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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004092Chr63024123130254291+Non-functional pseudokinase ZED1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004092.m1187478PF00069.28PkinaseDomain60.71.50E-16
LITCHI004092.m1190368PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain60.81.30E-16
LITCHI004092.m1586818PF00069.28PkinaseDomain89.62.30E-25
LITCHI004092.m1594819PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain87.78.20E-25
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>LITCHI004092.m1
ATGGACACTACCAATGCATTTGCATATTTTCATGTTGGATTTCAAAGGCCTATCGTTTAT
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>LITCHI004092.m1
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>LITCHI006272.m1
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TAGTAGAAGTTGAGGGTGAGAAAGTAAAACTCAAAGAGCATAAGTTCGGTCCATTCAACC
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AAATAACTCCTGATGCCGCCGGTAATTTCACCCTCACCAACAGGTCAGGCAGTGTGTTTT
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TCATCAATACCTATCGCCTTCCCAATCCCAATATCTTATCTCCTGGTGAGGGCTTTGCTT
TCGTTATATCACCTGACCACACCACCCTCCCTCTCAACAGTCACGGTCAGTTCCTTGGTT
TGACCAACTCCACCACCGATGGCCTCTCTTCCAACCATTTCATTGCCATCGAGCTCGACA
CTTTGAAGCAGGATTTTGATCCTGATGACAACCATATTGGTCTTGACATTAACAGTGTCC
ACTCCAACAAGATTGTGTCTTCGTCTGATGCGGGTATCCAAATCTTCCCAAATGGTACCA
AATTTCACGTGGTTTGGATCCAGTATGACGGCCTCAACCAGATGTTGGACGTTTTCATTG
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CTGTGCTGAGTTCGAAACTTGACCTGAGAAGCATCGTCAAACAGCAGTCGTATTTCGGAT
TTGCAGCATCAACGGGGGACGCCATACAACTCAACTGCGTTCTCAGGTGGAATATAACGG
TGGAAGATTTGGGTAGTCAGCTTAACAGGGAGGCTGTAAAGATTGGTTTGGGGGTGGGTA
TACCGTTGTTGGTATTGGGGGTCATAGGAGTAGGAGTGTTAGGATATTACATGCATAAGA
AGAGGGCAGCCAGGTCAGACCCAAACATACTGGGGGCTCTCAAGACCCTGCCTGGAACGC
CAAGGGAGTTCAGGTTCAGGGATCTGAAGAAGGCCACCAACAACTTCGACGACAAACACA
AGCTTGGTCAAGGTGCTTTTGGTGTGGTCTACAAAGGTGTGCTGCCGAAAGAGAATCTTG
AGATTGCTGTCAAGAAATTTTCAAGGGACAGCCTCAAGGGTAAAGATGACTTCTTGGCTG
AACTTACCATTATCAATCGTCTTCGCCATAAACATCTCGTCCGGTTACTTGGTTGGTGTC
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CATCCGGGGTAGCATCAGCCTTACACTACCTCCATGATGAGTACGACCAGAAAGTGTTGC
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AGCCAGCCTTTGTGTGGCCTTCAATGCCTGGGCCAGGCAGCATAAGCATTACCACTAGCA
TGGCTAATACTGCTTCCGTCACATCGGGGTGGAGTCCACAATGTTTAAGCCACGACAGTT
ATATTCAAGAAGCAGAATACAGTGATAGCAGCTCTCTCGTGTGAGAGAATTTCTACCTCC
TATCATATTGTTAACTTTATTCAAGTGGGAAGCTTTAAAGTGTTCCTCCTATTACTGTTT
TTCTTTTGTGATTTTACTCTTTTTCTTCCTTCATATTGGAAGAGCAGGTGGTTTGCATTC
GTACATTTTTCATTTTATAGAACTACATTCCATTGATATATGTTTTCTTTTTTCACTTGT
GATCCTTTGTGTATCTTCTTGTATGTACGAATATAAAGTCTCCTTTAAGTTTGAATTTAG
TATTTGTAATAACATCATATTAAATGAACCAAAGTAGGTGGATTATTGGTTTCAGATGTA
AAAAATCAAGCTATTGTCATCTGCAACATGGCCCTACGAACTAGATGTTTGGGATTGTCT
AGTTCCTCACAGGCTCTGGTGCGAAAAGATCAATCTAAGGATCACGTACAGGCTTGTTAA
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TCTGTTGGACAAGACTACAAACAAGAAGGTATTCCTTGCTATATTTGGAGGATTAGGCAC
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TATATTATATATATATAAATTTAAAGTGCTTGTGAATGAAGGCAATTGTATCCATTCTTG
AGCAAACCAGAATGATAAAAAGAAATCATATATGCATATTTGCATTCATTTTAAGGGTCC
TTACATACCCATGTCAATATGAGTTGATTGTTGATTCAAGGATGCAAACGCACAAGTTCA
AGAGCTTCACCAGCCTGCAACTTCTTGGAGAATCGTAGCTGCCTATAATCTTCGTAAGTA
ATAGGTATATAAAGACGCGGGTGTTCAGAGTCTACAAATTCAGCCGAGGCTTCCACTGCT
GTTTCCTTAGGTCCCAAGAGGAAGGAAGCGATAGACACCCTAACAGTTGGTTCCTTGCAT
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GGGTCAACTGGCACAAATGCACCAGACCTGTCCATCACTTCAAGTCCACCAACGTTTTCA
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CTACCCGCAATCACATCTGTATTGCGTCTTTTAATCTCCCAAGGAAGGTCCAATAGGCTT
CCCACCACCTTCTTCATCTCCGACATCACTGTTAATGGAATCTTGTGGTTCACGATTCTG
AAACATCCCCATTCCTCGCTTGCTTCTCTCAGTTTCCTATACTCAGCCGGAAAGTTCTGC
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TTGCACTTACTAATAATATTTCCTGTTTCTAGTTCTTAAAATTAAAACTAACTTTTAGAA
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>LITCHI006272.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GGGGTCAACTACATTATTCATAAATTTATTAATATGCATAGATAATTTTCTTTTTTATAA
TGAGAGTAGTGGTTGATATAACAAGATTGAAAGTAACTTCATTTATTTGCTTATTTTTTA
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CAGGCAGCGACGCGTGATTAACGTACTGGAAAGTGATATCAATAATTGATCATGTCACTT
CAAAAAAAAAATTAAAAATTGATCATGTCCATATAATATTAAAATAATGGAAAGTTGGAA
GAAAATTCGGTAAGCAAGATTTAAAATGACCAAAACACGTATGTTCACATGTTGTAATGA
TCCATCTTAAAAGAATGAGAAAATTAATTAGTTGTTGACAGCGGCCAGGCAGGAAGAGAA
GGAAGATTGCAAGTGATGTG
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>LITCHI011190.m1 GenomeSequence - 
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AAATCGATTATGGAAATTGCTAACCTTGCAAAAAGGTGTGTAAACTTAAATAGTAGCAAA
GAAATACCTTCAATGAAAAAAGTTGCAAAGGAATTGGAGACAATTCAAGCGCCAAGTAAG
GTTGAAAACTGTGAAGAGATAGAGCATGGTTGAGATGGAATTTCTACTACAGCGTTTATT
TTTGAAATTGATTCACCATTTCGATCAAGTTCTACGTTTGAAATTGGCTCTTCTTCTCGA
CTAGGTTCTACATTCGAAATGGATTTTTTTGGAAATTCTGATTCTACTTTGGAAATTGTT
TCTTCATCTTAACTATTATTAATCAAGTTTGTTGATGAGTTGGGATTTTAAAGAGATAAA
GATTTTTCTTCAATTTTATTCTTCTTAGCTTTTCCTGGTGAGTTTTTCAGTGCTGTTGGA
GGAGGTGCATTAGAATTTGTTTATTTCACTTGTAAAAGCAATGCATTATTTGTAACTGTT
TTAGATTAGGGAAGAAGCATCAACTTATGAAATGATCTCAATCTTCAATGAAGACTGTTG
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GAGATGGGAAAGCTAAGAAGTAGTGGTTTTCTCAAGAGAAATATATCAAGAATGTTTTAG
AAAAGTTTCGCATAAGGAATGCAAAACTAGTTGCTACTCTTTTAGCTGGACATTTCAAAC
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ATACAGTGGTGGTTGGAAGCTTAATGTATACAATTGTATGAATTAGACTAAACTTAGCAC
ATGCTGTAGGTATAGTAAGCAGATTTATTTCAAATCCAGGAAAGGAACATTAGGCAACCG
TTAGATTAGGATGAAACAGAAGTTTTTCAAAAGTAATGGTGTTTTGCTTCTTCAGCAGAA
TTATAATTCATTTGAGGCGACTACTGATGGAAGACTATTTAATGCAAGAGAATTAGACAA
AGCCACTGATCACTTCAATGAGAGCAGAATACTTGGTCAAGGATTCTTAGACACAATTTA
CAAAGGGATGTTGACAGATGGAAGAATCGTTGCTGTGAAGAAATGCAACATGGTTGAAGA
AGGAAGGCTTGAAGAATTTATAAATGAACTAGCTATTCTAAATGAAATTAACCATAGGAA
TGTGGTTAAACTTTTTGGTTTTCGTTTGGAAACAGAGGTTCCATTATTAGTCTATGAATA
CATTCTCAATGGAACCTTTTCTTAGTATCTTCACAGCTAGAATGATGAATTTCCTCTGTC
ATGGTCTATGCGCTTACAAATTGCTTCAGAAGTTGCAGGGGCCATTGCATACTTGCATTC
TGCCGCTTGCTCTCGCATTTATCATCGAGATATCAAGTCTGCAAATATACTATTAGATGA
TAAGTATAGAGCAAAGATAGCAGACTTTGGAACTTCTTAA