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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004396 | Chr14 | 918719 | 922745 | + | Nuclear transcription factor Y subunit A-1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004396.m1 | 147 | 202 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.4 | 2.10E-26 |
LITCHI004396.m2 | 162 | 217 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.3 | 2.30E-26 |
LITCHI004396.m3 | 147 | 202 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.4 | 2.10E-26 |
LITCHI004396.m4 | 147 | 202 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.3 | 2.30E-26 |
LITCHI004396.m5 | 147 | 202 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.4 | 2.10E-26 |
LITCHI004396.m6 | 109 | 164 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.7 | 1.70E-26 |
LITCHI004396.m7 | 15 | 70 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 93.5 | 9.60E-27 |
LITCHI004396.m8 | 147 | 202 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 92.4 | 2.10E-26 |
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>LITCHI004396.m1 ATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAG TCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAA ACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCAT TCACAAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACT CCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCG ATTGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGGTATATTGACTCCATAT GGGCCACAAGCTATGATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATCATGCTAGGATGCCTCTG CCCCTTGAAATGGAAGAGGAGCCTGTTTATGTAAATGCAAAGCAGTATCATGGTATTCTG AGACGCAGGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAG CCTTATCTTCATGAGTCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGC CGCTTTCTTAATACAAAGAAGCCGGACAACAATGGTGCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGC GCAAATGCCGGTTCAAACCTTTCAGCGGAGTCTGCCAGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTG CCCAACAATTGTAGTGGAAATACGGCATCCTCCATTGATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTT GGACACATGCAGAGAGTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTA TCAATGTATAATTCATCATCCACTGATGGCATCAAAGGTGACTTGTTGGGTCAGCAGAGG GAAAGCATGCAGGGGAATGGGGCACCGCGAGGGGCCCTTCCCGTTAAGTGA >LITCHI004396.m2 ATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAG TCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAA ACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCAT TCACAAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACT CCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCG ATTGTGAGACATCTCTCTCTTTACACACTCACACACAAGCACACAGTTGTTTTGACATCA TATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGGTATATTGACTCCATATGGGCCACAAGCTATG ATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATCATGCTAGGATGCCTCTGCCCCTTGAAATGGAA GAGGAGCCTGTTTATGTAAATGCAAAGCAGTATCATGGTATTCTGAGACGCAGGCAGTCA CGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAGCCTTATCTTCATGAG TCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGCCGCTTTCTTAATACA AAGAAGCCGGACAACAATGGTGCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGCGCAAATGCCGGTTCA AACCTTTCAGCGGAGTCTGCCAGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTGCCCAACAATTGTAGT GGAAATACGGCATCCTCCATTGATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTTGGACACATGCAGAGA GTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTATCAATGTATAATTCA TCATCCACTGATGGCATCAAAGGTGACTTGTTGGGTCAGCAGAGGGAAAGCATGCAGGGG AATGGGGCACCGCGAGGGGCCCTTCCCGTTAAGTGA >LITCHI004396.m3 ATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAG TCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAA ACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCAT TCACAAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACT CCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCG ATTGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGGTATATTGACTCCATAT GGGCCACAAGCTATGATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATCATGCTAGGATGCCTCTG CCCCTTGAAATGGAAGAGGAGCCTGTTTATGTAAATGCAAAGCAGTATCATGGTATTCTG AGACGCAGGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAG CCTTATCTTCATGAGTCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGC CGCTTTCTTAATACAAAGAAGCCGGACAACAATGGTGCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGC GCAAATGCCGGTTCAAACCTTTCAGCGGAGTCTGCCAGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTG CCCAACAATTGTAGTGGAAATACGGCATCCTCCATTGATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTT GGACACATGCAGAGAGTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTA TCAATGTATAATTCATCATCCACTGATGGCATCAAAGGTGACTTGTTGGGTCAGCAGAGG 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TCCGAACTTGGAGGTCGGGGATATGCTCACAAGTGTGGGGCAGTCCTCAGGCAAATCATT CTTGGCTTAACAAACCTATCTTTGCTGGGGTTTAGATGA >LITCHI004396.m5 ATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAG TCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAA ACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCAT TCACAAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACT CCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCG ATTGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGGTATATTGACTCCATAT GGGCCACAAGCTATGATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATCATGCTAGGATGCCTCTG CCCCTTGAAATGGAAGAGGAGCCTGTTTATGTAAATGCAAAGCAGTATCATGGTATTCTG AGACGCAGGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAG CCTTATCTTCATGAGTCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGC CGCTTTCTTAATACAAAGAAGCCGGACAACAATGGTGCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGC GCAAATGCCGGTTCAAACCTTTCAGCGGAGTCTGCCAGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTG CCCAACAATTGTAGTGGAAATACGGCATCCTCCATTGATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTT GGACACATGCAGAGAGTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTA 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ATGCATCATGCTAGGATGCCTCTGCCCCTTGAAATGGAAGAGGAGCCTGTTTATGTAAAT GCAAAGCAGTATCATGGTATTCTGAGACGCAGGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAA AAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAGCCTTATCTTCATGAGTCGAGGCACCAACATGCCATG AGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGCCGCTTTCTTAATACAAAGAAGCCGGACAACAATGGT GCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGCGCAAATGCCGGTTCAAACCTTTCAGCGGAGTCTGCC AGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTGCCCAACAATTGTAGTGGAAATACGGCATCCTCCATT GATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTTGGACACATGCAGAGAGTGCAGTCTTCCTCCAGTGGC AACAGCAACGGACATGGTCTGTTATCAATGTATAATTCATCATCCACTGATGGCATCAAA GGCAAAGTAGGAGGTGGTTGCCCCTCCGAACTTGGAGGTCGGGGATATGCTCACAAGTGT GGGGCAGTCCTCAGGCAAATCATTCTTGGCTTAACAAACCTATCTTTGCTGGGGTTTAGA TGA >LITCHI004396.m8 ATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAG TCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAA ACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCAT TCACAAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACT CCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCG ATTGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGGTATATTGACTCCATAT 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>LITCHI004396.m8 TTTATATTTATTTTCTCTTCTCAAACATAAATAAATAAGTCTCCAATATAAAATCTGTCT TTCTCCATCACAAAATGTCACTGTGTCTGTGTCTCTCCTTAAGGTTGCAGAGAGAAACGG AAAATGAACCCAACTCCATGACTTCCGTCTAGCGTTTGACGTTCTTTTCTTTGCTTCGCA TCCAATTGTAAGCCCCTCTCTCTCTCTCTTGCTGTTTGCTCTGTGAAATTTTGATTGGAC ATCAAATTCAGGTTCTTTGATGGACGTCCGATTTTTTTTTTTGTTTGTGGTTTCTGGGTT GTTGAAAGTTGGTTTTTTCGAATTCTATGACAAGGGTTTTGTGTTTGGTTGATGAGAAAG CTGTTAGAGAAGAAAAAGTTTGAAGCTTTGGACTTTTTTGTTGGGGAGTTTTGGAGTGAG AAGGGTGGATGTAGTAGAATTTGGAGTGGAATTAGCAATAACCAGATGATGATATTTGTT TAATTGTGACTTAGTAGCTTGTTTTAGGTTCAGTTGAGGTTGGGGGTTCTGTGTTTTTTA GTTCTCGAATCATGTAAAGTTTTGATTTTTATGTTTTTTGGTTGTTCCTTGTTTGCATTT TGTTAGCTAATTCAATGGATTTTTTTGGTTTGGATTTTTTCTTTTTGAAGCTGAATTTCG CGCAGGAGGTTTTTATGTCAGTGGAGATTGAATTTGTTCTATTGGGTATTGAAGTTGACA GTAGGAAGATGGACATTTTTGTAACTATGCATGGCATTTGATATTCTATTTTTTCAACTG TTTGTATGCTCTTTTTTTGAAATTTGATTCTTCCTGTCTAAATTGTGGAGCCTGGATACT GAATCGAACAATTTTGTACTTCGTTGCTCTTGCTCTTTAGAATATTTAATCTTGTTTGTG TAAAAGTTAATTGTTTCTTAAGCTTTGTTTCATAGTCATATGCACTTAAATTATTGTTTT 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>LITCHI004396.m6 TTTATATTTATTTTCTCTTCTCAAACATAAATAAATAAGTCTCCAATATAAAATCTGTCT TTCTCCATCACAAAATGTCACTGTGTCTGTGTCTCTCCTTAAGGTTGCAGAGAGAAACGG AAAATGAACCCAACTCCATGACTTCCGTCTAGCGTTTGACGTTCTTTTCTTTGCTTCGCA TCCAATTGTTGTGAATAATGCCGGCAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTG CTCATAATGTGTTGCAGTCAACCATCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTG GTGGCTCCTTGAGTGAAACTGCTTCCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCT CTAATGAAGCTACCCATTCACAAGGTAATAGTCACTTTGGAGATGATTCTGGATTTCTTG GGGCTTGATCAGGTTGTAAGTTTTAATTTAACAGGTCTATATATGTATGTTAATGTGGTA TTCTACCAAATATGTATGAGCAACTTGTTCTTGTCAGCTTTACTTGGAGTGTGATAGTGA TAGAATTCTTTTTCGTTAAAGCAGATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGC ATATTCCATCCTCAACTCCCCATGCTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGG AGCTAGTTGGTCACTCGATTGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTG GTATATTGACTCCATATGGGCCACAAGCTATGATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATC ATGCTAGGATGCCTCTGCCCCTTGAAATGGAAGAGGAGCCTGTTTATGTAAATGCAAAGC AGTATCATGGTATTCTGAGACGCAGGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAG CGATAAAAGTTAGAAAGCCTTATCTTCATGAGTCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAG 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