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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003864 | Chr6 | 27988652 | 27996258 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003864.m1 | 41 | 190 | PF19160.3 | SPARK | Domain | 83.4 | 2.40E-23 |
LITCHI003864.m1 | 310 | 383 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 32.7 | 5.10E-08 |
LITCHI003864.m1 | 312 | 388 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 29.2 | 5.50E-07 |
LITCHI003864.m1 | 522 | 722 | PF00083.27 | Sugar_tr | Family | 136.4 | 1.40E-39 |
LITCHI003864.m1 | 721 | 755 | PF00083.27 | Sugar_tr | Family | 25.3 | 7.10E-06 |
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>LITCHI003864.m1 ATGTCACCATTTCTATTATTTTTCCTGTCAGGTTTCTTTGCTTCAGGATTCAGCTTATCA TCTTCCAGGTCCGATACTACCATTTCTGATGGTCAGATAGTTCTAAAAAAAAGCCCTTTT GAAGCTTCTTGTCCACTGGATTTTGATTCTATCAGGAAACTGGTTCATGAATCCCCTCCA AAGCCTGTGCTTACCGATATGACAAGCCAATGTAAAGGCATGTTTCGAACAGTCCTCGTG CTACGTTCCGAGTATCTTCGAACCAGTGGATACTTCCTGCCTCCTCCTGAAGCTACTGAG GCATGTTGGGAAGCATTCCGGGGCTTGATCTCAGAGTTCATACAAGGTTTTGACATTAAA GCTTCTTGTGGGAACCATCCTGATTCGATGTCAGATACTTGCAACAACATTACAACTCGA GAAGAGTTTGAGCGCCAGATTCCTGAAACTAAAATGCAGGAGATTTGGCATTACTGTAAT CAATCTTTGGATACTAATTCTGCTTGTGATTCATGTACGAGTAAGTTGTCAGGTCTTGGG GATTATTACTCCCAAATGGTTGGAAATGTCTCGGTTTGTACAGGATATGCAGCTATGTAT GCTGCTGGTATTGTCAATCAATTTGGACCATTTGATAGAGCAACTATGAGGTGCTTGTTT GCACTTTACTTTCCCTCCAAGGCATCTGGATTCAATACACAAAAAGTTGTCTTTTGGTCT GTTCTGTCAGGTTCTGTTGTTCTTGGGATCTTGGGGGCTTTTTCTGCAGTTAGGATTTGT TGGACTCGGCAGAACAAACCTGAGAAGAAGCAGCAGGTTCCTTTGAGTTATGAGACTAGT TCTGTATTTGGGTCAGGATTGTATGCTAGGGGTTCCTGTTTGGTCAGGTTCCAGTTTGAG GAAATCAAGGAAGCCACAGGAAATTTCTCCAGGGAGAATATTATTGGCAGGGGAGGGTAT GGGAATGTTTACAAGGGGATTTTACCAGATGGGACTGAAGTTGCATTCAAAAGGTTCAAG AATTGTTCTGCTACTTGTGATGAAAACTTCAAACATGAGGTGGAGGTTATTGCAAGTATC AGACATGTGAATCTTGTTGCTTTGAGAGGCTATTGTACTGCAACACTTCCTCTGGAAGGT CACCAGAGAATCATTGTGTGTGATTTAGTACTAGATGTTGTTGACGAGAACATGCCTGGA ATGTCGTTGCCAGAATTGATGAAACAATATGTTCTCATTGCTGTGCTTTGTGTGCATCCA ATACTAGAAGCTAGGCCAACAATGGACCAGATAGTGACCATATTGGAAACAGATTTTTCA AATCATAAAAATCCTGGAGCATATGTTGCTTCTCCAAGCAGTGATGTCACCAATGAGAGA TCAGATTCTATGCAAAGTTGTCTAACAGATGAGAAAGTGATTGTAAACTATGATTTGCAG ATGGGATATTCATCACCAGCACAATTTGGCATTATGGAAGATCTTAATCTGTCCTATTCA GAGAACATGAGGCTTTCATCGATCTTGTGCATACTAGGATGGTTGGCAATCTACATAACT TCAGCAATGGTTGGTCGACAAAAGGAATTTGAATCTGCATTGAGAGCTCTCCGAGGAGTT CATGCTAATATTAATCATGAACAGACTGAAATTCAAGATTCCATAGAAATGCTCCGACAA ATTCCAGAAGTCAAGATTCTGGACTTGTTTAATAGAAGGAACATCAAATACGTCACAATT GGAGTCGGATTGATGGTGTTTCAGCAGTTCATTGGAGTCAATGGAATAATTTATTATGCG GGTCAAATTTTTGTGTCTGCAGGAGTGTCTCCAAGTGTCGGAGGTATTCTGTATTCTTCT CTACAGGTTGTTGTCACTGCATTTGGAGCAACCTTGATGGACAAAGCAGGCAGAAGACCC CTTTTCTTGATTTCTGTATCCGGGATACTCCTTGGCAACCTGTTAACAGGTCTTTCCTTC ATTATGAAGGAACATAATTTAGCTGTTGACTTTGCTCCAACCCTTGCAATTGCTGGTGTT ATGGTTTTCATTGGCTCCTTCTCGATAGGAGCAGGACCGGTTCCTTGGGTTATAATGTCA GAGATATTTCCAATCAATGTAAAGGGAATTGGTGGAAGCATAGTGACTTTGGTGAACTGG TTTGGTGTATTTTTCCTGTATGCTGCTATTTGTGTAATGGCAATCATTTTCACCATAGCG GTGGTACCTGAAACAAAAGGTCGGACACTGGAGGAGATTCAAGCATCACTTGACAACTGA
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>LITCHI003864.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCACTTCGTACAAGATTTAATACATATGACAAATACAAGGATCTTCTTATGAAGGTGTTT TATATTAAGTGTTCTACTTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGACTTGAAGTTTAAATT TTTTTGTTCATAATTTAAATGCGTTTGCTTAACATGTATGTTTATATGATTAAAGAATAA GATAGAGGGTGGCTCCACAAGGGCATGACCCCTTCTCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTCA TCTTTTTAAGGTTACTAGTTACTTTAATTAATTAAATCTAGTAAATTGTACATTTTGCTC GTGTACACCTCACAATCATATATATGCATTAAAAACATACATATAATCACTTACGCTTTC ACTATTATAGGTAATGACAAAATTACTACTATGATTTAAAGAAACAATTAAACGCACTTT TAGAATTTTTAAAATGACAAATGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTGTGTATT TATTTTTGTGCTTGTAGTTTATTATCTTTATTTCAATGAGTTTAATAATATTTGTTAGGA ATTGTTTGGTACTAATTTCTAAGTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATCCACTAAGATCAA TTGGGGAAGAAAATAAAACTAGGTTCAAGTTGTCACATTTAAAAACAATATGTCTTTCAT TGGAGTCGAACATGTCAATTTATATTGTTAAACACATAGCACTAGATTTTTTTTTTTTTA AATTACATTAAATATTATTCATAACATGCCATTTTTGGATATCTTGCTCTTTTTAATTTG ACATAACTCTATATTGTATGATCCAATATTCTCATATCAGTGTCTTTGTTTAAAAGACGA GATCATAAGAACCCATAATTCTCATATTTCGACAAGGTTTTACCAAGATAGTTGAAAATT AGTTTGACTTCTAAAATGCTTATTAGTATGCAATCATAAATGATTAAAAATATATTTCTA CTCGACTCCCGTAAGTATAAGATATTTTACTAAAAGACAGTCCGAAAAACATAAATTGAC TGTCAGGTAAGGACCCGATTAATCATATAAATCTTTCTAACATATCCACTTATGTGTCTG ACTATCAGATTTGATACATAGACTAAAACTACATAAGTATCCAAATTATAGAAAAAATAT ATAAGCATATTGCATGCAAGATGACTCGGTAAATTCTCCCCCTCTTATGTGTCAGACTAA CTTTGAAACTATCTTGGTAACCAATAGAATCAAAAGTTTAAAACATGAGATAAGGATCCA ATTAATGCTATAATGTTCTCTAATAAGATTGTCATACCTAGATAAAGCTGCCCTTCAAAA TATTAGTTTTAGTTCCATTTTTTGGACTGCATATGGAGAGACTAATTTGAATTTTTGATA TGTAAGATGTAATTAATGGTCCAAGCATAAAGCTTCTCAGGTTTAAGATCCTAAACTTAG TTATATTTGATACAACAATTTGTTACGTTAGAGAATCTCTTCTCTAAGATTAAGTGTGAG AATTCCGATTTTAATATTGAAAAAGTAATTTTACAAAATTGTTAGTCAGAACTTGAAAAA AAATTATAAGTTACCACATTTATAAACAGTCATTCTCCAATTAGAACGTCTTGATTTTAA TTTCATCTTGATCGTACACTTAACTATCATGGTATAAGTCTTTTGAACAATTGTCTTAAT CATAGTGCACCAAGTTCTCTACGAAAAATAACTACCAGAATCATCTTGACTAGAGAATTT TTGTAGGTATAATAGAATTCGATTGTCTTGGTCTCCCAGGAAGATGATCCTGTCACCCTC CTGCTAGATAATCCACAATAGTATTAAACATTAACGTATATTCATGCCACAATGAATTAT TTTTAAAAAAAAAATCTACATGTTTTGCATCAAACATTAGAAATGTCAATCTTTCCAAGC AAGCTCAAGCCTTTTGTAATATTTTCAAGAATCTAGTTATTACACGTTCCAATTCCCAGC CATCTCACTGCAACCCTGAA
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>LITCHI003864.m1 GenomeSequence + ATGTCACCATTTCTATTATTTTTCCTGTCAGGTTTCTTTGCTTCAGGATTCAGCTTATCA TCTTCCAGGTCCGATACTACCATTTCTGATGGTCAGATAGTTCTAAAAAAAAGCCCTTTT GAAGCTTCTTGTCCACTGGATTTTGATTCTATCAGGAAACTGGTTCATGAATCCCCTCCA AAGCCTGTGCTTACCGATATGACAAGCCAATGTAAAGGCATGTTTCGAACAGTCCTCGTG CTACGTTCCGAGTATCTTCGAACCAGTGGATACTTCCTGCCTCCTCCTGAAGCTACTGAG GCATGTTGGGAAGCATTCCGGGGCTTGATCTCAGAGTTCATACAAGGTTTTGACATTAAA GCTTCTTGTGGGAACCATCCTGATTCGATGTCAGATACTTGCAACAACATTACAACTCGA GAAGAGTTTGAGCGCCAGATTCCTGAAACTAAAATGCAGGAGATTTGGCATTACTGTAAT CAATCTTTGGATACTAATTCTGCTTGTGATTCATGTACGAGTAAGTTGTCAGGTCTTGGG GATTATTACTCCCAAATGGTTGGAAATGTCTCGGTTTGTACAGGATATGCAGCTATGTAT GCTGCTGGTATTGTCAATCAATTTGGACCATTTGATAGAGCAACTATGAGGTGCTTGTTT GCACTTTACTTTCCCTCCAAGGCATCTGGATTCAATACACAAAAAGTTGTCTTTTGGTCT GTTCTGTCAGGTTCTGTTGTTCTTGGGATCTTGGGGGCTTTTTCTGCAGTTAGGATTTGT TGGACTCGGCAGAACAAACCTGAGAAGAAGCAGCAGGTTCCTTTGAGTTATGAGACTAGT TCTGTATTTGGGTCAGGATTGTATGCTAGGGGTTCCTGTTTGGTCAGGTTCCAGTTTGAG 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