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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004089 | Chr6 | 30206637 | 30207531 | + | Non-functional pseudokinase ZED1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004089.m1 | 96 | 258 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.2 | 2.00E-16 |
LITCHI004089.m1 | 96 | 280 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 59.9 | 2.70E-16 |
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>LITCHI004089.m1 ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
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>LITCHI004089.m1 MNPFRVRKNREKLDKKTFMLKNGEILLEKLITTFHGKCNPICNFSSKELQLATNNYDTMN VMTDSGCYTFYKGFLNDRQISVMMYHKFRIGNNDWQCEASIKNIVFTSQMCYKHILKLIG CCLDTRTPILVFESMVKCGTLKDHIYSRHISTPSRIFNMETEITMEIANAFAYLHVGFTR PIVYAGISLSTVLLDEHYVPKLVDFAFAECIPEGKTEIEEATIRGIGDSVAPEHISKRVL HEKCDVYGFGILLVKVLAGQSFGDFFSGDTEDEDWRSNVSTKTREESMKLGGPLF.
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>LITCHI004089.m1 ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
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>LITCHI004089.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGTTTTCATTAGAAATGACAAAGAGCTTTAAAGATACTTGAATTTTGAACGTGGCTAAAG TCAAGTCTCCTATAACTCTCTAGCCTCGATTCATTTGTGTAGTCTTGGCAGCTTTAAACG CATCCGTATTTGACTTCTTAAACGCGTTAGTTTGGATATTCTAAGGAAAGTTGTGTTCTT TGGTGATGCAAATTTCCACAGCATAATAATACATATTCGACAAAATTTCCACATTATTTT TAAATTTAGTGGTTGACGGAGAAGACTTTTGTTTTACATACTTTACTTCTAAGGAATCAT TCTGGTTTATCTTTGTCTGTGCTTCATCTCTGATATTAAATTCCAGTTATAAAACTCGAG CACTCTCTCATACTCGATTCTCCTGGTGCAATGTTACGTGCATGAAGCAGTTGCTGGATC ACATGTTACTTGGCTTGGTGTGGAGCAAGTCTTCACACTTATTTAATTATTGTTATCAGT TTGTTAGTGGAAATAATGTTGGGATAGTGGCTGAATGTAGGCCATATTTTTAGTACCCTG TTTCCTTGTTCGTAGGAGATGTTCTCCTATTTTATTGCTTGCCTGTTAACAACTGATCTA TTTTACATAGACAGTGGATGTAATTTGTTTTCTTATGTTGAATTAATCAAAACTCACTCC TTCCTAATCTATTTTCTTTCTTCTTCCTCACTCTTCTCACATTCGAACCCAAATCTACTC ACCATGCAATTTTTTTTGTCTCGATACCTGGATATCAGCTAGCCTTCCACAAGTACTCTT CTATATGAACTCTATTATATGTAGCACTTATATTTTTTTTTACTTCACTTCAGTCAACAG TGATATGCAATTAATAATTTTTCTTCCTTTAGGAAAGATCTATTAAAGTTCAAGTTAATC AAAATTTAGGCTTGATCGCCATCTTATACTCTCGATAGTATTGGTTATATAGGTATAAAG AATAAGAACATTTTAGTTTATATATATATATATATATATTTATTTATTTATTTATACATT CTTATTTTAAAAATTCAGCACAATTTTTATTAAAATTTTGCCTTAATTTTTTAGTTATTT ACATTTTTCTATTAACATTTTGCTGGTTTTTCTTAAATCGGTTCCCCAAATTGATGGGAT TGGCTTCGCCTAAAAGTGGAGCTAGCTGGGGTTCGATTAATATAATTATTTTAATAAAAA TATTATTTTTTTAAACGTAATAATTAGGTAACTAAATTATGAAAAATATATAATTAGGTA ACTATATCAATATGCTTGTCAAGGAATGTTTTTTAATTGCAAGATATTTTTTCCCGTTTA ATGTATAATATGCTAAACTACCAATTACCTAATAAGCTCAATATCATACATAGTAAATCA ATGTTCTTCAGTAGAAGACGTGAAACAAGTGGACAAAAAATTTATAAATTTTTTTTAATT GTCATTTATGATGTAATGACTTCAATCTGGGACATTTTCAGACTGAATGGGTGTTTTTAC TATTATAACACATTGAGCAATGGAAAAAAGTTTAGGAAATTTCAATGATGGAAAGCATCA ATCAAATTTTCTAGTGGCATTCTCTTGTCTTAGCTTTAAATAATATATACTTCTAAGAAT TCATTTCTGATTTATCTTGCTCTGTGCTTCAGATTAAATTCCAATTCTAAAGCTTGTGCT TTCTCCCAAACTCAACTCTCTCGTGGTTTAATTAGCCCAGGTATTCTTCTATATTATATG AACTCTCATATATAGTAATTACGTATATGTTTTTTCTTTGACCTTAGTCAACGGGATATG ATCAATCATTTTTTATTTTCTAAGAATGATTTGTTAATTAAGTCCACCATAAATTGAGTT TTATGGTCAATTTTATGTTGGTTCAAAGAACAAGAACTTCTTAGTTTATATTCTTATTTT ATATATATGCATGCTTCATGTTTATTGTTTAAATAAAGTGAAAGCATTTCAGGAGATTTA TTTTCTAATAGGTAAATTAA
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>LITCHI004089.m1 GenomeSequence + ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGGTTAAAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATT TACTAGACCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTA CGTTCCAAAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAAT AGAAGAGGCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAG AGTTCTCCATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGC TGGACAGAGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAA TGTTTCGACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA