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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003914 | Chr6 | 28499019 | 28501643 | - | Transcription factor bHLH96 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003914.m1 | 138 | 189 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.4 | 4.80E-10 |
LITCHI003914.m2 | 138 | 189 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.6 | 4.20E-10 |
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>LITCHI003914.m1 ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATAATTGGAGGA GCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATAAAGAG AAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCTTCACA TTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCATCATCA ACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCATGACT ACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGCAGACT CAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCAAAATA AGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACATGCGC TTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTCTCAGT GTCAAGGTAGAGGAAGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTAT CAGTTGCTAGGTAGGATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAG >LITCHI003914.m2 ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGGTGATCAAGCATCAATAATTGGAGGA GCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATAAAGAG AAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCTTCACA TTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCATCATCA ACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCATGACT ACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGCAGACT CAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCAAAATA AGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACATGCGC TTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTCTCAGT GTCAAGGTTAGTTAA
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>LITCHI003914.m2 - Up_Stream_Len 2000 TAAAATAAAAATGATCATTTTATTTTTTTAAAAAAATAAAATCATCATTTTTATTTCATG TATATGTTTGAATCATATGATTATGAGGTATGTTTTTATTTATCAAGAGTTTTTTTATCT TTGTTGTTATATCTAATTCAAAAATTTAAAATTAATTAATTAAATTTTATCTCTTGAATC TTGATGATATATAGAGTCTATATTTGTTAGCTATATGTCTTCAATATATATAAATTTTAA GATAACTAGATGTGAATAAGCTATTTGAATTTCATATTGCTTTATTTGTCGTTGGCATGA TATTTCCCGATGAAGAGAAATTCTACCACGCAGCTGATGCATGATGCATTTAATTTTTTA AATAAAAATCAAAATTAAAATCATAAACAGTGATTATAAAAATTAGAAATGATGTTTTTT AAAATGAAACAAAAAGAGAGAATTCTCATAAAACAAATCAAACTCATATTCGTATTAAAA TATTATTTCTTTGAAACTAGAAATTATTAAAGCTCGAAAGTACTGTGCTATAATCATTAT CATCCCATCTATTAGAACTAAAAAATTTAAATATTCACTAATTAAGTTTTACCTCTATCT AAATCATAATATTAATTAATACTTAATATCCGCTAATCTTAATAAACTGCATTAATTAAT AGGTATTTCGGTCTCCTGCATCTAGTATGTATATAGGAATAAGATGATTCATTGAGATGG GTTCCTCATGCTCAAATTTTGGGATTGAGAGAGACAAATTTATACACCTTATCAATATAT GTATCTTGATCCAAAAAACAACATAAAAAACTACTCAAATTTTAAATCAATAAAAAACTA ATAATATAAAAACAGAACAATTTATGCACACACAAGAGATTCTTAAAAAAAAAAAACAAA GGGCAAGGGAGATGGCGATATGTATGATAATGGACAAATGACATGAACATATAAACAAAA GAAGAGGGGCTCAAGTTTGGGGTTGTTTGGCAGTTTGTATAGTCACATGGATTCCCTCTG TACAATTTTCTGACAACAAAAAAAAAATTGCAAACCTATTTAGCTTTGTAAGAATCTGAG CTTTCTCATCAGCCTTTTTCACACACAACTCTCTCTCTCTGTTTGCTTGTACAACCGACC GTATTATTACCAAATGATCCCAACTCTCTATTTACATCTCTCAATTACCCTTCTATGTGA ATTGTGTAACGCTCTTACATTACATATGTTCATTATATTGGTATAAATCGATATGAAAAT TTTAGTTTCAGTACTTAATTTTTTTTTTTATCTCTTAACGATTTACACCAATAATAATTT TCAGATATATTCTATGTTATAAAGATTGTATTTTTAAAAATAGGACCTATAATTGAGAAG TATATAATGTATATGAATATTTATCATAAAATTATATTGTGTATAGATTTACTTATAAAC TTAAATTATAAATTCAAATTTAGATTTACCATTATAATGGGTAGCTTTCGGAACATAATA TTTATAGAAAATGCTTTTATTGGATAAATATATAAATACTACGTCAATGCTATTAAAACT TTGGTGCTTTGTATGTGTCAATTTTAAATTTTAAAATAAGCATTGGAATATAATTATTCC ATTGTTTAGTACGCACAAGATTTAGGTAAGTTGCATTAATTTTAGATTAAAATGAAATGA TTTGTAACCGAATACTGATATCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAG AGAAAAATGAAAATATTCTAATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAG TATTTCACGTGCGATCTTAAACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTT TCTTTTGGTTTCCTGAAGAAGGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCA AACCCCCTCCAAAAAGCGAAAAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATA CACAAACACAGAGAGAGAGA >LITCHI003914.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAAAATAAAAATGATCATTTTATTTTTTTAAAAAAATAAAATCATCATTTTTATTTCATG TATATGTTTGAATCATATGATTATGAGGTATGTTTTTATTTATCAAGAGTTTTTTTATCT TTGTTGTTATATCTAATTCAAAAATTTAAAATTAATTAATTAAATTTTATCTCTTGAATC TTGATGATATATAGAGTCTATATTTGTTAGCTATATGTCTTCAATATATATAAATTTTAA GATAACTAGATGTGAATAAGCTATTTGAATTTCATATTGCTTTATTTGTCGTTGGCATGA TATTTCCCGATGAAGAGAAATTCTACCACGCAGCTGATGCATGATGCATTTAATTTTTTA AATAAAAATCAAAATTAAAATCATAAACAGTGATTATAAAAATTAGAAATGATGTTTTTT AAAATGAAACAAAAAGAGAGAATTCTCATAAAACAAATCAAACTCATATTCGTATTAAAA TATTATTTCTTTGAAACTAGAAATTATTAAAGCTCGAAAGTACTGTGCTATAATCATTAT CATCCCATCTATTAGAACTAAAAAATTTAAATATTCACTAATTAAGTTTTACCTCTATCT AAATCATAATATTAATTAATACTTAATATCCGCTAATCTTAATAAACTGCATTAATTAAT AGGTATTTCGGTCTCCTGCATCTAGTATGTATATAGGAATAAGATGATTCATTGAGATGG GTTCCTCATGCTCAAATTTTGGGATTGAGAGAGACAAATTTATACACCTTATCAATATAT GTATCTTGATCCAAAAAACAACATAAAAAACTACTCAAATTTTAAATCAATAAAAAACTA ATAATATAAAAACAGAACAATTTATGCACACACAAGAGATTCTTAAAAAAAAAAAACAAA GGGCAAGGGAGATGGCGATATGTATGATAATGGACAAATGACATGAACATATAAACAAAA GAAGAGGGGCTCAAGTTTGGGGTTGTTTGGCAGTTTGTATAGTCACATGGATTCCCTCTG TACAATTTTCTGACAACAAAAAAAAAATTGCAAACCTATTTAGCTTTGTAAGAATCTGAG CTTTCTCATCAGCCTTTTTCACACACAACTCTCTCTCTCTGTTTGCTTGTACAACCGACC GTATTATTACCAAATGATCCCAACTCTCTATTTACATCTCTCAATTACCCTTCTATGTGA ATTGTGTAACGCTCTTACATTACATATGTTCATTATATTGGTATAAATCGATATGAAAAT TTTAGTTTCAGTACTTAATTTTTTTTTTTATCTCTTAACGATTTACACCAATAATAATTT TCAGATATATTCTATGTTATAAAGATTGTATTTTTAAAAATAGGACCTATAATTGAGAAG TATATAATGTATATGAATATTTATCATAAAATTATATTGTGTATAGATTTACTTATAAAC TTAAATTATAAATTCAAATTTAGATTTACCATTATAATGGGTAGCTTTCGGAACATAATA TTTATAGAAAATGCTTTTATTGGATAAATATATAAATACTACGTCAATGCTATTAAAACT TTGGTGCTTTGTATGTGTCAATTTTAAATTTTAAAATAAGCATTGGAATATAATTATTCC ATTGTTTAGTACGCACAAGATTTAGGTAAGTTGCATTAATTTTAGATTAAAATGAAATGA TTTGTAACCGAATACTGATATCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAG AGAAAAATGAAAATATTCTAATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAG TATTTCACGTGCGATCTTAAACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTT TCTTTTGGTTTCCTGAAGAAGGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCA AACCCCCTCCAAAAAGCGAAAAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATA CACAAACACAGAGAGAGAGA
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>LITCHI003914.m2 GenomeSequence - TCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAGAGAAAAATGAAAATATTCTA ATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAGTATTTCACGTGCGATCTTAA ACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTTTCTTTTGGTTTCCTGAAGAA GGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCAAACCCCCTCCAAAAAGCGAA AAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATACACAAACACAGAGAGAGAGA ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGTACTTGTTTTTCAATTCTCTACTAGT TTAATTTTTGTTTCCTGATATATAATTTTTTTTTTTAGAATGATACTTACTAGTTTAGTT GATAATATATGCGATAATCTCTTACAACTTTTACAGTTCAAGGATTTTCAAATTAAATAC TAAACTAAATAGAAAAAATATTTTATACATTTTTTTAGGGTGATCAAGCATCAATAATTG GAGGAGCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATA AAGAGAAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCT TCACATTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCAT CATCAACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCA TGACTACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGC AGACTCAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCA AAATAAGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACA TGCGCTTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTC TCAGTGTCAAGGTTAGTTAACCAAAGAGTTAGTCACTTTAATATCATTGTTTCGACTCTT ACCTTCTACCTTTTTATTTTTTATATTTAAACGATTATTAATACAGTACTAGTAAAACGT TTACAGACTCCTATAGTTAATACAGAGCAAGGATTCTTTGATAATCATTTTAAAGGAGGT TTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTAATAATTATTATTTTTTAATTTAATGCAGGTAGAGGA AGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTATCAGTTGCTAGGTAG GATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAGAATTCTTCAGTGATTTTTACTTTAATTTTACC CACTGTAATTTGGATCTCTTTTTTTACCTTCGTGAATGACCATTTGTGGGTACTTTTTAT TTTCCCCTCTAATTAGGTTGTACCTGAAATTGCTTTATGCAATTGATGTTATTTTTACAT TTGACATTACTGTAGAATTTGTTGTTTTGCTTTTTAGGAAATGGGTTGGTTGAGCTATTT GGCTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTTGTCATTAGTATCTTCTTCTTTTTAATTTACTTTTT TGGATTATGTGTTGTGTATGAGCCACAAATAGTTGCTTTGCTCTATTCAACCCATAAATA ATCTTTCCTCAATAATTAATGTGTGCAGTTGTATATTTATGAGATAATGTTGGAATATGT CAACGCAAAATTTCTTTGTGAATCTTTTGCTTGTGCTAATCTTTAGATAAGAAAAAACTA AGTTCGAGTGATATATGAGAGAAAAAAATAAATCAATTTTGATCGTCCATATTTTTTTAT GTTGATGTGTCATTAGATTATTAAAAGACCAATAAAAAAAGTAAGCAAAAAGTAGAGAAT TGCTCTGTTTATTTGTTAACCCTGGATTAACATATAGATTGATAAATACATCACTAAGTA ATCTGACATTGGGGTTTAGTTCTTTTGATGATGATCGATGACTCTTCATTGTCCTTGTAA ATGTACTCTATTATTCGTCATCTTAGATAATTTATAAGTTCGATATAGCTGGAAATCGAC CTTATATTTTATATGCCATATAAAACCAATACAAACCTTTCAAGT >LITCHI003914.m1 GenomeSequence - 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