATACGGCTACCAAAGACCAACAACAACGGGACAAAAGCTGCTCATCCGCGCCCCGTAC
ACCCCGTTGCAGGCTAACATTTCCTTACCTCCCACTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCGTTGG
TTCCTTCTTTAACTTGTAGCTCCAGCCTCCCCTCTACGACTAACTACTACGTAACAGCAA
TCAAATCAAAAAGGGAAATAATACTCACCAATTATGCTCAACATTTAATAACTCAATTAA
TCAAAATCTGATTCAATAATAAAACAAAAATAAAAATAATTAAAATCATTAACACTTTAT
ACTAAACAAATCTCCATTAATCTCCCCTTTGTATTTCTCTCTCATCATTTATCCAAATAC
CACCAAAATCGATCCTTTCGAACTTCGGGTGGGTCGAATCGAATCCAGTCGAATCTCCAA
CCAGATTAGATAACCTCGTCTTCCAGGTCTTGAATCTCGTTATCCGGAGCAAGATTCCGG
GTTCGGATCTTTCTAATTAGGGTCTAGTTGCTGCTTTCAATGGCTCAACCGACGGGAAGA
GGCAGGGTCGTCGGAGACTACTTGGTGGGTCGGCAAATCGGGTCGGGTTCGTTCTCGGTG
GTGTGGCACGCTTGGCACCGCGTCCATGGAACCGAAGTGGCGATAAAGGAGATCGTCACG
GGTCGACTCAACAAGAAGTTGCAGGAGAGTCTCATGTCGGAGATTTTTATCTTGAAGAGA
ATCAACCATCCTAATATTATTCGATTACACGATATTATTGAGGTACCTGGGAAGTTACAT
ATTGTATTGGAGTATTGTAGAGGAGGTGATCTTTCAATGTATATACAACGCCACGGATGT
GTCCAAGAAGAAACCGCTAAGCATTTCTTGCAGCAGCTGGCGGCTGGCTTGCAAGTTCTT
CGTGATAATAATCTTATACATCGAGACTTGAAACCTCAGAATCTTCTTCTTTCCACTGAT
GATAACAATGCTGTTTTGAAGATTGCAGATTTTGGATTTGCGAGATCTCTGCAACCTAGA
GGCCTTGCAGAAACCTTGTGTGGTTCACCTCTTTACATGGCTCCCGAGATAATGCAACTT
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ACTGGGAGAACCCCGTTTACTGGAAACAATCAAATACAGTTGCTCCAGAACATTATGAAA
TCAACTGAATTGCGTTTCCCTTTGGGTGCGAAAGTTTTAAGTGCTGACTGCAAAGACTTA
TGCCAGAAATTGTTGCGACGTAATCCAGTGGAACGATTAACATTTGAAGAGTTCTTTAAC
CATCCATTCCTTTCTCAGAGGCAATCAGATAACATGTTCAGGAGTAGGAGGCATTCAGCA
CCAACTGATGGTTTTCCTATGTTTGAAAGTAACTCTGGGAGGGACACAGAGGAAAGTTCT
CAGGACGATTGTCTACCTTTCTTTCTGGATGATGATTCTAGTGGTCCTGAGGGGAGCCCT
TCCTTTTCGAAAAGGAGATCCTCAATAAAGTCTACTTATGGATTCTCTATTGATGCAAAA
GTTGATGGAAGGGAACCAACATCAAATGCTTTAAACAGCATGGATCTTACTTCAAGACAT
GGTAATACTACCAGACGCAAATCAGAAAGTACTAGTTTTAGGCATGACAGCCACAAATTA
TCAGATGAAAATCTAAATGAACCTCCGAAATTGATGGACCAAAGATTGGCAACCACCAGG
TCAAGAGTTGGGGATTCACTGGACTTAATTGATCAAGATTATGTTCTTATCTCTGTGCCA
CCTATGGATATGTCGTCTTCTTCGGCAAGTATTTCCAAGCCAAATCCTATCCCAAACAAA
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ATCATCGGTGCCTCAAAAAGTAATTTCTGTTGCATTGGAAGCTTAGACAGTCAGAACTCT
GCACCTGGTACTTCTCTAGGATCAATGGATGCGGGAGATGCTTTGGAACAGCCTTCAACT
CACTGCATGACAAGGTTAAAGTCATTGCAGCAGTGTGCATCTGCCATCACAGAGTTAGTA
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