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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004356 | Chr14 | 639213 | 644411 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 30 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004356.m1 | 17 | 125 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 44.6 | 1.80E-11 |
LITCHI004356.m1 | 59 | 86 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 19.9 | 0.0008 |
LITCHI004356.m1 | 59 | 108 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 25.9 | 1.10E-05 |
LITCHI004356.m1 | 94 | 125 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 25.8 | 1.10E-05 |
LITCHI004356.m1 | 282 | 302 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.8 | 7.00E-05 |
LITCHI004356.m2 | 31 | 139 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 44.5 | 1.90E-11 |
LITCHI004356.m2 | 73 | 100 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 19.8 | 0.00082 |
LITCHI004356.m2 | 73 | 122 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 25.9 | 1.20E-05 |
LITCHI004356.m2 | 108 | 139 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 25.8 | 1.10E-05 |
LITCHI004356.m2 | 296 | 316 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.7 | 7.20E-05 |
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>LITCHI004356.m1 ATGAATACTCTAACTGCTGCTGAAGATTCTTTTTCAAGTGTTCTTGAACTTGCTGCTAAC AATGATGTTGAAGGCTTTAAAAGTTTGGTCGAGCATAATGTTTCTTGCATTGATGAGGTT GGACTGTGGTATGGACGTCGAAAAGGCTCAAAACAGATAGTTCTTGAACCCAAAACTCCA TTGATGGTTGCTGCTATCTATGGTAATGTTGAGGTTCTGAAGCTTATATTGATGCACTCT GAAGCTAATGTGAATCTCTCATGTGGCTCGGATAAAAGCACTGCCCTTCATTGTGCTGCT TCTGGAGGTTCTGTTAATGCAATTGATGTAGTCAAGTTGCTTTTATCAGCGGGTGCTGAT CCAAATTGTGTTGATGCCAATGGTCATAGTCCTATCGATGTTATTGTTGTTCCACCAAAA CTACAAACCATGAGGATGGTTCTTGAAGATCTTCTTGGAAACAATAATTCTTGTATTGTT GTCTCTGATGGTGAGCACAACTTAACGGTGTCCATTAGTTCAAATTCTAGCTCGCCGCTT CTTTCTGCATCGCCTACAAATGGATCACCATCATCGCCTTCGGAGTCACTATCTTCACCA ATGGCTTCTAAGTTTAATGAGGTACATGTTGGTACTGTTGCTGAGAAGAAAGAGTACCCA ATTGACCCATCGCTCCCAGACATAAAAAACAGCATCTATGCAACCGATGAGTTCCGTATG TTCTCATTTAAGGTCCGCCCTTGTTCCAGAGCATATTCTCATGATTGGACTGAGTGCCCT TTTGTACACCCGGGAGAAAATGCCCGTCGAAGAGATCCCAGAAAGTTCCACTATAGCTGT GTGCCGTGCCCTGATTTTAGAAAGGGTGCTTGTAGGCGTGGTGATATGTGCGAGTATGCT CATGGAGTGTTTGAGTGCTGGCTACACCCAGCTCAATACAGAACTCGACTATGCAAGGAT GGCACAAGTTGCAACAGGCGTGTTTGCTTTTTTGCCCATACAGCTGAAGAGCTTCGTCCC TTGTATGTCTCTAGTGGATCAGTAGCACCATCACCTCGCTCATCTGTTTCTGGTGCTAGT GTCATGGACATGGCTACTGCTTTGAGCCTTTTGCCTGGTTCTCCTTCATCAATGTCTACC GTGTCACCAAACCCTTTTGGCCAACCCATTTCTCCTTCAGGGAATGGGCACTCATCTGTT TCTTGGCCTCAGCCAAATGTACCCACACTTCATCTCCCAGGAAGCAACATTCAATCAAGT CGCTTGAGGTCTTCCCTGAGTGCTCGGGATATCCCACCTGAGGATTTAAATATGTTGCCA GATTTTGATGCCCAGCAACATATTTTGAATGATCTAACTTGTTATTCACAACCGCGGAAT AATTCTGTGCCTATGAGTCGTTCTCTTCGGACTAAAACACTAACTCCTTCAAACCTCGAA GAGCTTTTTTCTGCTGAGCTCTCTTCATCACCTAGGTACTCTGATCAGGCTGTGTTCTCG CCAAATCACAAATCAGCTGTTCTCAATCAATTCCAACAGCAACAACAACAAAGCATGTTA TCTCCTGTCAACACAAATGTTTTCTCCCCCCAAAATGTAGAACATCCTTTTTTGCAAGCT TCATTTGGTGTTGGTTCTCCTGGTAGAATGTCACCCAGAAGCATGGAGCCAATATCCCCA ATGAGCTCTAGGCTTGCTGCATTTGCTCAGCGTGAAAAACAGCACCAACAGCTGCACAGC CTCAGCTCGAGAGATCTTGTATCTAGCGATCCTCTCTCCAATGTTGGATCTCCTGGGAAT GCAAATTCTTGGTCTAAATGGGGATCTCCTAATGGAAAGCTGGACTGGTCTGTAAATGAG GATGAACTGAATCTGATACGGAGATCATCTTCTTTCGATCATCGGAACAAGAACAACAAT GGCGAGGAGCCTGATTTTTCTTGGGTTCAATCTCTTGTCAAGGAATCACCACCTGAGATG ATGAAAGAGAAACCAGCAGTTCCCATCTCCGGTGCTGCACCAGGTGAGGGTTTGGGTTCT GATACTCAAACCGATCCTGTCGATCATTCTGTTATCGGGGCGTGGCTTGAGCAGATGCAG CTTGATCAGCTTGTAGTTTAG >LITCHI004356.m2 ATGTGTGGTGGTCCAGAACAATCAAAATCTAGTAACAAAGATATGAATACTCTAACTGCT GCTGAAGATTCTTTTTCAAGTGTTCTTGAACTTGCTGCTAACAATGATGTTGAAGGCTTT AAAAGTTTGGTCGAGCATAATGTTTCTTGCATTGATGAGGTTGGACTGTGGTATGGACGT CGAAAAGGCTCAAAACAGATAGTTCTTGAACCCAAAACTCCATTGATGGTTGCTGCTATC TATGGTAATGTTGAGGTTCTGAAGCTTATATTGATGCACTCTGAAGCTAATGTGAATCTC TCATGTGGCTCGGATAAAAGCACTGCCCTTCATTGTGCTGCTTCTGGAGGTTCTGTTAAT GCAATTGATGTAGTCAAGTTGCTTTTATCAGCGGGTGCTGATCCAAATTGTGTTGATGCC AATGGTCATAGTCCTATCGATGTTATTGTTGTTCCACCAAAACTACAAACCATGAGGATG GTTCTTGAAGATCTTCTTGGAAACAATAATTCTTGTATTGTTGTCTCTGATGGTGAGCAC AACTTAACGGTGTCCATTAGTTCAAATTCTAGCTCGCCGCTTCTTTCTGCATCGCCTACA AATGGATCACCATCATCGCCTTCGGAGTCACTATCTTCACCAATGGCTTCTAAGTTTAAT GAGGTACATGTTGGTACTGTTGCTGAGAAGAAAGAGTACCCAATTGACCCATCGCTCCCA GACATAAAAAACAGCATCTATGCAACCGATGAGTTCCGTATGTTCTCATTTAAGGTCCGC CCTTGTTCCAGAGCATATTCTCATGATTGGACTGAGTGCCCTTTTGTACACCCGGGAGAA AATGCCCGTCGAAGAGATCCCAGAAAGTTCCACTATAGCTGTGTGCCGTGCCCTGATTTT AGAAAGGGTGCTTGTAGGCGTGGTGATATGTGCGAGTATGCTCATGGAGTGTTTGAGTGC TGGCTACACCCAGCTCAATACAGAACTCGACTATGCAAGGATGGCACAAGTTGCAACAGG CGTGTTTGCTTTTTTGCCCATACAGCTGAAGAGCTTCGTCCCTTGTATGTCTCTAGTGGA TCAGTAGCACCATCACCTCGCTCATCTGTTTCTGGTGCTAGTGTCATGGACATGGCTACT GCTTTGAGCCTTTTGCCTGGTTCTCCTTCATCAATGTCTACCGTGTCACCAAACCCTTTT GGCCAACCCATTTCTCCTTCAGGGAATGGGCACTCATCTGTTTCTTGGCCTCAGCCAAAT GTACCCACACTTCATCTCCCAGGAAGCAACATTCAATCAAGTCGCTTGAGGTCTTCCCTG AGTGCTCGGGATATCCCACCTGAGGATTTAAATATGTTGCCAGATTTTGATGCCCAGCAA CATATTTTGAATGATCTAACTTGTTATTCACAACCGCGGAATAATTCTGTGCCTATGAGT CGTTCTCTTCGGACTAAAACACTAACTCCTTCAAACCTCGAAGAGCTTTTTTCTGCTGAG CTCTCTTCATCACCTAGGTACTCTGATCAGGCTGTGTTCTCGCCAAATCACAAATCAGCT GTTCTCAATCAATTCCAACAGCAACAACAACAAAGCATGTTATCTCCTGTCAACACAAAT GTTTTCTCCCCCCAAAATGTAGAACATCCTTTTTTGCAAGCTTCATTTGGTGTTGGTTCT CCTGGTAGAATGTCACCCAGAAGCATGGAGCCAATATCCCCAATGAGCTCTAGGCTTGCT GCATTTGCTCAGCGTGAAAAACAGCACCAACAGCTGCACAGCCTCAGCTCGAGAGATCTT GTATCTAGCGATCCTCTCTCCAATGTTGGATCTCCTGGGAATGCAAATTCTTGGTCTAAA TGGGGATCTCCTAATGGAAAGCTGGACTGGTCTGTAAATGAGGATGAACTGAATCTGATA CGGAGATCATCTTCTTTCGATCATCGGAACAAGAACAACAATGGCGAGGAGCCTGATTTT TCTTGGGTTCAATCTCTTGTCAAGGAATCACCACCTGAGATGATGAAAGAGAAACCAGCA GTTCCCATCTCCGGTGCTGCACCAGGTGAGGGTTTGGGTTCTGATACTCAAACCGATCCT GTCGATCATTCTGTTATCGGGGCGTGGCTTGAGCAGATGCAGCTTGATCAGCTTGTAGTT TAG
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