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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003727 | Chr6 | 26383886 | 26393134 | + | Serine/threonine-protein kinase EDR1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003727.m1 | 1 | 160 | PF14381.9 | EDR1 | Family | 185.3 | 1.20E-54 |
LITCHI003727.m1 | 743 | 1044 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 176.7 | 5.80E-52 |
LITCHI003727.m1 | 745 | 947 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 129.6 | 1.50E-37 |
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>LITCHI003727.m1 ATGCCATCTCTTGCACACCTTGAAGCAAATCCGGGGAGTTCTGGCTTCGAAGCTGTAATG GTTAATCGAACTATTGATCCTCCCTTGGAAGAGTTGCTTCAAGTTGCACAGTGCATTGCA TTAGATGTGCCTGCTACTGATGTTAAATTTTTGGTACAAAGACTTGCTGAAGTTGTTTCT GAGCACATGGGTGGCCCTGTAGAGGATGCAAATATGATGCTTGCAAAATGGTTGGAAAGT AACACAGTGTTGAGGAGGTCTCTTCACACAAGTGTGCTGCCTATTGGGTCCATACATATT GGGTTTTCTCGACACCGTGCTTTGCTTTTTAAGGTATTGGCTGACTGTATGGGGTTACCT TGTAGACTTGTAAAGGGTATCCATTACACTCGAGTAAAGGATGGTGCTGTTAACCTAATA AAGCTCAACGATGAAAGGGAGTTTTTGGTTGATCTCATGGCAGCTCCTGGGACACTTATA CCTGCAGATATTTTAAGTGCAAAGGATACTGTCCGTAAGCTGAATAACCAAATTAAAATC CTTGCTTTCCAGCCAAAGCCTTTACTTGTCTACTCAAGGCCAAAGCAATTACTTGGTGCA GGCAGTAGTCAAAACACTACTGCAGATGGTAATTCTCTTGTAGACAGAGGGTCTAGTTCT GGAAAGACAGAGTCCTTGCCTTTATTCCAAGTCCCAAGTAATGAAACTGCTGCTGGTTCT TCTGGATTATCTAGTCGAGTAGCTCCTAGTCAATTGGATAATCTTTCTATATCAGTTGTT GGAAGCTCTGTGTGTAAAGGAGGTCATGGAGCCAGTGCAGTTGGCGATGAGGTGAGGAGA AATCTCAATGTAGTTCCATATGGTCAAAATGGTCAGGAGGATTCTAAAAACCTTTTTGCA GATCTTAATCCATTCCAGATTAGAGGAGCTGGAAAAACTTCCTCCCCAAACAAGCCTGCA GAGATTAAAGTTGAAGAGTTTCAGAGACACAGAAATAACCTTGTGTCAGGTCGACTCTCT GTACCAATGATAAGGAAGAACCAAAATCCTTTTAATGAAGTCCCAAGGAAAAAAGATTAT AATTATGAGGAGGGCATCTTACCAAAGATTAACCGTGCATCTAATAATTATAATCTGTCA CCGTCAACCTCGACCAGTTCAACTGCATCTGAAAAGTTCTATCCTCATGGTTTAAAACCA TCTGGTAATGCAAATTTGTCAGGTAAAGATAGTGATGCCAGGAATGCTTTGTCTGGTAGT GGCTCACCGCTGATTTCTAGGTTAAATCAGCCAAATAGGCCTCGTATGCCAATGATGTGG AAGAACCATAATCCTTATATTAAAGTCCCAGGAAAAAAAGATTATAATTATAAGGAGGAC ATCTTACCAAAGATTAACCGTGAACTTAATAATTATAATCCGTCATCATCAACCTCGACT GGTTCAACTGCATCTGGACATTTCTATCCTCATGGTTTAAAGCTATCTGGTAATGCAAAT TTGTCAACCTCGACTGGTTCAACTGCATCCAAAAAGTTCAATCCTCATGGTTTAAAGCCA TCTGGTAATGCAAATTTGTCAGGTAAAGATAATGATGCCAGGAATGCTTTGTCTGGTAGT GGCTCACCGCTGATTTCTAGGTTAAATCAGCCAAATAGGCCTCGTATGCCAATGATGTGG AAGAACCATAATCCTTATATTAAAGTCCCAGGAAAAAAAGATTATAATTATAAGGAGGAC ATCTTACCAAAGATTCACCGTGAACCTAATAATTATAATCTGTCATCATCAACCTTGACT GGTTCAACTGCATCTGAAAAGTTTTATCCTCATGGTTTAAATCCATCTGGTAATGCAAAT TTGTCAATTAAAGGTAATGATGCCAGGAATGCTTTGTCTGGGAGTGGCTTACCGCTTCTT TCTACCACAAATCAGCCAAATAGGCCTCCTTTGGTTGAAGATTCAAGCCCAAATTTTAAG GAAGAAATTCATATGGATGGGAAGGACGCTAAATTTGATATGCTAGAGATGGTTAAAGAA CATGAAAACAATGAAATTGGTTACCATGATCGAAGAAAGTGCACACATGACAGATTTATG GGAAGCTATTTGAAACTAAAGGATCAGGAAAGTCGAAGGTCATCAGTTAATTCCAGCACA AACAGGGTTGGTCAGATCTTTGATGGTGTAGATGTTAGTGAATCTGAAATTCCATGGGAA GACTTGGTTCTTGGTGAAAGAGTTGGACTAGGTTCATATGGAGAAGTCTACTATGCGGAT TGGAATGGCAAGGAGGTTGCGGTGAAGAAGTTATTTGACCAAGACATCTCAGGTGACGGT TTGCTTGAATTTAAAAGAGAAGTGAAAATAATGCATAGATTGCGTCATCCAAATATTGTT ATGTTTATGGGTGCTGTCACGCGTCCTCCAAATCTATCTATCGTTTCTGAGTTTCTTCCA AGGGGAAGCTTATTTCAGATTCTTCATCGTCGTCAATGTCAAATTGATGAGAAGCGTAGA ATCAAAATGGCACTTGATGTGGCTACGGGTATGAATTACTTACATACCCGTACACCTACA ATTGTTCATGGTGATTTAAAGTCACAAAATCTTTTGGTTGATAAAAACTGGAATGTCAAG GTATGTGCTTCATTTTTTCTTTGTTTGATAGATGGTTGGTACGTTACCATGCAGGTTTGT GATTTTGGGATGTCACGCCTGAAGTATAGTACCTTTCTGTCATCCAAATCATTTGTAGGA ACGCCTGAGTGGATGGCACCAGAACTTCTTCGCAGTGAGCGATCTAACGAAAAGTGGGTT GCTATATTTCAGTTCAGCATCACTGAGTTTGTTCTTGTACTTTTTGTAGCTGAATTCATT GGACATCCTTATTACATTGTTTGCTTTGTGTCTAGATGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTC ATCTTGTGGGAGCTTGCCACTCTGAGATCGCCTTGGACTGGAATGAACCCGATGCAAGTA GTAGGTGCAGTAGGTTTCGACAATCGTCGCCTTGAGATTCCCAAGGAAGTGGATCCTTTG GTTGCAAGAATAATTCATGAATGCTGGCAGATGGATCCACACTTGCGTCCGTCATTTGCA CAACTCACAGTAGCTCTGAAGCCCTTGCAGCGGCTGGTCATTCGATCGCATCTGTACCAG CCGAGCTCACCACTGCCTCAAGAGATTTCAGTAAATTCTACACCTTGA
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>LITCHI003727.m1 GTCCGCCACTGCGCATAGACTTAGCTGCACAATTTGAAATACCGAAGACTGAAGACTTCT GATTTTGATGATGCGTATGAACTTCTCTTATAGATTACGAAGTGTTGAATCTATCTGTAG AGGATAAGGATCTCCACGGAACTTCTAGACATAGAACCCATGCCTAAGTTGCAACACCCC AATTGTCGATATAAGGACTCTAGAATAGTATTTAGTAAAACTTAAATTACAAAATATACT TTATTCAATCAAAAACTTAAAATCAAACTCCAATTAATAAAATGTTATAGCAATAACACA AAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAACAATAGTTCTCCAACTGAAACAATAAGAAACAAGTTCT AATAGCTAGTTTTTGTCTGAAACCAATCCCTAAGTGATATGAAAATCAACATCCTGATAT AAGTGTAGCTATTCTATAAAAATATTATGATGATGGGTGAGCTGCTAACTCAATAAATAA ATTCAATATAATATTATAAAACACTTACAACACTTTCAATATAAATGAACCATATAACAT AAATACATATTATAACAGTAAATATTTAATATTAACATTTATCAAACAAAAACTAAATAG TTCATATCATGTAATGTCTATAATAATGGTAACAATATGCTATATATACTCGTGCGATTC GACGTTAACGATAACGGCAATTGTAATAGTAGGTGTGCATACGATAGCTTAGCTAGTATA ATTAACAAAACTATGGGTAATGAGTCATAACGTTTTATAATATTTCATATAAATAAATAA TTTTTAAAATCACAATCATAATATACTTTCATGTTTAATGAATCTTTAGTATAAAATAAA TTGAAAAAAAAATGCAATACTAATTTCAATTTAGCCTGAACAAACTTTTACGTGTATTTT CACAAAATTTGTGTATTTTATAAAAGCTAGTTCAAAATATATTTGTCGAAAGTAATTTTA 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>LITCHI003727.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAGCTATTCTATAAAAATATTATGATGATGGGTGAGCTGCTAACTCAATAAATAAATTCA ATATAATATTATAAAACACTTACAACACTTTCAATATAAATGAACCATATAACATAAATA CATATTATAACAGTAAATATTTAATATTAACATTTATCAAACAAAAACTAAATAGTTCAT ATCATGTAATGTCTATAATAATGGTAACAATATGCTATATATACTCGTGCGATTCGACGT TAACGATAACGGCAATTGTAATAGTAGGTGTGCATACGATAGCTTAGCTAGTATAATTAA CAAAACTATGGGTAATGAGTCATAACGTTTTATAATATTTCATATAAATAAATAATTTTT AAAATCACAATCATAATATACTTTCATGTTTAATGAATCTTTAGTATAAAATAAATTGAA AAAAAAATGCAATACTAATTTCAATTTAGCCTGAACAAACTTTTACGTGTATTTTCACAA AATTTGTGTATTTTATAAAAGCTAGTTCAAAATATATTTGTCGAAAGTAATTTTAGAAAA CAACAATTAAATTATAAAACATACTTTCCTCAACGTAAACTGACACCAAATAAAATAAAG AATATTAAATTATAAAGACTAACTTTATAAAGACCTCAATTTGGCTGCTGGTGCCAACGC GCCGTGTGTTGGTGTGGGTTCGACACCCGCAATATCCAAAAAAATTATATATATATAATA ATTAATTAATTAATTAATAATAATAATATAATAATATAAACATACCCTTATCTCCTACCG TCCGTTATGAGTTGACCTCCCAACTTCGTATGAATTTCTTTCTCATCGTCATGTAGGTCT CTCCCTCATCTTTGTGTGGATGGATCCCTCTCAATTGAAAGTAGTTCTCCCAATCAAGCT ATTAATATTCTATTTCAGTTGGTGCCGATTGTTCTCTCGATTAGTCCATATTCAATTCCT GTATTAAAAAAAAAAAACTTTATAAAGACCTGAAACAGTCTGGATTAACTTAATTTCAAC GTACACAAATCAACAACTGGAAAGTAATCCAAACAAAAAAATCAATAACTGGAAAATTGG AATCTGCGTTACAGGTGCAGCTGGCGATGGCGACCAGCGTCGTCGTCGTCGTCGAACACC GACGATTTCGGGGAGAAGGATCAGATCCGGGCGGAGACGCTGTTGAGTTTGAACTATAAC AGTGATCGGAGAGGCGATTTGGCGGGGAGAGATGAGGCTGACGTGGCGGCGGAGGCTCTG TCGAGGCAGTACTGGGTAATATTCATTTTCGAGCTCGACTTTAGTTGATTGAACTTGAAA CTGCGTTTTGTGCATGTTTAGTGTAGTCGGTTTTTGTTGATTGAACTTGAAACCGCGTTT TGTATGCTTTCTGTGTTCGATTATGAGTACATAGGCTATGTGGTTGATATAAGCTTATAT AGCTGTGTGTTGGGTGATTGAACTGAATGGTTGGTTATTTCAATTTAGTTTTGTTGTTGG GCTAGTAGATGTTTCGTCAATTTGAAAGCAGCAATTTATTATTATTATTTTTTAAATAAT AAAAGCAGCAATTGATGTTTTTCTGTTTCTGCTCGTTTTGCTTTATTTTTACGTTTTAAT TTTGGTCTTTTTTAAAATTTATTGCAAAATGGGTGAATTTTTATAATTTCAAAAAAGTAT TTATTTAATACGAAATAGATATTAAAAATTTTTAAAAATGTAAATAAATATTATAAATTT AATGTTTTCGGGTTTTTTTTTAGTCATTTTTAGTGGATACATCATACCAACCGTATTGGG CGTAGCGAACCATACCGCAGCGGGGTGTCCATACTGCATGGCATAATGCACTTTCGAGCA TTGGTAGTACCAAAGTTTTGCTTTATTTTTTTTTCTTTTTGTGTCACTAGGAGTATAATG TGCTCGACTATGAGGAGAAGGTGGTGGATGGTTTTTATGATGTTTATAGGCTTTCAACTG ATTCAGCCACCCAAGGAAAA
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>LITCHI003727.m1 GenomeSequence + GTCCGCCACTGCGCATAGACTTAGCTGCACAATTTGAAATACCGAAGACTGAAGACTTCT GATTTTGATGATGCGTATGAACTTCTCTTATAGATTACGAAGTGTTGAATCTATCTGTAG AGGATAAGGATCTCCACGGAACTTCTAGACATAGAACCCATGCCTAAGTTGCAACACCCC AATTGTCGATATAAGGACTCTAGAATAGTATTTAGTAAAACTTAAATTACAAAATATACT TTATTCAATCAAAAACTTAAAATCAAACTCCAATTAATAAAATGTTATAGCAATAACACA AAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAACAATAGTTCTCCAACTGAAACAATAAGAAACAAGTTCT AATAGCTAGTTTTTGTCTGAAACCAATCCCTAAGTGATATGAAAATCAACATCCTGATAT AAGTGTAGCTATTCTATAAAAATATTATGATGATGGGTGAGCTGCTAACTCAATAAATAA ATTCAATATAATATTATAAAACACTTACAACACTTTCAATATAAATGAACCATATAACAT AAATACATATTATAACAGTAAATATTTAATATTAACATTTATCAAACAAAAACTAAATAG TTCATATCATGTAATGTCTATAATAATGGTAACAATATGCTATATATACTCGTGCGATTC GACGTTAACGATAACGGCAATTGTAATAGTAGGTGTGCATACGATAGCTTAGCTAGTATA ATTAACAAAACTATGGGTAATGAGTCATAACGTTTTATAATATTTCATATAAATAAATAA TTTTTAAAATCACAATCATAATATACTTTCATGTTTAATGAATCTTTAGTATAAAATAAA TTGAAAAAAAAATGCAATACTAATTTCAATTTAGCCTGAACAAACTTTTACGTGTATTTT 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