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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004202Chr63126885531272840-PHD and RING finger domain-containing protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004202.m1325368PF13639.9zf-RING_2Domain31.22.20E-07
LITCHI004202.m1419464PF00628.32PHDDomain34.21.90E-08
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LITCHI004202.m3180223PF13639.9zf-RING_2Domain31.61.70E-07
LITCHI004202.m3274319PF00628.32PHDDomain34.51.50E-08
LITCHI004202.m4325368PF13639.9zf-RING_2Domain31.42.00E-07
LITCHI004202.m4419464PF00628.32PHDDomain34.31.80E-08
LITCHI004202.m5325368PF13639.9zf-RING_2Domain31.42.00E-07
LITCHI004202.m5419464PF00628.32PHDDomain34.31.80E-08
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>LITCHI004202.m1
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GGTTCGGATGATTCAGATGAGGATTATGTTGTTTCGGCTGAGGAGTATGTTGTGTCTGAG
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GAGGAGGATGAGGATGAGGAGTTTACACCGGATGAAGATGAAGATGAAGATGATTGTTTG
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>LITCHI004202.m5
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>LITCHI004202.m4
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>LITCHI004202.m5 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI004202.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI004202.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI004202.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI004202.m4 GenomeSequence - 
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GGTGCACCCACCAACAATTTGTTCCCACGTTGAAAGATTGGTAGCCGGACAGACAAGTCT
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AGACTGGTTTTAACTTAATTCAGAAC
>LITCHI004202.m5 GenomeSequence - 
AAAAAAACACGCGCAGCAACTATATTAAGAAAAACACATTTCGAAAAACCGCAAATGTTT
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GCACTAACTCTCTCGGGGAGACGTTGGATACATCGTCATATACAAAATCTCCTTTCTGTC
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ATTCATCCATGCAATTTGATTTATAACTATTCACGAGCGTGACCAATTGATTTGTTGGAT
AGACTGGTTTTAACTTAATTCAGAAC
>LITCHI004202.m2 GenomeSequence - 
AAAAAAACACGCGCAGCAACTATATTAAGAAAAACACATTTCGAAAAACCGCAAATGTTT
TCACTGGTTTCTTCTCCCTTCCTCCTTACAGGTTACGAATCTCCTCGCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCGCTGTGTCCACTTTCTCTGTCTAGAATATCAATTTTTTTAAGGT
GGAAAAAAAATCAATCTTTTATCATTTTTTAGATATATTAATTAGCTGTTGTGATGGTTA
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TGATTTTACTCTTAGAGTAACTGGTAACTCAAATGTCACTTGTCCTTCTGATCTAATATT
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ATTCATCCATGCAATTTGATTTATAACTATTCACGAGCGTGACCAATTGATTTGTTGGAT
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>LITCHI004202.m3 GenomeSequence - 
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GGAAAAAAAATCAATCTTTTATCATTTTTTAGATATATTAATTAGCTGTTGTGATGGTTA
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TGAGGATGAGTTGGATGATTATTGCTCATCGTTAGATGCAGATGCGTTGGATGAGAGTTT
TGATGCTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGATGAGAAAAATTGTTAGGCC
GAAAGTGAAGAGGGGTAATTTAGGGAATGGGAGAGTTAGGGATAAAACATCGAGGAAGAG
AAAAAGGGTGTCGGATGGAGAAGATGAGGATTATGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGA
GGAGGAGGAGGATGAGGATGAGGAGTTTACACCGGATGAAGATGAAGATGAAGATGATTG
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CATGGACACGAGACTGCCACAGTGGTTAAGTTTAGGTCTTTAGGATTGATACAAAGAGCA
CGTTTGCCACTCTGCAACATCTATTTTTGTTAGGTGATAGACAAAAATTGATTATTAACT
TGTTTATAGAGATAATTTAACTGACATTGAGCACTAATAAAGGGCTCTTCATTCTTATTC
CATCATCAATGTAGTCATTGTTTAGACAGGACAAATTAAGCTATTTTTTTAACTGGTCAA
TATTTCTCTCTGTTGTGTGTGTGTGTGTATCTGGTGGAGGATCACTCTGCTTTAATAATG
TTGTGGATTGCTCGTTAGATGATCATTTTTTCTAGAACATTGTGAAATGCATATCAGGAG
TCTGTTGACATGTAAATCCCTTATTTTGTTTTACTTTGTTGGACCTGTTATCAAGGTTGG
AAAATATACGGTCAAGAAATTAAAAGATCCAAGTAATAGTATCTTAGTAGTTTGATTTAT
ATTCATCCATGCAATTTGATTTATAACTATTCACGAGCGTGACCAATTGATTTGTTGGAT
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>LITCHI004202.m1 GenomeSequence - 
AAAAAAACACGCGCAGCAACTATATTAAGAAAAACACATTTCGAAAAACCGCAAATGTTT
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GGAAAAAAAATCAATCTTTTATCATTTTTTAGATATATTAATTAGCTGTTGTGATGGTTA
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ATATTATAAACTTCGCTAAACTCTCCTGTATGCTTATCATATATTTTTTTTTTTTTGCCT
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GCACTAACTCTCTCGGGGAGACGTTGGATACATCGTCATATACAAAATCTCCTTTCTGTC
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CTTGCTGTGGTCAATTCTATGCCACCCTATGAGCAACTCCTTCAGTGCAACAGCATACCC
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TGATTTTACTCTTAGAGTAACTGGTAACTCAAATGTCACTTGTCCTTCTGATCTAATATT
GGTATGAGCTATAATAATCAATGTGCAGAATAACCTTGATCTAGCATCGATTACAAAATG
ATCAAACAACTTGTTTTTCTTCGATGCAGACAACAGTACATTCAAGGACATTGCGAGAAG
CTCTACGCACACCATCTTAGCCGCTTGTGGACTTGAGCACAGGAGGAGCGAGGTTCAGGT
GGTGCACCCACCAACAATTTGTTCCCACGTTGAAAGATTGGTAGCCGGACAGACAAGTCT
GATGAAAGGTTTTTGCTCATCTTGCTTTGATTCATTCGTAAGAGACGTGGTAAAGAGAAT
CATGGACACGAGACTGCCACAGTGGTTAAGTTTAGGTCTTTAGGATTGATACAAAGAGCA
CGTTTGCCACTCTGCAACATCTATTTTTGTTAGGTGATAGACAAAAATTGATTATTAACT
TGTTTATAGAGATAATTTAACTGACATTGAGCACTAATAAAGGGCTCTTCATTCTTATTC
CATCATCAATGTAGTCATTGTTTAGACAGGACAAATTAAGCTATTTTTTTAACTGGTCAA
TATTTCTCTCTGTTGTGTGTGTGTGTGTATCTGGTGGAGGATCACTCTGCTTTAATAATG
TTGTGGATTGCTCGTTAGATGATCATTTTTTCTAGAACATTGTGAAATGCATATCAGGAG
TCTGTTGACATGTAAATCCCTTATTTTGTTTTACTTTGTTGGACCTGTTATCAAGGTTGG
AAAATATACGGTCAAGAAATTAAAAGATCCAAGTAATAGTATCTTAGTAGTTTGATTTAT
ATTCATCCATGCAATTTGATTTATAACTATTCACGAGCGTGACCAATTGATTTGTTGGAT
AGACTGGTTTTAACTTAATTCAGAAC