Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI004089Chr63020663730207531+Non-functional pseudokinase ZED1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI004089.m196258PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain60.22.00E-16
LITCHI004089.m196280PF00069.28PkinaseDomain59.92.70E-16
Download   Copy
>LITCHI004089.m1
ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG
AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC
ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT
GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC
TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT
ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA
TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT
CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG
ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA
CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA
AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG
GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC
CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG
AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG
ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
Download   Copy
>LITCHI004089.m1
MNPFRVRKNREKLDKKTFMLKNGEILLEKLITTFHGKCNPICNFSSKELQLATNNYDTMN
VMTDSGCYTFYKGFLNDRQISVMMYHKFRIGNNDWQCEASIKNIVFTSQMCYKHILKLIG
CCLDTRTPILVFESMVKCGTLKDHIYSRHISTPSRIFNMETEITMEIANAFAYLHVGFTR
PIVYAGISLSTVLLDEHYVPKLVDFAFAECIPEGKTEIEEATIRGIGDSVAPEHISKRVL
HEKCDVYGFGILLVKVLAGQSFGDFFSGDTEDEDWRSNVSTKTREESMKLGGPLF.
Download   Copy
>LITCHI004089.m1
ATGAATCCTTTTCGGGTAAGGAAGAATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAGACATTCATGCTG
AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTAATTACTACTTTCCACGGTAAATGCAATCCC
ATTTGCAATTTTTCTTCTAAAGAGCTCCAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT
GTTATGACGGATAGTGGTTGTTATACATTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAAATC
TCTGTTATGATGTACCATAAATTTCGTATTGGTAATAATGATTGGCAATGTGAGGCGAGT
ATAAAAAACATTGTATTCACATCTCAAATGTGTTACAAACATATTTTGAAGTTGATCGGA
TGTTGTTTGGATACTCGAACTCCTATTTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGTGTGGAACT
CTCAAGGACCATATTTATAGTCGTCATATATCAACCCCGTCTCGAATCTTTAACATGGAG
ACAGAGATTACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGA
CCTATTGTTTATGCTGGTATCAGTCTATCAACAGTCTTGTTGGATGAACATTACGTTCCA
AAACTAGTTGATTTTGCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATAGAAGAG
GCAACCATTAGAGGAATAGGAGACTCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAAGAGTTCTC
CATGAGAAGTGCGATGTTTATGGTTTTGGTATATTGCTAGTCAAGGTTTTGGCTGGACAG
AGCTTCGGTGATTTTTTCAGCGGTGATACAGAGGACGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCG
ACTAAAACTAGGGAAGAGAGCATGAAACTTGGCGGTCCATTGTTTTGA
Download   Copy
>LITCHI015034.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ACCAACTCTCACAAACCTTAAAAAACATCACACAGCTTGAAATAACCAAAAATTACAGCC
AAAAAGGTACCGGAACCTGCAGAATTAATTAACATTTAAGCTTCATAAACACTGTCCATT
TTTCATACCTTAAAGCACACAGAAATTAATGTGAAAAACAAAGGACACAGAAATTCATGA
ACAACAATTAGAATGTCAATTTTACACAAGCAAAAGGTCTCACTTAAGCCTCATGGTCCA
CCCAACAAACTCTACTAGCATATACTGGAGAGGGAGAGACAGAGATGAAGAGAAGAAGGA
TATAGACCTGCATGTCTCTTGACAATGGAGACTTATAATGGATGGCTCTTCAATAGACAG
CATTGGCTTCACAAACCCGCAAATACAGTACAAAAGAAGAATTCTCTTCTCAGGAAACTG
TATGCTCCTTGTGTGTCTCTGTGTAGTGATCACAACTTTCAAAATGTGTGAACAGTGGCA
GACCAGAGGTTGATATTAGATGGTGCACTTTAAATATAAAAAGTAATATTAAAAATAACT
AAAATTTTAGTAGTAAAATATGAAATTTTTATTTTGTTTAATTTCTAGTTATTTCTAACA
ATCCAAAATAACTAAAAATAAAAATAAAAGAAAGAGGATTTAGTTATTGATTTGTAATTA
AATTATAACCATTAGCTATCAAGTTACATTTTTACCAATTGATAATTCAAATAAAAGAAA
GATACTTAATTATTGATTTGTGATTACATTATAATCATTAGCAATCAAATTATGTAAATT
TTTCATTCAAATTGTAAATGAAGTTTTTGCATGAAATTGAATTGGAGTTTATACGTAACA
AATTAAAATTTAAAATTTTAGGATTTATTGATTTGATTTTCAAATCAAGTTAGAGATATC
AATATTTAAAATGTGTGATAAGATATTATTATTTCGATAAAAATTATGAATACATTTACA
TTTATTTTTTATGATATATATGATTGTTATAATAGAGATATACTAAATGACAGATAAATT
ATGAACAAAAATTAAAGAAAATGTTAGAAATTAAATATTAATAAAGATAAGGATTCAAAA
AATAAAAATAAAAAAGAATAATGTTAGGTCAGAAAAATATGTCCTGAATTTAGGAACATA
GATCCCGAATTCGGGAAAATAATTAACTACTAAAAAATCCATTGCATCTCAATTAAATTT
AATAAAATTACTAAAATACCATTAAATTAAATTAATGTAAAAAAGCTTTAGAATTCCATC
GCCTACTAGATAAAAGGTGGATATATTTCTTTTAATAATATTTTAAAAAATAATGAAAAA
AGTGGATCTTCTTATTCTAAAACGGATGGTTAAAATTAAAAAAATATTAAAAAATTTAAT
TACATAGTTTTGATTTTAATTTTGTGTCAAGATGATCAAGTTGCCTCTCCATCAATTAGT
TTTGACAGTAAACTATATTAAACTTTAATGTATGATGCTTATTTATCAATACATTGAAAA
AGTCAATTTGGATTCAATTCATTTGTTATTTAACAGTAAAATGTAGAAACTACATAGAAC
TATGGAATTAAAGGAAATTGCATAAATATTTACATGTGTACGCTTGAATCCTAATTAACA
TAATATTCTAATAATTCTTTAACTTATTATAAGGTATTAAAATTACAAATTTAATCTTTC
AAAAGAAAAAATACAAATTTAAATTAATAGAGTCAGATAGCAGTAATTATTCAAATATAG
TACATTATTTTCAAATATGGAAAAATAATCATCTAAAGTGATATGATCATATTTCAAAGA
TATTGTAATGAATGTGAATCAAATAAATTTACAATTATTATAAAATAAGTAACCATTTGA
TTTTTTGGGATTCAGAATCCCAATCCAAATCACACAAGGATACATAATCATTCTTGGAGT
CTGTTTTTCGAAAGTACAAAAAATCTCCCATCTGCTCTGAAATATTTTTCACTTGGTTTC
CTGAGAAAAAACCAATTTCA
Download   Copy
>LITCHI015034.m1 GenomeSequence + 
AATTATTCAAATATAGTACATTATTTTCAAATATGGAAAAATAATCATCTAAAGTGATAT
GATCATATTTCAAAGATATTGTAATGAATGTGAATCAAATAAATTTACAATTATTATAAA
ATAAGTAACCATTTGATTTTTTGGGATTCAGAATCCCAATCCAAATCACACAAGGATACA
TAATCATTCTTGGAGTCTGTTTTTCGAAAGTACAAAAAATCTCCCATCTGCTCTGAAATA
TTTTTCACTTGGTTTCCTGAGAAAAAACCAATTTCAATGAAGAGGGCTAGAGAAGATGAT
GACAAGGAGGACGTTGAGGTAGCATCACAATCAAAGAAAGCTGGTGGTAGCGGGGGGTCG
GAGACAGCGGCATTCGCTTATCTGATGTCTGTCAAAGTTAAAGTCTCGAGTAGCTTGTAC
ACCAAGTTTCTGGTTCTTTTGCGGGATTTCAGGACCTGTAGAATCAACGTGGACTTTGTT
AGGCTTCAGGTAAAGAAGTTATTTGCAGGGTATGAAGATTTGATACTTGGGTTCAACGTG
TTTTTGCCGGAGCCTTACAAGATCTCATTGGATGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGACAAAT
ACAGATCCAGAAATAGAGGAGGAAGATGAGAACTTGGATTCAGGTAAATTCGAAGAAGCT
CTTGGTTTTGTTAACAAGGTAAAGTTGCGGTTTGGAAAGGGTGATCAGCATGTTTACAAG
GCTTTCCTAGATCTTCTTCGGGCTCCGAGTCTTGAGAAGAAGAAGGTCTTCAACTTTGAA
GATTACTCTAAGGCTGCTCAACTTCTTGGTGATCATCCTGATTTGTTGCAGGACTTTGAT
AGATTGATTGGTCCTGCCTGGAAAGCTTCTGATGGCAGTAATCATCAAAGTATTACTGTT
GAGGATCCTGATAGAGAGGTCAAAACCAAGCTTTTGAAACAAGGATTGAATTTATGTGAT
AAGGTTGAACAAGTGCTCTCCGCTTCAAACTATCGCGAATTCTTAAGAAAACTATATGAT
TACAGCAGTGGAAAGATTACAAGAGATGATTTGAAAGCTGCTGTTACTGATATTCTGGGG
TCTGATGGAAATATCGATGGAAATCTTGTTGAGGAGTTCACTAGTTTCATCAATGCCCCT
GAAGAACATTTATCCAAGTTGTGGAAGTTTGAAGAGAAAAACAAGGAGCAAAAACAGATA
AAATCTGTTTACCAACTTGATCTTTCTAAATGCAAAAGAATCAGCCCCAGCTACTGGCTT
TTGCCGAAAGCCTATCGCATCTCTTCGAGCACACAGATATCAAAGAAAGATCAAGTTTTG
AATGATAAGTTTGTCTGTTTGAGTGTGAGAGGCGGAAACTATTCGTTCAAGCATAGGCGG
ATACAAGAAGGCGAAGAAATCCTATTCAGATGCGAGGATGATAGGTATGAGATGGATATG
TTAATGGAATATATAAGATCAGCAATTGAGAAAGTGAGGAAACTATTGAGTGCCATTGAA
GAAAATAAAGTCAATCTGGAAATTGGAATGACGATTGAAGATCATCTGAGTATTTTCAAT
AGAAGATGCGTAGAGAAGTTGTATGGGGAATACGGGCTTGAAATGATGGATGTGATGCAG
CAGAAACCAACTAAAGCTTTGCCTGTGATATTGAAGAGGCTGGAGCAGAAGCAAGAAGAG
CTTACAAAGTTTCGAGACAATTTCAACAAGCTTTGTGCTCATATTTATGCTATAAACTTT
TCGAAAAAGTCAAGCAGGGAATGTTCTGTAGAGGAACACGATCATATGATGCAACAAACT
GTCAATGAACAAGCACTAGCATTGCAAGGAGCAGTGGCTGGTGAATTATAAACTTAGAAA
GGTCATTTAGCATTGTATTGGGTCGAGGTAAATATTATCTCATAGTTTGTGTCAGGTATA
GAGGCAATCAAATTATTTGCAGTAATTTAGTGTAGGTTTATCTTGTTTTCATCAAAGCCA
CTAATATTCGTCCATCTTCAATGGAATTTGTTCTTCTTTTTGTTCTTTTGGTGTAATTGT
ACTTGTGTAGTTGCAACTTTCAATTCCGCTTAAAAGCAAAAACCTGCCAACAGTACCTAA
CAAACCATCACTGCAACCCTTAAAATGGAATGATCTGAATTTAATCATTCTTCCAATGAT
GTAATGCAATTCCACTTGCCCTTAAAATGAAATAATCAGAATTTAATCATTCTTCTAAAG
ATGTAAGTCTCAGCTATACTCAAACCACATTATTTATATGTCAGAAGCTCATATACAGAA
CTTAACATTACAAGTTCTTATATGTTAAACGCCCAATTGTTGTCATTTACCAAAGAAGAA
AGAAAAGAGTAAAAAATATTAAAGTTTATAAAGAGAAAGAAACTCATTAATGTGATTGAC
TCTTATATAGAAAGTAATAATATTGGCAACTTATATTAGAAGGGAAAG