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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004085 | Chr6 | 30165998 | 30179895 | + | Non-functional pseudokinase ZED1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004085.m1 | 237 | 471 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 74.9 | 7.20E-21 |
LITCHI004085.m1 | 288 | 472 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.4 | 2.90E-15 |
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>LITCHI004085.m1 ATGAGTTCTTGTTTAAGAATATTAAGCAGGCACGGAAAGAAACCAGAGAAGGAAGCATTT ATGATGAAGAATGGAGCAATTCTACTCGAGGAATTGATTACTTATTCCAATGTTATTCCA GAAGGTGAAACTCATGTAAACAATGGAATAGTAAGAGGAACAACGGGATATGTCGCACTT GAGTATGTGATGACTGGCGATTTCAACGAAAAATGTGATGTTTTCTGTTTCGGTGTATTG CTACTTCAGCTTTTATCTGGAAAAGAATATGGTGAGAAAGTTTTATGCCAATGCGTGAAC AATACCGGTGAAAATTATAGGTTTGATGAAATAATAGATCCCATAATTGTTGGAGATGGA CTATGTCCTGAGAAAGAGTATCAATTAAAAGCTTTTTCAGATCTTGCTTTCAAATGTATC TCTGAATCAGCTGAAGACAGGCCAACTATGATCATGAGTTCTTGTTTGGGAATATTAAGC AAGCATGGAAAGAAAGCAGAGAAGAAAGCATTTATGATGAAGAATGGAGCAATTCTACTT GAGGAGTTGATTACTTATTCCAATGGTAGATACAATCCTATTCGTATTTTCTCTGCTAAT GAATTGAATAAAGCAACAAACAACTATAGCCCACTTAATATCATAAAGAATGATTCATAC TATATATTATACAAGGGTTATCTACATGAGCGTTCAATCTCCGTTATGAAGTTTGAAAAG GAGCGAGATACAAAACAATTTTGTTACAATAATATTGTATTTGCAGCACAGATGAATCAT AAAAATATTGTGAAGTTAATCGGATGTTGTTTAGAAACTCAAATTCCAATTTTAGTTTTT GAATTAGTTGAGTGTAAGACTATGGGGCCGATTGCAGTGGAGATAGCCAATGCAGTTGCA TATCTTCATGTTGGATTCACTAGGCCCATTGTCTCTAAAAGCATCAAATTATCAAACATT TTATTTGATGAAGAATACGTTGCCAAACTATTTGATTTTACGCTATTTGAGGTTATCCCA GAAGGTGAAACTCACGTAAGCAATGGAAAAGTAATAGCAACAATGGGATTTGTCGCACCT GAGTGTATGAGGACTGCTGATTTCAATGAAAAAAGTGATGTTTTTAGTTTTGGTCTATTG CTACTTCAGCTTTTATTTGGAGAAGAATATGGTCAAAAACTTTTATGCCAATGCGTGAAG TATACAGGTGAAAGTGATAGGTCTGATGAAATAATAGATCCCATAATTGTTGGAGATGAA CTATGTCGGTTTGATGAAATAATAGATCCCATAATTGTTGGAGATGGACTATGTCCTGAG AAAGAGTATCAATTAAAAGCTTTTTCAGATCTTGCTTTCAAATGTATCTCTGAATCAGCT GAAGACAGGCCAACTATGGTTGACGTGGCCAAGCAACTCAGACAAATGGATCTATTAAAT CCTGAAAAAGAGTATCAATTAAAAGCTTTTGCTGATCTTGCTTTCACATGTGTCTCCCAA TTAGGTGAAGACAGGCCAACTATGAAGTATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAAACATTCATG CTGAAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTTATTACTACTTTCGACGGTAAACGCAAT CCCATTCGCAATTTTTCTTCTGAAGAGCTCAAGCTAGCAACAAACAATTATGACAAGATG AATGTTCTGATGGATAATAGATGTTATATACTTTATAAAGGTTTTCTAAATGATCGTCAA ATCTCTGTTATGAAGCATAAATTTCTTTTTGGTAATAATGATTGGAAATGTGAGGCGAGT ATAAATAACATTGTATTCACATCTCAAATGCGTCACAAATATATTTTGAAGTTGATTGGA TGTTGTTTGGATACTTGA
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>LITCHI002298.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATATTAAACTGGTGTGAATAATCAATGCAACCAATAAATTTTAATTTTTCAATATTATT TATTTATTTTTTTAATACATTTACTGACTAATTGGTCTATTTGCTTTGAACATTTATAAA TTAGGTAGATTTTGAAAGATATCTTAAAGTCTAGTCAAATTTGAAAAATAACTCTATATT TCTGTTACCCTTCAATTTAAACATTTTAAGATTGTCAATCAAATCTCATGGTCAAACTTT TTTTTTTATTTGTCCAAATTTTCTCTATAAATTATATTAACATGTGTCAAATTAGGTTTT ATTTAATGATATATCAAATGAATAAATATTTATTTATCATTTTTTTATTAATAAAAATCA TTTTCAAAATAAGCTCTTCTTGACCTATCTTACCTTACTGGTACACAATATCTTTATAAG TCAGATTGAGTAATAAAATGTTATTCTTCTTCTTCTTCAAAAAAAGGTAATAAATATTTA AACCTTAAATGGGATGTTTGACCAACAAATTCATTATCAAATCTAAAAGAAAAATAAAAT ATGCACAACATTTCACCAATATTCTAGAACAAATTGCACGCCAACTTTGGACTTATTTAG GGATGTATTTATTAGTAGAAAATTTGATTTATAGTTACCATATTTATTAAAAACTCTTAA AAATTATATTTCATGGCTTTACACATAAATCAAACTACCCTTTATCTAATATAAATGTGG GTTTACTATCCTGATTCCCATTTTCAAAAAGAATTTAGTTCATTATTTAAATATGAGTTC CATATAATTTGATTTCTATGTATTTAGTAAACATTAGACTTACAAATCAGGAATTAAGTT ACTTTTCTTTTCTAAGAATGTCTTAGTTAGTAAACATGCCCTTGATTCTCTCAAAATTTA GTAAACATTTTCAAAATTAATTATCTTTCTGAGCGTATTCACATCCGATCCTAACAGATT CCGTTAAATATTTGAGTTCAACTCAATTTATACATACATTTTTTAATGAAACAAAGTTAA ATATGTTAGTTTTGGTTTTAGAAATATTTTTATAAAGAGAAAAAATGTGAATGAGGGTGC ATATGTTGAAAGTTGAAAATGTAGAAGGCGGCCTTTTAACATACATATTTCAATGTGATG CTTGTGTTTTACTGTAACAAAAATGTTATGTAAATGGTTGTAATGTGTTGTAAGGTATCT AAACTCATCACCTACCACTGATAACTCCATCTCTTCTTCTTCCTCTTATTCCCATCCCCA CCACCCAAAAATAATTATATATATATAAATATAACTCAGCACCAACTACTACTACTTCAA TTCCAACCCCCTTTTGTTTTTTTTTGGTAAGGCTCACATTCCCATGTCCACAATCTCTTC TTTAATAAAAGTTGAAGCCTTTTCTGGTCATAGGCTTTATAAGGAGGAGGAGGGTCATCA CTGGTGGTGGTGGTGTGTTTGCCAGTATAGATTTGGACTTGCATTTGGTTCTTCAGTCAC ACCCCAGATGCAAGATTGAGTCTTTTTGGCTTTGGCTATATGACGTTGTGAGCTTTTTGG CTTTGGCTATAGAAAGTTGTGACATGGGGTTTTTGTGTGTGAGATCTGGGTTTGGTGGGG TTGGTTTCTTGCGTTGAGGGTCTAAAGATCTGGACTTTGGAGGGTGGTTGTAGTGAATTC CATCTCTTGGAGGTATGTGGTTGAACAATTTGGCTTTGTTTTAATGTTTTATTTGCATAT GTTGTGATCTGTTTGTTTGGAAACTGAAATGCTTGTATAGGGGTTGTTTTCTGCTTCTGT GTTTTGTTAAATTTGTGTTGGAAAAAGGTGAATTTTGATGAAGATTATAGATTTTGAAAC TAGTTCTGATAGTGGTTACTGTGGTAGTTCTGACACTGGTGATGTTGTAATTGATGGCTT AATATATATTGACCTTAGTGAGTGTAATATTCCACATTAATGAATTCAATCCTGTAGGTT GATATTTGAGATAGGAAAGG
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>LITCHI002298.m1 GenomeSequence + ACATTTTCAAAATTAATTATCTTTCTGAGCGTATTCACATCCGATCCTAACAGATTCCGT TAAATATTTGAGTTCAACTCAATTTATACATACATTTTTTAATGAAACAAAGTTAAATAT GTTAGTTTTGGTTTTAGAAATATTTTTATAAAGAGAAAAAATGTGAATGAGGGTGCATAT GTTGAAAGTTGAAAATGTAGAAGGCGGCCTTTTAACATACATATTTCAATGTGATGCTTG TGTTTTACTGTAACAAAAATGTTATGTAAATGGTTGTAATGTGTTGTAAGGTATCTAAAC TCATCACCTACCACTGATAACTCCATCTCTTCTTCTTCCTCTTATTCCCATCCCCACCAC CCAAAAATAATTATATATATATAAATATAACTCAGCACCAACTACTACTACTTCAATTCC AACCCCCTTTTGTTTTTTTTTGGTAAGGCTCACATTCCCATGTCCACAATCTCTTCTTTA ATAAAAGTTGAAGCCTTTTCTGGTCATAGGCTTTATAAGGAGGAGGAGGGTCATCACTGG TGGTGGTGGTGTGTTTGCCAGTATAGATTTGGACTTGCATTTGGTTCTTCAGTCACACCC CAGATGCAAGATTGAGTCTTTTTGGCTTTGGCTATATGACGTTGTGAGCTTTTTGGCTTT GGCTATAGAAAGTTGTGACATGGGGTTTTTGTGTGTGAGATCTGGGTTTGGTGGGGTTGG TTTCTTGCGTTGAGGGTCTAAAGATCTGGACTTTGGAGGGTGGTTGTAGTGAATTCCATC TCTTGGAGGTATGTGGTTGAACAATTTGGCTTTGTTTTAATGTTTTATTTGCATATGTTG TGATCTGTTTGTTTGGAAACTGAAATGCTTGTATAGGGGTTGTTTTCTGCTTCTGTGTTT TGTTAAATTTGTGTTGGAAAAAGGTGAATTTTGATGAAGATTATAGATTTTGAAACTAGT TCTGATAGTGGTTACTGTGGTAGTTCTGACACTGGTGATGTTGTAATTGATGGCTTAATA TATATTGACCTTAGTGAGTGTAATATTCCACATTAATGAATTCAATCCTGTAGGTTGATA TTTGAGATAGGAAAGGATGGCCAACGATCTTAATGCGGAATTATCGAAGAAAACTGCAAT TTTTGATCTTAAAGTGTGGGAGGTAATCGGAATTTGTGTTGCATTATTCATCATAATCAT CCTGTCTGTATTGTCGTTTTGCTTAACTTCACGCAAGAAGTCGAAGAGAGCTACGAACAA GCTTCCCGTTACTCAAATTCCGACTGTTTCGAAGGAAATTAAGGAGGTTAGAGTAGACCA AGTATCGACGAATGAATTTGTTCCTCGTGATGGTATTCTTCTAACCATTCATGATAAATC TAGTGATAAAGACTCGGATAAGGTTTTGGTTCATCTGGGTATGGGGAAAGTGAAGAATGG GGATAATAGTAGTCAGTCAGGTTCATTTCATCATTATGAGAAAGATGGAGGGTCTATATC AGGTGAAGAAGGGAGTTCAGGCACTGTAGCTGTGTATAAGCCTTCTTCTTTGCATCCTAT TACTGCTCCTTCTCCGCTAACTGGTCTGCCTGAGTTTTCTCACTTGGGATGGGGTCACTG GTTTACGTTAAGGGATCTTGAGCTTGCTACAAACAGGTTTTCGAAGGATAATGTCCTAGG TGAGGGTGGATACGGAGTTGTTTATCGGGGACATTTGATCAATGGGACTCCGGTGGCAGT TAAGAAGATTCTCAATAACTTGTGAGTTCATAATGTGTTCTGTCAATTGCATATCTTCAT TAACATGCATTGGTCTTTCCACGCGTTATTCTTTAACTAACTTCTTAAATTCTTCCTCTT AGGGGTCAGGCAGAGAAAGAGTTCAGAGTAGAAGTTGAAGCCATTGGTCATGTTCGCCAC AAGAATTTGGTTCGTCTTCTGGGATACTGCATTGAAGGGATTCATAGGTACCATGTACTT TTACTGTATATTATTATCTGCCTTGAATTATAATCCATGAAAGGATCTATTCTAAGAACT TATTAGCAAACTCTTAAGAGGAGAAATGCAGAGAAAATTTTTATTATGTTTTTTATTTTT AACCATCAAACTTTCTGTTGCGTTTGTTACTGACTGATTATAGATGGAGGGATTGACATT GATATCGACTATATTCACAGGATATTGGTTTATGAATATGTCAACAATGGAAACTTAGAA CAGTGGCTTCATGGAGCAATGCGTCAGCATGGGTACCTTACTTGGGAGGCCCGTATGAAA GTTCTACTTGGCACAGCTAAGGCGTAAGTCAAAACTCACTTCACCTACATCTATTTTAAG CACTCTAGTTCTCATTTAACATGACGTATCTTGTTGCAGTCTTGCCTACTTGCACGAGGC CATTGAGCCAAAAGTTGTTCACCGAGACATTAAATCAAGTAATATATTGATTGATGAGGA CTTCAATGCAAAAGTTTCTGACTTTGGCTTGGCTAAGTTGCTGGGTGCCGGGAAAAGCCA TGTTACGACTCGAGTTATGGGGACCTTCGGGTAAGCATTTTCTCAGATGCAGGACGGAAC TCTATCAATATATATATTTTTCTGTTTCTGCAACCTCTTTTATTTTGTTTGTTCTAAATG CTTAATAAATGTTGCTCGAAATTTTGCAGGTATGTGGCTCCTGAGTACGCAAACACTGGC CTCTTGAATGAAAAGAGCGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTGCTTTTAGAAGCAATAACT GGAAGAGACCCTGTGGACTATGGTCGCCCTGCCCACGAGGTATGTGATAATCATACACAT CATGAAATGCCGAAACTATTGTTTTACAATCATAGGTGTCCTGTAATCGTCACGAGCGTA ATGCAACTTAAGTGCATTATGATAGTTCCATATGCTGTTCAACTATTAGTTGATATAGTG TGATTGGATCTCCATAGAATCCCTTAAGACTTAAGTTTGTTCCAAGCCAATCCTAGACTT AATTAACTTGATATAATGTGATTGGATCTCCATAGTATCTTCAACCCCAACAATTGTTGT TTTATTTGTTATGCACGATATTATATTGCATGTTAGTCCATCTGTTGTCGGTTAGGTAAC CGTGAAGTATCCGAAAGTATACCTTTCTGAGGATTCAAGAATTTGTTATGGAACCACTGT GGTGTCCAATGTCCATGACATAATAAACCTCCACTTGCCTATATGGGACAGTGTCTGATA ATCCTTTATTGTCACTGTGGGAATGGGGCCACCCTAATGCGTCCACAGTTCTGCAGCTAT CAGATGCTACAGAGAAATTTACTTCAATTATTGGATGGTGGTCACCACCATTACTTGAGC CTGGTCCCGTTTAAGAAACTTTACAAAATGACATGTGCAACAAAAATCATAAAACAAAGG AAGTCATTTATAACTGGAAAATGGGTTGAGCCTCTACAAGCACATTGGTTCTGCTCTGAG AAATCTTTCTAAAAGTGACTTATGTAGGGGTAATACTTTAAGTTGCTTCAAAATGTACCT ATAACATCCATCTAGCATATCTTGCTACGAGAGCGCTTAAAAGCAAGTGAGAAGAAAGGG AAAAGGGCATGTGTTTTCTTAATGTATATCTATTGCATGACTGTTCAGAATACATGCGTG TTTCTGTGACTTGATGTGGTGAACGGACATGTGCTATTGGCCTTGAGTACAAAATCTGAA TTAACTGGGGCCCTTTAATATCATTATTTTTCCAAATTTCAAAAACAGCTGCTTATGGGT CCATTATGTTTCCACACTTGTTAAAGTTTGGTATATTCCTGTGTATTATTGAGAAACAAA TGTCAGTTTCATTATTGTTGTCTTACATCATTACATGAAATCTTAATGACTTCATCTAAT AACTTCGATACTTGTTTTATGTATCTGATATCTCCATAAAACTGCTTGTTTTTACGCCAA CAGTTACCTGATTTTTTGAACATGAAATCATGTTGCTTACAGGTAAACCTGGTTGATTGG CTGAAAATGATGGTTGGAAACAGGCGGTCAGAAGAAGTGGTAGACCCAAACATTGAGGTA AGGCCATCAACAAGGGCCCTAAAGCGTGCCCTTTTAACTGCATTGAGATGTGTCGATCCA GACTCTGAGAAGAGACCAAAAATGGGCCAAGTTGTGCGCATGCTTGAGTCCGAGGAGTAT CCTATAGCAAGAGAGGTTAGTTTCTGTTAGATCGTTATATAGTTCAGCTATACATATGAT AAATATAGTCTATGCATGATTGATTAAATCATTGAATAGCTCACTAACTGTTGTGAACTG TGTTTGTTCATCATTGCAATCATTTCCTTGTCTTTCTCATCCGCAATGCATTTCATTTTA ATAATAAATTTTTTCCCCAGATGGGAAATTTGAGTACCTAATATCACACTTAACTTTTTG CTATGCAAATGTACTAGATAAAACATGTTGATTGATCTTGGTTTGCATTCTTTTAAACAT TACTTTTTGCACATCGTTTGTCCATTCTATGGTAGCATTGAGCTCTTTTAACAAGTGCCC TTTTCCAAGTTCAAATGTAAGCTGTATTCGAATAAAACTTTTTACTATTTCCAGGACCGA AGACACCGAAGGACTCAAGGAGGAGGGAGCATGGAGATCGAATCCCAGAAGGAAAATTCC GACACAGAAAAGAGTGATTATCTGGGTTCAAGGCCAGAGAGCAGGCGGACGTAA