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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI004089 | Chr6 | 30206637 | 30207531 | + | Non-functional pseudokinase ZED1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI004089.m1 | 96 | 258 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.2 | 2.00E-16 |
| LITCHI004089.m1 | 96 | 280 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 59.9 | 2.70E-16 |
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>LITCHI004089.m1 ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
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>LITCHI015034.m1 MKRAREDDDKEDVEVASQSKKAGGSGGSETAAFAYLMSVKVKVSSSLYTKFLVLLRDFRT CRINVDFVRLQVKKLFAGYEDLILGFNVFLPEPYKISLDEEDEEEETNTDPEIEEEDENL DSGKFEEALGFVNKVKLRFGKGDQHVYKAFLDLLRAPSLEKKKVFNFEDYSKAAQLLGDH PDLLQDFDRLIGPAWKASDGSNHQSITVEDPDREVKTKLLKQGLNLCDKVEQVLSASNYR EFLRKLYDYSSGKITRDDLKAAVTDILGSDGNIDGNLVEEFTSFINAPEEHLSKLWKFEE KNKEQKQIKSVYQLDLSKCKRISPSYWLLPKAYRISSSTQISKKDQVLNDKFVCLSVRGG NYSFKHRRIQEGEEILFRCEDDRYEMDMLMEYIRSAIEKVRKLLSAIEENKVNLEIGMTI EDHLSIFNRRCVEKLYGEYGLEMMDVMQQKPTKALPVILKRLEQKQEELTKFRDNFNKLC AHIYAINFSKKSSRECSVEEHDHMMQQTVNEQALALQGAVAGEL.
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>LITCHI024576.m1 GATTGGTATATGCTTCCCTATATAACCACTTTAGCTTCGAAACAAGCTTTTCTCAAAGAT TCAAAACAAATCTAGGAACCAACAAAAAGGCAGCTAAGCAGTATAGCCAGTTGGATAGTG GAGATCAACAGGAGCAATACATAGAGTATGATCTCATCAGACGCCACTAGTTCTTGCTTT CCCAATGTGTCACAAGGTCTGAGAATGTATCCTGCGGCTGAAAATTTTGTTTCATCTTCT GTGGAAGGTAGTGGGGGGCCAGAAAACCACTCAAATTCTCTTCTCTACACTCTTTCTTTG TTAAAAGAGAAGGTCCATCAGGTTCAAGGATTGGTTGGCATACTAATCTCCCCAGATCAA AACCAGCAGCCCGAGTCAACGTCCATGGCCGTGGCTAACATGGGCTCTTTAGTTCAAGAA ATAATCGTGGCCGCTTCTACGATGTTGCTCACTTGCCAGCAAACGAATCATGGTGCCACT ACTGTTTCAGGTAACAACAATAATATTTCCAATGAGATAGCGCCTCAACAACATGTTAAA GTTCGAGCAACCGATGGCTTGTCCACGTCTCATCAAACACATTTTGATGGTAGCATTGGA CAAGAAAGAGCGCAAGGTTTCTATTCTGGTGAGACTTTTGAGAATTGGTATGGTGAGAAT TACTTCAATTGTAACACTAACGTTGATCATAATCGCGTTGGCATGACTATTAGCAATGCA ATCAGGGTTGATAGGAGTGAATTATCTCAAAGGGTTGTTGAGATAAAGGAAGGATCATCG AAAGGGGCTGGTACTTCTTCAAAGAATCATGATGATATAATCGAATTGGATGCCGCGAAT TTGTTAGCTAAGTACACGCATTATTGTCAAGTTTGTGGTAAAGGATTCAAGAGAGATGCG AATTTAAGAATGCACATGAGAGCTCATGGTGATGAATACAAGAGTAGTGCTGCCTTGGCA AATCCATTGAAGAAGATCAATGGAAACGCAACGGGGAACGAGGCTGCAATGAAGTTTCCA AGGAAATATTCATGTCCACAAGAGGGTTGTAGGTGGAACCAGAAACACGCCAAGTTCCAG CCATTGAAGTCCATGATTTGCGTGAAGAATCATTACAAAAGAAGCCATTGCCCGAAGATG TACGTGTGCAAGCGTTGCAACAGGAAGCAGTTCTCGGTGCTGTCTGATCTACGGACACAT GAGAAGCACTGTGGGGATCTCAAGTGGCAATGTTCTTGTGGTACCACATTTTCTCGGAAA GATAAGCTTATGGGGCATGTTGCTTTGTTCGTTGGACACACGCCGGTCACTACTAATTCA ATATTGAAGCCAGCTAAAGTGGAGATCAACCATGTAGCACAAGTGCAATTAGATGATAGG GGATGAAGCAATTTGGATTACTACTGTGCATGGCTTCTGAATCTCTGCGAGAATCCGGTT TGTTTTTCTGTGACACACATACGACTCTTGAAATTACATATACATATTAACAGTCGTTCC TTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTTATTTATCTGCTATTGTATGCTCATGCATGAC AAACATTAATGTTGTTAGAATGTTAAACCTCTGTAAAGAATGTTTAATGAAGTACAATAA TAAATATGTAACTACAAATGCGAAATAAATGCTATGTATAATTACGACGGACGTTTGTGG AAGCATATATACAGCTTTAACTACATCTTAC
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>LITCHI005477.m2 - Up_Stream_Len 2000 CAAGATTCAGTTGTTGGGTAGTTTTCATATTAAGATGGAGTATCTCAGCTGTACAAATGT ATAGCTTTGCTGGAGATCCCACATAAACAATTTCCGACATCAGTTGGACTTTTAATTAAA TGTATAAATACATGGGAGTGTCATGTACATCGTAGAACGAATAAGCAGTGACTTTGCTCG CAGGAATTGGATCCATTTAATCGTCGTAATAAATCTTATTTACATTTTTTGAAATATTTC TCTAGGCAGCTGGCTCAAATTTCTATTGAAGGAGAATAATTTCACTATATATGCTTTTCG TTATGAAGGATATTACTCACAAATGAGAGGTTTTAGCTAACTATTCTATGGAAGATAAAA TTGAGACTAATTTAATGATATATCGGTTATGTTACATTCATATAACTGAAATCGTCTATT TCTCCAACTTCTATGTTCGTATCAGTTTAAAAGAGACATACTGACATCCAGAATTCAATA ACCCCGATCAGGTAACGTACACACCTACATATATGGAAACATGAATAAGTAGCAAGATAA ATATACCTCTAGTATGAACTGATAATGTCATAATGACTCTTTGTGAACCACTAGTACAAA AACTTACAAAAATTGAGGTTTGGAAGGATGAATATGATAGCAACAAGATTTGATAGAATG GAGAAGTTGGAATTTATATTCCAAAAAATCATTGTTTTTACAAAGATAGATACAAATAAG AGGTTTGGAAGGATGAATATGACTGTAACTCTTTGCGAATCTTTTTTTTTTTTTTGTATG TTTCAAAATTAAATCCAATAGGTTTGGAAGGATGAATGTGACTGTAACTCTTTGTGAATC ATTGTATTTTTTGTATGTTTCAAAATTAAATCTAATAAAATAATTTTTTTTTTTTAAAAA GAACTATCTATCAAGATTGATCACTCATAGTACGATCCAAATGATTATTTTCACAACTCA TACTTTGTGTTTTAATAAAATAAATGTTAAACTTGAACTTTTAATCTCAAATAATTAATC CCACAACCCACACTTTGTATTTTAAGGATGAGATTCAAACTCTTAACCTCTTTAGATCAA AGGATACCCAATCATTCCTACGAATAGATGGTGTGTTAATAAAACAACTTTTGAAACCTT ATTTATAATGTTAAAAATAATGGAAGATAAGATTAGTAATTAAATAAAATAAAATTAATT AAAAAATAGTTTTTAACATGGTTTACTAATTTGAATATCACTTCTTAATAAAAGTGGTAG GACACTTATCAACTCATCAAAGTATGGGAGGTTAATTTCCACTTAACATATTTTAAAATT TCAATGGATAATTTTTTTTCTTTTACCTTATTTTAAAAGTAGTTGTCTTCTTTTGAGGGA GTTGATATCAGCTTCTTAATAAATAAGCATAGTTTACTAACCTGAAAATTGCTAGAAGGA ACTTCTTCCATTACTCATTTAGCTACATTTATAAGATTATAGATTTCACTAGATATGAAA AAGAAAAAAAACAAAAAAACAAATGTAACTTTCACCTTGTCTCTTCACTTGTAAATGATT AAATTTAAACAATGGTTAGATTTATTCTCACAAATAAGTAATAATAGTATTTCAAAATAA TAATAATAAGTAGCAATAGGATAGGTGTGCGAAATTTTTTTTTTTTCTTTCCCAATAAAA AATTTGTCGAAAAACAAATTTCAGTGTAATTTTGTGCAATTCATTCATGGGAGAAAACAA ATTTAAATAATACCGAACAAGCCCGGCCCAGCCCATCCAAGCCCAATGTATGTAAACGTG CCTCGTATGGCTCATAGTTGTCATCGATCCTTCTGAGTGCTTTGCCTCCACAAAAAATAC CTTAAATAGCGATCAAATACAAAATGAAAATTTAAAATAATAAAATTAAAACAGAAACAG AGACTAGTGGTCCAAATTGGAAGAAGATTGATTCAAGTAAAGGAGACTGTGGCAGTGCCC CCACAAGCTGGAAGCAGACC >LITCHI005477.m3 - 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>LITCHI005477.m2 GenomeSequence - AAAACAGAAACAGAGACTAGTGGTCCAAATTGGAAGAAGATTGATTCAAGTAAAGGAGAC TGTGGCAGTGCCCCCACAAGCTGGAAGCAGACCATGCTCTGCACAAACATGGCCACTGTG GCACCAGGAGGTGCTACTTTAAGACTTATCATCAGTCCCCAAAACCTGAAGACAAAGTCT CCATCATCGTCTCCATTTCTTGGCAAGAAGCTAAAACCATTCAAAACCTCTTCGAGAAAC ACCACCACCGTCACGAAGTTCACAGCAAAAGCTGAGCTGGTTGATGCAGTTCGTGATCTT TTTGTGGGAGTGGGAGTGGGGTTACCATGCACAGTCATGGAGTGTGGTGACATCATATAC AGAAGCACATTGCCCAAGTCCAATGGCCTGACTCTTACTGCACCTGGTGTTGCTTTGGCT CTTGGTGCTCTTTCTTACCTCTGGGCCACCCCTGGTGTGGCTCCTGGCTTTTTTGACATG TTTGTGCTTGCTTTTCTTGACAGGCTGTTTAGAACCACTTATAGGAGGGTCAGTGGTTTG ATTTTTATTTTTTCTGCCTTGATCTTTTTTTCCTGTTTTTGTTTGATTTTGTGTTCTTTT CTTTTTCCTGTTTTTGTTTATAATTAATTATGTGTATTAATAGTTTTGGTTATTGGTTGC AGGATGATTTTGTATTGGGGAAGAAGCTGGGTGAGGGAGCTTTTGGTGTGGTTTATAGGG CTTCCTTGGCTAAGAACCCTTCTTCCAAGGTATCAAATGCGTTCATTTCTGCTTAATTGT TTTCTCTGTTACCAGTTCCCTTGAGTTGGAATCGTAAACTATATATATATATATATATAT ATATATATATATACTGTTTGAATTTTCATAGTTTGCAAATCATTAATTTTGCTAGGGAGT 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