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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI004089 | Chr6 | 30206637 | 30207531 | + | Non-functional pseudokinase ZED1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI004089.m1 | 96 | 258 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.2 | 2.00E-16 |
| LITCHI004089.m1 | 96 | 280 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 59.9 | 2.70E-16 |
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>LITCHI004089.m1 ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
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>LITCHI004089.m1 MNPFRVRKNREKLDKKTFMLKNGEILLEKLITTFHGKCNPICNFSSKELQLATNNYDTMN VMTDSGCYTFYKGFLNDRQISVMMYHKFRIGNNDWQCEASIKNIVFTSQMCYKHILKLIG CCLDTRTPILVFESMVKCGTLKDHIYSRHISTPSRIFNMETEITMEIANAFAYLHVGFTR PIVYAGISLSTVLLDEHYVPKLVDFAFAECIPEGKTEIEEATIRGIGDSVAPEHISKRVL HEKCDVYGFGILLVKVLAGQSFGDFFSGDTEDEDWRSNVSTKTREESMKLGGPLF.
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>LITCHI004089.m1 ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
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>LITCHI030392.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATTTTTATTATTATAAATCCATTCTATAGTAAGTCACCATCTTTTTTGTTACAGAGATT TATCATACAACCGGTTGACAGGGCCATTACCAGAATTTTTGGCACAACTTCCAAATTTGA AAGTTCTGTAAGTAGTTGGCCTTTTAGTTTGAATTGCAATTACAAGTTTATATTTGTGAA TTTGTATATTTTTGCCATGTTAGACCACATTTTGCCAGTCCTGTTGTAAGTTATCATCCC TTTTTGTTACAGAAATTTATCATACAATGACTTGACAGGGCCATTACCAGAATTTTTGGC ACTTCTACCTAATTTGGAAATCCTGAAAGTAGTTGGCCTTCGATTTTCACATTGCAAGTT TAAAGTTTCTGTGTATGAACTGAAAATAGTCTATTTTGAATTGCAGTAATTTAACTGGGA ACAAACTCACGGGTGCAATTCCTGATGCTCTTATGGGAAAGTCCAAGGATGGGAAATTGC TGATGAGGTTTTCTAATCTTACTAATGGAAATACTTCACTATAGCTAGCTAGTATAAATC ATTTCGTTGAAAGTAATGGTTCCTCTTTGTGTAAAATATTATAAAAAATAAAATAAAATC TTGTCTTTCAAATTTTGCATCTAATATTTTCTTTTCTCTTTCCTGTAAATGTCCTGACAA ATTTTTATGATGTTTATTTGTTGCAAGTGTGGAAGAAAATCCAGATCTCTGTCTGTCCGC ATGCCATAAAAGGACAAAGAACAAGTTCATTATTCCAGTAATTGTATCCACTTCAGTTGT GCTGGTCATCTTGATCTCTATCACTGTCCTGGCTATCTACAAAAGAAAAAGAAATCAAGG TATTATCATTATTTCTTTTTTTGCTTTACAAATTTATAGTGCAATTCTTAGCAGTTTAAT GAATTTCTACAACAGAGCAAACCCCTAAGCAACATTTGAAAGTAAAACACTGGACACAAA GAAAAGCAGACTGCCTTGGTCTACTCCCCGTAGGGCATGCTGACTGACTACATTGTAGCA ACATCATCATTTACACATTGGATTAGTTAGCAACAGTTAAAAGCCCAGTAGCCAATATAT GATTAAATATTTAATTATATTTTCAAAATAATGTATTTCAGGCATATTCACCTATAGCTA AATGGTTAATGCATTTTCGCTTCATATTTATAAATAAGATTTAAGTCCCACAGTAATCGT AGACATGACCTGACAGTAATCACATATTTTCACTAAGTGGAGGTTTCAAATTTAATTTTG CCGCCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTAATAATAATAAAAAAAAAAAATTAATAAATAAA TATTTGAGTCCCACCATGAGCATTTATTTATGAGGAGTATTTTTCTCTTAATGTGAGAGT AAATATCTCTTATGTTAAGAGAGTAAATTTTAGAGCTGTCTCATAATATTTAATCTTGAT AGATTTTAGTAAACCTCTAATCGTTAGTCATAGATTTCCAATGACATTGTAATTATATAA ATATATAATATAATAATGTAATCCAGTATGACAACACTAATAATTATGTCAAACAGAATA ATTGCCCAATTATTGTCGATACACAAGTAAATTCGATAGCAGATGTGAACTGAACCTTGT GACAGCTCTAAATTGTGAATGTTCAACTCATAGCTTTTGCTGTAAGAAAACAAGGAAAGT TACGAGGTTGAACAACTTATTGTAGTAGCATGCAATGCGGGATTTCACTAAACATATAAA AGCAAATTAGTGAGATACCAAGTTGTAAATTTTATTTACTGTCATCAGATCAATTACTTA TGTGTGCAAAAACTTCATTTGAACGAGGCCGAAAGGTCTTAAGTTGTAATAATCTTGAGG AATAAATTCATTAAAAACTGTAATGCCTAAAAGTCCATTGGAATTATGTAAGATGCCCTA ATTTGATTTGTGCATGTTGTGTTATCAATTTATTATGATAATCTGCCTCAAATTTATTTT TTCAAGAAAAAAAATTGACC
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>LITCHI030392.m1 GenomeSequence + ATGCTCATTGATGTAGAGATGCCTATTAGATCTAAGGAAAGTGCGCTAACAGCAAAGAAC CAGCCGTTTACTTACTCTGAGGTTGTTAGTATCACTGGTAATTTTCAAACCGTCATTGGA GAAGGGGGATTTGGAAAAGTGTACTTTGGCACTCTGAAAGATGGCACTGAGGTTGCTGTT AAGGTGCTTTCTTCACTATCAAGACAAGGTTATAAGGAATTTCAAGCAGAGGTTAGACAA AATAATGCACCCAAAGTTATCAACTGCTTGAAATTTTCATTAATGTTGAAATTATATAAG AAAAACGGTGATATAAATTTTCATCTAGTTGTAACAGTATCATTTTGAATGCAGGCACAA CTTTTAATGGTTGTTCATCATAGGAACTTGGTTTGTCTCATTGGTTACTGCAATGAAAAT GAAAATAAGGCACTAGTGTATGAATATATGGTCAATGGAAACCTTAAACAACATCTATCA GGTATGTATGTAAGATATTGTGGTATACTTTTGCAGCTATAAACTAGGAGTCATTATTTG ATGACCCTATAATATAAATCCATATTTTCTTGTAAGAATAAACTATGCATCTCCTTCACT ATCACGTCTTGTTTGCAGAGACAGATTCAAATATGCTGAGCTGGAATGACAGACTTCAAA TTGCTGTAGATGCAGCCCATGGTTTGCAGCAGATTTTCTTTTGTTTATTTTGTAGTCTTT GAATAATTACAATAAGTTAACTAGTGGCTAACTGGACTTGCAGGATTGGATTATCTACAT AATGGCTGCAAACCACCTATAATCCACAGAGATTTGAAGCCTTCTAACATCTTATTAAAT GAGAACATGCAAGCAAAATTAGCTGATTTTGGGCTGTCAAGAGTTGTCATCGAGGGAAGT CACTCTCAGTCCACAACTTACCCTGCTGGTACACCTGGATATCTAGATCCTGAGTAAGTA CTAAGTTATGTTGTTGAAGTTATTGAGAATATATGTTTAAATAGCTGTATGAGAGCTCAC TCATAATCAGCTAGATTTCCTTCGTACCTTGCTAACTTACAGGTGTGAGCTGATAATTTT ATTCTGTCTTCATTGGAAATGCAACTCTGGAAACAAGTTGCCAACCTGTCCCACTACTTA AATGTGGAAAAAGAGAGTGAAATCATATTACTCCAATATGAAGTTCTACTATATCAGCTA TAAATTTTATGGCTTAACTTCCACCAAGTATAATTCTGAATGGTTCGTGCTTTAGCACTA CTCATTGAAAGTTGATTATTGAGTCTGAACATGATAAAATAAGTAAATTCATATATTAAT GAAATATTGAGAACTGTTGTGTGTAAAGTTTCAATATGGTCCTATCAATTTAATTTTCTG GGTGATTCTATGAGTTAATCATATTTCTGATTACCAAACAGATTTTATGTAGGGGGAATC CCAAACAAGAAAAGTGATGTCTATAGCTTTGGGATTATTTTGTTTGAGCTTATAACTGGC CAACCTGCCCTACACAGAGGTCCAACAAACAAGAGACACATACTTCAACGGGTTGCTCCT GAAATCAAAAGAGGGGATATTCAAAACATTATCGATCCAAGGTTACAAGGTGAATTTAGC ACCACTGCTGCCTGGAAAATTGTGGACATAGCCATGTCATGTGTACTCACAACTGCAGTG CAAAGACCGGACATAAATCATGTGCTGGCAGAACTTAAGGAATGTTTGGCTGTAGAGATG GCTTCAAGCAACAGGACAGGGTCAAACTTTTTACTTGAAGAGAATTTCCAGGATCCTGTG ATGGATTTGGCTCCCAGTACAAGGTAACAACTGAACAATATACTACATGGCTGGATGTAG CTTCCGTCATATATGTTAAAGCTAAGAACTTCTGGAAACTTTGTTGGGTGTGA
