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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI004202 | Chr6 | 31268855 | 31272840 | - | PHD and RING finger domain-containing protein 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI004202.m1 | 325 | 368 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 31.2 | 2.20E-07 |
| LITCHI004202.m1 | 419 | 464 | PF00628.32 | PHD | Domain | 34.2 | 1.90E-08 |
| LITCHI004202.m2 | 325 | 368 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 31.2 | 2.20E-07 |
| LITCHI004202.m2 | 419 | 464 | PF00628.32 | PHD | Domain | 34.2 | 1.90E-08 |
| LITCHI004202.m3 | 180 | 223 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 31.6 | 1.70E-07 |
| LITCHI004202.m3 | 274 | 319 | PF00628.32 | PHD | Domain | 34.5 | 1.50E-08 |
| LITCHI004202.m4 | 325 | 368 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 31.4 | 2.00E-07 |
| LITCHI004202.m4 | 419 | 464 | PF00628.32 | PHD | Domain | 34.3 | 1.80E-08 |
| LITCHI004202.m5 | 325 | 368 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 31.4 | 2.00E-07 |
| LITCHI004202.m5 | 419 | 464 | PF00628.32 | PHD | Domain | 34.3 | 1.80E-08 |
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>LITCHI004202.m1 ATGGGAAGGGGAGGGAAGGCTAGTTCTAAGGGGGGATTCAAGAAGAGGGTTAAAGATAAT GGTTCGGATGATTCAGATGAGGATTATGTTGTTTCGGCTGAGGAGTATGTTGTGTCTGAG GATGAGTTGGATGATTATTGCTCATCGTTAGATGCAGATGCGTTGGATGAGAGTTTTGAT GCTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGATGAGAAAAATTGTTAGGCCGAAA GTGAAGAGGGGTAATTTAGGGAATGGGAGAGTTAGGGATAAAACATCGAGGAAGAGAAAA AGGGTGTCGGATGGAGAAGATGAGGATTATGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG GAGGAGGATGAGGATGAGGAGTTTACACCGGATGAAGATGAAGATGAAGATGATTGTTTG GATGAGGAAGAGGAGATGGTGATTGCTAAAAGGAAGAATAATAATATTAAGAAGAAGAAT CCGGGTAGAAAAGGTCTGAGGAAGAAGGGTGCTGTTAGGGGTCGGAAAAAGAGGAAATCT ACAGTCTCTAAGAAGCCTTTGGGAAAGAAAGGAAGAAGGAATCGTCGATTGAGGAAGAAA GAAAGGTGTGAAGATGATGATGGTGATGAGGATGATGACGATTATGACTCTGATTTTATG GACAACATTCCAGTTGCAAGAGAAAAGAGCAAGAAAAACTCTGGTCGGAGAAAGAGGAAG CATGTTGTACCTTCAGATTCGGAGTTTGTATCTTCGGGATCATCTGATTATGATTATACA ATCTCAGAGGAAGAGAGGGAGCAAGTGAGGGAAGCCAACGAGTTTTGTGGACGTCTAAAA ACTACTTTGCGGCGCTCTTCCTGCTCTAAGAAAACTGAAGAGGATAGCAACATAGAGCAG CAACAAAAACCTGTTGTAAGAAAGGGCAAGGAGAAGATAGAGGAAGTGAAGATGAATGAA GGGGGAAAGCAGGTTTGTGGTATATGTCTGTCTGAGGAAGATAAGAGAAGATTGAGGGGA ACCCTGAACTGCTGCAGTCATTATTTTTGTTTCACTTGCATCATGGAATGGTCGAAAGTG GAATCTCGTTGTCCTTTGTGCAAGCAGAGGTTCCAGACAATCACCAAACCGGAAAGATCA ACAGGTGGTGTTGAATTGAGAAGTGTGGTAATTCAAGTACCTGAGCGCGATCAGGTGTAT CAACCGACTGAGGAAGACTTGATGAGTTATCTTGATCCCTATGAGAATGTTCTTTGTTCA GAATGCCACCAAGGAGGGGATGATGGCCTTATGCTACTCTGTGACATATGTGATTCACCG GCACACACCTATTGTGTAGGCCTTGGGCGGGATGTGCCTGATGGTAATTGGTACTGTTAT GGCTGTAGACCTGTTGCGGTTGGATCCACTAGTTCCCAATCTCAACATCCTTTGCCTGAT CAAAGGAACACAAGCAACAACTTGTATAATAGACCATCACCCATTGTAAGTTTCGGGGAA GGTTTAGATCCTTCTTCGGTGTCTTCACCTCGTGTACAAATAAATCAAGGAGTGGGGAAT CTTTCATCTCCTAGATTTGCTGTTGGAGATGTTCAGACAGCTTCTCCAGGATCTGGAGCA GGGGCACTAACTCTCTCGGGGAGACGTTGGATACATCGTCATATACAAAATCTCCTTTCT GTCAATAGAACAAATCTTATGGCTGGCAGTGCTGATGGTATGGCGGCTGCAAATTTGAGT AGTAATTATTTAAACTCTCAGATTGATCAGGGTAGGGAAACGGTAGTTCAACCTACAAGG GCACAAAATATGGAGCAATCTAATCAGATCATCTTTGAGGAGAGATTGCAGGAAAACTTC CCATCTTCAGTGGAAAATACTGAGCTATTCGCGTCGAGATCAAGCCATCCGAGAAGGCAA 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>LITCHI012915.m1 MSGSIKIEDLCDDHFEGSHDEHRIFSEIFFGNDAAVTSKRCLVTGVINFEADNDKSADIS LCSNSENSSITSQSSSKNLFVEDSYNVTEISGAASGSRCFPERSVLERDDQNLSVKRMKL SVDALSNTRSYMGKTLNSTVLASEVVASTSCPVTDTASKTVKLHLVDTSNHGVTSSCYLF KRHVDRGGDVGQFDVIKHRMTSLDGNDSKEMVVGKAIASPISQESFATRLAVASPSMTVA EKSDSSLHDVGRSNAFDSLGFNVGDTSLKMETKIDPRSLLQGHIVQLLTAAGWNIERRQR PSRKYMDTVYRSPGGRLFREFPKAWRACGRTIFADRYNLLPEDDNKEWTDINQFHSDLLD TLTNIEKKITQSDIANAVAHQWSLLDPFVFVVFIDRKIGSLKKGEVVKAARTLVVDKSEK IDAVLALDNAQSFGTCSQKVPVQVYDASPAAKSEFTVSDRSCHAYDVQSGNGSFPKYGGQ TKDSTSQCLTGVSISMADKVGTYTVDTSNATENLCFEISGTKRSNDLIFLPPCGADSTCV QSGGCLYGVPTASRDVNNVVGGSEFASSLQDSKKSCNKQASEDNVEAPKQAPEDVAIHSW EEKQKLFEGPEIDKLGNHLQNSLDDSVNCRNDGLAHSPGFVNSGVPQQSEQSEDDGEKCI EALNPKTENKYSPPNEKAKRKTRRKSKKISEIKLTSLLDQSDILSVTLPEKSEQQDINAI SSQLEPEEVQEYLVTDATIQGSQENLHALSSQHEVAVKCSKFQKIQRDCNGPRSGQKKPV TCEIKDDDLLVAAIIKNKDCIRNITVSSSKRKPRKIRGHGKLRNQKGGCRLLPRTVGKQG KLIGNGVWVMEGTRTILSWLIVSGVISLNDVIQFRDPQDDVVIKDGLVTSNGIICKCCNQ VLSVSQFKTHAGFGLNRPCLNLFMDSGKAFTLCQLQAWSAEYKSRKSGNKTGTVEADEED 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>LITCHI012518.m4 - Up_Stream_Len 2000 GGTCCAAAGTTTGTTCCCAATATACCCTTTTGAAGTTTGCCTGTAAAATGAGTAAAGGAC GATTTCACCCTTGGCCATCCCTCTTCAAACCTAGAGAGATTGTTGAAATCATCAGCTTAT ACAGTCTGACCATAACATACAAAATTAACATCATTACAGTCAGTTTCTTTCTCGGGAGAA AAAAGGGGATGCTCGAGTTTTCTTGAACAAGGGGTCTTGGAATCGAATCGTGCAGATGGA GGGGATAACATAACATGCAGCTCGTTTTATCACCTAACCATATTCCAGCAACCACCAATT CCATTGTTCAAGTACCAAATCTCGAACTCTCTGCAACTAGGGAAAATAAATAAATAAACA TTGTTTTTCAGATTTGCTGCAATGGTGACTAAATGACTCTTTTGCCCTTCCACCATCCCT TCCAATTACTCAGACACATCACCCTGTTTCTCTTCTTCTCTCTTCTGAAACCAAAAAGCT TTCTTCTTGTTGGAACGAAAATACCCATCTCTTATAAGTAGCCAATAAATGTTAAAAAGG TACCATCAAAAGCTTCTCAAAACACCTCTAATCGTGGAATACGCTTGATCTTGACTAGAT TTTGACAAATTATTGACCTGACCTATTTGCTATGTACATCCTTCATGGATCCATAATCAA CAAGCAACCTAAAAAGTGTAGAAGAAAAGCTTAAGCTTTGCTAAAAATTGATATTAAGTA TTGATTTGCTTTCAAAATAAATTAAATCGAACCCATCACCAACCAATTCATCAAAATGAC AAAACCCCATTATTTGATGATAAAAATCAATATTTTTGTTCACACATACCTAAAACTCCA AATAATTAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATTGAAATTGAAATTTATATTATTCTATTCA TATTGCGCCAATTTTTCATTCGAACTACTTCACAGGGCAACCCCATCAACGTATTTCCAT ATCCAAAAATCTGCAGAAAAAAAAAAATTGTTCTATTTCAAATCATTAAACATTTACAAC CAATCCCAAACACCAACATCAAATCCACCAAAATAAAAATCGGTCCAACATTACATGCAT ATGTAGATTATCACATTCCAAACAAAGAAAGCTCTCAAATTTGCAAACTCATCAACACAC ACCAAACCAAACCAAACTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATCCATCTTCACCA CCGATTAATTCAACTTAGTTTAGTCGGTCTTAACATTCATCCACCAAAACAATTCAAAGC AACTTAAATTCCCATAACCTCAAACTTTTCCTACATCACCCATGCACAAAATTTTACCCA AAAACACTTCCAAAAACCACAAAAACAAAACCAAAAATATCAATAAAAAAGGAAAAAAAG AAAGAAAGAAAGAAATCATAGAAAGAAGAAAATCACACTTGTACCATCATAATACCATAT AGACTGCAAAACAAACCACTCACAAGAAGGAAGAAAATCGGACAAACGACACCCGCGGCG CAAATTAGCATCCATCCTTTTAAAAAAATTCAACACTCACAAAGTCACATTTCATGACTC AGATAACGCAGACCCAAATTCAATCCCAAAAGGAAAAAAAAAAAAACCTTTTATAAAAAA AAAATAGAAATATAAATAAATAAATAAATATTTTATTATTATTATTATTATTACTAAGAA GCAGTTAGATAGAGAGAAAGAGAGTTTTTTCTTCGAAACAGATCTCTCCTGATATTCTTT TCTTTTCAATTTGGTGTTTTTTTGGCTTCAATTCTCCGTTTTTATTTTTTTATTCAATTT TATTTGGTGTTTGGAGAAATAGTAGAATTAAACAAAAACCCAAAAAAAATAAAAAATTAA GAATGAAAATCGTGTGTTAGTTATTTTTTTTTTTACATTGTTATAGTTTTGGTTGTGTTT CTCTCTGTATATGTTCGATTTTTAGGGTTTTACGTGGATTTTGTTGAAATTGAAATTGGT GAGATTCGATTGGATTGAAA >LITCHI012518.m3 - 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>LITCHI012518.m4 GenomeSequence - CATCAACGTATTTCCATATCCAAAAATCTGCAGAAAAAAAAAAATTGTTCTATTTCAAAT CATTAAACATTTACAACCAATCCCAAACACCAACATCAAATCCACCAAAATAAAAATCGG TCCAACATTACATGCATATGTAGATTATCACATTCCAAACAAAGAAAGCTCTCAAATTTG CAAACTCATCAACACACACCAAACCAAACCAAACTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT TAAATCCATCTTCACCACCGATTAATTCAACTTAGTTTAGTCGGTCTTAACATTCATCCA CCAAAACAATTCAAAGCAACTTAAATTCCCATAACCTCAAACTTTTCCTACATCACCCAT GCACAAAATTTTACCCAAAAACACTTCCAAAAACCACAAAAACAAAACCAAAAATATCAA TAAAAAAGGAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAATCATAGAAAGAAGAAAATCACACTTGTA CCATCATAATACCATATAGACTGCAAAACAAACCACTCACAAGAAGGAAGAAAATCGGAC AAACGACACCCGCGGCGCAAATTAGCATCCATCCTTTTAAAAAAATTCAACACTCACAAA GTCACATTTCATGACTCAGATAACGCAGACCCAAATTCAATCCCAAAAGGAAAAAAAAAA AAACCTTTTATAAAAAAAAAATAGAAATATAAATAAATAAATAAATATTTTATTATTATT ATTATTATTACTAAGAAGCAGTTAGATAGAGAGAAAGAGAGTTTTTTCTTCGAAACAGAT CTCTCCTGATATTCTTTTCTTTTCAATTTGGTGTTTTTTTGGCTTCAATTCTCCGTTTTT ATTTTTTTATTCAATTTTATTTGGTGTTTGGAGAAATAGTAGAATTAAACAAAAACCCAA 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