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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004089Chr63020663730207531+Non-functional pseudokinase ZED1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004089.m196258PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain60.22.00E-16
LITCHI004089.m196280PF00069.28PkinaseDomain59.92.70E-16
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>LITCHI004089.m1
ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG
AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC
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>LITCHI004089.m1
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>LITCHI004089.m1
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>LITCHI030392.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TATTTTTATTATTATAAATCCATTCTATAGTAAGTCACCATCTTTTTTGTTACAGAGATT
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AAGTTCTGTAAGTAGTTGGCCTTTTAGTTTGAATTGCAATTACAAGTTTATATTTGTGAA
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TAAAGTTTCTGTGTATGAACTGAAAATAGTCTATTTTGAATTGCAGTAATTTAACTGGGA
ACAAACTCACGGGTGCAATTCCTGATGCTCTTATGGGAAAGTCCAAGGATGGGAAATTGC
TGATGAGGTTTTCTAATCTTACTAATGGAAATACTTCACTATAGCTAGCTAGTATAAATC
ATTTCGTTGAAAGTAATGGTTCCTCTTTGTGTAAAATATTATAAAAAATAAAATAAAATC
TTGTCTTTCAAATTTTGCATCTAATATTTTCTTTTCTCTTTCCTGTAAATGTCCTGACAA
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GAAAAGCAGACTGCCTTGGTCTACTCCCCGTAGGGCATGCTGACTGACTACATTGTAGCA
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AATGGTTAATGCATTTTCGCTTCATATTTATAAATAAGATTTAAGTCCCACAGTAATCGT
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AAATATCTCTTATGTTAAGAGAGTAAATTTTAGAGCTGTCTCATAATATTTAATCTTGAT
AGATTTTAGTAAACCTCTAATCGTTAGTCATAGATTTCCAATGACATTGTAATTATATAA
ATATATAATATAATAATGTAATCCAGTATGACAACACTAATAATTATGTCAAACAGAATA
ATTGCCCAATTATTGTCGATACACAAGTAAATTCGATAGCAGATGTGAACTGAACCTTGT
GACAGCTCTAAATTGTGAATGTTCAACTCATAGCTTTTGCTGTAAGAAAACAAGGAAAGT
TACGAGGTTGAACAACTTATTGTAGTAGCATGCAATGCGGGATTTCACTAAACATATAAA
AGCAAATTAGTGAGATACCAAGTTGTAAATTTTATTTACTGTCATCAGATCAATTACTTA
TGTGTGCAAAAACTTCATTTGAACGAGGCCGAAAGGTCTTAAGTTGTAATAATCTTGAGG
AATAAATTCATTAAAAACTGTAATGCCTAAAAGTCCATTGGAATTATGTAAGATGCCCTA
ATTTGATTTGTGCATGTTGTGTTATCAATTTATTATGATAATCTGCCTCAAATTTATTTT
TTCAAGAAAAAAAATTGACC
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>LITCHI030392.m1 GenomeSequence + 
ATGCTCATTGATGTAGAGATGCCTATTAGATCTAAGGAAAGTGCGCTAACAGCAAAGAAC
CAGCCGTTTACTTACTCTGAGGTTGTTAGTATCACTGGTAATTTTCAAACCGTCATTGGA
GAAGGGGGATTTGGAAAAGTGTACTTTGGCACTCTGAAAGATGGCACTGAGGTTGCTGTT
AAGGTGCTTTCTTCACTATCAAGACAAGGTTATAAGGAATTTCAAGCAGAGGTTAGACAA
AATAATGCACCCAAAGTTATCAACTGCTTGAAATTTTCATTAATGTTGAAATTATATAAG
AAAAACGGTGATATAAATTTTCATCTAGTTGTAACAGTATCATTTTGAATGCAGGCACAA
CTTTTAATGGTTGTTCATCATAGGAACTTGGTTTGTCTCATTGGTTACTGCAATGAAAAT
GAAAATAAGGCACTAGTGTATGAATATATGGTCAATGGAAACCTTAAACAACATCTATCA
GGTATGTATGTAAGATATTGTGGTATACTTTTGCAGCTATAAACTAGGAGTCATTATTTG
ATGACCCTATAATATAAATCCATATTTTCTTGTAAGAATAAACTATGCATCTCCTTCACT
ATCACGTCTTGTTTGCAGAGACAGATTCAAATATGCTGAGCTGGAATGACAGACTTCAAA
TTGCTGTAGATGCAGCCCATGGTTTGCAGCAGATTTTCTTTTGTTTATTTTGTAGTCTTT
GAATAATTACAATAAGTTAACTAGTGGCTAACTGGACTTGCAGGATTGGATTATCTACAT
AATGGCTGCAAACCACCTATAATCCACAGAGATTTGAAGCCTTCTAACATCTTATTAAAT
GAGAACATGCAAGCAAAATTAGCTGATTTTGGGCTGTCAAGAGTTGTCATCGAGGGAAGT
CACTCTCAGTCCACAACTTACCCTGCTGGTACACCTGGATATCTAGATCCTGAGTAAGTA
CTAAGTTATGTTGTTGAAGTTATTGAGAATATATGTTTAAATAGCTGTATGAGAGCTCAC
TCATAATCAGCTAGATTTCCTTCGTACCTTGCTAACTTACAGGTGTGAGCTGATAATTTT
ATTCTGTCTTCATTGGAAATGCAACTCTGGAAACAAGTTGCCAACCTGTCCCACTACTTA
AATGTGGAAAAAGAGAGTGAAATCATATTACTCCAATATGAAGTTCTACTATATCAGCTA
TAAATTTTATGGCTTAACTTCCACCAAGTATAATTCTGAATGGTTCGTGCTTTAGCACTA
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ACCACTGCTGCCTGGAAAATTGTGGACATAGCCATGTCATGTGTACTCACAACTGCAGTG
CAAAGACCGGACATAAATCATGTGCTGGCAGAACTTAAGGAATGTTTGGCTGTAGAGATG
GCTTCAAGCAACAGGACAGGGTCAAACTTTTTACTTGAAGAGAATTTCCAGGATCCTGTG
ATGGATTTGGCTCCCAGTACAAGGTAACAACTGAACAATATACTACATGGCTGGATGTAG
CTTCCGTCATATATGTTAAAGCTAAGAACTTCTGGAAACTTTGTTGGGTGTGA