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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004363 | Chr14 | 684362 | 686724 | - | Transcription factor bHLH130 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004363.m1 | 382 | 427 | PF00010.29 | HLH | Domain | 35.4 | 8.20E-09 |
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>LITCHI004363.m1 ATGAGCCTTTTGTATTCTACTAGTTTCAGATATCCTGAGGGAGATCACTTGAGGAAGAAC CAGGAAATGTTCATGGATTCAAGTCCTCACTATAATCATCATCATCATCATCATTATCAT CAACAACAGCAACAACAAAACAATAACCACCAGCACCAGCAGAATAATTCTGGCCTAATG CGGTATAGTTCAGCTCCAAGCTCTTTCTTAGAGAGCCTTGTCAATGGTAGCAGCAGCGGT GGTGAGGACTATCGATATTTTCGATCCTCAAGTCCTGAAATCGACACCTTTCTTGAAAAA TATATGCTGCCAAGTAACAATTCTGGTGATTCGGGTTCTCATGATTTGCAACAATTTGGA GAGAAATCTATGAAGCAAGAAGAGGCAGAGACTACTACTACTACTGATATCCCTCCACAG AATGGATACTCTAACGGCTCATCCTCCCACATGATCTACCAGAGTCTACAAGTTCAGGGT CTGCAGAGAAATAATGATAACAATAACAACAACAAGACAATGGACACTTCATTTGGTGTT ACCAATTCTATGGTCTTGGAGTCAAAAATGGCTACCGGAAATGGCTCCAATCTTATCAGG CAAAGCAGCTCCCCAGCTGGACTTTTCTCCAACCTAGGCGTTGACAATGGATTTGCTGTG ATGCAAGATGTGGGATGTTTTAGAGGTGGGAATGGTAACAATGGAGAATCTGGTGCATCA ACTAGTAGGTTAAATAATCATATAAACTTTTCGACTGGACCTTCTTCAAGACTTAATATG CCTCAGATTGGTGAAATTGGGAACCAAAACATGGGGACTTGTAGCCCGGAAAAAGGATTG GGGAGCAATAATGGTAGCAATAATAGACAGTACATGTCCAATTTTGCTAGTGATTCTTGG GATGACACTTCATTCAATGGCCTGAAGAGAGCTAGAGGAAATGATGGCAACATGTATTTT GGTTTGAACACTTTGGAAACAACTCAGAATGGAAACGCTGGAAGCCGGTCTAATGCCCTG ACTCGCCATTTGAGCTTGCCTAACCCTCCTTCTGAGATACCTACTGCGGAGAAGTTTTTG CACTTTCAAGGCTACATTCCTTGCAAGATTCGTGCCAAAAGAGGTTTCGCTACTCATCCG CGTAGCATTGCTGAGAGGGTGAGAAGAACAAGGATCAGTGAAAGAATGAGAAAATTGCAA GATCTTTTTCCAAACATGGACAAGCAAACAAACACAGCTGATATGTTAGATTTGGCAGTT GAATACATCAAAGATCTTCAAAAGCAAGTCAAGACTCTCACGGATACGAAAGCGAAGTGC ATGTGTTCACATAAACAGAAACAATAA
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>LITCHI004363.m1 - Up_Stream_Len 2000 ACGCTACGTTTTTTTGTAGTCCCCCCACACACACATTCAACTCTCCACGTTGGATGAAAG ACACTTGACCCAGAAGCAAAGCATCATTAATTGAATCTTACTTATGCTTTCAAGCTTGGA TAAGGTTGTTTTATAAAATACATAAAACAAAAACATTAATTTCACCCTTTCGTCCCCCAC AAACAAACATGTGATATATATATATATATATATATAACTAGTTAAAACGCTCCAAACATA TTCATTTATAATTCAAATATTAGTACATTTTCAAAGACTTTGATATTTTCATTATCTAAT TCTGTAATCATAATAAGAATCGACTTCTCTTTATATCATTATAAGGTTTTCTGTTTAAAA CTTGAGAAATGACATGTGACACATCTATGTATGTCGGACACATACTAAACACTTTCTATT ATATAATATTGTAACAGAAATTTGAGATAAATGAGAGAGATGGAGTTTGAATCAGAGGTC TCCAAATTTTGATATCATATTAGTTATCATCAAACTTAAAAGTTTAAACTGATAAGAAAT GATTCAACTGTAATATTTATGACTTAAGATTAACACGTGATAAAATCCATAAAAATTGAT ATCAATACCCCTAAAAAGTTAAGATGAACTTTATTAATATTATTTTATTCCAATAGATTC CTAACCATTGGTGTTAATACCGTTAGGAAGTTGAGACAATCCAATTTTAAATCTTTCATA TTTTCGTTAATAAAATTGAATTTGAGTTTTTTCCCCCTCGCTCAACTAATATCTCTGAAA TTTTATTACTAATTCTAGCTTAACCTTTGGTAATTACAAGATGGGTTATATCTCACAATC TTTATTCATTTGTAAAATTAAGACTGTTTATAAAATAATACCCCCTTTCCTTTTCTCCAA TGCAAACGTTTGTATTTACTATACATTTTTGTCCCAATATAAATTCTCAACCATGGTATA GTACAATTCAACGTGTCGGTAATATAAAATTGTTGTTTTATCGATAGATGTATTTTGCTT AGGTAAGCAGGTGAAATTAAGGACCTCTAAGTGAATTTCCATAGCAAAATTATAGGGTAG TTTAGTCAATTCGCAAGATGAGTTACATGTCACTTGTCATGGTCTTTGGACCACATGACA TCATCATCAATGGCAAGTCTTTAATTAGTTGCAACATCAAGGGTGTTTGTGAAACTACAT GCTTAGATATATGGCCTAATGGAGAGGCAAATTTGTTGGGCTGCTGCGAGACTCTTCTCC CTCTCTTTTTCACTGAGTCCTGTCTCTCTTGTCTTTGCTTTATTTTGGCTGTTTCTTGAT TTCAGTGTTTTGATTGAGAAGCAAAAAAGAAACAGTGGTTGGATTTGGAATTTGGATTCA GACACCACCCCACACACCCCCCCTCCCACAGATAGTTTCGATAGAGAGAGGTACTACATG ATTCATCAAAACATTGATGTTTTGATGATGATGATGATAAATATGTTATTTTGGTGTTAA AAACTATACTGCATGTGAATATATATGTCTGTTTTTTTCCCTGTCTTGAACCTACTTTTC ATGGCAAAGGAACAAAAAACAACAAAGATTCTAGGCTTGGTTGTCTTTAAGTTTTGTCGT CATGAGCTGATTTTGAGATGTGTTTTAGGCTCGTGAGTAGTCACAAATATAGCAAGTTCA ATTTTTTGTGATCTGGGGTGTTCCGTTCCTGAAACTTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTT TTTTTGCAGGTTTTGTGTGAAGGAAAAGGAATCTATATATTGACCCTTTTGAGCAAACTA TGAAGGACAAGTTATTGATTGTTTAAGTTGAAGCAACGTTTAGAGGTCAATATCACAGCT TGGATTTAGTACAATCGAGCGTATCTTTCTCAGGTATGTAACATTCATGATTATATAGTC AAAAAAGTTGGAAATAATAAATTATAAGATTGATATGATATATCTATGGTTTTGATGGTT TTCAGGATTCTTCAGGAGAT
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>LITCHI004363.m1 GenomeSequence - ATGAGCCTTTTGTATTCTACTAGTTTCAGATATCCTGAGGGAGATCACTTGAGGAAGAAC CAGGAAATGTTCATGGATTCAAGTCCTCACTATAATCATCATCATCATCATCATTATCAT CAACAACAGCAACAACAAAACAATAACCACCAGCACCAGCAGAATAATTCTGGCCTAATG CGGTATAGTTCAGCTCCAAGCTCTTTCTTAGAGAGCCTTGTCAATGGTAGCAGCAGCGGT GGTGAGGACTATCGATATTTTCGATCCTCAAGTCCTGAAATCGACACCTTTCTTGAAAAA TATATGCTGCCAAGTAACAATTCTGGTGATTCGGGTTCTCATGATTTGCAACAATTTGGA GAGAAATCTATGAAGCAAGAAGAGGCAGAGACTACTACTACTACTGATATCCCTCCACAG AATGGATACTCTAACGGCTCATCCTCCCACATGATCTACCAGAGTCTACAAGTTCAGGGT CTGCAGAGAAATAATGATAACAATAACAACAACAAGACAATGGACACTTCATTTGGTGTT ACCAATTCTATGGTCTTGGAGTCAAAAATGGCTACCGGAAATGGCTCCAATCTTATCAGG CAAAGCAGCTCCCCAGCTGGACTTTTCTCCAACCTAGGCGTTGACAATGGTATATTTTAC TTTCTTTGGTGCCATAACCAGTTTTTGTGTTGCATATTGTTTTATGCCAACTTGTGTTCA CATATGTCCTGAAATTGTGATTGAATCTAATGATTTATGTCTGTTCAACCATGTGTGAAC TCAAGTTGCAATCGATGAAAATTTTATAGTCAGAAGTACAATAACAATAGTAATATATAA TATATAAAATATAGAGATGTATTGTTTTTCAATACTTATTAAGCGATTAAAGATATTGAA TGTCTTCCTTTGTAAACATATTATTTAGATTGATGTGTGTGGGGCTGTTTTTTATGTGGA GAGAGTTGACTAATTGATAAGCGTTTTTTGTTCCCTTTTTACTTCAATTATTTTCTGATT AAGATTGTTGTTACTTGAGAAAATAGAATGGAAGAATAAGAGAATATATCTATATAGAGA AGAGGAGAAGAATTTTGGAAGATGAAACAACAAAAATTCTTACTTTTGTATTACAATTTG AACTCTTAGAATTTCAACTTGCATGATGACAATTTGAGTTGCTCAGGCTTTTATTGAAAT ACTAATTAAGTGTTAATTTGATGTGCTTATATCTTAAATGAACAGGATTTGCTGTGATGC AAGATGTGGGATGTTTTAGAGGTGGGAATGGTAACAATGGAGAATCTGGTGCATCAACTA GTAGGTTAAATAATCATATAAACTTTTCGACTGGACCTTCTTCAAGACTTAATATGCCTC AGATTGGTGAAATTGGGAACCAAAACATGGGGACTTGTAGCCCGGAAAAAGGATTGGGGA GCAATAATGGTAGCAATAATAGACAGTACATGTCCAATTTTGCTAGTGATTCTTGGGATG ACACTTCATTCAATGGCCTGAAGAGAGCTAGAGGAAATGATGGCAACATGTATTTTGGTT TGAACACTTTGGAAACAACTCAGGTAGCAACATTGATTTGCACTATATATTTCTATTTGT TCGCTTTGTTCTTGTTTAATGTGTGTCTAGTTACTGATTATGGTATCGCGATTCATTAGA ATGGAAACGCTGGAAGCCGGTCTAATGCCCTGACTCGCCATTTGAGCTTGCCTAACCCTC CTTCTGAGATACCTACTGCGGAGAAGTTTTTGCACTTTCAAGGCTACATTCCTTGCAAGA TTCGTGCCAAAAGAGGTTTCGCTACTCATCCGCGTAGCATTGCTGAGAGGGTAATTAAAT CTCATCCGTTACATACAATTAATTTGTACATTTTATTGTGATTATTTAATTTGTTTCTGT CTCTATATCATCATATTTGACAAGTACTTCAATTGGGGTGTGTAAATTTTCAGGTGAGAA GAACAAGGATCAGTGAAAGAATGAGAAAATTGCAAGATCTTTTTCCAAACATGGACAAGG TAGTTAAGACTGTAGAGCTCTCACTCACTTGTTTTAGTCCAAGTTGTTGTTACTTGAAAC TCAAATTTTGCAACATTTTCCTCTTGGCAGCAAACAAACACAGCTGATATGTTAGATTTG GCAGTTGAATACATCAAAGATCTTCAAAAGCAAGTCAAGGTAACATTAAATAAATTACCA CCCTTTGCTCAAACTCACATATGTCTCTAACAAACACCATCTTCCCTCACCAAAAACTTT ATTTATTTATTTATTTTCTTTTCTTGCAGACTCTCACGGATACGAAAGCGAAGTGCATGT GTTCACATAAACAGAAACAATAA