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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004375Chr14770831776836-Putative RING-type E3 ubiquitin transferase C3H69

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004375.m1626PF18044.4zf-CCCH_4Domain25.68.40E-06
LITCHI004375.m1625PF14608.9zf-CCCH_2Domain14.60.041
LITCHI004375.m13453PF18044.4zf-CCCH_4Domain327.80E-08
LITCHI004375.m13454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.30E-05
LITCHI004375.m13453PF14608.9zf-CCCH_2Domain130.13
LITCHI004375.m1134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.91.3
LITCHI004375.m1197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.76.90E-07
LITCHI004375.m1198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.94.00E-07
LITCHI004375.m1290312PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.10.0015
LITCHI004375.m10626PF18044.4zf-CCCH_4Domain25.96.60E-06
LITCHI004375.m103454PF00642.27zf-CCCHFamily24.71.80E-05
LITCHI004375.m103453PF18044.4zf-CCCH_4Domain32.46.10E-08
LITCHI004375.m10132155PF00642.27zf-CCCHFamily20.60.00033
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LITCHI004375.m10198255PF00097.28zf-C3HC4Domain30.33.00E-07
LITCHI004375.m11626PF18044.4zf-CCCH_4Domain25.68.40E-06
LITCHI004375.m11625PF14608.9zf-CCCH_2Domain14.60.041
LITCHI004375.m113453PF18044.4zf-CCCH_4Domain327.80E-08
LITCHI004375.m113454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.30E-05
LITCHI004375.m113453PF14608.9zf-CCCH_2Domain130.13
LITCHI004375.m11134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.91.3
LITCHI004375.m11197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.76.90E-07
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LITCHI004375.m11290312PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.10.0015
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LITCHI004375.m13625PF14608.9zf-CCCH_2Domain14.40.048
LITCHI004375.m133453PF18044.4zf-CCCH_4Domain31.89.10E-08
LITCHI004375.m133454PF00642.27zf-CCCHFamily24.12.70E-05
LITCHI004375.m133453PF14608.9zf-CCCH_2Domain12.80.15
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LITCHI004375.m13197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.48.30E-07
LITCHI004375.m13198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.84.40E-07
LITCHI004375.m13290311PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.70.018
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LITCHI004375.m14131188PF00097.28zf-C3HC4Domain303.70E-07
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LITCHI004375.m153454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.20E-05
LITCHI004375.m15197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.76.70E-07
LITCHI004375.m15198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.93.90E-07
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LITCHI004375.m163453PF18044.4zf-CCCH_4Domain327.80E-08
LITCHI004375.m163454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.30E-05
LITCHI004375.m163453PF14608.9zf-CCCH_2Domain130.13
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LITCHI004375.m16290312PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.10.0015
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LITCHI004375.m173453PF14608.9zf-CCCH_2Domain12.80.15
LITCHI004375.m17134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.71.5
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LITCHI004375.m17198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.84.40E-07
LITCHI004375.m17290311PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.70.018
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LITCHI004375.m183454PF00642.27zf-CCCHFamily24.12.70E-05
LITCHI004375.m183453PF14608.9zf-CCCH_2Domain12.80.15
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LITCHI004375.m23453PF18044.4zf-CCCH_4Domain327.80E-08
LITCHI004375.m23454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.30E-05
LITCHI004375.m23453PF14608.9zf-CCCH_2Domain130.13
LITCHI004375.m2134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.91.3
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LITCHI004375.m2290312PF14608.9zf-CCCH_2Domain19.10.0015
LITCHI004375.m20626PF18044.4zf-CCCH_4Domain25.68.30E-06
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LITCHI004375.m223453PF18044.4zf-CCCH_4Domain31.89.10E-08
LITCHI004375.m223454PF00642.27zf-CCCHFamily24.12.70E-05
LITCHI004375.m223453PF14608.9zf-CCCH_2Domain12.80.15
LITCHI004375.m22134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.71.5
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LITCHI004375.m22290311PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.70.018
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LITCHI004375.m233454PF00642.27zf-CCCHFamily24.12.70E-05
LITCHI004375.m233453PF14608.9zf-CCCH_2Domain12.80.15
LITCHI004375.m23134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.71.5
LITCHI004375.m23197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.48.30E-07
LITCHI004375.m23198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.84.40E-07
LITCHI004375.m23290311PF14608.9zf-CCCH_2Domain15.70.018
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LITCHI004375.m33454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.20E-05
LITCHI004375.m3197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.76.70E-07
LITCHI004375.m3198255PF00097.28zf-C3HC4Domain29.93.90E-07
LITCHI004375.m4626PF18044.4zf-CCCH_4Domain25.68.40E-06
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LITCHI004375.m43453PF18044.4zf-CCCH_4Domain327.80E-08
LITCHI004375.m43454PF00642.27zf-CCCHFamily24.32.30E-05
LITCHI004375.m43453PF14608.9zf-CCCH_2Domain130.13
LITCHI004375.m4134153PF14608.9zf-CCCH_2Domain9.91.3
LITCHI004375.m4197256PF13639.9zf-RING_2Domain29.76.90E-07
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LITCHI004375.m56588PF00642.27zf-CCCHFamily20.70.00032
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>LITCHI004375.m10
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>LITCHI004375.m11
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>LITCHI004375.m12
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>LITCHI004375.m13
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>LITCHI004375.m14
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>LITCHI004375.m15
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>LITCHI004375.m16
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>LITCHI004375.m17
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>LITCHI004375.m18
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>LITCHI004375.m19
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>LITCHI004375.m2
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>LITCHI004375.m20
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>LITCHI004375.m21
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>LITCHI004375.m22
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>LITCHI004375.m23
ATGTCTAAAAGGGTCCTTTGCAAGTTCTTTGCTCATGGAGCATGCCTAAAGGGCGAGCAT
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>LITCHI004375.m3
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TGTGAGTTTTCTCACGATTGGAAGGATCCATCGAATAATATATGCACTTACTATCAGAAA
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GTAACAACGGTTCCTGGTGCATTGCCGGAGCTTTCTTCATTGAGTAGACCTTTCCTGCCT
TCCAATAAACCAGCATGGAATTTGGAGTGTGGGCATAATGGTTCTTTAGAGGATGGTGAT
TTTGGGGAGCTTAGGGATCTTAAACCAGGTGACCGTCCTATATGTTCTTTTGCTGCTGCT
GGTAATTGTCCCCGTGGGGAAAAATGCCCTCACATACATGGAGAATTGTGTTCTACTTGT
GGGAAACATTGCTTGCATCCTTTCAGACCTGAAGAAAGAGAAGAGCACATTAAAACATGT
GAGAAAAAGCAAAAGCACCTCGAAGCTTTAAGACGCAGCCAAGAAATAGAATGTAGTGTG
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GAATGTGATCATCCATTCTGTATATCCTGTATCAGGAACTGGCGCAGCAGTTCTCCTACC
TCTGGAGTGGATGTCAATACTGCATTGAGGGCTTGTCCAATTTGCCGTAAGCTATCATAC
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TGCTTGATTATATATTTCTTGTTTTTTTTCCCAAGTTGTATGAAGCTGGTTATGTTGAGA
TCTTTTAGGGAATGTCTTTGA
>LITCHI004375.m4
ATGTCTAAAAGGGTCCTTTGCAAGTTCTTTGCTCATGGAGCATGCCTAAAGGGCGAGCAT
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GTAACAACGGTTCCTGGTGCATTGCCGGAGCTTTCTTCATTGAGTAGACCTTTCCTGCCT
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>LITCHI004375.m5
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>LITCHI004375.m6
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>LITCHI004375.m7
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>LITCHI004375.m8
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>LITCHI010840.m1
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>LITCHI010840.m1
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GAATAGCTAATAGCCCCAGAGATGCGCGAGACGCGTCGTGCACAGGGGACTAAGAATCTG
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TATTCCTGTGATGATCTGGCGCACTTTCAACGTGTCGACACGGCCAAGACAGCTACACAT
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GGTTGGCAAGTCGCGTCCTAATATTGAGCAAGACCCTGTTTTTTATTTTTTATTTACACT
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TTAGATCCATTGACCGACAAAGTTTTGACCAAATTTCTTTTTTTGACTTTATCTTATCAT
ACATGATGTTTTAATGAAACCAATTTATCATATTATATGGAGTAATGCTAGA
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>LITCHI010840.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GGCATACTCGTGCCACAGCTACGTGCTTGCTTACGCATGACCTAATTTAGAAAGCCGCCA
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>LITCHI020193.m1 GenomeSequence - 
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GTTTCTGTGTGGAAGATTCTTTCGGGAAAAAGAAAGGGTTTATTTGGGTGGTCACAGGAA
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TCCTAGCTTGCAGAAGGAGAACCTTTTCAAAACCAAAAAGCAAGCAAGAATATATTACAA
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TCTCTTTTTTCTGTTTTGATGGCAGAGAGCCACAAATGCATGAGTGTTGTGTTGTTGTAC
TTCTTCTCATGCTCATAGCCTCATACTTCTCTCGCTTTGTCTCGACTCTCGCTCACTTGG
GTCCTCCTTTAATCATTATCTCTTACTTTTCCTACATACTAAGGACTTCTATTATTGCTT
GTGTGCAGAGAATTCCGGGATGAGGCCTCCAACTTTGAACATTTTCCCTTCTCAGCCTAT
GCACGTAGAGCCATCATCGACAAACAAGGTACACTATTAAACCGTTAAATGACTTAATTA
ATTAACACACATGTTAGTTGGTGATGGTGGGTTTATCATTTTAATTTCATTAAATTAATG
GTCATGTTTCTAATGGGGTTTTGGTTGTCTGTATTTGGTATAGGCTGGTACAGCATTAGT
TTCTCCTGCAAGTAGTGGTTCAAAGAGACCATCTGAGCCGTCCATGGAGTTGCCCAACGC
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CATATAAAATAAAGAATTATTAAATATTGTATGTGGTTCAAGAATAATAGCTTCCTGTAA
GTGAGATTCTTAGTTTTATTTTCTTTTGCTTTTGTTATTTAATTAATTGCTATTGGCGCA
GCGTGAAGGAAACCGAAAAGGTCCAACATCAAGTTCTGAACAGGAAGGGCCCAAAACACC
AGATCCTAAGGTGGCTTCTTGGTTTTAACCACTTTATATTATTAGAAGAATTATCAACAT
TAATTTTGTTACATCACTATATATAATGACAAATTTTTTTCAATGTGCGATGTGATTATT
TCTAAGCAGACATTGAGAAGACTTGCTCAGAATAGAGAGGCAGCAAGGAAAAGCAGGTTG
AGAAAAAAGGTCAGTCTCCATCATTTAATTCAAGCTAGATTTTTCAAGTCATCGTTATTT
TCTTGTGGAGTTCATTATTTATTTATTTTCTTTTTTCTTCCCAGGCTTATGTCCAGCAGC
TAGAGTCAAGTAGGATCAAACTTACCCAACTGGAACAAGAGCTACAAAGAGCCAGATCTC
AAGTGAGCTTCGATTTCTTAGCAAATTTCCAGTGTCTCTTGAGACCAAAAACAACATTTA
TCACCAACTCTCTCTCATTGAATTGTAACCCTTCTTCAGTTCTACACTTTTGTCTCCTGT
CATGATGTATGCTTATTCAAGACCTGGGTTTCTTTAGGGCATATTTTTTGGTGGAGTCTT
AGGAGGAGACCAAGGCCTTCCTGGTGGTATCAACAGCATGAGCTCAGGTACTCAATTTCT
CCCACTACTATTTTTTATATAATAAACTCCTCTTTGTTTTCGTCACCTCAGACATGCATG
TATAGTTATCTTCATTTCTCTCTCTTTTTTCTTTTCACTAGATGCGGCTGTGTTTGATAT
GGAATATGCGCGATGGCTTGAGGTCCATCATCGTCTAATGTGTGAGCTTCGAGCCGCGGT
GCAAGAGCATTTGCCGGAGAACGAGCTGCGGCTCTTTGTTGACAACTGCTTGGCTCACTA
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TGGCACGTGGAAGACTCCAGCTGAGCGATGCTTCATGTGGATGGGTGGATTCCGGCCATC
TGAGCTCATCAAGGTTTGGTTCCAATCATGCACTTATTTGCATAGTATACATTTCTTTTA
ACCTCATGATCTCATTTCTGCTTTCAAGTAAGTATACATATACGAAGATAGAATCGCACG
CAACACAAAATGTGACAAGAAAATGACAAAAAACATGACCAGAAAACCACTAAGCTTGAA
TTAGGGTTAGTTAACTAATCCTGATTAGATTTTCCTAACATATATTTCCTCTTTTAATAT
TATATATATATATAAAAGAAAAATCTTTCTTTTTCATGGTTGAGAGGATATACTGTAGTA
ATCACGACGTAGAATCTGATGTGGGGATATTATGAGATGCTTAAAGGGGTATATACGACG
ATTTTATTGCATGGTTTGTAAGTTGTAGGTGGGGTGCAAAGAAGATCGCACTACAAATTA
AATATAAATGAGTGACGAAAGGTATCGTGAAAGGTCTCTACAATAGGGTTTGGTTAGGTG
TGATTCAAATAAAAGGCATGTTCTGTTACTACAAATTCTGGTTTGAAAGTGAAAGAGAGA
GGAGGAGAAGATTGCACGGTTCTGGCTGGCTATTCTCTTTCTGTGTCTTCTGACTACTTC
ATTGATATGCCAACTAAGTGTTTTGTTGTCACCTTCATCTTTTTCTTTGTTTTTTAGCAA
ATAACTGAACAAAAGCCTCTTGAAAATTACACTCTAATTCATAACCAGAAATTCGATTCT
ATATGATCTGATAATAATATCTACAGTCAGAATATATTCACCTTTGGAACATGTATTGTC
AGAAATAATTAATATCTAGGAATATATATGATATTATTTTCATTAGTTGTGAGTATCTAG
TTTTAATTGGTGACTTTTTTGCTTTTTATTTACATATAGTCTTAGAAATTGAGAGGTTTA
ATCTACATTTAATTATTATTTGTGAAAATTATAGTCTATCAAATTTTGAGCTGTATTCTG
TTTTTAACTTGTGCTTTTATAGTGTAGATTAAAGGACCCTATAGAAAATGATAATAGTCT
TAACAAGTAGGTTGTTTAATTTGAATGATTCAGGTTATACTGAACCAAATTGAGCCGTTA
ACGGAACAACAGATATTAGGCATATGTGGATTGCAACAATCTACACAGGAGACAGAAGAA
GCTCTCTCCCAAGGACTTGAAGCTCTAAACCAGTCAATCTCAGACACCATAGCTTCTGAT
TCACTCAGCTGCCCTCCTAACATGGCTAACTACATGGGTCAAATGGCTGTAGCCATGAAC
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AACAAATCACATCTATTCCATTGCTGTTTTGATTTGTCCGTGGACCACCATGCATGAATT
ATGATTTTTTATTTTTATATATTATTGATGTGGGCCATTTGGAACAAGATATCTGGTCCT
GCCTGGGTTTGGAAACCTACCCCAATTTATGAACTACTTCATGTTCCAAACACATGAGGT
GGCTGGCTGGTTGTTACATGGTATATATCTACCGATATATTTTGCCTCTAACGAGCCCCA
TTGGGCTATTAAGGTTTGATAGCGACTCCATATATAAAGCTAAGCTGTTCTTGTGGTTTT
TTAGGTTCCCAATAAGGTTAGGTCTTTCCCATCCATGTGTATGTCTGATTCAGTAGAACC
ATATATGATGTTCTCAAAATAGATCTTTAAATACAGGTTTTACAAACTAGATTAAATTAA
ATTGAACATCTCATTTTTGCGGAAGTTTAAATTACAGTATGCCTATCATGTACTCACGTG
TATTAGTAGAAGTCTTTGTAATGGCCCGCTAGATTGACCTGAGGGCACCTTGATGATGGT
CTACCATCAGACTAGCACCACGTAATACTCGTCCGTTCACATGGTCCTACAAACTATAGT
CGGGTCCCACATATGTCCAGTTCCAAGTGTCTCAAAGCCCCATATCCGCATGATGTCACG
GTCGTAACCGTTTGACTTAAAGACACCATGTAGACAGCCCCACCCCAACTTCCTTTTTGA
CTGTTCTTAGGATAAACACAGACATTAAGACACACAAACTCTTATCATGTGTACATTTCA
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GTCAAGAATTCATCAATCAAACCATAGGAAGTCATCATTAATCATTATTGTTATCAGCAT
ATATTCACCAAAGCTGTATGCTATGTTGACAAGCCTTTTTTTTTGTTATTAAATTGGCTG
ACTTTTGGTACTAAATTATTTTCTGTTTCAGTCCATCTACATTATTAGTTGTGTATAATA
TGCATATTCTTAAAAGGATTGGTTGAAAGCTAGGCAATAGAATTTTCTGGGTTAATTTTT
TAAACTTTGTGTCCTATGCAATTTTTCCTGTCAAACTTCTAGATAAATAGGAGTTCATTT
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A
>LITCHI020193.m2 GenomeSequence - 
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TGAGCTCATCAAGGTTTGGTTCCAATCATGCACTTATTTGCATAGTATACATTTCTTTTA
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TAAACTTTGTGTCCTATGCAATTTTTCCTGTCAAACTTCTAGATAAATAGGAGTTCATTT
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ACAACCCGTCAAGCCGCTAGGTGTTTGCTGGCGATAGCGGAGTACTTTCACCGTCTCCGA
GCTCTTAGCTCTCTCTGGTTGGCTCGCCCTCGACAGGAATGATCAAAACCCTTGTCCAGG
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ATTAACACACATGTTAGTTGGTGATGGTGGGTTTATCATTTTAATTTCATTAAATTAATG
GTCATGTTTCTAATGGGGTTTTGGTTGTCTGTATTTGGTATAGGCTGGTACAGCATTAGT
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GCAAGAGCATTTGCCGGAGAACGAGCTGCGGCTCTTTGTTGACAACTGCTTGGCTCACTA
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TAAACTTTGTGTCCTATGCAATTTTTCCTGTCAAACTTCTAGATAAATAGGAGTTCATTT
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CATTTGACAATCAAAGCCCTTGATGCCCCCAAAGTCATAAGTAAAATATATTATGGAAAC
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TAAAATGTTAACTAGAAGCACATGCATTCATAGTTTTTTTTTTTTGAATTTCATGCGCTC
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A