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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004180 | Chr6 | 31095415 | 31099807 | - | "Intermediate cleaving peptidase 55, mitochondrial " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004180.m1 | 14 | 91 | PF02362.24 | B3 | Family | 37.5 | 1.80E-09 |
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>LITCHI004180.m1 ATGGCTCCCCAACTGCAATTCCAAATCTCTAAACTTCTCTCCAATTATGATATTGCTAAA AAATTTACGTTCCCAGCTAAAATTCTGAAGCACGTTCCGATTCCGGAAGGAATACATTTT GTTATGGACTCAACAGAACAACTGTGGGCACTTCGTTACTACACGCGCCCTACTGGAAAG CGAGCATGTCCCGTCTTCACAAAGGGGTGGCGGCAATTTGCCCGAGCCAAACGTCTTCAA GCTGGCGATAAACTCACCTTTTACGGGCACCAAGTTAGGTCTGCTGATGGAGAATTGAAG ATGCAGTACATGATTCAAGTGACTAGGCCAAGTAACGTCACTTATCAGGGTGAACCTATT CTTCCAGATATGACAGGAAAATCTTCTAAACTGTTCCACAATAAGGAGGCAGCCACGCTA ATGTACACAAATTTGGAGGCCTTTCAGAAGGCAGATTACTATGGTAAATTTACAAATCTT TCTAAGCTCACTCATCAGTTGCGGTGGGTAAAATCTCCAGTAGAGGTTAGATTAATGAGG GAATCTGCATCAATCGCTTGCCAGGCAGAAGATTATTCCGATAAAGGGCAACATTACGGT CTAGTTTTCACTGCAAGTACAATGATGTATTCAAAGACACATCCTCGTGAGGCATTGTTA GCAGCAAATTTTGACCACGAATGTAAAACAAGAGGTGCCCAGAGAATGGCTGTTGTTGTG AGGAATAACTCAAATGGATCTGAATCTGGCTCCTTGCTGCACACCATGAATCATACTCTT ACTATATATCGTTCAAGGCTTCTTAGACATCGGGAACGATGTAAACCTTTTCTGACGTAC CATTCCTACTCCTTTCATTGCATGAAACAGCTGACTCACCCTTTATGTGATAGAAATATG ATTTCAACCATAGTTATTCAAGCGGTATTATATGCTGGGAAACAACTTCAACGACTTTGT GTTGAGGAAGAATATAAGGAGAAAGCACCATCAAAGGTTGTGCACTCTATTCTATTCAGA AAATTGATATTGACTGCTGCTTCAGCCATTGTAGTTGGCAAAGCTGCAAAACTTTTGTCC ACACTAAATAAAGAAGCAGCTGATCAAGGGGATTCACCAAACTTACTCATCGTATCCAAT GGCGAGTATGAAGAGGTAGTGATTAAATAA
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>LITCHI004180.m1 ATGGCTCCCCAACTGCAATTCCAAATCTCTAAACTTCTCTCCAATTATGATATTGCTAAA AAATTTACGTTCCCAGCTAAAATTCTGAAGCACGTTCCGATTCCGGAAGGAATACATTTT GTTATGGACTCAACAGAACAACTGTGGGCACTTCGTTACTACACGCGCCCTACTGGAAAG CGAGCATGTCCCGTCTTCACAAAGGGGTGGCGGCAATTTGCCCGAGCCAAACGTCTTCAA GCTGGCGATAAACTCACCTTTTACGGGCACCAAGTTAGGTCTGCTGATGGAGAATTGAAG ATGCAGTACATGATTCAAGTGACTAGGCCAAGTAACGTCACTTATCAGGGTGAACCTATT CTTCCAGATATGACAGGAAAATCTTCTAAACTGTTCCACAATAAGGAGGCAGCCACGCTA ATGTACACAAATTTGGAGGCCTTTCAGAAGGCAGATTACTATGGTAAATTTACAAATCTT TCTAAGCTCACTCATCAGTTGCGGTGGGTAAAATCTCCAGTAGAGGTTAGATTAATGAGG GAATCTGCATCAATCGCTTGCCAGGCAGAAGATTATTCCGATAAAGGGCAACATTACGGT CTAGTTTTCACTGCAAGTACAATGATGTATTCAAAGACACATCCTCGTGAGGCATTGTTA GCAGCAAATTTTGACCACGAATGTAAAACAAGAGGTGCCCAGAGAATGGCTGTTGTTGTG AGGAATAACTCAAATGGATCTGAATCTGGCTCCTTGCTGCACACCATGAATCATACTCTT ACTATATATCGTTCAAGGCTTCTTAGACATCGGGAACGATGTAAACCTTTTCTGACGTAC CATTCCTACTCCTTTCATTGCATGAAACAGCTGACTCACCCTTTATGTGATAGAAATATG ATTTCAACCATAGTTATTCAAGCGGTATTATATGCTGGGAAACAACTTCAACGACTTTGT GTTGAGGAAGAATATAAGGAGAAAGCACCATCAAAGGTTGTGCACTCTATTCTATTCAGA AAATTGATATTGACTGCTGCTTCAGCCATTGTAGTTGGCAAAGCTGCAAAACTTTTGTCC ACACTAAATAAAGAAGCAGCTGATCAAGGGGATTCACCAAACTTACTCATCGTATCCAAT GGCGAGTATGAAGAGGTAGTGATTAAATAA
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>LITCHI004180.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAGAGAGAAGAGAGAGAGAGAGGAGTTCTAAACATTAAATACATTTTTTTTTTATTTTTT TTTGAATTGTGTCCAAGTGTTCAATTTTTTTTTATATATATTAAATTTGCATTTTATTAA ATATTAATATTTTCATATTTTATTTTGCTTTGACAATTTTACCCTTCATATTAATGGTTA AACGTTGACTTTTAATATTCAAGATAATAGTAGGGGGTTTTTCTTTTTGGATATTTTAAT AATTTGTGGGGGAGGGGGGGCGGCTTTTATCTATTTCGAAAATCAGTAGGGAGGAAATTA GCGATTTCTCAAACTTAAAGGTAATTTTGTCTATTTCATCAAACTACTGAGGGAAGGGGA AGGGGGGATGGAAGGGAGAGGGGTGGTGAAGGGGAATGGAATAGGATTATCCCATAAAAT TATGACAAGTGTAGTCAATATAAGTAAGTAGTTTACATAAGATTTGTGGGTCGATACATG TACAAGCTGGCATGAAATCCAACAATTATAATGAGGTTGAAAAGTTGTGAAAATTTGGAT GTAATAAAGCTGTAAATAGTGTAGCCAATGTATGGAAAAAATAAGTAATTTATTTGATCA ACATTACTAGACTAGCTAAGAAATGTAAGCATGACATCCAACTATTACAATAAGGTTGAA AAGGTGTGAAATTTGGACACTACAAAATTGTGAGTTTGGATGCAATAAAGTTGAAAATAA TATAATCAATGTAAATAAATAATTTATTTGGATAATATTTAATTATTCATGGACCAATAC ATTCAAGCATAAAATTTGGATACTATAAAGTAATGAAAATGGGTGCAATAAAATTGTAAA TAGTTGTCAGTTTATGAAAAGAATATGTAAGTAGTACTTTATTGGGATAATATTTTCTAT ACCAACTAAAACATGTAAGATTGAAATTTAACAATTACAATAAAGAAGAAAAGTTTGTCA GCTATTTAAGTTGTTGGATACTACAAAGTTGTGAAAATGGATGCAATAAAATTGTAAATA GTGTTGTTATTTATAAAAAGAATAAGTAAGTAGTATTTTATTGGGATAATATTTCTATAC CGACTAAAATATGTAAGCTTGAAATTTAGCAATGCCAATAAAGAAGAAAAGTAATTGTCT ACTATTAAGTTGTGGAATTTGGATGCAATATAAAGTTATAAATAATATAGTCAATATAGA TAAGCAGTTTACTTGGATAATATTTATGGACCAATACATGTATAAGAATGAACAATTACG ATAAAGTTAAAAAGTTGCGGAATTTGGATGCAATACAATTGTAAATAGTCTAGCTGACTG GAAAGAATAAACAAGTAGTTTATTTAAATCATATTTCTAGACTAGCTAACACATGTAAGC ATGACATCCAACCATAACGTTGAAAAGTTGTGAAATTTGGATACTACAAAATGGTGAATT TGGATGGAACAAAGAGATAAATAGAATAGTGTCAATACAAGTAAGTAGTTTATTTGGATA ACAATTAATTATTTATGGACCAATACGTGTGGTAGCATGAACAATAAATATTAAAAAGTG TGAAATCCAACAATAAGATAGGATAATATTTCTATACCAGTTAGGACACACAAGCATGAT ATTCAACCATTACAAATAGAAATGAAAATATCAAAAGGAAGAAAATGATTCTCTTACAAT GTGAAGATTTGAATGTGAGTTTGTTAGATAGTATTAAATTCTAACAAACCAAGTATCAAA AGTCCTAGGACTTTCTAATACCTAATCAACAAAAATTACCTGTCTTAATCAGACCAAGTA TCAATAGTCTTAGGCATCAAAAATTACCTGTCTCTCAAAGAAGAAGAGCTTCAAATCTTC AACTAACACTTCACATTCTCTTCTTCTTCTTTGCTTATTATTTTTTCAGTGTTCCTCGCT CTATATAATACCTCACCGTTGCCCTTCTACTCATTTCCAAATTAATTTTAAAGCTGCCCG CATTTCCAGACAATTAGTCC
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>LITCHI004180.m1 GenomeSequence - ATGGCTCCCCAACTGCAATTCCAAATCTCTAAACTTCTCTCCAATTATGATATTGCTAAA AAATTTACGTTCCCAGCTAAAATTCTGAAGCACGTTCCGATTCCGGAAGGAATACATTTT GTGGATATGCAGGTTATGGACTCAACAGAACAACTGTGGGCACTTCGTTACTACACGCGC CCTACTGGAAAGCGAGCATGTCCCGTCTTCACAAAGGGGTGGCGGCAATTTGCCCGAGCC AAACGTCTTCAAGCTGGCGATAAACTCACCTTTTACGGGCACCAAGTTAGGTCTGCTGAT GGAGAATTGAAGATGCAGTACATGATTCAAGTGACTAGGCCAAGTAACGTCACTTATCAG GGTGAACCTGTTTATCTGGATGTGGAGTCCTTTCTCTAAATTATTATATGTATAATGTTT TCTTTTCCACTTGAATCATGTACTTTTTGTTTTTTGTGTTTTGCAAAAATAAATTACCTT GGTTGCTTTACGATTAATTGTGTGTTTTTTCTGGAAATGGGAAGCGTGCATCGTTTTGCT TTTCCCGCTTTTACGTACTATAAGGCATATTTTAGCTCTCTGTATCATGCATGTGCTGAT GTGATCACACCTTTAAAATGAACATGAGAGCAAATTATAGAAGCCTCAATCTACAGTAAT AAATTCAATTTAGTTGACAACAAAATGAAATCATCGGTTAAATTTTCCGCACAATTATTA TCTCATCAGAAACAAAATAAATTCAATTTTAAGAAAAAAAAATTGAACATACAAAAATCT GTATACATATACCAGATTACTGAAATTATGAAGAAAAAACTGTTTTCAGAGCGTGCCGTG GCTTCTGCATGGTATCAGGATCTAATAAATATATGTGTACATCATAATCTTAATGATGTT TTATTGGGTAGCATGAACCCTGTTTTTTAGCCCAAGGGTCGAGATCGGTGATAATTTTTG TGTATAGCACACATTGACACATACATGTAGACAGAAACACCACTCATTATTACAACATAG TGCTTGCAAGCACTCACTCCAGCACTGGTTTATTTATTTCTGGTCAATTTCATACTCTTA CTATGATTAAGTTTATGCGTCTATGTAGATATATTTTTTCTATTACTTTGGCTGTTGAGA GCTAATTACGCTACCCTATTTTGTCACTAGAAAGTATGATGTTCAGATGCATTTCGATAA TCCTAGTTGGTTGTAGTAGTAGCCCAGCTACGCATGCCTTTCCTATGCTCGCAATCTATT ATTTCTTATTCCAATTAATGACTGCAGATTCTTCCAGATATGACAGGAAAATCTTCTAAA CTGTTCCACAATAAGGAGGCAGCCACGCTAATGTACACAAATTTGGAGGCCTTTCAGAAG GCAGATTACTATGGTAAATTTACAAATCTTTCTAAGCTCACTCATCAGTTGCGGTGGGTA AAATCTCCAGTAGAGGTTAGATTAATGAGGGAATCTGCATCAATCGCTTGCCAGGTAAAC TTCCAAGCATCAGTCGTAGCTTACTACTCTTACAAGACCAGCTGTCCTGAACATTCTTAC TTTTTGTTCTTTGTATTGAGCTTCTTATATTTATCCTCAAATGATTTTTAGCCGCCAGTT CTACTGTGGAGTATACTTTTTATTGGAAAAAATTAATCTCTCTCTGTTTTGGAAGGGTCT GATCATAATTGTTCGTTGCACCTCAACTCGGAACATCTAAAGTCTACTCTAGTTGTTTGT TATAGTTAAAATTTGGCTAAATAGTACTTCCTCTCCTTACGATTAGATTTCATGCGCGTT CTACTGTCACTAAAACACACCAAAGCAAACTTTCCTATTAATGCACATTAACATTTGTTC TTCAGCAAATATGTCAGTAATCTTTTCTTCCGATAGAAATGGATCTTATGGTTTTATTCC AATTGTCATTTGGTTCACTAGACTTTCTATCTTGTCAGTTCTTCTTATAGGCAGAAGATT ATTCCGATAAAGGGCAACATTACGGTCTAGTTTTCACTGCAAGTGTACTTCATTGTCATG CTGTCGATTTCTAATAGATCTCTGTTTGTTAAATGGACCATCTGATTCTTAATGCGTGTA TGTGTACTTTCTACTTGGATAGGCTCTTTTGCAGACAATGATGTATTCAAAGACACATCC TCGTGAGGCATTGTTAGCAGCAAATTTTGACCACGAATGTAAAACAAGAGGTGCCCAGAG AATGGCTGTTGTCCTTTCCTAATTGTTGGGGAGCAAAAGTGATCCTTAATGTGCATACCT CTGTTTTTATGTGGGTTGGCATCGAGTTTGACGGTGCAGTGCAAGAAATGAACTAGATAA GTTATACCGTATTTCCATAAAATCGGGTTGCAATGATTAAAGATCAAACATGTTTAGATA ATTGCTGGAAGATAAATAATTCATTTTGGCACTCATGTACATCTCCACTTCTCACTAAAT TATTCTTTTACTCTAGTTAATGTTATTATTGTTTTTAGGTTGTGAGGAATAACTCAAATG GATCTGAATCTGGCTCCTTGCTGCACACCATGAATCATACTCTTACTATATATCGTTCAA GGCTTCTTAGACATCGGGAACGATGTAAACCTTTTCTGACGTACCATTCCTACTCCGTAT CTTTTTCCAATACATAATTTGTCAGTTTCATTGCATGAAACAGCTGACTCACCCTTTATG TGATAGAAATATGATTTCAACCATAGGTAAACTTTTGGATTTGTTGTCTCTTTAGGACCT GCATGTCTAAATTACTTGAGGTCTTATTATCTTGACATTAGTCAGACTTAATTATGGTAT CTGAAGACAACTTTTTTAATCATCAGAACATAGCTTACGTAGTTGTATTTATTAAGCAAC CCTGTTGTGATTCATGCTGACTTATTTTAAATGATTGGTTGGTACAATTCATTGCAGTTA TTCAAGCGGTATTATATGCTGGGAAACAACTTCAACGACTTTGTGTTGAGGAAGAATATA AGGAGAAAGCACCATCAAAGGTTGTGCACTCTATTCTATTCAGAAAATTGATATTGACTG CTGCTTCAGCCATTGTAGTTGGCAAAGCTGCAAAACTTTTGTCCACACTAAATAAAGAAG CAGCTGATCAAGGGGATTCACCAAACTTACTCATCGTATCCAATGGCGAGTATGAAGAGG TATGTGAAAAACATATAGTTTGTGAGATGCAAACAAACCTAGTAGTGATTCGTAAAGATA GCGTGATATAATCAACCAAAGGTGTGATGCCAAGGGCCAGCAGGTGTGATGCCTTAATTA TCATATTTCTATTCATTTTGTGTCTTAACTTTGAAATAGCTTTCTCAGCCATTAAAACTA GCCTACTAATGAACTAAAAAGAAAGGCCTGCAATTCATTACAAATAGAACCCCCAAAATC CTGTCCTGCATCGCTTATATTTGCATATTTTCCAAGTTTCTTTTTTCTTATTTAGTGTCT TGGAAGATGTAAGGAATATGGAGGCTGATGTAAGATTATGCATGTTTTTAACATAATGAC CCTATAAAGTTTTAGGATACATGAGATTTTTTCCATCTGAAAGATTTCTTTACAAAGTTG TAATCGTTAACTAAAGGTATGTATGCGGTTTGGAAATAATCTTTTGATTCTTTGACTGCT ATATATATATATATATTTTTTATTGGGATTTACATTGAATTTGTTTCCATTTTGTCGGAT TTTTGTACTAGGTACTGATTTAAATCTTCTAAATTGTTCATTTCAGTTCTTAATCAACTG ATTTAGCCTTCTAAATTATTCATTTCAGTTCTTAGCCAACTTAGCTGAATCTGTTGGTTA AGTCAGTTAGTTCTCAATATTATTTTTAAGACTTTATATGCATAAACATAAGATTAATTA AGTTGAAATACGATGGAAAAAAAATACTTATATCTCAGAAGAACATTTAAATTCAAACAA CATTTTTCATTCGAGGATTTTCAGTTGCTTCTTCTATAGATGACTTTGAAACAACCAAAG TGATCCTAGATGTGAAACTTTGTTTCTCATGCAAGCAGGTTTCAAATGCCATGGAAGTGC TTTTGCTCATAGTTGTATTATCTATTATGTGTATGTCCAGGTAGTGGTACGTCTATAAAA ATAATCACTAGCCATGAACAAGGTGTGGATTTTGTAACACTTTTTGTGCTCTTGATAAAT GTGAGACAGTGAACACTAAGTTGAAATGATCTGGATTACAATAACTTCAAATTATTGTAT AAATACTTTATGTTGTTGTGTTTAAGCATGAAAGATGTATAAAACTAAATACCGTATTAA GTTATATCAATCTTGTTTGTGTTTTTAACATGCACCTTTTAATTATAAAATTATGTTTAT TTAGATTAAATAA