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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI003934Chr62864739328655163+Nuclear transcription factor Y subunit C-9

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI003934.m164166PF00125.27HistoneDomain63.42.50E-17
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LITCHI003934.m2103166PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain64.96.30E-18
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LITCHI003934.m4103166PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain64.96.30E-18
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LITCHI003934.m5103166PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain64.96.30E-18
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LITCHI003934.m6103166PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain64.96.30E-18
LITCHI003934.m764166PF00125.27HistoneDomain63.42.50E-17
LITCHI003934.m7103166PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain64.96.30E-18
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GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
ACTGCTGGAATGATCATGGGTAAGCCTGTGATGGACCCTACTATGTATGGTCAACAATCT
CACCCCTACATGGGTCAACAGATGTGGCCACAGGGACCAGAGCAACAACAGTCACCTTCT
GATCATTAG
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ATGCCATATGGCACAAACCCTTATCAGCCTAATCAAATGACCGGCGGCCCAAATCCTGGA
TCAGTTGTAACATCTGTTGGAGCAATGCAATCTACTAGTCAGCCTACAGGTGCTCAGCTG
GCACAGCAGCAACTTGCTTATCAACAAATCCACCACCAGCAGCAACAGCAACTGCAGCAA
CAACTCCAGTCTTTTTGGGCGAATCAGTATCAAGAAATCGAAAAAGTTAATGATTTCAAG
AACCATAGCCTTCCCTTAGCAAGGATCAAGAAAATCATGAAGGCTGATGAGGATGTGAGG
ATGATATCAGCTGAGGCACCAGTCATATTTGCCAGGGCATGTGAAATGTTCATTTTGGAA
CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
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CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
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CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
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CACCCCTACATGGGTCAACAGATGTGGCCACAGGGACCAGAGCAACAACAGTCACCTTCT
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ATGCCATATGGCACAAACCCTTATCAGCCTAATCAAATGACCGGCGGCCCAAATCCTGGA
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GCACAGCAGCAACTTGCTTATCAACAAATCCACCACCAGCAGCAACAGCAACTGCAGCAA
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ATGATATCAGCTGAGGCACCAGTCATATTTGCCAGGGCATGTGAAATGTTCATTTTGGAA
CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
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ATGCCATATGGCACAAACCCTTATCAGCCTAATCAAATGACCGGCGGCCCAAATCCTGGA
TCAGTTGTAACATCTGTTGGAGCAATGCAATCTACTAGTCAGCCTACAGGTGCTCAGCTG
GCACAGCAGCAACTTGCTTATCAACAAATCCACCACCAGCAGCAACAGCAACTGCAGCAA
CAACTCCAGTCTTTTTGGGCGAATCAGTATCAAGAAATCGAAAAAGTTAATGATTTCAAG
AACCATAGCCTTCCCTTAGCAAGGATCAAGAAAATCATGAAGGCTGATGAGGATGTGAGG
ATGATATCAGCTGAGGCACCAGTCATATTTGCCAGGGCATGTGAAATGTTCATTTTGGAA
CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
ACTGCTGGAATGATCATGGGTAAGCCTGTGATGGACCCTACTATGTATGGTCAACAATCT
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AACCATAGCCTTCCCTTAGCAAGGATCAAGAAAATCATGAAGGCTGATGAGGATGTGAGG
ATGATATCAGCTGAGGCACCAGTCATATTTGCCAGGGCATGTGAAATGTTCATTTTGGAA
CTGACACTACGGTCCTGGAATCACACGGAGGAGAACAAAAGGAGGACTCTTCAAAAGAAT
GATATTGCTGCGGCAATCACCAGGACTGATATATTTGATTTCTTAGTCGACATTGTGCCA
AGGGAGGATCTGAAAGATGAAGTGCTCGCTTCTATCCCACGAGGAACGATGCCTGTTGGT
GGACCTGCTGATACGCTACCTTATTGCTACATGCCACCTCAGCATGCACCTCAGGTTGGG
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TCTTTGTAAATTATTATTAACAAGCCTCTTGATGAATTTAAAAAATTCTTAAGGTCCTTT
CGTAAATCAAATAAACGGAGAAGGTAAATGAAGTGGCGCAAGTGTGGCAAGAAGAATTTA
AATCAATTACTGATATAATTATGGCGGAGCTGTCCAGAACAAATTTGAATTTGAAACGGG
CACACGCACACACAAACATGGCACTTAGCCAAAAACAGAAAAAACCAAACACCACCTCAG
TTTCTTTAGCGGCTTCTCTTCTGTCTTGAGTTTCCCATCTCTGAGTGTCCAAAAATGGTG
GAATCAAAGTTGACATACGAAGAATGCCGCCGACAGAGAGTAGAAGAGAACAAGAAAAGA
ATGGAAGAGCTCAACCTCAACAACCTCTCTCGCTCTCTTAAACCCTCCAAAACCCACAAC
CCATCTCCAGCTAAAAAGCGGGTTCGAACCCCACAAGTGGAGGCGGAGCAGGTGAGAAGG
TCCAGTCGTGTTGCCAACAAGCCCCCTCCCAACTACAAGGATGATGTAGTAGAACCTTTC
CTGACCAGAAGAAGGAGCTACCCAGGGAGAAATCTGCTGAGTCGTGTTTATGCTTCGGAT
GAAGAAAGAATGTATGCAATTGAAAGAGCTGAAAAACTTCAATCAGGCTTAGATTCTCAA
TTTCCAAGTTTTGTCAAGCCCATGCTACAATCACATGTCACTGGCTGCTTTTGGCTGGGT
CTTCCTGTCCAGTTTTGCAAGGATCATCTACCCACTTGCGACGAAACAATGATACTAGTG
GATGAAGAAGGAAATGAGTCCGCGACCAAATACCTTCCCCGTAAAACCGGTCTAAGTGGT
GGATGGCGGGGATTTTCCTTGGATCATGAGTTAGTTGATGGAGATGCATTGGTTTTCCAT
CTTGTGAAGCCTACAACATTTAAGGTCTACATTATCAGGGCATACGAGTCTGAAGACAGT
GAAGACAAAGTTGACAACGAAGAGCAAGTTGATAAGGACAAGAAGGAAAACTCTGATGTC
ACTCGCTTGACCAGGAGTGCCAAACGAGCCAGAGCAAGTAAGTATCTGTAACTCCTTTTT
ACAGCTCCAAAGTTGTTTCTGACAGGTTATTCAACAATTGAATCAAATTAGTTATAATGA
CATTTATTTATAATACTGAGTAATGATGTACTGGCCAAATCAAATATCTGCTGATTTAGA
TCCACTTTCAAGGTTTTATAAGATCAGTGCAAATACATTTGACACTTGATTAATGAAGAT
AGATTTAATACAACGTAAATGTACAGTTTAAAGCCAAAACAAGCTACAAGATTTTATCAT
TCAAAAGCGAATTGATAATTAAATTTGTGAATGTATTATACTTTTCTATGAGATGCTGTC
ACTATGCAACTAGGTCACCATTTTATAAAGTGTTTTATGCTTACACATTTGCATGGAAGT
ACCATCTAGAACTTGTCTTCAACAAAAACTATGGATTTATGTTTTAACACTTGAAATTAA
ACAATATTAGTTGAATATATAATGATTTTGGTAGAAAAGGTGAATTTTATCTTGCCTTAT
TGTGTGAGTGTAACTTG
>LITCHI001634.m1
TCTTTGTAAATTATTATTAACAAGCCTCTTGATGAATTTAAAAAATTCTTAAGGTCCTTT
CGTAAATCAAATAAACGGAGAAGGTAAATGAAGTGGCGCAAGTGTGGCAAGAAGAATTTA
AATCAATTACTGATATAATTATGGCGGAGCTGTCCAGAACAAATTTGAATTTGAAACGGG
CACACGCACACACAAACATGGCACTTAGCCAAAAACAGAAAAAACCAAACACCACCTCAG
TTTCTTTAGCGGCTTCTCTTCTGTCTTGAGTTTCCCATCTCTGAGTGTCCAAAAATGGTG
GAATCAAAGTTGACATACGAAGAATGCCGCCGACAGAGAGTAGAAGAGAACAAGAAAAGA
ATGGAAGAGCTCAACCTCAACAACCTCTCTCGCTCTCTTAAACCCTCCAAAACCCACAAC
CCATCTCCAGCTAAAAAGCGGGTTCGAACCCCACAAGTGGAGGCGGAGCAGGTGAGAAGG
TCCAGTCGTGTTGCCAACAAGCCCCCTCCCAACTACAAGGATGATGTAGTAGAACCTTTC
CTGACCAGAAGAAGGAGCTACCCAGGGAGAAATCTGCTGAGTCGTGTTTATGCTTCGGAT
GAAGAAAGAATGTATGCAATTGAAAGAGCTGAAAAACTTCAATCAGGCTTAGATTCTCAA
TTTCCAAGTTTTGTCAAGCCCATGCTACAATCACATGTCACTGGCTGCTTTTGGCTGGGT
CTTCCTGTCCAGTTTTGCAAGGATCATCTACCCACTTGCGACGAAACAATGATACTAGTG
GATGAAGAAGGAAATGAGTCCGCGACCAAATACCTTCCCCGTAAAACCGGTCTAAGTGGT
GGATGGCGGGGATTTTCCTTGGATCATGAGTTAGTTGATGGAGATGCATTGGTTTTCCAT
CTTGTGAAGCCTACAACATTTAAGGTCTACATTATCAGGGCATACGAGTCTGAAGACAGT
GAAGACAAAGTTGACAACGAAGAGCAAGTTGATAAGGACAAGAAGGAAAACTCTGATGTC
ACTCGCTTGACCAGGAGTGCCAAACGAGCCAGAGCAAGTAAAAAGTAGTCCTTGGAATGC
CAAGTTGCAAGTTCCCTATTTTGTGGCATAGAAGCTGAGGTGTTGAAGTTTTGGCTGTGT
AATCCACCCTTGTATTATATCCATTTACTCGAGGAAGAAACTTTAGGCTTTTGTCATAGA
CTAAAGAGTGTTAACTGCATCTATCTATTTGGTCTTGGCTTAAGTGCTATGAAGGATGCC
TTTCAAAGAGTGCTATAATTGATTAATATGCAAAGAATTGATCGTCAGCTTTACAGAGAA
TTTGAAAATGATCATGTTTTGTGGTTTGCAACGTGAGGTCAAGCTCTAGGAGTAAAACAC
ATATAATAATGATGATCAGATAATATTCAGATTTCCCACGATGAAAAACATAATACGTCA
ATAACAATTTCCAGGAATTTACAGCGTTCGCCTTTGTAAACAAAATTTTTTGAAACCAAC
AGTCATTATATGGCAGAAGCTGCTGCACACTTATTGATTCTATTGAACAGAAATTTTGTG
GAGGGCAAGATTGAAACAGCAATTGGCTCATAATTTTGCCATTTGTTGACTGAAGGCTGG
ATCGATGCAAACAACAACCTGCAAAATTTTATCGCCAAAGTAAAAGCCAGCAGAACTACT
TGTCAAAAAAACTGGGATGAATTGGAATAGGTAGAAACAGATAATGAGAAGATAAGCAGA
CTGTCGAGAAAAGTAGCACATACCTTGCCAACACTTTTACCCGAATGAAGATACTCAACA
GCATCTGCCACTGAATTGAGACCGAAAAACCTTTTTGGGTCTATGGAAACCTACATAAAA
TGGAATGACAGTCATCAGGCCACCTGTTTGTCCAACGAACTCATTTAAACGACACGTCAT
GGTCTAGTATGCGAAAATGACTTCAACATTATAGAAATGTCCACTTTAACACAATCAGCA
GCTGAAAAGGCCTGCGTATTTTCCCCATCAACTGACAAAATAATTCTTATCGGCAACTTT
AAAAAGAAAAGTGTTAATAGTTAATAAGCTGGCCAGTTGATTCACTGTTGAGCTCAGTAC
AATCAGTATTTAACAAGTACATCACAATACAGTAATGCCATGGTTCTTCTAAGACCCAAA
AAAAAAGGAAATTTCATGCAGGACATGGTTAGTTTAAGACATCACACTGCTTACCTTCTT
AAGATTGGCAAACTTAATGCTTTAAAAGAGTTAATCAACACAAGAAACAGCACATGGTTT
ACACAACACTAATAATGTAATACTGGTAATGATAATCATAATCATAGTGATAGAAAAATA
ATTAATAAATACAGGTTACATAATTGTAAACCTTATGCCTCATTGAGTCACTCTGGTATT
TTGATTCAAAAAGCACTCGCTAACGTCAGTCATGTGAAAGTTGACAATTCAGGAACTCGA
ACTTTAAAGTCGTATTTACATAGGTTAGCATCTGTAAATCACTGTAAGATGACAGGCAAC
ATACAGATTCAATACCACCATGAACTCTTAAAACCTGTAACTAATTTTGATATCATACGG
AAAACATAGTGGTGCAGGCTCAGAAGAGGCCAAACTAAAGTTATTTTCCAAAGCGTAGTG
TAGATGCAAGATAGTTTTTAATTTTAAAATTAGAAAAAAATATATATATTAATAATTATT
TTGCAGCTGATTACAGGATAATATTCAGAATTGACAATATGAGCTATTGAGTTCAATTGG
ATGTATTGTATAACTTTGCACAACAATTTTTACACAAGGCTAAGACAGGGCAATGAGGAA
ATATAACAGGATGAAAGTACTACCTTAAGCTTTCCTGTAGCGAAAAGATGATAGAGTCTG
TCCAGATGTTGTTGCCATAAGCGACCATATTGCACTAGGAAAAATCCAGCCTGAAACACA
TCAGCAACTTTAAAAAAACTAATGCATATGAATCCCCATAAAATATTGTAAATAATGCTC
TACGGTACCCAACAGAGAGTGACATTTGACCACCTCTTGATTTTCAAAAGAAAATACTAA
AATGAGTTTCTTTCAGTAATAGAAAACAACAAGAATTTAAGAAATCATATACTTCAACCA
AGAGAAGAGAACCACAATTGGTTGAAAGTTTTCATTTAATAATAAAAATGTATTATGGAA
ACCAAAAGAGATATCTACAACATATTGCATCAAAATAATATCGGCAGAGAAGACAAGTTT
TCCGGAGATTTACTCAGTCTGGTACCTTATTTGGGAGTCTAAGGTGCAAAGTTTTAGCTA
AATGACAGATATTTAGAATGGCTCATTGTCAGCAGATAAAAGTGACTTCATTATCCAGCA
CCTACTTACCACAGTTTGGCTTTTTGCTAAAATCTTCTCACATAGGCCAGGGTAATTCGA
TGGCTGCCATCCATGTTCTCCTTGGTACTGAGACATATATAAAACCATTTCATCACTAAT
AAATTAAAACCATTACAAATAAATCCAAAGAACAAATTAAAACATAAACACAGAAGTTAA
CAAAAGGAGTTATGTTGACAGATATAAATGACAGATTTTAAATTTTATAAATCCGATGAA
GTTGACAATATATATATTTTTTGGGTCAATTGATAATTTATCAGATTGACATGTGGAAAA
TATGCATCAAGAACCTCAGAAAGGACCAGATAAAATTTGTCATATGTAGATTACCAAGAT
AGATATAAACAAATGCAAGTTACAGAATTTGAATCCGAGTCATATTGTTGAGCCCTAAAT
ATACCTCGGATACTTTGCCTAGATTTACAACTCCTTGTTCCGGTGTAGGAATAATTTACC
AAGATAAAAGCTTTAACTATGGCAATAGATACCTTTAATTTTAAGCAAGTAAATAAATAT
CCAGCTGGACATGGAATAATATCCAATTCGCACGGCCAAGGAAGGACTTCAGCTATATCT
TGTCAAACTTGTGCAAAACCCTTAGTACAAAGATTTTTGGATTTTACAGAACTTTCAAAT
TAAAGAAACTTTTAGGTATAACATCCAGAGGTGCTTTAGAAGTTCCCTTCTTTCATATCT
TTGATCCAGCATTCAATTATTAGGGCAGCCAACAATTAGCTGTTTATTTGTGTTAACAGT
AATTCATTAAAATGCCTATTACAGATGCATTTTACAGATAGCAACCTGAGAAATCATTCC
GATCACGATGAGTCGTCCGTAGACTGCCAAAGCATTCAAGCACAAATTAAACATGTCACC
ACCAACAGATTCATAAATGATGTCAAAACCATTGGGAAACTCCTTCTTAAGAACCTGGCA
GGATTCAGAAGCATTAGCATTTTAACAAAAAAAAATATTATATAATAATAATAATAATAA
TAATAATAATCAGTGAAAGTAATACAAAAGCAGATATCTTAGGATGGTTTAGCATGACAA
ATCAGTTTCAAAAGTTTGGAAAACCGCTAGTCCAAGTAGCTAAGTCAGAATACTCTCATT
CTTGTAATTAAATCCTAGAAAATATATGAAGTGGTGGGACCAACAATTTTTAACATACAA
AAAGGTTTGTACAAGGCAACGAGACTGAAAAACAGATTAATGTGGAGGAAGCTCTAAAAT
CTTGTAAAGGTTAAGTCAACAGAACCTTCCTTATTCTATTAATATATTTAATTTGCAGGT
GATATTAAAGGCCAGGAAATGTAATGCACGTGTGTGCACATGTTGATATTAATCCTTAGC
AATTATTCCCAGAAGCCTGTAAATGAAATAACCATAAAAAGAATAAAAACTAATCCTAAT
CAAACCCATTCACCAAATCAGTTAACTCATTGCCTCCAAATGAAATTTGGTCAATCTGCG
TCTCATTCCTCTAGGATTACAAGATGTACAGAAGTTTTGAGAACTGAAACAAAACAAAAA
TTACAGACATACTGTTTTAATATCTTCTGCTTTATAGTCTATGGCTCGATCAACGCCAAG
TTGTCTCAAAAGCTGGGCCTTTTCCTGACCTCCACAAGTTGCTACCGCTGTATTTCCAGC
CAATTTTGCAAGCTGCATTTGTAGCAATTTGTTTTATTCTAAAAATTGTTTCATATTTGC
AACATGCACAGAAACACACTGCTCAACAGCCAAAAAGAGTTTGATAGTTGCATGTAAACT
ACTAGAGAATGTATTATAGGATTATCTTTGTATATGAGAATAAACCTGGACTGCAAATTG
CCCAGTGCCTCCAGCAGCGGCTGTAACTAGAACTTTGTTTCCAGATGTCATCTGTCCTGC
CTATA
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>LITCHI001634.m2 -  Up_Stream_Len 2000
AAAGATACAATTTAAAGGAAAGGTTAGTCATTAATCAAAGAAACTTGGTTAACAATTAAG
TAATAATAAACTTTTAAATGAGCTTTTTTCTTGTTTACTTTCATAGATGCTGTCATTATG
CAACTCAGTTCACTATTTGATCTACTGTAATGATTCTATACTTATTAATGTGGCCCAAAA
CTATAATCACGCACAAAAAGTATCATTTGCACAAAATTGTCACATGTAGAAGTACTCAAC
CAAGGAAAATTAATTGATATTACAATGCAATGAACTGATAGAAATTGGAAGGTGAAAAAA
TGTTGGATTTATCAAGCCTTCAAAATGCTTGGCATTTCAGATAATATTTGTCACTAGTGG
TTTTACTGGGTTCTAAACTAATCTCTAATCCGTTGTTGCTTTGGCAGGTAAAAAAAAGTA
GTCTATCAGTGCTACTGGCCTTCCTTTTGTAAGTTCTGGGAGATGATGTATTATTAATAT
TTATTAGAAACTTATGGCAGAGTTGCAATTGATATAGACTGATTTATCAACTGTGTTCTC
CCTCATGTGTCTCTGTAATTCAAATGGTTGTCAAGTGCCCAGCACCATTCGACAAAAGCA
TTATAACTAAATTTTCGTTTCACTCGCAATCTTTTCAAGACTCTAGAACCCTAAACTTGT
ATAACCAAATTTTTGTTTAACTTTGTGTATAATCTATCGAAGACTCTAGAACCCAAAAGT
TATATTTGACAATCAAGTGTTACTATATTAGGTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTTTTT
TTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCACTTATGGTATAATTATTGAAATTCGAATTATT
ATCAAGTTGAAAAGGTTCTCTATGACTAAGTCATGTTGAATGATGATGAAATTAGGTTTA
ATTTGAATACGTTTATGTTTTCTTATCAAAATTAACTATAACAAATCTTAAGAGATGTAG
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