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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI004084 | Chr6 | 30160648 | 30163127 | + | Non-functional pseudokinase ZED1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI004084.m1 | 96 | 259 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 54.7 | 1.00E-14 |
LITCHI004084.m1 | 102 | 274 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 63.9 | 1.50E-17 |
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>LITCHI004084.m1 ATGATTCCTTTTCGGGGAAAGAAATATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAAACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTTATTACTACTTTCGACGGTAAACGCAATCCC ATTCGCAATTTTTCTTCTGAAGAGCTCAAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGATGTGTGATCGTTGGCGTGTATATTATAAAGGTTTTCTAAAGGGTCGTCAAATC TCTGTTATGAAGTATTGTTCTGATGATTGGTGGGTATGTGAGGGGAGTATAAATAACATT GTATTCACATCTCAAATGTGTCACAAATATATTTTGAAGTTGATTGGATGTTGTTTGGAT ACTCAAATTCCTATCTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGGGTGGAACTCTCAAGGACCAT ATTTATAGTCGTCATCAACCCCATTTCGAATCTTTAACATGGAGACAGAGGTTAAAGATT ACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGACCTATTGTT TATGCTGCTATCAGTCTATCAACAGTCTTCTTGGATGAACATTATGCTCCAAAACTAGTT GATTTTTCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATACAAGTGGCAACTATT AGAGCAATGGAAGACCCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAGGAGTTCTCCATGAGAAG TGCGATGTTTATCGTTTTGGTAGATTGCTATTCGAGGTTTTGGTTGGACAGAGCAGCCGT GAGTTTTTCGGCAGTCAGCTTTTCAGCAGTATTGAAACCAATGATGAATTTGAGGAAAAC AACTCTGACACAAAAGATGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCGACTAAAACTAGGGAAAGA GAGCATGAAGATTGCGATCCCATAATAGTTGGAGATGGGCTATGTCCTGAAATCGAGCAG CAATTAATAGTTTTCGCAGAACTTTCACGAGGTCAAACCCAATTACATGATAAAATTGTG AGAGGCACTTACAGATTTATAGCACCTGAGCACAAGAACAAAGCTATTCTCAATGAGAAG CTACTTGTTGAAAACAACCTTTACAAATATGGAACTGTGGATGCATATTGA
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>LITCHI004084.m1 MIPFRGKKYREKLDKKTFMLKNGEILLEKFITTFDGKRNPIRNFSSEELKLATNNYDTMN VMMCDRWRVYYKGFLKGRQISVMKYCSDDWWVCEGSINNIVFTSQMCHKYILKLIGCCLD TQIPILVFESMVKGGTLKDHIYSRHQPHFESLTWRQRLKITMEIANAFAYLHVGFTRPIV YAAISLSTVFLDEHYAPKLVDFSFAECIPEGKTEIQVATIRAMEDPVAPEHISKGVLHEK CDVYRFGRLLFEVLVGQSSREFFGSQLFSSIETNDEFEENNSDTKDEDWRSNVSTKTRER EHEDCDPIIVGDGLCPEIEQQLIVFAELSRGQTQLHDKIVRGTYRFIAPEHKNKAILNEK LLVENNLYKYGTVDAY.
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>LITCHI004084.m1 ATGATTCCTTTTCGGGGAAAGAAATATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAAACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTTATTACTACTTTCGACGGTAAACGCAATCCC ATTCGCAATTTTTCTTCTGAAGAGCTCAAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGATGTGTGATCGTTGGCGTGTATATTATAAAGGTTTTCTAAAGGGTCGTCAAATC TCTGTTATGAAGTATTGTTCTGATGATTGGTGGGTATGTGAGGGGAGTATAAATAACATT GTATTCACATCTCAAATGTGTCACAAATATATTTTGAAGTTGATTGGATGTTGTTTGGAT ACTCAAATTCCTATCTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGGGTGGAACTCTCAAGGACCAT ATTTATAGTCGTCATCAACCCCATTTCGAATCTTTAACATGGAGACAGAGGTTAAAGATT ACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGACCTATTGTT TATGCTGCTATCAGTCTATCAACAGTCTTCTTGGATGAACATTATGCTCCAAAACTAGTT GATTTTTCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATACAAGTGGCAACTATT AGAGCAATGGAAGACCCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAGGAGTTCTCCATGAGAAG TGCGATGTTTATCGTTTTGGTAGATTGCTATTCGAGGTTTTGGTTGGACAGAGCAGCCGT GAGTTTTTCGGCAGTCAGCTTTTCAGCAGTATTGAAACCAATGATGAATTTGAGGAAAAC AACTCTGACACAAAAGATGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCGACTAAAACTAGGGAAAGA GAGCATGAAGATTGCGATCCCATAATAGTTGGAGATGGGCTATGTCCTGAAATCGAGCAG CAATTAATAGTTTTCGCAGAACTTTCACGAGGTCAAACCCAATTACATGATAAAATTGTG AGAGGCACTTACAGATTTATAGCACCTGAGCACAAGAACAAAGCTATTCTCAATGAGAAG CTACTTGTTGAAAACAACCTTTACAAATATGGAACTGTGGATGCATATTGA
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>LITCHI004084.m1 + Up_Stream_Len 2000 GCAATGTTGGTCCTATCATCCCGCCCCATGAAGAGATTAAAAGCGATCCTTACATTCGCT AACTTCAAAAGATCTTCATTATTAATTGGACCCTTACTTGTACGATCTTGGCAGCTTATA TGGCTTCTTACCCCTAGAAACGTGGTTAACTTGATCACATCCGATGGCACTCCATTAAAC AATCACCATAGGAGACTGTTCTAGTCATTTGGTAATGTATTGAAGATTTCACGGTCGATG CCTCCAAAAGAAAGTCATGTAACCAATAAAAACTCATGTTTCCCAAACCTATATATTCTC TCCTTTATTTCAAACCATATTTTATCACGGCGTCCACCAATGACCTTCACCTCTCTAGCA ATAATATCATGAAGGTAGCAATCATATTATTGGTAATCTTCAAAATATGTCCGAATAGGC ACTCTTTTATAAATCGATCGTACAAATTTCTTCTAGTAACAACGACAATTATTTTACTAA GCAACCTTTGACCAATGTGTTTATTCTCGCTTGTATGTTTGTCAATTGTTTGTGAATTAT ATTTATACCTAAAATCTATCTATAGGAAGAAAAACAACAAAAAAGATCAGTAGGGATGTT AAAAACCGAATCGGTTTTTTATTGCTTCTAAAAAACTGATCAAGGTAATAGATCAGTTTT TTCCTTCAATTATTCACATCAGTTTTTCACTTCGGTTTTTCAGTTTGGTTATTCACTTCT AAGGAAAACAATTGTGAAAAACTGAACTGAAAAATCGATGTAAAAAACTGAAGTGAAAAA CCGAAATGAAAAACCGATCTAAAAAATCGAATTGAAAAATCAAACCAATGCTGATGACAT TGCTATCCTCGAAATCGGCCATTTTCAACCCAAATCCTACCAAATACAATCAAATCCAAT CTATTCTAAACCTAATAATCATAACTCAATATCTATAACACAAGAAACATCTCAAAATCG TAAATCAAAATGATAATAAAAAAAAAAATACAACCTTTCCAATAGAACCCATACCTTCGC AAGATGTGGAAGCTCGCCGATAGTCAGAGATCCTTTAGGAAGGTTAAAAAATTCAAGAGA ATGCCCGAAAAAAGTGGATGTGCCTCGTTAGGTCGCGATCGGATTCAGGTCTCATCAAAC GGGTCGATTTTTGCTTTTACTCGGTGATGAAAAGTGCTTTCCGTCGAGTTTTTTACGATA TATACATGAGGGTTGTTTCATAATTTCACATTTCATTTTTTATAAAATTATAACAGTTGA GGGTAAAAATGTACATGGGTATTATGGGTAATTTGGGTATATAATGAAATTAATTTGTTT GAGAGGCTAGAAACATTTTTTTTTTAAATAGTGGATAAAAACAAAATTGACCCTTTTTGA ATAGGTATTTCTGGTAATTTTCACTAAAAAATTTATGAATTTTTTTTAATTGTCAGTTAT AATATAACGACGCGAATCTGGACATTTTCATACTGAGTGTTTTTACTATTATAACACATT GAGCAACGGAAAAAAGTTTAGGAAATGTCAATGACGGAAAGCATCAATCAAATTTTCTAG TGGCATTCTCTTGTCTTAGCTTTAAATAATATATACTTCTAAGAATTCATTTCTGATTTA TCTTGCTCTGTGCTTCAGATTAAATTCCAATTCTAAAGCTTGTGCTTTCTCGCAAACTCA ACTCTCTCGCGGTTTAATTAGCAGCCATCCACACAGGTATTCTTCTATCTTATATGAACT CTGATCTGATATATAGTAATTACGTGTATGTTTTTCCTCTCACCTTAGTCAACGGTATAT GATCCATCATTTTTCATTTCCAAGAATGATTTGTTAATTAAGTCCACCATAAATCAAGTT TTATGGTCAATTTTATGTTGGTTCAAAGAATAAGAACTTCTTAGTTTGTATTCTTATTTT ATATATATGCATGCTTCATGTTCATTGTTTAAATAAAGTGAAAGCATTTCAGCAGATTTA TTTTCTAATAGGTAAATTAA
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>LITCHI004084.m1 GenomeSequence + ATGATTCCTTTTCGGGGAAAGAAATATAGGGAGAAGCTAGATAAGAAAACATTCATGCTG AAGAACGGTGAAATTTTGCTTGAAAAGTTTATTACTACTTTCGACGGTAAACGCAATCCC ATTCGCAATTTTTCTTCTGAAGAGCTCAAGCTAGCAACAAACAATTATGACACGATGAAT GTTATGATGTGTGATCGTTGGCGTGTATATTATAAAGGTTTTCTAAAGGGTCGTCAAATC TCTGTTATGAAGTATTGTTCTGATGATTGGTGGGTATGTGAGGGGAGTATAAATAACATT GTATTCACATCTCAAATGTGTCACAAATATATTTTGAAGTTGATTGGATGTTGTTTGGAT ACTCAAATTCCTATCTTAGTTTTTGAATCAATGGTCAAGGGTGGAACTCTCAAGGACCAT ATTTATAGTCGTCATCAACCCCATTTCGAATCTTTAACATGGAGACAGAGGTTAAAGATT ACAATGGAGATTGCTAACGCATTTGCTTATCTGCATGTTGGATTTACTAGACCTATTGTT TATGCTGCTATCAGTCTATCAACAGTCTTCTTGGATGAACATTATGCTCCAAAACTAGTT GATTTTTCGTTTGCCGAATGTATTCCAGAAGGAAAAACTGAAATACAAGTGGCAACTATT AGAGCAATGGAAGACCCTGTAGCACCTGAGCACATCTCAAAAGGAGTTCTCCATGAGAAG TGCGATGTTTATCGTTTTGGTAGATTGCTATTCGAGGTTTTGGTTGGACAGAGCAGCCGT GAGTTTTTCGGCAGTCAGCTTTTCAGCAGTATTGAAACCAATGATGAATTTGAGGAAAAC AACTCTGACACAAAAGATGAAGATTGGCGGTCCAATGTTTCGACTAAAACTAGGGAAAGA GAGCATGAAGATTGCGGTCCAATTTTTGGACTAAAACTATGAAAAGTAATAGGTTTATTG AGCTTATAGATCCCATAATAGTTGGAGATGGGCTATGTCCTGAAATCGAGCAGCAATTAA TAGTTTTCGCAGAACTTTCACGTAAATGTCTTTCTTATTCAGCTGAAGATAGGCCAACAA TGATTGAAGTGGCCAAACAACTTAGGCAACTTTATTTATCTGCTTGATAATGTAGTTGAT TCATGTTGTTGATTAGAATTTAATTTTTGAACTTTCATGTGTAATTTTGTGAAGGGTTAA GGCATTCCTTTGTCTATGGATTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTGTCTATGGATTTTAATCT CCTTTAAGCATTGCACTAGTTTTAATTACATGCTTCTTGTTGTAGTTTGATTATAATCTA TAATGAAATCCCATACAGAATTCACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAACGGAAAT AATACTCAAGCTATCATATTGTTCGAGTTATGTTGCGTGTTTTATGCATACAATTTTTTA TTATATCATTTTTAGACATTCAGTGTAAGCTTTATTGTTTATATTCCCCCTTTTTACTCA TTGTGCACAAAATAACATGGATTTTAATATAATTTTCATTCTCTTCTTAATATATATACT CATTGTACTATCATTACACCATAATTTTTCCTCTGTTATATCATAAATTTATTTTTTCTT TAAAGCTCAATAACTTGAAATTTTAAATAAAACATTATAAGAAGACTATTTTAGTGGTAA AGTTTGTAAGTATCTACATTGATCTTTCTTATAGCGCGATCTTTTCCCATGATAGAAAAA AAAATAAAAAATAAAACCTAAAAATTAATCCATTTGATTACAACTTGTGAAATTATCATC ATCTCAAGAAGTGGTGAAATTATGTTGAAAAACTGGATTGTTTCATTTTGACGAGAGAAA GACACCACTAGACAAACAACCAACAGCTATATTCTCCCATGTATTGAAGCTAATAGAAAC CAACAGACTATAATGCAGTCCCACGGTAATTTATATGCTGTAATTTGTCAAACAGACTTC AAAAATTAATCCAACATGCACACTAATGCAAGTAAATTTTTAACGTGTAAAACCTTCCCA AATTTGATGAGTAAAAACCACGTCATCTGAGTCCACCCAAAATCTCCACTATCAATCAAA TTATGAATGTACAATATGTCCCTAATTTCAAGTAGGGATAGATAACAGCAACAACATCAA AAAATTTGATTCTTTCGCAACACAAACACTAAACAAATAAAAGAGAGCAATATCACAAAC TCAGAGACTCTGTTCAATTAGATTAGCAGGAACTTTATTGGATGAGAACTACGTCACCAA ACTATTTGATTTTTCACTATCCAAATCTATTCCAGGAGGTCAAACCCAATTACATGATAA AATTGTGAGAGGCACTTACAGATTTATAGCACCTGAGCACAAGAACAAAGCTATTCTCAA TGAGAAGGTTTTGGTGTATTGCTAGCTAGCTACTTGTTGAAAACAACCTTTACAAATATG GAACTGTGGATGCATATTGA