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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004385 | Chr14 | 838853 | 842274 | + | Transcription factor MYB83 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004385.m1 | 32 | 79 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.4 | 2.10E-13 |
LITCHI004385.m1 | 35 | 94 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 51.1 | 1.30E-13 |
LITCHI004385.m1 | 85 | 129 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.1 | 2.50E-13 |
LITCHI004385.m1 | 89 | 141 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 24.4 | 2.80E-05 |
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>LITCHI004385.m1 ATGAGGAAGCCGGATCTAATGGGCAAAGATAGAGTACTAGTCAACAATAACAACAACAAC AGCAATAACACCAAGATTATCAATAAGCTTAGAAAGGGCTTGTGGTCTCCAGAAGAAGAT GAGAAGCTCATCAAATACATGCTCACCAATGGACAGGGCTGTTGGAGTGACATTGCCAGA AATGCTGGCCTTCAGAGATGTGGCAAGAGTTGTCGTCTTCGTTGGATCAATTACTTGAGA CCTGACCTCAAACGTGGTGCATTCTCGCTTCAAGAGGAGGAGCTCATCATCCATTTGCAT TCCATCCTTGGTAACAGGTGGTCTCAAATTGCGGCTCGTCTTCCTGGAAGAACAGACAAT GAAATAAAAAACTTCTGGAACTCTACATTGAAGAAAAGGTTGAAAAACAACACAGCAAAT CCCACATCTTCACCAAATGATAGTGATTCATCGGAGCACATCATCAATAGAGGTCATCAT GTAAGTAACATTGGAGGGATTATGCCCATGCATGATCATGATCATCATCACATCATGACA ATGTGCAATGTGGACTCATCATCATCGTCATCAGTGTCAGCATCCATGCAAACCATGGTC ACTACTGCAGGCAACAGTAGTAGTGCAAGTGGCCAGATAGTACCTGCCCACCACCACCCT TTCTCAGTGCTCGAAAACCGCTTCGACATGACAGGTGTCCCTTGTATGTTCAACAATAAT GTGCATGCATGTTTGTCTCATCATCAAGTTGATGTGGGAGATGGGTTGTTTTATGGGGAT TACGGGGTTTTGGAGCCAAGTAAAATGGGGTTAGAAGGAGATTTTTCTCTGCCTCCATTG GAGAGTAGTAGAAGTACTGTTGAAGAGAACATTAATGGTTCCAACATTAACAACAACAAC AAAGGTATTGATCAAATGAAAAGCAATAACAACCACTACAATAATAATTCTTGCTTTAAT AATACAGCTGAGGATCTTCCGGGATTTAAAGTAGGGGACATGTTTGGGATAGAAAATAAT CATTGGCATGGAGAAAACTTAAGAGTTGGAGAATGGGATTTTGAGGGTTTCATGGACAAT ATTTCCTCCTTTCCTTTTCTTGATTTTCAAGTTGAATAA
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>LITCHI016164.m2 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTTTTAAAATTATAAATGTAAAATTTTTTCAAATATTATTCTGTAATACTTTACTTT CTTTTAAATGTCTTTTATGGTAAATTTATAATTTAAAGGAGTTTTTAAAAGTAATATAAC TAAATAATTTATAATTTAAAAGATTTTTTTTAACAATTTACCAAATGACCAACAATTTCT TTTTAATAGTTTTACAAGATCTATTTATAAAAAATTTACTTAGAGAAGCTACACTAGGTA ATAAACTTATGCATCATATGCATGCACTTGAAGACATAGACCTTGACAAGTAAAAAAAAA AAAAAGATCTTGACCAACTGCGTTATAAATGTCATTTCATGGGGCCATATTGTTACCTAC GCGCAAGGGCAGAATGAAAAGATTAAAATTGGAGGGGACGGGCCCGACGTACACGTTTGG TATATGGAATTAAGATTAAAATTGAACTATTTTACATAATTTAATTCATACAATGCGATG GGACTGTTTAGTCCTACACTTCATCATGAAATTAGTCAGTTCCATGTTTTTGGGACTAAA TTATATAAATTAATACTTTATTTTATTTAAAATTAATTTAAAATAAAATGACAAAAACAA AAAAATATTTAATTACTGAAATATTATTAATTATATAATTAATAATATGATAATAATAAA TTATGAAATTATGTAGTTATTAATGTTCTTTAAATTAGTTTATTTAATATAATTATAACT AATTCAAGTAAACATACATATTCAGATTTAGTCTGATCTTACACTACCAAAGAGAAAACA ATATTGAACTTAATTTTATCCAATCTAATCCCACAAAATAACTCAATCTAATCTCGTACA TTAAACGGAACCTTAATAGGTTATTTACAATATATAAAACATATAAAATAATAAACGATG 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>LITCHI016164.m2 GenomeSequence + GCAAAGGTTATAAAAATCCAAATTAGTGAGAACTAATTGAAAAATAAAAAGTTGAAGTTG AAAAATTACAGTTTTTGAATCTATATATCGCAGAATTATTCCTCAAATATAAGAAGAAAG AGTTGTCATCTCTAAGTTCACCGAAATAGGATTCAAGCAGCAATTTTTTTTTTCCAATGG TATCCAAGATAATCATTTTCGTTTTCATTTTCCATATTTGCCTCACCTTGGTAACCCGCC CTTCAAAAGCACAAACATGGATCAGAGCCGGTTACTACTCGCCTGCAGGAAAAGAGTTCC CAAGTTCAGACATTAATTCTGCTCTCTTTACTCACCTTCTTTGCGGGTATGGTTCTTTGA ACTCCTCTTCCTATGAGGTCTTTATAGAACCTTCTGATGAAAACTATTTCTCCAGTTTCA CAGCAACTGTGAAACAGAAAAACCCATCGGTCACCACTCTTGCATCCATTGGAGGAGGAA ATATAAACTCTTCCACCTTTTATTCAATGTTGGGTAATCCTTCTTATAGAAGAATTTTCA TCGATACCTCAATAAAAATTGCTAGGCATTATGGTTTTCAAGGCCTAGACCTTGATTTGA TTAAATATACGTATGATTTGGGTGTTCTCTTCAAGGAGTGGCGAGCAGCTATCAACTTAG AGGCCAGAAGCTCCAACCAGTCAAAACTGATCTTAACTGCAGCAGTTTGGTATTCACCAA ATTGGTATGCAGAAGCCTATCCCATAGACTCGATACAGTACTTAAATTGGATTCATATAA ACTTTTATCTCCCTCAGTCGAACACAAGCACGTCCGCCCCATATGCTCTCTATAACCCAA CTAATGTTTTGAATGTCAATAGTGCTATAAAGGCATGGATCGATGCTGGAATAGCAGCAA 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